Polyketides are a diverse group of natural compounds synthesized biochemically by a modular assembly line process that involves the condensation of acetate or propionate units. These complex molecules are produced by various organisms, including bacteria, fungi, and plants, and have significant medical and pharmaceutical importance due to their wide range of bioactivities, such as antibiotic, antifungal, anticancer, and immunosuppressant properties. Polyketides' structural diversity arises from the different combinations of building blocks, the length and type of the carbon chain, and the various tailoring modifications during their biosynthesis.

EC 2.3.1.-.

En grupp makrocykliska föreningar som bildas genom kedjeförlängning av flera propionater och cykliseras till en stor, (vanligen 12-, 14-, 16-) ledad laktonmolekyl. De är ofta glykosylerade. Många av dem är antibiotiska.

Streptomyces är ett släkte av grampositiva, strikt aeroba bakterier som tillhör ordningen Actinomycetales. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att producera en rad olika antibiotika och andra bioaktiva metaboliter, vilket gör dem viktiga inom biomedicinsk forskning. Streptomyces-arterna har en komplex livscykel som inkluderar sporbildande hyfer och vegetativa mycel. De förekommer naturligt i en rad olika miljöer, till exempel jord, vatten och på levande växter.

"Biosynthetic pathways refer to the series of biochemical reactions in cells that lead to the production of specific molecules, such as proteins, lipids, or carbohydrates, from simpler precursors."

En klass bakterier med varierande morfologiska egenskaper. Stammar av Actinobacteria har mer än 80% 16SrRNA-sekvensöverensstämmelse sinsemellan, samt vissa signaturnukleotider.

Saccharopolyspora är ett släkte av grampositiva, sporbildande och aeroba aktinobakterier. Dessa bakterier producerar ofta yttre höljen runt sig själva som ger dem en karaktäristisk koloni Morphology med en halo-liknande struktur. Släktet innehåller flera arter, varav den mest kända är Saccharopolyspora erythraea, som producerar det antibiotiska ämnet Erytromycin. Saccharopolyspora-arter förekommer vanligtvis i naturen i mark, vatten och luft, men kan också orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunförsvagna individer.

En antracenring med två ketondelar i någon position. I alla positioner utom på ketongruppernas plats kan substitutioner ske.

Ett släkte askomycetsvampar i familjen Hypocreaceae som omfattar flera arter som framkallar sjukdom hos sädesslagen. Svamparna är även källa för växtreglerande ämnen (växthormoner) som gibberellin och gibberellinsyra.

I den medicinska kontexten, är "pyro" ett prefix som betyder "relaterad till eld eller värmeförbränning". Men det finns inget etablerat medicinskt begrepp eller diagnos som heter "Pyroner". Om du avser att fråga om någon specifik medicinsk tillstånd eller symptom, kan du vänligen ge mer information.

System av enzym som verkar i följd genom att katalysera på varandra följande reaktioner sammankopplade med gemensamma metabola intermediärer. De kan medverka i en enkel omsättning av vattenmolekyler eller väteatomer, eller vara förknippade med stora supramolekylära strukturer som mitokondrier eller ribosomer.

Ett släkte askomycetsvampar tillhörande familjen Chaetomiaceae, av ordningen Sordiriales. Många medlemmar bryter ned cellulosa, och vissa är mykotoxiska. De förekommer naturligt på papper och bomullst extilier.

"Oxitetracycliner är en grupp av brett verksamma antibiotika som står för sin bakteriestatiska aktivitet genom att hämma proteinsyntesen hos bakterier. De används vanligtvis för behandling av olika infektioner orsakade av både grampositiva och gramnegativa bakterier, såsom lunginflammation, hudinfektioner och urinvägsinfektioner. Oxitetracykliner har även visat sig vara verksamma mot vissa parasiter och protozoer."

Peperomia är ett släkte inom familjen pepparväxter (Piperaceae) som består av cirka 1500 arter. De flesta Peperomia-arterna är små, tropiska örter med köttiga blad och stjälkar. Många av arterna odlas som rumsväxter på grund av deras dekorativa utseende och lättodlande egenskaper. Det bör dock poängteras att Peperomia inte är en medicinsk term, utan snarare en botanisk benämning på ett släkte av växter.

