Une dégradation procédé par lequel correctement plié protéines sont sélectivement banni du Endoplasmic Reticulum et dans le cytoplasme. Les protéines manquante Ubiquitinated et sont ensuite dégradés par le protéasome.
Un système de cisternae dans le cytoplasme des cellules. Le réticulum endoplasmique est continue avec la membrane plasmatique membrane) ou de membrane externe de l ’ enveloppe nucléaire. Si l'emballage surfaces du réticulum endoplasmique muqueuses sont recouverts par les ribosomes, le réticulum endoplasmique serait rough-surfaced (Reticulum Endoplasmique brutalement) ; sinon est réputé smooth-surfaced (Reticulum Endoplasmique doux). (King & Stansfield, Un Dictionary of Genetics, 4ème éditeur)
Un grand multisubunit complexe qui joue un rôle important dans la dégradation de la plupart des protéines et cytosolique nucléaire dans les cellules eucaryotes. Il contient un 700-kDa sub-complex catalytique et deux 700-kDa sub-complexes réglementaires. Le complexe digère Ubiquitinated protéines et protéine activation antizyme ornithine décarboxylase.
Récepteurs de surface pour Autocrine motilité facteur, qui est la forme de déficit en glucose-6-phosphate isomerase sécrété. Le récepteur a une rédaction pour qu'il partage des similitudes avec structurelles G-Protein-Coupled récepteurs et fonctionne comme une protéine ubiquitin ligase quand intériorisé.
Un acide 76-amino hautement conservée peptide universellement trouvé dans les cellules eucaryotes qui fonctionne comme un marqueur pour protéines intracellulaires TRANSPORTER and degradation. Ubiquitine est activé par une série de compliqué étapes et forme une caution pour isopeptide lysine résidu de protéines spécifiques dans la cellule, ces "Ubiquitinated" protéines peuvent être reconnu et dégradé par proteosomes ou être transportée à certains compartiments au sein de la cellule.
Une classe d'enzymes, qui interagissent avec les substrats des enzymes et protéine UBIQUITIN-CONJUGATING ubiquitination-specific. Chaque membre de cette enzyme a sa propre groupe spécificité pour un substrat et ubiquitin-conjugating enzyme. Ubiquitin-protein Ligases existent comme tous les deux protéines protéines Monomériques multiprotein complexes.
L'acte de ligature UBIQUITINS à PROTEINS ubiquitin-protein ligase pour former des complexes d'étiqueter protéines pour le transport au Proteasome Endopeptidase complexe où la protéolyse survient.
De la formation de la structure des protéines tertiaire.
Les hydrolases glycoside qui catalysent l ’ hydrolyse d ’ alpha ou bêta liée du mannose.
Décolleté de protéines en petits peptides et acides aminés soit par des protéases ou non-enzymatically (par exemple, l ’ hydrolyse). Cela n'inclut pas Protein Processing, Post-Translational.
La classe des enzymes qui forment un lien avec thioester UBIQUITIN avec l'aide de UBIQUITIN-ACTIVATING d'enzymes... ils transfèrent ubiquitin de la lysine d'un substrat de protéine avec l'aide de UBIQUITIN-PROTEIN Ligases.
Un groupe d'enzymes hydrolyse catalyser la réaction d'ATP. L'hydrolyse est habituellement de pair avec une autre fonction comme transporter Ca (2 +) sur une membrane. Ces enzymes peut dépendre de Ca (2 +) Mg (2 +), les anions, H +, ou l'ADN.
Une famille de protéines cellulaire qui interviennent dans la bonne rassemblement ou démontage de non glycosylés et leurs ligands associés. Même s'ils participer au processus d'assemblage, chaperons ne sont ni moléculaire composantes de la dernière structures.
Un oligomer formées par les liens entre ces répétitif propeptide C-terminal glycine d'une molécule UBIQUITIN isopeptide via une attachée à un lysine résidu sur une seconde ubiquitin molécule. C'est structurellement différent de UBIQUITIN C, qui est une protéine unique contenant une tandemly liguées ubiquitin peptide séquence.
Trouvé dans une une lectine Endoplasmic Reticulum muqueuses qui se lie aux spécifique oligosaccharides trouvé sur N-glycosylation nouvellement synthétisé en protéines. Des protéines peut jouer rôle dans COMME manquante ou la conservation et la dégradation de protéines dans le réticulum endoplasmique.
Espèce de protéines Saccharomyces cerevisiae. La fonction de protéines spécifiques de cet organisme font l 'objet d' un intérêt scientifique et ont été utilisés pour obtenir compréhension basique du fonctionnement protéines semblables à fortes eukaryotes.
Le produit chimique ou biochimiques plus de glucide glycosyl groupes ou autres produits chimiques toxiques, surtout les peptides ou des protéines. Glycosyl transférases sont utilisés dans cette réaction biochimique.
L ’ amidohydrolase qui élimine un intact asparagine-linked oligosaccharide chaînes de glycoprotéines. La présence de plus de deux Amino-Acid les résidus dans le substrat d 'activité. Cette enzyme était précédemment énumérées comme CE 3.2.2.18.
Une réponse cellulaire insultes pour l ’ environnement qui provoque des perturbations en protéines plié et / ou accumulation de proteines dans les defectively plié Endoplasmic Reticulum. Il se compose d'un groupe de cascades de réglementation qui jaillissent en réponse à une altération des taux de calcium et / ou la redox état du réticulum endoplasmique. Activation persistante de la protéine Unfolded réponse mène à l'induction d'apoptose.
Un hexose fermentable monosaccharide ou de glucose et à isomère Mana, la cendre fraxinus ornus et autres plantes. (De Grant & Hackh est Chemical Dictionary, 5ème e & Random House Unabridged Dictionary, 2d éditeur)
Le niveau de structure protéique dans lesquels les associations de structures (protéine secondaire hélice alpha, bêta draps, boucle régions, et motifs) ensemble pour former plié formes appelé domaines : Disulfures des ponts entre cysteines dans deux différentes parties de la chaine polypeptidique avec autres interactions entre les chaînes jouer un rôle dans la formation et stabilisation des protéines habituellement tertiaire. Petite structure consistent en un seul domaine, mais plus grande protéines peut contenir un certain nombre de domaines liés par les segments de chaine polypeptidique peu structure secondaire habituel.
Une espèce du genre Saccharomyces, famille Saccharomycetaceae, ordre Saccharomycetales, connu comme "boulanger" ou "Brewer" est la levure. La forme est utilisée comme complément alimentaire.
Membre de la glycoprotéine plasmatiques Serpin superfamille qui inhibe l ’ élastase trypsine ; neutropénie ; et autres protéolytique des enzymes.
Protéines présentes dans les membranes cellulaires incluant les membranes intracellulaires et ils sont composés de deux types, périphérique et protéines intégrale. Ils comprennent plus Membrane-Associated enzymes, antigénique protéines, des protéines de transport, et une hormone, de drogue et les récepteurs une lectine.
Le train de déménager d'un cellulaire protéines compartiment extracellulaire (y compris) à une autre par différents mécanismes de tri et transport tels que des clôtures, des protéines de transport et vésiculaire translocation, transport.
Composés protein-carbohydrate conjugué mucoïde Mucines, y compris et amyloïde glycoprotéines.
Une lignée cellulaire générée par les cellules rénales embryonnaires humaines qui ont été changé par adénovirus humaine de type 5.
Les liquides intracellulaires du cytoplasme après le retrait de organites et autres composantes cytoplasmique insolubles.
Aucun de diverses méthodes de dosage enzymatiques catalysé modifications post-translationnelles de peptides ou PROTEINS dans la cellule d'origine. Ces modifications concernent carboxylation ; hydroxylation ; acétylation ; phosphorylation ; méthylation ; glycosylation ; Ubiquitination, oxydation ; protéolyse ; et crosslinking et entraîner des modifications de poids moléculaire et analyse électrophorétique mobilité.
Les substances non plus, ou se lient aux protéines exogènes d ’ irradiation précurseur des protéines, enzymes, ou allié composés. Liaison aux protéines spécifiques sont souvent utilisés comme des mesures de diagnostic évaluations.
Protéines qui contrôlent la cellule Division synchronise. Cette famille de protéines inclut un large choix de classes, y compris CYCLIN-DEPENDENT kinases activées par des kinases cyclines et Phosphoprotein Phosphatases ainsi que leurs substrats putatif tels que des protéines chromatin-associated CYTOSKELETAL PROTEINS, et la transcription FACTEURS.
Aucun détectable et héréditaire changement dans le matériel génétique qui peut provoquer un changement dans le génotype et qui est transmis à cellules filles et pour les générations futures.
Cysteine Endopeptidases qui ont une impliquées dans le processus catalytique. Ce groupe d ’ enzymes est DE LA SEROTONINE cystéine protéase tels que Cystatines et SULFHYDRYL réactifs.
Établi des cultures de cellules qui ont le potentiel de propager indéfiniment.
Polypeptides linéaire qui se produisent par synthèse sur ribosomes et peuvent également être modifié, crosslinked, fendu ou assemblées de protéines complexe avec plusieurs sous-unités. La certaine séquence d'AMINO ACIDS détermine la forme prendra ce polypeptide, COMME pendant des protéines, et la fonction de la protéine.
Substances inhibant l ’ action de la fonction protéolytique ou le protéasome.
Une chaîne qui régule la sécrétion chlorure dans de nombreux tissus exocrine. Anomalies dans le gène Cftr ont entraîné la mucoviscidose. (Bourdonnement Genet 1994 ; 93 (4) : 364-8)
Acide aminé, spécifique des descriptions de glucides, ou les séquences nucléotides apparues dans la littérature et / ou se déposent dans et maintenu par bases de données tels que la banque de gènes GenBank, européen (EMBL laboratoire de biologie moléculaire), la Fondation de Recherche Biomedical (NBRF) ou une autre séquence référentiels.
Polyosides sont des polysaccharides complexes et hautement branchés, composés principalement de résidus de D-glucose, qui sont une partie importante des glycoprotéines et glycolipides dans les membranes cellulaires.
Une classe de MOLECULAR CHAPERONES trouvé sur les deux des procaryotes et dans plusieurs compartiments de les cellules eucaryotes. Ces protéines peuvent interagir avec polypeptides pendant une variété de processus d'assemblage de manière à éviter la formation de structures non fonctionnel.
Les protéines de transport qui transportent spécifiquement des substances dans le sang ou à travers la membrane cellulaire.
L'ordre des acides aminés comme ils ont lieu dans une chaine polypeptidique, appelle ça le principal structure des protéines. C'est un enjeu capital pour déterminer leur structure des protéines.
Protéines qui partagent la caractéristique commune de la liaison de glucides. Des anticorps (protéines carbohydrate-metabolizing d'enzymes... et se lient à d ’ hydrates de carbone), cependant ils sont pas considérées comme lectine. Lectines Végétales sont carbohydrate-binding des protéines qui ont été principalement identifié par leur activité hemagglutinating (HEMAGGLUTININS). Toutefois, une variété de lectine survenir chez animal où ils servent à diverses fonctions hydrate gamme de reconnaissance.
Fréquemment observés composantes structurelles de protéines formé par simple associations des structures secondaire fréquemment observés. Un composé d 'une structure peut être conservé séquence qui peut être représenté par un CONSENSUS séquence.
Représentations théorique qui simulent le comportement ou de l ’ activité des processus biologiques ou des maladies. Pour les animaux vivants dans des modèles de maladie, la maladie des modèles, LES ESPÈCES est disponible. Modèle biologique l'usage d'équations, ordinateurs et autres équipements électroniques.
Immunologic méthode utilisée pour la détection ou quantifying substances immunoréactifs. Identification de la substance avant l'immobilisant par explosion sur une membrane puis taguer ça avec étiqueté anticorps.
Protéines dans le noyau d'une cellule. Ne pas confondre avec NUCLEOPROTEINS qui sont des protéines conjugué avec les acides nucléiques, qui ne sont pas nécessairement présent dans le noyau.
La première cellule maligne continuellement cultivé humaine dérivée de la ligne, carcinome cervical d'Henrietta Lacks. Ces cellules sont utilisées pour la culture et Antitumor VIRUS contrôle anti-drogue dosages.
Une enzyme qui catalyse l ’ hydrolyse de terminal, non-reducing alpha-D-mannose alpha-D-mannosides. Les résidus dans l ’ enzyme joue un rôle dans le traitement des N-glycans nouvellement formé et en dégradation mûr glycoprotéines. Il y a de multiples isoformes de alpha-mannosidase, chaque histoire ayant son propre localisation et cellulaires spécifiques pH optimale. Défauts dans la forme de l ’ enzyme lysosomale entraîne une accumulation de métabolites mannoside ALPHA-MANNOSIDOSIS intermédiaire et la maladie.
Systèmes de la fonction enzymes catalysant séquentiellement par des réactions consécutives métaboliques liées par des intermédiaires. Elles peuvent entraîner simplement un transfert de molécules d'eau ou les atomes d'hydrogène et peut être associée à de grandes structures supramolecular tels que mitochondries ou les ribosomes.
Un carboxypeptidase qui catalyse la libération d'un acide aminé propeptide C-terminal spécificité avec un large. Elle joue un rôle dans les lysosomes en protégeant BETA-GALACTOSIDASE et neuraminidase de dégradation. Avant, c'était classé comme CE 3.4.12.1 et CE 3.4.21.13.
Une famille de protéines Heat-Shock 70 acides aminés contenant un consensus séquence connu comme le J domaine. Le domaine de J HSP40 chaleur choc protéines interagit avec HSP70 Heat-Shock PROTEINS. HSP40 Heat-Shock protéines jouer un rôle dans la régulation du adenosine Triphosphatases activité de HSP70 Heat-Shock protéines.
Composants d'une cellule produit par divers séparation techniques, cependant ils perturbent l'anatomie d'une cellule délicate, préserver la structure et la physiologie de son fonctionnement électeurs pour biochimiques et analyse ultrastructurale. (De Alberts et al., biologie moléculaire du 2d Cell, Ed, p163)
Une famille de protéines structurally-related à ubiquitine. Ubiquitines et protéines ubiquitin-like participer à diverses fonctions cellulaires, tels que la dégradation de protéine et Heat-Shock RÉPONSE, conjuguée aux autres protéines.

