Kolingivaren vid biosyntes av kolinhaltiga fosfoglycerider.
Estern av diacylglycerol med cytidindifosfatets ändfosfat. Det fungerar som mellanled vid biosyntesen av fosfatidyletanolamin och fosfatidylserin i bakterier.
Nukleinsyraenheter bestående av en sockermolekyl, en fosforsyramolekyl och en basmolekyl, som utgörs av cytosin.
Nukleosiddifosfatsocker, även känt som nucleoside diphosphate sugars (NDPs), är en typ av organisk molekyl som består av en sockerdel (sugar) som är kovalent bundet till två fosfatgrupper och en nukleosid. Nukleosiden är i sin tur en basen (en kvävebas) som är kovalent bunden till en pentos, en fem carbongruppig sockertyp, ofta ribos eller deoxyribos.
En pyrimidinnukleosid som består av basen cytosin, kopplad till D-ribos, ett socker med fem koldelar.
Cytidin-5'-(trivätedifosfat). En cytosinnukleotid med två fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen. Syn. CRPP; cytidinpyrofosfat.
Estrar av glycerol.
En basisk beståndsdel av lecitin som förekommer i många växter och djurorgan. Det är viktigt som prekursor till acetylkolin, som metylgivare i olika metaboliska processer och i fettomsättningen.
Ett enzym som katalyserar deaminering av cytidin, varvid bildas uridin. EC 3.5.4.5.
Cytidindivätefosfat. En cytosinnukleotid med en fosfatgrupp som förestrats till sockerdelen vid positionerna 2', 3' och 5'.
En något heterogen klass av enzymer som katalyserar överföringen av alkyler eller liknande grupper (utom metylgrupper). EC 2.5.
Polyisoprenylfosfater är en typ av organisk förening som innehåller en lång, icke-ramifierad polymer av isoprenenheter som är kovalent bunden till en fosfatgrupp. De förekommer naturligt i celler och är involverade i olika cellulära processer, såsom proteinsyntes och modifikation. Exempel på polyisoprenylfosfater inkluderar dolicholfosfater och undekaprenylfosfat.
Nukleosiddifosfatkinas (NDK) är ett enzym som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från ATP till nukleosiddifosfater, vilket resulterar i produktionen av triphosphatnukleotider. Denna reaktion är viktig för energiproduktion och syntesen av nukleinsyror inom celler.
Adenosin-5´-(trivätedifosfat). En adeninnukleotid innehållande två fosfatgrupper som förestrats till en sockerdel vid 5´-positionen.
Terpenbyggstenarna med fem kolenheter som fås från mevalonsyra eller deoxixylulosfosfat.
Cytidin-5'-(tetravätetrifosfat). En cytosinnukleotid innehållande tre fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen.
NM23 nucleoside diphosphate kinases are a group of enzymes that play a role in regulating the intracellular concentrations of nucleoside tri- and diphosphates, which are important for various cellular processes including DNA replication, repair, and translation. The NM23 protein was originally identified as a potential metastasis suppressor gene, but its exact function in cancer biology is still not fully understood. There are several isoforms of the NM23 protein, with NM23-H1 being the most well-studied. In addition to its enzymatic activity, NM23 has been shown to have non-enzymatic functions, such as acting as a transcriptional regulator and modulating cell adhesion and motility.
Ett enzym som under kolesterolbiosyntesen katalyserar kondenseringen av isopentenylpyrofosfat och dimetylallylpyrofosfat till pyrofosfat och geranylpyrofosfat. Därefter katalyserar enzymet kondenseringen av sistnämnda förening med ytterligare isopentenylpyrofosfat till pyrofosfat och farnesylpyrofosfat. EC 2.5.1.1.
Enzymer som katalyserar förflyttning av en kol-koldubbelbindning från en position till en annan inom samma molekyl. EC 5.3.3.
Somatisk hypermutation är ett naturligt fenomen som sker inne i vårt immunsystem och leder till att antikroppsmolekyler (immunglobuliner) muterar och blir mer varierade. Detta hjälper kroppen att effektivt bekämpa olika typer av främmande ämnen, såsom bakterier och virus.
A Ribonucleotide Reductase (RNR) is a crucial enzyme in DNA synthesis and repair, responsible for catalyzing the conversion of ribonucleotides to deoxyribonucleotides by reducing the 2'-hydroxyl group of the ribose sugar to a hydrogen, creating the building blocks necessary for DNA replication and repair.
Avlägsnande av en aminogrupp (NH2) från en kemisk förening.
Cytosin demethylation är ett biologiskt process där metylgrupper (–CH3) avlägsnas från cytosinbaser i DNA:t, vanligtvis vid CpG-rikedomar i genomet. Denna process spelar en viktig roll för epigenetiska regleringar av genuttryck och cellulär differensiering.
Genetisk omfördelning av B-lymfocyten som medför en substitution i den typ av fast område för tunga kedjor som uttrycks. Detta möjliggör ett ändrat effektorsvar, medan den specifika antigenbindningen (det variabla området) förblir oförändrad. De flesta klassbyten sker genom DNA-omkastning, men sådana kan även inträffa på RNA-nivå.
Nukleosiddeaminas är en typ av enzym som katalyserar reaktioner där en aminogrupp i en nukleosid substitueras med ett annat gruppering, vanligtvis en oxygen- eller svavelgrupp. Denna reaktion resulterar i konverteringen av den ursprungliga nukleosiden till en nukleosiddeamin som innehåller en ny funktionell grupp. Nukleosiddeaminaseryt spelar en viktig roll i celldelningen, DNA-reparation och immunförsvaret.
