Bacteriófagos cujo material genético é o RNA, fita única em todos os fagos, exceto no fago Pseudomonas Phi 6 (BACTERIÓFAGO PHI 6). Todos os fagos RNA infectam a bactéria hospedeira através da superfície pilosa da célula hospedeira. Alguns fagos RNA frequentemente encontrados são: BF23, F2, R17, fr, PhiCb5, PhiCb12r, PhiCb8r, PhiCb23r, 7s, PP7, fago Q beta, fago MS2 e o BACTERIÓFAGO PHI 6.
Gênero de bacteriófagos (família LEVIVIRIDAE) cujos vírus contêm a versão curta do genoma e possuem um gene separado para lise celular.
Gênero de bacteriófagos da família LEVIVIRIDAE, cujos vírus contêm a versão mais longa do genoma e nenhum gene separado de lise celular.
Família de bacteriófagos que infecta enterobactérias, CAULOBACTER e PSEUDOMONAS. O genoma consiste em RNA linear, de fita única e sentido positivo.
Vírus cujo hospedeiro é a Escherichia coli.
Vírus cujos hospedeiros são células bacterianas.
Vírus cujo material genético é RNA.
Ácido ribonucleico que constitui o material genético de vírus.
Polinucleotídeo que consiste essencialmente em cadeias contendo unidades repetidas de uma estrutura de fosfato e ribose às quais as bases nitrogenadas encontram-se unidas. O RNA é único entre as macromoléculas biológicas pelo fato de codificar informação genética, servir como um componente celular estrutural abundante e também possuir atividade catalítica. (Tradução livre do original: Rieger et al., Glossary of Genética: Classical and Molecualr, 5th ed)
Enzima que catalisa a replicação de RNA do colifago Q beta. EC 2.7.7.-.
Espécie de bactérias Gram-negativas, facultativamente anaeróbicas, em forma de bastão (BACILOS GRAM-NEGATIVOS ANAERÓBIOS FACULTATIVOS) comumente encontrada na parte mais baixa do intestino de animais de sangue quente. Geralmente não é patogênica, embora algumas linhagens sejam conhecidas por produzir DIARREIA e infecções piogênicas. As linhagens patogênicas (virotipos) são classificadas pelos seus mecanismos patogênicos específicos como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXIGÊNICA), etc.
RNAs pequenos, de cadeia dupla, de codificação não proteica (21-31 nucleotídeos) envolvidos nas funções de INATIVAÇÃO GÊNICA, especialmente o RNA DE INTERFERÊNCIA (RNAi). Os siRNAs são endogenamente gerados a partir de dsRNAs (RNA DE CADEIA DUPLA) pela mesma ribonuclease, Dicer, que gera miRNAs (MICRORNAS). O pareamento perfeito das cadeias de siRNAs' antissenso com seus RNAs alvos medeia a clivagem do RNAi guiado por siRNA. Os siRNAs caem em diferentes classes, inclusive siRNA de atuação trans (tasiRNA), RNA com repetições associadas (rasiRNA), RNA de varredura pequena (scnRNA), e RNA de interação com a proteína Piwi (piRNA) e têm funções diferentes de inativação gênica específica.
Vírus cujo hospedeiro é Salmonella. Um fago de Salmonella frequentemente encontrado é o BACTERIÓFAGO P22.
Descrições de sequências específicas de aminoácidos, carboidratos ou nucleotídeos que apareceram na literatura publicada e/ou são depositadas e mantidas por bancos de dados como o GENBANK, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), National Biomedical Research Foundation (NBRF) ou outros repositórios de sequências.
Vírus cujo hospedeiro é Pseudomonas. Um fago de Pseudomonas frequentemente encontrado é o BACTERIÓFAGO PHI 6.
Processo que modifica a sequência nucleotídica do RNAm em relação àquela do molde de DNA que a codifica. Algumas classes importantes de edição de RNA são as seguintes: 1) conversão de citosina em uracila no RNAm, 2) adição de um número variável de guaninas em sítios pré-determinados e 3) adição e deleção de uracilas moldadas por RNAs guias (RNA GUIA).
Exclusão final (ultimate) de sequências "nonsense" ou de sequências intervenientes (íntrons), antes que a transcrição final do RNA seja enviada para o citoplasma.
Arranjo espacial dos átomos de um ácido nucleico (ou de um polinucleotídeo) que resulta em sua forma tridimensional característica.
Sequência de PURINAS e PIRIMIDINAS em ácidos nucleicos e polinucleotídeos. É chamada também de sequência nucleotídica.
Vírus cujo hospedeiro é Streptococcus.
A forma mais abundante de RNA; juntamente com proteínas ele forma os ribossomos, desempenhando um papel estrutural e também um papel na ligação ribossômica dos RNAm e RNAt. As cadeias individuais são designadas convencionalmente pelos seus coeficientes de sedimentação. Nos eucariotas, existem quatro grandes cadeias, sintetizadas no nucléolo e constituindo cerca de 50 por cento do ribossomo. (Dorland, 28a ed)
Ácido ribonucleico das bactérias, que tem papéis regulatórios e catalíticos, tanto quanto envolvimento na síntese proteica.
Fenômeno pelo qual um fago temperado se incorpora no DNA de um hospedeiro bacteriano estabelecendo um tipo de relação simbiótica entre o PRÓFAGO e a bactéria, resultando na perpetuação do prófago em todos os descendentes da bactéria. Sob indução (ATIVAÇÃO VIRAL) por vários agentes, como radiação ultravioleta, o fago é liberado e, então, se torna virulento e lisa a bactéria.
Grupo de enzimas que catalisa a extensão dirigida pelo DNA molde, do terminal 3'de uma fita de RNA, um nucleotídeo de cada vez. Podem iniciar uma cadeia de novo. Em eucariotos, três formas da enzima foram identificadas de acordo com a sensibilidade à alfa-amanitina e o tipo de RNA sintetizado. (Tradução livre do original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Coleção de peptídeos clonados ou quimicamente sintetizados, frequentemente constituídos por todas as combinações possíveis de aminoácidos formando um peptídeo n-aminoácido.
Vírus cujo hospedeiro é Bacillus. Fagos bacilares frequentemente encontrados incluem o bacteriófago phi 29 e o bacteriófago phi 105.
Sequências de RNA que servem como modelo para a síntese proteica. RNAm bacterianos são geralmente transcritos primários pelo fato de não requererem processamento pós-transcricional. O RNAm eucariótico é sintetizado no núcleo e necessita ser transportado para o citoplasma para a tradução. A maior parte dos RNAm eucarióticos têm uma sequência de ácido poliadenílico na extremidade 3', denominada de cauda poli(A). Não se conhece com certeza a função dessa cauda, mas ela pode desempenhar um papel na exportação de RNAm maduro a partir do núcleo, tanto quanto em auxiliar na estabilização de algumas moléculas de RNAm retardando a sua degradação no citoplasma.
Fenômeno de inativação gênica, pelo qual os RNAds (RNA DE CADEIA DUPLA) desencadeiam a degradação de RNAm homólogo (RNA MENSAGEIRO). Os RNAs de cadeia dupla específicos são processados em RNA INTERFERENTE PEQUENO (RNAsi) que serve como guia para a clivagem do RNAm homólogo no COMPLEXO DE INATIVAÇÃO INDUZIDO POR RNA. A METILAÇÃO DE DNA também pode ser desencadeada durante este processo.
RNA que consiste de duas fitas ao contrário do mais prevalente RNA de fita única. A maior parte dos segmentos de dupla fita são formados a partir da transcrição do DNA por pareamento intramolecular de sequências de bases complementares invertidas separadas por uma alça de fita única. Alguns segmentos de dupla fita de RNA ocorrem normalmente em todos os organismos.
Técnica de tipagem bacteriana que faz uma diferenciação entre bactérias ou tipos de bactérias por sua susceptibilidade a um ou mais bacteriófagos.