L'endoplasmique réticulum-associé à la dégradation (ERAD) est un processus cellulaire qui vise à identifier et à dégrader les protéines mal repliées ou anormales dans l'endoplasmique réticulum (ER). Il s'agit d'une voie de contrôle de la qualité des protéines qui aide à maintenir la fonction cellulaire normale en éliminant les protéines endommagées ou incorrectement pliées.

Le processus ERAD implique plusieurs étapes, y compris la reconnaissance et la rétrotranslocation des protéines ER mal repliées dans le cytoplasme cellulaire, leur ubiquitination et enfin leur dégradation par le protéasome 26S. Ce processus est essentiel pour prévenir l'accumulation de protéines toxiques dans l'ER, ce qui peut entraîner un stress ER et déclencher la réponse au stress de l'endoplasmique réticulum (RESP).

Les dysfonctionnements de l'ERAD ont été associés à plusieurs maladies humaines, y compris les maladies neurodégénératives, le diabète et certains types de cancer. Par conséquent, une meilleure compréhension des mécanismes sous-jacents de l'ERAD peut fournir des cibles thérapeutiques pour le traitement de ces maladies.

Le réticulum endoplasmique (RE) est un organite membraneux complexe et continu présent dans les cellules eucaryotes. Il joue un rôle crucial dans la synthèse, le transport et le métabolisme des protéines et des lipides. Le RE se compose de deux parties distinctes mais interconnectées : le réticulum endoplasmique rugueux (RER) et le réticulum endoplasmique lisse (REL).

Le RER est recouvert de ribosomes sur sa surface extérieure, ce qui lui donne un aspect granuleux ou "rugueux". Ces ribosomes sont responsables de la synthèse des protéines. Après leur traduction, les protéines sont transloquées dans le lumen du RE où elles peuvent être correctement pliées et modifiées par des chaperons moléculaires et des enzymes spécifiques. Le RER est également impliqué dans le transport des protéines vers d'autres compartiments cellulaires via les vésicules qui se forment à partir de sa membrane.

Le REL, quant à lui, ne possède pas de ribosomes à sa surface et a donc un aspect "lisse". Il est responsable du métabolisme des lipides, notamment de la synthèse des phospholipides et des stéroïdes. De plus, le REL contient des enzymes détoxifiantes qui neutralisent divers composés toxiques, tels que les médicaments et les polluants, en les conjuguant à des molécules telles que le glutathion avant leur exportation hors de la cellule.

En résumé, le réticulum endoplasmique est un organite essentiel à la synthèse, au pliage, au transport et au métabolisme des protéines et des lipides, ainsi qu'à la détoxification cellulaire.

Le complexe protéasome endopeptidase est une structure cellulaire intricatement organisée qui joue un rôle crucial dans la dégradation des protéines intracellulaires. Il s'agit d'un système multiprotéique composé de plusieurs sous-unités protéiques, dont quatre sont des endopeptidases à sérine, trois sont des endopeptidases à cystéine et deux sont des endopeptidases à métallo-protéase. Ces enzymes travaillent ensemble pour dégrader les protéines mal repliées, endommagées ou non fonctionnelles en petits peptides et acides aminés. Ce processus est essentiel pour réguler la concentration des protéines intracellulaires, éliminer les protéines anormales et participer à la signalisation cellulaire. Le complexe protéasome endopeptidase est également impliqué dans la présentation de l'antigène aux cellules immunitaires pour initier une réponse immunitaire spécifique.

Les récepteurs du facteur d'motilité autocrine (AMFR) font référence à un type de protéines situées à la surface des cellules qui se lient au facteur d'motilité autocrine (AMF), une protéine sécrétée par les mêmes cellules. Ce processus de liaison déclenche une série de réactions chimiques à l'intérieur de la cellule, entraînant des changements dans son comportement et sa fonction.