Uridindifosfatsugar (UDP-sugar) är ett nukleotidsocker som spelar en viktig roll i cellens metabolism, särskilt inom glykosyleringsprocesser där kolhydrater kopplas till proteiner och lipider. UDP-sugaren består av en uridinmonofosfat (UMP) del som är kopplad till en sockerdel, ofta glukos eller galaktos. Denna molekyl fungerar som en donator av sockergrupper under biosyntesen av olika glykosider och proteoglykaner.
Farnesyltransferase är ett enzym som katalyserar den sista steget i proteinfarnesyleringen, en posttranslationell modifikationsprocess där ett farnesylgrupp (ett 15-kolatomlångt isoprenoid) adderas till ett cysteinrest nära C-terminalen av specifika proteiner. Denna modifikation är nödvändig för att vissa proteiner ska kunna korrekt lokaliseras inom cellen, exempelvis till cellytan eller till membran inuti cellen.
Nukleosid är en organisk komponent i nukleotider, som i sin tur är byggstenarna i nukleinsyror såsom DNA och RNA. Nukleosider bildas genom kondensation av en pentos (en fem-kolmon sugarkedja) med en heterocyklisk bas, vanligtvis adenin, guanin, cytosin, uracil eller tymin. Exempel på nukleosider är adenosin, guanosin, cytidin och uridin.
Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) definieras en transferas som: "En enzym som katalyserar överföringen av en funktionell grupp (-X), till exempel en metyl-, acetyl- eller aminosgrupp, från ett donorsubstrat till ett acceptorsubstrat, vanligtvis en molekyl med en aktivt hydroxyl (-OH) eller amino (-NH2) grupp." Transferaser utgör en av sex huvudklasser av enzymer enligt den systematiska EC-numreringen.
Organofosforföreningar är en kemisk term som refererar till samtliga föreningar som innehåller minst en kovalent bunden fosforatom och en eller flera kolatom(er), vanligtvis i form av en fosfatester-bindning.
Uridin är ett nucleosid som består av en pyrimidinbas (uracil) kovalent bundet till en femtoribos (ribose) via en beta-N1-glykosidbindning. Det förekommer naturligt i RNA och har en central roll i cellers proteinsyntes som en del av transfer-RNA (tRNA).
Guanosin 5'-(trivätedifosfat). En guaninnukleotid med två fosfatgrupper som förestrats till sockerdelen. Synonymer är GRPP och guanosinpyrofosfat.
Ett nukleosidmonofosfatsocker som ger N-acetylneuraminsyra till ändsockret hos en gangliosid eller ett glykoprotein.
Uridindifosfat (UDP) är ett nukleotid difosfat som innehåller den pentos sugar uridin kopplad till två fosfatgrupper. Det är en viktig molekyl i celld metabolism, speciellt involverad i syntesen av sockerarter och andra organiska compound. UDP fungerar som en donator av uridinmonofosfat (UMP) vid syntesen av DNA och RNA, och är också inblandat i glykosylering, ett process där socker kopplas till proteiner och lipider.
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
Tiaminpyrofosfat, även känt som Thiamin diphosphate (ThDP), är den aktiva formen av vitamin B1 och en viktig koenzym i kroppen. Det spelar en central roll i metabolismen av kolhydrater, aminosyror och fettsyror genom att vara involverat i processer som oxidativ decarboxylering och syntesen av neurotransmittorer. Tiaminpyrofosfat är essentiellt för normal hjärnfunktion och energiproduktion i celler.
RNA editing refererer til den proces, hvor der foretages ændringer i det posttranskriptionelle RNA, før det oversættes til protein. Dette kan involvere indsættelse, deletyion eller substitution af nukleotider, der resulterer i en forandring af aminosyresekvensen i det endelige protein. Den mest almindelige form for RNA editing hos pattedyr er den reversible konvertering af adenosin (A) til inosin (I), katalyseret af enzymerne ADAR (Adenosine Deaminases Acting on RNA). Inosin kan derefter behandles som guanosin under oversættelsesprocessen, hvilket resulterer i en aminosyreforandring i det endelige protein.
"Uracilnukleotider" är en typ av nukleotider som innehåller den nucleobasen uracil. De förekommer naturligt i RNA, men inte i DNA där thymin används istället. Uracilnukleotider bygger upp strukturen hos enskilda nukleotider i en RNA-molekyl, tillsammans med en pentos (ribos) sockerstruktur och en fosfatgrupp.
Sesquiterpenes are a class of organic compounds that are biosynthesized from farnesyl pyrophosphate, consisting of three isoprene units (a total of 15 carbon atoms) and possess a variety of structural types and biological activities.
Oorganiska salter av fosforsyra med två fosfatgrupper.
Terpenes are a class of organic compounds produced by a variety of plants, including conifers, citrus fruits, and cannabis. They are the primary components of essential oils and contribute to the aroma and flavor of these plants. Terpenes have been found to have potential medicinal properties, such as anti-inflammatory, analgesic, and antimicrobial effects. However, more research is needed to fully understand their therapeutic potential and safety profile in humans.
En art grampositiva, runda bakterier som är hopkoppplade fyra och fyra eller i klungor av tetrader. De finns främst på huden hos däggdjur.
Pyrimidinnukleotider är molekyler som består av en pyrimidinbas (tymin eller cytosin), en pentos fosfatbacke (ribose eller deoxyribose) och en fosfatgrupp. De är en del av nukleinsyrorna DNA och RNA, där de bildar baspar med purinnukleotider genom komplementär basparning (tymin med adenin och cytosin med guanin).
En inosinnukleotid som innehåller en pyrofosfatgrupp som förestrats mot C5 i sockerdelen.

