Pip kolsyror, även kända som fenoler, är en grupp organiska ämnen som innehåller en benzenring bunden till en hydroxylgrupp (-OH). De bildas naturligt under förbränningsprocesser och kan också förekomma i vissa livsmedel, såsom rökta och konserverade produkter. Höga nivåer av pip kolsyror kan vara skadliga för hälsan och har associerats med en ökad risk för cancer och hjärt-kärlsjukdomar.
En metabolit i lysinets biokemiska huvudpathway. Den verkar som antagonist mot neurostimulerande aktivitet modulerad av glutamatreceptorn N-metyl-d-aspartat (NMDA).
Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) saccharopine dehydrogenase is an enzyme complex that catalyzes the reversible conversion of saccharopine to L-lysine and alpha-ketoglutarate in the lysine biosynthesis pathway. It consists of two distinct subunits, Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) L-pipecolate dehydrogenase (LPD1) and Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) saccharopine reductase (LYS9), which are encoded by separate genes. The enzyme complex plays a crucial role in maintaining the balance of amino acids in cells and is a target for developing antifungal agents.
Rhodotorula är ett släkte av svampar som tillhör klassen Microbotryomycetes. De är encelliga, färgade jästsvampar som ofta förekommer i naturen på fuktiga ytor och kan orsaka opportunistiska infektioner hos människor, särskilt hos immunosupprimierade individer. Rhodotorula-arter producerar röd-, rosa eller orangefärgade kolonier på kulturmedier, vilket har gett upphov till deras namn (från grekiskan rhodo-, som betyder "rosa" och latinets -torula, som betyder "liten knöl").
En stor och heterogen grupp av svamporganismer som saknar sexuellt stadium. Många humanpatogena svampar tillhör denna grupp.
*Penicillium chrysogenum* är ett filamentöst svamparorganismer som tillhör den flercelliga djurrikets stam (Fungi). Det är välkänt för sin förmåga att producera penicillin, ett betydelsefullt β-laktamantibiotikum. Svampen förekommer naturligt i mark och luft och kan kolonisera en mångfald av substrat, inklusive livsmedel och foder. I industriell skala odlas *P. chrysogenum* ofta för penicillinproduktion som används i medicinska tillämpningar för behandling av bakteriella infektioner.
Pikolin syra är en organisk förening som tillhör familjen polykarboxylsyror. Det är en aromatisk förening med tre karboxylgrupper och används kommersiellt inom bland annat cementindustrin som katalysator i cementets härdprocess. I biologiska system har pikolin syra visats ha en viktig roll som en intermediär i nedbrytningen av tryptofan, ett essentiellt aminosyra, och i produktionen av niacin, också känt som vitamin B3.
En essentiell aminosyra. Den tillsätts ofta djurfoder.
Enzym som katalyserar dehydrogeneringen av sekundära aminer och ger upphov till en C=N dubbelbindning som primär reaktion. I vissa fall hydrolyseras denna senare.
Prolin är en icke-polär, sekundär aminosyra som förekommer naturligt i proteiner. Det kännetecknas av sin cykliska sidokedja, vilket gör den till en imidazolidinonring, och är den enda proteinogenetiska aminosyran med en sekundär struktur inbyggd i peptidkedjan. Prolin fungerar ofta som en flexibel punkt i proteinstrukturen och kan påverka proteinkonformationen.

Pipecolsyror är en grupp av organiska syror som innehåller en piperidinring, det vill säga en sex-ledad ring med kolatomer i centrum. Pipecolsyror förekommer naturligt i levande organismer och är involverade i olika metaboliska processer, framför allt i aminosyremetabolismen.

En speciell pipecolsyra som ofta diskuteras inom medicinen är α-pipecolic acid (även känd som pipecolin syra eller L-pipecolin syra). Denna pipecolsyra bildas som en biprodukt under biosyntesen av neurotransmittorn noradrenalin och kan påträffas i högre nivåer hos personer med vissa neurologiska eller psykiatriska tillstånd, såsom schizofreni och autism. Vissa studier har också visat att förhöjda nivåer av α-pipecolic acid kan vara associerade med ett ökat risktakinge för neurodegenerativa sjukdomar som Parkinson's disease.

