Ras gef. Medicinsk sök. Definitionerna

Ras-GEF (Rat Sarcoma-Guanine Nucleotide Exchange Factor) är ett enzym som aktiverar Ras-proteinet genom att utbyta ett bundet GDP (guanosindifosfat) mot ett GTP (guanosintrifosfat). Detta leder till en konformationsförändring hos Ras-proteinet och därmed dess aktivering, vilket i sin tur kan leda till cellyckering eller celldelning. Ras-GEF spelar alltså en viktig roll i cellsignalering och kan vara involverat i onkogenes och tumörutveckling vid felreglering.

Proteinfaktorer som verkar för utbyte av GTP mot GDP bundet till GTP-bindande proteiner.

SOS1-proteinet är ett nedvärtningsskyddat GTPas-enzym som spelar en viktig roll inom cellsignalering, särskilt inom RAS/MAPK-signalslingapaden. Det hjälper till att aktivera RAS-proteinet genom att byta ut ett bundet GDP-molekyl mot ett GTP-molekyl. SOS1 står för "Son of Sevenless 1".

RAS-GFR1 (anglicky: Ras-guanine nucleotide dissociation stimulator) je protein, který se váže na receptor vaskulárního endotelového růstového faktoru 1 (VEGFR1) a stimuluje jeho aktivitu. Tento proces hraje důležitou roli v angiogenezi, která je nezbytná pro vývoj a růst nových cév. Mutace v genech kódujících RAS-GFR1 mohou být spojeny s některými zdravotními stavy, jako jsou rakovina a diabetická nefropatie. Nicméně, termín 'ras-GFR1' se obvykle nepoužívá v medicínské definici samostatně, ale spíše ve vědeckých kontextech pro popis specifických biologických mechanismů.

'Son of Sevenless' proteins (SOS) are a type of guanine nucleotide exchange factor (GEF) that play a crucial role in intracellular signaling pathways, particularly the Ras/MAPK pathway. SOS proteins activate Ras by facilitating the exchange of GDP for GTP, which leads to downstream signaling events involved in cell growth, differentiation, and survival.

Ras proteiner är en typ av signalsubstanser inom cellbiologi som hjälper reglera celldelning och cellyttväxling. De aktiveras genom att kopplas till G-proteiner och kan fungera som en sorts switch som aktiverar eller inaktiverar olika cellulära processer. Mutationer i Ras-generna kan leda till onkogenes och cancer.

Rho guanine nucleotide exchange factors (Rho-GEFs) are a group of proteins that play a crucial role in regulating the Rho GTPase family, which includes Rho, Rac, and Cdc42. These GTPases act as molecular switches, cycling between an active GTP-bound state and an inactive GDP-bound state. Rho-GEFs facilitate the exchange of GDP for GTP on these GTPases, thereby promoting their activation. This activation is essential for various cellular processes such as cytoskeleton reorganization, gene transcription, and cell cycle progression. Dysregulation of Rho-GEFs has been implicated in several diseases, including cancer and neurological disorders.

'GRB2-adaptorprotein', eller GRB2 (growth factor receptor bound protein 2), är ett cytoplasmatiskt adaptorprotein som spelar en viktig roll i intracellulära signaltransduktionsvägar, särskilt den mitogenaktiverade proteinkinas-vägen (MAPK). GRB2 fungerar som en länk mellan receptor tyrosinkinaser och nedströms effektorproteiner genom att binda specifika fosforylerade tyrosinresiduer på receptorer och SH3-domäner till effektorproteiner. Detta hjälper till att koordinera cellulär signalering i response till olika extracellulära stimuli som tillväxtfaktorer, cytokiner och tillväxtfaktorreceptorer.

Föreningar av guanosin och fosfatgrupper. De vanligaste är GMP (guanosinmonofosfat), GDP (guanosindifosfat) och GTP (guanosintrifosfat).

Protoncogene proteiner c-Vav refererar till en grupp av signalproteiner som spelar en viktig roll inom cellens signalsystem och kan bidra till onkogenes och cancerutveckling när de muterar eller överaktiveras. Specifikt är c-Vav-1, c-Vav-2 och c-Vav-3 tre isoformer av samma protoonkogen, som kodas av genen VAV1, VAV2 respektive VAV3. Dessa proteiner fungerar som GTPaser och har en reglerande roll i aktiveringen av Rho-GTPaser, vilket leder till celldelning, cellmigration och cytoskelettreorganisation. Dysfunktion eller överaktivering av dessa proteiner kan leda till onkogenes och cancerutveckling, särskilt i hematopoetiska celler.

Guanosin 5'-(trivätedifosfat). En guaninnukleotid med två fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen. Synonymer är GRPP och guanosinpyrofosfat.

En medlem i Rho-familjen av monomeriska GTP-bindande proteiner. Den är förenad med ett varierande spektrum av cellulära funktioner, bl a cellskelettförändringar, filopodiebildning och transport genom golgiapparaten. EC 3.6.1.-.

Guanosin 5'-(tetravätetrifosfat), en guaninnukleotid som innehåller tre fosfatgrupper, förestrade till sockerdelen.

Rac1 är ett GTP-bindande protein som tillhör Rho-familjen av små GTPaser och spelar en viktig roll i cellulär signalering relaterad till aktinocytoskelettet, cellytan och cellmotilitet. Rac1 fungerar som en molekylär switchn där den cyclerar mellan en inaktiv form (GDP-bundet) och en aktiv form (GTP-bundet) för att reglera olika cellulära processer, inklusive celldelning, vesikulär trafficking och celldifferentiering. Aktivering av Rac1 initierar signaltransduktion via olika effektorproteiner som aktiverar cytoskelettreorganisation, generering av reaktiva syreföreningar och cellproliferation. Dysreglering av Rac1 har visats vara involverat i patologiska tillstånd såsom cancer, neurodegenerativa sjukdomar och kardiovaskulära sjukdomar.

Rho GTP-bindande proteiner är en familj av små G-proteiner som fungerar som molekylära switche inom cellen, cycling mellan en aktiverad, GTP-bundet form och en inaktiverad, GDP-bundet form. De spelar en viktig roll i regulationen av cytoskelettet och cellens rörelser, såsom celldivision, cellmigration och cytokeinesis. Rho GTP-proteiner aktiveras av upstream-signaltransduktionsvägar och fungerar sedan som effektorer för att påverka cellytan och cytoskelettet genom att interagera med andra proteiner, till exempel kinaser och effektorer av actin.

Monomeriska GTP-bindande proteiner som ursprungligen påvisades som allosteriska aktivatorämnen för NAD(P)(+)-argenin-ADP-ribosyltransferas i den katalytiska subenheten av koleratoxin. De är engagerade i kärltransport och aktivering av fosfolipas D. EC 3.6.1.-.

"Rac GTP-binding proteins are a subfamily of the Rho GTPase family, which function as molecular switches that regulate various cellular processes, including actin cytoskeleton organization, gene expression, and cell survival. They cycle between an inactive GDP-bound state and an active GTP-bound state to transmit signals from membrane receptors to downstream effector proteins."

Rap1 (Ras-associated protein 1) GTP-bindande proteiner är en typ av G-proteiner som binder till och hydrolyserar GTP (guanosintrifosfat). Rap1 aktiveras när det binder till GTP och inaktiveras när det hydrolyserar GTP till GDP (guanosindifosfat). Rap1 är involverat i cellulär signaltransduktion och reglering av cellulära processer som celldelning, adhesion, migration och differentiering.

RhoA är ett medlemmar i Rho-familjen av små GTP-bindande proteiner, som fungerar som molekylära switche som cycler mellan en aktiverad, GTP-bundet form och en inaktiverad, GDP-bundet form. RhoA är involverat i regulationen av cytoskelettet och cellulär migration genom att styra aktinpolymerisation och stressfiberbildning.

En 145 kD-guaninnukleotidutbytesfaktor som är specifik för rap1- och ras-GTP-bindande proteiner. Den binder sig till SH3-domäner på signalproteiner i crk-familjen.

Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.

Proteiner som aktiverar GTPas hos specifika GTP-bindande proteiner.

I en enkel mening kan 'signalomvandling' inom medicin definieras som processen där celler konverterar inkommande signaler, ofta i form av hormoner, neurotransmittorer eller tillväxtfaktorer, till intracellulära svar genom en kaskad av biokemiska händelser. Detta kan leda till aktivering eller inhibitering av vissa cellulära funktioner och är en central mekanism i cellkommunikationen och regleringen av cellulär homeostas.

Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.

Proteiner är komplexa biomolekyler, byggda av aminosyror som kedjas samman i en polymer. De utför viktiga funktioner inom levande organismers celler, såsom att fungera som strukturella komponenter, hormoner, enzymer och signalsubstanser. Proteinernas specifika aminosyrasekvens bestämmer deras tertiärstruktur och därmed också deras funktionella egenskaper.

Reglerproteiner som verkar som molekylära omkopplare. De reglerar ett stort antal biologiska processer, inklusive receptorsignallering, intracellulära signalöverföringsvägar och proteinsyntes. Deras verkan kontrolleras av faktorer som styr deras förmåga att binda till och hydrolysera GTP till GDP.

Adaptorproteiner i signalöverföringen är strukturella proteiner som hjälper till att koppla receptorer till intracellulära signalsystem genom att verka som mellansteg och organisera signalkomplex, vilket leder till specificerad cellulär respons under homeostatiska och patologiska tillstånd.

En substans som deltar i regleringen av den intracellulära transporten genom att modulera samverkan mellan höljeproteiner och organellmembran på ett tidigt stadium i det sekretoriska förloppet. Den in går i höljeproteinkomplex I.

Enzymer som hydrolyserar GTP till GDP. EC 3.6.5.1.

"Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett protein, som resultat av specifika interaktioner mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-skikt."

I'm sorry for any confusion, but "ral-GDS" does not appear to be a recognized medical term or abbreviation in English medical literature. It is possible that there may be a misunderstanding or typo in the term you are looking for. If you have more context or information about where this term comes from, I'd be happy to help you try to find a definition or clarification.

"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."

En guaninnukleotidomvandlingsfaktor vars verkan är att återställa eIF-2 till dess GTP-bundna form. Syn. eukaryot initieringsfaktor 2B.

Rab GTP-bindande proteiner är en familj av små GTPas-proteiner som regulerar intracellulär trafficking av vesiklar och organeller inom eukaryota celler. De fungerar som molekylära switche genom att cycliskt binda och hydrolysera GTP, vilket aktiverar och inaktiverar deras funktioner respektive. Varje Rab-protein har en specifik subcellulär lokalisation och är involverat i olika steg av membrantrafiken, såsom budbudning, transport, fusion och klyvning. De spelar därför en viktig roll i celldelning, signaltransduktion, endocytos och exocytos, samt i homeostasen hos celler.

Ral GTP-binding proteins are a subfamily of the Ras superfamily of small GTPases, which function as molecular switches regulating various cellular processes, including vesicle trafficking, cytoskeleton reorganization, and cell proliferation. Ral proteins (RalA and RalB) bind to GTP and GDP and exist in an inactive state when bound to GDP. Upon activation by guanine nucleotide exchange factors (GEFs), they switch to the active GTP-bound form, which can interact with downstream effectors to mediate various cellular responses. Ral proteins are involved in several oncogenic pathways and have been implicated in cancer progression and metastasis.

'Rap GTP-bindande proteiner' är en typ av intracellulära signalproteiner som binder och hydrolyserar GTP (guanosintrifosfat) till GDP (guanosindifosfat). Dessa proteiner fungerar som molekylära switches i cellulär signaltransduktionsvägar, inklusive viktiga signaleringsvägar som reglerar celldelning, cellyta och cellmotilitet. Rap-proteinerna är en underfamilj av Ras-superfamiljen av GTPaser och de aktiveras och desaktiveras genom att byta mellan GTP- och GDP-bundna former med hjälp av olika regulatoriska proteiner.

Organisk bas, 6-oxi-2-aminopurin (C5H5N5O). Det ingår i guaninnukleotider.

Cellinje från den afrikanska grönapan som används för transfektion och kloning.

Proteinfaktorer som blockerar separation av GDP från GTP-bindande proteiner.

Nukleotider är de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA, molekyler som lagrar genetisk information och kodar för proteiner. En nukleotid består av en pentos-socker (ribosa eller deoxyribosa), en fosfatgrupp och en nitrogenbas. Nitrogenbaserna kan vara adenin, guanin, cytosin och uracil i RNA eller thymin i DNA. Nukleotider kopplas samman med varandra genom fosfatbrückor mellan sockerstrukturerna och bildar på så sätt långa polymerkedjor.

Rab5 GTP-binding proteins are a subfamily of the Rab family of small GTPases that play crucial roles in regulating intracellular membrane trafficking, particularly in early endocytic pathways. These proteins bind to guanosine triphosphate (GTP) and guanosine diphosphate (GDP), and they function as molecular switches that cycle between an active GTP-bound state and an inactive GDP-bound state. In their active form, Rab5 GTP-binding proteins interact with various effector molecules to regulate the formation of early endosomes, vesicle transport, membrane fusion, and signal transduction events. They are essential for proper endocytic cargo sorting, degradation, and recycling, and their dysfunction has been implicated in several human diseases, including cancer and neurodegenerative disorders.

Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.

En allmänt genetiskt uttryckt familj alfaunderenheter av heterotrimera GTP-bindande proteiner som signalerar genom samverkan med en rad olika andrabudbärare, som t ex GTPas-aktiverande proteiner, guaninnukleotidutbytesfaktorer och värmechockproteiner. G12-G13 skrivs ibland G12/G13.

Ett proteinkomplex bestående av coatomerprotein och ADP-ribosyleringsfaktor 1. Det ingår i transporten av blåsor (vesiklar) mellan det endoplasmatiska nätverket och golgiapparaten.

Omvandling av en inaktiv enzymform till en med metabolisk aktivitet, vilket inkluderar: 1) jonaktivering (aktivatorverkan); 2) kofaktor-/koenzymaktivering; 3) omvandling av enzymprekursor (proenzym eller zymogen) till aktivt enzym.

Varje påvisbar och ärftlig förändring i det genetiska materialet som medför ändrad genotyp och som överförs till dotterceller och efterföljande generationer.

En klass monomera GTP-bindande proteiner av låg molekylvikt (20-25 kDa) som reglerar en rad intracellulära processer. Den GTP-bundna formen av proteinet är aktiv och hämmas av sin inneboende GTPas-verkan, som regleras av ett antal olika GTPas-aktiverare, GDP-dissociationshämmare och guaninnukleotidbytesfaktorer. EC 3.6.5.2.

Införande av en fosforylgrupp i en förening genom bildande av en esterbindning mellan föreningen och en fosfordel.

I medicine refererer "cellinje" til en gruppe af celler med ensartet funktion og opbygning, der samarbejder for at udføre en specifik biologisk proces eller opgave i et levende organisme. Celliner er ofte specialiserede i deres struktur og funktion for at udføre deres rolle effektivt, og de kan findes i alle levende organismer, fra encellet bakterie til komplekse flercellede dyr og planter.

Proteiner som kontrollerar celldelningscykeln. Denna proteinfamilj omfattar ett stort antal klasser, inklusive cyklinberoende kinaser, mitogenaktiverade kinaser, cykliner och fosfoproteinfosfataser, s amt deras förmodade substrat, så som kromatinassocierade proteiner, cytoskelettproteiner och transkriptionsfaktorer.

Guanosin-5'-(trivätedifosfat), monoanhydrid med tiofosforsyra, är en stabil GTP-analog med en rad fysiologiska verkningar, så som stimulering av guaninnukleotidbindande proteiner, hydrolys av fosfoinositid, ackumulering av cykliskt AMP och aktivering av specifika protoonkogener.