Cytidine diphosphate-coline (CDP-coline) er en fosfoestrader av colin, som spiller en viktig rolle i cellemembranens struktur og funksjon. Det er involvert i syntesen av fosfatidyldikolin, en viktig komponent i cellemembranen hos dyr. CDP-coline kan også spille en rolle i signaloverføring i nervev systemet.

Cytidindifosfatdiglycerider (CDP-diglycerider) är en typ av fosfolipider som spelar en viktig roll i celldelningen och cellmembranets struktur och funktion. De bildas genom en reaktion där cytidindifosfat (CDP) kombineras med diglycerider. CDP-diglycerider är involverade i syntesen av andra fosfolipider, såsom fosphatidylserin och fosphatidylinositol, som är viktiga komponenter i cellmembranet. Dessa lipider deltar också i signaltransduktionsprocesser och reglering av celldelning och apoptos (programmerad celldöd).

Cytosinnukleotider är organiska molekyler som består av en fosfatgrupp, en pentos (sackarid) och en kvävebas. De är en viktig del av cellernas genetiska material, DNA och RNA. Cytosinnukleotiden innehåller kvävebasen cytosin.

Den exakta medicinska definitionen kan variera beroende på källa och kontext, men den allmänna betydelsen avbildas ovan.

Nucleoside diphosphate sugars (NDP-sugars) är en typ av organiska molekyler som spelar en viktig roll i cellens metabolism, särskilt inom biosyntesen av kolhydrater och glykoproteiner.

En NDP-socker består av en sockermolekyl som är kovalent bundet till två fosfatgrupper via en nucleosid. Nucleosiden är i sin tur bildad av en pentos, ofta ribosa eller deoxyribosa, som är kovalent bunden till en nitrogenbas (purin eller pyrimidin).

NDP-sockrar är viktiga intermediärer inom cellens sockermetabolism och används som substrat i reaktioner där sockermolekyler kopplas till andra molekyler, såsom proteiner eller andra kolhydrater. Exempel på NDP-sockrar är UDP-glukos (uridin difosfat glukos) och GDP-mannos (guanosin difosfat mannos).

I summa, Nucleoside diphosphate sugars är viktiga biomolekyler som består av en sockermolekyl kovalent bundet till två fosfatgrupper via en nucleosid. De spelar en central roll inom cellens metabolism och används som substrat i reaktioner där sockermolekyler kopplas till andra molekyler.

Cytidin är en nucleosid som består av cytosin (en nukleotidbas) kopplad till en ribose (sönderfallsprodukt från RNA). Det bildas när cytosin kombineras med ribos via en glykosidasbindning. Cytidin spelar en viktig roll i cellers DNA- och RNA-syntes, och är också en del av koenzymet PT (tiaminpyrofosfat), som är involverad i flera metaboliska processer, särskilt kolvätets metabolism.

Cytidindifosfat (CDP) är en nukleotid som deltar i biosyntesen av fosfolipider i celler. Det bildas inifrån cytidintrifosfat (CTP) och två kolvätegrupper från snuvlitidsyra, under katalys av enzymet CTP:fosfatidsyra cytidyltansferas. CDP används sedan för att syntetisera andra fosfolipider, såsom fosfatidylserin och fosfatidiletanolamin.

Glycerider, även känt som glycerides, är en klass av estrar som bildas när glycerol (ett triol) reagerar med en eller flera molekyler av en fettsyra genom en esterbindning. Glycerider kan vara monoglycerider (en fettsyramolekyl), diglycerider (två fettsyramolekyler) eller triglycerider (tre fettsyramolekyler). De flesta naturliga fetter och oljor består av triglycerider. Glycerider är viktiga i levande organismers närings- och energimetabolism.

'Kolin' (eller 'cholin' på engelska) är ett vattenlösligt, organiskt ämne som är en essentiell näringsämne och en viktig beståndsdel i vår kropp. Det ingår i strukturen hos vissa lipider, så kallade fosfolipider, som är en viktig del av celldelarnas (membranernas) struktur.

Kolin är också en prekursor till neurotransmittorerna acetylkolin och noradrenalin, vilket betyder att det spelar en roll i signaleringen mellan nervceller. Dessutom har kolin visat sig ha en viktig roll för minnesfunktionen och hjärnans funktion överlag.

I kroppen kan kolin tillföras genom dieten, där det finns i föda som lever, ägg, fisk, nötter och gröna lökväxter.

