Chlorophyll Binding Proteins (CBPs) are a class of proteins found in the thylakoid membranes of chloroplasts in plants, algae, and cyanobacteria. They play a crucial role in photosynthesis by binding to and stabilizing chlorophyll pigments within the photosystems I and II complexes. CBPs help to harvest light energy and transfer it to the reaction centers of these complexes, where it is used to convert carbon dioxide and water into oxygen and organic compounds during photosynthesis. There are several types of CBPs, including the light-harvesting complex (LHC) proteins, which are the most abundant membrane proteins in plants and algae.
Porfyrinderivat med magnesium som deltar i omvandlingen av ljusenergi i organismer med fotosyntes.
Komplex som innehåller klorofyll och andra ljuskänsliga molekyler. De kan fånga upp energi i form av fotoner och förekommer som beståndsdelar av fotosystem I-proteinkomplexet eller fotosystem II-proteinkomplexet.
Fotosystem II-proteincomplex är ett protein-komplex som finns i kloroplastmembranet hos växter, alger och cyanobakterier. Det är en viktig del av fotosyntesen, där det absorberar ljusenergi och använder den till att reducera vattenmolekyler till syre, protoner och elektroner. Fotosystem II-proteincomplexet består av flera olika subenheter, inklusive D1 och D2 proteinkedjor, cytochrom b559, och ett antal små protein som hjälper till att stabilisera komplexet. Det är också värd för två fotosyntetiska pigmentkomplex: det klorofyll-a bindinga P680-komplexet och den accessoriska pigmentbärande antennkomplexet. När ljusenergi absorberas av dessa pigment kommer elektroner exciteras till ett högre energinivå, vilket initierar en serie redoxreakt
I en mening kan definitionen av 'Photosynthetic Reaction Center Complex Proteins' vara: Proteinkomplex som inkluderar reaktionscentra för fotosyntesen, vilka är membranproteiner som binder och aktiverar klorofyll och andra pigment som absorberar ljusenergi. Denna energi används sedan för att skapa elektrontransportkedjor som genererar ATP och NADPH, vilket ger cellen den nödvändiga energian för att syntetisera kolhydrater och andra organiska molekyler under den ljusberoende delen av fotosyntesen.
Produkter av hydrolys av klorofyller, hos vilka fytinsyrasidokedjan eliminerats, och karbonsyrorna förtvålats.
Produktion av kolhydrater, med frigörande av molekylärt syre, utifrån koldioxid och vatten i klorofyllvävnad hos växter och blågröna alger under inverkan av ljus. Vid fotosyntes hos bakterier förbrukas svavelväte, molekylärt väte och andra reducerade föreningar i stället för vatten, varvid molekylärt syre inte frigörs.
Fotosystem I-proteinkomplex är ett proteincomplex som spelar en central roll i den ljusberoende fotosyntesen hos växter, alger och vissa bakterier. Det är en del av den fotosyntetiska elektrontransportkedjan och sitter lokaliserat i thylakoidmembranen inuti kloroplasterna.
Protoklorofyllid är ett grönt pigment som förekommer hos vissa fotosyntetiserande bakterier, såsom cyanobakterier och grönsvarta sulfurbakterier. Det är en föregångare till protoklorofyll a och b, vilka är de två formerna av protoklorofyll som finns hos högre växter och alger. Protoklorofyllid absorberar ljus i det röda delområdet av det visible spektret (vid ungefär 650 nanometer) och reflekterar grönt ljus, men det är mindre effektivt vid fotosyntes jämfört med protoklorofyll a och b.
Det område av det elektromagnetiska spektret som det mänskliga ögat är känsligt för. Ljusets våglängd ligger mellan 400 och 800 nanometer, dvs mellan de ultravioletta och infraröda frekvenserna.
Inklusionskroppar i växtceller som innehåller fotosyntespigmentet klorofyll, vilket hör samman med tylakoidmembranet. Kloroplaster finns i bladceller och unga stammar hos högre växter.
Färgämnen, även kända som pigment, är ämnen som absorberar ljus av vissa våglängder och reflekterar eller transmiterar andra, vilket ger upphov till en visuell upplevelse av färg.
En växtblad är ett blad som hör till en växt, och är en flata, ofta brett utbredd struktur som har en viktig funktion för fotosyntesen genom att utgöra en stor yta för att ta emot solljus. Växtbladet innehåller också klorofyll och andra pigment, som gör att det kan absorbera ljusenergi och använda den till att producera näringsämnen genom fotosyntes. Dessutom har växtblad ofta en skyddande funktion för växten, och kan även ha en roll i växtens vattenförlustreglering. Slutligen kan växtblad ha en attraktiv funktion för att attrahera pollinerare till blommande växter.
En undergrupp klorofyllbärande bakterier (blågröna alger) bestående av encelliga eller flercelliga organismer med förmåga att genom fotosyntes producera syre. Blågröna alger är de enda kända organismer som kan binda både koldioxid (under medverkan av ljus) och kväve. Cyanobakterierna betraktades tidigare som alger, men de saknar algernas typiska kärnor och kloroplaster, och jämförelser av nukleotidbaser från 16S och 5S-rRNA tyder på att cyanobakterierna fylogenetiskt har en plats ganska långt ned under de gramnegativa bakterierna.
