Fenomenet att en fag tar plats i värdbakteriens DNA och etablerar ett slags symbios mellan profagen och bakterien, vilket resulterar i att profagen förevigas i kommande bakterieceller. Vid aktivering av viruset genom olika utlösande faktorer, som t ex ultraviolett strålning, frigörs fagen, blir virulent och löser upp bakterien.
Virus som infekterar bakterieceller.
I en enkel medicinsk definition är ett profag prosjektet eller en del av ett bakteriechromosoms DNA som inte är del av den genetiska koden för bakteriens eget protein, utan istället kapslar in virus-liknande gener. När profagen induceras kan detta resultera i produktion och frisättning av viruslika partiklar, även kallade bakteriofager, som kan infektera andra bakterier. Detta är en del av bakteriens överlevnadsmekanism där den kan använda profagen för att ta över andra bakteriers DNA och öka sin egen fitness.
"Streptococcus-angina" är en infektionssjukdom orsakad av bakterien Streptococcus pyogenes, och kännetecknas av inflammation i hals- och svalgregionen. Också känd som stafylokockangina eller enbart streptokock. Sjukdomen kan ge upphov till komplikationer om den inte behandlas korrekt, såsom reumatisk feber och glomerulonefrit.
Siphoviridae är en familj av virus som infekterar både prokaryota och eukaryota värdar, men de är mest kända för att infektera bakterier. Virusen i denna familj har en icke-flexibel, stavformad kapsid med en längd på omkring 60-200 nanometer och en diameter på omkring 20 nanometer. Deras genom består av dubbelsträngat DNA (dsDNA) och har vanligtvis en stor genomstorlek på mellan 40 och 150 kilobaspar (kb).
Särskilda platser på såväl bakterie- som bakteriofag-DNA-molekyler, vid vilka fag-DNA genom rekombination integreras med bakterie-DNA.
Bakteriecellers bristning till följd av mekanisk påverkan, kemisk verkan eller tillväxt av bakteriofager.
En tempererad, inducerbar bakteriofag som utgör typarten av släktet lambdaliknande fager i familjen Siphoviridae. Dess naturliga värd är E. coli K12. Viruspartikeln innehåller linjärt, dubbelsträngat DNA med undantag för 12 komplementbaser vid 5´-änden av polynukleotidkedjorna. Vid infektion sluter sig DNA i cirkel.
"Mykobakteriefag" är ett begrepp inom medicinen som refererar till speciella virus, även kända som bakteriofager, som kan infektera och döda mykobakterier, vilket är en grupp av bakterier som inkluderar Mycobacterium tuberculosis, den bakterie som orsakar tuberkulos. Dessa mykobakteriefager kan eventuellt utvecklas till terapeutiska möjligheter för att behandla infektioner orsakade av mykobakterier.
'Viral Regulatory and Accessory Proteins' refer to a group of proteins encoded by viruses that play roles in regulating viral replication, gene expression, and host immune response, as well as modulating the cellular environment for optimal viral infection and propagation. These proteins are not essential for viral replication in isolation but can significantly enhance viral fitness and pathogenesis during infection. They often manipulate various cellular signaling pathways, interfere with host defense mechanisms, or interact with other viral components to ensure efficient virus life cycles.
"Salmonella-hoste" refererer til et individ eller et dyr som er infisert med Salmonella-bakterier, som kan forårsage sygdom hos både mennesker og dyr. Disse bakterier er ofte forbundet med fødevareborne sygdomme, der typisk resulterer i gastroenteritis, som viser sig ved symptomer som diarré, mavepine og opkastninger. Infektionen skyldes normalt at have spist kontaminerede fødevarer, såsom æg, kyllingkød, grøntsager eller mælkeprodukter. Det er vigtigt at notere at mange dyr, herunder reptiler og amfibier, kan være bærere af Salmonella-bakterier uden at vise tegn på sygdom, men de kan stadig overføre bakterierne til mennesker.
Myoviridae is a family of viruses that infect both prokaryotic and eukaryotic hosts, including bacteria and archaea. These viruses are characterized by their icosahedral heads and contractile tails, which they use to inject their genetic material into host cells during infection. Myoviridae viruses have double-stranded DNA (dsDNA) genomes that can vary in size from around 40 to over 170 kilobases (kb). The family includes many well-known bacteriophages, such as T4 and lambda phages, which have been extensively studied for their biological properties and potential applications in molecular biology and medicine.
En stafylokockfage (Staphylococcus aureus-fage) är ett bakteriofag, det vill säga ett virus som infekterar och dödar stafylkocker (Staphylococcus aureus-bakterier), vilket kan användas inom medicinen för att behandla resistenta bakterieinfektioner. Definitionen i en enda mening:
Virus med Escherichia coli som värdorganism.
"Virusaktivering" refererer til en proces, hvor et virus, som er i en latent (inaktiv) fase i en værtscelle, bliver aktiveret og begynder at producere viruse protein og genmateriale, der kan resultere i skader på værten og udbredelse af virussen til andre celler.
"Virusproteiner" refererer til proteiner som produceres af et virus for å fullføre sin infeksjonsprosess og reproducerer seg i værtsorganismen. Disse proteinet kan ha ulike funksjoner, såsom å binde til værtscellene for å fremme infeksjonen, å beskytte virusgenomet under overføringen mellom værter eller å hjelpe med replikasjonen av viruset.
Den fullständiga arvsmassan i DNA- eller RNA-molekylen i ett virus.
Deoxiribonukleinsyra som utgör arvsmassan hos virus.
I geneticen refererar "operator regions" till specifika sekvenser av DNA som kontrollerar genuttryck genom att reglera transkriptionen av angränsande gener. De flesta operatorregionerna är belägna i bakterier och arkeer, där de fungerar som samlingsplatser för regulatoriska proteiner, som kan binda till operatorn och påverka om transkription skall ske eller inte. I eukaryota celler (t.ex. djur- och växtceller) är kontrollen av genuttryck mer komplex och involverar flera olika mekanismer, inklusive epigenetiska modifieringar och långa icke-kodande RNA, så operatorregioner som i prokaryota celler saknas.
En oplacerad temperad colifag tillhörande familjen Myoviridae med en linjär, dubbelsträngad DNA-molekyl som slumpmässigt kan tränga in vid vilken punkt som helst på värdkromosomen. Den ger ofta upphov till mutationer genom att störa bakteriens operon vid angreppspunkten.