Cytidine deaminase (CDA) er ein enzym som fungerer i kroppens prosess for å bryte ned (metabolisere) bestemt type av nukleosider, specifikt cytidin og deoxicitidin. Nukleosider er byggesteiner i DNA og RNA. Cytidine deaminasen fjerner en aminosgruppe fra cytidin eller deoxicitidin, som resulterer i omsetning til uridin eller deoxyuridin. Dette kan ha betydning for behandling med visse typer av kreftmedisin, fordi det påvirkar hvor lange tid cytostatika (kreftmedisiner) som er basert på nukleosider forblir aktive i kroppen.

Det finnes to typer av cytidine deaminaser:

1. Cytidine deaminase 1 (CDA1): Denne enzymet forekommer naturligvis i leveren og andre organer, og er involvert i normal metabolisme av nukleosider.
2. Cytidine deaminase 2 (CDA2): Dette er en variant av cytidine deaminasen som forekommer i hvit blodceller (leukocytter) og kan være involvert i immunforsvaret.

Det finnes også en tredje type, APOBEC3A, som er en cytidine deaminase som spesielt er involvert i antivirale immunforsvar mot retrovirus og andre virus.

Cytidinmonofosfat (CMP) är en nukleotid som består av en cytosinbase kopplad till en ribosemolekyl via en β-N1-glykosidbindning, och med en fosfatgrupp bundet till den 5'-kolvidden på ribosen. CMP är en ester av fosforsyra.

CMP spelar en viktig roll i cellens metabolism, särskilt inom nukleinsyrans syntes och energitransport. Det är ett building block i RNA-molekyler och deltar i olika biokemiska reaktioner som kräver energiföring eller fosfatgruppdonation.

Alkyl- and aryltransferases are a group of enzymes that facilitate the transfer of alkyl or aryl groups from one molecule to another. These enzymes play a crucial role in various biological processes, including detoxification and the metabolism of xenobiotics (foreign substances) in the body.

In the medical field, these enzymes are often studied in the context of drug metabolism and toxicology. For example, certain drugs may be metabolized by alkyl- or aryltransferases, which can affect their efficacy and safety. Similarly, exposure to environmental toxins that are metabolized by these enzymes can lead to the production of harmful metabolites, which may contribute to the development of various diseases.

Understanding the function and regulation of alkyl- and aryltransferases is therefore important for developing strategies to enhance drug efficacy, reduce toxicity, and prevent or treat environmental toxicant-induced diseases.

Polyisoprenylfosfater är en typ av organiska föreningar som innehåller en lång, icke-ramifierad kedja av isoprenenheter som är bundna till en fosfatgrupp. De kan variera i längd och består vanligtvis av 5-substituerade carbonsubenheter (isoprenenheter) som är sammanlänkade i en linjär kedja.

Dessa ämnen spelar en viktig roll inom cellbiologin, där de fungerar som byggstenar vid syntesen av olika biologiskt aktiva molekyler, såsom steroler och ubichinoner. Polyisoprenylfosfater biosyntetiseras i cellen genom en serie enzymkatalyserade reaktioner som involverar isoprenoidprecursorer som ger upphov till de olika isoprenenheterna.

Det är värt att notera att polyisoprenylfosfater inte är ett vanligt begrepp inom medicinsk litteratur, men de kan vara relaterade till vissa sjukdomar eller störningar i cellulär metabolism som kan ha medicinska konsekvenser.

Nukleosid difosfat kinaser (NDK) är ett enzym som katalyserar överföringen av en fosfatgrupp från en nukleosid difosfat till en annan molekyl, ofta en annan nukleosid difosfat. Denna reaktion resulterar i bildandet av två nukleosid trifosfater (NTP:er). NDK spelar därför en viktig roll i regleringen av cellens energibalans och näringsmetabolism, samt i syntesen av DNA och RNA. Det finns flera olika isoformer av NDK hos människor, var och en med sina egna specifika funktioner och subcellulära lokaliseringsställen.

Adenosindifosfat (ADP) är en nukleotid som spelar en viktig roll inom cellens energimetabolism. Det är en direkt föregångare till adenosintriphosphat (ATP), som är den primära energibäraren i levande organismer.

När ATP hydrolyseras, det vill säga splittras upp i vatten, frigörs energi och en fosfatgrupp avspjälas, vilket resulterar i bildandet av ADP. Vid behov kan ADP omvandlas tillbaka till ATP genom att koppla på en extra fosfatgrupp, ett process som kräver energi. Denna energikälla kan vara syre (i oxidativ metabolism) eller glukos (i glykolys).

Sålunda är ADP en viktig del av cellens energicykel och hjälper till att lagra och frisätta energi när det behövs.

In medicinal chemistry, "hemi terpenes" are not a widely used or recognized term. However, in the context of organic and natural products chemistry, a hemi terpene is a chemical compound that contains a monoterpene unit (a 10-carbon skeleton) that is linked to another molecule.

Monoterpenes themselves are a class of naturally occurring compounds that are synthesized in plants and some animals through the biosynthetic pathway known as the mevalonate pathway. Monoterpenes have various biological activities, including antimicrobial, anti-inflammatory, and antioxidant properties.

A hemi terpene is formed when a monoterpene unit undergoes chemical reactions with other molecules, resulting in the formation of a new compound that contains the 10-carbon skeleton of the monoterpene. These compounds can have diverse structures and biological activities, depending on the nature of the reaction and the molecule to which the monoterpene is linked.