Fagos RNA, ou bacteriófagos de RNA, se referem a vírus que infectam bactérias e possuem genoma de ácido ribonucleico (RNA) em vez de DNA. Esses fagos têm um ciclo de vida relativamente simples, geralmente seguindo o padrão lítico, no qual eles infectam a bactéria, se replicam e produzem novos vírus, que são subsequentemente liberados quando a bactéria hospedeira se rompe (lysis).

Existem quatro principais grupos de fagos RNA, classificados com base em suas características genômicas e estruturais:

1. Levivírus: São os fagos RNA mais simples e estudados, consistindo apenas em uma cápside proteica que abriga o genoma de RNA de aproximadamente 3.500 a 4.500 nucleotídeos. Eles infectam bactérias do gênero *Escherichia coli* e outras enterobactérias.
2. Cystovírus: São fagos RNA com uma estrutura complexa, possuindo um envelope lipídico externo, cápside icosaédrica interna e genoma segmentado de dupla cadeia (dsRNA) dividido em três partes. Eles infectam bactérias do gênero *Pseudomonas*.
3. Corticovírus: São fagos RNA com uma cápside esférica rígida e genoma circular de dsRNA. Eles infectam bactérias aquáticas, como *Phaeobacter inhibens* e *Glaciecola punicea*.
4. Tectivírus: São fagos com uma cápside alongada proteica que abriga um genoma de dsRNA linear. Eles infectam bactérias do gênero *Bacillus*.

Embora os fagos RNA sejam menos conhecidos e estudados em comparação com os fagos de DNA, eles desempenham um papel importante no ecossistema bacteriano e na evolução dos vírus.

Laevívirus é um gênero de vírus que pertence à família *Leviviridae* e ordem *Caudovirales*. Esses vírus infectam bactérias e possuem um genoma de ARN de fita simples, monocistrônico, com aproximadamente 3.500 nucleotídeos. Eles não possuem envelope lipídico e têm uma cápside icosaédrica com cerca de 28 nm de diâmetro.

Os levivírus são classificados como bacteriófagos, o que significa que eles infectam e se replicam dentro de bactérias. Eles são relativamente simples em termos de estrutura e genoma, o que os torna úteis para estudos de biologia molecular e virologia.

Alguns exemplos de espécies de levivírus incluem MS2, Qβ, FR, e GA. Esses vírus foram originalmente isolados a partir de amostras de águas residuais e são capazes de infectar diferentes espécies de bactérias.

Allolevivirus é um gênero de vírus que pertence à família Picornaviridae e à ordem Picornavirales. Esses vírus têm um genoma de ARN simplesmente enrolado de sentido positivo e capsídeos icosaédricos não envelopados. O gênero Allolevivirus inclui várias espécies que infectam insetos, como moscas-da-fruta e moscas-domésticas. Esses vírus podem causar doenças em suas espécies hospedeiras, mas geralmente não são considerados uma ameaça à saúde humana ou de outros animais além dos insetos.

De acordo com a International Committee on Taxonomy of Viruses (Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus, em tradução livre), Leviviridae é uma família de vírus que infectam bactérias. Esses vírus possuem genomas de RNA de fita simples e não contêm envelope lipídico. A replicação dos vírus Leviviridae ocorre no citoplasma da célula hospedeira.

Os membros mais conhecidos dessa família são o MS2 e o Qβ, que infectam a bactéria Escherichia coli. Esses vírus têm um diâmetro de aproximadamente 27 nanômetros e sua cápside é composta por 180 cópias de uma única proteína estrutural.

Os vírus Leviviridae são importantes modelos experimentais para o estudo da replicação de RNA e da interação entre vírus e hospedeiro. No entanto, eles não são considerados um risco para a saúde humana ou animal, uma vez que infectam exclusivamente bactérias.

Colifagos são vírus que infectam e se replicam nas bactérias do gênero Escherichia, especialmente a cepa E. coli, que é encontrada no intestino humano e animal. Esses vírus não podem se multiplicar fora das células hospedeiras bacterianas e exigem um ambiente rico em nutrientes para completarem seu ciclo de vida.