P21-activated kinases (PAKs) are a family of serine/threonine protein kinases that play important roles in various cellular processes, including cytoskeleton reorganization, cell motility, and gene transcription. They are activated by binding to small GTPases of the Rho family, such as Cdc42 and Rac, which become active upon stimulation of cell surface receptors. Once activated, PAKs phosphorylate a variety of downstream targets that regulate various cellular functions, making them critical components in intracellular signaling pathways. Abnormal regulation of PAKs has been implicated in several diseases, including cancer and neurological disorders.

Two-hybrid system techniques are a group of genetic methods used in molecular biology to detect and study protein-protein interactions within living cells. These techniques are based on the modular nature of transcription factors, which consist of two separate domains: one for DNA binding and another for transcription activation. In a two-hybrid system, these two domains are split and linked to two proteins of interest (target proteins). When the target proteins interact, the functional transcription factor is reconstituted, leading to the expression of a reporter gene. The activity of the reporter gene serves as an indicator of protein-protein interaction, allowing researchers to identify and analyze specific interactions between proteins in a high-throughput manner.

En familj retrovirusassocierade DNA-sekvenser (ras) som ursprungligen isolerades från Harveys (H-ras, Ha-ras, rasH) och Kirstens (K-ras, Ki-ras, rasK) mussarkomvirus. Rasgenerna är välbevarade bland djurarterna, och sekvenser motsvarande såväl H-ras som K-ras har påvisats i genom från människa, fåglar, möss och ryggradslösa djur. Den närbesläktade N-rasgenen har påvisats i humana neuroblastom- och sarkomcellinjer. Samtliga gener i familjen har likartad exon-intronstruktur, och var och en kodar för ett p21-protein.

Rekombinanta fusionsproteiner är proteiner som skapats genom att kombinera genetiska sekvenser från två eller fler olika proteinmolekyler, vilket resulterar i en hybridprotein med unika funktionella egenskaper. Genetisk manipulation används för att fusionera generna på ett sådant sätt att de uttrycks som ett enda proteinskapsel i värdenorganismen. Dessa tekniker används ofta inom biomedicinsk forskning för att undersöka proteininteraktioner, skapa nya diagnostiska verktyg och utveckla terapeutiska läkemedel.

En cellinje som härstammar från fibroblaster från särade embryon av schweiziska möss. Linjen är ett värdefullt in vitro-värdsystem förtransformationsstudier av onkogena virus, eftersom 3T3-celler besi tter hög känslighet för kontaktinhibition.

Proteintransport refererer til den proces, hvor proteiner bliver transporteret gennem cellemembraner for at nå deres destination indenfor eller udenfor cellen. Dette sker ved hjælp af specielle transportproteiner, som kender vej og kan genkende de forskellige typer proteiner. Proteintransport er en nødvendig proces for at sikre, at cellen fungerer korrekt og at proteinerne kan udføre deres biologiske funktioner på det rigtige sted i organismen.

Eukaryot initieringsfaktor i proteinsyntesen. Faktorn består av tre underenheter: alfa, beta och gamma. När initieringen kommit igång bildar eIF-2 ett trippelkomplex med Met-tRNAi och GTP (guanosintrifosfat). Syn. eukaryot initieringsfaktor 2.

Transfektion är en process där DNA, RNA eller andra molekyler överförs till eukaryota celler, ofta med syfte att introducera en specifik gen så att cellen kan producera ett protein som kodas av den genen. Detta kan göras för forskningsändamål, till exempel för att studera proteinet och dess funktion, eller för medicinska ändamål, till exempel för att ersätta en defekt gen hos en patient med ärftlig sjukdom. Transfektion kan ske med olika metoder, såsom elektroporering, kemisk transfektion eller viralvektorbaserad transfektion.

Ran GTP-bindande protein är ett regulatoriskt protein som aktiveras av guanosintrifosfat (GTP) och desaktiveras genom hydrolys till guanosindifosfat (GDP). Det spelar en central roll i cellkärntransporten av makromolekyler, såsom proteiner och RNA, mellan cytoplasman och kärnan. Ran-proteinet hjälper till att reglera transporten genom att cycliskt växla mellan sin aktiverade GTP-bundna form och sin desaktiverade GDP-bundna form under olika stadier av transportprocessen.

Proton pump inhibitor proteins, also known as protono pumpare, refer to a group of protein pumps found primarily in the parietal cells of the stomach that play a key role in regulating gastric acid secretion. These proteins are responsible for transporting hydrogen ions (protons) from the cytoplasm of the cell into the lumen of the stomach, where they combine with chloride ions to form hydrochloric acid. By inhibiting the function of these proton pumps, medications known as proton pump inhibitors can reduce gastric acid secretion and alleviate symptoms associated with acid-related disorders such as gastroesophageal reflux disease (GERD) and peptic ulcers.

HSP110 (heat shock protein 110) are a type of stress proteins that play a role in protecting cells from stressful conditions, such as heat shock, oxidative stress, and inflammation. They are part of the larger family of heat shock proteins (HSPs) that help maintain protein homeostasis by assisting in protein folding, assembly, translocation, and degradation. HSP110 proteins have been shown to have chaperone activity and are involved in the regulation of the immune response. They are primarily located in the endoplasmic reticulum (ER) and can be induced by various stressors, including elevated temperatures, inflammation, and exposure to certain chemicals.

Trådliknande proteiner som utgör huvuddelen av muskelfibrernas tunna trådar. Trådarna (också benämnda filamentöst - eller F-aktin) kan sönderdelas i globulära underenheter (G-aktin) bestående av en e nda polypeptid, 375 aminosyror lång. I samverkan med myosin ansvarar aktin för musklernas sammandragning och avslappning.

Rab1 GTP-binding proteins are a subfamily of the Rab family of small GTPases that play crucial roles in regulating intracellular vesicle trafficking. Specifically, Rab1 GTP-binding proteins are involved in the regulation of vesicle transport between the endoplasmic reticulum (ER) and the Golgi apparatus. They function as molecular switches that cycle between an active GTP-bound state and an inactive GDP-bound state, thereby controlling the recruitment and activation of various effector proteins required for vesicle budding, transport, and fusion. Rab1 GTP-binding proteins have been implicated in several cellular processes, including protein secretion, ER-associated degradation, and autophagy.

'Saccharomyces cerevisiae proteins' refererar till proteiner som är specifika för jästsvampen Saccharomyces cerevisiae, även känd som bagerijäst eller öljäst. Detta organismer är välstuderade modellorganismer inom molekylärbiologi och genetik. Proteiner från Saccharomyces cerevisiae har varit av central betydelse för att förstå grundläggande cellulära processer, såsom celldelning, transkription, translation, DNA-replikering och metabolism. Många proteiner från Saccharomyces cerevisiae har blivit välkaraktäriserade och används ofta som referensproteiner i forskning.

Ras GTPase-aktiverande proteiner (GAPs) är en typ av regulatoriska proteiner som ökar den inbyggda GTPasaktiviteten hos Ras-proteiner, vilket leder till att deras aktiva GTP-bundna form konverteras till den inaktiva GDP-bundna formen. Detta process är viktig för att kontrollera Ras-signaltransduktion och på så sätt reglera cellcykeln, celldelning och cellytors funktioner.

NIH 3T3 celler är en immortaliserad musmuscellinje som vanligtvis används inom grundläggande forskning för att studera celldifferentiering, signaltransduktion och genuttryck. Denna celllinje utvecklades ursprungligen från embryonala fibroblastceller hos mus (Mus musculus) och är nu etablerad som en standardcellinj i biomedicinsk forskning. NIH 3T3-celler har en normal kromosomal status och kan differensieras till adipocyter under speciella kulturförhållanden, vilket gör dem användbara för att studera fettcellsdifferentiering och relaterade sjukdomar.

Den första, kontinuerligt odlade cellinjen av humana, maligna celler, vilka kom från ett livmoderhalskarcinom hos "Henrietta Lacks". Cellerna används för virusodling och testning av cancerpreparat.

Metabolit hos svamp, bestående av makrocykliskt lakton med omfattande antibiotisk verkan.

Det fett- och proteinhaltiga, och selektivt genomsläppliga, membran som omger cytoplasman i prokaryota och eukaryota celler. Hos de flesta typer av mikrobiella celler gränsar den utåt till cellväggen.

De reaktiva områden på en makromolekyl som är direkt envolverade i dess specifika sammankoppling med en annan molekyl.

Rho-specific guanine nucleotide dissociation inhibitors (RhoGDIs) are a group of proteins that regulate the function of Rho GTPases, which are important signaling molecules involved in various cellular processes such as actin cytoskeleton regulation, cell motility, and gene expression. RhoGDIs bind to Rho GTPases in their inactive state in the cytoplasm, preventing them from interacting with downstream effectors and maintaining them in a stable form. By regulating the activity of Rho GTPases, RhoGDIs play a crucial role in controlling various cellular functions and have been implicated in several diseases, including cancer and neurological disorders.

Proteiner som transporterar specifika ämnen i blodet eller genom cellväggar.

'Saccharomyces cerevisiae' är en art av jästsvamp som tillhör kungariket svampar, och är vanligt förekommande i naturen på frukt, grönsaker och jord. Den är en enkelcellig eukaryot organism med en diameter på omkring 5-10 Mikrometer.

Onkogenproteiner är proteiner som bildas från onkogener, som är gener som kan orsaka cancer när de muterar eller överaktiveras. Dessa proteiner kan påverka celldelning, cellcykelkontroll, apoptos (programmerad celldöd) och andra signaltransduktionsvägar som kan leda till onkogenes (cancerframkallande) effekter.

I medicinsk kontext, refererar "source domains" (eller "src-domäner") till specifika områden i hjärnan som är aktiverade under en given mentala upplevelse eller kognitiv process och bidrar till att informera andra relaterade hjärnregioner. Dessa domäner kan vara involverade i inmatning, tolkning och integrering av sensoryperception, emotionella tillstånd, minnen eller andra kognitiva funktioner som är relevanta för upplevelsen. Detta koncept används ofta inom forskningsområden som neurovetenskap, psykiatri och kognitionsvetenskap för att undersöka neurala nätverk och deras roll i hjärnfunktioner och beteende.

Det nätverk av trådar, kanaler och bryggor som ger cytoplasman form, stadga och organisation.

Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.

Cellers förflyttning från en plats till en annan.

Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.

A-kinase anchor proteins (AKAPs) are a group of structurally diverse scaffolding proteins that play a crucial role in organizing and targeting signaling molecules to specific subcellular locations. They are named after their ability to bind and anchor protein kinase A (PKA), a key enzyme involved in many cellular processes, including metabolism, movement, transport, and division. By tethering PKA and other signaling proteins together, AKAPs help ensure the proper regulation of various signaling pathways within the cell, contributing to the maintenance of normal cell function and homeostasis.

Alla proteiner som förekommer i svampar.

Teoretiska modeller som efterliknar förlopp hos biologiska processer eller sjukdomar. För sjukdomsmodeller hos levande djur

Stress fibers are thick, rope-like bundles of actin filaments and myosin II motor proteins that form in response to mechanical or chemical stress in cells. They play a crucial role in maintaining cell shape, generating contractile forces, and providing structural support necessary for various cellular functions such as migration, adhesion, and signal transduction.

Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.

En medlem i Rho-familjen av monomeriska GTP-bindande proteiner som påträffas hos Saccharomyces cerevisiae. Den har en morfologisk roll i cellcykeln. EC 3.6.1.-.

Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.

En packe tillplattade, små blåsor som medverkar i posttranslationsproduktionen och sorteringen av proteiner, genom att ta emot dem från det endoplasmatiska nätverket och vidarebefordra dem till sekretoriska mikrokärl, lysosomer eller cellmembranet. Proteiner förflyttas med hjälp av transportblåsor som knoppas av från det endoplasmatiska nätverket eller Golgiapparaten och smälter samman med Golgi, lysosomer eller cellmembranet.

Mikroskopering av prov färgade med fluorescent färgämne (vanligen fluoresceinisotiocyanat) eller av naturligt fluorescerande material, vilka avger ljus vid belysning med UV- eller blått ljus. Vid immunfluorescensmikroskopi utnyttjas antikroppar märkta med fluorescent färg.

Fosfoproteiner är proteiner som innehåller kovalent bundna fosfatgrupper, ofta på serin-, treonin- eller tyrosinresidveni. Dessa fosfatgrupper kan spela en viktig roll i regleringen av proteinkunktioner, såsom enzymsaktivitet och signaltransduktion. Fosforylering och dephosphorylering av fosfoproteiner är centrala för cellulär reglering och styrs ofta av kinaser och fosfataser.

En art av Cercopithecus med tre underarter: C. tantalus, C. pygerythrus och C. sabeus. De lever i skogs- och savannområden i Afrika. Den afrikanska grönapan, C. pygerythrus, är den naturliga värden fö r SIV och används i AIDS-forskningen.

Protein-serin-treonin kinases are a type of enzyme that plays a crucial role in various cellular processes by adding phosphate groups to serine and threonine residues on target proteins. This post-translational modification can activate or inhibit the function of these proteins, thereby regulating signal transduction pathways involved in cell growth, differentiation, metabolism, and survival. Dysregulation of protein-serin-treonin kinases has been implicated in numerous diseases, including cancer, diabetes, and neurodegenerative disorders.

I medicinen, refererar "sekvensinpassning" till processen av matchning eller korrelerande en genetisk sekvens, vanligtvis en DNA- eller RNA-sekvens, med en specifik referenssekvens, för att fastställa dess position, orientering och eventuella variationer i förhållande till den referenssekvensen. Detta används ofta inom genetisk forskning och klinisk diagnostik för att identifiera gener, mutationer eller polymorfismer som kan vara associerade med sjukdomar eller andra hälsotillstånd.

Celler som drivs fram in vitro i odlingsmedia som främjar deras tillväxt. Odlade celler används bl a för studier av utveckling, morfologi, metaboliska, fysiologiska och genetiska processer.

De GTPas-innehållande underenheterna hos heterotrimera GTP-bindande proteiner. När de frigörs från det heterotrimera komplexet samverkar dessa enheter med en rad olika budbärarsystem. Hydrolys av GTP genom underenhetens inneboende GTPas-aktivitet får det att återgå till sin inaktiva (heterotrimera) form. De GTP-bindande proteinernas alfaenheter grupperas i familjer, beroende på vilken verkan de har på andrabudbärarsystem.

Experimentella eller teoretiska modeller för undersökning av molekylers form, elektroniska egenskaper eller interaktioner. Hit hör även analoga molekyler, datorframställd grafik och mekaniska strukturer.

Proteiner i biologiska membran, som t ex cellmembran och intracellulära membran. De utgörs av två typer, yttre (perifera) och inre, integrerade, proteiner. De omfattar de flesta membranbundna enzymer, antigena proteiner, transportproteiner, och receptorer för läkemedel, hormoner och lektiner.

'Vesicular Transport Proteins' refererar till specifika proteiner som fungerar som transportörer under cellens membrantransport via vesiklar. Dessa proteiner hjälper till att transportera olika substanser, såsom näringsämnen, hormoner och neurotransmittorer, mellan olika kompartment inom cellen eller mellan celler genom att forma små blåsor (vesiklar) som avgränsas av ett lipidbilaga. Genom att binda specifikt till vesikelmembranet och/eller transportbanans membran, underlättar vesikulära transportproteiner frakt, fusion och innehållsutbytet mellan olika kompartment i cellen. Exempel på vesikulära transportproteiner inkluderar SNARE-proteiner, coatomer och kinesin.

GTP-bindande proteiner som innehåller tre olika underenheter. De förekommer tillsammans med någon av de sju G-proteinbundna receptorerna i transmembrandomänsuperfamiljen. Vid aktivering frigörs alfa-underenheten från det GTP-bindnade proteinkomplexet, varvid återstår en dimer av beta-underenheten och gamma-underenheten.