Proteobacteria är en fylum (division) av gramnegativa bakterier, inklusive en mångfald artar med olika egenskaper och former. De flesta proteobakterier lever som frisättande individer eller i symbiotiska associationer med andra organismer. Flera är viktiga patogener hos människor, djur och växter. Proteobacteria innehåller även en stor andel artar som spelar nyckelroller i naturens närings- och energicykler, till exempel syrefixerande bakterier och fotosyntetiserande cyanobakterier.
Repressorproteiner är proteiner som binds till specifika DNA-sekvenser och hämmar transkriptionen av ett visst genetiskt material, vilket leder till nedreglering av genuttrycket för de gener som kontrolleras av dessa repressorproteiner.
'Streptococcus' är ett släkte av grampositiva, kokkalformade bakterier som ofta förekommer naturligt i människans och djurens övre luftvägar samt hud. Vissa arter av Streptococcus kan orsaka infektionssjukdomar hos människor, till exempel streptokockangin, strupledvärksinflammation och reumatisk feber. Dessa bakterier är vanligen lättläkta med antibiotika, men kan i vissa fall leda till komplikationer om de inte behandlas korrekt eller i tid.
En grupp metylazirinopyrroloindoledioner från vissa streptokockstammar. De är mycket giftiga antibiotika som används mot vissa solida tumörer. Porfiromycin och mitomycin är de mest användbara medlen i gruppen.
En icke-patogen art av Lactococcus som finns i mejeriprodukter och gör att mjölk surnar och bildar mjölksyra.
Ett antibiotiskt ämne med antitumörverkan som produceras av Streptomyces caespitosus. Det tillhör gruppen bi-eller trifunktionella alkylerande ämnen som ger upphov till korslänkning av DNA och blockerar DNA-syntes.
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
Rekombinaser som infogar exogent DNA i värdgenom. Exempel är proteiner som kodas av polgenen hos Retroviridae och även latenta bakteriofager, varav bakteriofag lambda är mest känd.
En "Viral Plaque Assay" är en laboratoriemetod för att bestämma koncentrationen av infektiösa viruspartiklar i ett prov, uttryckt som plaqueformingenheter per ml (PFU/ml). Metoden bygger på att viruset infekterar celler i en monolayer av cellkulturer, vilka därefter dödas och bildar en "plaque" eller nekroszon runt varje infekterad cell. Genom att räkna antalet plakor kan man bestämma virustitern.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
"Salthalt" refererer til mængden af opløst salt, typisk natriumklorid (NaCl), i et vandløb, havvand eller i kroppen hos levende organismer. Salthalten angives som regel i enheden ppm (parts per million) eller i promille (%o). I medicinsk sammenhæng er saltholdigheden af kroppens væskebalance vigtig, da for store ændringer kan have negativ indvirkning på cellerne og føre til forstyrrelser i kroppen.
Plankton är en samlingsbeteckning för de organismar som lever i ett suspended state och drifts med vattnets strömningar i sjöar, hav och andra vattenmiljöer. Plankton består av både vegetativt plankton (fitoplankton) och djurplankton (zooplankton) och kan variera i storlek från mycket små encelleda alger och bakterier till större djursamhällen som kräftdjur och blötdjur. Plankton utgör en viktig del av näringskedjan i vattenmiljöer, då de bildar föda för många andra marina djur, inklusive fiskar och valar.
Bacteroidetes är en fylum (domän) av gramnegativa, anaeroba eller aeroba, icke-sporbildande bakterier. De flesta arterna av Bacteroidetes lever som kommensala i tarmen hos djur och människor, där de spela en viktig roll i nedbrytningen och metabolismen av kolhydrater och proteiner. Några arter kan dock vara patogena och orsaka infektioner såsom lunginflammation, blodförgiftning och meningit. Bacteroidetes är en av de vanligaste bakteriegrupperna i naturen och kan hittas i en mängd olika miljöer, inklusive jord, vatten och livsmedel.
Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.
I en mening kan "Open Reading Frames" (ORF) definieras som en sekvens av DNA eller RNA som har potentialen att koda för ett protein. ORF börjar med en startkodon, vanligtvis AUG, och fortsätter till nästa stoppkodon (UAG, UAA eller UGA). Den resulterande aminosyrasekvensen kan potentiellt vara kapabel till att bilda ett protein om den översätts korrekt. Det är värt att notera att inte alla ORF:er leder nödvändigtvis till produktionen av ett funktionellt protein, eftersom det kan finnas flera skäl till varför translationen kan misslyckas eller ge upphov till en icke-funktionell peptid.
Arvsmassan hos virus, som hos alla DNA- och vissa RNA-virus består av en enda nukleinsyramolekyl, och hos några RNA-virus av flera separata RNA-bitar.
"Genetisk rekombination är ett naturligt fenomen där gener kombineras och omordnas på något sätt för att bilda ny DNA-sekvens. Detta kan ske genom olika mekanismer, till exempel crossing over under meios eller via specifika enzymer som kan klippa och klistra ihop DNA-strängar på nya sätt. Genetisk rekombination är viktig för genetisk variation och evolution."
Varje påvisbar och ärftlig förändring i det genetiska materialet som medför ändrad genotyp och som överförs till dotterceller och efterföljande generationer.
Uppslagsböcker med informativa artiklar inom alla kunskapsfält (allmänna uppslagsverk), oftast med alfabetiskt ordnade uppslagsord eller ämnesord, eller uppslagsverk inom ett speciellt ämnesområde. Syn. uppslagsböcker; uppslagsverk.
Capillary electrochromatography (CEC) is a separation technique that combines the principles of capillary electrophoresis and high-performance liquid chromatography (HPLC), utilizing an electric field to drive the movement of analytes through a narrow fused-silica capillary filled with a stationary phase, resulting in efficient and highly resolute separation of charged and neutral analytes based on their charge and interactions with the stationary phase.
Proteiner från Escherichia coli.
NLMs (National Library of Medicine, USA) utvidgade informationstjänst för medicnska yrkesutövare och allmänheten. Tjänsten, som är webbaserad, har en omfattande länkning till informationskällor för sjukdomstillstånd och hälsofrågor.