Os colifagos são frequentemente usados em pesquisas laboratoriais como modelos para estudar a biologia dos vírus, pois sua estrutura genética é simples e bem compreendida. Além disso, eles desempenham um papel importante no equilíbrio da microbiota intestinal, podendo contribuir para o controle de populações bacterianas indesejadas.

Existem diferentes tipos de colifagos, classificados com base em suas características genéticas e estruturais. Alguns deles possuem cauda (filamentos alongados usados para se ligarem às células hospedeiras), enquanto outros não. A infecção por colifagos pode resultar em diferentes efeitos sobre as bactérias hospedeiras, desde a lise celular (explosão da célula) até a integração do material genético viral no genoma bacteriano.

Bacteriófago, também conhecido como fago, é um tipo de vírus que infecta e se replica exclusivamente em bactérias. Eles são extremamente comuns no ambiente e desempenham um papel importante na regulação dos ecossistemas microbianos. A infecção por bacteriófagos pode resultar em lise (destruição) da bactéria hospedeira ou, em alguns casos, a integração do genoma do fago no genoma bacteriano, formando um prophage. Alguns bacteriófagos têm sido usados como agentes terapêuticos no tratamento de infecções bacterianas, particularmente aquelas resistentes a antibióticos, numa prática conhecida como fagoterapia.

Os vírus de RNA (RNA, do inglês, Ribonucleic Acid) são um tipo de vírus que possuem genoma constituído por ácido ribonucleico. Esses vírus diferem dos vírus de DNA (Deoxyribonucleic Acid) em relação à sua replicação e transcrição, visto que os vírus de RNA geralmente utilizam o mecanismo de tradução direta do genoma para a síntese de proteínas.

Existem diferentes tipos de vírus de RNA, classificados conforme sua estrutura e ciclo de replicação. Alguns deles são:

1. Vírus de RNA de fita simples (ssRNA): Esses vírus possuem um único fio de RNA como genoma, que pode ser de sentido positivo (+) ou negativo (-). Os vírus de RNA de sentido positivo podem ser traduzidos diretamente em proteínas após a infecção da célula hospedeira, enquanto os de sentido negativo requerem a produção de uma molécula complementar antes da tradução.
2. Vírus de RNA de fita dupla (dsRNA): Esses vírus possuem dois filamentos de RNA como genoma, geralmente em configuração de "anel" ou "haste". A replicação desse tipo de vírus envolve a produção de moléculas de RNA de sentido simples intermediárias.
3. Retrovírus: Esses vírus possuem um genoma de RNA de fita simples e utilizam a enzima transcriptase reversa para converter seu próprio RNA em DNA, o qual é então integrado ao genoma da célula hospedeira.

Alguns exemplos de doenças causadas por vírus de RNA incluem: gripe (influenza), coronavírus (SARS-CoV-2, MERS-CoV e SARS-CoV), hepatite C, poliomielite, dengue, zika, ebola e raiva.

RNA viral se refere a um tipo de vírus que utiliza ácido ribonucleico (RNA) como material genético em vez de DNA. Existem diferentes tipos de vírus RNA, incluindo vírus com genoma de RNA de fita simples ou dupla e alguns deles precisam de um hospedeiro celular para completar o seu ciclo reprodutivo. Alguns exemplos de doenças causadas por vírus RNA incluem a gripe, coronavírus (SARS-CoV-2, que causa a COVID-19), dengue, hepatite C e sarampo.

RNA, ou ácido ribonucleico, é um tipo de nucleico presente em todas as células vivas e alguns vírus. Existem diferentes tipos de RNA, incluindo o RNA mensageiro (mRNA), RNA ribossomal (rRNA) e RNA de transferência (tRNA).

O mRNA é responsável por transportar a informação genética codificada no DNA para os ribossomas, onde essa informação é usada para sintetizar proteínas. O rRNA e o tRNA são componentes importantes dos ribossomas e desempenham papéis cruciais na tradução do código genético em aminoácidos durante a síntese de proteínas.

Além disso, existem outros tipos de RNA que desempenham funções regulatórias importantes no organismo, como o microRNA (miRNA), pequenos RNAs interferentes (siRNA) e RNA longo não codificante (lncRNA).

Em resumo, o RNA é uma molécula essencial para a expressão gênica e a síntese de proteínas em células vivas.

Qβ replicase, também conhecida como RNA-dependente RNA polimerase (RdRp) do fago Qβ, é uma enzima viral essencial para a replicação e transcrição do genoma de RNA do fago Qβ, um bacteriófago que infecta a bactéria Escherichia coli.

A Qβ replicase é composta por três subunidades: a subunidade grande (proteína 1), a subunidade pequena (proteína 2) e o fator de iniciação (proteína A). A subunidade grande é responsável pela atividade principal da RdRp, enquanto a subunidade pequena auxilia na replicação do RNA. O fator de iniciação é usado para iniciar a síntese do RNA no local correto do template de RNA.

A Qβ replicase catalisa tanto a replicação quanto a transcrição do genoma de RNA do fago Qβ, produzindo cópias do RNA genômico e mRNAs subgenômicos que codificam proteínas virais. A enzima é capaz de reconhecer e replicar diferentes tipos de RNA, o que a torna uma ferramenta útil em estudos biológicos e bioquímicos, especialmente na área da biologia estrutural e função das RdRps.

"Escherichia coli" (abreviada como "E. coli") é uma bactéria gram-negativa, anaeróbia facultativa, em forma de bastonete, que normalmente habita o intestino grosso humano e dos animais de sangue quente. A maioria das cepas de E. coli são inofensivas, mas algumas podem causar doenças diarreicas graves em humanos, especialmente em crianças e idosos. Algumas cepas produzem toxinas que podem levar a complicações como insuficiência renal e morte. A bactéria é facilmente cultivada em laboratório e é amplamente utilizada em pesquisas biológicas e bioquímicas, bem como na produção industrial de insulina e outros produtos farmacêuticos.

