Cyclin T
Cyclin T är ett protein som hör till familjen av cyklinproteiner och spelar en viktig roll i cellcykeln. Cyclin T kopplas till och aktiverar en specifik kinase, CDK9 (Cyclin-dependent kinase 9), för att bilda komplexet P-TEFb (Positivt transcriptionsfaktor b). Detta komplex är involverat i transkriptionell kontroll genom fosforylering av CTD (Carboxyterminal domain) hos RNA-polymeras II, vilket leder till elongationen av mRNA-syntesen. Cyclin T har också visat sig vara involverad i andra cellulära processer som DNA-reparation och apoptos.
Cyklin D1
Protein, kodat av bcl-1-genen, som spelar en avgörande roll i cellcykelregleringen. För stort uttryck av cyklin D1 beror på omkastning i bcl-1-genen, en t(11;14)-translokering, och är förknippat med diverse tumörer.
Cyklin A
Cyklinberoendekinas 9
Cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) är ett enzym som hör till familjen av serin/treoninkinaser och spelar en viktig roll i regleringen av transkription genom att fosforylera flera proteiner involverade i denna process. CDK9 bildar komplex tillsammans med cyklin T och är aktivt under hela cellcykeln, men är speciellt viktigt för initiering och elongation av transkription av protein kodande gener genom att fosforylera RNA-polymeras II.
Cyklin E
Ett 50 kD-protein som bildar komplex med cdk2 sent i cellcykelns G1-fas.
Positive Transcriptional Elongation Factor B
Cykliner
Reglerproteiner som i cellcykeln aktiverar MPF (en cellmognadsfaktor). De bildar komplex med protein p34cdc2, som är cellmognadsfaktorns katalytiska enhet, och modulerar dess proteinkinasaktivitet. Cykliner har i sig själva ingen enzymatisk verkan.
Cyclin B1
Cyclin B1 är ett protein som spelar en viktig roll i cellcykeln, särskilt under den mitotiska skedet när cellen delar sig för att bilda två identiska dotterceller. Cyclin B1 binder till och aktiverar en kinas enzymkomplex kallad CDK1 (Cyclin-dependent kinase 1), som reglerar intrångningen i mitosen genom att fosforylera olika substrat. Nivåerna av cyclin B1 stiger under G2-fasen av cellcykeln och når sin topp just innan cellen går in i mitos. Efter mitosen och cellens delning bryts down cyclin B1, vilket leder till att CDK1 inaktiveras och cellcykeln stoppas tills nästa G1-fas.
Cyclin D2
Cyclin D2 är en typ av cyklin, som är proteiner involverade i cellcykeln och celldelningen. Cyclin D2 binder till och aktiverar CDK4 eller CDK6 kinaser, vilket leder till fosforylering av retinoblastomproteinet (pRb) och på så sätt frigör transkriptionsfaktorer som E2F, vilka stimulerar celldelningen. Cyclin D2 uttrycks främst under G1-fasen av cellcykeln och spelar därför en viktig roll i kontrollen av cellcykelns ingångsfas.
Cyclin D3
Cyclin D3 är ett protein som hör till cyclinfamiljen och spelar en viktig roll i cellcykeln. Cyclin D3 binds till och aktiverar cyklinberoende kinas 4 och 6 (CDK4/6), vilket leder till fosforylering av retinoblastomproteinet (pRb) och därmed progression från G1-fasen till S-fasen i cellcykeln. Cyclin D3 uttrycks främst under G1-fasen och är känsligt för nedreglering av tumörsuppressorgenen p16, vilket gör att överaktivering eller överexpression av Cyclin D3 kan leda till onkogenesis.
Cyclin A1
Cyclin A1 är ett protein som hör till familjen av cykliner, molekyler involverade i celldelningens reglering. Cyclin A1 binder och aktiverar cyklindependent kinas 2 och 3 (CDK2/3) under G2-fasen av interfasen och tidig anafas i mitosen. Detta komplex reglerar olika processer som är nödvändiga för celldelning, inklusive DNA-replikering, kromosomseparation och celldelning. Cyclin A1 har också visat sig spela roller i cellcykeln oberoende av CDK-aktivering, såsom att reglera transkription och DNA-reparation. Anormalt uppehåll eller förändringar i cyklin A1 kan leda till onormal celldelning och potential cancerogenes.