Zearalenon är ett mycotoxin, eller svampgift, som produceras av vissa arter av svampar inom släktet Fusarium. Det kan infektera grödor som majs, vete och hö, vilket kan leda till kontaminering av dessa livsmedel och djurfoder. Zearalenon har förmågan att binda till estrogenreceptorer i djurs och människors kroppar, vilket kan orsaka hormonella störningar och reproduktiva effekter som missfall, fetma hos ungar och könscelleravstötning.

Plakortis är ett släkte av svampdjur som tillhör klassen Demospongiae och ordningen Homosclerophorida. Dessa marina djur kännetecknas av sin cellstruktur, som innehåller små spikar och speciella fiber som ger stöd och form. Plakortis-arter förekommer främst i tropiska och subtropiska havsområden över hela världen. De lever vanligtvis fastsatta till hårda underlag, såsom klippor eller korallrev. Släktet innehåller ett tjugotal beskrivna arter, varav några är kända för att producera bioaktiva ämnen som kan ha potential inom medicinsk forskning och utveckling av läkemedel.

Den inbördes placeringen av atomer, atomgrupper eller joner i en molekyl, samt antal, typ av och plats för kovalenta bindningar.

Omvandling av en öppen kolvätekedja till en sluten ring. Syn. cyklisering.

Ett fylum (en stam) små, vattenlevande och kolonibildande djur. Vissa påminner om koraldjur och bildar rev, men de har en mer komplicerad inre struktur. De flesta bildar beläggningar på tång och sten. Syn. mossdjur; Ectopracta.

"Peptidbiosyntese, nukleinsyraoberoende" refererer til en biokemisk proces hvor peptider syntetiseres uten bruk av nukleinsyrer som RNA eller DNA som skabelon. I stedet brukes en ikke-nukleinsyrebasert mekanisme, ofte involverende enzymatiske reaksjoner, for å koble aminosyrer sammen i en bestemt sekvens for å forme et peptidmolekyle. Dette er i kontrast til den mest alminnelige formen av peptidbiosyntese, som er nukleinsyra-avhengig og involverer transskripsjon og translasjon av genetisk informasjon fra DNA via mRNA for å styre peptidsyntesen.

Cykliska estrar av hydroxikarboxylsyror, med en 1-oxacykloalkan-2-on-struktur. Stora, cykliska laktoner med fler än ett dussin atomer är makrolider.

Farmaceutiska ämnen eller föreningar av organiskt ursprung och vanligen framställda med biologiska metoder, och som för sin verkan är beroende av immunologisk aktivitet. De används för både diagnos oc h behandling (t ex pollenextrakt och vacciner).

En uppsättning gener som genom mångfaldigande och variation härstammar från någon ursprunglig gen. Sådana gener kan sitta tillsammans på samma kromosom eller vara utspridda på olika kromosomer. Exempel på multigenfamiljer är de som kodar för hemoglobiner, immunglobuliner, histokompatibilitetsantigener, aktiner, tubuliner, keratiner, kollagener, stressproteiner, salivproteiner, korioproteiner, membranproteiner, ägguleproteiner och faseoliner, och även histoner, ribosom-RNA och tRNA-gener. De tre senare utgör exempel på upprepningsgener, av vilka det finns hundratals identiska i tandemformationer.

NAFTA är en akronym som står för Nordamerikanska frihandelsavtalet (North American Free Trade Agreement). Detta var ett handelsavtal mellan Kanada, Mexiko och USA som undertecknades 1994 och upphörde officiellt den 1 juli 2020.

Riktad modifiering av genuppsättningen hos en levande organism genom ändring av DNA, utbyte av genetiskt material med hjälp av t ex virus, transplantation av cellkärnor, transplantation av cellhybrider osv.

Marinbiologi är ett forskningsfält som handlar om studiet av organismer och ekosystem som lever i marina (havs) miljöer.

'Streptomyces coelicolor' är en art av grampositiva bakterier som tillhör släktet Streptomyces och familjen Streptomycetaceae. Den är känd för sin förmåga att producera ett antal olika antibiotika, inklusive aktinorhodin, undecylprodigiosin och calciumdependentant cyklopeptid. 'Streptomyces coelicolor' används ofta som en modellorganism inom forskning om bakteriers sekundära metabolism, genetik och cellbiologi.