RhoB GTP-binding proteins are a subtype of the Rho GTPase family that bind to and hydrolyze GTP, playing crucial roles in regulating various cellular processes such as actin cytoskeleton organization, gene transcription, and cell cycle progression. They are involved in signal transduction pathways that control cell behavior, including cell migration, proliferation, and survival, and have been implicated in several diseases, including cancer. RhoB proteins are unique within the Rho GTPase family as they can be localized to both the cytoplasm and the plasma membrane, allowing them to play diverse roles in cell regulation.

Påskyndande av en kemisk reaktion genom medverkan av en särskild reaktorsubstans, katalysator.

En icke-hydrolyserbar analog till GTP, hos vilken syreatomen som är brygga mellan beta- och gammafosfatet ersatts av en kväveatom. Den binder hårt till G-protein i närvaro av Mg2+. Nukleotiden stimulerar kraftigt adenylatcyklas.

Cykliskt adenosinmonofosfat (adenosin-3',5'-vätefosfat). Det är en adeninnukleotid med en fosfatgrupp som förestrats mot sockerdelens 3'- och 5'-positioner. Det är en sekundär budbärare med avgörande intracellulär reglerfunktion som förmedlare av verkan av ett flertal hormoner, däribland epinefrin, glukagon och ACTH. Syn. cAMP.

Protoncogeneringsproteiner, inkludert c-Crk, refererer til en gruppe signalingproteiner som spiller en viktig rolle i cellers signaltransduksjon og regulering av cellers vekst, differentiering, apoptose og motilitet. Specifikt er c-Crk et adaptorprotein som hører til tyrosinkinasere/SH2-domenefamilien og er involvert i intracellulære signalveier som regulerer cellers adherensjonskomplekser, aktinindelning og endosomals sorting.

Cellkärneproteiner är proteiner som lokaliseras till cellkärnan och utövar strukturella, regulatoriska eller katabola/anabola funktioner inom cellkärnans olika kompartment, såsom kromosomer, karyolymfa och kärnmembran.

Enkelsträngat, komplementärt DNA som syntetiseras utifrån en RNA-mall genom verkan av RNA-beroende DNA-polymeras. cDNA (dvs komplementärt, "complementary", DNA, inte cirkulärt DNA och inte heller C-DNA) används i en rad olika molekylära kloningsstudier och som specifik hydridiseringssond.

"Serum response level" är ett laboratoriemedicinskt begrepp som används för att beskriva mängden av ett specifikt protein, kallat serumreaktivt protein (SRP), i blodserum. SRP är en akutfasprotein som produceras av levern i respons på inflammation eller skada i kroppen.

Ett enzym som katalyserar tillägg av alifatiska, aromatiska eller heterocykliska radikaler, liksom även epoxider och arenoxider, till glutation. Bindningen sker vid svavelatomen. Det katalyserar även reduktion av polyolnitrat genom glutation till polyol och nitrit. EC 2.5.1.18.

Son of Sevenless (SOS) protein in Drosophila melanogaster is a guanine nucleotide exchange factor (GEF) that plays a crucial role in the Ras signaling pathway, which is involved in various cellular processes such as growth, differentiation, and development. The SOS protein acts as a molecular switch that activates the Ras protein by facilitating the exchange of GDP for GTP. This activation ultimately leads to the regulation of gene expression and other downstream effects. The name "Son of Sevenless" comes from the original mutation in Drosophila, where the loss of this gene resulted in males with only one functional seventh sternite segment instead of the usual seven.

Arrangerad genetisk mutagenes på någon specifik plats i DNA-molekylen som ger en bassubstitution, infogning eller radering.

Pseudopodia är ett medicinskt begrepp som refererar till temporära utskjutningar eller fingerliknande formationer på cellmembranet hos vissa celltyper, särskilt amöbor och andra typ av vita blodceller som neutrofila. Dessa utskjutningar består av cytoplasma och membran och används för att röra sig, fästa till ytor eller fagocytera (faga = äta upp, kyta = cell) främmande partiklar som bakterier. Pseudopodia är en form av cellmotilitet och kan variera i storlek och form beroende på cellens aktivitet och miljö. Termen 'pseudo' används eftersom dessa formationer inte är permanenta eller bestående delar av cellen, till skillnad från en vanlig cellkropp eller cilium.

HEK293 cells, also known as human embryonic kidney 293 cells, are a type of immortalized cell line that were originally derived from human embryonic kidney tissue. They are widely used in scientific research due to their ability to express high levels of recombinant proteins and other foreign genes, making them valuable for the study of protein function, drug discovery, and gene therapy. HEK293 cells have a flat, fibroblast-like morphology and can be grown in culture under standard conditions, allowing for easy manipulation and analysis. It is important to note that while HEK293 cells are derived from human tissue, they are not considered to be primary cells, as they have been transformed and do not retain the same characteristics as the original tissue from which they were derived.

Hopklumpning av lösliga antigen och antikroppar, ensamma eller med antikroppsbindningsfaktorer som anti-antikroppar eller stafylokockprotein A, till komplex som är stora nog att fällas ut ur lösning.

Fosfatidylinositoler där en eller fler alkoholgrupper i inositolet har ersatts med en fosfatgrupp.

Peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase (PAM), även känt som peptidförlängningsfaktor 1, är ett enzymkomplex involverat i posttranslationell modifiering av peptider genom att katalysera konverteringen av peptidylglycin till den aktiva peptidhormonformen genom alpha-amidering, vilket ökar stabiliteten och biologisk aktiviteten hos peptiden.

En familj alfaunderenheter till heterotrimert GTP-bindande protein som ursprungligen identifierades genom sin förmåga att blockera adenylatcyklas. Medlemmar i denna familj kan binda till beta- och gamma-G-proteinunderenheter som aktiverar kaliumkanaler. Gi-Go skrivs ibland även Gi/Go.

Blåsor som bildas i cytoplasman när höljeförsedda blåsor ömsar sitt klatrinhölje. Endosomer innesluter makromolekyler som binds av receptorer på cellytan.

Ras-GEF (Rat Sarcoma-Guanine Nucleotide Exchange Factor) er en type enzym som aktiverer Ras-proteiner, som er involvert i reguleringen av cellulær signalveier. Ras-proteinerne er små G-proteiner som cycler mellom et inaktivt GDP-bindingsform og et aktivt GTP-bindingsform. Ras-GEF-ene er ansvarlige for utvekslingen av GDP med GTP, derved aktiverer de Ras-proteinet. Dette resulterer i en kaskade av signaler som styrer cellulær vekst, differentiering og apoptose. Mutasjoner i Ras-GEF-ene kan føre til uregulert aktivering av Ras-proteinet, noe som er assosiert med mange typer av cancer.

Guaninnukleotidutbytesfaktorer (G-protein-coupled receptors, GPCR) är en typ av transmembranreceptor som spelar en viktig roll i cellsignalering. När en ligand binder till den extracellulära domänen av receptorn induceras en konformationsförändring som får proteinet ras att byta ut ett guanosindifosfat (GDP) mot ett guanosintrifosfat (GTP). Detta resulterar i att G-proteinet delas upp i två delar, och båda dessa kan sedan interagera med andra proteiner och enzymer för att påverka cellens signaltransduktionsvägar.

GPCR är involverade i en rad olika fysiologiska processer, såsom seende, lukt, smak, smärta, blodtryck, immunförsvar och hormonell signalering. De är också mål för många läkemedel, eftersom de kan påverka cellers respons på signalsubstanser som kan vara involverade i sjukdomar.

SOS1-proteinet er ein Ras-GEF (guaninnukleotidbytesskapingsfaktor) som spiller en viktig rolle i intracellulære signalveier, bl.a. cellvoksisjon og cellegrovlekst. SOS1-proteinet hjelper med å aktivere Ras-proteinet ved å bytte ut guanosindifosfat (GDP) med guanosintrifosfat (GTP). Dette fører til at Ras-proteinet blir aktivert og kan overføre signalen videre i cellen. SOS1-proteinet er også involvert i reguleringen av cytoskelettet og endocytosen.

I'm sorry, there seems to be a mistake in your question. "Ras-GFR1" doesn't appear to be a standard medical term or abbreviation in the context of renal function or any other medical specialty.

Ras is a family of proteins that are involved in cell signaling pathways, while GFR (glomerular filtration rate) is a test used to check how well the kidneys are working. However, "Ras-GFR1" doesn't make sense as a combined term.

If you meant to ask about something else or provided an incorrect term, please let me know and I will do my best to provide a correct and helpful response.

Son of Sevenless (SOS) proteins are a family of dual-function guanine nucleotide exchange factors (GEFs) that play a crucial role in intracellular signaling pathways, particularly the Ras/MAPK signal transduction cascade. These proteins are named after the Drosophila melanogaster mutant "Son of Sevenless," which has a defective SOS protein and exhibits abnormal eye development.

In humans, there are two isoforms of SOS proteins: SOS1 and SOS2. They consist of several functional domains, including the Dbl homology (DH) domain, pleckstrin homology (PH) domain, and a C-terminal region containing a proline-rich domain (PRD). The DH domain is responsible for GEF activity, which facilitates the exchange of GDP to GTP on Ras family proteins, thereby activating them.

SOS proteins are involved in various cellular processes, such as cell growth, differentiation, and survival, by mediating signals from receptor tyrosine kinases (RTKs) and other membrane receptors. Upon activation of RTKs, SOS proteins are recruited to the plasma membrane through interactions between their PH domains and phosphatidylinositol lipids or via adaptor proteins containing SH2/SH3 domains. Once localized to the membrane, SOS proteins activate Ras GTPases, which in turn initiate downstream signaling cascades, including the Raf-MEK-ERK pathway.

Dysregulation of SOS protein function has been implicated in various diseases, such as cancer and developmental disorders. For example, mutations leading to increased SOS activity or constitutive activation have been found in several types of tumors, contributing to uncontrolled cell growth and proliferation.

Ras-proteiner är en typ av intracellulära (cellinterna) signalproteiner som hör till de viktigaste regulerande proteinerna i cellen. De aktiveras genom att koppla sig till GTP (guanosintrifosfat) och inaktiveras genom att omvandla GTP till GDP (guanosindifosfat). Ras-proteinernas huvudfunktion är att transducera signalsubstanser från cellmembranet in i cellen, där de aktiverar olika cellylefongeprocesser som till exempel celldelning och celldifferentiering.

Mutationer i Ras-generna kan leda till onkogenes (cancerframkallande gener) överaktivering, vilket kan orsaka oreglerad celldelning och cancerutveckling. Ras-proteiner är därför viktiga mål för cancerbehandlingar.

'Rho Guanine Nucleotide Exchange Factors' (Rho-GEFs) er en type enzymer som aktiverer Rho-GTPaser, en klasse av G-proteiner. Rho-GEFs stimulerer utvekslingen av guanosindifosfat (GDP) med guanosintrifosfat (GTP) i Rho-GTPasen, som fører til at den aktive GTP-bundne formen av Rho-GTPasen dannes. Dette er en viktig biokjemisk prosess for regulering av cellegrovn og -mobilitet, celleregningsprosesser, celledeling og -død, samt andre cellulære funksjoner. Rho-GEFs kan aktiveres av signalveier som G-protein-koblede reseptorer (GPCR), receptor tyrosinkinaser (RTK) og andre intracellulære signalveier.

Growth Factor Receptor Bound Protein 2 (GRB2) är ett adaptorprotein som spelar en viktig roll i intracellulära signalkaskader relaterade till cellyta och celltillväxt. GRB2-proteinet har två src homologa 3 (SH3)-domäner och en src homolog 2 (SH2)-domän. SH2-domänen binder till fosforylerade tyrosinresiduer på receptorer för tillväxtfaktorer, vilket leder till att GRB2 rekryteras till aktiverade receptorer. Genom sin association med olika proteiner kan GRB2 hjälpa till att koordinera signaltransduktionen och på så sätt reglera cellulära processer som celldelning, migration och differentiering.

'Guaninnukleotider' är en typ av kemiska föreningar som innehåller en guaninbas, en sockergrupp (ribos eller deoxyribos) och en eller flera fosfatgrupper. De spelar en viktig roll inom cellernas signalsystem och är också en del av strukturen hos vissa biologiskt aktiva molekyler, till exempel G-proteiner och sekretionsvésikeln. Guaninnukleotiderna kan fungera som energibärare och vara involverade i regleringen av en rad cellulära processer, såsom celldelning, signaltransduktion och proteinsyntes. De två viktigaste guaninnukleotiderna är GTP (guanosintrifosfat) och GDP (guanosindisfosfat).

"c-Vav" er ein onkogen som koder for ein proteinkjempe, "Vav-proteinet", som spiller en viktig rolle i reguleringen av celles signalvegviseringssystem. Dette proteinet innehar SH2- og SH3-domener og er involvert i a aktivere andre intracellulære signalkjempe, slik som Ras og Rac, som igen påvirker cellegrov i ulike måter, for eksempel ved å styre celledeling og cellerformingsprosesser. Protonkogenet c-vav kan bli aktivert av viktige cellulære signaler, slik som voksgrovefakter og faktorer relatert til immunsystemet. Mutasjoner i c-vav-onkogenet kan føre til u kontrollert aktivering av dette proteinet og dermed øke risikoen for ugunstige medisinske tilstander, for eksempel kreft.

Guanosindifosfat (GDP) är ett nukleotidtriphosphat som består av en guanosinbase, en pentos (ribos) och tre fosfatgrupper. Det bildas när en fosfatgrupp tas bort från guanosintrifosfat (GTP) under en reaktion katalyserad av ett enzym. GDP är en viktig molekyl inom cellens energihushållning och signaltransduktion.

CDC42 är ett småGTP-bindande protein som tillhör Rho-GTPas familjen. Det spelar en viktig roll i regulationen av cytoskelettet, cellsignalering och celldelning. CDC42 agerar som en molekylär switchn som kan aktiveras och inaktiveras genom att byta mellan två konformationer: en GTP-bundet (aktiv) form och en GDP-bundet (inaktiv) form. När CDC42 är aktiverat, kan det interagera med effektorproteiner och initiera signaltransduktionsvägar som reglerar cellmorphologi, cellrörelser och celldelning.

Guanosintrifosfat (GTP) är ett cellulärt energibärande molekylliknande ATP, men med guanosin istället för adenosin som bas. Det spelar en viktig roll inom signalsubstanser och proteiner som är involverade i celldelning och reglering av genuttryck. GTP hydrolyseras ofta till GDP (guanosindifosfat) för att frisätta energi till cellens processer.

Rac1 (Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1) är ett GTP-bindande protein som tillhör Rho-GTPasfamiljen. Dessa proteiner fungerar som molekylära switche och cyclerar mellan en aktiverad, GTP-bundet form och en inaktiverad, GDP-bundet form. Rac1 aktiveras av olika signalsubstanser och är involverat i cellulär processer som cytoskelettreorganisation, celldelning, migration och differentiering. När Rac1 är aktiverat kan det binde till effektorproteiner och initiera en kaskad av händelser som leder till dessa cellulära processer. Dysfunktion i Rac1-signalering har visats vara involverad i olika sjukdomar, inklusive cancer och neurodegenerativa sjukdomar.

Rho GTP-bindande proteiner är en underfamilj av små G-proteiner, som fungerar som molekylära switche eller regulatorer av viktiga cellulära processer såsom cellytaners omorganisation, cellcyklens regulation och signaltransduktion. De aktiveras genom att binda till GTP och inaktiveras genom att hydrolysera GTP till GDP. Rho-proteinerna deltar i regleringen av cytoskelettets dynamik, vilket påverkar cellens form, rörelse och adhesion. Exempel på Rho GTP-bindande proteiner är RhoA, Rac1 och Cdc42.