I medicinsk kontext refererer «lysogeni» til en infeksjonsmåte hvor et bakteriofag (et virus som infiser batterier) integrerer sin genetisk informasjon (DNA eller RNA) in i værtsbakteriens genome i stedet for å omdannes til infektiøse partikler umiddelbart. Dette kaller man også for en latent infeksjon.

Bakterien som er infisert med bakteriofagen og har integrert genomet sin, kan fortsatt leve og repliseres normalt, og den infekterende DNA-strengen blir reprodusert sammen med værtsbakteriens genetisk materiale. Den infekterende DNA-strengen kan også bli overført til nye generasjoner av bakterier ved celledeling.

I noen tilfeller kan den infiserte bakterien utløse en lytisk cyklus, hvor bakteriofagen starter å replisere seg i store antall og eventuelt resultere i lysen (bakteinndeling) av værtsbakterien. Dette skjer vanligvis som svar på en stressfull situasjon eller under bestemte miljøforhold, og det kan også utløses av gener som kontrollerer denne prosessen i bakteriofagens genetisk materiale.

Lysogeni er viktig å forstå fordi det kan ha betydning for bakteriers evne til å utvikle resistans mot antibiotika og andre typer av bakteriedrap, og det kan også spille en rolle i bakteriens evne til å overleve under ugunstige miljøforhold.

"Bakteriofager" er en medisinsk term for virus som infekterer og replikerer seg i bakterier. De kaller også for «bakterievirus» eller «fag». Bakteriofager består av et proteinkapsel som inneholder genetisk materiale, og de kan være helt eller delvis indleirende i værtsbakteriens DNA eller RNA. Når en bakterie infiseres av en bakteriofag, kan det føre til lysing (bursting) av bakterien og frigivelse av nye bakteriofager som kan infisere andre bakterier. Bakteriofager spiller en viktig rolle i biologisk kontroll av bakterielle populationer, og de har også vært studert for mulige bruk i medisinske terapeutiske tilnærminger som fagbasert terapi.

I en medicinsk kontext refererar "proфаger" till den del av ett bakterievirus' genom som innehåller genetisk information för att producera nya viruspartiklar, men som inte inkluderar de strukturella komponenterna som behövs för att bilda en fullständig viruspartikel. Profagen existerar som en del av värdbakteriens kromosom och replikeras tillsammans med denna. I gynnsamma omständigheter, såsom stress eller skada på värdbakterien, kan profagen aktiveras och börja transkribera och translatera sina gener för att producera de strukturella komponenterna och bilda nya viruspartiklar genom en process som kallas lyssning. Dessa nya viruspartiklar kan sedan frisättas från värdbakterien och infektera andra celler för att reproduceras vidare.

'Streptococcus-fager' er en betegnelse for en infektion som forårsages af bakterien Streptococcus pyogenes. Denne type bakterie er også kendt som β-hemolytiske streptokokker, gruppe A streptokokker eller blot GAS (Group A Streptococcus). Infektionen kan føre til en række forskellige sygdomme, herunder halsbetændelse, impetigo, lungebetændelse og rheumatisk feber.

Halsbetændelse (streptococcus-faryngitis) er den mest almindelige infektion, der forårsages af Streptococcus pyogenes. Symptomerne inkluder halskrat, smerte ved svælging, feber og svulmede lymfeknuder. Andre typer af streptococcus-fager omfatter:

* Impetigo: En hudinfektion som oftest rammer børn og er karakteriseret ved blærer og gule krasser på huden, især omkring munden og næsen.
* Lungebetændelse (pneumoni): Streptococcus pyogenes kan også forårsage lungebetændelse, særligt hos personer med svækkede immunsystemer eller andre sygdomme, der gør dem mere modtagelige.
* Rheumatisk feber: En komplikation af streptococcus-fager, som kan opstå flere uger efter en halsbetændelse. Symptomerne inkluder feber, smerter i led og hjerteklappenes skader.

Det er vigtigt at søge lægebehandling for streptococcus-fager, da den kan føre til alvorlige komplikationer, hvis den ikke behandles korrekt. Behandlingen består typisk af antibiotika, der tager i reglen 10 dage at helbrede en infektion.