O RNA interferente pequeno (ou small interfering RNA, em inglês, siRNA) refere-se a um tipo específico de molécula de RNA de fita dupla e curta que desempenha um papel fundamental no mecanismo de silenciamento do gene conhecido como interferência de RNA (RNAi). Essas moléculas de siRNA são geralmente geradas a partir de uma via enzimática que processa o RNA de fita dupla longo (dsRNA) inicialmente, o que resulta no corte desse dsRNA em fragmentos curtos de aproximadamente 20-25 nucleotídeos. Posteriormente, esses fragmentos são incorporados em um complexo enzimático chamado de complexo RISC (RNA-induced silencing complex), que é o responsável por identificar e destruir as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) complementares a esses fragmentos, levando assim ao silenciamento do gene correspondente. Além disso, os siRNAs também podem induzir a modificação epigenética das regiões promotoras dos genes alvo, levando à sua inativação permanente. Devido à sua capacidade de regular especificamente a expressão gênica, os siRNAs têm sido amplamente estudados e utilizados como ferramentas experimentais em diversas áreas da biologia celular e molecular, bem como em potenciais terapias para doenças humanas relacionadas à expressão anormal de genes.

Fágios de Salmonella referem-se a bacteriófagos (vírus que infectam bactérias) específicos para a bactéria Salmonella. Esses fágios são usados em pesquisas científicas e, potencialmente, em terapias antimicrobianas alternativas. Eles infectam e se replicam dentro de células de Salmonella, às vezes levando ao seu lise (explosão celular) e destruição. Existem diferentes tipos de fágios de Salmonella, cada um com suas próprias características genéticas e interações com hospedeiros bacterianos específicos. Esses fágios têm sido estudados para fins de controle e prevenção de infecções por Salmonella em humanos e animais. No entanto, é importante notar que o uso clínico de fágios ainda está em estágios iniciais de pesquisa e desenvolvimento, e sua segurança e eficácia precisam ser avaliadas em estudos clínicos rigorosos.

"Dados de sequência molecular" referem-se a informações sobre a ordem ou seqüência dos constituintes moleculares em uma molécula biológica específica, particularmente ácidos nucléicos (como DNA ou RNA) e proteínas. Esses dados são obtidos através de técnicas experimentais, como sequenciamento de DNA ou proteínas, e fornecem informações fundamentais sobre a estrutura, função e evolução das moléculas biológicas. A análise desses dados pode revelar padrões e características importantes, tais como genes, sítios de ligação regulatórios, domínios proteicos e motivos estruturais, que podem ser usados para fins de pesquisa científica, diagnóstico clínico ou desenvolvimento de biotecnologia.

Fágos de Pseudomonas referem-se a bacteriófagos que infectam e se replicam nas bactérias do gênero Pseudomonas, especialmente a espécie P. aeruginosa. Esses fágos são vírus que parasitam bactérias em vez de células humanas ou animais. Eles desempenham um papel importante no equilíbrio natural dos ecossistemas microbianos e têm sido estudados como potenciais agentes terapêuticos para tratar infecções bacterianas, especialmente as resistente à antibioticoterapia. Alguns fágos de Pseudomonas possuem propriedades líticas (capazes de destruir a parede celular bacteriana) e podem ser usados em terapias farmacológicas, como a fagoterapia. No entanto, é necessário realizar mais pesquisas para compreender melhor seus mecanismos de ação e garantir sua segurança e eficácia clínica.

A edição do RNA é um processo biológico no qual se produzem modificações químicas específicas em certas moléculas de RNA após a transcrição do DNA e antes da tradução em proteínas. Essas modificações podem envolver a inserção, deleção ou alteração de uma ou mais bases no RNA, levando assim à produção de aminoácidos não codificados pela sequência original do DNA.

Existem diferentes tipos de edição de RNA, sendo o mais comum a adição ou remoção de um grupo metil em uma base de RNA. No entanto, o tipo mais estudado e bem compreendido de edição de RNA é a A-to-I editing (edição A-to-I), na qual se realiza a conversão de um nucleotídeo adenosina (A) em um nucleotídeo inosina (I). Essa modificação é catalisada por uma enzima chamada ADAR (adenosine deaminase acting on RNA), que remove o grupo amino do nitrogénio da base adenosina, convertendo-a em inosina.

A edição de RNA desempenha um papel importante na regulação gênica e na diversificação das proteínas produzidas a partir de um único gene. Além disso, está associada à patogênese de várias doenças neurológicas e neoplásicas, tornando-se assim um alvo potencial para o desenvolvimento de terapias.

O Processamento do RNA, ou maturação do RNA, refere-se a um conjunto de modificações e manipulações que ocorrem em diferentes tipos de moléculas de RNA (ácido ribonucleico) imediatamente após a transcrição do DNA para RNA. Estes processos incluem:

1. Capping (ou capilarização): Adição de uma estrutura modificada, chamada "cap", à extremidade 5' da molécula de RNA. Essa modificação protege a molécula de RNA contra degradação enzimática e facilita o transporte do RNA para o citoplasma e sua tradução em proteínas.

2. Tail (ou cauda): Adição de uma sequência de repetições de nucleotídeos de uridina, chamada "poly(A) tail" ou simplesmente "tail", à extremidade 3' da molécula de RNA. Essa modificação também protege a molécula de RNA contra degradação enzimática e facilita sua exportação para o citoplasma e tradução em proteínas.

3. Splicing (ou processamento do empalme): Remoção de intrões, ou sequências não-codificantes, presentes no RNA pré-mRNA (RNA mensageiro primário) e junção das sequências codificantes (exões) restantes. Isso gera uma molécula de RNA mensageiro maduro, capaz de ser traduzida em proteínas.

4. Edição do RNA: Alterações pontuais na sequência de nucleotídeos do RNA, como a adição, remoção ou modificação de um único nucleotídeo. Essas alterações podem resultar em mudanças na sequência de aminoácidos da proteína final e, consequentemente, em sua estrutura e função.

5. Modificações no RNA: Alterações químicas nas bases do RNA, como a metilação ou a hidroxilação, que podem influenciar na estabilidade da molécula de RNA, na sua interação com outras moléculas e no processo de tradução.