Dans le contexte médical, on pense que l'AMF et ses récepteurs jouent un rôle important dans la régulation de la motilité cellulaire, c'est-à-dire le mouvement des cellules à l'intérieur du tissu. Des études ont montré que l'AMF peut stimuler la migration et l'invasion des cellules cancéreuses, ce qui suggère qu'il pourrait contribuer au développement et à la progression de divers types de cancer.

Les récepteurs AMFR sont souvent surexprimés dans les tumeurs malignes, ce qui peut entraîner une augmentation de l'activité de l'AMF et favoriser la croissance et la propagation des cellules cancéreuses. Par conséquent, l'inhibition des récepteurs AMFR est considérée comme une stratégie thérapeutique potentielle pour le traitement du cancer.

Il convient de noter que les connaissances sur les récepteurs AMFR et leur rôle dans la maladie sont encore en cours d'élucidation, et des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre pleinement leurs fonctions et mécanismes.

L'ubiquitine est une petite protéine hautement conservée qui joue un rôle crucial dans la régulation des processus cellulaires tels que la dégradation des protéines, l'endocytose, le trafic vésiculaire, la réparation de l'ADN et la réponse au stress. Elle est impliquée dans le marquage des protéines pour la dégradation par le protéasome, un complexe enzymatique qui dégrade les protéines endommagées ou mal repliées. Ce processus, appelé ubiquitination, consiste à attacher une chaîne de plusieurs molécules d'ubiquitine à la protéine cible via des liaisons isopeptidiques.

L'ubiquitine est donc essentielle au maintien de la stabilité et de la fonctionnalité du protéome cellulaire, ainsi qu'à la réponse aux stimuli internes et externes. Des dysfonctionnements dans le système ubiquitine-protéasome ont été associés à plusieurs maladies, y compris les maladies neurodégénératives, le cancer et l'inflammation.

Les ubiquitine-protéine ligases sont des enzymes qui jouent un rôle crucial dans le processus de dégradation des protéines. Elles sont responsables de l'ajout d'une molécule d'ubiquitine à une protéine cible, ce qui marque cette protéine pour être dégradée par le protéasome, un complexe multiprotéique présent dans la cellule qui dégrade les protéines.

Le processus de marquage des protéines par l'ubiquitine est appelé ubiquitination et se produit en trois étapes : activation, conjugaison et ligature. Les ubiquitine-protéine ligases interviennent dans la dernière étape du processus, où elles catalysent la formation d'un lien covalent entre l'ubiquitine et la protéine cible.

Les ubiquitine-protéine ligases sont une famille importante de protéines qui comprennent plusieurs centaines de membres différents. Elles peuvent être classées en fonction du nombre d'ubiquitine qu'elles ajoutent à leur protéine cible. Les ubiquitine-protéine ligases mono- et multi-ubiquitinantes sont les deux principales catégories.

Les ubiquitine-protéine ligases jouent un rôle important dans la régulation de nombreux processus cellulaires, tels que la réponse au stress, la division cellulaire, l'apoptose et la signalisation cellulaire. Des anomalies dans le fonctionnement des ubiquitine-protéine ligases ont été associées à plusieurs maladies, telles que les maladies neurodégénératives, le cancer et les maladies inflammatoires.

L'ubiquitination est un processus post-traductionnel dans lequel une protéine est marquée pour la dégradation en y attachant une chaîne ubiquitine, une petite protéine hautement conservée. Ce processus se produit en trois étapes: activation, conjugaison et liaison. Dans la première étape, l'ubiquitine est activée par une E1, une ubiquitine-activating enzyme. Ensuite, l'ubiquitine est transférée à une E2, une ubiquitin-conjugating enzyme. Enfin, une E3, une ubiquitin ligase enzyme, facilite le transfert de l'ubiquitine de l'E2 à la protéine cible. L'ubiquitination peut également réguler d'autres processus cellulaires tels que l'endocytose, la réparation de l'ADN et la transcription.

Le marquage ubiquitine d'une proténe peut entraîner sa dégradation par le protéasome, une grande protéase située dans le noyau et le cytoplasme des cellules eucaryotes. Le processus de dégradation commence lorsque plusieurs molécules d'ubiquitine sont liées à la protéine cible pour former une chaîne polyubiquitine. Cette chaîne agit comme un signal pour le protéasome, qui reconnaît et clive la protéine en petits peptides qui seront ensuite dégradés en acides aminés libres.

L'ubiquitination est un processus dynamique et réversible, car les protéines peuvent être déubiquitinées par des enzymes spécifiques appelées des déubiquitinases (DUBs). Ce processus permet de réguler la stabilité et l'activité des protéines.

Des anomalies dans le processus d'ubiquitination ont été associées à plusieurs maladies, notamment les maladies neurodégénératives, le cancer et les maladies inflammatoires.

Le repliement des protéines, également connu sous le nom d'enroulement ou de pliage des protéines, est un processus physico-chimique au cours duquel une chaîne polypeptidique fraîchement synthétisée adopte sa structure tridimensionnelle native et fonctionnellement active. Cette structure finale est déterminée par la séquence d'acides aminés spécifique de chaque protéine et est maintenue par des liaisons covalentes, ioniques et hydrogènes ainsi que par des interactions hydrophobes.

Le repliement correct des protéines est crucial pour leur activité biologique appropriée. Des erreurs dans ce processus peuvent entraîner la formation de structures anormales ou agrégées, comme les fibrilles amyloïdes, qui sont associées à diverses maladies neurodégénératives telles que la maladie d'Alzheimer et la maladie de Parkinson.

Le processus de repliement des protéines se produit spontanément dans la plupart des cas, bien qu'il puisse être assisté par certaines molécules appelées chaperons qui aident à prévenir les interactions inappropriées entre différentes parties de la chaîne polypeptidique pendant le repliement. Cependant, dans certains cas complexes, le repliement des protéines peut être coopératif et dépendre d'une série de réactions chimiques et physiques qui se produisent simultanément à plusieurs endroits le long de la chaîne polypeptidique.

Les mannosidases sont des enzymes qui coupent et retirent des résidus de sucre spécifiques, appelés mannoses, des chaînes de glucides complexes. Ces enzymes jouent un rôle crucial dans le processus de dégradation des glycoprotéines et des glycolipides, qui sont des molécules essentielles à diverses fonctions cellulaires.

Il existe deux principaux types de mannosidases : alpha-mannosidases et beta-mannosidases. Les alpha-mannosidases éliminent les résidus d'alpha-mannose, tandis que les beta-mannosidases enlèvent les résidus de beta-mannose. Ces enzymes sont importantes pour la maturation des protéines et la régulation du trafic intracellulaire des protéines.

Les défauts dans le fonctionnement des mannosidases peuvent entraîner diverses affections, y compris certaines formes de maladies lysosomales telles que la maladie de mannosidosis et la mucolipidose de type I. Ces maladies sont caractérisées par un stockage anormal de glycoprotéines et de glycolipides dans les lysosomes, entraînant une variété de symptômes, notamment des retards de développement, des problèmes neurologiques, des anomalies squelettiques et des infections récurrentes.

La protéolyse est le processus biologique par lequel des protéines sont décomposées en petits peptides ou en acides aminés individuels grâce à l'action d'enzymes appelées protéases. Ce processus est crucial pour de nombreuses fonctions cellulaires, telles que la régulation de la signalisation cellulaire, la réponse immunitaire et le recyclage des protéines endommagées ou inutilisées. Cependant, un déséquilibre dans la protéolyse peut également contribuer à diverses maladies, y compris les maladies neurodégénératives et le cancer.

Les enzymes conjuguant l'ubiquitine, également connues sous le nom d'E2 ou UBC (Ubiquitin Conjugating) enzymes, sont une famille d'enzymes qui jouent un rôle crucial dans le processus de modification post-traductionnelle des protéines appelé ubiquitination. Ce processus consiste à attacher une molécule d'ubiquitine, un petit peptide hautement conservé, à une chaîne polymérique ou monomérique sur une lysine spécifique d'une protéine cible.

Le système ubiquitine-protéasome est responsable de la dégradation des protéines intracellulaires endommagées, mal repliées et régulatrices. L'ubiquitination marque ces protéines pour une reconnaissance ultérieure par le protéasome, où elles seront clivées en peptides plus petits et dégradées.

Les enzymes conjuguant l'ubiquitine fonctionnent comme des intermédiaires entre les deux autres classes d'enzymes impliquées dans ce processus : les enzymes d'activation de l'ubiquitine (E1) et les ligases d'ubiquitine (E3). Après activation par une E1, l'ubiquitine est transférée à une cystéine réactive sur une enzyme conjuguante d'ubiquitine. Ensuite, la molécule d'ubiquitine liée est transférée de l'E2 à une protéine cible spécifique avec l'aide d'une ligase E3.

Il existe plusieurs isoformes d'enzymes conjuguant l'ubiquitine, chacune ayant des rôles distincts dans la régulation cellulaire et la dégradation des protéines. Des anomalies dans le fonctionnement de ces enzymes peuvent entraîner diverses maladies neurodégénératives, telles que la maladie de Parkinson et la sclérose latérale amyotrophique (SLA).