*Siphoviridae* är en familj av virus som infekterar både prokaryota och eukaryota värdar. Dessa virus har en icke-segmenterad, dubbelsträngad DNA-genom (dsDNA) och en icke-höljd, stavformad kapsid. De är kända för att ha en lång, smal, flexibel, svansliknande struktur som används under infektionsprocessen. Svansen består av ett proteinkapsid och en basplatta som innehåller en injiceringsmaskin som möjliggör överföring av genomet till värden.

*Siphoviridae* ingår i den stora gruppen av dsDNA-virus som kallas *Caudovirales*, eller "svansvirus". Familjen innehåller många olika arter och stammar, inklusive de välkända bakteriofagerna T4, lambda och P22. Dessa virus är mycket viktiga i forskning om molekylär biologi och genetik, eftersom de ofta används som modeller för att studera grundläggande principer inom dessa områden.

"Bacterial lysis" är en medicinsk term som refererar till processen där cellmembranet hos en bakterie krossas eller förstörs, vilket resulterar i att cellens innehåll spills ut och dödar bakterien. Detta kan ske naturligt genom andra bakterier eller virus som producerar en substance som orsakar lysis, eller konstladt genom metoder såsom antibiotika eller enzymatisk behandling. När bakteriens cellmembran krossas, kommer dess DNA, RNA och cytoplasma att läcka ut, vilket oftast leder till bakteriens död.

Bakteriofagen lambda, eller λ-fagen, är ett virus som infekterar och replicerar i specifika stammar av enterobakterier, särskilt Escherichia coli (E. coli). Bakteriofagen lambda tillhör gruppen tempererade bacteriofager, vilket innebär att de kan införliva sin genetiska information i värdbakteriens kromosom och därmed existera som en prophag under en tid av latens.

När bakterien utsätts för strålnings- eller kemisk stress, eller när den är i konkurrens med andra bakterier, kan prophagen excindera från värdbakteriens kromosom och påbörja en lytisk cykel. Under denna cykel produceras nya viruspartiklar (virioner) som sedan frisätts genom att värdbakterien lyses upp, vilket dödar bakterien.

Bakteriofagen lambda används ofta inom molekylärbiologi som ett verktyg för kloning och genmanipulation på grund av dess förmåga att integrera sin genetiska information i värdbakteriens kromosom, samt på grund av den specifika induceringsmekanismen som orsakar excision och lytisk cykel.

'Mykobakteriofager' är ett begrepp inom mikrobiologin och refererar till bakteriofager (bakterieförstörelsevirus) som kan infektera mykobakterier, vilket är en speciell grupp av grampositiva bakterier. Mykobakterier innefattar bland annat Mycobacterium tuberculosis, som orsakar tuberkulos, och Mycobacterium leprae, som orsakar lepra.

Mykobakteriofagerna är speciella eftersom de kan penetrera mykobakteriens cellvägg, som annars är svårgenomtränglig på grund av dess unika sammansättning av lipider och proteiner. Mykobakteriofagen infekterar mykobakterien genom att faga DNA:t in i värdbakteriens cytoplasma, där det kan integreras i värdens genetiska material eller replikeras och bildar nya viruspartiklar som sprider sig till andra bakterier.

Mykobakteriofager har visat sig vara ett intressant forskningsområde inom studiet av mykobakterier, eftersom de kan användas för att undersöka mykobakteriers biologi och patogenes, samt utveckla nya terapeutiska strategier för behandling av mykobakterieinfektioner.

'Viral regulatory and accessory proteins' refer to a group of proteins encoded by viruses that play roles in regulating the virus's replication cycle and modulating the host cell environment to facilitate viral replication and evade host immune responses. These proteins can function at various stages of the viral life cycle, such as transcription, translation, genome replication, virion assembly, and release.

Regulatory proteins typically control the expression or activity of other viral genes, while accessory proteins may have more diverse functions, including modulating host cell signaling pathways, suppressing antiviral responses, altering host cell metabolism, or promoting viral dissemination. The specific functions and mechanisms of these proteins can vary widely between different virus families and even between different strains of the same virus.

It is important to note that understanding the roles of viral regulatory and accessory proteins can provide valuable insights into viral pathogenesis, host-virus interactions, and potential targets for antiviral therapies.

'Salmonella-förgiftning' är en infektionssjukdom orsakad av bakterien Salmonella enterica. Den uppstår vanligen som följd av att man har ätit mat eller druckit vatten som är kontaminerat med bakterierna. Sjukdomen kännetecknas ofta av plötsliga buksmärtor, diarré, illamående och feber. Symptomen brukar vanligtvis uppstå inom 12 till 72 timmar efter att man har blivit smittad och kan vara milda eller allvarliga. I de flesta fall av Salmonella-förgiftning behövs inget särskilt medicinskt ingrepp och sjukdomen botas av sig själv inom en vecka. Vid allvarligare fall kan dock antibiotika behövas för att behandla infektionen. För att förebygga Salmonella-förgiftning rekommenderas god handhygien, att tillaga maten på rätt sätt och att hålla igång med vaccinationsprogrammen mot Salmonella för höns och andra djur.

Myoviridae är en familj av virus som infekterar både prokaryota och eukaryota värdar. De kännetecknas av en icke-segmenterad, dubbelsträngig DNA-genom och en komplex, kontraktil behållare (kapsid) med häftplattor (spikeproteiner) som används för att binder till och penetrera cellmembranet på värden. Myoviridae-medlemmar är kända för sin förmåga att infektera en rad olika bakterier, inklusive många patogena stammar, och de används ofta i forskning och medicinska tillämpningar som bakteriofager-terapi.

Stafylokockfager, även känt som stafylokock-fago eller stafylococcal bacteriophage, är ett virus som infekterar och replicerar i bakterien Staphylococcus aureus. Fager är en förkortning av det grekiska ordet "phagein", vilket betyder att äta eller förtäras. Dessa virus dödar värdbakterierna genom att infektera dem, ta över deras replikationsmekanism och producera nya fager som sedan sprider sig till andra bakterier.

