Caliciviridae är en familj av små, enkelsträngade RNA-virus som orsakar en rad olika sjukdomar hos djur, inklusive människor. Calicivirus har en karakteristisk morfologi med tydliga, skålformiga depresioner på ytan av viruskapsidproteinet, vilket gett familjen dess namn (calyx är grekiska för "skål").

Hos människor orsakar calicivirus huvudsakligen mag-tarmsjukdomar, som diarré, kräkningar och buksmärtor. De två viktigaste släktena inom familjen Caliciviridae som infekterar människor är Norovirus och Sapovirus. Norovirus är den vanligaste orsaken till akut gastroenterit hos alla åldersgrupper, medan sapovirus främst orsakar sjukdom hos barn under fem år.

Calicivirus sprids ofta via kontaminert mat eller vatten, men de kan också spridas direkt från person till person genom nära kontakt, som handskakning eller andningsluft. Virusen är mycket smittsamma och kan överleva länge på ytor och händerna, vilket gör att de enkelt kan sprida sig i samhället.

Det finns inga specifika behandlingar eller vaccin mot calicivirusinfektioner, så patienter behandlas vanligen symptomatiskt med vätskeersättning och vila. För att förebygga smitta rekommenderas god handhygien, att undvika nära kontakt med sjuka personer och att tillaga maten grundligt för att döda eventuella virus som kan finnas på råvarorna.

Caliciviridae är en familj av små, enkelsträngade RNA-virus som orsakar en rad olika sjukdomar hos djur, inklusive människor. Calicivirusinfektioner är vanligen kända för att orsaka gastroenterit, en mag-tarmsjukdom som karaktäriseras av diarré, kräkningar, buksmärtor och feber.

Hos människor orsakar calicivirusinfektioner ofta sjukdomen vinterkräksjuka, även känd som norovirusinfektion. Norovirus är det vanligaste orsakande agensen till akut gastroenterit hos människor över hela världen och sprids främst via kontaminerad mat eller vatten, direkt person-till-personkontakt eller via ytor som har kontaminerats med virus.

Andra arter av calicivirus kan orsaka sjukdom hos andra djur, till exempel kan felines Kalicivirus orsaka mag-tarmsjukdom hos katter och vesicular exanthema of swine (VES) hos grisar.

Calicivirusinfektioner behandlas vanligen symptomatiskt, det vill säga man behandlar de enskilda symptomen som uppstår under sjukdomsförloppet. Det finns inget specifikt botemedel mot calicivirusinfektioner och de flesta människor återhämtar sig inom några dagar till en vecka efter att sjukdomen brutit ut.

Calicivirus hos katter, även känt som feline calicivirus (FCV), är ett sjukdomsalstrande virus som kan orsaka en rad respiratoriska och oral-kliniska tecken hos katter. Viruset tillhör familjen Caliciviridae och innehåller en enkel, positivt styrd RNA-sträng. Det finns många olika FCV-stammar med varierande virulens, vilket kan leda till en bred skala av sjukdomar, från subkliniska infektioner till allvarliga systemiska sjukdomar.

FCV-infektionen sprids främst via direkt kontakt mellan katter eller indirekt via kontaminering av miljön med sekret från infekterade katter. De vanligaste kliniska tecknen på FCV-infektion inkluderar snuva, hosta, slemmig näsa och ögon, ulcerationer i munhålan och svullnad av halsen. I vissa fall kan viruset också orsaka artriter, pneumoni och dödlig sepsis.

FCV-infektionen är vanligt förekommande bland katter över hela världen och drabbar ofta unga katter hårdast. Även om det finns inget botemedel för själva viruset, kan symtomen behandlas med stödjande vård, såsom vätskeersättning, antibiotika för sekundära bakteriella infektioner och smärtlindring. Preventivt kan katter vaccineras mot FCV som en del av deras rutinimmunisationsprogram.