Tylakoider är membranstrukturer inne i kloroplasten hos växter, alger och cyanobakterier. De är primära platsen för ljusberoende fotosyntes där solljusenergi konverteras till kemisk energi i form av ATP (adenosintrifosfat) och NADPH (nikotinamidadenindinukleotidfosfat-reducerad). Tylakoidmembranen innehåller också fotosystem I och II, cytochrom b6f-komplexet och ATP-syntas, som alla är involverade i den ljusberoende fotosyntesen. Tylakoiderna är ofta staplade på varandra och bildar granumstaplar eller thylakoidstaplar inuti kloroplasten.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Feofytin är ett pigment som förekommer i fotosyntetiskt aktiva komplex hos växter och cyanobakterier. Det fungerar som elektronacceptor under fotosyntesen, och är en del av både fotosystem I och II. Feofytin är ett derivat av chlorofyll, men saknar den centrala magnesiumjonen som finns i chlorofyllmolekylen.
Proteiner som transporterar specifika ämnen i blodet eller genom cellväggar.
'Växtproteiner' är proteiner som härstammar från växter, och de utgör en viktig källa till näringsprotein för människor.
Egenskapen hos ett ämne att lysa under bestrålning. Den avgivna strålningen är vanligtvis av längre våglängd än den infallande (eller absorberade), t ex kan ett ämne som bestrålas med osynligt ljus avge synligt ljus. Röntgenfluorescens används för diagnostiska ändamål.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
'Mörker' är inte en medicinsk term, utan snarare en allmän beskrivning av ett frånvaro av ljus. I vissa medicinska sammanhang kan uttrycket 'nattblindhet' användas för att beskriva en specifik form av synnedsättning där individen har svårt att se klart i dimma, skymning eller under mörker. Men själva termen 'mörker' används inte medicinskt.
I medicinsk kontext är "Synechocystis" ett specifikt slags blågröna cyanobakterier, som kan användas inom forskning och medicin. Det exakta sättet Synechocystis används på kan variera, men ofta används den som en modellorganism för att studera fotosyntes, metabolism, cellcykel och andra biologiska processer. Den kan också användas i utvecklingen av bioenergiteknologier, såsom solceller och hydrogenproduktion.
Starkt gulröda, fettlösliga färgämnen som strukturellt liknar karoten. De utgörs av alifatiska kolväten med en polyisoprenbas och förekommer i växter, djur och mikroorganismer och omfattar t ex betakaroten och de olika xantofyllerna. Av de mer än 600 kända karotenoiderna återfinns ca 10 % i växtriket.
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
Ett släkte ettårigt gräs som utgör sädesslaget korn, en viktig gröda som odlas både som livsmedelsväxt och som foderväxt. Korn används t ex för malt- och etanolframställning.
Tetrapyrroler är en grupp organiska föreningar som innehåller en tetrapyrrolring, det vill säga en ringstruktur bestående av fyra pyrrolenheter kopplade till varandra via kol-kolbindningar. Denna struktur är central för många biologiskt viktiga molekyler, bland annat hem-gruppen i hemoglobin och cytochrom-gruppen i cytochrom P450 enzymkomplexet. Tetrapyrroler deltar också i fotosyntesen som central komponent i klorofyllmolekylen.
"Takrolimusbindande proteiner" refererar till proteinmolekyler som binder specifikt till immunosuppressiva läkemedlet Takrolimus, även känt som FK506. Denna typ av proteiner, som exempelvis FKBP (FK506-bindande proteiner), fungerar som intracellulära receptorer och bildar en komplex med Takrolimus, vilket i sin tur hämmar kalciumberoende signaltransduktionsvägar involverade i T-cellsaktivering. Detta gör att Takrolimus används som en immunosuppressiv behandling efter transplantationer för att förebygga avstötningar.
'Spinacia oleracea' är den botaniska termen för grönsaken spinat, som är känd för sitt höga näringsvärde och används ofta inom matlagning och medicinska tillämpningar.
Fytol är ett tetrasakosansyrederivat av isoprenoid natur, som förekommer naturligt i växter och djur. Det bildas vid nedbrytningen av klorofyll i växter och kan också syntetiseras från beta-karoten. I djursammanhang är fytol en viktig prekursor för syntesen av dolicholer, som är essentiella för proteinklusteringsprocesser i cellytan.
Ett släkte blommande växter i den norra tempererade zonen. Arten A. thaliana används för växtgenetiska studier.
'Växter' är en botanisk term som definierar en grupp organismar som utmärks av celldelning genom vävnadsomslutande delning, kärndelning genom mitos och cellväggar byggda av cellulosa. De flesta växter har också klorofyll och kan därför producera sin egen näring genom fotosyntes.
Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.
In medicine, energy transfer refers to the process of moving energy from one system or entity to another, such as the transfer of heat energy between molecules during a chemical reaction or the transmission of electromagnetic energy in the form of radiation for diagnostic or therapeutic purposes.