Stafylokockfager är specifika för Staphylococcus aureus-bakterier och kan delas in i olika typer baserat på deras morfologi, genomföringsmekanism och genetiska uppbyggnad. De flesta stafylokockfagerna är tempererade, vilket betyder att de kan överleva vid relativt höga temperaturer (upp till 60°C).

Fager används ibland som en alternativ behandlingsmetod för att bekämpa antibiotikaresistenta bakterier. Denna metod kallas fagterapi och innebär att man använder specifika fager för att eliminera patogena bakterier från ett system, till exempel vid behandling av infektioner.

Kolibakterier (E. coli) är en typ av bakterier som normalt förekommer i tarmen hos människor och djur. Det finns många olika stammar av kolibakterier, varav de flesta är ofarliga eller till och med nyttiga för kroppen. Några stammar kan dock orsaka allvarliga infektioner. Exempel på sjukdomar som kan orsakas av vissa former av kolibakterier inkluderar matförgiftning, urinvägsinfektion och tarmsjukdom.

'Virusaktivering' (eng. 'viral reactivation') refererar till ett tillstånd där ett latent infekterat virus åter blir aktivt och börjar replikera sig inne i en värdkropp. Detta kan inträffa när värdkroppen är under stress, har en nedsatt immunförsvar eller på grund av andra faktorer som exponering för ett nytt infektionsagent eller genomgången av en behandling som stör den normala cellcykeln.

Exempel på virus som kan aktiveras från ett latent tillstånd inkluderar herpes simplex-virus (HSV), varicella-zoster-virus (VZV) och cytomegalovirus (CMV). Aktivering av dessa virus kan leda till symtom som sår, utslag, feber och andra systemiska symptom.

Det är värt att notera att en del virusaktiveringar kan vara asymptomatiska eller ge milda symtom, medan andra kan orsaka allvarliga sjukdomar eller komplikationer, särskilt hos personer med nedsatt immunförsvar.

'Virusproteiner' refererer til proteiner som produceres af et virus for å fullføre sin replikasjonsprosess og forårsage infeksjon i værtsorganismen. Disse proteinet kan inkludere strukturelle proteiner, som utgjør kapsiden eller membranen til viruset, og ikke-strukturelle proteiner, som involveres i regulering av virusets replikasjon og infeksjonsprosess.

Strukturelle proteiner kan inkludere:

* Kapsidproteiner: disse er proteiner som utgjør den proteinhylle som omger viruses genetiske materiale. De kan være formet som en helix, som hos bakteriofager, eller som en ikosaeder, som hos mange arter av RNA- og DNA-viruser.
* Membranproteiner: disse proteinet er inkorporert i lipidmembranen til de enkle- eller doppelstrands RNA-viruser som koronavirus og flavivirus. Disse proteinet kan være involvert i sammensetningen av membranen, infeksjonen av værtscellen, og/eller frigjøringen av nyproducerte virusher.

Ikke-strukturelle proteiner kan inkludere:

* Replikasjonsproteiner: disse er nødvendige for replikasjonen av virusets genetiske materiale og kan være enzymer som revers transkriptase, RNA-polymerase eller ligase.
* Regulatoriske proteiner: disse proteinet kan regulere aktiviteten til andre virusproteiner eller værtsorganismens celler for å øke viruses evne til å replikere seg og spre seg.

I allmennhet er virusproteinene spesifikke for hvert individuelt virus og kan være mål for antivirale terapier eller vaccineutvikling.

'Genom' refererer til det totale sæt af genetisk information, der er indeholdt i et organisme. Det består af DNA-molekyler, der har kodet for alle de gener, proteiner og regulerende sekvenser, der er nødvendige for at danne og opretholde livet hos det pågældende organisme.

'Viralt genom' refererer til den totale genetiske information, der findes i et virus. Et viralt genom kan være lavet af DNA eller RNA og kan variere meget i størrelse alt efter hvilken type virus vi taler om. Virus' genom indeholder instruktionerne for at producere nye viruspartikler, så de kan inficere andre celler og fortsætte med at sprede sig.

'Virus-DNA' refererer til det genetiske materiale i form av DNA (deoxyribonucleic acid) som findes i visse typer virus. Virus er små infektiøse partikler som ikke kan reproducere seg selv, men har brug for en værtscell for å formere seg.

Virus-DNA kan være enten enkeltstreget eller dobbeltstreget, og den kan være lineær eller cirkulær. Nogle viruser har DNA som det primære genetiske materialet, mens andre har RNA (ribonucleic acid).

DNA-viruses inneholder ofte en begranset mengde genetisk informasjon og er avhengige av værttens cellulære mekanismer for å syntetisere proteiner og replikere seg. Eksempler på DNA-viruses inkluder herpesvirus, papillomavirus og adenovirus.

Operator regions, genetic, refer to specific DNA sequences in a gene that regulate its transcription into messenger RNA (mRNA). These regions are often located near the promoter region of a gene and can bind proteins called transcription factors. The binding of these proteins can either enhance or repress the transcription of the gene, depending on the specific sequence of the operator region and the type of transcription factor that binds to it. Operator regions are an important part of how genes are regulated in response to various stimuli and environmental factors.

"Bacteriophage Mu" er en type bakteriofag (bakterieviruset) som infekterer og replikerer seg i bakterien Escherichia coli ("E. coli"). Bakteriofagen Mu har en unik egenskap kalt "generalisert transduktion", hvor den kan overføre gener fra sin egen genome til værtbakteriens genome under replikasjonen. Dette gjør at bakteriofagen Mu er i stand til å endre arven til værtbakterien på en måte som kan føre til nyttige eller skadelige effekter for bakterien.