It's worth noting that the term "hemi terpene" is not commonly used in the medical literature or in clinical practice, and its meaning may vary depending on the context in which it is used.

Cytidintriphosphat (CTP) är en nukleotid som spelar en viktig roll i cellens metabolism, särskilt inom syntesen av RNA. Det består av en cytosinbas, en fosfatgrupp och två additionella fosfatgrupper som sitter bundna till varandra i en lineär kedja. CTP är ett viktigt byggsteget vid produktionen av RNA, eftersom det hjälper till att bygga upp den alternerande strukturen av ribos och deoxyribos i RNA-kedjan. Det är också involverat i syntesen av andra nukleotider och energitransfer inom cellen.

NM23 (Non-Metastatic Cells 23) Nucleoside Diphosphate Kinases are a group of evolutionarily conserved proteins that play a crucial role in regulating the intracellular concentrations of nucleoside tri- and diphosphates. These enzymes catalyze the reversible transfer of the terminal phosphate group between nucleoside diphosphates and triphosphates, maintaining a balanced pool of these nucleotides required for various cellular processes such as DNA replication, repair, transcription, and energy metabolism.

There are ten isoforms of NM23 proteins identified in humans (NM23-H1 to NM23-H10), among which NM23-H1 and NM23-H2 are the most extensively studied. These two isoforms share approximately 75% sequence identity and exhibit nucleoside diphosphate kinase activity, although their primary function appears to be unrelated to this enzymatic activity. Instead, they have been implicated in several cellular processes, including cell growth, differentiation, and motility.

NM23-H1 is also known as NDKA (Nucleoside Diphosphate Kinase A) or HSN2 (Human Submandibular Gland Protein 2), while NM23-H2 is referred to as NDBA (Nucleoside Diphosphate Kinase B) or HSN1.

Interestingly, reduced expression of NM23-H1 has been associated with increased metastatic potential in various types of cancer, which led to the initial naming of this protein as a "non-metastatic" factor. However, subsequent research revealed that both NM23-H1 and NM23-H2 could have dual roles in tumor progression, acting as either metastasis suppressors or promoters depending on the context and cellular environment.

Dimethylallyltranstransferase (DMAT) er en type enzym som spiller en viktig rolle i biosyntesen av flere forskjellige typer compounds, inkludert terpener og terpenoider. Disse compounds har en bred vifte av funksjoner i biologiske systemer, noe som inkluderer roller som antioxidanter, feromoner, pigmenter, og aroma-komponenter.

DMAT-enzymet katalyserer en reaksjon der det metylgruppa-holdende molekylet dimethylallyldiklorid (DMAPP) blir overført til et annen molekyl, ofte en isoprenoid-föreldre. Denne reaksjonen er en viktig forstadie i biosyntesen av flere forskjellige typer terpener og terpenoider.

Det finnes flere forskjellige typer DMAT-enzymer, noen av dem spesialiserte på å overføre dimethylallylgruppa til bestemte substrater. Disse enzymene er viktige mål for forskning på grunn av deres rolle i biosyntesen av flere biologisk aktive compounds, inkludert noen som har potentiale som medisinske behandlinger.

"Carbon-monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex (CODH/ACS) also known as 'Col-koldubbelbindingsisomerases' er ein bimolekylært enzymkompleks som forekommer hos anaerobe bakterier og arkeer. Dette enzymkomplekset har to funksjoner:

1. Kol-koldubblbindning (CO-binding): Det kan reversibelt binde kolmonoxid (CO) og reduse det til kolsynteg (CS2).

2. Isomerase-aktivitet: Det kan omdanne acetylkoenzym A (acetyl-CoA) til en aktivert form av carbonyl (karbonylgruppen blir overført fra acetyl-CoA til et annat molekyle).

Dette enzymkomplekset spiller en viktig rolle i kolstoffmetabolismen hos anaerobe organismer, for eksempel ved syreproduksjon fra metan (metsmalsyreproduksjon) og ved konversjon av kolsynteg til acetat."

Somatisk hypermutation (SHM) är ett naturligt fenomen som sker i B-celler under deras differentiering och aktivering. Det innebär en hög frekvens av mutationer i de gener som kodar för immunglobuliner (antikroppar), särskilt V-regionerna hos immunoglobulin-heavy chain (IgH) och immunoglobulin-light chain (IgL). Dessa mutationer leda till en diversifiering av antikropparnas specifika bindningsegenskaper, vilket möjliggör en bättre anpassning till olika patogener. SHM är en viktig mekanism i adaptiva immunförsvaret hos däggdjur och styrs av enzymer som AID (aktivator av immunglobulin-switch) och DNA-polymeras η.

Ribonucleoside difosfate reductase (RNR) er ein viktig enzym i cellene, som spiller en rolle i DNA-syntesen og -reparasjonen. Det konverterer ribonukleosiddifosfater (RNP) til dekorresponnerande deoxyribonukleosiddifosfatene (dNTP). Disse dNTP-molekylene er nødvendige for å syntetisere ny DNA. RNR-enzymer finst i alle levende organismer, og defekt i disse enzymer kan føre til alvorlige sykdommer som kreft og genetiske sjeldnefeleksjoner.