ADP-ribosyleringsfaktorer (ADP-rybbosylating factors) är en grupp proteiner som spelar en viktig roll i celldelningen, signaltransduktion och DNA-reparation. Dessa proteiner katalyserar överföringen av ADP-ribosyrgruppen från NAD+ (nikotinamidadenindinukleotid) till specifika aminosyror i målproteiner, ett process som kallas ADP-ribosylering.

Det finns två huvudsakliga typer av ADP-rybbosylating factors: mono-ADP-rybbosyltransferaser (mARTs) och poly-ADP-rybbosyltransferaser (pARTs). mARTs överför en enda ADP-ribosyrgrupp till målproteinet, medan pARTs kan överföra flera ADP-ribosyrgrupper, vilket resulterar i poly-ADP-ribosylering av målproteinet.

ADP-rybbosylering är en dynamisk posttranslatorisk modifikation som kan påverka målproteiners funktion, lokalisation och interaktion med andra proteiner. Dysfunktion i ADP-rybbosylering har associerats med flera sjukdomar, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och kardiovaskulära sjukdomar.

Rac GTP-bindande proteiner är en underfamilj av Rho-GTPaser, som är en grupp av små GTP-bindande proteiner. Dessa proteiner fungerar som molekylära switches och cyklierar mellan en aktiverad, GTP-bundet form och en inaktiverad, GDP-bundet form. Rac-proteinerna är involverade i regulationen av celleras aktinfilament och därmed cellens rörelse och form. De aktiveras av upstream-signaler och reagerar genom att aktivera nedströms-effektorer, vilket leder till cellytiska respons som exempelvis cellmigration, cytoskelettreorganisation och celldifferentiering. Rac-proteinerna har också visat sig vara involverade i signaltransduktionen relaterad till celldelning, apoptos och inflammation.

Rap1 (Ras-associated protein 1) är ett typ av små GTP-bindande proteiner som tillhör Ras-superfamiljen. Dessa proteiner fungerar som molekylära switche som kan aktiveras och inaktiveras genom att binda eller släppa loss guanosindifosfat (GDP) respektive guanosintrifosfat (GTP). När Rap1 är aktiverat, det vill säga när det binder till GTP, kan det interagera med och reglera en rad olika cellulära processer, såsom cellytocysh, differentiering, adhesion och signaltransduktion. Rap1-proteinerna har visat sig spela viktiga roller inom flera olika signalsystem i cellen, bland annat i regleringen av cellcykeln, cytoskelettet och cellytares cellulära kontakter med omgivningen. Dysfunktionella Rap1-proteiner har kopplats till olika sjukdomar, inklusive cancer.

RhoA är ett medlemmar i Rho-GTPasfamily, som är involverade i regulationen av cytoskelettet och cellulär signalering. Dessa proteiner fungerar som molekylära switchar genom att cycliskt binda och hydrolysera GTP (guanosintrifosfat). När RhoA binder till GTP, är det aktiverat och kan interagera med sina effektorproteiner för att påverka cellulär processer som cellcykeln, celldelning, cellmigration och cellstammcellsförnyelse. När RhoA hydrolyserar GTP till GDP (guanosindifosfat), inaktiveras det och kan inte längre interagera med sina effektorproteiner.

Guaninnukleotidfrisättande faktor 2 (GNF2), även känt som integrinfaktor beta-3 eller CD61, är en protein som ingår i en grupp av signalproteiner som reglerar cellers adhesion och signalsamtal med andra celler och extracellulär matrix. GNF2 bildar komplex tillsammans med andra proteiner, såsom integrinfaktor alpha-V (GNF5), för att bilda heterodimeriska integrinreceptorer på cellmembranet.

När GNF2-integrinerna binder till sina ligander i extracellulära matrix, leds detta till en konformationsförändring av integrinerna och aktivering av intracellulära signalslingor som involverar GTP-bindande proteiner, såsom Ras. Detta resulterar i celldelning, migration, proliferation, också känd som cellcykeln, och överlevnad.

GNF2 har visat sig spela en viktig roll i flera fysiologiska processer, såsom blodomloppet, angiogenes, immunresponser och embryonal utveckling. Dessutom har mutationer i GNF2-genen korrelerats med olika sjukdomar, till exempel kärlkramp och tumörbildning.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

GTPase-aktiverande proteiner (GAPs) är en typ av regulatoriska proteinmolekyler som ökar den inbyggda GTPasaktiviteten hos GTPaser, en grupp enzymer som binder och hydrolyserar guanosintrifosfat (GTP) till guanosindifosfat (GDP). Genom att höja hastigheten på GTP-hydrolysen fungerar GAPs som negativa regulatorer av GTPaser och hjälper till att avsluta signaltransduktionsvägar som involverar GTPaser.

I människor finns det flera olika GAP-proteiner, var och en med specifika funktioner och subcellulära lokaliseringsställen. Ett exempel är p120GAP, som är involverat i kontrollen av cellcykeln och celldifferentiering. Andra exempel är neurofibromin, som är associerad med neurofibromatos, och IQGAP1, som är involverat i cytoskelettreorganisering.

I medicinen kan "signalomvandling" definieras som den process där celler eller molekyler omvandlar inkommande signaler till en biologisk respons. Detta sker ofta genom en kaskad av reaktioner, där en initial signal aktiverar en receptor, som sedan aktiverar andra molekyler i en signalkedja. Den slutliga responsen kan vara en genetisk aktivering eller enzymatisk aktivitet, beroende på vilken typ av cell och signal som är inblandad. Signalomvandling är en central mekanism för cellkommunikation och koordinering av cellulära processer som tillväxt, differentiering och apoptos (programmerad celldöd).

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

Proteiner (eller proteinmolekyler) är stora, komplexa molekyler som består av aminosyror som kedjas samman i en specifik sekvens. Proteiner bygger upp och utgör en väsentlig del av alla levande cellers struktur och funktion. De utför viktiga funktioner såsom att underlätta kroppens tillväxt och reparation, reglera processer i cellen, skydda organismen från främmande ämnen som t.ex. virus och bakterier samt hjälpa till vid transport av andra molekyler inom kroppen. Proteiner kan ha en mycket varierad struktur och form beroende på deras funktion, och de kan indelas i olika klasser baserat på deras specifika egenskaper och roller inom cellen.

GTP (Guanosintrifosfat) är ett nukleotid som deltar i cellers energimetabolism och signaltransduktion. GTP-bindande proteiner är proteiner som kan binda till och hydrolysera GTP till GDP (Guanosindifosfat) och en fri fosfatgrupp.

Denna process används ofta som ett on/off-switchn för att reglera proteinaktiviteten inom celler. När GTP är bundet till proteinet är det aktiverat, medan när GTP hydrolyseras till GDP så inaktiveras proteinet igen.

Exempel på viktiga GTP-bindande proteiner inkluderar Ras-proteiner, som spelar en central roll i cellsignalering och kan vara muterade i cancer, samt G-proteiner, som är involverade i signalsystemet för många hormoner och neurotransmittorer.

Adaptorproteiner som är involverade i signalöverföring är proteiner som hjälper till att överföra signalsubstanser eller andra molekyler från en receptor till intracellulära signaltransduktionsvägar. Dessa proteiner har ofta modulerbara strukturer och kan binda till flera olika proteiner, vilket gör det möjligt för dem att fungera som en slags "mellanhand" i signalskeppen. På så sätt kan de hjälpa till att koordinera och integrera signalsubstansernas effekter inom cellen. Exempel på adaptorproteiner som är involverade i signalöverföring inkluderar proteiner i GRB2-familjen, SOS-proteiner och proteiner i Crk-familjen.

ADP-ribosylation factor 1 (ARF1) är ett protein som tillhör ARF-familjen av GTPas-proteiner. Det spelar en viktig roll i regleringen av intracellulär trafficking, aktinomorfologi och signaltransduktion. ARF1 fungerar som en molekylär switchn som styr vesikeltransporten mellan olika kompartment inne i cellen genom att cyclisera mellan GTP- och GDP-bundna former. När ARF1 är aktiverat av en guaninnukleotidutbytare (GEF) binder det till membranet och rekryterar andra proteiner som behövs för att bilda och transportera vesiklar. När ARF1-cykeln är fullbordad inaktiveras det av en GTPaseraktivator (GAP), vilket leder till att det återgår till sin inaktiva form och friges från membranet.

GTP-fosfohydrolas är ett enzym som katalyserar nedbrytningen (hydrolys) av GTP (guanosintrifosfat) till GDP (guanosindifosfat) och en fri fosfatgrupp. Detta enzym spelar en viktig roll inom cellulär signalering, där GTP används som energirik källa för att driva olika cellulära processer, till exempel proteinsyntes och celldelning. När GTP-fosfohydrolasen aktiveras bryts GTP ner till GDP, vilket leder till att signaltransduktionen avbryts eller modifieras på något sätt. Detta hjälper till att reglera cellulära processer på ett kontrollerat sätt.

Tertiär proteinstruktur refererar till den tresdimensionella formen och flexibiliteten hos ett proteinmolekyl som resulterar från de specifika interaktionerna mellan dess sekundära strukturelement, såsom alfa-helixar och beta-flakor. Den tertiära strukturen av ett protein bestäms av den sekvensordningen (primär struktur) av aminosyror som utgör proteinet och de krafter som verkar mellan dem, såsom vätebindningar, dispersion-krafter och elektrostatiska attraktioner. Den tertiära strukturen är viktig för ett proteins funktionella aktivitet och kan vara stabil eller dynamisk beroende på proteinets roll i cellen.

I'm sorry, but I cannot provide a medical definition for "ral-GDS" as it is not a recognized term in the medical field. It is possible that there may be a spelling error or transcription mistake in the term you have provided. If you have more context or information about what "ral-GDS" might refer to, I would be happy to try and help you further.

Proteinbindning (ibland även kallat proteininteraktion) refererar till den process där ett protein binder sig till ett annat molekylärt ämne, exempelvis en liten organisk molekyl, ett metalljon, ett DNA- eller RNA-molekyl, eller till ett annat protein. Proteinbindningar är mycket viktiga inom cellbiologi och medicinen, eftersom de ligger till grund för många olika biokemiska processer i kroppen.

Exempel på olika typer av proteinbindningar inkluderar:

* Enzym-substratbindningar, där ett enzym binder till sitt substrat för att katalysera en kemisk reaktion.
* Receptor-ligandbindningar, där en receptor binder till en ligand (exempelvis ett hormon eller en neurotransmittor) för att aktiveras och utlösa en cellsignal.
* Protein-DNA/RNA-bindningar, där proteiner binder till DNA eller RNA-molekyler för att reglera genuttrycket eller för att delta i DNA-replikation eller -reparation.
* Protein-proteinbindningar, där två eller fler proteiner interagerar med varandra för att bilda komplexa eller för att reglera varandras aktivitet.

Proteinbindningar kan styras av en mängd olika faktorer, inklusive den tresdimensionella strukturen hos de involverade molekylerna, deras elektriska laddningar och hydrofila/hydrofoba egenskaper. Många proteinbindningar kan också moduleras av läkemedel eller andra exogena ämnen, vilket gör att de är viktiga mål för farmakologisk intervention.

eIF-2B, forkortelse for eukaryot initiation factor 2B, er en viktig protein kompleks som spiller en sentral rolle i den eukaryote prosessen for proteinsyntese, også kalt translasjon. eIF-2B fungerer som en GTP-egs-aktivert enzymkomplex som aktiverer et annet protein, eIF-2, som er nødvendig for initiasjonen av proteinsyntesen.

I utgangspunktet er eIF-2 i en inaktiv form, og det må aktiveres før prosessen for proteinsyntese kan starte. Dette skjer ved at eIF-2B katalyserer byttet av GDP med GTP på eIF-2, noe som får eIF-2 til å bli aktivt og binde seg til initiator Met-tRNA og en annen prosessprotein, eIF-3. Dette komplekset kan deretter binde seg til 40S ribosomen og starte prosessen for proteinsyntese.

eIF-2B er derfor en viktig regulator av proteinsyntesen i eukaryote celler, og feilregulering av denne prosessen kan føre til ulike sykdommer og patologiske tilstander, inkludert neurologiske lidelser og kreft.

Rab GTP-bindande proteiner är en typ av GTPas-proteiner som spelar en central roll i regleringen av intracellulär trafficking och transport av vesiklar inom celler. De är involverade i processer som exocytos, endocytos, membrantransport och autofagi. Rab-proteinerna fungerar som molekylära switchar som växlar mellan en aktiverad tillstånd, då de binder till GTP, och ett inaktiverat tillstånd, då de binder till GDP. I aktiverat tillstånd kan Rab-proteinerna interagera med sina effektorproteiner och på så sätt styr vesikeltransporten och membranfusionen. Varje Rab-protein har en specifik funktion och är involverad i olika delar av cellens trafficking-nätverk.

Ral GTP-bindande proteiner är en typ av små GTPas-proteiner som aktiveras genom bindning av det molekylära signalsubstratet guanosintrifosfat (GTP). De är involverade i intracellulära signaltransduktionsvägar och reglerar cellulära processer såsom celldelning, vesikeltransport och cytoskelettreorganisering. Ral-proteinerna aktiveras av RalGDS-proteiner som fungerar som guaninnukleotidbytare (GNE) och byter ut det inaktiva guanosindifosfatet (GDP) mot det aktiva GTP:t. När Ral-proteinerna är aktiverade kan de interagera med effektorproteiner som utför specifika cellulära funktioner.

Rap GTP-bindande proteiner är en underfamilj av små G-proteiner, som binder och hydrolyserar guanosintrifosfat (GTP) till guanosindifosfat (GDP). Rap-proteinerna spelar en viktig roll i intracellulära signaltransduktionsvägar, särskilt inom celldelning och cellcykeln. De aktiveras av GEF (guaninnukleotidexchangefaktorer) som underlättar utbytet av GTP för GDP och inaktiveras av GAP (GTPas-stimulerande proteiner) som ökar hydrolysen av GTP till GDP. Rap-proteinerna kan också binda till och reglera andra proteiner, såsom kinaser och fosfataser, för att kontrollera cellulära processer som celldelning, cytoskelettdynamik och transkription.

Guanin är ett av de fyra nucleotidbaserna som förekommer i DNA och RNA. Guanin bildar par med cytosin via tres bonded hydrogen bonds, vilket är en viktig del av DNA-replikationen och transkriptionen. Guanin har också en roll i cellsignalering och reglering av celldelning genom att ingå i signalsubstanser som cGMP (cyclisk guanosinmonofosfat).

'COS-celler' är en typ av genetiskt modifierade celler som används inom molekylärbiologi och biomedicinsk forskning. COS-celler är en speciell linje av simia (apa) fibroblaster som har transformerats med ett virus, bestående av adenoviruskapselförpackat DNA från svin-svampsvulstvirus (SV40).

Denna modifiering gör att COS-cellerna uttrycker T-antigen, ett protein som binder till och aktiverar origo på plasmid-DNA, vilket underlättar effektivare och säkrare kloning av exogena DNA. Detta gör COS-celler till en populär val för att producera stora mängder fritt protein in vitro från klonade gener.

Det finns två huvudtyper av COS-celler: COS-1 och COS-7. COS-1 är diploid, medan COS-7 är en subklon av COS-1 som har ökad stabilitet och effektivitet vid proteinproduktion.

En guaninnukleotidseparationshämmare är ett läkemedel som hämmar nedbrytningen av guaninnukleotider, vilket leder till en ökning av aktiverade G-proteiner och på så sätt modulerar cellsignalering. Dessa läkemedel används för att behandla olika medicinska tillstånd som exempelvis astma, kronisk obstruktiv lungsjukdom (COPD) och cancer. Genom att hämma nedbrytningen av guaninnukleotider kan läkemedlen påverka cellers förmåga att kommunicera och koordinera sina funktioner, vilket kan ha en positiv inverkan på sjukdomsprocessen.