Sapovirus är ett genus inom familjen Caliciviridae och är en av de viktigaste orsakerna till akut diarré hos barn och vuxna världen över. Viruset är relativt små, icke-höljda partiklar som mäter cirka 27-40 nanometer i diameter. Sapovirus har en enkelsträngad RNA-genom som kodar för fyra strukturella proteiner och sex icke-strukturella proteiner.

Sapovirus orsakar ofta mag- och tarminflammationer, vilket kan leda till symptom som diarré, kräkningar, buksmärtor och feber. Symptomen är vanligtvis mildare än hos andra calicivirus, såsom norovirus, men kan fortfarande vara mycket smittsam. Sapovirus sprids främst via kontaminert mat eller vatten, men kan också spridas via direkt person-till-personkontakt.

Det finns nio huvudgrupper av sapovirus, betecknade GI till GIX, och varje grupp innehåller en mängd genetiskt skilda serotyper. De flesta kända serotyperna av sapovirus har identifierats hos barn i utvecklingsländer, men virus har också isolerats från djur som grisar och kor.

'Vesivirus' är ett släkte inom familjen *Caliciviridae*, som är en grupp små, enkelsträngade RNA-virus. Vesivirus är kända för att orsaka sjukdom hos djur, framför allt hos primater och valar. Ett välkänt exempel på ett vesivirus är det vaccinpreparat som använts för att immunisera grisar mot fotsjuka, kallat Vesicular Exanthema of Swine Virus (VESV). Detta virus kan också orsaka en infektionssjukdom hos människor som arbetar med infekterade djur, men det anses vara sällsynt och tenderar att ge milda symptom. Andra vesivirus som kan påverka människor är San Miguel seas lion virus och Feline calicivirus.

Norovirus är ett samlingsnamn för en grupp virus som orsakar mag- och tarminflammation, även kallad magsjuka eller gastroenterit. Norovirus är den vanligaste orsaken till akut mag-tarminflammation världen över och sprids lätt från person till person, ofta genom smittospridning via förorenat mat- eller vattenuppslag eller via direktkontakt med en smittad persons avföring eller slemhinnor. Symptomen på norovirusinfektion inkluderar plötslig onda magbrytningar, illamående, diarré och kräkningar. Andra symtom kan vara trötthet, feber, huvudvärk och muskel- eller ledsmärtor. Symptomen brukar vanligtvis vara milda och varaade mellan ett och tre dagar. Norovirusinfektioner är vanligare hos barn än vuxna, men kan drabba alla åldrar. Det finns inget botemedel mot norovirusinfektion, men det går att behandla symtomen med bland annat vätskeersättning för att förebygga dehydrering. För att undvika smitta rekommenderas god handhygien och att undvika att dela mat, dryck eller redskap med en smittad person.

Norovirus, tidigare känt som Norwalk-like virus eller Norwalk-virus, är ett samlingsnamn för en grupp relaterade virus som orsakar akut gastroenterit, allmänt kallat mag-tarmlopp. Symptomen påföljande en norovirusinfektion innefattar illamående, kräkningar, diarré och buksmärtor. Norovirus är mycket smittsamt och kan spridas via kontaminert mat eller vatten, direkt personlig kontakt med en smittad person eller genom beröring av kontaminerade ytor.

Norovirus är den vanligaste orsaken till akut gastroenterit i alla åldersgrupper och orsakar uppemot 23 miljoner fall av sjukdom, 570-800 dödsfall och cirka 1,1 miljon sjukhusvistelser per år i USA. Infektionen är vanligare hos barn under fem år och äldre vuxna över 65 år.

Det finns inget specifikt behandlingssätt för norovirusinfektion utöver att ersätta vätskor och elektrolyter som förlorats genom diarré och kräkningar. Det är också viktigt att tvätta händerna ofta, undvika att dela mat och dryck med andra under sjukdomstiden och rengöra kontaminerade ytor för att förebygga spridningen av viruset.