Chlorophyll binding proteins are a type of protein found in the chloroplasts of plants, algae, and some bacteria. They play a crucial role in photosynthesis by binding to and stabilizing chlorophyll pigments within the photosystems, which are complexes of proteins and pigments involved in light absorption and energy conversion during photosynthesis.

There are two main types of chlorophyll binding proteins:

1. Light-harvesting complex (LHC) proteins: These proteins bind to and stabilize chlorophyll a and b pigments, as well as carotenoids, in the light-harvesting complexes of photosystems I and II. They help absorb light energy and transfer it to the reaction centers of the photosystems, where the energy is used to convert water and carbon dioxide into oxygen and organic compounds.
2. Reaction center proteins: These proteins bind to and stabilize chlorophyll a pigments in the reaction centers of photosystems I and II. They are involved in the initial charge separation events that occur during photosynthesis, where light energy is converted into chemical energy in the form of ATP and NADPH.

Chlorophyll binding proteins are essential for the efficient functioning of the photosynthetic apparatus and play a critical role in the survival and growth of plants, algae, and some bacteria.

Klorofyll är ett grönt pigment som förekommer hos växter, alger och vissa batterier. Det är ett viktigt ämne för fotosyntesen, processen där solenergi omvandlas till kemisk energi. Klorofyllet absorberar ljus i blått och rött spektrum men reflekterar grönt, vilket gör att växter ser gröna ut. Det finns olika typer av klorofyll, men de två vanligaste är klorofyll a och klorofyll b. Klorofyll a är det viktigaste pigmentet för fotosyntesen och absorberar ljus mellan 430 och 662 nanometer, medan klorofyll b absorberar ljus mellan 455 och 642 nanometer.

Ljusupptagande proteinkomplex, även känt som photoreceptorproteinkomplex, är ett slags proteinmolekyler som finns i vissa levande organismer och har förmågan att absorbera ljusenergi. Detta komplex består ofta av flera olika proteiner som interagerar med varandra för att möjliggöra denna funktion.

I människor och andra djur är det vanligaste exemplet på ett ljusupptagande proteinkomplex rhodopsin, som finns i stavarna i ögat och är involverad i synprocessen. Rhodopsin består av två huvuddelar: ett protein, opsin, och en kromofor, retinal. När ljus träffar retinalet förändras dess molekylära struktur, vilket orsakar en konformationsförändring i opsinet som aktiverar en signaltransduktionsväg som slutligen leder till att vi uppfattar ljuset.

Ljusupptagande proteinkomplex förekommer också hos växter och cyanobakterier, där de är involverade i fotosyntesen. Dessa komplex absorberar ljusenergi för att driva den fotokemiska processen som producerar syre och reducerar energriktiga elektroner som kan användas för att producera kolhydrater.

Fotosystem II-proteincomplex är ett protein-komplex som spelar en central roll i fotosyntesen hos växter, alger och cyanobakterier. Det är en del av den fotokemiska fosforyleringskedjan, där ljusenergi konverteras till kemisk energi i form av ATP (adenosintrifosfat).

Fotosystem II-komplexet består av ett antal olika proteiner och cofaktorer, inklusive två photosyntetiska pigmentkomplex som absorberar ljusenergi. Det ena komplexet är ett p680-reaktionscentrum, som består av en specialparet av klorofyllmolekyler som exciteras av ljus och överför sin energi till ett annat pigmentkomplex, det så kallade accessorypigmentkomplexet. Detta komplex innehåller fler klorofyllmolekyler, karotenoider och fenofiler, som hjälper till att absorbera ljusenergi och skydda fotosystem II-komplexet från skada orsakad av för höga energinivåer.

Fotosystem II-komplexet är också ansvarigt för vattenoxidationen, en process där vattenmolekyler splittras upp i syre, protoner och elektroner. Syret frigörs som ett biprodukt, medan de frigjorda elektronerna används för att reducera NADP+ till NADPH, en viktig reducerande agens i fotosyntesen.