Les adénosine triphosphatases (ATPases) sont des enzymes qui catalysent la réaction qui convertit l'adénosine triphosphate (ATP) en adénosine diphosphate (ADP), libérant de l'énergie dans le processus. Cette réaction est essentielle pour de nombreux processus cellulaires, tels que la contraction musculaire, le transport actif d'ions et la synthèse des protéines.

Les ATPases sont classées en deux types principaux : les ATPases de type P (pour "phosphorylated") et les ATPases de type F (pour "F1F0-ATPase"). Les ATPases de type P sont également appelées pompes à ions, car elles utilisent l'énergie libérée par la hydrolyse de l'ATP pour transporter des ions contre leur gradient électrochimique. Les ATPases de type F, quant à elles, sont des enzymes complexes qui se trouvent dans les membranes mitochondriales et chloroplastiques, où elles jouent un rôle clé dans la génération d'ATP pendant la respiration cellulaire et la photosynthèse.

Les ATPases sont des protéines transmembranaires qui traversent la membrane cellulaire et présentent une tête globulaire située du côté cytoplasmique de la membrane, où se produit la catalyse de l'hydrolyse de l'ATP. La queue de ces protéines est ancrée dans la membrane et contient des segments hydrophobes qui s'insèrent dans la bicouche lipidique.

Les ATPases sont régulées par divers mécanismes, tels que la liaison de ligands, les modifications post-traductionnelles et les interactions avec d'autres protéines. Des mutations dans les gènes qui codent pour les ATPases peuvent entraîner des maladies humaines graves, telles que des cardiomyopathies, des myopathies et des neuropathies.

Un chaperon moléculaire est une protéine qui assiste et régule le pliage et l'assemblage corrects d'autres protéines dans les cellules vivantes. Ils aident à prévenir l'agrégation des protéines mal pliées et favorisent leur dégradation si un repliage correct ne peut être accompli. Les chaperons moléculaires jouent donc un rôle crucial dans la protection de l'intégrité du proteome cellulaire et dans la prévention des maladies liées à des protéines mal pliées, telles que les maladies neurodégénératives.

Les chaperons moléculaires sont souvent classés en fonction de leur taille et de leur structure. Les plus étudiés comprennent les chaperonnes de la famille des chocs thermiques (HSP), comme Hsp60, Hsp70 et Hsp90. Ces protéines sont hautement conservées dans divers organismes vivants, ce qui témoigne de leur importance fonctionnelle cruciale.

Les chaperons moléculaires peuvent se lier aux protéines clientes à différents stades du processus de pliage, depuis la traduction des ARNm jusqu'à l'assemblage et au transport des complexes multiprotéiques vers leurs destinations intracellulaires. Leur activité est généralement régulée par des changements dans les interactions protéine-protéine, la modification post-traductionnelle et l'énergie fournie par l'hydrolyse de l'ATP.

Dans l'ensemble, les chaperons moléculaires sont essentiels pour maintenir l'homéostasie protéique et prévenir le stress cellulaire associé aux protéines mal pliées. Leur dysfonctionnement a été lié à diverses affections pathologiques, notamment les maladies neurodégénératives, la fibrose kystique, le cancer et les infections virales.

La polyubiquitination est un processus post-traductionnel d'importance critique dans la régulation des protéines. Il s'agit d'une modification covalente d'une protéine, où plusieurs molécules d'ubiquitine sont attachées à une protéine cible via des liaisons isopeptidiques. L'ubiquitine est un petit polypeptide de 76 acides aminés qui peut être conjuguée à d'autres protéines par une série d'enzymes spécifiques, y compris l'activateur d'ubiquitine (E1), le conjuguant d'ubiquitine (E2) et la ligase d'ubiquitine (E3).

Le marquage des protéines par la polyubiquitination peut entraîner divers résultats, selon le type de chaîne ubiquitine formée. La forme la plus courante est la polyubiquitination liée aux lysines 48 (K48), qui cible généralement les protéines pour la dégradation par le protéasome 26S. D'autres types de chaînes ubiquitine, tels que K63 et K11, peuvent participer à des processus tels que l'endocytose, la réparation de l'ADN et la régulation du cycle cellulaire.

La polyubiquitination joue un rôle essentiel dans divers processus physiologiques et pathologiques, notamment le maintien de la stabilité des protéines, la réponse au stress, la signalisation cellulaire, l'inflammation et la tumorigénèse. Des altérations du système ubiquitine-protéasome ont été associées à un large éventail de maladies humaines, y compris les maladies neurodégénératives, le cancer et les maladies inflammatoires.

Calnexine est une protéine chaperonne située dans le lumen du reticulum endoplasmique (RE). Elle joue un rôle crucial dans la maturation et l'assemblage des protéines membranaires et sécrétées correctement pliées. Calnexine se lie spécifiquement aux glycoprotéines qui possèdent des résidus de glucose non clivés sur leur chaîne de sucre, ce qui indique qu'elles n'ont pas été correctement pliées. En se liant à ces protéines, calnexine facilite leur repliement correct et le processus de dégradation si le repliement ne peut être accompli.

Calnexine est également connue pour participer au contrôle de la qualité des protéines dans le RE en aidant à identifier et à éliminer les protéines mal pliées ou endommagées. Elle joue un rôle important dans divers processus cellulaires, notamment la signalisation cellulaire, l'adhésion cellulaire et la réponse immunitaire.

Des mutations dans le gène de calnexine ont été associées à certaines maladies humaines, telles que la neuropathie héréditaire sensitive et la rétinopathie pigmentaire. Ces mutations peuvent entraîner une altération de la fonction de calnexine, ce qui peut perturber le repliement des protéines et conduire à l'accumulation de protéines mal pliées dans les cellules, contribuant ainsi au développement de ces maladies.

Les protéines Saccharomyces cerevisiae, également connues sous le nom de protéines de levure, se réfèrent à des protéines spécifiques qui sont originaires de la souche de levure Saccharomyces cerevisiae. Cette levure est souvent utilisée dans l'industrie alimentaire et est également un organisme modèle important en biologie moléculaire et cellulaire.

Les protéines de levure ont été largement étudiées et sont bien comprises en raison de la facilité relative de cultiver et de manipuler la levure. Elles jouent un rôle crucial dans une variété de processus cellulaires, tels que la régulation du métabolisme, la réparation de l'ADN, la division cellulaire et la réponse au stress environnemental.

Les protéines de levure sont souvent utilisées dans la recherche biomédicale pour étudier les fonctions des protéines humaines, car elles partagent souvent des structures et des fonctions similaires avec leurs homologues humains. En outre, les protéines de levure peuvent être utilisées dans l'industrie alimentaire et pharmaceutique pour diverses applications, telles que la fermentation, la production d'enzymes et la formulation de médicaments.

La glycosylation est un processus post-traductionnel dans lequel des glucides, ou des sucres, sont attachés aux protéines ou lipides pour former des glycoprotéines ou des glycolipides. Ce processus joue un rôle crucial dans une variété de fonctions cellulaires, y compris la reconnaissance cellulaire, la signalisation cellulaire, et le contrôle de la réponse immunitaire. Les erreurs dans ce processus peuvent conduire à des maladies telles que les maladies lysosomales, le diabète, et certaines formes de cancer. Il existe deux types principaux de glycosylation : N-liée et O-liée. La glycosylation N-liée se produit lorsqu'un résidu d'asparagine dans une protéine est lié à un oligosaccharide via un groupe fonctionnel nitrogène. D'autre part, la glycosylation O-liée se produit lorsqu'un résidu de sérine ou de thréonine dans une protéine est lié à un oligosaccharide via un groupe fonctionnel oxygène.

L'Unfolded Protein Response (UPR) est un mécanisme de régulation cellulaire qui se déclenche lorsque le réticulum endoplasmique (RE), un organite intracellulaire responsable de la synthèse, du pliage et du transport des protéines, est soumis à un stress important. Ce stress peut être dû à une accumulation excessive de protéines mal repliées dans le RE.

L'UPR vise à rétablir l'homéostasie du RE en réduisant la charge de protéines à traiter, en augmentant la capacité du RE à gérer les protéines et en éliminant les protéines défectueuses. L'UPR implique l'activation d'un ensemble de voies de signalisation qui aboutissent à l'atténuation de la traduction des protéines, à l'augmentation de la production de chaperons moléculaires pour aider au pliage des protéines et à l'initiation de l'autophagie ou de l'apoptose si l'homéostasie du RE ne peut être rétablie.

L'UPR joue un rôle crucial dans la prévention des maladies liées au repliement des protéines, telles que les maladies neurodégénératives et le diabète de type 2. Cependant, une activation prolongée ou excessive de l'UPR peut également contribuer au développement de ces maladies.

La mannose est un sucre simple (monosaccharide) qui se produit naturellement dans certains fruits et légumes. Elle est similaire à la glucose dans sa structure chimique, mais diffère par la configuration de l'un de ses groupes hydroxyles.

Dans le corps humain, la mannose est un composant des chaînes de polysaccharides qui sont importantes pour la structure et la fonction des glycoprotéines et des glycolipides, qui sont des molécules complexes trouvées à la surface des cellules.