Esses processos de maturação do RNA são essenciais para a geração de proteínas funcionais e estão intimamente relacionados com a regulação da expressão gênica. Defeitos nesses processos podem resultar em diversas doenças genéticas, como distúrbios neurológicos, síndromes congênitas e câncer.

A "conformação de ácido nucleico" refere-se à estrutura tridimensional que um ácido nucleico, como DNA ou RNA, assume devido a interações químicas e físicas entre seus constituintes. A conformação é essencialmente o "enrolamento" do ácido nucleico e pode ser influenciada por fatores como sequência de base, nível de hidratação, carga iônica e interações com proteínas ou outras moléculas.

No DNA em particular, a conformação mais comum é a dupla hélice B, descrita pela primeira vez por James Watson e Francis Crick em 1953. Nesta conformação, as duas cadeias de DNA são antiparalelas (direções opostas) e giram em torno de um eixo comum em aproximadamente 36 graus por pares de bases, resultando em cerca de 10 pares de bases por volta da hélice.

No entanto, o DNA pode adotar diferentes conformações dependendo das condições ambientais e da sequência de nucleotídeos. Algumas dessas conformações incluem a dupla hélice A, a hélice Z e formas triplex e quadruplex. Cada uma destas conformações tem propriedades únicas que podem influenciar a função do DNA em processos biológicos como replicação, transcrição e reparo.

A conformação dos ácidos nucleicos desempenha um papel fundamental na compreensão de sua função e interação com outras moléculas no contexto celular.

Uma "sequência de bases" é um termo usado em genética e biologia molecular para se referir à ordem específica dos nucleotides (adenina, timina, guanina e citosina) que formam o DNA. Essa sequência contém informação genética hereditária que determina as características de um organismo vivo. Ela pode ser representada como uma cadeia linear de letras A, T, G e C, onde cada letra corresponde a um nucleotide específico (A para adenina, T para timina, G para guanina e C para citosina). A sequência de bases é crucial para a expressão gênica, pois codifica as instruções para a síntese de proteínas.

Fágios de Streptococcus referem-se a bacteriófagos específicos que infectam e se replicam nas bactérias do género Streptococcus. Os bacteriófagos, também conhecidos como fágios, são vírus que infectam exclusivamente bactérias. Eles desempenham um papel importante em regulamentar a dinâmica das populações bacterianas e podem contribuir para a diversidade genética dos streptococos. Alguns fágios de Streptococcus têm sido estudados como potenciais agentes terapêuticos no tratamento de infecções por streptococos resistentes a antibióticos. No entanto, é importante notar que existem diferentes espécies e cepas de streptococos, e cada uma pode ser suscetível a diferentes fágios específicos.

RNA ribossomal (rRNA) se refere a um tipo específico de ácido ribonucleico presente nos ribossomas, as estruturas citoplasmáticas envolvidas na síntese proteica. Os rRNAs desempenham um papel crucial no processo de tradução, que consiste em transformar a informação genética contida no mRNA (ácido ribonucleico mensageiro) em uma cadeia polipeptídica específica.

Existem diferentes tipos e tamanhos de rRNAs, dependendo do organismo e do tipo de ribossoma em que estão presentes. Em células eucarióticas, os ribossomas possuem quatro moléculas de rRNA distintas: a subunidade maior contém um rRNA 28S, um rRNA 5,8S e um rRNA 5S, enquanto que a subunidade menor contém um rRNA 18S. Já em células procarióticas, os ribossomas possuem três tipos de rRNAs: a subunidade maior contém um rRNA 23S e um rRNA 5S, enquanto que a subunidade menor contém um rRNA 16S.

Além da síntese proteica, os rRNAs também desempenham outras funções importantes, como ajudar na formação e estabilização da estrutura do ribossoma, participar na iniciação, elongação e terminação da tradução, e interagir com outros fatores envolvidos no processo de tradução. Devido à sua importância funcional e estrutural, os rRNAs são frequentemente usados como marcadores moleculares para estudar a evolução e filogenia de organismos.

O RNA bacteriano se refere ao ácido ribonucleico encontrado em organismos procariotos, como bactérias. Existem diferentes tipos de RNA bacterianos, incluindo:

1. RNA mensageiro (mRNA): é responsável por transportar a informação genética codificada no DNA para as ribossomos, onde é traduzida em proteínas.
2. RNA ribossômico (rRNA): é um componente estrutural e funcional dos ribossomos, que desempenham um papel fundamental no processo de tradução da síntese de proteínas.
3. RNA de transferência (tRNA): é responsável por transportar os aminoácidos para o local de síntese de proteínas nos ribossomos, onde são unidos em uma cadeia polipeptídica durante a tradução do mRNA.

O RNA bacteriano desempenha um papel crucial no metabolismo e na expressão gênica dos organismos procariotos, sendo alvo de diversos antibióticos que interferem em seu processamento ou funcionamento, como a rifampicina, que inibe a transcrição do RNA bacteriano.

Lisogenia é um processo em que um bacteriófago (vírus que infecta bactérias) integra seu DNA circular no cromossomo da bactéria hospedeira. Neste estado, o bacteriófago é denominado profago e a bactéria é chamada de lisogênica. O profago pode permanecer inativo por gerações, sendo copiado junto com o DNA da bactéria durante a divisão celular. Em determinadas condições, o profago pode ser induzido a se replicar e produzir novos vírus, levando à lise (destruição) da célula hospedeira. Esse processo é chamado de lisogenia a lise.

RNA polimerases dirigidas por DNA são enzimas essenciais para a transcrição do DNA em RNA. Eles são responsáveis pela síntese de RNA usando uma sequência de DNA como modelo. Existem três tipos principais de RNA polimerases em procariotos: RNA polimerase I, II e III, cada um dos quais é responsável por transcribir diferentes genes. Em eucariotos, existem três tipos principais de RNA polimerases também: RNA polimerase I, II e III, que são responsáveis pela transcrição de genes específicos em diferentes compartimentos celulares. A RNA polimerase II, por exemplo, é a enzima responsável pela transcrição dos genes que codificam para proteínas.