Bakteriofagen Mu har også en høy grad av lysgenomintegrering, hvilket betyr at den kan integrere seg selv i værtbakteriens genome ved slikingssteder (attachmentsites) som kalles "attachment sites" eller "att sites". Dette gjør at bakteriofagen Mu kan eksistere i bakterien som en prophage, hvor den ikke produserer nye viruspartikler før den aktiveres av et stimulus, for eksempel UV-stråling eller antibiotisk behandling.

Bakteriofagen Mu er blitt viktig i studiene av bakteriens genetikk og molekylærbiologi, og har også vært brukt som et redselsmiddel mot bakterielle infeksjoner.

Proteobacteria är en fylum (division) inom riket bakterier som inkluderar en mångfald av patogena arter, det vill säga bakterier som kan orsaka sjukdom hos djur, växter och människor. Proteobacteria delas vanligen upp i fem klassgrupper: Alfa-, Beta-, Gamma-, Delta- och Epsilonproteobacteria.

Till de patogena arterna som ingår i proteobakterier hör bland annat Escherichia coli (E. coli), Salmonella enterica, Vibrio cholerae, Helicobacter pylori och Yersinia pestis. Dessa bakterier kan orsaka en rad olika sjukdomar som till exempel matförgiftning, magsår, lungsäcksinflammation och pestsjukan.

Proteobakterier är gramnegativa bakterier, vilket betyder att de inte tar upp den färglösning (gramfärgning) som används för att skilja olika grupper av bakterier åt under mikroskopisk undersökning. Istället har de en dubbelmembran, där den inre membranen består av lipopolysackarider och den yttre membranen av fosfolipider.

Proteobacteria är mycket artrika och förekommer i en mängd olika miljöer, som till exempel jord, vatten, luft och på levande organismer. De kan leva antingen fritt eller som symbionter tillsammans med andra organismer.

Repressorproteiner är proteiner som binds till specifika DNA-sekvenser och på så sätt förhindrar transkriptionen av angränsande gener. De fungerar som del av regulatoriska system i celler, där de kan stänga av genuttrycket när det inte behövs. Repressorproteinens aktivitet kan moduleras av olika signalmolekyler, till exempel sekundära meddelandeämnen (secoeder), för att möjliggöra precisely kontrollerad genuttryck. I prokaryota celler är repressorprotein ofta en del av operonregulatoriska system, medan de i eukaryota celler oftare är involverade i regleringen av enskilda gener.

'Streptococcus' er en slags bakterie som tilhører familien Streptococcaceae. Disse bakterier er gram-positive, kokkoidformede (runde) og ofte forekommer i par eller kæder. Der findes mange forskellige arter af Streptococcus, herunder nogle som kan forårsage infektioner hos mennesker, såsom streptokokkerne A, B, C og G. Disse arter kan forårsage en række forskellige sygdomme, herunder halsbetændelse, lungebetændelse, impetigo (en hudinfektion) og rheumatisk feber. Andre arter af Streptococcus, såsom S. pneumoniae, kan forårsage lungebetændelse og meningitis.

Mitomycin är ett typiskt exempel på en sorts cancerbehandlande läkemedel som kallas cytotoxiska antineoplastiska medel, och mer specifikt, en alkylerande agent. Mitomycin fungerar genom att skada DNA i cancerceller, vilket stoppar celldelningen och kan leda till celldöd. Det används vanligtvis som en del av kombinerad behandling för olika typer av cancer, inklusive mag-tarmcancer och hudcancer (bland annat basalcellscancer och squamosacellscancer). Läkemedlet ges ofta via en intravenös infusion eller som ett topiskt preparat som appliceras direkt på huden.

'Lactococcus lactis' är en grampositiv, kul- eller ovalformad bakterie som normalt förekommer i naturen, särskilt i mjölkprodukter. Den används ofta inom livsmedelsindustrin som starterkultur vid tillverkning av ostar och fermenterade mjölkprodukter, såsom yoghurt och kesella. Bakterien är en homofermentativ laktatproducerare, vilket betyder att den konverterar socker (laktos) till mjölksyra som ett sätt att generera energi.

I medicinsk kontext kan 'Lactococcus lactis' användas inom näringsmedicin och probiotikaterapi, då den har visat sig ha potentialen att bidra till att förbättra tarmfloran och stärka immunförsvaret. Dessutom har forskare upptäckt att vissa stammar av 'Lactococcus lactis' kan producera protein som påverkar cellsignalering, vilket kan ha potentialen i behandlingar för olika sjukdomar, såsom cancer och autoimmuna sjukdomar.

MITOMYCIN är ett cytostatikum, det vill säga ett ämne som hämmar celldelningen och används inom medicinen som cancerbehandling. Mitomycin är ett antibiotiskt medel som isolerats från jordsvampen Streptomyces caespitosus. Det har alkylerings-, interkalations- och korslänkningsegenskaper, vilket gör att det kan binda till DNA och hindra celldelningen.

Mitomycin används vanligtvis som intravenös infusion för behandling av olika typer av cancer, såsom mag- och tarmslemcancer, lungcancer, hudcancer (basalcellscancer) och ögoncancer (svullnad i ögats bindehinna). Det kan även användas som lokalbehandling vid operationer för att minska risken för cancerrekommande.

Som alla cytostatika har mitomycin en rad biverkningar, däribland allvarliga blodbristtillstånd (myelosuppression), mag- och tarmbesvär samt skada på lever, njurar och lungor. Dessa biverkningar kan vara livshotande och kräver därför noggrann medicinsk övervakning under behandlingen.