La mannose peut également être utilisée comme un supplément nutritionnel ou thérapeutique pour traiter certaines conditions médicales. Par exemple, il a été démontré que la supplémentation en mannose réduit l'adhésion des Escherichia coli producteurs de pyélonéphrite à l'épithélium des voies urinaires, ce qui peut aider à prévenir les infections des voies urinaires.

Cependant, il est important de noter que la consommation excessive de mannose peut entraîner des effets secondaires tels que des maux d'estomac, des nausées et des diarrhées. Par conséquent, il est recommandé de consulter un professionnel de la santé avant de commencer à prendre tout supplément nutritionnel ou thérapeutique contenant de la mannose.

La structure tertiaire d'une protéine se réfère à l'organisation spatiale des différents segments de la chaîne polypeptidique qui forment la protéine. Cela inclut les arrangements tridimensionnels des différents acides aminés et des régions flexibles ou rigides de la molécule, tels que les hélices alpha, les feuillets bêta et les boucles. La structure tertiaire est déterminée par les interactions non covalentes entre résidus d'acides aminés, y compris les liaisons hydrogène, les interactions ioniques, les forces de Van der Waals et les ponts disulfures. Elle est influencée par des facteurs tels que le pH, la température et la présence de certains ions ou molécules. La structure tertiaire joue un rôle crucial dans la fonction d'une protéine, car elle détermine sa forme active et son site actif, où les réactions chimiques ont lieu.

'Saccharomyces cerevisiae' est une espèce de levure unicellulaire communément trouvée dans l'environnement et utilisée dans la fabrication de produits alimentaires et boissons depuis des siècles. Elle appartient au royaume Fungi, phylum Ascomycota, classe Saccharomycetes, ordre Saccharomycetales et famille Saccharomycetaceae.

Cette levure est également connue sous le nom de «levure de bière» ou «levure de boulangerie». Elle est souvent utilisée dans la production de pain, de bière, de vin et d'autres aliments fermentés en raison de sa capacité à fermenter les sucres en dioxyde de carbone et en alcool.

Dans un contexte médical, 'Saccharomyces cerevisiae' est parfois utilisé comme probiotique pour aider à rétablir l'équilibre de la flore intestinale et améliorer la digestion. Cependant, il peut également causer des infections fongiques chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

En outre, 'Saccharomyces cerevisiae' est largement utilisé dans la recherche biomédicale comme organisme modèle en raison de sa facilité de culture, de son génome entièrement séquencé et de ses caractéristiques génétiques bien étudiées. Il est souvent utilisé pour étudier des processus cellulaires fondamentaux tels que la réplication de l'ADN, la transcription, la traduction, le métabolisme énergétique et le vieillissement cellulaire.

L'alpha-1 antitrypsine (AAT) est une protéine produite principalement par le foie et libérée dans la circulation sanguine. Elle joue un rôle important dans la protection des tissus du corps contre les enzymes protéolytiques, en particulier l'élastase, qui sont libérées par les globules blancs (neutrophiles) pendant l'inflammation.

L'AAT agit en inactivant ces enzymes pour empêcher qu'elles ne dégradent les protéines structurelles des tissus, telles que l'élastine et le collagène, qui sont importantes pour maintenir l'intégrité des poumons, des vaisseaux sanguins et d'autres organes.

Une déficience en AAT peut entraîner une maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) et une insuffisance hépatique, car les poumons et le foie sont exposés à des niveaux élevés d'enzymes protéolytiques qui dégradent les tissus. Cette déficience est souvent héréditaire et peut être due à des mutations dans le gène SERPINA1, qui code pour l'AAT.

Les personnes atteintes de cette maladie génétique peuvent présenter un risque accru de développer une bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), une cirrhose du foie et d'autres complications liées à la déficience en AAT. Le traitement peut inclure des suppléments d'AAT pour remplacer les niveaux insuffisants de cette protéine dans le sang, ainsi que des mesures visant à réduire l'inflammation et à prévenir les dommages aux poumons et au foie.

Les protéines membranaires sont des protéines qui sont intégrées dans les membranes cellulaires ou associées à elles. Elles jouent un rôle crucial dans la fonction et la structure des membranes, en participant à divers processus tels que le transport de molécules, la reconnaissance cellulaire, l'adhésion cellulaire, la signalisation cellulaire et les interactions avec l'environnement extracellulaire.

Les protéines membranaires peuvent être classées en plusieurs catégories en fonction de leur localisation et de leur structure. Les principales catégories sont :

1. Protéines transmembranaires : Ces protéines traversent la membrane cellulaire et possèdent des domaines hydrophobes qui interagissent avec les lipides de la membrane. Elles peuvent être classées en plusieurs sous-catégories, telles que les canaux ioniques, les pompes à ions, les transporteurs et les récepteurs.
2. Protéines intégrales : Ces protéines sont fermement ancrées dans la membrane cellulaire et ne peuvent pas être facilement extraites sans perturber la structure de la membrane. Elles peuvent traverser la membrane une ou plusieurs fois.
3. Protéines périphériques : Ces protéines sont associées à la surface interne ou externe de la membrane cellulaire, mais ne traversent pas la membrane. Elles peuvent être facilement éliminées sans perturber la structure de la membrane.
4. Protéines lipidiques : Ces protéines sont associées aux lipides de la membrane par des liaisons covalentes ou non covalentes. Elles peuvent être intégrales ou périphériques.

Les protéines membranaires sont essentielles à la vie et sont impliquées dans de nombreux processus physiologiques et pathologiques. Des anomalies dans leur structure, leur fonction ou leur expression peuvent entraîner des maladies telles que les maladies neurodégénératives, le cancer, l'inflammation et les infections virales.

Le transport de protéines dans un contexte médical fait référence au processus par lequel les protéines sont transportées à travers les membranes cellulaires, entre les compartiments cellulaires ou dans la circulation sanguine vers différents tissus et organes. Les protéines peuvent être liées à des molécules de lipides ou à d'autres protéines pour faciliter leur transport. Ce processus est essentiel au maintien de l'homéostasie cellulaire et du métabolisme, ainsi qu'au développement et au fonctionnement normal des organismes. Des anomalies dans le transport des protéines peuvent entraîner diverses maladies, y compris certaines formes de maladies génétiques, neurodégénératives et infectieuses.

Les glycoprotéines sont des molécules complexes qui combinent des protéines avec des oligosaccharides, c'est-à-dire des chaînes de sucres simples. Ces molécules sont largement répandues dans la nature et jouent un rôle crucial dans de nombreux processus biologiques.

Dans le corps humain, les glycoprotéines sont présentes à la surface de la membrane cellulaire où elles participent à la reconnaissance et à l'interaction entre les cellules. Elles peuvent aussi être sécrétées dans le sang et d'autres fluides corporels, où elles servent de transporteurs pour des hormones, des enzymes et d'autres molécules bioactives.

Les glycoprotéines sont également importantes dans le système immunitaire, où elles aident à identifier les agents pathogènes étrangers et à déclencher une réponse immune. De plus, certaines glycoprotéines sont des marqueurs de maladies spécifiques et peuvent être utilisées dans le diagnostic et le suivi des affections médicales.

La structure des glycoprotéines est hautement variable et dépend de la séquence d'acides aminés de la protéine sous-jacente ainsi que de la composition et de l'arrangement des sucres qui y sont attachés. Cette variabilité permet aux glycoprotéines de remplir une grande diversité de fonctions dans l'organisme.

Les HEK293 (Human Embryonic Kidney 293) sont une lignée cellulaire immortalisée, largement utilisée dans la recherche biomédicale et les biotechnologies. Elles ont été initialement dérivées d'une cellule rénale embryonnaire humaine transformée par une infection avec un adénovirus de type 5. Les HEK293 sont des cellules adhérentes, épithéliales et présentent un taux de croissance élevé.

Elles sont souvent utilisées pour la production de protéines recombinantes, l'étude de la transcription, de la traduction, du trafic intracellulaire et des interactions moléculaires. Les HEK293 sont également populaires dans les études de virologie moléculaire, car elles peuvent être facilement infectées par de nombreux types de virus et utilisées pour la production de virus à des fins de recherche ou thérapeutiques.

Cependant, il est important de noter que, comme toute lignée cellulaire immortalisée, les HEK293 ne sont pas représentatives des cellules humaines normales et présentent certaines caractéristiques anormales. Par conséquent, les résultats obtenus avec ces cellules doivent être validés dans d'autres systèmes expérimentaux avant d'être généralisés à la physiologie humaine.

Le cytosol est la phase liquide du cytoplasme d'une cellule, excluant les organites membranaires et le cytosquelette. Il contient un mélange complexe de molécules organiques et inorganiques, y compris des ions, des nutriments, des métabolites, des enzymes et des messagers intracellulaires tels que les seconds messagers. Le cytosol est où se produisent la plupart des réactions métaboliques dans une cellule, y compris le glycolyse, la synthèse des protéines et la dégradation des lipides. Il sert également de milieu pour la signalisation cellulaire et la régulation de divers processus cellulaires.

