Super-famille de protéines
La séquence des acides aminés est généralement mieux conservé que la séquence de l'ADN des gènes en raison de la dégénérescence ... évoluent de telle sorte qu'elles ne présentent plus ni similitude séquentielle ni similitude structurelle, et leur homologie ne ... La substitution d'un acide aminé par un autre présentant des propriétés semblables (taille, charge électrique, caractère ... la structure tertiaire peut permettre de détecter une homologie entre protéines même lorsque plus aucune homologie structurelle ...
Alignement de séquences
... elle permet d'indiquer les propriétés des acides aminés, ce qui aide à conclure sur la conservation du rôle d'un acide aminé ... nécessaire]. Les alignements séquentiels peuvent être fournis dans une large variété de formats de fichiers, dépendant par ... On peut aussi utiliser l'alignement de séquence pour prédire la ou les fonctions d'une protéine, si on détecte une homologie ... En effet, on ne compare plus simplement les acides aminés ou les nucléotides deux à deux, mais à l'intérieur d'une colonne de ...
Prédiction de la structure des protéines
... colonnes du profil représentent des positions séquentielles dans la structure et ses rangées représentent les 20 acides aminés ... Sans surprise, la modélisation par homologie est plus précise lorsque la cible et le modèle ont des séquences similaires. ... Chaque acide aminé des brins intérieurs du feuillet forme deux liaisons H avec des acides aminés voisins, alors que chaque ... 6 acides aminés par tour, avec une liaison H formée entre chaque quatrième résidu ; la longueur moyenne est de 10 acides aminés ...
Séquence homologue
L'homologie de l'ADN, de l'ARN et des protéines est généralement déduite de similitudes de la séquence des acides nucléiques ou ... à similitude séquentielle comparable, mais plusieurs publications remettent en cause cette conception,. (en) Eugene V. Koonin ... également distincte de la conservation de certains résidus d'acides aminés jouant un rôle spécifique dans une protéine, qui ... à-dire présentant une homologie au sens de l'évolution moléculaire. Deux segments d'ADN distincts sont susceptibles d'avoir une ...