Nukleotider är de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA, som är de två typerna av nucleic acids som förekommer naturligt. En nukleotid består av en pentos-socker (en femkolossig sockerart), en fosfatgrupp och en nitrogenbas. De vanligaste nukleotiderna i DNA innehåller de fyra olika nitrogenbaserna adenin, timin, guanin och cytosin, medan RNA innehåller adenin, uracil, guanin och cytosin.

Nukleotider kan även fungera som en energibärare i celler, genom att innehålla en hög koncentration av kemisk energi som kan frigöras genom hydrolys. Exempel på sådana nukleotider är adenosintrifosfat (ATP) och guanosintrifosfat (GTP).

Rab5 GTP-bindande proteiner är en typ av Rab-proteiner som fungerar som regulerande komponenter i intracellulära membrantransportprocesser, särskilt i tidiga stadier av endocytos. Dessa proteiner binder till GTP (guanosintrifosfat) och cyclerar mellan en aktiv GTP-bindande form och en inaktiv GDP (guanosindifosfat)-bindande form. När Rab5 är bundet till GTP aggregerar det vesiklar och membran, vilket initierar bildandet av tidiga endosomer. Dessutom spelar Rab5 en roll i att rekrytera andra proteiner till membranen för att reglera trafficking, fusion och nedbrytning av membrankapslade vesiklar.

Sekvenshomologi, eller sekvenstillhörighet, inom biokemi och genetik refererar till den grad av likhet mellan två eller flera molekylära sekvenser, som kan vara DNA-sekvenser, RNA-sekvenser eller proteinsekvenser. När det gäller aminosyrasekvenser, handlar det om den ordningsföljd av specifika aminosyror som bildar en proteinmolekyl.

Aminosyrasekvenshomologi mellan två proteiner används ofta för att undersöka deras evolutionära släktskap och funktionella likheter. Hög sekvenshomologi kan indikera närbesläktade proteiner med möjligen liknande funktioner, medan låg homologi kan tyda på mindre närstående eller icke-relaterade proteinsekvenser.

Det är värt att notera att även om två proteiner har en hög sekvenshomologi kan deras struktur och funktion skilja sig ifrån varandra, eftersom aminosyrasekvenser inte alltid korrelerar perfekt med proteiners tredimensionella struktur eller biokemiska aktivitet.

'GTP-bindande proteiners alfaunderenheter, G12-G13', refererar till två specifika proteiner som tillhör superfamiljen av GTP-bindande proteiner. Dessa två proteiner kallas G12 och G13 och de är involverade i intracellulära signaltransduktionsvägar, särskilt inom cellens cytoskelett.

G12- och G13-proteinerna binder till GTP (guanosintrifosfat) och fungerar som så kallade G-proteinkopplade receptorers (GPCRs) effektorproteiner. När en ligand binder till en GPCR, induceras en konformationsförändring i receptorn som leder till utbyte av GDP (guanosindifosfat) mot GTP på G12- eller G13-proteinet. Detta resulterar i att proteinet aktiveras och kan sedan interagera med andra effektorproteiner för att överföra signalen in i cellen.

G12- och G13-proteinerna är involverade i en mängd olika cellulära processer, inklusive celldelning, migration, adhesion och cytoskelettomorganisation. Dysfunktion eller mutationer i dessa proteiner kan leda till patologiska tillstånd som cancer och kardiovaskulära sjukdomar.

I medicinsk kontext, refererar "höljeproteinkomplex I" till ett proteincomplex som spelar en viktig roll i den cellulära andningen och energiproduktionen inne i mitokondrier. Det kallas också för NADH-dehydrogenas eller Komplex I.

Höljeproteinkomplexet I är beläget i den innersta membranen av mitokondrien och är den första komponenten i den elektrontransportkedjan. Det består av flera sous-enheter och koenzym Q (ubichinon), och dess huvudsakliga funktion är att överföra elektroner från NADH till koenzym Q, samtidigt som protoner pumpas över mitokondriens membran. Detta skapar ett elektrokemiskt gradient över membranet, vilket driver ATP-syntasen för att producera ATP, den primära energikällan i cellen.

Defekter i höljeproteinkomplex I kan leda till mitokondriella sjukdomar och har också visats vara relaterade till neurodegenerativa sjukdomar som Parkinson's disease.

Enzymaktivering refererar till processen där ett enzym aktiveras för att kunna börja katalysera en biokemisk reaktion. Detta kan ske på olika sätt, beroende på typen av enzym. I allmänhet kan enzymaktivering involvera att en molekyl, kallad en aktivator, binds till enzymet och orsakar en konformationsändring som gör att enzyms aktiva plats blir tillgänglig för substratet. I andra fall kan enzymaktivering ske genom att en inhibitor tas bort från enzyms aktiva plats, eller genom att enzymet modifieras genom en kemisk reaktion.

Exempel på mekanismer för enzymaktivering inkluderar allosterisk regulering, där bindningen av en molekyl till en allostersk plats på enzymet orsakar en konformationsändring som påverkar aktiva platsen, och covalent modifiering, där en grupp kovalent binder till enzyms aktiva plats och förändrar dess egenskaper.

I medicinsk kontext kan enzymaktivering ha betydelse när det gäller att behandla sjukdomar genom att påverka enzymaktiviteten i kroppen. Exempelvis kan enzymaktiverande läkemedel användas för att behandla vissa typer av cancer, där aktivering av specifika enzymer hjälper till att bromsa celltillväxten eller inducerar apoptos (programmerad celldöd).

En mutation är ett tillfälligt eller permanet genetiskt förändring i DNA-sekvensen som kan resultera i en förändring i strukturen eller funktionen hos ett protein eller en genprodukt. Mutationer kan uppstå spontant under celldelning, eller orsakas av externa faktorer såsom strålning, kemikalier eller virus. Mutationer kan vara skadliga, neutrala eller till och med fördelaktiga beroende på vilken del av genomet de påverkar och hur de påverkar genens funktion.

'Monomera GTP-bindande proteiner' är en benämning på en grupp av proteiner som kan binda till och hydrolysera (sönderdelar) molekyler av guanosintrifosfat (GTP). Dessa proteiner spelar ofta en viktig roll i cellulära processer såsom celldelning, signaltransduktion och cytoskelettdynamik.

Ett exempel på ett monomera GTP-bindande protein är Ras-proteinet, som är involverat i cellsignalering och kan påverka cellcykeln och celldifferentiering när det är muterat. När Ras-proteinet binder till GTP blir det aktiverat och kan interagera med andra proteiner för att överföra signaler inom cellen. När GTP hydrolyseras till GDP avslutas den aktiva formen av Ras-proteinet, och det blir inaktiverat.

Andra exempel på monomera GTP-bindande proteiner inkluderar Rho-proteiner, Ran-proteiner och Rab-proteiner, som alla är involverade i olika aspekter av cytoskelettdynamik, celldelning och vesikeltrafik.

'Fosforylering' er en biokjemisk prosess hvor et fosfatgruppe (PO4-) blir lagt til ein molekyll, ofte ein protein eller en enzym. Dette skjer når ATP (Adenosintrifosfat) deler seg i ADP (Adenosindifosfat) og frigir ein energirik fosfatgruppe som kan bli lagt til et anna molekyll for å endre dets egenskaper eller aktivere det. Fosforylering er en viktig reguleringsmekanisme innenfor cellegjenforening og signalveiledning i levande organismer.

"Cell line" er en betegnelse for en population av levende celler som deler seg selvstandig og ubestemt i laboratoriet. Disse cellene har typisk samme karyotype (sammensetningen av deres kromosomer) og genetiske egenskaper, og de kan replikeres over en lang periode av tid. De kan brukes i forskning for å studere cellebiologi, molekylær biologi, farmakologi, virologi og andre områder innen biovitenskapen. Eksempler på velkjente cellinjer inkluderer HeLa-cellinjen (som er tatt fra en livstrukturløs kvinne i 1951) og Vero-cellinjen (som er vanlig å bruke i studier av virusinfeksjoner).

"Cell cycle proteins" are a group of proteins that play crucial roles in regulating and controlling the cell cycle - the series of events that take place in a cell leading to its division and duplication. These proteins are involved in various checkpoints during the cell cycle, ensuring that each phase is completed accurately before progressing to the next one. They also help to coordinate the complex biochemical processes that occur during cell division, including DNA replication, chromosome separation, and cytokinesis. Examples of cell cycle proteins include cyclins, cyclin-dependent kinases (CDKs), and various checkpoint proteins.

P21-activated kinases (PAKs) är en familj av serin-/treonin-kinaser som spela en viktig roll i cellsignalering och regulering av celldelning, cellmigration och cytoskelettremodelering. De aktiveras av små GTPaser av Rho-familjen, till exempel Cdc42 och Rac1, som binder till deras p21-bindande domäner (PBD). Aktiverade PAKs kan fosforylera och därmed reglera en mängd olika substrat, inklusive proteiner involverade i cytoskelettremodelering, transkriptionsfaktorer och andra signalproteiner. Dysregleringar av PAK-aktivitet har visats vara involverade i patologiska tillstånd som cancer och neurodegenerativa sjukdomar.

A two-hybrid system technique is a genetic assay used to identify and study protein-protein interactions (PPIs) within an organism, typically in yeast cells. It is based on the modular nature of transcription factors, which consist of separate DNA-binding and activation domains. The technique involves fusing the two proteins of interest to these domains, creating hybrid proteins. One protein is fused to the DNA-binding domain (BD), while the other is fused to the activation domain (AD). When both fusion proteins interact within the cell, they bring the DNA-binding and activation domains together, leading to the transcription of a reporter gene. The activity of this reporter gene serves as an indicator of the interaction between the two proteins.

There are several variations of the two-hybrid system technique, but the most common one is the "yeast two-hybrid" (Y2H) assay. In addition to Y2H, other variants include bacterial two-hybrid systems and mammalian two-hybrid systems. These techniques have been instrumental in discovering and characterizing numerous PPIs, contributing significantly to our understanding of protein function and cellular processes.

"Ras-generator" är inget etablerat medicinskt begrepp, utan verkar vara ett felstavat eller förvrängt uttryck. Det kan möjligen syfta på "rasgeneder", vilket är en benämning inom genetiken som avser förändringar (mutationer) i gener som kodar för proteiner i RAS-signalvägar.

RAS-proteiner spelar en viktig roll i cellcykeln och celldelningen, och förändringar i dessa gener kan leda till onormal celltillväxt och cancer. Exempel på cancersjukdomar som kan vara associerade med RAS-geneder inkluderar lungcancer, coloncancer och pankreascancer.

Rekombinanta fusionsproteiner är proteiner som skapats genom molekylärbiologiska metoder, där genetisk information från två eller fler olika protein kodande gener kombineras till en enda gen. Den resulterande fusionerade genen ger upphov till ett protein som innehåller delar av de ursprungliga proteinenheterna, vilka är sammanfogade i en enda peptidkedja.

Denna teknik möjliggör skapandet av proteiner med nya och unika funktionella egenskaper som inte finns hos de ursprungliga proteinerna. Rekombinanta fusionsproteiner används inom forskning, diagnostik och terapi, exempelvis vid tillverkning av monoklonala antikroppar för behandling av cancer och autoimmuna sjukdomar.

3T3-celler är en typ av immortaliserade musmusceller (fibroblaster) som används inom forskning, särskilt inom områdena cellbiologi, toxicologi och molekylär biologi. "3T3" står för "tissue culture and transfer number three", eftersom dessa celler var de tredje i en serie av cellkulturer som utfördes vid Tomizawas laboratorium på Tokyo Tech. Dessa celler är lätta att odla och har därför blivit ett vanligt val för forskningsändamål. De används ofta för att studera celldelning, signaltransduktion, cellcykeln, oxiativ stress, apoptos och olika former av cellulär skada.

Proteintransport refererer til den proces, hvor proteiner transporteres fra sted til sted i eller mellem celler. Proteinerne kan transporteres gennem membraner via specielle transportkanaler eller ved hjælp af transportproteiner, også kaldet kvasi-transportproteiner eller receptorer. Disse proteiner har evnen til at genkende og binde sig til bestemte typer proteiner og transportere dem gennem membranen.

Proteintransport er en nødvendig proces for cellernes overlevelse, da proteinerne skal være placeret korrekt i cellen for at udføre deres funktioner korrekt. Der findes to hovedtyper af proteintransport: intracellulær transport (indinside cellen) og extracellulær transport (udenfor cellen).

Intracellulært transporteres proteinerne fra det sted, hvor de syntetiseres i cytoplasmaet til deres endelige destination, som kan være i organeller eller membraner. Extracellulært transport involverer frigivelse af proteiner ud af cellen og transportering af dem gennem extracellulært miljø til deres destination, f.eks. andre celler eller organer.

Proteintransport kan reguleres af mange forskellige faktorer, herunder pH, temperatur, membrankomposition og andre proteiner. Dysfunktion i proteintransport kan resultere i en række sygdomme, herunder neurologiske forstyrrelser, immunologiske lidelser og kancer.

eIF-2 (Eukaryotic Initiation Factor 2) är ett protein som spelar en viktig roll i den eukaryota cellens proteinsyntes, eller translationen. Det hjälper till att initiera den process där aminosyror kopplas samman för att bilda ett protein under ledning av mRNA-molekylen.

Specifikt är eIF-2 involverat i den första steget av initieringen, där det hjälper till att binda metionininitiatoraminosyran till en tRNA-molekyl (tRNAi Met). Detta komplex kallas sedan för "ternärkomplexet" och interagerar med andra proteinkomplex som hjälper till att initiera translationen.

eIF-2 är ett reglerativt mål för cellulära signaltransduktionsvägar, såsom PKR-beroende stressrespons, vilket kan leda till en nedreglering av proteinsyntesen under stressförhållanden som till exempel infektion eller oxidativ skada.

Transfektion är en process där DNA, RNA eller andra molekyler överförs till celler i syfte att förändra deras genetiska makeup. Detta kan uppnås genom olika metoder, såsom elektroporering, kemisk transfektion eller viraltransduktion. Transfektion används ofta inom forskning för att studera geneffekter och proteinexpression, men den kan även användas i terapeutiska syften för att behandla genetiska sjukdomar.

Ran är ett GTP-bindande protein som spelar en central roll i nucleocytoplasmatisk transport i eukaryota celler. Det existerar i två former: GTP-bundet Ran (aktivt) och GDP-bundet Ran (inaktivt).

Ran aktiveras av en guanosintriphosphatväxelprotein, som katalyserar utbytet av GTP för GDP. När Ran är bundet till GTP transporteras det från cytoplasman in i kärnan genom ett komplex med importin. I kärnan hydrolyseras GTP till GDP och två fosfatgrupper av RanGAP (RanGTP-avkopplande protein), vilket leder till att Ran blir inaktiverat och kan transporteras tillbaka ut i cytoplasman genom ett komplex med exportin.

Ran deltar också i regleringen av mikrotubuliens dynamik och är involverat i celldelningen.

Protonpumpproteiner, också kända som protonkogenproteiner, är proteiner som aktivt transporterar protoner (H+) över cellyttmembranet. Denna transport process skapar ett koncentrationsgradient för H+ joner och genererar en protonsjö i specifika kompartment inom cellen, vilket är en viktig del av cellens energiproduktion.

Ett exempel på ett protonpumpprotein är ATPas, som hittas i mitokondriernas inner membran och i cellytan hos epitelceller i mag-tarmkanalen. I mag-tarmkanalen är detta viktigt för att möjliggöra en kontrollerad frisättning av H+ joner till magsäcken, vilket skapar den låga pH som krävs för att bryta ned matspillror. I mitokondrien är ATPas-proteinet en viktig del av oxidativ fosforylering och produktionen av ATP, det viktigaste energibärande molekylen i cellen.

Protonpumpproteiner kan också hittas i andra kompartment inom cellen, såsom i endosomer och golgiapparaten, där de hjälper till att underhålla ett specifikt pH-värde som krävs för korrekt proteintransport och -förädling.