La modification post-traductionnelle des protéines est un processus qui se produit après la synthèse d'une protéine à partir d'un ARN messager. Ce processus implique l'ajout de divers groupes chimiques ou molécules à la chaîne polypeptidique, ce qui peut modifier les propriétés de la protéine et influencer sa fonction, sa localisation, sa stabilité et son interaction avec d'autres molécules.

Les modifications post-traductionnelles peuvent inclure l'ajout de groupes phosphate (phosphorylation), de sucre (glycosylation), d'acides gras (palmitoylation), de lipides (lipidation), d'ubiquitine (ubiquitination) ou de méthylation, entre autres. Ces modifications peuvent être réversibles ou irréversibles et sont souvent régulées par des enzymes spécifiques qui reconnaissent des séquences particulières dans la protéine cible.

Les modifications post-traductionnelles jouent un rôle crucial dans de nombreux processus cellulaires, tels que la signalisation cellulaire, le trafic intracellulaire, la dégradation des protéines et la régulation de l'activité enzymatique. Des anomalies dans ces processus peuvent entraîner diverses maladies, telles que les maladies neurodégénératives, le cancer et les maladies inflammatoires.

Les protéines du cycle cellulaire sont des protéines régulatrices clés qui contrôlent et coordonnent les étapes critiques du cycle cellulaire, qui est le processus ordonné par lequel une cellule se divise en deux cellules identiques. Le cycle cellulaire consiste en quatre phases principales: la phase G1 (gap 1), la phase S (synthesis ou synthèse de l'ADN), la phase G2 (gap 2) et la mitose (qui comprend la prophase, la métaphase, l'anaphase et la télophase), suivie de la cytokinèse pour séparer les deux cellules.

Les protéines du cycle cellulaire comprennent des kinases cycline-dépendantes (CDK) et leurs inhibiteurs associés, qui régulent l'entrée dans la phase S et la progression de la mitose. Les cyclines sont des protéines régulatrices qui se lient aux CDK pour activer les complexes kinase CDK-cycline. L'activité des CDK est également régulée par des modifications post-traductionnelles telles que la phosphorylation et la déphosphorylation, ainsi que par la localisation subcellulaire.

Les protéines du cycle cellulaire jouent un rôle essentiel dans le maintien de l'intégrité génomique en coordonnant les événements du cycle cellulaire avec la réparation de l'ADN et la réponse aux dommages à l'ADN. Les dysfonctionnements des protéines du cycle cellulaire peuvent entraîner une régulation anormale du cycle cellulaire, ce qui peut conduire au développement de maladies telles que le cancer.

En génétique, une mutation est une modification permanente et héréditaire de la séquence nucléotidique d'un gène ou d'une région chromosomique. Elle peut entraîner des changements dans la structure et la fonction des protéines codées par ce gène, conduisant ainsi à une variété de phénotypes, allant de neutres (sans effet apparent) à délétères (causant des maladies génétiques). Les mutations peuvent être causées par des erreurs spontanées lors de la réplication de l'ADN, l'exposition à des agents mutagènes tels que les radiations ou certains produits chimiques, ou encore par des mécanismes de recombinaison génétique.

Il existe différents types de mutations, telles que les substitutions (remplacement d'un nucléotide par un autre), les délétions (suppression d'une ou plusieurs paires de bases) et les insertions (ajout d'une ou plusieurs paires de bases). Les conséquences des mutations sur la santé humaine peuvent être très variables, allant de maladies rares à des affections courantes telles que le cancer.

Les cystéine endopeptidases sont un type spécifique d'enzymes qui coupent les protéines en libérant l'acide aminé cystéine lors de la réaction catalytique. Elles sont également connues sous le nom de cystéine proteases ou cysteine peptidases. Ces enzymes ont un résidu de cystéine dans leur site actif qui est essentiel à leur fonctionnement.

Elles jouent un rôle crucial dans divers processus physiologiques, tels que la digestion des protéines dans l'estomac et l'intestin grêle, la régulation de la réponse immunitaire, la signalisation cellulaire, la croissance et la différenciation cellulaires. Cependant, certaines cystéine endopeptidases peuvent également être associées à des maladies, telles que les infections virales, l'arthrite rhumatoïde, le cancer et les maladies neurodégénératives.

Les inhibiteurs de cystéine endopeptidases sont souvent utilisés dans le traitement de ces maladies pour contrôler leur activité anormale. Les exemples bien connus de cystéine endopeptidases comprennent la papaïne, la bromélaïne, la trypsine et la chymotrypsine.

Une lignée cellulaire est un groupe homogène de cellules dérivées d'un seul type de cellule d'origine, qui se divisent et se reproduisent de manière continue dans des conditions de culture en laboratoire. Ces cellules sont capables de maintenir certaines caractéristiques spécifiques à leur type cellulaire d'origine, telles que la forme, les fonctions et les marqueurs moléculaires, même après plusieurs générations.

Les lignées cellulaires sont largement utilisées dans la recherche biomédicale pour étudier divers processus cellulaires et moléculaires, tester de nouveaux médicaments, développer des thérapies et comprendre les mécanismes sous-jacents aux maladies humaines. Il est important de noter que certaines lignées cellulaires peuvent présenter des anomalies chromosomiques ou génétiques dues à leur manipulation en laboratoire, ce qui peut limiter leur utilisation dans certains contextes expérimentaux ou cliniques.

En médecine et en biologie, les protéines sont des macromolécules essentielles constituées de chaînes d'acides aminés liés ensemble par des liaisons peptidiques. Elles jouent un rôle crucial dans la régulation et le fonctionnement de presque tous les processus biologiques dans les organismes vivants.

Les protéines ont une grande variété de fonctions structurales, régulatrices, enzymatiques, immunitaires, transport et signalisation dans l'organisme. Leur structure tridimensionnelle spécifique détermine leur fonction particulière. Les protéines peuvent être composées de plusieurs types différents d'acides aminés et varier considérablement en taille, allant de petites chaînes de quelques acides aminés à de longues chaînes contenant des milliers d'unités.

Les protéines sont synthétisées dans les cellules à partir de gènes qui codent pour des séquences spécifiques d'acides aminés. Des anomalies dans la structure ou la fonction des protéines peuvent entraîner diverses maladies, y compris des maladies génétiques et des troubles dégénératifs. Par conséquent, une compréhension approfondie de la structure, de la fonction et du métabolisme des protéines est essentielle pour diagnostiquer et traiter ces affections.

Les inhibiteurs du protéasome sont une classe de médicaments qui empêchent le fonctionnement des protéasomes, des complexes enzymatiques responsables de la dégradation des protéines marquées pour la destruction dans les cellules. En inhibant l'activité du protéasome, ces composés entraînent une accumulation de protéines mal repliées ou endommagées dans la cellule, ce qui peut conduire à l'apoptose (mort cellulaire programmée).

Dans le contexte médical, les inhibiteurs du protéasome sont principalement utilisés dans le traitement de certains types de cancer, tels que le myélome multiple et le lymphome de Hodgkin. En ralentissant la dégradation des protéines, ces médicaments peuvent favoriser l'apoptose des cellules cancéreuses, ce qui entraîne une réduction de la tumeur et un allongement de la survie des patients.

Les inhibiteurs du protéasome les plus couramment utilisés en médecine comprennent le bortézomib (Velcade), le carfilzomib (Kyprolis) et l'ixazomib (Ninlaro). Ces médicaments sont généralement administrés par voie intraveineuse ou orale, en fonction du type de cancer et de la posologie prescrite.

Bien que les inhibiteurs du protéasome aient démontré des avantages thérapeutiques dans le traitement de certains cancers, ils peuvent également entraîner une variété d'effets secondaires indésirables, tels que des nausées, des vomissements, de la fatigue, des neuropathies périphériques et une suppression du système immunitaire. Par conséquent, il est important de surveiller attentivement les patients traités avec ces médicaments pour détecter et gérer rapidement tout effet indésirable.

La protéine CFTR (CF Transmembrane Conductance Regulator) est une protéine membranaire qui agit comme un canal chlore activé par ATP. Elle joue un rôle crucial dans la régulation de l'équilibre des ions et de l'hydratation du épithéliale, en particulier dans les poumons, le pancréas et l'intestin grêle. Les mutations dans le gène CFTR sont responsables de la mucoviscidose (fibrose kystique), une maladie génétique grave qui affecte principalement les voies respiratoires et digestives. Ces mutations peuvent entraîner une production insuffisante, un fonctionnement anormal ou l'absence de la protéine CFTR, ce qui perturbe le transport des ions chlore et provoque la production de mucus épais et collant dans les organes affectés.

Les données de séquence moléculaire se réfèrent aux informations génétiques ou protéomiques qui décrivent l'ordre des unités constitutives d'une molécule biologique spécifique. Dans le contexte de la génétique, cela peut inclure les séquences d'ADN ou d'ARN, qui sont composées d'une série de nucléotides (adénine, thymine, guanine et cytosine pour l'ADN; adénine, uracile, guanine et cytosine pour l'ARN). Dans le contexte de la protéomique, cela peut inclure la séquence d'acides aminés qui composent une protéine.