I summa är Fotosystem II-proteinkomplexet ett mycket viktigt protein-komplex som spelar en central roll i fotosyntesen hos växter, alger och cyanobakterier genom att konvertera ljusenergi till kemisk energi och producera syre som en biprodukt.

'Photosynthetic Reaction Center Complex Proteins' refererar till de proteinmolekyler som är involverade i den fotosyntetiska reaktionscentern, där ljusenergi konverteras till kemisk energi. Det finns två typer av fotosyntetiska reaktionscenter: Typ I och Typ II.

Typ I-reaktionscentret inkluderar en fotosyntetisk pigment-protein-komplex som består av flera subuniteter, inklusive den centrala reaktionscentern (D1/D2), cytochrom b559 och olika ljuskänsliga pigmentmolekyler såsom klorofyll och pheophytin. Dessa proteiner hjälper till att transportera elektroner från vatten till plastokinon under fotosyntesen, vilket genererar en protongradient över membranet som används för att producera ATP.

Typ II-reaktionscentret inkluderar också en fotosyntetisk pigment-protein-komplex med flera subuniteter, inklusive den centrala reaktionscentern (P680), cytochrom b559 och olika ljuskänsliga pigmentmolekyler såsom klorofyll och bacteriopheophytin. Dessa proteiner hjälper till att transportera elektroner från vatten till fenoquinon under fotosyntesen, vilket genererar en protongradient över membranet som används för att producera ATP.

I allmänhet är photosyntetiska reaktionscenter komplexa proteiner som katalyserar de första stegen i fotosyntesen, där ljusenergi omvandlas till kemisk energi genom en serie elektrontransportreaktioner.

Klorofyllider är pigment som förekommer hos vissa fotosyntetiserande bakterier och alger. De är relaterade till klorofyll, som är det huvudsakliga pigmentet som används i fotosyntesen hos växter, alger och cyanobakterier. Klorofyllider absorberar ljus i ungefär samma delar av spektret som klorofyll, men de reflekterar eller transmittierar ljus i en något annorlunda frekvens än klorofyll, vilket ger dem deras specifika färg. Klorofyllider spelar en viktig roll i fotosyntesen genom att hjälpa till att absorbera ljusenergi som används för att producera kemisk energi i form av ATP och NADPH, som sedan kan användas för att syntetisera kolhydrater och andra organiska molekyler.

Fotosyntese er en biokemisk proces, hvor organismer som planter, alger og visse batterier omdanner lysenergi, typisk fra solen, til kemisk energi i form af organisk stof, samtidig med at de omsætter kuldioxid og vand til ilt og vand. Denne proces kan skrives som en kemisk ligning:

6 CO2 + 6 H2O + lysenergi -> C6H12O6 + 6 O2

Det vil sige at der dannes et molekyle glukose (C6H12O6) og seks molekyler ilt (O2) for hvert seks molekyler kuldioxid (CO2) og seks molekyler vand (H2O) der bliver omdannet. Glukosen kan derefter anvendes som energikilde for cellens processer, mens ilten frigives til atmosfæren.

Fotosystem I-proteinkomplex är ett proteincomplex som spelar en central roll i den ljusberoende fotosyntesen hos växter, alger och vissa bakterier. Det är en del av den fotosyntetiska elektrontransportkedjan och sitter lokaliserat i thylakoidmembranen inuti kloroplasten.

Fotosystem I-proteinkomplexet består av flera olika subuniteter, inklusive en reaktionscentrumprotein som binder till ett pigment som absorberar ljusenergi och överför denna energi till elektroner. Dessa elektroner transporteras sedan genom ett antal elektrontransportproteiner till nästa steg i fotosyntesprocessen.

Fotosystem I-proteinkomplexet är också ansvarigt för att reducera ferredoxin, en järn-svavelprotein som är involverat i den senare delen av elektrontransportkedjan och som till slut leder till produktionen av syre och ATP.

I summa, Fotosystem I-proteinkomplexet är ett viktigt proteincomplex i fotosyntesen som hjälper till att omvandla solljusenergi till kemisk energi genom en serie komplexa processer som involverar flera olika proteiner och pigment.

Protoklorofyllider är en typ av pigment som förekommer hos vissa fotosyntetiserande organismer, såsom cyanobakterier och rödalger. De är kemiskt relaterade till protoklorofyll, ett grönt pigment som är involverat i den tidiga fångsten av ljusenergi under fotosyntesen.