A RNA polimerase se liga à molécula de DNA no local chamado promotor e desliza ao longo da molécula de DNA até encontrar o início do gene a ser transcrito. Em seguida, a enzima começa a adicionar nucleotídeos de RNA à cadeia em crescimento, baseada na sequência de pares de bases no DNA. A RNA polimerase é capaz de ler a informação genética codificada no DNA e usá-la para criar uma cópia de RNA complementar.

A atividade da RNA polimerase é altamente regulada em células vivas, pois o processo de transcrição é um ponto crucial na regulação da expressão gênica. A ativação ou inibição da RNA polimerase pode afetar a taxa de produção de proteínas e, portanto, desempenhar um papel importante no controle dos processos celulares.

Uma "peptide library" (biblioteca de peptídeos) é um conjunto de diferentes peptídeos, que são moléculas formadas por ligações de aminoácidos. Essa ferramenta é amplamente utilizada em pesquisas biológicas e medicinais para identificar potenciais ligantes ou inibidores de proteínas-alvo, uma vez que os peptídeos podem se associar especificamente a determinados sítios de ligação em proteínas.

A biblioteca de peptídeos pode ser criada por meio de diferentes estratégias, como síntese aleatória ou combinatória, onde um grande número de variações de sequências de aminoácidos é gerado e testado em busca de interações desejadas. Essas bibliotecas podem ser compostas por milhares a milhões de diferentes peptídeos, cada um com uma sequência única de aminoácidos.

A análise dessas interações pode levar ao desenvolvimento de fármacos ou terapêuticas mais específicas e eficazes, visando tratar doenças ou condições médicas. Além disso, as bibliotecas de peptídeos também podem ser úteis em estudos estruturais e funcionais de proteínas, ajudando a elucidar mecanismos moleculares e interações entre biomoléculas.

Em termos médicos, "bacillary phages" referem-se a bacteriófagos específicos que infectam e se replicam em bactérias do género Bacillus. Bacteriófagos, ou simplesmente fagos, são vírus que infectam e se replicam exclusivamente em bactérias. Os fagos bacilares estão adaptados a infectar bactérias com forma de bastonete (bacilos) do género Bacillus, como a Bacillus anthracis (a causa da antrax) e a Bacillus subtilis (que é frequentemente usada em pesquisas laboratoriais).

A infecção por fagos bacilares geralmente resulta na lise (explosão) das células bacterianas hospedeiras, levando à libertação de novos fagos no meio ambiente. Estes fagos podem então infectar outras bactérias Bacillus, continuando o ciclo de replicação viral. Os fagos bacilares têm sido estudados como potenciais agentes terapêuticos no tratamento de infecções bacterianas, especialmente aquelas resistentes a antibióticos. No entanto, é importante notar que o uso de fagos em terapia clínica ainda está em fase experimental e requer mais pesquisas antes de ser amplamente aplicado na prática médica.

RNA mensageiro (mRNA) é um tipo de RNA que transporta a informação genética codificada no DNA para o citoplasma das células, onde essa informação é usada como modelo para sintetizar proteínas. Esse processo é chamado de transcrição e tradução. O mRNA é produzido a partir do DNA através da atuação de enzimas específicas, como a RNA polimerase, que "transcreve" o código genético presente no DNA em uma molécula de mRNA complementar. O mRNA é então traduzido em proteínas por ribossomos e outros fatores envolvidos na síntese de proteínas, como os tRNAs (transportadores de RNA). A sequência de nucleotídeos no mRNA determina a sequência de aminoácidos nas proteínas sintetizadas. Portanto, o mRNA é um intermediário essencial na expressão gênica e no controle da síntese de proteínas em células vivas.

A interferência de RNA (RNAi) é um mecanismo de silenciamento gênico em células eucariontes que envolve a inativação ou degradação de moléculas de RNA mensageiro (mRNA) para impedir a tradução do mRNA em proteínas. Isto é desencadeado pela presença de pequenas moléculas de RNA duplas chamadas siRNAs (pequenos RNAs interferentes) ou miRNAs (miRNAs, microRNAs), que se assemelham a parte do mRNA alvo. Esses pequenos RNAs se associam a um complexo proteico chamado de complexo RISC (Complexo da Argonauta associado ao RNA interferente), o qual é capaz de reconhecer e clivar o mRNA alvo, levando à sua destruição e, consequentemente, à inibição da síntese proteica. A interferência de RNA desempenha um papel importante na regulação gênica, defesa contra elementos genéticos móveis (tais como vírus) e desenvolvimento embrionário em organismos superiores.

RNA de cadeia dupla (dsRNA) se refere a um tipo de molécula de RNA que tem duas cadeias complementares, formando uma estrutura secundária em duplex. Normalmente, o RNA é encontrado como uma única cadeia simples, mas existem situações específicas em que as moléculas de RNA podem se emparelhar e formar uma estrutura em duplex.

A formação de dsRNA pode ocorrer naturalmente em células, por exemplo, no caso dos intrões não-codificantes que são processados ​​para formar RNAs de cadeia dupla intermediários durante a maturação do RNA. Além disso, alguns vírus possuem genomas de RNA de cadeia dupla.

O dsRNA também pode ser sintetizado artificialmente e usado em pesquisas laboratoriais como uma ferramenta para silenciar genes específicos por meio do mecanismo de interferência de RNA (RNAi). Neste processo, a dsRNA é cortada em pequenos fragmentos de RNA dupla curta (dsRNA short), que então se ligam a enzimas específicas chamadas dicer. Esses fragmentos são posteriormente usados ​​para guiar a destruição das moléculas de mRNA complementares, o que leva à diminuição da expressão gênica do gene alvo.

La tipagem de bacteriófags, também conhecida como fagotipagem, é um método utilizado em microbiologia para classificar e identificar diferentes cepas de bacteriófagos (vírus que infectam bactérias) com base em suas características fenotípicas. Isto inclui a análise da sua capacidade de produzir plaques claras ou turvas sobre uma camada bacteriana lactose fermentadora (LAF), o tamanho e forma dos plaques, a sensibilidade a diferentes temperaturas e a capacidade de transferência de genes de resistência a antibióticos entre as bactérias hospedeiras.