I klinisk praxis används pipecolsyrans metaboliter som markörer vid diagnostisering av specifika genetiska tillstånd, såsom fenylketonuri (PKU) och maple syrup urine disease (MSUD). Dessa tillstånd orsakas av en nedsatt funktion hos specifika enzymer som är involverade i aminosyremetabolismen, vilket leder till en påträngande accumulering av pipecolsyror och andra metaboliter. Genom att mäta nivåerna av dessa metaboliter kan läkare fastställa diagnosen och övervaka effekten av behandlingar som syftar till att korrigera den underliggande metabola störningen.

2-Aminoadipinsyra, eller 2-AA, är en biogener aminosyra som förekommer naturligt i vissa arter av svampar. Det är också ett intermediärt stadium i lysinmetabolismen hos däggdjur.

I klinisk kontext kan höga nivåer av 2-AA i cerebrospinalvätskan vara associerade med neurologiska störningar, såsom sludring och spasmer, som kan förekomma vid genetiska sjukdomar som fenylketonuri (PKU) och van delbart hemokromatos. Dessa sjukdomar påverkar ämnesomsättningen och kan leda till onormalt höga nivåer av 2-AA i kroppen.

Det är värt att notera att medicinska definitioner kan variera beroende på kontext och specialitet, så det är alltid viktigt att konsultera primära källor eller läkare för precisa information.

'Saccharomyces cerevisiae' er ein typisk ei spece av gjennomsiktighetshegg (svamp), som vanlegvis kalles bakerens gjær. I bakerens gjær finst en rekke forskjellige enzymer, inkludert saccharopindehydrogenaser.

Saccharopindehydrogenasen (EC 1.1.99.22) er et enzym som forekommer i bakerens gjær og som spiller en viktig rolle i stoffskiftet til organismaene som inneholder dette enzymet. Saccharopindehydrogenasen katalyserer oksidasjonen av D-xylulose til D-xylulose-5-fosfat ved bruk av pyrrolokinolin-kviksølv-kloriddion (PQQ) som elektronacceptor. Dette er en viktig reaksjon i bakerens gjærs nedbrytning av polysakkarider, som xylane og hemicelluloser, til enklere sukkerarter som kan brukes i energiproduksjonen.

I tillegg til å være viktig for bakerens gjær, er saccharopindehydrogenasen også interessant for bioteknologi og bioenergi-relaterte applikasjoner på grunn av sin evne til å konvertere bredere spekter av sukkerarter enn tradisjonelle enzymer. Dette gjør det mulig å utvinne energien fra en bredere variasjon av biomasse-ressursar, som kan være viktig for å utvikle mer bærekraftige energiløsninger i fremtiden.

Rhodotorula är ett släkte av svampar som tillhör klassen Microbotryomycetes. Denna art av svampar förekommer vanligtvis i naturen och kan hittas på olika ytor, inklusive luft, vatten och jord. Några arter av Rhodotorula kan vara opportunistiska patogener, vilket betyder att de kan orsaka infektioner hos människor med nedsatt immunförsvar. Infektioner orsakade av Rhodotorula är ovanliga, men kan drabba hud, slemhinnor eller blodomloppet. Symptomen på en infektion varierar beroende på vilken del av kroppen som är drabbad, men kan inkludera feber, trötthet och andningssvårigheter. Behandlingen av Rhodotorula-infektioner består vanligtvis av antimykotiska läkemedel.

Deuteromycota, även känt som Deuteromycetes eller Fungi Imperfecti, är en äldre och numera föråldrad taxonomisk grupp inom svamparna. Den användes för att klassificera svampar som saknade en sexuell reproduktionscykel och därmed även den typiska ascosfären eller basidiesfären hos andra svampgrupper.