Protoklorofylliderna skiljer sig från protoklorofyllen genom att de saknar en metylgrupp på ring B, vilket gör dem mindre effektiva i att absorbera ljusenergi. Detta betyder att de kan inte bidra till den effektiva fotosyntesen på samma sätt som protoklorofyllen och andra pigment som chlorofyll a och b.

I vissa organismer, såsom cyanobakterier, kan protoklorofyllider akkumuleras i stora mängder under vissa tillväxtförhållanden, vilket kan ge cellerna en rödaktig färg. Dessa pigment har också visat sig ha en viktig roll i den tidiga utvecklingen av fotosyntesen hos växter och andra organismer.

I medicsin används termen "ljus" ofta för att beskriva olika former av elektromagnetisk strålning, som kan användas diagnostiskt eller terapeutiskt. Det kan handla om:

1. Visuellt ljus: Det vanliga ljuset som vi ser med ögat, består av elektromagnetisk strålning i våglängder mellan ungefär 400 och 700 nanometer (nm).
2. Laserljus: Koncentrerad, samfälld och intensiv stråle av synligt ljus eller annan elektromagnetisk strålning, som kan användas inom medicinen för att exempelvis skära bort vävnad eller aktivera vissa läkemedel.
3. Röntgenljus: Elektromagnetisk strålning med kortare våglängd än synligt ljus, som används inom medicinen för att ta röntgenbilder och undersöka skelett, lungor och andra inre organ.
4. Ultraviolett (UV) ljus: Elektromagnetisk strålning med kortare våglängd än synligt ljus som används inom medicinen för att exempelvis behandla hudsjukdomar och bakterier.
5. Infrarött (IR) ljus: Elektromagnetisk strålning med längre våglängd än synligt ljus som används inom medicinen för att exempelvis behandla muskel- och ledsmärtor samt öka blodgenomströmningen.

Det är viktigt att notera att olika typer av ljus kan ha både nyttiga och skadliga effekter, beroende på dos, exponeringstid och andra faktorer.

En kloroplast er ein organell i de flertalls planteceller og algceller. Kloroplastern har en grønn farge på grunn av tilstedeværelsen av grønne fotosyntetiske pigmenter som kanskje er best kjent for klorofyllene. Disse pigmentene absorberer lys i det visuelle spektra, og de brukes i fotosyntesen til å omdanne kolsur og vann til glukose og oxygen. Kloroplastern inneholder også en rekke andre strukturer som er nødvendige for den fotosyntetiske prosessen, slik som tylakoider og stroma.

'Färgämnen' är ett samlingsbegrepp för ämnen som kan ge olika material färg eller teckna ut mönster när de tillförs eller appliceras på dem. Färgämnena kan vara organiska eller anorganiska och de fungerar genom att absorbera ljus av vissa våglängder och reflektera eller transmittera andra våglängder.

I en medicinsk kontext kan färgämnen användas för olika syften, till exempel:

1. Diagnostiskt: Vissa färgämnena används som markörer i kroppen för att undersöka olika organ eller system. De kan antingen tas upp av specifika celltyper eller bindas till specifika molekyler, vilket gör att de kan ses och analyseras med hjälp av bilddiagnostiska metoder som röntgen, ultraljud, datortomografi (CT) eller magnetresonanstomografi (MRT).
2. Terapeutiskt: Färgämnena kan användas i behandlingar för att ge läkemedel specifika egenskaper, till exempel för att underlätta identifiering och övervakning av läkemedlets placering i kroppen eller för att förbättra dess verkan genom att påverka dess frigivning eller upptag i kroppen.
3. Preventivt: Färgämnena kan användas i produkter som skyddar mot skador orsakade av UV-strålning, till exempel solskyddsmedel och kläder behandlade med UV-absorberande ämnen.

Exempel på olika typer av färgämnen som används inom medicinen inkluderar jod, barium, gadolinium, indisk röd, koltetraklorid och många andra.

I medicinsk kontext kan "växtblad" (phytolith) definieras som små, hårda kroppar av silikatmineral som bildas inne i levande växtceller och efterlämnas när cellerna dör. Dessa blir då en del av växtens struktur och kan bevaras under långa tider, även efter att växten själv har förfallit. Växtblad kan vara mycket små, ofta mellan 1-100 mikrometer i storlek, och deras form och storlek kan variera beroende på vilken växtart de kommer ifrån.

Växtblad är viktiga inom paleobotaniken och arkeologin eftersom de kan användas för att identifiera vilka växter som har funnits på en given plats vid en given tidpunkt. De kan också användas för att studera hur människor i det förflutna använt och förändrat sina landskap genom jordbruk, skogsbruk och andra aktiviteter som påverkat växtligheten.

