Protein prenylation är ett posttranslationellt modifieringssätt där lipider kovalent adderas till c-terminalen av proteiner. Den vanligaste formen av protein prenylation inkluderar att en 15-karbon lång farnesylgrupp eller en 20-karbon geranylgeranylgrupp adderas till ett protein via en tioatomig svavelbrygga. Proteinprenylering spelar en viktig roll i cellsignalering, celldelning och trafficking av proteiner inom cellen.
I en enskild mening kan 'prenylering' definieras som en biokemisk process där ett protein modifieras genom att fogas till ett lipofilt grupp, vanligtvis en farnesyl- eller geranylgeranylgrupp. Denna modifikation hjälper till att reglera proteinets funktion och dess subcellulära lokalisation. Prenylering är en viktig posttranslationell modifikation som påverkar många olika cellulära processer, inklusive signaltransduktion, celldelning och trafficking av proteiner.
En något heterogen klass av enzymer som katalyserar överföringen av alkyler eller liknande grupper (utom metylgrupper). EC 2.5.
Farnesyltransferase är ett enzym som katalyserar den sista steget i proteinfarnesyleringen, en posttranslationell modifikationsprocess där ett farnesylgrupp (ett 15-kolatomlångt isoprenoid) adderas till ett cysteinrest nära C-terminalen av specifika proteiner. Denna modifikation är nödvändig för att vissa proteiner ska kunna korrekt lokaliseras inom cellen, exempelvis till cellytan eller till membran inuti cellen.
3,5-dihydroxi-3-metylpentansyra, ett ämne som bildas som mellansteg i biosyntesen av kolesterol.
Ett enzym som under kolesterolbiosyntesen katalyserar kondenseringen av isopentenylpyrofosfat och dimetylallylpyrofosfat till pyrofosfat och geranylpyrofosfat. Därefter katalyserar enzymet kondenseringen av sistnämnda förening med ytterligare isopentenylpyrofosfat till pyrofosfat och farnesylpyrofosfat. EC 2.5.1.1.
Ett färglöst, flytande extrakt från bl a växterna citronella, pomerans, cyklamen och tuberos (natthyacint).
Polyisoprenylfosfater är en typ av organisk förening som innehåller en lång, icke-ramifierad polymer av isoprenenheter som är kovalent bunden till en fosfatgrupp. De förekommer naturligt i celler och är involverade i olika cellulära processer, såsom proteinsyntes och modifikation. Exempel på polyisoprenylfosfater inkluderar dolicholfosfater och undekaprenylfosfat.
En metabolit som isolerats ur odlingar av svampen Aspergillus terreus.
En medicinsk definition av 'Geranyltranstransferas' är ett enzym som katalyserar reaktionen där en geranylgrupp (C10) överförs från en donator, ofta den aktiva isoprenoiden geranyldifosfat, till en acceptor, vanligtvis en karboxylgrupp i ett protein. Detta posttranslationella modifieringsprocess kallas prenylering och är viktig för att stabilisera proteiner i cellmembranet och reglera deras funktioner.
Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) definieras en transferas som: "En enzym som katalyserar överföringen av en funktionell grupp (-X), till exempel en metyl-, acetyl- eller aminosgrupp, från ett donorsubstrat till ett acceptorsubstrat, vanligtvis en molekyl med en aktivt hydroxyl (-OH) eller amino (-NH2) grupp." Transferaser utgör en av sex huvudklasser av enzymer enligt den systematiska EC-numreringen.
Organiska föreningar med P-C-P-bindningar, där P står för fosfonater eller fosfonsyror. Dessa föreningar påverkar kalciumomsättningen. De hindrar ektopisk förkalkning och fördröjer benresorption och omsättning av benvävnad. Technetium-bifosfonatkomplex utnyttjas med framgång för benvävnadsskanning.
Svårflyktiga kolväten som ingår i eller är derivat av hartssyror. De används bl a i eteriska oljor.
Terpenes are a class of organic compounds produced by a variety of plants, including conifers, citrus fruits, and cannabis. They are the primary components of essential oils and contribute to the aroma and flavor of these plants. Terpenes have been found to have potential medicinal properties, such as anti-inflammatory, analgesic, and antimicrobial effects. However, more research is needed to fully understand their therapeutic potential and safety profile in humans.
Föreningar som blockerar HMG-CoA-reduktaser. De har visat sig direkt minska kolesterolsyntesen.
Enzyminhibitorer är substanser som sänker eller helt stoppar en enzymes aktivitet genom att binda till enzymet. Detta resulterar i försening eller minskning av den kemiska reaktionen som enzymet annars skulle ha katalyserat. Enzymer är proteinmolekyler som accelererar biologiska reaktioner inom celler, och deras aktivitet kan regleras genom olika mekanismer, däribland användning av enzyminhibitorer.
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
En missbildning bunden till X-kromosomen, kännetecknad av åderhinneatrofi och nedbrytning av näthinnans pigmentepitel, vilket leder till oförmåga till mörkerseende.
Celler som drivs fram in vitro i odlingsmedia som främjar deras tillväxt. Odlade celler används bl a för studier av utveckling, morfologi, metaboliska, fysiologiska och genetiska processer.
Rab GTP-bindande proteiner är en familj av små GTPas-proteiner som regulerar intracellulär trafficking av vesiklar och organeller inom eukaryota celler. De fungerar som molekylära switche genom att cycliskt binda och hydrolysera GTP, vilket aktiverar och inaktiverar deras funktioner respektive. Varje Rab-protein har en specifik subcellulär lokalisation och är involverat i olika steg av membrantrafiken, såsom budbudning, transport, fusion och klyvning. De spelar därför en viktig roll i celldelning, signaltransduktion, endocytos och exocytos, samt i homeostasen hos celler.