HSP110 är en typ av stressprotein som tillhör den stora familj av heat shock proteiner (HSP). Proteinet HSP110, även känt som HSPH1, har en molekylär vikt på 110 kDa och fungerar som en katalytisk chaperon. Det hjälper till att korrekt folda, monterara och transportera andra proteiner i cellen, särskilt under stressförhållanden som höga temperaturer, toxicitet av främmande ämnen eller oxidativ stress. HSP110-proteinet har också visat sig ha en viktig roll i celldefens och protekción mot apoptos (programmerad celldöd).

"Actiners" är ett medicinskt term som saknar betydelse på engelska eller svenska. Det kan ha förväxlats med "actinic keratosis", som är en medicinsk diagnos på svenska som ungefär betyder "aktinsk broskbildning". Det handlar om en förändring i huden som orsakas av solskador och kan vara ett tecken på ökad risk för hudcancer.

Om du menade något annat, vänligen klargör ditt spörsmål och jag kommer att göra mitt bästa för att besvara det korrekt.

Rab1 GTP-bindande proteiner är en typ av GTPas-proteiner som tillhör Ras-superfamiljen och är involverade i regleringen av intracellulär trafficking, särskilt vesikeltransport mellan endoplasmret retrogradt (bakåt) till endoplasmatiska retikulumet (ER). Dessa proteiner fungerar som molekylära switche genom att cycliskt binda och hydrolysera GTP. När Rab1-proteinet är bundet till GTP aktiveras det och kan interagera med sina effektorproteiner för att koordinera transporten av vesiklar mellan olika kompartment inne i cellen. När GTP hydrolyseras till GDP inaktiveras Rab1-proteinet och kan inte längre interagera med sina effektorproteiner, vilket gör att traffickingprocessen kan fortsätta till nästa kompartment.

'Saccharomyces cerevisiae' er en art av gjennomgående levende svamp, også kjent som bakerens gær. Proteiner i S. cerevisiae refererer til de forskjellige typer proteinmolekyler som produseres av denne organisasjonen. Disse proteinenene spiller mange forskjellige roller i cellens funksjon, inkludert strukturelle, enzymatiske og regulatoriske funksjoner. Nogen av disse proteinene kan også ha mediskje vital betydning for mennesker, særlig når det gjelder bakeri- og ølfermentasjon, ettersom de er involvert i prosessen til å omdanne sukker til alkohol og kultivering av dough. Proteiner fra S. cerevisiae brukes også i biomedisinske forskningsområder, særlig når det gjelder studier av celullær prosesser som kan være relevante for menneskelig sykdom.

Ras GTPas-aktiverande proteiner (Ras GEFs) är en typ av protein som aktiverar Ras-proteinet genom att underlätta utbytet av GDP (guanosindifosfat) till GTP (guanosintrifosfat). Ras-proteinet är en viktig regulerande komponent i intracellulära signaltransduktionsvägar som styr cellens tillväxt, differentiering och överlevnad. När Ras är aktiverat genom att binde till GTP, interagerar det med effektorproteiner och initierar en kaskad av händelser som leder till specifika cellulära svar. Ras GEFs spelar därför en viktig roll i cellsignaleringen och har visat sig vara involverade i patologiska processer som cancerutveckling.

NIH 3T3 celler är en immortaliserad celllinje som utvecklats från musvuxenfibroblaster. Den används ofta inom forskning, särskilt för studier av celldifferentiering, signaltransduktion och cancer. NIH 3T3-celler är en god kontrollcelllinje eftersom de tenderar att ha ett stabilt genetiskt tillstånd och är relativt lätta att odla i laboratoriemiljö.

Hela-celler, även kända som HeLa-celler, är en immortaliserad celllinje som isolerades från ett cancerpatient som led av cervixcancer. Patienten hette Henrietta Lacks och hennes celler togs utan hennes vetskap eller samtycke under en operation 1951.

HeLa-cellerna är speciella eftersom de är "immortala", vilket betyder att de kan dela sig oändligt i laboratoriemiljö och fortsätta växa och reproduceras under lång tid. Detta gör dem till en mycket användbar resurs inom biomedicinsk forskning, eftersom de kan användas för att studera cellbiologi, genetik, cancer, virusinfektioner och andra sjukdomar.

HeLa-cellerna var den första mänskliga celllinjen som lyckades kultivera i laboratoriet och har sedan dess använts i tusentals forskningsstudier världen över. De har bidragit till ett stort antal vetenskapliga framsteg, inklusive utvecklingen av poliovaccinet, upptäckten av telomeraser och studiet av cellcykeln.

Emellertid har användningen av HeLa-celler också varit kontroversiell på grund av etiska frågor kring patientens samtycke och efterlevande familjs rättigheter till hennes genetiska information.

Brefeldin A er ein protein kinase inhibitor som støter på den intracellulære transporten av proteiner i eit cellular system, særlig mellom endoplasmic reticulum og Golgi-apparatet. Det blir brukt i forskning for å undersøke mekanismane til proteintransport og -lagering i cellar. Brefeldin A er også kjent for å ha en antifungal effekt og blir brukt i medisinen som ein del av behandlinga av svampinfeksjonar.

"Cell membrane," også kjent som plasma membran, er en flexible, semipermeable barriere som omgir alle levende celler. Det består hovedsakelig av lipider og proteiner og har til oppgave å kontrollere pasasjen av molekyler, ions og andre stoffer inn i og ut av cellen. Lipidbilagen i cellmembranen er organiert som en dobbeltlayet med hydrofobe halvballer mot hverandre og hydrofille halvballer vendt ut og inne i cellen. Proteinmolekyler inneholdt i membranen kan fungere som transportproteiner, reseptorer, enzymers eller mekaniske koblinger til cytoskelettet. Cellmembranen er viktig for å opretholde cellens homeostasisme og integritet.

"Bindningsplatser" är ett begrepp inom strukturell biokemi och molekylärbiologi som refererar till de specifika områdena på en molekyl där den binder till en annan. Dessa bindningsplatser kan finnas på proteiner, DNA, RNA eller andra biomolekyler. De består ofta av aminosyrorsekvenser eller nukleotidsekvenser som har förmågan att känna igen och binda till specifika strukturella egenskaper hos en annan molekyl.

I proteiner kan bindningsplatser vara exponerade på proteinytan eller inbäddade i proteinets tredimensionella struktur. De kan vara specialiserade för att binde till små molekyler, joner, andra proteiner, DNA eller RNA. I DNA och RNA kan bindningsplatser bestå av komplementära baspar som möjliggör specifik bindning mellan två komplementära strängar.

Kännedom om bindningsplatser är viktigt inom forskning och medicinsk applikation, eftersom det kan användas för att utveckla läkemedel som binder till specifika proteiner eller andra molekyler i kroppen. Det kan också hjälpa till att förstå hur genuttryck regleras och hur signaleringsvägar fungerar inom celler.

Rho-specific guanine nucleotide dissociation inhibitors (RhoGDI) are a group of proteins that regulate the function of Rho GTPases, which are important signaling molecules involved in various cellular processes such as actin cytoskeleton regulation, gene expression, and cell cycle progression.

RhoGDI proteins bind to Rho GTPases in their inactive state, preventing them from interacting with guanine nucleotide exchange factors (GEFs) that would activate them. By doing so, RhoGDIs help regulate the spatial and temporal activation of Rho GTPases, ensuring that they are activated only when and where needed in the cell.

RhoGDI proteins have been identified as potential targets for therapeutic intervention in various diseases, including cancer, inflammation, and neurological disorders. Inhibitors of RhoGDI function have been shown to modulate Rho GTPase activity and affect downstream signaling pathways, making them promising candidates for drug development.

"Bärarproteiner", eller "transportproteiner", är proteiner som binder till och transporterar specifika molekyler, såsom hormoner, vitaminer, lipider och joner, genom cellmembranet eller inom cellen. De hjälper till att reglera cellytans homeostas och kommunikation mellan olika celler. Exempel på bärarproteiner inkluderar hemoglobin, som transporterar syre i blodet, och LDL-cholesterol, som transporterar kolesterol i blodet.

'Saccharomyces cerevisiae' er en art av enkle celler organismer kjent som gjær. Den er en av de mest velstuderte arter av gjær og har vært brukt i både vitenskapelige studier og industrielle prosesser i tusenvis av år.

'Saccharomyces cerevisiae' er en fakultativt anaerob livsform, det vil si at den kan overleve ved å bruke ilkje for å oksidere sukker til kolsiringsprodukter som koldioxid og alkohol. Denne fermenteringsevnen er viktig i bakeri- og drikkevareindustrien, hvor den blir brukt til å lage brød, øl og vin.

I tillegg til sine praktiske anvendelser, er 'Saccharomyces cerevisiae' også en viktig modellorganisme i biologi og genetikk. Den har en liten, veldefinerte genom med om lag 6000 gener, og denne enkelhet gjør den til et ideelt system for å studere grunnleggende cellulære prosesser som celldeling, DNA-reparasjon og regulering av genuttrykk.

Onkogenproteiner är proteiner som bildas från onkogener, vilka är gener som har potentialen att orsaka cancer. Onkogener kan utvecklas genom mutationer i normalt fungerande cellulära gener, kallade protoonkogener. När en protoonkogen muteras och blir onkogen, kan det leda till oreglerad celldelning och cancer. Onkogenproteinerna kan vara aktiverade kontinuerligt eller ha ökad aktivitet jämfört med deras normala motsvarigheter, vilket leder till onormal celltillväxt och cancer. Exempel på onkogenproteiner inkluderar HER2/neu, EGFR och BCR-ABL.

'SRC-domäner' är ett begrepp inom molekylär biologi och genetik. Det står för "sökvägsrelaterade komponenter" (engelska: "signal transducing receptor") och refererar till en grupp av membranproteiner som kan ta emot signaler från utvändiga faktorer, såsom hormoner, cytokiner eller tillväxtfaktorer, och överföra denna information in i cellen.

SRC-domäner är typiskt sett transmembrana proteiner med en extracellulär domän som binder till ligander (molekyler som aktiverar receptorn), en transmembrandomän som utgör den del av proteinet som spänner över cellmembranet, och en intracellulär domän som är involverad i signaltransduktionen. När en ligand binder till den extracellulära domänen aktiveras receptorn, vilket leder till att den intracellulära domänen interagerar med andra proteiner och utlöser en kaskad av intracellulära signaleringsvägar.

Det är värt att notera att SRC-domäner inte ska förväxlas med Src-proteinet, som är ett cytoplasmiskt tyrosinkinasprotein som också spelar en roll i cellsignalering.

The cytoskeleton is a complex network of various protein filaments that provides structural support, shape, and stability to the cell. It plays a crucial role in several cellular processes, including cell division, intracellular transport, and maintenance of cell shape. The cytoskeleton is composed of three major types of protein filaments: microfilaments, intermediate filaments, and microtubules.

1. Microfilaments: These are thin, flexible filaments made up of actin proteins. They are involved in muscle contraction, cell motility, and maintenance of cell shape.
2. Intermediate Filaments: These are thicker than microfilaments and less rigid than microtubules. They provide structural support and stability to the cell and are composed of various proteins such as keratin, vimentin, and neurofilaments.
3. Microtubules: These are hollow, tube-like structures made up of tubulin proteins. They play a crucial role in intracellular transport, maintenance of cell shape, and cell division (mitosis).

The cytoskeleton is dynamic and constantly undergoes reorganization to adapt to changing cellular needs. It interacts with various organelles and structures within the cell, such as the plasma membrane, nucleus, and centrosomes, to maintain proper cell function and organization.

Molekylär kloning är en biologisk teknik där man skapar exakta kopior av specifika gener eller andra stycken av DNA. Detta görs genom att skapa en rekombinant DNA-molekyl, vilken består av DNA från två olika källor. Denna rekombinanta DNA-molekyl innehåller oftast en önskad gen som är flankerad av kontrollsekvenser, så kallade promotor- och terminatorkärnor, som styr när och hur mycket av genen ska exprimera sig.

Den rekombinanta DNA-molekylen införs sedan i en värdcell, ofta en bakteriecell eller en eukaryot cell, där den kan replikera sig tillsammans med cellens egna gener. På det viset produceras stora mängder av den önskade genen eller DNA-sekvensen.

Molekylär kloning används inom forskning för att studera geners funktion och interaktion, för att producera proteiner i stor skala för medicinska tillämpningar och för att skapa genetiskt modifierade organismer som används inom jordbruk och bioteknik.

"Cell movement" or "cell motion" refers to the ability of cells to change their location within an organism. This process is essential for various biological functions, including embryonic development, wound healing, and immune responses. There are several types of cell movements, such as:

1. **Random motility:** Also known as chemokinesis, this type of movement occurs when cells move randomly in response to changes in their environment, such as temperature or pH.
2. **Directed motility:** This type of movement is directional and occurs when cells respond to chemical gradients, a process called chemotaxis. For example, immune cells can migrate towards the site of an infection in response to chemicals released by bacteria.
3. **Cytokinesis:** This is the process by which a cell divides into two daughter cells during mitosis or meiosis. The cell membrane constricts and eventually pinches off, separating the two cells.
4. **Amoeboid movement:** This type of movement is characterized by the extension and retraction of pseudopodia (false feet), allowing the cell to move through its environment. This is common in certain types of white blood cells and single-celled organisms like amoebas.
5. **Actin-based motility:** Many types of cells use actin filaments, a type of protein, to generate forces for movement. The polymerization and depolymerization of actin filaments can push or pull the cell membrane, leading to cell movement.

These are just a few examples of cell movements with their own unique mechanisms and functions.

I medicinen refererer kinetik specifikt till läkemedelskinetik, som är studiet av de matematiska modellerna som beskriver hur ett läkemedel distribueras, metaboliseras och utsöndras i en levande organism. Det finns fyra huvudsakliga faser av läkemedelskinetik:

1. Absorption (absorption): Hur snabbt och effektivt absorberas läkemedlet från gastrointestinal tract till blodomloppet.
2. Distribution (distribution): Hur snabbt och i vilken utsträckning fördelar sig läkemedlet i olika kroppsvävnader och vätskor.
3. Metabolism (metabolism): Hur snabbt och hur påverkar läkemedlets kemiska struktur i kroppen, ofta genom enzymer i levern.
4. Elimination (elimination): Hur snabbt och effektivt utsöndras läkemedlet från kroppen, vanligtvis via urin eller avföring.

Läkemedelskinetiken kan påverkas av många faktorer, inklusive patientens ålder, kön, genetiska variationer, lever- och njurfunktion samt andra läkemedel som patienten tar.

A-kinase anchor proteins (AKAPs) are a group of structurally diverse proteins that play a role in regulating cellular signaling by serving as scaffolds for the organization of signaling complexes. AKAPs have a specific binding site for protein kinase A (PKA), a key enzyme involved in many cellular processes, and help to localize PKA to specific subcellular compartments where it can phosphorylate and regulate its target proteins.

The term "A-kinase" refers to PKA, and "ankar" refers to the anchoring protein that binds to PKA. The AKAPs are named for their ability to anchor PKA in specific locations within the cell, allowing for precise regulation of signaling pathways.

In addition to binding to PKA, many AKAPs also interact with other signaling proteins, such as protein phosphatases, ion channels, and G-protein coupled receptors, forming large signaling complexes that allow for the integration and coordination of multiple signaling pathways.

Defects in AKAP function have been implicated in a variety of diseases, including cancer, cardiovascular disease, and neurological disorders. Therefore, understanding the structure and function of AKAPs is an important area of research with potential therapeutic implications.

'Svampproteiner' är ett mycket brett begrepp som inkluderar alla proteiner som produceras eller finns naturligt i svampar. Svampar utgör en egen domän av levande organismer, Fungi, och de har en unik cellstruktur och biokemi jämfört med växter och djur.