Cyclin A2
Cyclin A2 är ett protein som hör till cyklinfamiljen och spelar en viktig roll i celldelningen under G1-fasen och S-fasen av cellcykeln. Cyclin A2 binder till och aktiverar cyklindependent kinas 1 och 2 (CDK1 och CDK2), vilket leder till fosforylering av olika substrat och reglering av celldelningen. Nivåerna av cyclin A2 stiger under G1-fasen, når ett peak under S-fasen och degraderas sedan under G2-fasen och M-fasen av cellcykeln.
Cyclin D
Cyclin D är ett typ av cyklin, som är proteiner involverade i cellcykeln och celldelningen. Cyclin D är specifikt associerad med G1-fasen av cellcykeln. Den bildas i respons till mitogen signaler (till exempel tillväxtfaktorer) som binder till receptorer på cellens yta och aktiverar intracellulära signalslingor. Cyclin D binds till och aktiverar cyklin-beroende kinas 4 och 6 (CDK4/6), vilket leder till fosforylering av retinoblastomproteinet (pRb) och frigörandet av E2F-transkriptionsfaktorer, som aktiverar transkriptionen av gener involverade i DNA-syntesen. På så sätt spelar Cyclin D en viktig roll i regleringen av celldelningen och celltillväxten.
Genprodukter, tat
Transaktiva transkriptionsfaktorer bestående av kärnproteiner som är nödvändiga för virusreplikation hos HIV. tat-proteinet stimulerar HIV-LTR-styrd RNA-syntes för såväl regler- som strukturproteiner. tat är förkortning för transaktivering av transkription.
tat Gene Products, Human Immunodeficiency Virus
Tat proteins are accessory gene products of the Human Immunodeficiency Virus (HIV) that play a crucial role in the replication and pathogenesis of the virus. The Tat protein is a transcriptional transactivator, meaning it increases the transcription of the viral genome, leading to increased production of viral particles. This protein is essential for HIV replication and is a target for potential antiretroviral therapies.
Cyklinberoende kinaser
Proteinkinaser som kontrollerar cellcykelns gång hos alla eukaryoter och som kräver förbindelse med cykliner för att nå sin fulla enzymatiska verkan. Cyklinberoende kinaser styrs av fosforylerings- och defosforyleringsprocesser.
Cyclin G1
Cyclin G1 är ett protein som hör till familjen av cyklinproteiner, vilka är involverade i celldelningen och reglerar cellcykeln genom att interagera med olika kinaser. Cyclin G1 syntetiseras under G1-fasen av cellcykeln och når sin högsta koncentration under den sena G1-fasen och tidiga S-fasen. Det binder till och aktiverar kinasen CDK2, vilket leder till fosforylering av olika målproteiner som är involverade i celldelningen. Cyclin G1 har också visat sig ha en roll i DNA-skadors svar och cellcykelns kontroll efter DNA-skada.
Cyclin G
Cyclin G är ett protein som hör till cyclinfamiljen och spelar roller i cellcykelkontroll och apoptos (programmerad celldöd). Det reglerar bland annat aktiviteten hos kinaser som är involverade i cellcykelns kontroll. Cyclin G kan också spela en roll i responser på DNA-skador. Proteinet uttrycks främst under G1-fasen och i jämn del av cellcykeln, men dess exakta funktioner och mekanismer är fortfarande under forskning.
