In E. coli esistono almeno 4 diverse topoisomerasi, identificate con numeri romani da I a IV. Le topoisomerasi I e III sono di tipo I, mentre quelle II e IV sono di tipo II. La topoisomerasi II batterica, detta anche
DNA girasi, è bersaglio di numerosi antibiotici che inibiscono preferenzialmente lenzima procariotico piuttosto che quello eucariotico: la
novobiocina blocca il legame girasi-ATP, mentre lacido nalidixico e la ciprofloxacina interferiscono con la separazione e la ricongiunzione delle catene di
DNA. Questi antibiotici sono largamente utilizzati soprattutto nel trattamento delle infezioni del tratto urinario. Tra le topoisomerasi delle cellule eucariotiche, le topoisomerasi I e III sono entrambe del tipo I. Esse rilassano il
DNA rimuovendo i superavvolgimenti negativi (aumentando Lk). Le topoisomerasi IIα e IIβ, entrambe di tipo II, non riescono a introdurre superavvolgimenti negativi nel
DNA come invece possono fare le topoisomerasi batteriche di tipo II, ma possono indurre il ...