Ces données sont cruciales dans divers domaines de la recherche biologique et médicale, y compris la génétique, la biologie moléculaire, la médecine personnalisée, la pharmacologie et la pathologie. Elles peuvent aider à identifier des mutations ou des variations spécifiques qui peuvent être associées à des maladies particulières, à prédire la structure et la fonction des protéines, à développer de nouveaux médicaments ciblés, et à comprendre l'évolution et la diversité biologique.

Les technologies modernes telles que le séquençage de nouvelle génération (NGS) ont rendu possible l'acquisition rapide et économique de vastes quantités de données de séquence moléculaire, ce qui a révolutionné ces domaines de recherche. Cependant, l'interprétation et l'analyse de ces données restent un défi important, nécessitant des méthodes bioinformatiques sophistiquées et une expertise spécialisée.

Je suis désolé, "polyosides" n'est pas un terme médical généralement accepté ou largement utilisé dans la littérature médicale. Il semble que vous vous référiez peut-être aux "polysaccharides", qui sont des chaînes de sucres simples, ou monosaccharides, liés entre eux par des liaisons glycosidiques. Les polysaccharides sont un constituant important de nombreuses biomolécules et structures cellulaires, y compris les membranes cellulaires, les glycoprotéines et les protéoglycanes.

Si "polyosides" est utilisé dans un contexte spécifique ou restreint dans certaines publications ou domaines de recherche, je vous encourage à chercher une définition plus précise dans ces sources spécifiques.

Les protéines de choc thermique Hsp70, également connues sous le nom de chaperones heat shock protein 70 ou HSP70, sont une famille de protéines hautement conservées qui jouent un rôle crucial dans la protection des cellules contre les stress environnementaux et physiologiques. Elles sont appelées "protéines de choc thermique" car leur expression est fortement induite par une augmentation de la température, mais elles peuvent également être activées par d'autres facteurs de stress tels que des niveaux élevés de radicaux libres, une privation d'oxygène, une infection virale ou une exposition à des toxines.

Les protéines Hsp70 sont impliquées dans divers processus cellulaires, notamment la réparation et le repliement des protéines, l'agrégation des protéines, le transport transmembranaire des protéines et l'activation ou l'inhibition de certaines voies de signalisation cellulaire. Elles se lient spécifiquement aux segments d'hélices alpha exposées des protéines mal repliées ou endommagées, empêchant ainsi leur agrégation et facilitant leur repliement correct en collaboration avec d'autres chaperones.

Les protéines Hsp70 sont composées de trois domaines fonctionnels : un domaine N-terminal ATPase, un domaine substrat liant la peptide et un domaine variable C-terminal. Leur activité dépend du cycle ATPase qui régule l'affinité pour les substrats protéiques. Lorsque l'ATP est liée, l'affinité de Hsp70 pour les substrats protéiques est faible, ce qui permet le relâchement des protéines correctement pliées. En revanche, lorsque l'ADP est liée, l'affinité pour les substrats protéiques est élevée, favorisant la fixation et le maintien des protéines mal repliées ou endommagées.

Les protéines Hsp70 sont hautement conservées chez les eucaryotes et jouent un rôle crucial dans la protection contre le stress cellulaire, l'agrégation des protéines et la dégradation des protéines. Elles ont été impliquées dans divers processus pathologiques tels que les maladies neurodégénératives, le cancer et les infections virales. Par conséquent, elles représentent des cibles thérapeutiques potentielles pour le traitement de ces maladies.

Les protéines de transport sont des molécules spécialisées qui facilitent le mouvement des ions et des molécules à travers les membranes cellulaires. Elles jouent un rôle crucial dans la régulation des processus cellulaires en aidant à maintenir l'équilibre des substances dans et autour des cellules.

Elles peuvent être classées en deux catégories principales : les canaux ioniques et les transporteurs. Les canaux ioniques forment des pores dans la membrane cellulaire qui s'ouvrent et se ferment pour permettre le passage sélectif d'ions spécifiques. D'un autre côté, les transporteurs actifs déplacent des molécules ou des ions contre leur gradient de concentration en utilisant l'énergie fournie par l'hydrolyse de l'ATP (adénosine triphosphate).

Les protéines de transport sont essentielles à diverses fonctions corporelles, y compris le fonctionnement du système nerveux, la régulation du pH sanguin, le contrôle du volume et de la composition des fluides extracellulaires, et l'absorption des nutriments dans l'intestin grêle. Des anomalies dans ces protéines peuvent entraîner diverses affections médicales, telles que des maladies neuromusculaires, des troubles du développement, des maladies cardiovasculaires et certains types de cancer.

Une séquence d'acides aminés est une liste ordonnée d'acides aminés qui forment une chaîne polypeptidique dans une protéine. Chaque protéine a sa propre séquence unique d'acides aminés, qui est déterminée par la séquence de nucléotides dans l'ADN qui code pour cette protéine. La séquence des acides aminés est cruciale pour la structure et la fonction d'une protéine. Les différences dans les séquences d'acides aminés peuvent entraîner des différences importantes dans les propriétés de deux protéines, telles que leur activité enzymatique, leur stabilité thermique ou leur interaction avec d'autres molécules. La détermination de la séquence d'acides aminés d'une protéine est une étape clé dans l'étude de sa structure et de sa fonction.

Les lectines sont des protéines végétales qui se lient spécifiquement et avec une forte affinité à des glucides ou des oligosaccharides. On les trouve dans une grande variété de plantes, y compris les légumineuses, les céréales, les fruits et les légumes. Les lectines peuvent avoir divers effets biologiques sur les animaux qui les consomment, notamment en ce qui concerne la digestion et l'absorption des nutriments. Certaines lectines sont connues pour être toxiques ou indigestes pour l'homme à des niveaux élevés de consommation, bien que de nombreuses lectines soient inactivées par la cuisson. Les lectines ont également été étudiées pour leurs propriétés immunologiques et leur potentiel dans le traitement du cancer.

Les acides aminés sont les unités structurales et fonctionnelles fondamentales des protéines. Chaque acide aminé est composé d'un groupe amino (composé de l'atome d'azote et des atomes d'hydrogène) et d'un groupe carboxyle (composé d'atomes de carbone, d'oxygène et d'hydrogène), reliés par un atome de carbone central appelé le carbone alpha. Un side-chain, qui est unique pour chaque acide aminé, se projette à partir du carbone alpha.

Les motifs des acides aminés sont des arrangements spécifiques et répétitifs de ces acides aminés dans une protéine. Ces modèles peuvent être déterminés par la séquence d'acides aminés ou par la structure tridimensionnelle de la protéine. Les motifs des acides aminés jouent un rôle important dans la fonction et la structure des protéines, y compris l'activation enzymatique, la reconnaissance moléculaire, la localisation subcellulaire et la stabilité structurelle.

Par exemple, certains motifs d'acides aminés peuvent former des structures secondaires telles que les hélices alpha et les feuillets bêta, qui sont importantes pour la stabilité de la protéine. D'autres motifs peuvent faciliter l'interaction entre les protéines ou entre les protéines et d'autres molécules, telles que les ligands ou les substrats.

Les motifs des acides aminés sont souvent conservés dans les familles de protéines apparentées, ce qui permet de prédire la fonction des protéines inconnues et de comprendre l'évolution moléculaire. Des anomalies dans les motifs d'acides aminés peuvent entraîner des maladies génétiques ou contribuer au développement de maladies telles que le cancer.

Un modèle biologique est une représentation simplifiée et schématisée d'un système ou processus biologique, conçue pour améliorer la compréhension des mécanismes sous-jacents et faciliter l'étude de ces phénomènes. Il s'agit souvent d'un organisme, d'un tissu, d'une cellule ou d'un système moléculaire qui est utilisé pour étudier les réponses à des stimuli spécifiques, les interactions entre composants biologiques, ou les effets de divers facteurs environnementaux. Les modèles biologiques peuvent être expérimentaux (in vivo ou in vitro) ou théoriques (mathématiques ou computationnels). Ils sont largement utilisés en recherche fondamentale et appliquée, notamment dans le développement de médicaments, l'étude des maladies et la médecine translationnelle.

Je suis désolé, mais la terminologie «immunotransfert» ne semble pas être reconnue dans le domaine médical. Il est possible que vous ayez fait une faute d'orthographe ou que ce terme ne soit pas largement utilisé en médecine.

Cependant, les termes «immunité» et «transfert» sont bien sûr des termes médicaux établis.

- Immunité fait référence à la protection du corps contre une maladie spécifique, généralement acquise grâce à l'exposition antérieure au pathogène ou à la vaccination.
- Transfert se réfère généralement au processus de mouvement ou de déplacement d'une substance d'un endroit à un autre.

Dans certains contextes, vous pourriez peut-être faire référence à «transfert d'immunité», qui est le processus par lequel une immunité active ou passive est transmise d'un individu à un autre. Par exemple, la transmission de cellules mères à fœtus via le placenta ou l'administration d'immunoglobulines pour fournir une immunité passive contre certaines maladies.

Si vous cherchiez une définition différente ou plus spécifique, pouvez-vous s'il vous plaît me fournir plus de contexte ou clarifier votre question ?