RHD-virus, også kjent som Rabbit Hemorrhagic Disease Virus, er ein virus som kan føre til en alvorlig sykdom hos kaniner og harmer deres lever og blodsystem. Det er en art av calicivirus og forekommer i to hovedtyper (RHDV og RHDV2). RHD-viruset kan spredes gjennom direkte kontakt mellom dyr eller gjennom kontaminert fôr, vann eller luft. Sykdommen har en høy dødelighet og kan føre til blødninger, leversvikt og død innen få dager etter infeksjonen. Der er ingen behandling for RHD-viruset og forebyggelse består av å holde dyrene vaksine og redusere mulighetene for smitte gjennom god hygiene og biosikkerhet.

Vesicular exanthema of swine (VES) är ett contagiost, viralt sjukdomstillstånd hos grisar som orsakas av ett lipid-belagt RNA-virus som tillhör familjen Caliciviridae. Sjukdomen kännetecknas av att små blåsor (vesiklar) bildas på huden och slemhinnor, främst runt munnen och klövarna. Även feber, sömnlöshet, viktminskning och svullnad i lymfknutar kan förekomma.

VES är en zoonotisk sjukdom, vilket betyder att den kan överföras från djur till människa, men detta är mycket ovanligt. Människor som blir smittade tenderar att få milda symptom som feber och hudutslag.

Det finns inget behandlingsalternativ för VES annat än att stödja grisen med vård och symtomlindring. För att förebygga spridning av sjukdomen rekommenderas god hygien, isolering av sjuka djur och kontroll av infektionskällor. VES är en rapporterbar sjukdom i många länder, inklusive USA, och skall omedelbart anmälas till myndigheterna om det uppstår misstanke om att djuren lider av denna sjukdom.

Mag-tarmskatarr, også kendt som gastrit eller enteritis, er en betegnelse for inflammation i mavesækkens (gastritis) og/eller tarmløbets (enteritis) slimhinde. Denne tilstand kan have mange årsager, herunder infektioner med bakterier (f.eks. H. pylori), virus eller parasitter, forstyrrelser i mavesækkens fordøjelse og/eller syreregulering, alkohol- og stofforbruk, stress, medicinpåvirkning (f.eks. ved brug af ikke-steroid antiinflammatoriske lægemidler - NSAID) eller andre sygdomme i kroppen.

Symptomer på mag-tarmskatarr kan inkludere opkast, mavesmerter, fordøjelsesproblemer som diarre eller forstoppelse, vægttab og/eller manglende appetit. Behandlingen afhænger af årsagen til sygdommen og kan inkludere ændringer i kosten, antibiotika, syrereducerende medicin eller andre lægemidler for at reducere inflammationen og lindre symptomerne.

'Genom' refererer til det totale sæt af genetisk information, der er indeholdt i et organisme. Det består af DNA-molekyler, der har kodet for alle de gener, proteiner og regulerende sekvenser, der er nødvendige for at danne og opretholde livet hos det pågældende organisme.

'Viralt genom' refererer til den totale genetiske information, der findes i et virus. Et viralt genom kan være lavet af DNA eller RNA og kan variere meget i størrelse alt efter hvilken type virus vi taler om. Virus' genom indeholder instruktionerne for at producere nye viruspartikler, så de kan inficere andre celler og fortsætte med at sprede sig.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

"Fylogenetik" (förekommande stavning inom biologi på engelska: 'phylogenetics') är ett område inom biologin som handlar om att studera evolutionära relationer mellan olika arter eller andra taxonomiska grupper. Genom att jämföra morfologiska, genetiska och/eller fossila data kan forskare konstruera ett fylogenetiskt träd som visar hur olika arter tros ha utvecklats från gemensamma förfäder över tid.

Termen "fylogen" (på engelska: 'phylogeny') refererar till den evolutionära historien och relationerna mellan olika taxa, det vill säga en grupp organismer som är relaterade genom gemensam härstamning. En fylogeni kan representeras av ett diagramatiskt träd där varje gren representerar en klad, det vill säga en monofyletisk grupp med alla dess ättlingar inkluderat och utan inslag av äldre gemensamma förfäder.

I medicinsk kontext kan fylogenetiska analyser användas för att studera evolutionära relationer mellan patogena mikroorganismer, vilket kan vara viktigt för att förstå hur sjukdomar sprids och utvecklas, och hur vacciner och andra behandlingsmetoder kan utformas.