Cyclin C
Cyclin C är ett protein som spelar en viktig roll i cellcykeln hos eukaryota celler. Det binder till och aktiverar kinaset CDK3 (Cyclin-dependent kinase 3), vilket reglerar ingången till den sena G1-fasen av cellcykeln. Cyclin C/CDK3-komplexet är också involverat i transkriptionsreglering genom fosforylering av RNA-polymerase II och transkriptionsfaktorer som till exempel TFIIB. I onormala situationer kan förhöjda nivåer av Cyclin C leda till oreglerad celldelning och cancer. Dessutom har Cyclin C visat sig ha en roll i programmerad celldöd (apoptos) under speciella omständigheter. Sammanfattningsvis är Cyclin C ett viktigt regulatoriskt protein som hjälper till att kontrollera cellcykeln och celldelningen, men dess onormala funktion kan leda till allvar
Cyclin B2
Cyclin B2 är ett protein som hör till cyclinfamiljen och spelar en viktig roll i cellcykeln hos eukaryota celler. Cyclin B2 binds till och aktiverar CDK1 (cyklindependenta kinas 1), vilket bildar komplexet Cyclin B2-CDK1. Detta komplex reglerar intracellulära processer som är involverade i cellcykelns G2-fas och mitos. Specifikt initierar Cyclin B2-CDK1 komplexet den mitotiska skiljningen av kromosomer och kontrollerar inträdet till mitosen. Nivåerna av Cyclin B2 ökar under cellcykelns G2-fas och når sin topp under profasen, varefter de minskar under mitosen på grund av proteasomdegradering.
Långt repetitionsöverhäng, HIV
Reglersekvenser, viktiga för virusreplikation, belägna i båda ändar av HIV-genomet. Det långa repetitionsöverhänget (LTR) innehåller HIV-förstärkaren, promotorn och andra sekvenser. Specifika områden i LTR omfattar det negativa reglerelementet (NRE), bindningsställen för NF-kappa B och Sp1, tataboxen och "trans-acting responsive element" (TAR). Bindning av såväl cell- som virusproteiner till dessa områden styr HIV-transkriptionen.
Cyklinberoendekinas 2
Cyclin-dependent kinase 2 (CDK2) är ett enzym som spelar en viktig roll i cellcykeln, den process där celler delar sig och växer. CDK2 aktiveras av cykliner, proteiner vars nivåer varierar under olika faser av cellcykeln. CDK2-komplexet hjälper till att reglera celldelningens kontrollpunkter och säkerställa att celldelningen sker korrekt. Defekter i CDK2 kan leda till oregelbunden cellcykel och potential för cancerutveckling.
Cyclin G2
Cyclin G2 är ett protein som hör till familjen av cyklinproteiner, som regulerar cellcykeln genom att interagera med olika kinaser. Cyclin G2 är specifikt involverat i regleringen av celldelningen och kan påverka cellers överlevnad och död. Det uttrycks främst under G1-fasen av cellcykeln, men kan även ha en roll under G2-fasen. Cyclin G2 har också visat sig vara involverat i celldifferentiering och svar på DNA-skador.
Cyclin H
Cyclin H är ett protein som hör till cyklinfamiljen och spelar en viktig roll i cellcykeln. Det bildar tillsammans med CDK7 komplexet, även känt som cyklin-dependent kinase 7 (CDK-aktiverande komplex), vilket är involverat i transkriptionsinitiering och cellcykelreglering. Cyclin H har sin högsta koncentration under G1-fasen och börjar avta under G1/S-gränsen, för att sedan öka igen under den senare delen av cellcykeln.
Cellcykel
En komplex följd av händelser, som inträffar mellan slutet av en celldelning och slutet av nästa, varigenom cellmaterial delas upp mellan dottercellerna.
Cyklinberoendekinas 4
"Cyclin-dependent kinase 4 (CDK4) är ett enzym som reglerar cellcykeln genom att aktivera övergången från G1-fas till S-fas. Det gör detta genom att fosforylera retinoblastomproteinet (pRb), vilket leder till frigörelse av transkriptionsfaktorer och på så sätt initierar DNA-replikation."
CDC2-CDC28-kinaser
CDC2 and CDC28 refer to cyclin-dependent protein kinases (CDKs) that play crucial roles in regulating the cell cycle, which is the series of events that take place as a cell grows, copies its DNA, and divides into two daughter cells. CDKs are enzymes that add phosphate groups to other proteins, thereby modifying their function.
