RNA Cleavage
Single-Strand Specific DNA and RNA Endonucleases
Enzimi in grado di catalizzare la endonucleolytic spaiati regioni di molecole di DNA o RNA a doppio filamento mentre lasciavamo i regioni intatta. Sono particolarmente utili in laboratorio per la produzione di "blunt-ended" DNA le molecole di DNA con spaiati finisce e tecniche genetico per sensibile come protezione nucleasi test che implicano il rilevamento di spaiati DNA e RNA.
Endonucleasi
Desossiribonucleasi Di Tipo Ii Sito-Specifica
Subunità sistemi contenenti un singolo enzima e che necessitano solo magnesio per endonucleolytic. La relativa modifica Methylases sono diversi enzimi. I sistemi riconosce brevi sequenze di DNA specifico e aderiscono either within, o a breve distanza, il riconoscimento specifica sequenza di dare specifiche frammenti a doppia catena terminale 5 '-phosphates. Enzimi da diversi microrganismi con la stessa specificità sono chiamati isoschizomers. CE 3.1.21.4.
Enzimi Di Restrizione Del Dna
Enzimi che sono parte del Restriction-Modification sistemi endonucleolytic catalizzare la scollatura di sequenze di DNA che manca la metilazione specie-specifico schema il DNA della cellula ospite. Scollatura o specifici dei frammenti casuali a doppia catena terminale 5 '-phosphates. La funzione di enzimi di restrizione era eliminare ogni DNA estraneo che invade la maggior parte sono state studiate in sistemi batterici, ma pochi sono stati trovati in eukaryotic organismi. Sono anche usati come strumenti per la dissezione sistematico e la mappatura dei cromosomi, nella determinazione delle sequenze di base di diversi DNA, e aver reso possibile collegare e da un organismo si ricombinano geni nel genoma di un'altra. CE 3.21.1.
Sequenza Base
Rna
Polynucleotide essenzialmente si trattava di un consistente con un ripetendo spina dorsale del fosfato e Ribosio unità a cui nitrogeni basi sono attaccate. RNA e 'l'unico tra macromolecules biologico come quello di codificare informazioni genetiche, servili come componente strutturale un'abbondante di cellule, e possiede anche l ’ attività catalitica. (Rieger et al., glossary of Genetics: Classico e cura di),
Dna
Un polimero deossiribonucleotide è il principale materiale genetico delle cellule eucariotiche procariote. E tutti gli organismi normalmente contiene DNA in uno Stato a doppia catena, eppure diversi importanti processi biologici temporaneamente coinvolgere spaiati regioni. DNA, che consiste in una proiezioni polysugar-phosphate spina dorsale possiede delle purine (adenina, guanina, citosina e timina pyrimidines (e), forma una doppia elica che e 'tenuto insieme da legami idrogeno tra questi purine e pyrimidines (adenina a timina e guanina, citosina).
DNA Breaks, Single-Stranded
Polimorfismo Conformazionale Del Dna A Singolo Frammento
Variazione in una popolazione 'sequenza di DNA che è stata rilevata da determinare modifiche delle la conferma di denaturato frammenti di DNA. DNA denaturato possono renature in condizioni che prevengono la formazione di DNA a doppia catena e struttura secondaria a formarsi nel singolo bloccati frammenti. Questi frammenti sono poi passate Polyacrylamide gel per rilevare variazioni nella seconda struttura che si manifesta come un ’ alterazione della migrazione attraverso i filtri.
Dna A Singola Elica
Dati Di Sequenza Molecolare
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Endodesossiribonucleasi
Piccoli Rna Di Interferenza
Piccola, a doppio filamento codificante 21-31 non-protein RNAS (nucleotide) implicate nella Ehi zittire funzioni, soprattutto RNA interferenze (RNAi). Endogenously, siRNAs sono generati da dsRNAs (RNA a doppio filamento) dallo stesso Ribonuclease, Dicer, che genera miRNAs (MICRORNAS). La coppia perfetta del siRNAs 'antisense di concreto il loro obiettivo RNAS media l ’ RNA RNAi da siRNA-guided cleavage. siRNAs cadere in classi diverse incluso trans-acting breve RNA interferente (tasiRNA), repeat-associated RNA (rasiRNA), small-scan RNA (scnRNA) e Piwi protein-interacting RNA (piRNA) hanno diversi gene specifico zittire funzioni.