In biochemistry, deamination is the removal of an amino group (-NH2) from a molecule. In the case of amino acids, this process results in the conversion of an amino acid to a keto acid. Deamination of DNA or RNA bases refers to the removal of an amine group from these molecules. This can occur as a result of natural processes, such as programmed cell death (apoptosis), or due to environmental factors like radiation and chemicals. Deamination can lead to mutations in the genetic code, which may contribute to the development of diseases, including cancer.

Cytosine deaminase (CDA) är ett enzym som katalyserar den spontana reaktionen där cytosin konverteras till uracil. Detta enzym förekommer naturligt i bakterier, svampar och vissa djurceller, men saknas i människor. I cancerbehandling har cytosine deaminas använts som ett enzym i immunterapi, där det konverterar det kemoterapeutiska läkemedlet 5-fluorocytosin till 5-flurouracil, vilket är en aktiv cytotoxisk metabolit.

'Antikroppsklassswitching' är ett medicinskt begrepp som refererar till en mekanism där B-celler, en typ av vita blodkroppar som producerar antikroppar, kan byta klass på de antikroppar de producerar.

Antikroppar, även kända som immunglobuliner, är proteiner som produceras av B-celler för att hjälpa till att bekämpa infektioner och främmande ämnen i kroppen. Det finns fem olika klasser av antikroppar: IgA, IgD, IgE, IgG och IgM. Varje klass har en unik funktion och roll i immunförsvaret.

Genom att byta klass på de antikroppar de producerar kan B-celler anpassa sig till olika typer av infektioner och förbättra sin förmåga att bekämpa dem. Detta sker genom en process där genuttrycket i B-cellen ändras så att den börjar producera en annan typ av antikropp.

Antikroppsklassswitching är en viktig del av den adaptiva immunresponsen och hjälper till att ge kroppen en bredare och mer flexibel förmåga att bekämpa olika typer av patogener.

Nukleosiddeaminas är en typ av enzym som katalyserar reaktioner där en aminogrupp i en nukleosidmolekyl ersätts av ett hydroxylgrupp. Detta resulterar i att nukleosiden konverteras till en nukleosiddeamin, som sedan kan konvertingas till en nukleotiddeamin via en process som kallas nukleotiddeaminering.

Nukleosiddeaminaseryreaktioner spelar en viktig roll i cellens normala funktion och metabolism, men de kan också vara involverade i patologiska processer, såsom cancer och virusinfektioner. Ett exempel på ett nukleosiddeaminas som är känt för att spela en roll i cancerutveckling är AID (aktiverad immundefektförmedlad idiopatisk inflammatorisk vesikelbildning), som aktiveras under B-cellernas differentiering och kan orsaka mutationer i DNA som leder till onkogenesis.

Andra exempel på nukleosiddeaminaser inkluderar enzymer som katalyserar konverteringen av cytidin till uridin i RNA (t.ex. CAD) och enzymer som är involverade i antivirala svar, såsom APOBEC3G, som kan orsaka mutationer i retrovirus-DNA genom att konvertera cytidin till uracil.

Uridindifosfatsocker, även känt som UDP-glukos, är en organisk komponent som spelar en viktig roll inom cellmetabolismen. Det är en ester av fosforsyra, uridinmonofosfat (UMP) och glukos, vilket innebär att det består av två fosfatgrupperingar, en uridinmolekyl och en glukosmolekyl.

UDP-glukos fungerar som en aktiv donator av glukos till olika acceptorer i cellen, vilket är en viktig process för att bygga upp komplexa kolhydrater såsom glykogen och proteoglykaner. Dessa molekyler är viktiga för energilagring, cellytstruktur och intercellulär kommunikation.

I medicinskt hänseende kan störningar i UDP-glukosmetabolismen vara associerade med olika sjukdomstillstånd, såsom lever- och muskelsjukdomar, samt med förhöjd risk för diabetes.

Farnesyltransferase är ett enzym som katalyserar en reaktion där ett farnesylgrupp (ett 15 kol långt lipid) kovalent binds till ett protein. Denna modifiering, kallad farnesylering, sker vanligtvis på ett cystein aminosyraresid i en speciell sekvens (CVIM) nära proteinkterminalen. Farnesyltransferasen spelar därför en viktig roll i proteinlokaliseringsprocesser, särskilt för proteiner som behöver transporteras till celldelningen eller cellmembranet. Ett exempel på ett sådant protein är Ras, ett onkogen som kan bli överaktiverat vid felaktig farnesylering och som är involverat i cancerutvecklingen.

Nukleosider är en organisk komponent i nukleotider, som är byggstenarna i nukleinsyror såsom DNA och RNA. En nukleosid bildas genom kondensation av en pentos (en fem carbonsugar) med en heterocyklisk bas, vanligtvis adenin, guanin, cytosin, uracil eller tymin. Nukleosider spelar därför en central roll i lagring och överföring av genetisk information inom celler.

Enligt IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) är en transferas ett enzym som katalyserar överföringen av en funktionell grupp (-X), till exempel en sockergrupp, från ett donormolekyl till ett acceptormolekyl i en kemisk reaktion. Transferaser kan delas in i olika klasser beroende på vilken typ av funktionell grupp som överförs. Exempel på transferaser är glycosyltransferaser (som överför sockergrupper), acetyltransferaser (som överför acetylgrupper) och metyltransferaser (som överför metylgrupper). Transferasers kodas ofta av gener som finns i kluster på kromosomen.