HIV-1
Transkription, genetisk
CDC2-proteinkinas
CDC2-proteinkinase, även känt som cyclin-dependent kinase 1 (CDK1), är ett enzym som spelar en central roll i cellcykeln hos eukaryota celler. Det aktiveras av cyklin B och är involverat i kontrollen av celldelningen genom att fosforylera andra proteiner, vilket reglerar deras funktion. CDC2-proteinkinaset är kritiskt för ingången till mitosen, den fas av cellcykeln då cellkärnan och kromosomerna delas.
G1-fas
G1-fas, också känd som G1-fasen eller G1-skedet, är den första fasen i cellcykeln hos eukaryota celler. Under denna fas sker celldelningen inte ännu, utan cellen förbereder sig istället för DNA-replikation genom att öka storleken och syntetisera nya proteiner och organeller. G1-fasen kan delas in i tre olika faser: G1 early, G1 middle och G1 late. Under den senare delen av G1-fasen, G1 checkpointen, kontrollerar cellen om den är redo att gå vidare till S-fasen (syntesfasen), där DNA replikeras. Om alla nödvändiga villkor inte är uppfyllda kommer celldelningen att stoppas och cellen kommer istället att gå in i en quiescent fas, G0.
Hela-celler
Protein-serin-treoninkinaser
Protein-serin-treonin kinases are a type of enzyme that plays a crucial role in various cellular processes by adding phosphate groups to serine and threonine residues on target proteins. This post-translational modification can activate or inhibit the function of these proteins, thereby regulating signal transduction pathways involved in cell growth, differentiation, metabolism, and survival. Dysregulation of protein-serin-treonin kinases has been implicated in numerous diseases, including cancer, diabetes, and neurodegenerative disorders.
Cellcykelproteiner
Proteiner som kontrollerar celldelningscykeln. Denna proteinfamilj omfattar ett stort antal klasser, inklusive cyklinberoende kinaser, mitogenaktiverade kinaser, cykliner och fosfoproteinfosfataser, s amt deras förmodade substrat, så som kromatinassocierade proteiner, cytoskelettproteiner och transkriptionsfaktorer.
Fosforylering
RNA-polymeras II
Cyklinberoendekinashämmare p27
"Cyclin-dependent kinase inhibitor p27" refers to a protein that regulates the cell cycle by inhibiting the activity of cyclin-dependent kinases, which are enzymes that play a crucial role in controlling the progression of the cell cycle. The p27 protein functions as a tumor suppressor by preventing cells from dividing too rapidly or in an uncontrolled manner, and its expression is often reduced in various types of cancer.
Proteinbindning
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
S-fas
S-fase (Syntese-fase) er en fase i cellers delingsprosess, kaldet cellcyklus. Under S-fasen syntesiserer cellen ny DNA for at forberede sig på celldeling, hvorved cellens genetiske materiale bliver duplikeret. Dette sker således, at hver dattercelle, der dannes under celldelingen, får en kopi af modercellens DNA.
Reglering av genuttryck, virus
Retinoblastomprotein
Retinoblastomproteinet (Rb-proteinet) är ett tumörsuppressorprotein som spelar en viktig roll i cellcykeln och celldifferentieringen, särskilt i ögats retinalceller. Det produceras av RB1-genen och hjälper till att kontrollera celldelningen genom att binda till transkriptionsfaktorer som E2F och förhindra deras aktivitet. När Rb-proteinet är inaktiverat frigörs E2F, vilket leder till cellcykelprogression och eventuellt oreglerad celldelning och cancertillväxt. Mutationer i RB1-genen kan orsaka avsaknaden eller funktionsnedsättningen av Rb-proteinet, vilket kan leda till Retinoblastom, en typ av ögontumör som ofta drabbar barn under 5 års ålder.
Cyclin I
Cyclin I är ett protein som tillhör familjen av regulatoriska proteiner, kallade cycliner, som spelar en viktig roll i cellcykeln hos eukaryota celler. Cyclin I är specifikt involverat i kontrollen av meiosen, en typ av celldelning som sker under produktionen av könsceller.