Protein prenylation är en posttranslationell modifikation av protein, vilket innebär att den sker efter att proteinet har syntetiserats. Denna process involverar addering av en lipidgrupp till ett cystein aminosyreres side chain i proteinet. Detta sker vanligtvis genom en reaktion med farnesylpyrofosfat eller geranylgeranylpyrofosfat, vilket resulterar i bildandet av en tioether- eller diolefinbindning mellan lipiden och proteinets cystein.

Protein prenylation spelar en viktig roll i cellulär trafficking, signaltransduktion och proteinkomplexbildning. Den kan också vara involverad i patologiska processer som cancer och neurodegenerativa sjukdomar.

"Prenylering" er ein biokjemisk prosess der en proteinkjedje blir modifisert med ein lipofil gruppe som kallas ein prenylgrupe. Denne modifikasjonen foregår i cellen og påvirkar proteinet sine egenskaper, for eksempel ved å endra plasseringen i cellen eller ved å påverke interaksjoner med andre proteiner.

Det fins tre typer prenylgruper: farnesyl (15 kolonner), geranylgeranyl (20 kolonner) og nerylgeranyl (20 kolonner). Disse grupane blir lagt til på proteinet ved å bruke ein enzymkompleks kalt "prenyltransferas".

Prenylering er viktig for regulering av mange cellulære prosesser, for eksempel signaltransduksjon og celldeling. Feilfunksjon i prenyleringsprosessen kan føre til ulike sykdommer, for eksempel kreft og neurodegenerative lidelser.

Alkyl- and aryltransferases are a group of enzymes that facilitate the transfer of alkyl or aryl groups from one molecule to another. These enzymes play a crucial role in various biological processes, including detoxification and the metabolism of xenobiotics (foreign substances) in the body.

In the medical field, these enzymes are often studied in the context of drug metabolism and toxicology. For example, certain drugs may be metabolized by alkyl- or aryltransferases, which can affect their efficacy and safety. Similarly, exposure to environmental toxins that are metabolized by these enzymes can lead to the production of harmful metabolites, which may contribute to the development of various diseases.

Understanding the function and regulation of alkyl- and aryltransferases is therefore important for developing strategies to enhance drug efficacy, reduce toxicity, and prevent or treat environmental toxicant-induced diseases.

Farnesyltransferase är ett enzym som katalyserar en reaktion där ett farnesylgrupp (ett 15 kol långt lipid) kovalent binds till ett protein. Denna modifiering, kallad farnesylering, sker vanligtvis på ett cystein aminosyraresid i en speciell sekvens (CVIM) nära proteinkterminalen. Farnesyltransferasen spelar därför en viktig roll i proteinlokaliseringsprocesser, särskilt för proteiner som behöver transporteras till celldelningen eller cellmembranet. Ett exempel på ett sådant protein är Ras, ett onkogen som kan bli överaktiverat vid felaktig farnesylering och som är involverat i cancerutvecklingen.