Les protéines nucléaires sont des protéines qui se trouvent dans le noyau des cellules et jouent un rôle crucial dans la régulation de l'expression des gènes, la réplication de l'ADN, la réparation de l'ADN, la transcription de l'ARN et d'autres processus essentiels à la survie et à la reproduction des cellules.

Il existe plusieurs types de protéines nucléaires, y compris les histones, qui sont des protéines structurelles qui aident à compacter l'ADN en chromosomes, et les facteurs de transcription, qui se lient à l'ADN pour réguler l'expression des gènes. Les protéines nucléaires peuvent également inclure des enzymes qui sont impliquées dans la réplication et la réparation de l'ADN, ainsi que des protéines qui aident à maintenir l'intégrité structurelle du noyau.

Les protéines nucléaires peuvent être régulées au niveau de leur expression, de leur localisation dans la cellule et de leur activité enzymatique. Des anomalies dans les protéines nucléaires peuvent entraîner des maladies génétiques et contribuer au développement du cancer. Par conséquent, l'étude des protéines nucléaires est importante pour comprendre les mécanismes moléculaires qui sous-tendent la régulation de l'expression des gènes et d'autres processus cellulaires essentiels.

Les cellules HeLa sont une lignée cellulaire immortelle et cancéreuse dérivée des tissus d'une patiente atteinte d'un cancer du col de l'utérus nommée Henrietta Lacks. Ces cellules ont la capacité de se diviser indéfiniment en laboratoire, ce qui les rend extrêmement utiles pour la recherche médicale et biologique.

Les cellules HeLa ont été largement utilisées dans une variété d'applications, y compris la découverte des vaccins contre la polio, l'étude de la division cellulaire, la réplication de l'ADN, la cartographie du génome humain, et la recherche sur le cancer, les maladies infectieuses, la toxicologie, et bien d'autres.

Il est important de noter que les cellules HeLa sont souvent utilisées sans le consentement des membres vivants de la famille de Henrietta Lacks, ce qui a soulevé des questions éthiques complexes concernant la confidentialité, l'utilisation et la propriété des tissus humains à des fins de recherche.

L'alpha-mannosidase est une enzyme qui joue un rôle important dans le processus de dégradation des glycoprotéines dans les lysosomes, des structures cellulaires qui décomposent et recyclent les composants des cellules. Cette enzyme est responsable du clivage des résidus d'acide alpha-mannosyl des oligosaccharides complexes.

Les défauts de l'alpha-mannosidase peuvent entraîner une maladie génétique appelée maladie d'Alpha-Mannosidosis, qui est caractérisée par un déficit en activité alpha-mannosidase et l'accumulation de substrats non dégradés dans les lysosomes. Cela peut entraîner une variété de symptômes, notamment des retards de développement, des anomalies squelettiques, des problèmes neurologiques, des infections récurrentes et une augmentation de la taille de la rate et du foie.

La maladie d'Alpha-Mannosidosis est héréditaire et se transmet selon un mode autosomique récessif, ce qui signifie que les deux copies du gène doivent être anormales pour que la maladie se développe. Elle est causée par des mutations dans le gène MAN2B1, qui code pour l'alpha-mannosidase.

Les complexes multienzyme sont des structures protéiques organisées qui contiennent plusieurs enzymes et leurs cofacteurs associés. Ils sont impliqués dans divers processus métaboliques, tels que la biosynthèse et la dégradation de molécules complexes. Les complexes multienzyme permettent une catalyse séquentielle ou simultanée des réactions chimiques en alignant les substrats pour chaque étape de manière optimale, ce qui améliore l'efficacité et la spécificité des réactions. Les exemples bien connus de complexes multienzyme comprennent le complexe pyruvate déshydrogénase, le complexe nucléotide réductase et le complexe ATP synthase.

Cathepsin A est une enzyme lysosomale qui appartient à la famille des peptidases. Elle est également connue sous le nom de peptidase A ou CTSA. Cette enzyme joue un rôle important dans la dégradation et le recyclage des protéines dans les cellules, ainsi que dans l'activation et la régulation d'autres enzymes et hormones.

Cathepsin A est capable de cliver une variété de substrats, y compris les peptides, les protéines et les lipides. Elle est exprimée dans de nombreux tissus du corps humain, bien que ses niveaux soient particulièrement élevés dans le cœur, les poumons, le foie et les reins.

Des mutations dans le gène CTSA peuvent entraîner des maladies génétiques rares telles que la galactosialidosis, qui se caractérise par une accumulation de certaines substances toxiques dans les cellules en raison d'un dysfonctionnement de cathepsin A. Cette maladie peut entraîner une variété de symptômes, notamment des problèmes neurologiques, des anomalies squelettiques et une insuffisance cardiaque congestive.

Les protéines de choc thermique Hsp40, également connues sous le nom de co-chaperones J, sont une famille de protéines de choc thermique qui jouent un rôle crucial dans la protection des cellules contre les stress environnementaux et les dommages aux protéines. Elles agissent comme des molécules d'aide pour les protéines de choc thermique Hsp70, en facilitant le repliement et l'assemblage des protéines ainsi que la prévention de l'agrégation des protéines dénaturées.

Les protéines Hsp40 contiennent un domaine de liaison à l'ARN dépendant de l'ATP et un domaine de liaison aux clientèles, qui interagit directement avec les protéines clientes dénaturées ou mal repliées. Elles peuvent également participer à la régulation de la dégradation des protéines en ciblant les protéines endommagées pour la dégradation par le protéasome.

Les protéines Hsp40 sont hautement conservées chez les eucaryotes et jouent un rôle important dans divers processus cellulaires, tels que la réponse au stress, le développement embryonnaire, l'apoptose et la différenciation cellulaire. Des niveaux anormalement élevés ou faibles de protéines Hsp40 ont été associés à diverses maladies, notamment les maladies neurodégénératives, le cancer et les maladies cardiovasculaires.

Les fractions subcellulaires en médecine et en biologie cellulaire se réfèrent à des parties spécifiques et fonctionnellement distinctes d'une cellule qui sont séparées ou isolées à des fins d'analyse. Ces fractions peuvent inclure des organites membranaires tels que le noyau, les mitochondries, les ribosomes, les lysosomes, les endosomes et les peroxisomes, ainsi que des structures non membranaires telles que les chromosomes, les centrosomes et les cytosquelettes.

L'isolement de ces fractions subcellulaires permet aux chercheurs d'étudier les propriétés biochimiques, structurales et fonctionnelles des différents composants cellulaires dans un état plus pur et sans interférence des autres parties de la cellule. Cette technique est largement utilisée dans la recherche biomédicale pour comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans divers processus cellulaires, tels que la signalisation cellulaire, le métabolisme, la division cellulaire et l'apoptose.

Les fractions subcellulaires sont généralement obtenues par une combinaison de techniques de fractionnement cellulaire, y compris la centrifugation différentielle et la chromatographie. Ces méthodes permettent de séparer les composants cellulaires en fonction de leurs propriétés physiques et chimiques, telles que leur taille, leur densité, leur charge électrique et leur affinité pour certains ligands.

Les ubiquitines sont des protéines régulatrices très conservées qui jouent un rôle crucial dans la dégradation des protéines et la signalisation cellulaire. Elles possèdent une petite taille, avec environ 76 acides aminés et un poids moléculaire d'environ 8,5 kDa. Les ubiquitines se lient aux lysines (résidus d'acides aminés) sur des protéines cibles spécifiques, formant une chaîne de polyubiquitine et marquant ainsi ces protéines pour la dégradation par le protéasome, un complexe multiprotéique responsable de la dégradation des protéines.

Le processus d'ubiquitination implique trois étapes principales: l'activation, la conjugaison et la ligature. Ces étapes sont catalysées par une famille d'enzymes appelées ubiquitine activant l'E1, les ubiquitine conjuguants E2 et les ubiquitine ligases E3 spécifiques des substrats. Les ubiquitines peuvent également être retirées des protéines cibles par une famille d'enzymes appelées déubiquitinases (DUBs).

Outre leur rôle dans la dégradation des protéines, les ubiquitines sont également impliquées dans divers processus cellulaires tels que l'endocytose, la réparation de l'ADN, la transcription, la différentiation et l'apoptose. Les dysfonctionnements dans le système d'ubiquitination ont été associés à plusieurs maladies humaines, notamment aux maladies neurodégénératives, au cancer et aux troubles immunitaires.

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  • Afin d'interférer avec les mécanismes de transport intracellulaire de la PrP C dans des lignées de neuroblastome murin infectées par les prions, nous avons choisi d'utiliser d'une part la protéine Rab4, qui agit dans les processus de recyclage des récepteurs endocytés, et d'autre part la protéine Rab6, qui stimule le transport rétrograde, de l'appareil de Golgi vers le réticulum endoplasmique (RE) [ 3 ]. (inserm.fr)
  • Système endo-lysosomal : réticulum endoplasmique : sites de contact membranaire (MCS) du RE : endosomes multivésiculaires (MVE/MVB) et lysosomes : 1. (vetopsy.fr)
  • L'importance des MCS du réticulum endoplasmique est essentielle, en particulier pour les endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB) et les lysosomes . (vetopsy.fr)