A tipagem de bacteriófagos é uma ferramenta importante em estudos de epidemiologia e controle de infecções, pois permite identificar rapidamente e com precisão diferentes cepas de bacteriófagos presentes em amostras clínicas ou ambientais. Além disso, a tipagem de bacteriófagos pode ser utilizada para estudar a diversidade genética e evolutiva de diferentes populações de bacteriófagos, o que pode fornecer informações importantes sobre a ecologia e a dinâmica das interações entre bactérias e seus vírus infectantes.

... que apresenta atividade de RNA helicase. Terminadores Rho-dependentes são encontrados em bactérias e fagos. A sequência ... a unidade da RNA polimerase ,,. Dessa forma a RNA polimerase ,, é dissociada do DNA e o RNA residual é removido. De forma ... Enquanto a exonuclease degrada assim o RNA, ela vai se aproximando à RNA polimerase ,,. Em humanos esta exonuclease é chamada ... do outro lado do corte a fita de RNA continua ligada ao DNA e à unidade da RNA polimerase II, que não para de transcrever o DNA ...
Em primeiro lugar, o DNA é separado a partir de componentes celulares, tais como proteínas, RNA, e lípidos. Isto é feito ... clonagem e sequenciação expressão génica medida regulação espacial e temporal cDNA imprinting bactérias e fagos em genética ... Ele contém enzimas para dissolver proteínas, produtos químicos para destruir todos os RNA presentes, e sais para ajudar a puxar ... Estudo de macromoléculas importantes na herança biológica rastreios genéticos interferência por RNA gene nocaute transgénicos e ...
A ribonuclease e o processo de interferência RNA estão presentes em todos os eukaryota, e pensa-se que tenham um papel na ... ou fagos. Os procariontes também possuem imunidade adquirida através de um sistema que usa sequências CRISPR para conservar ... Os mecanismos de silenciamento de RNA são particularmente importantes para esta resposta sistémica, uma vez que são capazes de ... como as que digerem a dupla hélice de RNA típica dos vírus) e aumentam também a apresentação de péptidos internos nos MHC I aos ...
Essential Features and Rational Design of CRISPR RNAs that Function with the Cas RAMP Module Complex to Cleave RNAs». Molecular ... Com a edição do gene alvo e ação das enzimas Cas, há o controle do espaçador e defesa contra fagos. Tal procedimento permite o ... RNA guia) que consiste na construção de uma molécula de RNA desenvolvida biotecnologicamente, com a capacidade de mimetizar o ... CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III». Nature. 471 (7340). PMID 21455174. doi:10.1038/ ...
Uma conquista foi a descoberta de como fazer RNA sintético. Se os nucleotídeos do RNA são misturados com uma enzima especial ( ... Os fagos mutantes de Brenner têm uma segunda característica interessante em comum além de uma proteína mais curta: a presença ... O primeiro mensageiro sintético obtido foi feito apenas com nucleotídeos uracil reagindo com a enzima de síntese de RNA, ... polinucleotídeo fosforilase) , um RNA unifilamentar é formado na reação. Ao contrário da transcrição, nenhum molde de DNA é ...
Ver artigo principal: Viroide Viroides são moléculas de RNA infeccioso que diferem dos vírus pelo fato de serem desprovidos de ... Bacteriófagos são vírus, também conhecidos como fagos, que infectam bactérias e geralmente levam à morte da bactéria infectada ... Eles não contêm nenhuma informação genética (DNA ou RNA), mas "replicam-se" pela conversão de proteínas normais, codificados ... Os viroides correspondem a pequenas moléculas circulares de RNA de fita simples, estando entre os menores patógenos conhecidos ...
1952 - A experiência de Hershey-Chase prova que a informação genética de fagos e de todos os outros organismos é composto por ... 1964 - Howard Temin mostra, usando vírus de RNA, que o dogma central de Watson não é sempre verdade. 1965 - François Jacob, ...
RNA). Já os membros do I (dsDNA-RT) replicam o seu genoma a partir de um intermediário de RNA (DNA → RNA → DNA). A montagem ... Ele utilizou os fagos para o tratamento de doenças bacterianas e fundou diversos institutos de fagos em vários países. ... os RNAs interferentes defectivos (DI-RNAs) e os príons: Vírus satélites: são moléculas de DNA ou RNA viral que carecem de ... Vírus RNA dupla fita (dsRNA); Grupo IV: Vírus RNA fita simples senso positivo ((+)ssRNA); Grupo V: Vírus RNA fita simples senso ...
O exemplo mais comum é o caso dos bacteriófagos (ou fagos) que infetam bactérias e utilizam-nas para se multiplicar. Um tipo ... DNA ou RNA). A desintegração da membrana, que provoca a morte da célula, pode ser induzida por agentes químicos, físicos e ...
... coli recebeu fagos marcados com 32P e a outra recebeu fagos marcados com 35S. Decorrido tempo suficiente para que ocorresse a ... PMID 1914495 Basu H, Feuerstein B, Zarling D, Shafer R, Marton L (1988). «Recognition of Z-RNA and Z-DNA determinants by ... Exceções para esta regra são os fagos AR9, 3NT, I10, bem como o PBS1 (muito utilizado em pesquisas), que contém uracila no seu ... Na natureza, estas enzimas protegem as bactérias contra as infecções de fagos, ao digerir o ADN do fago quando entra através da ...
O DNA por si só não pode criar uma célula viável: proteínas e RNAs são necessários para a leitura do DNA e membranas lipídicas ... pseudogenes e fagos, resultando em melhor manutenção de genes tóxicos codificados por plasmídeo, que geralmente são inativados ...
Além isso, acredita-se que estes vírus primordiais carregariam RNA ao invés de DNA, dado que a molécula de RNA permite o ... existem mecanismos imunes em bactérias que só são ativados com a percepção de determinados sinais moleculares de fagos. Ou seja ... Desta forma, seria possível que moléculas de RNA existentes antes de células tenham sido capazes de infectar as primeiras ... componentes do genoma de eucariontes que se locomovem através do genoma com o auxílio de um RNA. Além disso, retrotransposãos ...