Ett koenzym A-derivat som spelar en nyckelroll vid fettsyrasyntesen i cytoplasma- och mikrosomsystem.

S-acylkoenzym-A. Derivat av fettsyrakoenzym-A som ingår i biosyntes och oxidation av fettsyror samt i bildande av ceramid.

Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.

Myxococcales är en ordning inom domänen Bakterier (Bacteria) som inkluderar de så kallade myxobakterierna. Dessa bakterier är kända för sin sociala beteende och deras förmåga att bilda multicellulära strukturer, såsom fruktkroppar, under speciella förhållanden. Myxobakterier lever främst i jord- och vattenmiljöer där de livnär sig på andra bakterier genom att producera antibiotiska ämnen och sedan utsöndra enzymer som bryter ner deras byten till näringsriktiga molekyler. Myxobakteriernas sociala beteende och förmåga att bilda fruktkroppar gör dem till ett intressant forskningsområde inom bland annat cellulär differentiering, signalsubstanser och kooperativt beteende hos bakterier.

Består av en polypeptidkedja och 4´-fosfopantetein kopplade till en serinrest med en fosfodiesterbindning. Acylgrupper binds som tiolestrar till pantotenylgruppen. Acylbärarprotein ingår i alla steg i cytoplasmasystemets fettsyrasyntes.

I biokemin refererar 'polyener' till molekyler som innehåller flera (poly) energirika fosfatbindningar (enER). Dessa bindningar kan dissocieras för att frigöra energi, vilket gör polyener till viktiga energikällor i cellulära processer. Exempel på polyener är ATP (adenosintrifosfat) och GTP (guanosintrifosfat).

En peptidsyntase är ett enzym som katalyserar reaktioner involverade i skapandet av peptidbindningar mellan aminosyror för att bilda peptider eller proteiner.

Stereoisomerism är en form av isomeri, där två eller fler molekyler har samma kemiska formel och struktur, men differar i rumslig orientering av deras atomgrupper. Detta innebär att de har samma typ och antal atomer, men skiljer sig åt genom att vara speglar av varandra, liknande vänster- och högerhanden, vilket kallas att vara en form av "enantiomerer". Stereoisomeri är viktigt inom farmakologi eftersom olika stereoismoriska former av samma molekyl kan ha olika biologiska aktivitet och effekter på levande organismer.

Enzymer i transferasklassen som katalyserar överföringen av en acylgrupp från en kemisk förening (givare) till en annan (acceptor). EC 2.3.

Ett bakteriostatiskt, antibiotiskt ämne som produceras av Streptomyces erythreus. Erytromycin A anses vara den beståndsdel som har störst verkan. Hos känsliga organismer hämmar det proteinsyntesen genom att binda till 50S-ribosomala underenheter. Denna bindning blockerar peptidyltransferasaktiviteten och stör överflyttning av aminosyror under translationsprocessen och proteinsammansättningen.

Den genetiska massan hos bakterier.

Ett rike av eukaryota, heterotrofa organismer som lever som saprofyter eller parasiter, omfattande svampar, jästarter, mögel osv. De kan fortplanta sig sexuellt eller asexuellt och ha mer eller mindre komplexa livscykler. Trådsvampar bildar flercelliga kolonier.

Spektroskopimetod för mätning av det magnetiska momentet hos elementärpartiklar, så som atomkärnor, protoner eller elektroner. Tekniken har kliniska tillämpningar i form av NMR-tomografi (magnetisk resonanstomografi).

Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.

Proteiner förekommande hos någon bakterieart.

Protein engineering är ett samlingsbegrepp för de metoder och tekniker som används för att skapa, utveckla och justera proteiner med önskade egenskaper genom direkt manipulation av deras aminosyrasekvens och/eller tertiärstruktur. Detta kan uppnås genom användning av molekylärbiologiska tekniker, såsom mutagenes, rekombinant DNA-teknik och strukturbaserad design, för att skapa gener med önskade modifieringar som sedan exprimeras som proteiner med nya eller förbättrade funktioner.

Släktskapsförhållanden mellan grupper av organismer, baserade på deras genuppsättningar.

Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.

En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.