Cyanobacteria, också kända som blågröna bakterier, är en grupp av fotosyntetiserande bakterier som kan producera syre som en biprodukt av sin fotosyntes. De har förmågan att utföra oxygenic fotosyntes, liknande den hos växter, med hjälp av klorofyll a och andra pigment. Cyanobakterier kan vara enkeltcellade eller bilda kolonier eller trådformiga filament. De förekommer i en mångfald olika miljöer, inklusive vatten, jord och luft. Några arter av cyanobakterier kan producera toxiner som kan vara skadliga för djur och människor.

Tylakoider är membranstrukturer inne i kloroplasten hos växter, alger och cyanobakterier. De är primära platsen för ljusberoende fotosyntes där solljusenergi konverteras till kemisk energi i form av ATP (adenosintrifosfat) och NADPH (nikotinamidadenindinukleotidfosfat-reducerad).

Tylakoidmembranet innehåller fotosystem I och II, cytochrom b6f-komplexet och ATP-syntas. Dessa proteinkomplex arbetar tillsammans för att producera ATP genom en process som kallas fotofosforylering. Tylakoider är också inblandade i syntesen av klorofyll, karotenoider och andra pigment som används under fotosyntesen.

Tylakoidmembranet är vanligtvis staplat upp i granum-stackar (grana) eller kan förekomma som enstaka membransäckar (thylakoids) i stroman, det inre vattnet av kloroplasten.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

Feofytin är ett pigment som förekommer i vissa arter av fotosyntetiserande bakterier och alger. Det är en del av fotosystem II, där det fungerar som en elektronacceptor under ljusberoende fotosyntes. Feofytin är ett derivat av klorofyll, men saknar den centrala magnesiumjonen och har istället en hydroxylgrupp på sin centrala del. Detta gör att feofytinet inte kan absorba ljusenergi självt, utan fungerar som en mellanstationsmolekyl i överföringen av elektroner under fotosyntesen.

"Bärarproteiner", eller "transportproteiner", är proteiner som binder till och transporterar specifika molekyler, såsom hormoner, vitaminer, lipider och joner, genom cellmembranet eller inom cellen. De hjälper till att reglera cellytans homeostas och kommunikation mellan olika celler. Exempel på bärarproteiner inkluderar hemoglobin, som transporterar syre i blodet, och LDL-cholesterol, som transporterar kolesterol i blodet.

'Växtproteiner' är ett samlingsbegrepp för proteiner som härstammar från växter. Proteiner är komplexa molekyler byggda upp av aminosyror och har en rad viktiga funktioner i levande organismers celler, till exempel som enzym, strukturella komponenter, signalsubstanser och transportsystem.

Växtproteiner kan ha olika funktioner beroende på vilken växtart de kommer ifrån och i vilket syfte de används. Några exempel på användningsområden för växtproteiner inkluderar livsmedelsindustrin, där de kan användas som ingredienser i vegetariska alternativ till animaliska proteinkällor, samt inom medicinsk forskning och terapiutveckling.

Det är värt att notera att växtproteiner ofta betraktas som hälsosamma alternativ till animaliska proteinkällor, eftersom de saknar kolesterol och ofta har ett lägre fettsammansättning. Dessutom kan en hög konsumtion av växtbaserade protein kopplas till minskade risker för flera sjukdomar, inklusive hjärt-kärlsjukdomar och typ 2-diabetes.

'Fluorescens' er ein medisinsk termin som refererer til egenskapen til å absorbere lys av kort bølgjelengde og deretter emittere lys av lengre bølgjelengde. Dette skjer når ein molekyll i ein substans absorbierer en foton (en lyspartikkel) med en bestemt energi, eller bølgjelengde, som er mindre enn dets egen energinivå. Som følge av denne absorpsjonen kommer ein del av denne energien til å overføres til ein annen elektron i molekylet, som deretter stiger opp til ein høyere energinivå. Når denne elektronen senker seg ned til sin opprinnelige energinivå vil den frigjore en foton med lavere energien eller lengre bølgjelengde enn det som absorbiert var. Dette resulterer i at substansen synes å lyse opp i ein farg som er forskjellig fra den som absorbert var.

Fluorescens er viktig innenom medisinen, specielt innenfor diagnostisk testing og forskning. Fluorescerende markører kan brukes til å merke ut bestemte celler eller strukturer i ein kropp, noe som kan være velegnet for å undersøke hvordan ein sykdom utvikler seg eller for å evaluere effekten av ein behandling. Fluorescens er også brukt innenfor bildediagnostiske metoder som fluorescens-angiografi og fluorescens-mikroskopi.