I en medicinsk kontext är en kapsid den proteinhölje som omger och skyddar genomet hos ett virus. Kapsiden är ofta skapad av flera kopior av samma proteiner, som arrangerar sig i en specifik form som kan liknas vid en symmetrisk skal eller yta. Denna struktur hjälper till att stabilisera viruset och underlättar dess infektion av värdceller genom att binda till specifika receptorer på cellens yta. Kapsiden är en viktig del av virusets struktur och spelar en central roll i dess livscykel och patogenesis.

'Open Reading Frames' (ORF) refererar till genetiska sekvenssegment som har potentialen att koda för proteiner. De definieras vanligtvis som en sekvens av minst 300 nukleotider som börjar med en startkod (ATG) och fortsätter till en stoppkod (TAA, TAG eller TGA). ORF:er hittas ofta i delar av DNA eller RNA som kallas icke-kodande, eftersom de inte direkt koder för proteiner. Genom att identifiera ORF:er kan forskare förutsäga potentiala proteinsekvenser och undersöka deras funktioner. Det är värt att notera att inte alla ORF:er leder till produktion av ett fullständigt protein, eftersom det finns olika mekanismer som kan påverka den genetiska informationens överföring från DNA till protein.

'RNA viralt' refererer til et virus som har sin genetisk informasjon lagret i RNA (ribonukleinsyre) istedenfor DNA (deoxyribonukleinsyre) som er vanligere for levende organismer. Disse typer av viruser bruker RNA-polymerase enzym for å transkribere og replikere sin genetisk informasjon. Mange infektiøse og smittebærende virusser, som f.eks. HIV, influenza, SARS-CoV-2 (som forårsaker COVID-19), er RNA-virusser.

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

'Virusproteiner' refererer til proteiner som produceres af et virus for å fullføre sin replikasjonsprosess og forårsage infeksjon i værtsorganismen. Disse proteinet kan inkludere strukturelle proteiner, som utgjør kapsiden eller membranen til viruset, og ikke-strukturelle proteiner, som involveres i regulering av virusets replikasjon og infeksjonsprosess.

Strukturelle proteiner kan inkludere:

* Kapsidproteiner: disse er proteiner som utgjør den proteinhylle som omger viruses genetiske materiale. De kan være formet som en helix, som hos bakteriofager, eller som en ikosaeder, som hos mange arter av RNA- og DNA-viruser.
* Membranproteiner: disse proteinet er inkorporert i lipidmembranen til de enkle- eller doppelstrands RNA-viruser som koronavirus og flavivirus. Disse proteinet kan være involvert i sammensetningen av membranen, infeksjonen av værtscellen, og/eller frigjøringen av nyproducerte virusher.

Ikke-strukturelle proteiner kan inkludere:

* Replikasjonsproteiner: disse er nødvendige for replikasjonen av virusets genetiske materiale og kan være enzymer som revers transkriptase, RNA-polymerase eller ligase.
* Regulatoriske proteiner: disse proteinet kan regulere aktiviteten til andre virusproteiner eller værtsorganismens celler for å øke viruses evne til å replikere seg og spre seg.

I allmennhet er virusproteinene spesifikke for hvert individuelt virus og kan være mål for antivirale terapier eller vaccineutvikling.

"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.

En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.

Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.

"Cell line" er en betegnelse for en population av levende celler som deler seg selvstandig og ubestemt i laboratoriet. Disse cellene har typisk samme karyotype (sammensetningen av deres kromosomer) og genetiske egenskaper, og de kan replikeres over en lang periode av tid. De kan brukes i forskning for å studere cellebiologi, molekylær biologi, farmakologi, virologi og andre områder innen biovitenskapen. Eksempler på velkjente cellinjer inkluderer HeLa-cellinjen (som er tatt fra en livstrukturløs kvinne i 1951) og Vero-cellinjen (som er vanlig å bruke i studier av virusinfeksjoner).