Smittsam hästanemivirus
Diklororibofuranosylbensimidazol
Molekylsekvensdata
RNA-bindande proteiner
RNA-binding proteins (RBPs) are a type of protein that selectively interact with RNA molecules, playing crucial roles in post-transcriptional regulation of gene expression. They can bind to various structural elements within RNA, such as double-stranded RNA, single-stranded RNA, hairpins, and other secondary structures, influencing RNA processing, stability, localization, and translation. The specificity of RNA-protein interactions is determined by the recognition of distinct RNA sequences and/or structural motifs through the modular domains present in RBPs.
Immunbristvirus, bovint
Mitos
Cellinje
I medicine refererer "cellinje" til en gruppe af celler med ensartet funktion og opbygning, der samarbejder for at udføre en specifik biologisk proces eller opgave i et levende organisme. Celliner er ofte specialiserede i deres struktur og funktion for at udføre deres rolle effektivt, og de kan findes i alle levende organismer, fra encellet bakterie til komplekse flercellede dyr og planter.
Two-Hybrid System Techniques
Two-hybrid system techniques are a group of genetic methods used in molecular biology to detect and study protein-protein interactions within living cells. These techniques are based on the modular nature of transcription factors, which consist of two separate domains: one for DNA binding and another for transcription activation. In a two-hybrid system, these two domains are split and linked to two proteins of interest (target proteins). When the target proteins interact, the functional transcription factor is reconstituted, leading to the expression of a reporter gene. The activity of the reporter gene serves as an indicator of protein-protein interaction, allowing researchers to identify and analyze specific interactions between proteins in a high-throughput manner.
Onkogenproteiner
Onkogenproteiner är proteiner som bildas från onkogener, som är gener som kan orsaka cancer när de muterar eller överaktiveras. Dessa proteiner kan påverka celldelning, cellcykelkontroll, apoptos (programmerad celldöd) och andra signaltransduktionsvägar som kan leda till onkogenes (cancerframkallande) effekter.
bcl-1-gener
Cyclin-Dependent Kinase 8
Cyclin-Dependent Kinase 8 (CDK8) är ett enzym som tillhör familjen serin/treoninkinaser och spelar en viktig roll i celldelningen och regleringen av genuttryck. CDK8 bildar komplex tillsammans med cyklin C, MED12 och MED13 och är involverat i aktivering och stängning av transkriptionsfaktorer som påverkar uttrycket av gener relaterade till celldelning, differentiering och cellcykelkontroll. CDK8 kan också vara involverad i andra cellulära processer såsom DNA-reparation och signaltransduktion.
Rekombinanta fusionsproteiner
Rekombinanta fusionsproteiner är proteiner som skapats genom att kombinera genetiska sekvenser från två eller fler olika proteinmolekyler, vilket resulterar i en hybridprotein med unika funktionella egenskaper. Genetisk manipulation används för att fusionera generna på ett sådant sätt att de uttrycks som ett enda proteinskapsel i värdenorganismen. Dessa tekniker används ofta inom biomedicinsk forskning för att undersöka proteininteraktioner, skapa nya diagnostiska verktyg och utveckla terapeutiska läkemedel.
Aminosyrasekvens
Promotorregioner, genetik
I en enkel mening kan promotorregionen inom genetiken definieras som den del av ett genetiskt material (DNA) där transkriptionsfaktorer binder till att initiera transkriptionen av ett specifikt gen. Promotorregionen ligger vanligtvis uppströms (5'-ändan) av det gen som ska transkriberas och innehåller ofta cis-regulatoriska element som reglerar genuttrycket genom att påverka bindningen av RNA-polymeras II, enzymet ansvarigt för transkriptionen av protein kodande gener.
tat-gener
Cellkärna
Cyklinberoendekinas 6
Cyclin-dependent kinase 6 (CDK6) är ett protein som hör till en grupp enzymer kallas serin/treoninkinaser, vilka reglerar cellcykeln genom att fosforylera (och därmed aktivera eller inaktivera) andra proteiner involverade i celldelningen. CDK6 bildar komplex tillsammans med cyklin D och är specifikt involverat i kontrollen av G1-fasen av cellcykeln. Detta enzym bidrar till att koordinera progressionen genom cellcykeln genom att reglera aktiviteten hos olika transkriptionsfaktorer och andra proteiner som är involverade i celldelningen, celldifferentiering och celltillväxt. Dysreglering av CDK6 har visats påverka cancerutveckling och progression, vilket gör det till en potential terapeutisk måltaxa för behandling av vissa typer av cancer.