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

'Mörker' är inte en medicinsk term, utan snarare en allmän term som används för att beskriva frånvaron av ljus eller dålig synbarhet. I medicinskt sammanhang kan man dock tala om "nattsyn" (night vision), vilket är ett mått på hur väl ögat fungerar i mörker. Nattsyn kan vara nedsatt hos vissa personer, till exempel på grund av åldring, näthinneförändringar eller vissa sjukdomstillstånd. Det finns också medicinska instrument som använder sig av intensifierad ljusförstärkning för att underlätta synen i mörker, så kallade nattsynsgranater eller nattsikten.

'Synechocystis' er en slags blågrønne cyanobakterier (tidligere kjent som blågrønnalger), og den er ofte brukt som ein modelorganisme i forsking. Det er en enokellig art av slik at den ikke har noen undervisningsarter, og den tilhører klassen Synechococcaceae. Synechocystis-cellar kan være både autotrofe (som bruker lys for å produsere kulhydrater gjennom fotosyntese) og heterotrofe (som bruker organiske forstoffer som energikilde), avhengig av tilgjengelige næringsstoffer.

Det er viktig å merke seg at Synechocystis sp. PCC 6803 ofte refereres til i forsking og litteratur, som er en kjent strain av Synechocystis-arten som er velstudert og har blitt sekvensiert på generomnivå. Dette gjer det enklere å sammenligne forskingsresultatene mellom ulike studier.

Karotenoider är en typ av fettlösliga pigment som förekommer naturligt i vissa livsmedel, särskilt i gröna, gula och orangea frukter och grönsaker. De fungerar också som provitamin A, vilket betyder att de kan konverteras till vitamin A i kroppen. Det finns över 600 olika karotenoider, men de mest välkända är beta-karoten, alpha-karoten och lykopen. Karotenoider har antioxidanta egenskaper och kan hjälpa till att skydda celler från skada. De kan också stödja ögats hälsa och stärka immunsystemet.

Proteinbindning (ibland även kallat proteininteraktion) refererar till den process där ett protein binder sig till ett annat molekylärt ämne, exempelvis en liten organisk molekyl, ett metalljon, ett DNA- eller RNA-molekyl, eller till ett annat protein. Proteinbindningar är mycket viktiga inom cellbiologi och medicinen, eftersom de ligger till grund för många olika biokemiska processer i kroppen.

Exempel på olika typer av proteinbindningar inkluderar:

* Enzym-substratbindningar, där ett enzym binder till sitt substrat för att katalysera en kemisk reaktion.
* Receptor-ligandbindningar, där en receptor binder till en ligand (exempelvis ett hormon eller en neurotransmittor) för att aktiveras och utlösa en cellsignal.
* Protein-DNA/RNA-bindningar, där proteiner binder till DNA eller RNA-molekyler för att reglera genuttrycket eller för att delta i DNA-replikation eller -reparation.
* Protein-proteinbindningar, där två eller fler proteiner interagerar med varandra för att bilda komplexa eller för att reglera varandras aktivitet.

Proteinbindningar kan styras av en mängd olika faktorer, inklusive den tresdimensionella strukturen hos de involverade molekylerna, deras elektriska laddningar och hydrofila/hydrofoba egenskaper. Många proteinbindningar kan också moduleras av läkemedel eller andra exogena ämnen, vilket gör att de är viktiga mål för farmakologisk intervention.

'Hordeum' är ett släkte inom gräsfamiljen (Poaceae) och innehåller arter som vanligtvis kallas korn. Det mest välkända exemplaret är vanlig vetekorn (*Hordeum vulgare*), som odlas över hela världen för sin näringstäta frö, vilket används till mat och drycker såsom öl. Andra arter inkluderar exempelvis tvåårigt korn (*Hordeum distichon*) och fjäderkorn (*Hordeum jubatum*).

Tetrapyrroler är en grupp organiska föreningar som innehåller en tetrapyrrolring, det vill säga en ring med fyra pyrrolenheter. Denna struktur är central för många biologiskt viktiga molekyler, bland annat hem-gruppen i hemoglobin och cytochrom-komplexen, samt klorofyllen hos växter och cyanobakterier. Tetrapyrroler deltar i en rad olika biologiska processer, såsom syretransport, elektrontransportkedjor och fotosyntes.

Takrolimus är ett immunsupressivt läkemedel som används efter transplantationer för att förhindra avstötning. Takrolimus fungerar genom att hämta ned aktivering av T-celler, en typ av vita blodkroppar som är involverade i immunförsvaret.

Takrolimusbindande proteiner (TBP) är proteiner som binder till takrolimus och hjälper till att transportera det in i celler, där det kan utöva sitt verkan. De två viktigaste typerna av TBP är FKBP12 och FKBP1A. När takrolimus binder till dessa proteiner bildar de en komplex struktur som hämmer ned kalmodulin-beroende aktivering av kinasen Calcineurin, vilket i sin tur förhindrar transkriptionen av cytokiner och andra proteiner som är involverade i T-cellsaktivering.