En kolibakterie (officiellt kallas Escherichia coli, ofta förkortat till E. coli) är en typ av gramnegativ bakterie som normalt förekommer i tarmarna hos varma blodcirkulerande djur, inklusive människor. Det finns många olika stammar av kolibakterier, och de flesta är ofarliga eller till och med nyttiga för värden. Några stammar kan dock orsaka allvarliga infektioner i mag-tarmkanalen, blodet eller andra kroppsdelar. En välkänd patogen kolibakteriestam är E. coli O157:H7, som kan orsaka livshotande komplikationer som hemolytisk uremisk syndrom (HUS) och tack följd av förtäring kontaminert mat eller vatten.

Integrase är ett enzym som förekommer hos retrovirus, inklusive HIV, och har en central roll i virusets infektionsprocess. Integrasen katalyserar integrationen av viral DNA in i värddjurets genetiska material, vilket möjliggör fortsatt replikation och infektion av den drabbade cellen. Integraser är därför ett viktigt mål för antiretrovirala läkemedel som används för att behandla HIV-infektioner.

En viral plaqueassay är en metod inom virologi för att bestämma den infektiösa titern (antalet infektiösa partiklar per volymenheter) av ett virus. Metoden bygger på principen att virus infekterar och dödar celler i en monolayer av cellkulturer, vilket resulterar i en synlig klar plak (en liten, distinkt klump eller fläck) av döda celler mot en bakgrund av levande, metaboliskt aktiva celler.

I ett typiskt experiment seedas en standardiserad celllinje i en platt 6-well plate och infekteras sedan med seriella dilutioner av ett virusprov. Efter en inkubationsperiod på flera timmar till dagar, överstryks cellmonolagret med ett semi-solid medium (till exempel agarose) för att begränsa virusspridningen och underlätta plakbildning. Efter ytterligare inkubation bildas tydliga plak av döda celler som kan räknas och korreleras med den ursprungliga viruskoncentrationen i provet.

Viral plaqueassay är en mycket känslig metod för att uppskatta virustiter, och det ger information om både absoluta antalet infektiösa partiklar och deras förmåga att bilda plak (plaquaeffektivitet). Denna metod används ofta för att karakterisera nya virusstammar, utvärdera effektiviteten av antivirala medel och undersöka patogenes inom virologi.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

'Salthalt' refererer til mængden af opløst salt i et vandløb, hav eller andet vandførende system. Det er typisk udtrykt som salinitet, der er en dimensionsløs størrelse som angiver forholdet mellem den masse af opløste stoffer (i gram) og den væskevolume (i liter), hvorpå de er opløst. Saliniteten for havvand ligger typisk på omkring 3,5%, svarende til en salinitet på ca. 35.

I medicinske sammenhænge kan 'salthalt' også referere til saltindholdet i kroppen eller i en bestemt væske i kroppen, såsom blodet. Normal saltholdighed i blodet er typisk på omkring 0,9%, svarende til en salinitet på ca. 9 g/L. For højt saltindhold (også kaldet hypernatremi) eller for lavt saltindhold (hyponatremi) kan have negativ indvirkning på kroppen og føre til forskellige sundhedsproblemer.

'Plankton' är ett samlingsbegrepp för de organism som lever i vatten och har svag eller ingen förmåga att simma mot strömmen. De flöder fritt med vattnets rörelser och kan inte aktivt simma emot strömmen på grund av sin lilla storlek eller brist på utvecklade simmuskler. Plankton kan delas in i två huvudgrupper: vegetabiliskt plankton (phytoplankton) och animaliskt plankton (zooplankton). Phytoplankton består av små alger och cyanobakterier som utför fotosyntes, medan zooplankton består av små djur, såsom kräftdjur, blötdjur och lägre forms av fiskar. Plankton är en viktig del av ekosystemet i alla typer av vattenmiljöer, inklusive hav, sjöar och floder, och bildar grunden för näringskedjan i dessa miljöer.

Bacteroidetes är en fylum (stam) av gramnegativa, aeroba och anaeroba, icke-sporbildande bakterier. De flesta arterna i denna stam är strikt anaeroba och förekommer naturligt i tarmfloran hos djur, inklusive människor. Bacteroidetes är en av de vanligaste fylumen av bakterier i mänskliga tarmsystemet och spelar en viktig roll i nedbrytningen av komplexa kolhydrater och proteiner. Dessutom kan vissa arter orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunförsvagna individer.

"Bassekvens" er en medisinsk betegnelse for en abnorm, gentagen sekvens eller mønster i et individ's DNA-sekvens. Disse baseparsekvenser består typisk av fire nukleotider: adenin (A), timin (T), guanin (G) og cytosin (C). En bassekvens kan være arvelig eller opstå som en mutation under individets liv.

En abnormal bassekvens kan føre til genetiske sygdomme, fejlutviklinger eller forhøjet risiko for bestemte sykdommer. For eksempel kan en bassekvens, der koder for en defekt protein, føre til en arvelig sykdom som cystisk fibrose eller muskeldystrofi.

Det er viktig å understreke at en abnormal bassekvens ikke alltid vil resultere i en sykdom eller fejlutvikling. I mange tilfeller kan individet være asymptomatisk og leve et normalt liv.

'Open Reading Frames' (ORF) refererar till genetiska sekvenssegment som har potentialen att koda för proteiner. De definieras vanligtvis som en sekvens av minst 300 nukleotider som börjar med en startkod (ATG) och fortsätter till en stoppkod (TAA, TAG eller TGA). ORF:er hittas ofta i delar av DNA eller RNA som kallas icke-kodande, eftersom de inte direkt koder för proteiner. Genom att identifiera ORF:er kan forskare förutsäga potentiala proteinsekvenser och undersöka deras funktioner. Det är värt att notera att inte alla ORF:er leder till produktion av ett fullständigt protein, eftersom det finns olika mekanismer som kan påverka den genetiska informationens överföring från DNA till protein.