Idag är det vanligare att använda sig av molekylärfylogenetiska metoder för att bestämma svamparnas släktskap, och Deuteromycota har därför blivit en parafyletisk grupp som inte längre anses vara giltig. Många av de svampar som tidigare ingick i Deuteromycota har istället placerats i andra taxonomiska grupper baserat på deras molekylära egenskaper och släktskap.

Exempel på svampar som tidigare ingick i Deuteromycota är många mögelsvampar, såsom *Penicillium* och *Aspergillus*, samt vissa gisselsvampar, såsom *Oidium* och *Erysiphe*.

'Penicillium chrysogenum' är en art av svamp som tillhör släktet Penicillium. Det är en filamentös sländsvamp som förekommer världen över i mark, luft och på vegetabilier. Den är känd för sin förmåga att producera penicillin, ett betydelsefullt β-laktamantibiotikum som har använts i medicinsk behandling av bakteriella infektioner sedan 1940-talet.

Svampen växer optimalt vid temperaturer mellan 20 och 30 grader Celsius och föredrar fuktiga och näringsrika miljöer. Den kan bilda kolonier med en grå, blå eller grön färg och har en karakteristisk doft som påminner om sur mjölk eller rakvatten.

I medicinsk kontext är det främst den penicillinproducerande stam av Penicillium chrysogenum som är relevant, men det bör noteras att svampen också kan producera toxiner och allergier orsakas hos vissa individer.

Pikolin syra är en organisk förening som tillhör familjen aromatiska karboxylsyror. Den har den kemiska formeln C6H5COOH och är relaterad till benzoesyra, men med en extra hydroxylgrupp (-OH) i molekylen. Pikolin syra förekommer naturligt i kolhydrathydrolysat från hirs (en sorts gräs). Den har flera användningsområden inom organisk syntes och kan användas som en sura katalysator. Det är också möjligt att finna pikolin syra i vissa livsmedel, men den anses vara ofarlig för människor i små mängder.

'Lysin' er en type aminosyre som er essensiell for mennesker, det betyr at kroppen ikke kan produsere den selv og den må derfor tilføres gjennom kosten. Lysin spiller en viktig rolle i produksjonen av kollagen, en strukturell proteinskjemakke som er viktig for styrken og integriteten til huden, knoklene, blodkarrene og andre bindivisjevev. Det er også involvert i absorbsjonen av calcium, noe som er viktig for helse og styrke i knoklene. Lysin er en polar, alifatisk aminosyre med en lengre hydrokarbonkjede og en positivt ladet amino-gruppe. Den finnes naturligvis i mange matvarer som kjøtt, fisk, egg, bærtanter, ost og visse grønnsaker.

'Oxidoreductases acting on CH-NH group donors' är en kategori inom klassificeringssystemet EC-nummer (Enzyme Commission number) för enzymer. Detta betyder att de specifika enzymer som faller under denna kategori katalyserar reaktioner där en donator av en CH-NH grupp reduceras, medan en acceptor oxideras.

Exempel på enzymer inom denna kategori är:

* EC 1.5.1: L-lysin-5,6-aminomutase
* EC 1.9.3.1: Formamidase
* EC 1.9.7.1: Dimetylsulfoniopropionat degradering

Det är värt att notera att det finns många andra kategorier av oxidoreduktaser som agerar på olika typer av donatorer och acceptorer, såsom EC 1.1 (oxidoreductaser som agerar på CH-OH grupper), EC 1.3 (aktiverande enzymer för karboxylgrupps oxidering) och EC 1.10 (hydroxylaser).

PROLINE (förkortat Pro eller P) är en proteinogen aminosyra, vilket betyder att den används som byggsten i proteiner. Prolin är en icke-polär aminosyra och har en cyklisk sidokedja med en sekundär aminogrupp. Detta ger prolin en unik konformation jämfört med andra aminosyror, vilket kan ha betydelse för proteins struktur och funktion. Prolin är också en iminoessential aminosyra, eftersom den har en imin ring istället för en karboxamidgrupp i sin sidokedja. Detta gör att prolin inte kan bilda peptidbindningar på samma sätt som andra aminosyror och kan därför orsaka en avbrott i alfa-helixstrukturen i proteiner.