Organofosforföreningar är en grupp av kemiska föreningar som innehåller minst en kovalent bunden fosforatom till en eller flera kolatomer. Dessa föreningar kan vara naturligt förekommande, såsom i vissa enzymer och livsmedel, eller syntetiska, som i bekämpningsmedel, plaster och andra industriella produkter.

Syntetiska organofosforföreningar är kända för sin användning som insecticider, herbicider och nervgaser. De kan vara mycket giftiga för levande organismer, inklusive människor, och kan orsaka allvarliga skador på nervsystemet. Några exempel på välkända organofosforföreningar är parathion, malathion och sarin.

Uridin är ett nucleosid som består av en pyrimidinbas (uracil) kopplad till en ribosemolekyul. Det förekommer naturligt i RNA och har en viktig roll i cellers proteinsyntes och andra biokemiska processer. Uridin kan också ingå i vissa koenzymer och andra biomolekyler.

Guanosindifosfat (GDP) är ett nukleotidtriphosphat som består av en guanosinbase, en pentos (ribos) och tre fosfatgrupper. Det bildas när en fosfatgrupp tas bort från guanosintrifosfat (GTP) under en reaktion katalyserad av ett enzym. GDP är en viktig molekyl inom cellens energihushållning och signaltransduktion.

Cytidinmonofosfat-N-acetylneuraminic acid (CM-NA) er en slags molekyler som kaller for sialinsyrederivater. Disse er typisk funnet på ytterste ender av komplekse kulhydratmolekyler, også kalt glycoconjugater, som er bundet til cellevæggene hos levende organismer. CM-NA er en aktiv form av sialinsyre som spiller en viktig rolle i biologiske prosesser som cell-til-cell kommunikasjon og infeksjoner av patogener.

I medisinsk sammenheng kan forstyrrelser i sialinsyresyntesen og -metabolismen være forbundet med ulike sykdommer, som f.eks. neurologiske lidelser, infeksjoner og kreft.

Uridindifosfat (UDP) är ett nukleotidförening som består av en pentos sugar (ribos) kopplad till en fosfatgrupp och uracil, en av de kvävebaser som finns i RNA. UDP är en viktig byggsten i celldelningen, speciellt när det gäller syntesen av sockerarter och glykosylering av proteiner. Det spelar också en roll i nedbrytningen av glykogen till glukos 1-fosfat som en del av energiproduktionen i kroppen.

Molekylsekvensdata (molecular sequencing data) refererer til de resultater som bliver genereret når man secvenserer DNA, RNA eller proteiner i molekylærbiologien. Det innebærer typisk en række af nukleotider (i DNA- og RNA-sekvensering) eller aminosyrer (i proteinsekvensering), der repræsenterer den specifikke sekvens af gener, genetiske varianter eller andre molekyler i et biologisk prøve.

DNA-sekvensdata kan f.eks. anvendes til at identificere genetiske varianter, undersøge evolutionæ forhold og designe PCR-primerer. RNA-sekvensdata kan bruges til at studere genudtryk, splicevarianter og andre transkriptionelle reguleringsmekanismer. Proteinsekvensdata er vigtige for at forstå proteinstruktur, funktion og interaktioner.

Molekylsekvensdata kan genereres ved hjælp af forskellige metoder, herunder Sanger-sekvensering, pyrosekvensering (454), ion torrent-teknikker, single molecule real-time (SMRT) sekvensering og nanopore-sekvensering. Hver metode har sine styrker og svagheder, og valget af metode afhænger ofte af forskningens specifikke behov og ønskede udbytte.

I medicinen refererer kinetik specifikt till läkemedelskinetik, som är studiet av de matematiska modellerna som beskriver hur ett läkemedel distribueras, metaboliseras och utsöndras i en levande organism. Det finns fyra huvudsakliga faser av läkemedelskinetik:

1. Absorption (absorption): Hur snabbt och effektivt absorberas läkemedlet från gastrointestinal tract till blodomloppet.
2. Distribution (distribution): Hur snabbt och i vilken utsträckning fördelar sig läkemedlet i olika kroppsvävnader och vätskor.
3. Metabolism (metabolism): Hur snabbt och hur påverkar läkemedlets kemiska struktur i kroppen, ofta genom enzymer i levern.
4. Elimination (elimination): Hur snabbt och effektivt utsöndras läkemedlet från kroppen, vanligtvis via urin eller avföring.

Läkemedelskinetiken kan påverkas av många faktorer, inklusive patientens ålder, kön, genetiska variationer, lever- och njurfunktion samt andra läkemedel som patienten tar.

Tiaminpyrofosfat (TPP) är ett koenzym som spelar en viktig roll i cellens energiproduktion. Det bildas genom fosforylering av vitamin B1, också känt som tiamin, och är involverat i den enzymkomplex som katalyserar oxidativa decarboxyleringar av α-ketosyror under cellandningen. TPP hjälper till att aktivera karboxylgruppen i substraten genom att bilda en covalent bindning med dem, vilket sänker den aktiveringsenergi som krävs för decarboxyleringen. På detta sätt bidrar TPP till en effektivare energiomsättning i cellen.