Riparazione Del Dna
La ricostruzione di un continuo two-stranded molecola di DNA senza disallineamento da una molecola che conteneva danneggiata regioni. I principali meccanismi di riparazione escissione riparazione, nelle quali regioni difettoso in un solo filo sono asportato, e resynthesized utilizzando le informazioni complementari accoppiamento delle basi intatto filamento; photoreactivation riparare, nel quale il letale e effetti mutageni di raggi ultravioletti vengono eliminati; e post-replication riparazione primaria, in cui le lesioni non sono riparata, ma la distanza tra una figlia duplex sono occupati per incorporazione di porzioni delle altre (intatta) figlia duplex. Una recisione riparazione e post-replication riparare sono talvolta indicato come "dark conservare" perche 'non ci serve luce.
Conformazione Dell'Acido Nucleico
Rna Splicing
Rna Ribosomiale
Il più comune forma di RNA. Insieme con le proteine, forma la ribosomi. Esse svolgono un ruolo strutturali e anche un ruolo nel legame ribosomiale del mRNA, sia tRNAs. Singolo catene sono convenzionalmente designato dalla loro coefficienti di sedimentazione. In eukaryotes, quattro grandi catene esiste, creati nell'Nucleolus rappresentano circa il 50% e del ribosoma. Dorland, 28 (M)
Editing Dell'Rna
Un processo che cambia la sequenza di nucleotidi del mRNA da quello del DNA che codificano alcuni classi principali di RNA montaggio sono come segue: 1, la conversione di citosina con Uracile in mRNA; 2, l ’ aggiunta di variabile numero di siti guanines al predeterminato; e 3, l 'aggiunta e cancellazione degli uracils, modellata dalle, guide-RNAs (RNA).
Escherichia Coli
Una specie di, Facultatively anaerobi gram-negativi, forma a bastoncino batteri (anaerobi Gram-negativi Facultatively RODS) comunemente trovato nella parte inferiore dell ’ intestino di gli animali a sangue caldo. Di solito si nonpathogenic, ma alcuni ceppi sono nota per avere la diarrea e infezioni piogeno. Ceppi (patogeni virotypes) sono classificati in base al patogeno specifici meccanismi quali tossine (Enterotoxigenic Escherichia coli), ecc.
Rna Batterico
DNA Cleavage
Una reazione che separi uno dei collegamenti tra sugar-phosphate covalente nucleotidi che compongono lo zucchero fosfato spina dorsale di DNA. È catalizzato con metodi enzimatici, chimicamente o dalle radiazioni. Scollatura può essere exonucleolytic - rimuovere la fine nucleotide, o endonucleolytic - dividere il filamento in due.
Specificità Del Substrato
Proteine Leganti Dna
Desossiribonucleasi
Plasmidi
Mutazione
Danni Al Dna
Ferite di DNA che presentarvi deviazioni dalle sue normali, intatta e la struttura che può, se lasciato intoccato, porterebbe ad una MUTATION o un blocco di processi di replicazione. Questi scostamenti possono essere causate da agenti chimici e fisici o avvenire per circostanze naturali o innaturali, presentati e includono l 'introduzione di basi illegittimo nella replicazione o deaminazione o altra modifica di alcune basi; la perdita di una base dalla spina dorsale lasciando un DNA abasic sito, associati alla proteina; doppio filamento rompe; e (intrastrand dimers) o delle pirimidine interstrand crosslinking. Danno spesso puo' essere riparato (DNA) RIPARAZIONE. Se il danno è esteso, può indurre apoptosi.