Mevalonsyra är en organisk syra som spelar en viktig roll i kroppens produktion av kolesterol. Det är en intermediär metabolit i mevalonatvägen, en biokemisk väg som producerar flera viktiga komponenter till celldelningen och signaltransduktion. Mevalonsyra konverteras till mevalonat med hjälp av enzymet mevalonatkinas, och är den plats där kolesterolsyntes inhibitorer verkar för att sänka nivåerna av kolesterol i blodet.

Dimethylallyltranstransferase (DMAT) er en type enzym som spiller en viktig rolle i biosyntesen av flere forskjellige typer compounds, inkludert terpener og terpenoider. Disse compounds har en bred vifte av funksjoner i biologiske systemer, noe som inkluderer roller som antioxidanter, feromoner, pigmenter, og aroma-komponenter.

DMAT-enzymet katalyserer en reaksjon der det metylgruppa-holdende molekylet dimethylallyldiklorid (DMAPP) blir overført til et annen molekyl, ofte en isoprenoid-föreldre. Denne reaksjonen er en viktig forstadie i biosyntesen av flere forskjellige typer terpener og terpenoider.

Det finnes flere forskjellige typer DMAT-enzymer, noen av dem spesialiserte på å overføre dimethylallylgruppa til bestemte substrater. Disse enzymene er viktige mål for forskning på grunn av deres rolle i biosyntesen av flere biologisk aktive compounds, inkludert noen som har potentiale som medisinske behandlinger.

Farnesol är ett organisk kemiskt ämne som tillhör gruppen terpener. Det är en sesquiterpenal, vilket betyder att det består av tre isoprenenheter och har en alkoholgrupp. Farnesol förekommer naturligt i vissa eteriska oljor, som rosenolja och citronellaolja.

I medicinskt hänseende kan farnesol ha antibakteriella och antifungala egenskaper. Det har studerats som ett möjligt behandlingsalternativ för vissa infektioner orsakade av bakterier eller svampar. Dock behövs mer forskning för att fastställa dess effektivitet och säkerhet som medicinsk behandling.

Polyisoprenylfosfater är en typ av organiska föreningar som innehåller en lång, icke-ramifierad kedja av isoprenenheter som är bundna till en fosfatgrupp. De kan variera i längd och består vanligtvis av 5-substituerade carbonsubenheter (isoprenenheter) som är sammanlänkade i en linjär kedja.

Dessa ämnen spelar en viktig roll inom cellbiologin, där de fungerar som byggstenar vid syntesen av olika biologiskt aktiva molekyler, såsom steroler och ubichinoner. Polyisoprenylfosfater biosyntetiseras i cellen genom en serie enzymkatalyserade reaktioner som involverar isoprenoidprecursorer som ger upphov till de olika isoprenenheterna.

Det är värt att notera att polyisoprenylfosfater inte är ett vanligt begrepp inom medicinsk litteratur, men de kan vara relaterade till vissa sjukdomar eller störningar i cellulär metabolism som kan ha medicinska konsekvenser.

Lovastatin är ett läkemedel som tillhör en grupp av kolesterolsänkande läkemedel som kallas statiner. Lovastatin fungerar genom att blockera enzymet HMG-CoA-reduktas, som är involverat i kroppens produktion av kolesterol. När detta enzym hindras från att fungera, minskar kroppens produktion av kolesterol och nivåerna av LDL-kolesterol (dåligt kolesterol) sänks. Lovastatin används vanligen för att behandla höga kolesterolvärden och för att förebygga hjärt- och kärlsjukdomar, såsom hjärtinfarkt och stroke.

Geranyltranstransferas (GTT) är ett enzym som katalyserar en reaktion där en geranylgrupp överförs från en donator, ofta den aktiva isoprenoiden geranyldifosfat (GPP), till en acceptor, vanligtvis en karboxylgrupp i ett protein. Detta process kallas prenylering och är en posttranslationell modifikation av proteiner som involverar kovalent bundenhet av lipida till vissa proteiner. Geranyltranstransferas-katalyserade reaktioner spelar en viktig roll i celldelning, signaltransduktion och membranassociering av proteiner.

Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) är en transferas ett enzym som katalyserar överföringen av en funktionell grupp (-X), till exempel en sockergrupp, från ett donormolekyl till ett acceptormolekyl i en kemisk reaktion. Transferaser kan delas in i olika klasser beroende på vilken typ av funktionell grupp som överförs. Exempel på transferaser är glycosyltransferaser (som överför sockergrupper), acetyltransferaser (som överför acetylgrupper) och metyltransferaser (som överför metylgrupper). Transferasers kodas ofta av gener som finns i kluster på kromosomen.

Bisfosfonater är en grupp läkemedel som används för att behandla skelettrelaterade sjukdomar, till exempel osteoporos och cancer relaterad benförsvagning. De fungerar genom att hämma nedbrytningen av benvävnad och på så sätt minska benresorptionen. Detta kan leda till ökad benstyrka och minskat risk för skelettrelaterade komplikationer som frakturer (benbrott).

Bisfosfonater ges vanligen som tablett eller intravenös infusion och de olika medlen i gruppen har olika halvtider i kroppen, vilket påverkar hur ofta de behöver tas. De vanligaste bisfosfonaterna är alendronat, risedronat, ibandronat och zoledronat.

Samtliga bisfosfonater har vissa biverkningar som kan vara allvarliga om de inte behandlas, till exempel ont i mag-tarmkanalen, muskel-skelettbesvär och i sällsynta fall osteonekros (död av benvävnad). Dessa biverkningar är dock ovanliga och generellt sett är fördelarna med behandlingen större än riskerna.

Det är viktigt att diskutera eventuella frågor eller oro relaterade till bisfosfonater med läkaren innan man påbörjar en behandling.

Diterpenes are a class of organic compounds that are synthesized from geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP), a C20 compound, during the process of biosynthesis. They are composed of four isoprene units and have a molecular formula of C20H32. Diterpenes can be further classified into various subgroups based on their carbon skeletons, such as labdanes, abietanes, clerodanes, kauranes, and others.

Diterpenes are widely distributed in nature and are found in many plants, fungi, and marine organisms. Some diterpenes have significant biological activities and are used in medicine. For example, the anti-cancer drug paclitaxel (Taxol) is a diterpene that is isolated from the bark of the Pacific yew tree (Taxus brevifolia). Another example is forskolin, a diterpene derived from the plant Coleus forskohlii, which has been used in traditional medicine to treat various conditions such as heart disease and asthma.

In summary, diterpenes are a class of natural compounds that have significant biological activities and potential therapeutic applications. They are synthesized from geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP) and can be further classified into various subgroups based on their carbon skeletons. Some examples of medically relevant diterpenes include paclitaxel and forskolin.

Terpenes are a large and diverse class of organic compounds produced by a variety of plants, including conifers, citrus fruits, and cannabis. They are responsible for the distinctive aromas and flavors found in these plants. Terpenes are composed of isoprene units and can vary in structure and size, resulting in a wide range of chemical and biological properties.

In the context of cannabis, terpenes are produced in the resin glands of the plant and contribute to the entourage effect, which is the synergistic interaction between various compounds found in cannabis, including cannabinoids and terpenes. Different terpenes have different effects on the body and can influence the overall medicinal profile of a particular cannabis strain. For example, some terpenes may have anti-inflammatory, analgesic, or anxiety-reducing properties.

It's important to note that while terpenes are believed to have potential therapeutic benefits, more research is needed to fully understand their mechanisms of action and potential medical uses.

Hydroximetylglutaryl-CoA-reduktashämmare, även känt som statiner, är en grupp av läkemedel som används för att sänka nivåerna av kolesterol i blodet. De fungerar genom att hämma enzymet HMG-CoA-reduktas, som är involverat i produktionen av kolesterol i levern. När detta enzym hämmas, minskar mängden kolesterol som produceras och ledde till ökad upptag av kolesterol från blodet in i leverceller. Detta resulterar i sänkta nivåer av LDL-kolesterol (dåligt kolesterol) och totalt kolesterol i blodet, vilket kan hjälpa att minska risken för hjärt-kärlsjukdomar som hjärtinfarkt och stroke. Statiner är vanligen väl tolererade och effektiva, men de kan orsaka biverkningar som muskelvärk och leverfunktionsrubbningar i sällsynta fall.