Svampproteiner kan variera mycket i sin funktion och struktur beroende på vilken typ av svamp de kommer ifrån och vilket syfte de har i den specifika organismen. Några exempel på olika typer av svampproteiner inkluderar enzymer, toxiner, strukturproteiner, signalproteiner och transporterproteiner.

Enzymer är proteiner som fungerar som biokemiska katalysatorer och hjälper till att accelerera olika reaktioner i svampens cell. Toxiner är skadliga proteiner som kan producera av vissa svampar och användas för att bekämpa andra organismer eller försvara sig själva. Strukturproteiner ger stöd och form till cellen, medan signalproteiner hjälper till att koordinera olika cellprocesser. Transporterproteiner transporterar olika molekyler över celldelarna och hjälper till att reglera cellens inre miljö.

I medicinsk kontext kan svampproteiner ha potential som terapeutiska mål eller som bas för utveckling av nya läkemedel. Exempelvis kan enzymer som produceras av vissa svampar användas i industriella processer, medan toxiner kan användas som modeller för att designa nya läkemedel mot olika sjukdomar.

Biological models är matematiska eller datorbaserade representationer av biologiska system, processer eller fenomen. De används inom forskning för att simulera, analysera och förutsäga beteendet hos komplexa biologiska system, som exempelvis celler, organ, populationer eller ekosystem. Biological models kan vara mekanistiska (baserade på förståelse av underliggande mekanismer) eller empiriska (baserade på experimentella observationer och korrelationer). Exempel på biologiska modeller inkluderar systemdynamikmodeller, differentiall equations-modeller, agentbaserade modeller och neuronala nätverksmodeller.

Stress fibers are thin, cable-like structures in cells that are made up of bundled actin filaments and myosin motor proteins. They are called "stress" fibers because they tend to form in response to mechanical stress or tension on the cell, helping to maintain cell shape and provide structural support. Stress fibers also play a role in cell motility and adhesion, as well as in the transmission of forces within and between cells. They are dynamic structures that can change in length and organization in response to changes in the cell's environment or mechanical stresses.

"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.

En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.

Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.

CDC42 är ett småGTP-bindande protein som spelar en central roll i celldelning och cytoskelettreorganisering hos jästsvampen Saccharomyces cerevisiae. Det aktiveras av guaninnukleotideutexchanger (GEF) proteiner och inaktiveras av GTPas-aktiverande protein (GAP) proteiner. När CDC42 är aktiverat, interagerar det med effektormolekyler som reglerar cytoskelettreaktioner, vilket leder till cellcykelförlopp och cellytorreorganisering.

Rekombinanta proteiner är proteiner som har skapats genom tekniker för genetisk rekombination, där man kombinerar DNA-sekvenser från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskvärda egenskaper. Denna teknik möjliggör produktionen av stora mängder specifika proteiner med konstant och predikterbar struktur och funktion. Rekombinanta proteiner används inom flera områden, till exempel inom medicinen för framställning av läkemedel som insulin, vaccin och enzymer.

Den Golgi-apparaten är ett organell i eukaryota celler som är involverad i modifiering, sorting och transport av proteiner och lipider. Det består av staplade, flercelliga säckar, cisternor, som är arrangerade i parallella rader och omges av ett membransystem. Proteiner och lipider transporteras in i Golgi-apparaten i en vesikel från det endoplasmatiska nätverket (ER), där de modifieras genom en serie av processer, inklusive glykosylering, sulfatisering och fosforylering. Efter att ha blivit modifierade transporteras proteiner och lipider sedan ut från Golgi-apparaten i vesiklar till olika delar av cellen eller förpackas in i sekretoriska granuler som kommer att släppas ut från cellen.

Fluorescensmikroskopi är en form av ljusmikroskopi där man använder fluorescerande markörer för att göra vissa strukturer eller substanser i ett preparat synliga. Metoden bygger på att vissa molekyler, när de exponeras för ljus av en viss våglängd, absorberar den energin och sedan sänder ut den igen som ljus av en annan våglängd. Detta fenomen kallas fluorescens.

I fluorescensmikroskopi används ofta fluorescerande proteinmarker, så kallade fluoroforer, för att markera specifika proteiner eller andra molekyler i ett preparat. När preparatet exponeras för ljus av en viss våglängd kommer de markerade strukturerna att fluorescera och bli synliga under mikroskopet. Genom användning av olika typer av fluoroforer kan man få olika fluorescerande markeringar i samma preparat, vilket gör det möjligt att studera interaktioner mellan olika molekyler eller strukturer.

Fluorescensmikroskopi är en mycket känslig metod som kan användas för att studera mycket små koncentrationer av markerade substanser. Den kan också användas för att studera dynamiska processer i levande celler, eftersom fluoroforerna ofta är relativt ofarliga för cellerna och kan hålla i sig sin fluorescens under en längre tid.

Fosfoproteiner är proteiner som innehåller kovalent bundna fosfatgrupper. Den vanligaste typen av fosfatbinding sker på serin, treonin och tyrosinresidyer i proteinmolekylen, men även histidin kan under vissa förhållanden fosforyleras. Fosfatgruppen tillförs proteinet av en specifik enzymklass som kallas kinaser, medan de avlägsnas av en annan grupp enzymer som kallas fosfataser.

Fosforylering av proteiner är en mycket vanlig posttranslatorisk modifiering och spelar en central roll i cellulär signalering och reglering av olika cellulära processer, såsom celldelning, differentiering, apoptos och metabolism. Fosforyleringen kan leda till konformationsförändringar hos proteinet, vilket kan påverka dess funktion, samt skapa nya bindningsställen för andra proteiner som kan ingå i signaltransduktionskedjor. Dessutom kan fosfatgruppen fungera som en negativ laddning och på så sätt påverka proteinets elektrostatiska egenskaper, vilket kan ha konsekvenser för dess interaktion med andra molekyler.

'Cercopithecus aethiops' er en art innen slætten primater (Primates) og familien markattrer (Cercopithecidae). Den kjennes også under fremdeles navnet husabariabeeste, og er også kallen for grøn markatt. Denne aben er oprinnelig hjemmehørende i subsaharisk Afrika, og lever i en variert bredde av skogsområder, fra regnskog til savanner med trær.

'Cercopithecus aethiops' har en slank kroppsbygning og er kjent for sine svelge lange lemmer og svans. Den kan bli mellom 40 til 70 cm lang, med en svans som kan være like lang eller lenge som kroppen. Den veier mellom 3,9 til 7,7 kg. Pelsen er grønnegrå eller brun på ryggen og hvit på buken. Ansiktet er sort med en hvit skjegg rundt munnene.

Denne aben lever i grupper som kan inneholde opp til 30 individer, deriblant flere hanar og hunar. Den er allikevel merkет av en matriarkal struktur, med de ældre hunnene som dominerer over de yngre. Føden består av frukt, frø, blader, bark, insekter og små dyr.

'Cercopithecus aethiops' er kjent for sin evne til å springe langt og høyt fra gren til gren i skogen. Den har også en unik metode for å vaskes selv, ved å bruke sine hænder for å fjerne parasitter og skjedde med pelsen.

Denne aben er ikke direkte truet av utdøing, men populationen er i tilbakegang på grunn av økende jordbruksområder, skogsavverkning og illegal handel med viltlevende dyr. Derfor er det viktig å ta stilling for å beskytte denne abens levevilkår og sikre at den kan overleve og trives i fremtiden.

Protein-serin-treonin kinaser (PST-kinaser) är en grupp enzymer som har förmågan att katalysera överföringen av en fosfatgrupp från ATP till serin eller treonin aminosyror i proteiner. Denna process kallas fosforylering och den reglerar ofta proteinaktivitet, lokalisation och interaktion med andra molekyler inom cellen. PST-kinaserna spelar därför en viktig roll i cellsignalering, celldelning, apoptos och metabolism. Dereglering av dessa kinaser kan leda till olika sjukdomszustånd, exempelvis cancer.

'Sequencing' är ett begrepp inom genetiken som refererar till metoder för bestämandet av raka rader (sekvenser) av nukleotider, de grundläggande byggstenarna i DNA och RNA. 'Sequencing' används ofta för att undersöka gener och andra delar av DNA för att få information om deras struktur, funktion och evolutionära utveckling.

'Sekvensinpassning' (engelska: sequence alignment) är en metod inom bioinformatiken som används för att jämföra två eller flera DNA- eller proteinsekvenser för att hitta likheter och skillnader mellan dem. Genom att jämföra sekvenser kan forskare identifiera konserverade regioner, mutationer, evolutionära relationer och möjliga funktionella roller.

Sekvensinpassning kan användas för att undersöka olika aspekter av DNA- eller proteinsekvenser, till exempel struktur, funktion, evolutionärt ursprung och släktskap. Det är en viktig metod inom komparativ genetik, molekylär evolution och strukturell biologi.

I sekvensinpassning jämförs två eller flera sekvenser med varandra genom att lägga till luckor (gaps) i sekvenserna för att matcha upp dem så bra som möjligt. Det finns två huvudtyper av sekvensinpassning: global och lokal. Global inpassning jämför hela sekvenserna med varandra, medan lokal inpassning endast jämför delar av sekvenserna där likheter finns.

Sekvensinpassning kan användas för att hitta homologa sekvenser (sekvenser som har gemensam evolutionärt ursprung), identifiera mutationer och andra variationer, och studera evolutionära relationer mellan olika arter eller populationer. Det kan även användas för att förutsäga struktur och funktion hos okända sekvenser genom att jämföra dem med kända sekvenser med liknande egenskaper.

"Cell culturing" or "cell cultivation" is the process of growing and maintaining cells in a controlled environment outside of a living organism. This is typically done in a laboratory setting using specialized equipment and media to provide nutrients and other factors necessary for cell growth and survival. The cells can be derived from a variety of sources, including human or animal tissues, and can be used for a range of research and therapeutic purposes, such as studying cell behavior, developing new drugs, and generating cells or tissues for transplantation.

GTP (guanosintriphosphat) är ett nucleotid som fungerar som energibärare i celler. Proteiner som binder till och hydrolyserar GTP deltar i en rad cellulära processer, såsom signaltransduktion, translation, regulering av cytoskelettet och vesikeltrafik.

GTP-bindande proteiners alfa-underenheter är en specifik typ av GTPaser som består av ett monomeriskt protein med en molekylvikt på ungefär 20-40 kDa. Dessa proteiner har en gemensam struktur och funktion, vilket inkluderar:

1. En GTP-bindande domän: Denna domän binder till och hydrolyserar GTP till GDP (guanosindifosfat). När GTP är bundet har proteinet en hög affinitet för sina effektorproteiner, medan den minskar när GTP hydrolyseras till GDP.
2. En effektordomän: Denna domän interagerar med andra proteiner och utövar en reglerande funktion på cellulära processer.
3. En switch-region: Denna region är flexibel och kan ändra konformation när GTP hydrolyseras till GDP, vilket leder till att proteinet förlorar sin affinitet för sina effektorproteiner.

Exempel på GTP-bindande proteiners alfa-underenheter inkluderar RAS-proteiner, RAC-proteiner och CDC42-proteiner. Dessa proteiner är involverade i cellcykeln, celldelning, signaltransduktion och cytoskelettreglering.

Molekylära modeller är matematiska och grafiska representationer av molekyler och deras interaktioner på en molekylär nivå. Dessa modeller används inom flera områden inom naturvetenskapen, till exempel inom biologi, kemi och fysik, för att förutsäga hur olika molekyler beter sig och interagerar med varandra.

En molekylär modell kan bestå av en tredimensionell struktur av en molekyl, som visar var varje atom finns placerad och hur de är bundna till varandra. Den kan också inkludera information om elektronmolntopologi, laddning och andra fysikaliska egenskaper hos molekylen.

Molekylära modeller kan användas för att simulera kemiska reaktioner, studera proteiners struktur och funktion, utveckla läkemedel och förstå komplexa biologiska system på en molekylär nivå. Genom att visualisera och analysera molekylära modeller kan forskare få en bättre förståelse för de grundläggande principerna som styr molekyler och deras interaktioner, vilket kan leda till nya insikter och innovationer inom många olika områden.

Membranproteiner är proteiner som är integrerade i eller associerade med cellmembran, såsom plasma membran, mitokondriella membran och endoplasmatiska retikulums membran. De kan vara inkorporerade i lipidbilagan i membranet eller fäst vid ytan av membranet. Membranproteiner utför en rad viktiga funktioner, såsom transport av molekyler över membranet, signaltransduktion och cellytiska processer som celladhesion och celldelning. Enligt en uppskattning utgör membranproteiner upp till 30% av det proteomika landskapet hos eukaryota celler. Membranproteiner kan delas in i tre kategorier baserat på deras struktur och funktion: transmembrana proteiner, bitmembrana proteiner och GPI-ankrade proteiner.

'Vesicular transport proteins' refererer til klasse af proteinmolekyler som er involveret i intracellulær transport og fordeling av vesikler, små blærer der indeholder forskellige molekyler, inklusive neurotransmittere, hormoner og enzymer. Disse proteiner hjælper med at transportere vesiklerne fra én del af cellen til en anden, såsom fra endoplasmatisk reticulum til Golgiapparatet eller fra Golgiapparatet til cellemembranen.

Der findes to hovedtyper af vesicular transport proteins: vesikelklæbeproteiner (v-SNAREs) og targetmembranproteiner (t-SNAREs). V-SNAREs er placeret på vesiklens overflade, mens t-SNAREs findes på overfladen af det membran, som vesikeln skal fusionere med. Når v-SNARE og t-SNARE proteinerne interagerer, hjælper de med at sikre en præcis sammenfletning mellem vesikel og målmembran, så molekylerne i vesikeln kan frigives til deres destination.

Vesicular transport proteins spiller dermed en essentiel rolle for cellens normale funktion, herunder nogenlunde korrekt syntese, lagring og udskillelse af proteiner og andre molekyler.

Heterotrimera GTP-bindande proteiner är en typ av proteinkomplex som består av tre underenheter (alfa, beta och gamma), vilka var och en har en bindningsplats för GTP (guanosintrifosfat). Dessa proteiner deltar i intracellulära signaltransduktionsvägar och är involverade i regleringen av cellcykeln, celldelning och cellmotilitet.

De tre underenheterna i ett heterotrimert GTP-bindande protein har olika funktioner. Alfaunderenheten kan binda både GDP och GTP, medan betaunderenheten enbart kan binda GDP. Gammainunderenheten är konstant bundet till nucleotiden GDP. När ett signalmolekyl binder till receptorn aktiveras alfaunderenheten, vilket leder till utbytet av GDP till GTP och en konformationsändring hos alfaunderenheten. Detta resulterar i att alfaunderenheten separeras från betaunderenheten och gammainunderenheten, och kan nu interagera med andra proteiner för att utöva sin funktion. När GTP hydrolyseras tillbaka till GDP inaktiveras alfaunderenheten igen och den kan återförenas med betaunderenheten och gammainunderenheten.

Ett exempel på ett heterotrimert GTP-bindande protein är G-proteinet, vilket deltar i signaltransduktionen från receptorer till effektorproteiner.

RhoB GTP-bindande proteiner är en del av Rho-GTPasfamiljen, som tillhör de små GTP-bindande proteinerna. Dessa proteiner fungerar som molekylära switche och är involverade i regleringen av cellens cytoskelett, cellyta och celldelning. RhoB aktiveras genom att binda till GTP och inaktiveras genom att hydrolysera GTP till GDP. RhoB har också visat sig vara involverat i signaltransduktion relaterad till cellcykeln, apoptos och cancer.