I medicinska sammanhang kan man diskutera effekten av TBP på hur mycket aktivt takrolimus verkar, eftersom mängden tillgängligt fria takrolimus kan påverkas av mängden TBP.

"Spinacia oleracea" er en medisinsk betegnelse for arten spinat, som er en grønnsag og en slags bladgrøntsag. Spinat tilhører amarant-familien (*Amaranthaceae*) og stammer oprindeligt fra Centralasien. Den indeholder blandt andet store mængder af næringsstofferne jern, calcium, magnesium, vitamin A, C og K. Spinat er desuden kendt for at være en god kilde til antioxidanter som beta-karoten og floridermalin.

Fytol är ett typ av alkohol som förekommer naturligt i vissa typer av fetter och oljor, särskilt dem som hittas i växter. Det är egentligen en form av fotol, som är en kemisk förening som bildas när klorofyll bryts ned i växter. Fytol kan också hittas i djurprodukter, eftersom djur kan ta in det via sin kost och sedan utsöndra det i sina avskrädesämnen. I människokroppen kan fytol omvandlas till en annan kemisk förening som heter kolesterol, vilket är ett viktigt ämne för cellmembran och hormoner.

'Arabidopsis' er en slags plante som oftest refererer til den velkjente modellplanten 'Arabidopsis thaliana'. Denne liten, en-årige planten hører hjemme i de tempererede egne av Eurasia og Nord-Afrika. 'Arabidopsis' er en populær valg for biologisk forskning på grunn av sin enkle genetiske oppbygging, korte livscyklus og lette tilgjengelighet. Mange grunntannleg i planters molekylære biologi, celleteori og utviklingsbiologi er blitt klarlagt ved hjelp av studier på 'Arabidopsis'.

I medicinsk kontext kan 'växter' (plants) definieras som organismer som tillhör domänen *Eukarya* och kungörer riket *Plantae*, vilka karaktäriseras av celldelning genom mitos och meios, cellkärnor med en definitiv dubbelmembran, och en plastid (chloroplast) som innehåller gröna fotosyntetiska pigment. Dessa egenskaper gör att växter kan producera sin egen näring genom fotosyntes, vilket är en process där de omvandlar solljus till kemisk energi i form av socker (glukos).

Det bör noteras att den taxonomiska gruppen Plantae är något omstridd och kan inkludera olika arter beroende på vilken taxonomisk skola man följer. En vanlig definition inkluderar mossor, levermossor, ormbunkar, barrträd och blommor som del av Plantae, medan andra forskare kan exkludera vissa grupper som mossor och levermossor till andra taxonomiska grupper.

"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.

En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.

Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.

Energiöverföring är en process där energi överförs från ett system till ett annat. Det kan ske på olika sätt, beroende på vilken typ av energi som överförs och de två systemen mellan vilka överföringen sker.

Exempel på olika typer av energiförflyttning inkluderar:

* Mekanisk energiöverföring: Den här typen av överföring sker när mekanisk energi, såsom rörelseenergi eller arbetskraft, överförs från ett system till ett annat. Det kan ske genom kontakt, som när två föremål krockar och överför energi till varandra, eller på avstånd, som när en magnet drar till sig en järnfil.
* Elektrisk energiöverföring: Den här typen av överföring sker när elektrisk laddning överförs från ett system till ett annat. Det kan ske genom ledare, såsom trådar eller kablar, eller på avstånd, som när solstrålar genererar elektricitet i en solcell.
* Termisk energiöverföring: Den här typen av överföring sker när värmeenergi överförs från ett system till ett annat. Det kan ske genom konduktion, som när två föremål med olika temperaturer kommer i kontakt och värmeenergi överförs från det varmare till det kallare föremålet, genom konvektion, som när luft eller vätska rör sig och tar med sig värmeenergi, eller genom strålning, som när en varm yta sänder ut infraröd strålning som sedan upptas av en annan yta.
* Ljusenergiöverföring: Den här typen av överföring sker när ljusenergi överförs från ett system till ett annat. Det kan ske genom direkt sikt, som när solens strålar reflekteras i en spegel och sedan upptas av ett annat föremål, eller genom fiberoptik, som när ljuset leds genom en flexibel fiber till ett annat ställe.
* Elektromagnetisk energiöverföring: Den här typen av överföring sker när elektromagnetisk energi överförs från ett system till ett annat. Det kan ske genom induktion, som när en spole inducerar en ström i en annan spole, eller genom radiovågor, som när en radiosändare sänder ut signaler som sedan upptas av en radiotvätt eller en mobiltelefon.