'Virusgener' är ett begrepp inom virologi och refererar till den del av ett virusgenom som kodar för de proteiner som behövs för att producera nya viruspartiklar. Det kan bestå av en eller flera gener, beroende på vilken typ av virus det är. Virusgener innehåller allt väsentligt genetisk information som krävs för att en virusinfektion ska kunna fortgå och nya viruspartiklar ska kunna bildas.

Genetisk rekombination är ett naturligt fenomen som sker under meiosen, den typ av celldelning som leder till bildandet av könsceller hos djur och vissa växter. Genetisk rekombination innebär att genetiskt material, i form av DNA-strängar, byts mellan olika kromosomer. Detta sker genom en process som kallas crossing over, där två homologa kromosomer (kromosomer från varsin föräldrageneration som har samma gener i samma ordning) böjs så att deras telomera (ändar) möts och delar av deras längre armar byter plats med varandra.

Genetisk rekombination kan också ske i en laboratoriemiljö genom tekniker som innebär att man klipper DNA-strängar itu och klistrar samman dem på nytt på ett sätt som ger upphov till nya kombinationer av gener. Detta används bland annat vid produktionen av genetiskt modifierade organismer (GMO).

En mutation är ett tillfälligt eller permanet genetiskt förändring i DNA-sekvensen som kan resultera i en förändring i strukturen eller funktionen hos ett protein eller en genprodukt. Mutationer kan uppstå spontant under celldelning, eller orsakas av externa faktorer såsom strålning, kemikalier eller virus. Mutationer kan vara skadliga, neutrala eller till och med fördelaktiga beroende på vilken del av genomet de påverkar och hur de påverkar genens funktion.

"Encyclopedias are comprehensive reference works containing information on a wide range of topics. They are typically organized in alphabetical order and provide concise summaries of facts, concepts, and knowledge in various fields such as science, history, literature, philosophy, and arts. The principles behind the creation of encyclopedias include accuracy, objectivity, and authority, with contributions from experts in their respective fields. Encyclopedias serve as a valuable resource for researchers, students, and general readers seeking reliable information on a wide array of subjects."

Kapilläre Elektrokromatographie (engelska: Capillary Electrochromatography, CEC) är en separationsteknik som kombinerar principer från både kapillärkromatografin och kapillär elektrofores. I CEC används ett elektriskt fält för att driva ett mobilt stadium, vanligtvis en elektrolytlösning, genom en kapillär kolonn som är packad med en stationär fas, till exempel en kromatografisk packning.

I CEC separeras joner eller molekyler baserat på deras elektrokinetiska rörlighet och interaktioner med den stationära fasen. Separationen är beroende av flera faktorer, inklusive molekylernas laddning, storlek, form och hydrofoba egenskaper samt den elektriska fältstyrkan och de kemiska egenskaperna hos den mobila och stationära fasen.

CEC används ofta inom områden som läkemedelsanalys, miljöanalys, biokemi och proteomik för att separera, identifiera och kvantifiera olika joner eller molekyler.

'Escherichia coli' är en art av gramnegativa, aeroba, encapsulereda, stavformade bakterier som normalt förekommer i människans tarm. Det finns många olika serotyper och stammar av E. coli, varav vissa kan orsaka sjukdom hos människor och djur.

'Escherichia coli-proteiner' refererar till proteiner som produceras eller finns i E. coli-bakterier. Dessa proteiner har en rad olika funktioner och är viktiga för bakteriens överlevnad, tillväxt och patogenicitet. Några exempel på E. coli-proteiner inkluderar:

* Flagellin: ett protein som utgör strukturen i bakteriens flageller (svansar), vilket möjliggör bakteriens rörelse och motilitet.
* Fimbrier: proteiner som bildar små hårstrån på bakteriens yta, vilka underlättar bakteriens adhesion till celler i värden.
* Hemolysin: ett toxin som orsakar celldöd och skador på vävnader.
* Shiga-like-toksin: ett toxin som kan orsaka allvarliga njursjukdomar, blodproppar och till och med dödsfall hos människor.

Escherichia coli-proteiner är viktiga i forskning och utveckling av diagnostiska tester, vacciner och behandlingsmetoder för E. coli-relaterade sjukdomar.

MedlinePlus är en webbplats som tillhandahålls och underhålls av US National Library of Medicine (NLM), som är en del av National Institutes of Health (NIH). MedlinePlus erbjuder information om sjukdomar, förhållanden, terapier, läkemedel och preventiva omsorgsmått på ett tillgängligt, opartiskt och trovärdigt sätt. Innehållet på webbplatsen är skrivet på enkel engelska och spanska och inkluderar artiklar, videor, illustrationer, hälsorelaterade nyheter och information om kliniska prövningar.

MedlinePlus sammanställer information från American National Institutes of Health och andra välrenommerade organisationer och har som mål att erbjuda en neutral och opartisk resurs för allmänheten, patienter, familjer och vårdpersonal. Innehållet på webbplatsen genomgår en granskning av experter för att säkerställa att den är korrekt, aktuell och tillförlitlig.

Detta virus har en temperat livscykel som gör det möjligt att antingen integrera sig i genomet hos sin värd genom lysogeni ... Dock kan fag-DNA integrera sig i den mottagande cellens kromosom under vissa förutsättningar, vilket kallas lysogeni. I detta ...