Enzyminhibitorer, också kända som enzymhämmare, är molekyler som binder till enzym och minskar dess aktivitet. Denna bindning kan vara reversibel eller irreversibel och påverkar ofta den katalytiska funktionen hos enzymet genom att förhindra substratets bindning till aktivt centrum eller att störa den kemiska reaktionen som sker inne i enzymet. Enzyminhibitorer kan vara naturligt förekommande, till exempel i vissa giftiga substanser, eller syntetiskt framställda, och används ofta inom medicinen för att behandla olika sjukdomar.

Substratspecificitet betegner i farmakologi og enzyms biokemi, hvilken type af substrat (den molekyle, der binder til enzymet) et specifikt enzym er i stand til at binde sig til og katalyse en reaktion med. Enzymer er biologiske katalysatorer, der accelererer kemiske reaktioner inden for levende organismer, og hver enzym har typisk en specifik substratspecificitet, der bestemmer, hvilken type af molekyler, den kan arbejde på.

Substratspecificiteten for et enzym kan være meget snæver, så det kun kan binde sig til én specifik molekyletype, eller den kan være bredere, så det kan binde sig til flere relaterede molekyler. Substratspecificiteten af et enzym kan blive fastlagt ved at undersøge, hvilke substrater det kan binde sig til og katalysere en reaktion med under specifikke betingelser.

Det er vigtigt at notere, at substratspecificiteten for et enzym ikke altid er absolut. I nogle tilfælde kan et enzym have en vis grad af fleksibilitet og være i stand til at binde sig til og katalysere reaktioner med substrater, der ikke er helt identiske med dets normale substrat. Dette kaldes undertiden for "promiskuitet" eller "krydsreaktivitet".

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

En aminosyrasekvens är en rad av sammanfogade aminosyror som bildar ett protein. Varje protein har sin unika aminosyrasekvens, som bestäms av genetisk information i DNA-molekylen. Den genetiska koden specificerar exakt vilka aminosyror som ska ingå i sekvensen och i vilken ordning de ska vara placerade.

Aminosyrorna i en sekvens är sammanbundna med peptidbindningar, vilket bildar en polymer som kallas ett peptid. När antalet aminosyror i en peptid överstiger cirka 50-100 talar man istället om ett protein.

Aminosyrasekvensen innehåller information om proteinet och dess funktion, eftersom den bestämmer proteins tertiärstruktur (hur aminosyrorna är hopfogade i rymden) och kvartärstruktur (hur olika peptidkedjor är sammansatta till ett komplext protein). Dessa strukturer påverkar proteinet funktion, eftersom de avgör hur proteinet interagerar med andra molekyler i cellen.

Koroideremi är ett sällsynt genetiskt očningssjukdom där koroiden, det del av ögat som förser näthinnan med näring, skadas. Detta leder till att näthinnan degenererar och synen försämras. Koroideremi kan leda till blindhet och förekommer oftast hos unga vuxna. Sjukdomen orsakas av mutationer i gener som kodar för proteiner som är involverade i kroppens cellers energiproduktion. Det finns inget botemedel för koroideremi, men behandling kan hjälpa att fördröja dess framskridande och underlätta patienternas vardag.

"Cell culturing" or "cell cultivation" is the process of growing and maintaining cells in a controlled environment outside of a living organism. This is typically done in a laboratory setting using specialized equipment and media to provide nutrients and other factors necessary for cell growth and survival. The cells can be derived from a variety of sources, including human or animal tissues, and can be used for a range of research and therapeutic purposes, such as studying cell behavior, developing new drugs, and generating cells or tissues for transplantation.

Rab GTP-bindande proteiner är en typ av GTPas-proteiner som spelar en central roll i regleringen av intracellulär trafficking och transport av vesiklar inom celler. De är involverade i processer som exocytos, endocytos, membrantransport och autofagi. Rab-proteinerna fungerar som molekylära switchar som växlar mellan en aktiverad tillstånd, då de binder till GTP, och ett inaktiverat tillstånd, då de binder till GDP. I aktiverat tillstånd kan Rab-proteinerna interagera med sina effektorproteiner och på så sätt styr vesikeltransporten och membranfusionen. Varje Rab-protein har en specifik funktion och är involverad i olika delar av cellens trafficking-nätverk.

2006-01-01 Depletion of substrates for protein prenylation increases apoptosis in human periovulatory granulosa Christina ...