En katalys är ett molekyul eller jon som ökar hastigheten på en kemisk reaktion genom att sänka energibarriären för reaktionen, men själv inte förändras i antal eller typ under processen. Katalytiska reagens deltar alltså inte i reaktionen och produceras inte som ett produkt av den heller. Istället fungerar de genom att sänka den aktiveringsenergi som behövs för att starta reaktionen, vilket gör att fler molekyler kan reagera under givena förhållanden. Katalysatorer är mycket viktiga inom biologin och industrin eftersom de gör det möjligt att effektivt producera en mängd olika kemikalier och material.

Guanylylimidodifosfat (GITP) är ett syntetiskt nukleotidmolekyl som används inom forskning för att studera celldelning och signaltransduktion. Det fungerar som en analog av GTP (guanosintrifosfat), ett viktigt molekyll i cellulär signalsystem.

GITP är strukturellt sett mycket likt GTP, men har en extra imidodifosfatgrupp bunden till guaninringen. Denna modifiering gör att GITP kan användas som ett inhibitor av vissa enzymer som normalt behöver GTP för sin funktion.

I medicinsk kontext är GITP inte direkt använt som en läkemedel, men det kan användas inom forskning för att undersöka olika cellulära processer och möjligen hitta nya terapeutiska mål.

Cyclic AMP, eller cAMP (cyclisk adenosinmonofosfat), är ett second messenger-molekyl som spelar en viktig roll i cellsignalering inom organismen. Det bildas inifrån cellen när en hormonreceptor på cellmembranet aktiveras av ett hormon, till exempel glukagon eller adrenalin. Aktiveringen av receptorn leder till att en G-proteinkomplex kopplad till receptorn aktiveras, vilket i sin tur aktiverar en enzymkomplex kallad adenylatcyklas. Adenylatcyklasen konverterar ATP till cAMP, som sedan fungerar som en signalsubstans inom cellen och aktiverar olika proteinkinas-enzymkomplex. Dessa komplex kan leda till olika fysiologiska respons, beroende på vilket hormon som initialt aktiverade receptorn. När signalsubstanserna cAMP har utfört sin funktion bryts de ned av fosfodiesteras-enzymkomplex, varpå signalsystemet återgår till det ursprungliga tillståndet.

"PROTEINER C-CRK" er ein familie av signalproteiner som spiller en viktig rolle i cellers signalforskyvning og regulering. Disse proteinetne inneholder en domen kalla Src Homology 2 (SH2) som kan binde seg til andre proteiner som har en fosfatgruppering på tyrosinresidivet sitt. Dette gjør at de kan regulere andre proteins aktivitet og funksjon.

"PROTONKOGENPROTEINET C-CRK" er eit speisialt slags protein i denne familie som produseres av et gen kalla c-crk. Dette genet inneholder instruksjonene for å produsere dette proteinet, og det finnes to varianter av dette genet hos mennesket. Disse variantene kan resultere i ulike former av c-crk-proteinet som har ulikke funksjoner.

C-CRK-proteinet er involvert i mange cellulaere prosesser, blant annet reguleringen av cellevisning og cellevekst, samt reguleringen av celldeling og apoptose (programmert celledød). Det har også vore funnene som viser at det spiller en rolle i reguleringen av immunsystemet og inflammasjonen. Videre kan feilregulering av c-crk-proteinet være involvert i ulike sjukdomar, blant annet kreft.

Cellkärneproteiner är proteiner som finns i cellkärnan och utför olika funktioner där. De kan delas in i flera kategorier baserat på deras funktion, såsom strukturella protein som bildar kärnans cytoskelett och lamina, regulatoriska proteiner som kontrollerar genuttryck och replikation, och enzymproteiner som katalyserar reaktioner inne i cellkärnan. Cellkärneproteinerna är viktiga för celldelning, genreglering, signaltransduktion och andra cellulära processer.

"Complementary DNA" (cDNA) är en syntetisk enkelsträngad DNA-molekyl som skapas genom att transkribera en messenger RNA (mRNA)-molekyl med hjälp av en revers transkriptas. cDNA används ofta i molekylärbiologiska experiment, till exempel för att klona specifika gener eller studera genuttryck.

Den komplementära naturen av cDNA och den ursprungliga mRNA-molekylen gör det möjligt att använda cDNA som en representation av den ursprungliga genen, eftersom basparningen mellan DNA och RNA följer komplementära regler (A parar sig med T respektive G parar sig med C). Detta gör cDNA till ett värdefullt verktyg inom molekylärbiologi, eftersom det ofta är lättare att arbeta med DNA än RNA.

"Serum response factor (SRF) is a transcription factor that binds to a specific DNA sequence called the CArG box, which is found in the regulatory regions of many immediate early genes and genes involved in cellular responses such as proliferation, differentiation, and survival. SRF plays a crucial role in regulating gene expression in response to various stimuli including growth factors, hormones, and mechanical stress."

Source: NCBI Gene database -

Glutathion-S-transfereaser (GST) er en type enzym, som hjælper med at afbrydegiftene i kroppen. De gør dette ved at forbinde giftstofferne med et tripeptid kaldet glutation, der er dannet af aminosyrerne cystein, glutaminsyre og glycin. Dette dannes en mindre toksisk forbindelse, som kan fjernes fra kroppen mere let. GSTs findes i mange forskellige arter, herunder mennesker, og de er især koncentreret i leveren, lungerne og nyrerne. Der findes flere forskellige typer af GSTs, hver med en specifik rolle i at neutralisere bestemte slags gifte.

Sonen of Sevenless (Sos) er ein proteine som i Drosophila melanogaster spiller en viktig rolle i den intrasellulære signalingen i den såkalte Ras/MAPK-signalveien. Disse signalveiene er involvert i reguleringa av cellvoksing, celldifferentiering og cellcyklusregulering.

Sos-proteinet fungerer som en GEF (Guaninnucleotideutskifter) for Ras-proteinet, det vil si at det hjelper til å aktivere Ras ved å bytte ut en inaktiv form av Ras med en aktiv form. Dette skjer når Sos interagerer med Drk (Drosophila-ekvivalenten til Grb2 i pattedyr), som blir aktivert av RTKs (reaktorfaktor tyrosinkinasere) som er bundet til en ligand.

I sum, er Son of Sevenless Protein i Drosophila ein viktig del av Ras/MAPK-signalveien og hjelper til å aktivere Ras for å regulere cellvoksing, celldifferentiering og cellcyklusregulering.

Medicinsk definition: Mutagen, targeted

A mutagen is a physical or chemical agent that can cause permanent changes in the deoxyribonucleic acid (DNA) sequence of an organism's genetic material. These changes, known as mutations, can potentially lead to various consequences, including cell death, cancer, or heritable disorders.

A targeted mutagen is a specific type of mutagen that is designed to introduce mutations into predetermined locations within the genome. This process is often employed in genetic engineering and molecular biology research to study gene function, generate genetically modified organisms (GMOs), or develop novel therapeutic strategies.

Targeted mutagens typically include engineered nucleases, such as zinc finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), and clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein 9 (Cas9) systems. These molecular tools enable precise genome editing by creating double-stranded DNA breaks at specific sites, which are subsequently repaired through cellular mechanisms like non-homologous end joining (NHEJ) or homology-directed repair (HDR). The repair process can result in various outcomes, such as insertions, deletions, or point mutations, thereby altering the function of the targeted gene.

In summary, a targeted mutagen is a deliberate and controlled method to introduce specific genetic changes into an organism's genome using engineered nucleases for various research and therapeutic purposes.

'Pseudopodia' er ein termin i medisinen som refererer til temporære utskjutningar av cellens membran og cytoplasma. Disse strukturene oppstår vanlegest i forbindelse med cellers bevegelse eller fagocytosesproesser, og de kan ha ulik form og størrelse alt etter hvilken type celle det er om og hva som skal foregå.

Pseudopodia inneholder ofte aktinfilamenter, ein slags proteiner som spiller en viktig rolle i cellens skelett og bevegelse. Når de aktive seg, kan de forandre formen på pseudopodiya og drive cellebevegelsen framover.

I fagocytosen er pseudopodia involvert i å omringe og omslutte framtidige byttet, som deretter blir inkorporert inn i cellen gjennom en endelig fagosom. Pseudopodia kan også være involvert i andre prosesser som celleadherens og signaloverføring mellom celler.

HEK (Human Embryonic Kidney) 293 cells är en immortaliserad celllinje som isolerades från humana embryonala njurceller under 1970-talet. Dessa celler har sedan dess blivit ett vanligt verktyg inom molekylärbiologi och genetisk manipulation, eftersom de är lätta att kultivera och har en hög transfektionsgrad. HEK293 celler används ofta för att producera rekombinanta protein och virus-like partiklar (VLPs) i forskning och utveckling av biologiska läkemedel. Det är viktigt att notera att dessa celler inte längre bär samma karaktäristika som de ursprungliga njurcellerna, eftersom de har genomgått en genetisk förändring under kultiveringen.

Immunprecipitation (IP) är en biokemisk metod som används för att isolera och koncentrera specifika proteiner eller nucleinsyra-protein-komplex från en komplex biologisk blandning, såsom celllysat eller serum. Denna teknik bygger på principen om antigen-antikroppsreaktion där ett specifikt antikroppar (immunglobulin) binder till sitt korresponderande antigen (protein av intresse).

I immunprecipitationsexperimentet inkuberar man celllysat eller serum med ett specifikt antikropp som är bundet till en fast fas, såsom magnetiska perler eller en plasttub. Under inkuberingstiden binds antikroppen till sitt korresponderande antigen i lösan fasen. Sedan sköljs systemet för att avlägsna ospecificerat bundna proteiner och andra komponenter. Slutligen elueras immunkomplexen från fast fasen, vilket resulterar i en renare fraktion av det protein av intresse som kan analyseras ytterligare med olika metoder, såsom västra blotting eller masspektrometri.

Immunprecipitation används ofta i forskning för att undersöka interaktioner mellan proteiner, identifiera posttranslatoriska modifikationer och bestämma relaterade signaltransduktionsvägar.

Fosfatidylinositolfosfater (PIPs) är en typ av fosfolipider som innehåller en fosfoinostitol-huvudgrupp och två fettsyra-sidokedjor. De är viktiga komponenter i cellytorna och är involverade i cellsignalering, celldelning och membrantrafik. PIPs kan fosforyleras och dephosphorylas av olika enzymer, vilket ger upphov till en dynamisk reglering av deras funktioner. De kan även fungera som substrat för viktiga signalsubstanser såsom diacylglycerol (DAG) och inositoltrisfosfat (IP3), som är involverade i calciumsignaleringsvägar.

Peptide Extension Factor 1, också känt som PEFI-1 eller hORF57, är ett protein som kodas för av herpesvirus genom att använda alternativ splicing av ett stort öppet läsram (hORF57). Detta protein spelar en viktig roll i virusreplikationen och transkriptionen. PEFI-1 hjälper till att exportera virala mRNA från cellkärnan till cytoplasman, där de kan översättas till proteiner. Dessutom bidrar PEFI-1 till att stabilisera och förlänga virus-specifika peptider under den tidiga fasen av infektionen.

'GTP-bindande proteiners alfaunderenheter, Gi-Go' är benämningar på två olika G-proteiner som binder till och aktiveras av GTP (guanosintrifosfat) och som i sin aktiverade form reglerar vissa cellulära signaltransduktionsvägar.

Gi-proteiner är en del av den signalsystem som kallas för "inhibitörer av adenylatcyklas" (AHC, Adenylyl Cyclase Inhibitors). När Gi-proteinet aktiveras hämmar det enzymet adenylatcyklas från att producera cAMP (cykliskt AMP), vilket i sin tur påverkar andra cellulära processer som exempelvis cellytan, celldelning och celldöd.

Go-proteiner är en del av den signalsystem som kallas för "stimulerande G-proteiner" (GPCR, G Protein Coupled Receptors). När Go-proteinet aktiveras stimulerar det enzymet adenylatcyklas att producera cAMP, vilket påverkar andra cellulära processer som exempelvis cellytan, celldelning och celldöd.

Båda Gi-Go proteinerna är viktiga för att reglera olika cellulära processer och deras felreglering kan leda till sjukdomar som cancer, diabetes och neurologiska störningar.

I'm sorry for any inconvenience, but the term "endosomer" is not a widely recognized or used term in medical or scientific literature. It is possible that you may have misspelled or misremembered the term. If you meant to ask about "endosomes," I would be happy to help provide a definition for that term.

Endosomes are membrane-bound compartments within eukaryotic cells that play a critical role in intracellular trafficking and signaling. They are formed when endocytic vesicles fuse with early endosomes, which then mature into late endosomes. During this maturation process, the luminal pH of the endosome becomes more acidic, and membrane-associated proteins are sorted for recycling back to the plasma membrane or transport to lysosomes for degradation.

Endosomes also serve as a site for receptor-mediated signaling, where ligands can bind to their respective receptors and initiate intracellular signaling cascades. Additionally, endosomes can fuse with other membrane-bound compartments, such as the trans-Golgi network or autophagosomes, to facilitate the exchange of cargo and membranes between these organelles.

I hope this information is helpful! If you have any further questions or need clarification on any points, please don't hesitate to ask.

... är RAS, som aktiveras av GEF:en SOS i MAPK/ERK-signaltransduktionsvägen. Den här artikeln är helt eller delvis baserad på ... Guaninnukleotidutbytesfaktorer, eller guanine nucleotide exchange factors, GEF, är en grupp av proteiner som kan påverka andra ...

https://sv.wikipedia.org/wiki/Guaninnukleotidutbytesfaktor

Anatomi13

Organismer2

Kemikalier och läkemedel77

Tekniker och utrustning för analys, diagnostik och terapi9

Fenomen och processer18

Informatik3

ras-GEF

Guaninnukleotidutbytesfaktorer

SOS1-protein

ras-GFR1

Son of Sevenless Proteins

ras proteiner

Rho Guanine Nucleotide Exchange Factors

GRB2-adaptorprotein

Guaninnukleotider

Protonkogenproteiner c-vav

Guanosindifosfat

cdc42 GTP-bindande protein

Guanosintrifosfat

rac1 GTP-bindande proteiner

rho GTP-bindande proteiner

ADP-ribosyleringsfaktorer

rac GTP-bindande proteiner

rap1 GTP-bindande proteiner

rhoA GTP-bindande proteiner

Guaninnukleotidfrisläppande faktor 2

Molekylsekvensdata

GTPas-aktiverande proteiner

Signalomvandling

Aminosyrasekvens

Proteiner

GTP-bindande proteiner

Adaptorproteiner, signalöverförande

ADP-ribosyleringsfaktor 1

GTP-fosfohydrolaser

Proteinstruktur, tertiär

ral-GDS

Proteinbindning

eIF-2B

rab GTP-bindande proteiner

ral GTP-bindande proteiner

rap GTP-bindande proteiner

Guanin

COS-celler

Guaninnukleotidseparationshämmare

Protonkogenproteiner p21(ras)

Nukleotider

rab5 GTP-bindande proteiner

Sekvenshomologi, aminosyra

GTP-bindande proteiners alfaunderenheter, G12-G13

Höljeproteinkomplex I

Enzymaktivering

Mutation

Monomera GTP-bindande proteiner

Fosforylering

Cellinje

Cellcykelproteiner

Guanosin 5'-O-(3-tiotrifosfat)

p21-Activated Kinases

Two-Hybrid System Techniques

ras-gener

Rekombinanta fusionsproteiner

3T3-celler

Proteintransport

eIF-2

Transfektion

ran GTP-bindande proteiner

Protonkogenproteiner

HSP110-stressproteiner

Aktiner

rab1 GTP-bindande proteiner

Saccharomyces cerevisiae Proteins

ras GTPasaktiverande proteiner

NIH.3T3-celler

Hela-celler

Brefeldin A

Cellmembran

Bindningsplatser

rho-Specific Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitors

Onkogenprotein p21(ras)

Bärarproteiner

Saccharomyces cerevisiae

Onkogenproteiner

src-domäner

Cytoskelett

Kloning, molekylär