... "pela exibição em fagos de peptídeos e anticorpos". Isso fez de Frances a primeira mulher estadunidense a receber o Prêmio Nobel ... não se espalhou via DNA ou RNA, como uma doença viral ou bacteriana. A descoberta permitiu que os cientistas entendessem melhor ...
... que apresenta atividade de RNA helicase. Terminadores Rho-dependentes são encontrados em bactérias e fagos. A sequência ... a unidade da RNA polimerase ,,. Dessa forma a RNA polimerase ,, é dissociada do DNA e o RNA residual é removido. De forma ... Enquanto a exonuclease degrada assim o RNA, ela vai se aproximando à RNA polimerase ,,. Em humanos esta exonuclease é chamada ... do outro lado do corte a fita de RNA continua ligada ao DNA e à unidade da RNA polimerase II, que não para de transcrever o DNA ...
RNA ou DNA) Caracterização da estrutura do capsídeo (microscopia eletrônica). Ensaios biológicos para determinar a capacidade ... Isolamento de fagos que infectam Ralstonia solanacearum; Determinação do tipo de material genético ( ... Isolamento de fagos que infectam Ralstonia solanacearum; Determinação do tipo de material genético (RNA ou DNA) Caracterização ... da estrutura do capsídeo (microscopia eletrônica). Ensaios biológicos para determinar a capacidade inibitória dos fagos ...
de Radiologia, está estudando o uso do micro-RNA no combate à possível mutação de genes durante a destruição de tumores guiada ... Ran Nir-Paz, que está investigando fagos, os vírus que destroem bactérias; Dr. Hamutal Gur-Erenfeld, que estuda mieloma ... de milhares de amostras genéticas serão estudadas como parte de um esforço para criar um tipo de terapia genética na qual o RNA ...
28 RNA fita dupla: ex.: reovírus. DNA fita simples: ex.: fagos, FX174, S13, M13, parvovírus. 29 30 Experimento de ... 6 TIPOS DE RNA RNA FUNÇÃO snRNAs (pequenos RNA nucleares - do inglês small nuclear RNA) scRNAs (pequenos ... 4 RNA - MOLÉCULA TIPOS DE RNA RNA FUNÇÃO Informacional: codificam cadeias mRNAs (RNAs polipeptí ... SnoRNAs (pequenos RNAs encontrados nos nucléolos) Envolvidos no processamento do rRNA. RNA I (RNA iniciador ou primer) ...
Fagos RNA * Cystoviridae [B04.123.691.230] Cystoviridae * Bacteriófago phi 6 [B04.123.691.230.070] ...
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... Os retrovírus são um grupo de vírus de RNA que se replicam para produzir DNA a... ... Os retrovírus são um grupo de vírus de RNA que se replicam para produzir DNA a partir do RNA, usando uma enzima denominada ... Bacteriófagos, também chamados de fagos, são vírus que apresentam a capacidade de infectar bactérias, as quais são utilizadas ... Retrovírus: formados por RNA, por exemplo o vírus HIV. Arbovírus: transmitidos por insetos, por exemplo o vírus da dengue. ...
Na PhageLab® desenvolvemos soluções personalizadas baseadas em fagos para o controle de bactérias em processos de reprodução na ...
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O trabalho de Charpentier e equipe identificou outro componente do sistema Crispr, uma molécula de RNA. É esse entendimento que ... se defendem da infecção de um vírus chamados fagos. Com o sistema Crispr, esses seres conseguem reconhecer com precisão as ...
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Fagos Estreptocócicos use Fagos de Streptococcus Fagos lambda-Like use Siphoviridae Fagos RNA ...
Ele aborda a forma de orientar a coevolução entre fagos e bactérias para a concepção de estratégias terapêuticas bem-sucedidas. ... RNA) até rearranjos conformacionais em grande escala em máquinas moleculares. ...
  • Este tipo de sequência desencadeia processos que liberam o RNA recém-transcrito do complexo transcricional, composto por mRNA, DNA, RNA polimerase e fatores associados. (wikipedia.org)
  • Determinação do tipo de material genético (RNA ou DNA) Caracterização da estrutura do capsídeo (microscopia eletrônica). (mackenzie.br)
  • Dezenas de milhares de amostras genéticas serão estudadas como parte de um esforço para criar um tipo de terapia genética na qual o RNA é editado. (hadassahbrasil.org)
  • Daí, o DNA ou RNA do vírus vai caracterizar o tipo de infecção e doença. (treinamento24.com)
  • Ensaios biológicos para determinar a capacidade inibitória dos fagos isolados. (mackenzie.br)
  • Bacteriófagos , também chamados de fagos, são vírus que apresentam a capacidade de infectar bactérias, as quais são utilizadas para o processo de replicação viral. (treinamento24.com)
  • Eles requerem a formação de uma estrutura "hairpin" (grampo de cabelo) no transcrito que está sendo formado, que estimula a dissociação do complexo de transcrição formado por mRNA, DNA e RNA polimerase. (wikipedia.org)
  • A estrutura "hairpin" causa a estagnação e desestabilização da RNA polimerase, o qual leva a uma maior probabilidade de ocorrer a dissociação do complexo de transcrição nesse local. (wikipedia.org)
  • Além disso, o fator de elongação protéica NusA interage com a RNA polimerase e com a estrutura "hairpin" para estimular a terminação transcripcional. (wikipedia.org)
  • Após o corte, uma enzima com função exonuclease se liga à fita residual de RNA e remove um por um nucleotídeos os recém-transcritos. (wikipedia.org)
  • No caso dos terminadores de transcrição dependentes de Rho, a terminação requer a presença de uma grande proteína chamada fator Rho, que apresenta atividade de RNA helicase. (wikipedia.org)
  • Na PhageLab® desenvolvemos soluções personalizadas baseadas em fagos para o controle de bactérias em processos de reprodução na indústria avícola, pecuária e aquícola, reduzindo o uso de antibióticos para controlar doenças. (phage-lab.com)