La Cis-Trans-Isomerasi è un tipo specifico di isomerasi, che sono enzimi che catalizzano la conversione di uno stereoisomero in un altro senza alterare il numero o il tipo di atomi nella molecola. Nello specifico, una Cis-Trans-Isomerasi catalizza la conversione tra cis e trans isomeri di una data molecola.
I cis e i trans isomeri sono forme stereoisomere di una stessa molecola che differiscono solo nella disposizione spaziale dei loro sostituenti attorno a un doppio legame carbono-carbonio. Nel cis isomero, i due sostituenti sullo stesso lato del doppio legame sono uguali o simili tra loro, mentre nel trans isomero, i due sostituenti opposti sono uguali o simili tra loro.
Le Cis-Trans-Isomerasi svolgono un ruolo importante in molte reazioni biochimiche, compresa la biosintesi di proteine, lipidi e altri importanti composti biologici. Ad esempio, l'enzima retinale isomerasi è una Cis-Trans-Isomerasi che catalizza la conversione del retinal cis in retinal trans, un passaggio chiave nella visione.