Reazione Di Polimerizzazione A Catena
Metodo in vitro per la produzione di grandi quantità di frammenti di DNA o RNA specifici definiti lunghezza e la sequenza di piccole quantità di breve analisi Di Sequenze sequenze di supporto (inneschi). Il passi essenziali includono termico la denaturazione del bersaglio a doppio filamento molecole annealing degli inneschi al loro sequenze complementari e l 'estensione della ritemprate enzimatica inneschi per la sintesi di DNA polimerasi. La reazione è efficiente, in particolare, ed estremamente sensibile. Usa la reazione comprendono la diagnosi di malattie, la valutazione della mutazione difficult-to-isolate patogeni, analisi, test genetici, sequenza del DNA, analizzando le relazioni evolutivo.
Ibridazione Dell'Acido Nucleico
Tecnica diagnostica largamente impiegata che sfrutta la capacità delle sequenze di DNA complementari spaiati o RNAS accoppiare con gli altri per formare una doppia elica. Ibridazione può avvenire tra due sequenze di DNA in omaggio, tra il DNA e RNA un filamento spaiato complementari, o tra due RNA sequenze. La tecnica è indicato per rilevare e isolare specifico sequenze, misurare omologia, o definire altre caratteristiche di uno o di entrambi i fasci. (Kendrew, Enciclopedia di biologia molecolare, 1994, p503)
Deossiribonucleasi Iv (Indotta Da Fago T4)
Sequenza Aminoacidica
Siti Di Legame
Rna Polimerasi Dna Dipendente
Enzimi in grado di catalizzare DNA template-directed estensione della 3 '... - Fine della un filamento di RNA un nucleotide alla volta. Possono iniziare una catena de novo eukaryotes. In tre documenti dell ’ enzima, sono state distinte sulla base della sensibilità alla alpha-amanitin e dal tipo di RNA sintetizzata. (Dal Enzyme nomenclatura, 1992).
Dna-(Sito Apurinico O Apirimidinicoliasi
Un enzima che catalizza la riparazione del DNA l'asportazione degli Ribosio residui al Sito Apurinico e Apyrimidinic DNA siti che può derivare da l'azione del DNA Glycosylases. L ’ enzima catalizza la reazione in cui il beta-elimination C-O-P legame 3 al Sito Apurinico O sito nel DNA e 'rotto, lasciando un 3' -terminal insaturo zucchero e un prodotto con un terminale 5 '-Fosfato. Questo enzima precedentemente elencate sotto CE 3.1.25.2.
Rna Messaggero
RNA sequenze che servire come modelli per la sintesi proteica batterica mRNAs. Trascrizioni primario in genere a cui non richiedono Post-Transcriptional elaborando mRNA eucariotiche viene sintetizzata nel nucleo e devono essere esportati al citoplasma per una traduzione. MRNAs eucariote sono piu 'una sequenza di polyadenylic acido quando guardo la 3' fine, referred to as the poli (A) coda. La funzione di questa coda non si sa con certezza, ma potrebbe avere un ruolo nelle esportazioni di maturo mRNA dal nucleo nonché per stabilizzare un mRNA molecole da ritardato la degradazione nel citoplasma.
Elettroforesi Su Gel Di Agar
Ricombinazione Genetica
Desossiribonucleasi Ecorl
Desossiribonucleasi Bamhl
Oligonucleotidi
RNA Interference
Un gene specifico zittire fenomeno per cui dsRNAs (RNA) grilletto a doppio filamento di degrado dell'mRNA omologa (RNA messaggero). Le specifiche sono elaborati in piccolo dsRNAs INTERFERING RNA (breve RNA interferente) che costituisce una guida per scissione del mRNA omologa nel RNA-INDUCED zittire complicata. DNA metilazione può anche essere scattato durante questo processo.
