2-isopropylmalatsyntas
3-Isopropylmalate Dehydrogenase
Clostridium kluyveri
Oxo-syra-lyaser
Alkoholoxidoreduktaser
Thermus thermophilus
Thermus
2-Isopropylmalat syntase er en nøye definert enzym i medicinsk terminologi. Det er katalysator for en reaksjon som konverterer 2-oxoisovalerat og L-løse til 2-isopropylmalat i metabolismen av aminosyren leucin. Denne reaksjonen er en del av citronsyracykelen og er viktig for biosyntesen av andre essensielle aminosyrer som isoleucin og valin. Defekter i 2-isopropylmalat syntase kan føre til medisinske tilstander som 2-isopropylmalat syndrom, som er karakterisert av en akkumulering av 2-oxoisovalerat og 2-isopropylmalat i kroppen og kan føre til neurologiske symptomer og metabolisk acidose.
3-Isopropylmalate dehydrogenase (IPMDH) er ein enzym som spiller en viktig rolle i lecitineringen av aminosyren leucin i organismer. IPMDH katalyserer den siste steget i biosyntesen av leucin, nemlig omformingen av 3-isopropylmalat til α-ketoisocaproat og CO2 ved oxidasjonen av en sekundær alkoholgruve. Dette enzymet er vanligvis aktivt i mitokondriene og er kjent fra mange forskjellige arter, inkludert mennesker. Defekter i IPMDH-aktiviteten kan føre til medisinske tilstander som f.eks. leucinosis, en autosomal recessivt arvelig metabol napfelsskap.
'Clostridium kluyveri' är en gram-positiv, sporedbildande, anaerob bakterie som kan påträffas i människans tarm. Den är normalt inte patogen och förekommer vanligtvis i jord, vatten och föda. Bakterien kan orsaka infektioner i sällsynta fall, ofta hos personer med nedsatt immunförsvar eller vid medicinska ingrepp som stör den normala bakteriefloran i tarmen. Infektioner orsakade av 'Clostridium kluyveri' kan vara svåra att behandla på grund av bakteriens resistens mot många antibiotika.
Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) definieras en oxo-syra-lyas som:
"En enzym som katalyserar reaktionen där en oxo-syra avspjälas från en substratmolekyl genom att bryta en kol-kol-bindning."
Oxo-syror är organiska syror som innehåller en karboxylgrupp (-COOH) och en keton- eller aldehydgrupp (-C=O). Exempel på oxo-syror är pyroventsyra (PVA, C5H4O3) och α-ketoglutarsyra (AKG, C5H6O5).
En oxo-syra-lyas bryter därför en kol-kol-bindning i substratet och avlägsnar en oxo-syregrupp som produkt. Detta är viktigt inom cellens metabolism, till exempel vid nedbrytningen av aminosyror i citronsyracykeln.
Alkoholoxidoreduktas är ett enzym som katalyserar oxidationen av alkoholer till aldehyder eller ketoner, samtidigt som reducerande ämnen (t.ex. NAD+/NADP+) reduceras till deras motsvarande reducerade former (t.ex. NADH/NADPH). Detta enzym är också känt som alkoholdehydrogenas (ADH). Det finns olika typer av alkoholoxidoreduktaser, men de flesta av dem finns i levern och har en viktig roll i alkoholmetabolismen.
'Thermus thermophilus' är en art av extremofila bakterier som lever under höga temperaturer och har därför utvecklat en optimal tillväxttemperatur på omkring 70-75°C. Denna bakterie hör till släktet Thermus, som ingår i familjen Thermaceae inom fylumet Deinococcus-Thermus. 'Thermus thermophilus' förekommer naturligt i heta källor och andra högtempererade miljöer, såsom varma källvatten och geotermiska områden.
Bakterien är också välkänd för sin förmåga att producera en extremt termostabil DNA-polymeras, Taq-polymeras, som används flitigt inom molekylärbiologi och PCR (polymeraskedjereaktion). Taq-polymeras är aktivt upp till temperaturer på 95-100°C och har därför blivit ett viktigt verktyg för att kopiera DNA-sekvenser under de höga temperaturer som krävs i PCR-reaktioner.
'Thermus' är ett släkte av extremofila bakterier som först upptäcktes i termala källor i Yellowstone nationalpark i USA. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att trivas vid mycket höga temperaturer, upp till 70-80°C, och kan hitta i andra extrem miljöer som marina hydrotermiska ventilationsöppningar. 'Thermus' bakterier är också kända för att producera ett enzym kallat Taq-polymeras, som används flitigt inom molekylärbiologi för att amplifiera DNA-sekvenser genom PCR (polymeraskedjereaktion).