Cercozoa er en stor og divers gruppe encellede eukaryote organismer som inkluderer mange forskjellige arter, inklusive amøba-lignende former, flagellater (organismer med ett eller flere slags hårliknende strukturer kjent som flageller), og encellede organismer som lever parasittisk eller symbiotisk på andre organismer. Cercozoa inneholder to større klader, Filosa og Rhizaria, og disse inkluderer flere tusen arter.

Cercozoa-organismer er karakteristiske fordi de har en unik type struktur kjent som einophlagellum, som består av ett flagell med fire til seks lameller (tunn, plattformagasiner). Disse organismer lever oftest i vann eller fuktige omgivelser, og de kan være fritsvømmende eller fastsatt til underlaget. De kan leve av å spise andre encellede organismer, bakterier, eller organisk stoff som de trekker inn gjennom en slikstruktur kalt cytostom. Nogle cercozoa-arter lever parasittisk på andre organismer, og noen kan være skadelige for planter eller dyr.

Cercozoa har blitt identifisert gjennom molekylærfilogenetiske studier, som undersøker relasjonene mellom levende organismer basert på sekvensdata fra gener. Disse studier viser at Cercozoa er en særskilt linje i det eukaryote stamtreet og at den inkluderer mange forskjellige arter som ikke hadde blitt identifisert før.

Eukaryota, även känt som Eukarya, är ett domän inom systematisk biologi som inkluderar alla levande organismer vars celler har en definierad cellkärna och andra komplexa organeller. Detta innefattar djur, växter, svampar, protister (en heterogen grupp encelliga organismer) och flera andra grupper.

I kontrast till Eukaryota står prokaryoter, som inkluderar bakterier och arkéer, vilka saknar en definierad cellkärna och andra komplexa organeller.

Det är värt att notera att termen 'eukaryot' används för att beskriva både encelliga och flercelliga organismer som tillhör domänen Eukaryota, medan termerna 'djur', 'växter', 'svampar' och 'protister' vanligtvis används för att beskriva specifika undergrupper inom Eukaryota.

Haplosporidia är ett taxon av encelliga parasiter som orsakar sjukdomar hos både ryggradsdjur och evertebrater, särskilt bland musslor och kräftdjur. Dessa organismers celler har en unik struktur som kallas en haplosporosom, vilket är ett sorts hölje runt deras mitokondrier. Haplosporidier sprider sig ofta genom värddjurens vattenföroreningar och kan orsaka allvarliga skador på populationer av värddjur, särskilt inom akvakulturen. Exempel på sjukdomar som orsakas av Haplosporidia är brown ring disease hos musslor och MSX-sjukan hos ostron.

RNA står för Ribonukleinsyra och är ett molekylärt ämne som liknar DNA men har några viktiga skillnader i sin kemiska struktur. Det finns olika typer av RNA, inklusive ribosomalt RNA (rRNA).

Ribosomer är komplexa maskinerier som består av proteiner och RNA-molekyler och spelar en viktig roll i syntesen av protein. De två huvuddelarna av ett ribosom kallas för stora och små subenheter. I den stora subenheten finns det tre stycken rRNA-molekyler: 5S, 5.8S och 28S. I den lilla subenheten finns det en rRNA-molekyl som kallas 18S rRNA.

18S rRNA är en strukturell komponent i den lilla ribosomala subenheten och hjälper till att bilda den aktiva plats där aminosyror kopplas samman för att bilda proteiner under processen kallad translation. 18S rRNA är en viktig molekyl i cellens proteinproduktion och finns i alla levande celler.

Eukaryota cells, eller eukaryotceller, är de celler som utgör alla levande organismer utom bakterier, arkéer och vissa encelliga organismer som till exempel batterier. De kännetecknas av att de innehåller en definierad cellkärna, bounded by a nuclear membrane, och andra organeller som är omgivna av egna membran. Exempel på eukaryota celler är celler hos djur, växter, svampar och protister.

"Fylogenetik" (förekommande stavning inom biologi på engelska: 'phylogenetics') är ett område inom biologin som handlar om att studera evolutionära relationer mellan olika arter eller andra taxonomiska grupper. Genom att jämföra morfologiska, genetiska och/eller fossila data kan forskare konstruera ett fylogenetiskt träd som visar hur olika arter tros ha utvecklats från gemensamma förfäder över tid.

Termen "fylogen" (på engelska: 'phylogeny') refererar till den evolutionära historien och relationerna mellan olika taxa, det vill säga en grupp organismer som är relaterade genom gemensam härstamning. En fylogeni kan representeras av ett diagramatiskt träd där varje gren representerar en klad, det vill säga en monofyletisk grupp med alla dess ättlingar inkluderat och utan inslag av äldre gemensamma förfäder.

I medicinsk kontext kan fylogenetiska analyser användas för att studera evolutionära relationer mellan patogena mikroorganismer, vilket kan vara viktigt för att förstå hur sjukdomar sprids och utvecklas, och hur vacciner och andra behandlingsmetoder kan utformas.

Ribosom-DNA (rDNA) refererar till de specifika sekvenserna av DNA som kodar för ribosomalt RNA (rRNA), ett viktigt komponent i ribosomer, de subcellulära partiklar där protein syntesis sker i cellen. Ribosomer är nödvändiga för att bygga upp proteiner genom att översätta informationen från mRNA till aminosyror som bildar en polypeptidkedja.

I eukaryota celler, som exempelvis djur- och växtceller, finns rDNA-sekvenserna i kromosomernas nucleolus, ett område inne i cellkärnan där ribosomer tillverkas. Prokaryota celler, såsom bakterier, har också rDNA-sekvenser som ofta finns i plasmider eller andra extrakromosomala DNA-molekyler.

rRNA utgör en stor del av ribosomen och är känd för sin strukturella stabilitet och höga konservation mellan olika arter. Dessa egenskaper gör rDNA till ett användbart verktyg inom molekylärbiologi, exempelvis vid fylogenetisk analys och identifiering av okända organismer genom sekvensering av rDNA-sekvenser.