Legame Di Proteine
Mappa Di Restrizione
Polimorfismo Della Lunghezza Del Frammento Di Restrizione
Dna Circolare
Nessuna delle molecole di DNA trovato chiuso tramite un legame covalente con batteri, virus, molti mitocondri, plastids e plasmidi. Piccola, polydisperse circolare DNA sono stati osservati anche in un certo numero di organismi e eucariotiche consigliati è omologia con DNA cromosomico e la capacità di essere inerite e rimosso, DNA cromosomico. E 'un frammento di DNA formato da un processo di colpo e la cancellazione, contenente una costante regione del mu pesante catena e la 3' -part mu scambio della regione. Circolare DNA e 'un prodotto normale della riarrangiamento del gene variabile fra segmenti di regioni di immunoglobulina luce e catene molto pesanti, così come il recettore dell ’ a cellule T (Riger et al., glossary of Genetics, quinto M & Segen, Dictionary of Modern Medicine, 1992)
Desossiribonucleasi Di Tipo I Sito-Specifica
Contenente tre diversi sistemi enzimatici subunità e con necessità di ATP, S-adenosylmethionine e magnesio per attività endonucleolytic frammenti casuali di dare a doppia catena terminale 5 '-phosphates. Funzionano anche come DNA-dipendente ATPases e modifiche Methylases, principale che catalizza la reazione della CE 2.1.1.72 e CE 2.1.1.73 con simili site-specificity. I sistemi riconosce specifico e aderiscono brevi sequenze di DNA nei siti lontano dal riconoscimento sequenza. Enzimi da diversi microrganismi con la stessa specificità sono chiamati isoschizomers. CE 3.1.21.3.
Clonaggio Molecolare
Rna A Doppia Elica
RNA composto da due filamenti in opposizione al piu 'diffusa a RNA a singolo filamento. La maggior parte dei segmenti a doppia catena si formano con trascrizione di DNA da Ossidoriduttasi base-pairing di sequenze complementari capovolto separate da un loop spaiati alcuni segmenti di RNA a doppio filamento sono normali in tutti gli organismi.
Sonde Di Dna
Specie o subspecies-specific DNA (incluso LEGISLAZIONE DNA, conservato geni, cromosomi, o intero genoma) usati per l'ibridazione studi al fine di identificare i microrganismi, misurare DNA-DNA homologies, sottospecie di gruppo, ecc. La sonda di DNA hybridizes con uno specifico mRNA, se presente. Tecniche convenzionali usati come cavie per l'ibridazione prodotto includono Dot macchia di analisi, Southern blot, RNA e DNA: Hybrid-specific. - I test sugli anticorpi etichette convenzionali per la sonda di DNA include il radioisotopo etichette 32 penny e 125I e la sostanza etichetta Biotin. L 'uso di DNA sonde prevede una specifica, sensibile, rapido ed economico sostituto per le colture di cellule per la diagnosi di infezioni.
Dna Primers
Trascrizione Genetica
Denaturazione Dell'Acido Nucleico
Interruzione della struttura secondaria degli acidi nucleici dal calore estremo pH o trattamenti chimici, doppio filamento di DNA e '"fuso" di dissociazione della non-covalent legami idrogeno e Hydrophobic interazioni. Denaturato DNA sembra essere una struttura flessibile spaiati. Gli effetti di la denaturazione su RNA sono simili se meno pronunciato e generalmente reversibile.
Modelli Molecolari
Dna Superelicale
Rna Polimerasi Ii
DNA Breaks, Double-Stranded
Oligodeossiribonucleotidi
Fattori Di Trascrizione
Flap Endonucleases
ENDONUCLEASI che eliminano 5 'sequenze di DNA da una struttura del DNA ha chiamato un DNA. Il DNA risvolto struttura avviene in il DNA a doppia catena contenente una spaiati pausa dove il 5' parte della valle filamento troppo a lungo e si sovrapponeva al 3 'fine del controcorrente Strand. Flap Endonucleases fenderò l'a valle del lembo sovrapposizione struttura precisamente dopo i primi frammenti di DNA nucleotide, creando un ligatable Nick.
Esodesossiribonucleasi
Rna Catalitico
RNA dell ’ attività catalitica che ha la sequenza di RNA catalitica per formare una superficie complesso che funzioni come un enzima nell'reazioni con se stessa e altre molecole, potrebbe funzionare anche in assenza di proteine. Ci sono diversi esempi di RNA specie che sono influenzati da RNA catalitica, tuttavia l 'ambito di questo enzima lezione non e' limitata ad un particolare tipo di substrato.
Analisi Di Mutazioni Del Dna
Struttura Terziaria Della Proteina
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.