RNA, budbärar
Cyklinberoendekinashämmar p21
"Cyklinberoendekinashämmare p21" refererar till ett protein som kallas CDKN1A eller p21, som hämmar cyklinberoende kinaser (CDK), en grupp enzymer involverade i celldelningen och cellcykelregleringen.
RNA, smått nukleärt
Kaseinkinas I
Transkriptionsfaktorer
Cellkärneproteiner
Virusförökning
Terminalsekvenser, upprepade
Terminale sekvenser, upprepade refererar till upprepningar av specifika DNA-sekvenser vid slutet av en kromosom, som är involverade i processen av kromosomreplikering och celldelning under celleväxthöjden, och deras upprepning kan vara associerad med åldrande och olika genetiska sjukdomar, inklusive neuromuskulära förhållanden och cancer.
NF90-proteiner
NF90 (nuclear factor 90) proteiner är en typ av regulatoriska proteiner som binder till DNA och RNA och spelar en viktig roll i cellytans biologiska processer, såsom cellcykelkontroll, differentiering och apoptos. De är kända för att variera i molekylvikt från 82 till 90 kDa och består av två underenheter, NF45 och NF90. NF90-proteinet innehåller en dsRNA-bindande domän (dsRBD) och är involverat i regleringen av genuttryck genom att påverka stabiliteten och translasionskapaciteten hos mål-mRNA. Det kan också agera som en transkriptionsfaktor när det interagerar med DNA.
Transfektion
Transfektion är en process där DNA, RNA eller andra molekyler överförs till eukaryota celler, ofta med syfte att introducera en specifik gen så att cellen kan producera ett protein som kodas av den genen. Detta kan göras för forskningsändamål, till exempel för att studera proteinet och dess funktion, eller för medicinska ändamål, till exempel för att ersätta en defekt gen hos en patient med ärftlig sjukdom. Transfektion kan ske med olika metoder, såsom elektroporering, kemisk transfektion eller viralvektorbaserad transfektion.
G2-fas
G2-fas, även känd som G2-fasen eller den andra gapfasen, är en del av cellcykelns interfas och föregår den mitotiska delen av cellcykeln. Under G2-fasen sker ytterligare DNA-reparation och proteinsyntes för att säkerställa att cellynukleotiden är korrekt och fullständig innan celldelningen inleds. Det är också en kontrollpunkt i cellcykeln där cellen kontrollerar om allt är redo för celldelning genom att undersöka om DNA-skadorna har reparerats korrekt och om det finns tillräckligt med resurser för att stödja celldelningen. Om alla kraven inte uppfylls kommer cellcykeln att stoppas eller fördröjas tills de är det.
NIH.3T3-celler
NIH 3T3 celler är en immortaliserad musmuscellinje som vanligtvis används inom grundläggande forskning för att studera celldifferentiering, signaltransduktion och genuttryck. Denna celllinje utvecklades ursprungligen från embryonala fibroblastceller hos mus (Mus musculus) och är nu etablerad som en standardcellinj i biomedicinsk forskning. NIH 3T3-celler har en normal kromosomal status och kan differensieras till adipocyter under speciella kulturförhållanden, vilket gör dem användbara för att studera fettcellsdifferentiering och relaterade sjukdomar.
Celler, odlade
Nedreglering
Cellproliferation
Alla de händelser som tillsammans leder till ökat antal celler. Häri ingår fler processer än celldelning, som utgör en del av cellcykeln.
3T3-celler
En cellinje som härstammar från fibroblaster från särade embryon av schweiziska möss. Linjen är ett värdefullt in vitro-värdsystem förtransformationsstudier av onkogena virus, eftersom 3T3-celler besi tter hög känslighet för kontaktinhibition.