RNA editing refererer til den proces, hvor der foretages ændringer i det originale RNA-sekvens, som er blevet transkriberet fra et DNA-template. Disse ændringer kan inkludere indsættelse, udskiftning eller fjernelse af nukleotider, der resulterer i en forandret proteinsyntese. RNA-editing er særligt almindelig hos visse arter, herunder planter og insekter, men findes også hos pattedyr. Det spiller en vigtig rolle ved reguleringen af genudtryk og proteinsyntese, samt tilpasning til forskellige cellulære behov og respons på ændringer i miljøet.

'Uracilnukleotider' är en typ av nukleotider som innehåller den nucleobasen uracil. Nukleotider är byggstenarna i DNA och RNA, där varje nukleotid består av en nucleobas (uracil, adenin, timin, guanin eller cytosin), en sockerdel (ribosa eller deoxyribosa) och en fosfatgrupp. I DNA-molekyler är uracil inte en vanlig förekommande nucleobas, utan det är thymin som istället ingår i par med adenin. Emellertid spelar uracil en viktig roll i RNA, där det istället är i par med adenin.

Uracilnukleotider kan också ingå i andra biomolekyler och ha olika funktioner inom cellen. Till exempel spelar de en viktig roll i DNA-reparationsprocesser, där uracilnukleotider som har bildats genom spontan eller skadad desaminering av cytosin kan leda till att felaktiga basparningar uppstår. Dessa felaktiga basparningar kan sedan korrigeras genom processen som kallas för basexcisionsreparation.

Sesquiterpeners är en klass av organiska föreningar som består av 15 kolatomer. De bildas genom att tre isoprena, var och en med fem kolatomer, kombineras. Sesquiterpenerna har en mångfald strukturer och förekommer naturligt i växter, djur och mikroorganismer. De kan ha ett brett spektrum av biologiska aktiviteter, inklusive antiinflammatoriska, antibakteriella och cytotoxiska effekter. Exempel på sesquiterpenoider är artemisinin, som används för behandling av malaria, och β-caryophyllen, som förekommer i kryddor som rosmarin och oregano.

"Difosfater" er en generell betegnelse for kjemiske forbindelser som inneholder to fosfatgrupper bundet sammen med ein einast fettsyre. I biokjemisk sammenhenging refererer difosfat oftest til adenosindifosfat (ADP) og guanosindifosfat (GDP), som er betydende molekyler i cellulær energiproduksjon og -bruk. Disse molekylenes energirelaterte reaksjoner involverer konvertering mellom difosfat og triphosphat (ATP og GTP) med overgang av ein fosfatgruppe, som frigir eller absorberer energi i cellen.

Terpenes are a large and diverse class of organic compounds produced by a variety of plants, including conifers, citrus fruits, and cannabis. They are responsible for the distinctive aromas and flavors found in these plants. Terpenes are composed of isoprene units and can vary in structure and size, resulting in a wide range of chemical and biological properties.

In the context of cannabis, terpenes are produced in the resin glands of the plant and contribute to the entourage effect, which is the synergistic interaction between various compounds found in cannabis, including cannabinoids and terpenes. Different terpenes have different effects on the body and can influence the overall medicinal profile of a particular cannabis strain. For example, some terpenes may have anti-inflammatory, analgesic, or anxiety-reducing properties.

It's important to note that while terpenes are believed to have potential therapeutic benefits, more research is needed to fully understand their mechanisms of action and potential medical uses.

'Micrococcus luteus' är en grampositiv, kulformad (kocker) bakterie som normalt förekommer på huden och slemhinnor hos människor och djur. Den är en del av den normala bakteriefloran och är vanligen ofarlig för värden. Bakterien kan dock i sällsynta fall orsaka infektioner, framför allt hos immunsupprimierade individer eller vid inträngande i djupare vävnader.

Micrococcus luteus är en aerob bakterie, vilket betyder att den behöver syre för att kunna gro och föröka sig. Den kan bilda yttre skyddande strukturer som så kallade exotoxiner och endotoxiner, men de är vanligtvis ofarliga för människor med normalt fungerande immunförsvar.

Det är värt att notera att Micrococcus luteus kan vara användbar inom vetenskapen som en modellorganism för studier av bakteriell fysiologi, genetik och biokemi.

Pyrimidinnukleotider är en typ av nukleotider som innehåller en pyrimidinbas. Pyrimidiner är en klass av aromatiska organiska föreningar som består av två kolatomringar som är kondenserade med varandra och innehåller tre kväveatomer. De tre typerna av pyrimidinnukleotider som finns i DNA och RNA är cytidin (C), timidin (T eller U) och tymin (T). Dessa nukleotider spelar en viktig roll i cellers replikation, transkription och translation.

Inosine difosfate (Inosin diphosphate, IPP) är en nukleotid som deltar i cellens energimetabolism och signaltransduktion. Det bildas genom fosforylering av inosin monofosfat (IMP) med hjälp av enzymet IMP kinas. IPP kan sedan konverteras till adenosin difosfat (ADP) av enzymet myokinash som en del av cellens energiproduktion. IPP är också en prekursor för syntesen av andra nukleotider och har visats ha en roll i regleringen av celldelning, apoptos och inflammation.