Article principal : hybridation génomique comparative. La puce dhybridation génomique comparative, encore appelée Array comparative genomic hybridization (CGH array, array CGH, a-CGH ou aCGH) ou Chromosomal Microarray Analysis (CMA), est une technique de cytogénétique sur puces permettant danalyser les variations du nombre de copies dans lADN (Copy Number Variation). Cette technique permet une analyse à plus haut débit et à plus grande résolution que la technique dhybridation génomique comparative. Dans la puce dhybridation génomique comparative, les chromosomes en métaphase sont remplacés par des oligonucléotides fixés sur une puce. Ces oligonucléotides sont produits par clonage sur bactéries, par transcription inverse dARNm (ADNc) ou par synthèse in situ. Il est ainsi possible de déposer plusieurs milliers de sondes sur une puce, chaque sonde dérivant dun gène connu du génome. Les puces permettent la détection des microdélétions ou des amplifications pour des ...

Mélange, blocage des séquences répétées et co-hybridation marquage marquage ADN test (maladie génétique, cellules cancéreuses) ADN de référence Scan Mesure des intensités de fluorescence Log 2 Cy5/Cy3 Cy5/Cy3 X Clone délétés dans lADN à tester 0,5 -1 Patients hétérozygotes Clone « normaux » dans lADN à tester 1 0.6 Clone amplifiés dans lADN à tester 1.5 Patients hétérozygotes Patients homozygotes 2.0 1 ...

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Quelles anomalies peut-on « voir », avec quelle technique cytogénétique ? Notion de « résolution » Caryotype standard: 10 - 20 Mb Caryotype en « haute résolution »: 5 Mb FISH: 150 kb (BAC) à 50 kb (cosmide) CGH array: Puce BAC: 500 kb à 1 Mb Puce oligos: 100 kb (sur tout le génome) voire moins pour certains types de puces (< 1 kb) PCRq: amplicon = 90 à 150 pb  Techniques de plus en plus fines pour explorer le génome

Lhybridation génomique comparative est une technique de cytogénétique moléculaire permettant danalyser les variations du nombre de copies dans lADN. Dans un organisme diploïde tel que lhumain, chaque segment dADN peut être trouvé en duplicat : une copie est présente sur chacun des deux chromosomes dune paire. Dans certaines pathologies, le nombre de copies peut varier : il peut augmenter par exemple en cas de duplication et diminuer dans le cas de délétion. Lhybridation génomique comparative permet de diagnostiquer ces pathologies et didentifier les régions chromosomiques impliquées. Marquage des sondes LADN dun patient est extrait de tissu normal (souvent des lymphocytes) et de tissu potentiellement tumoral puis marqué par des fluorochromes. En général, lADN tumoral est marqué en vert par la fluorescéine (sous forme de dUTP-FITC) et lADN de tissu sain en rouge par la rhodamine (sous forme de dUTP-TR). Les sondes sont mélangées ensuite avec de lADN Cot-1, qui ...

Analyse chromosomique sur puce à ADN (CGH array) : principe et application en diagnostic prénatal Chromosomal microarray analysis (array CGH): principle and application in prenatal diagnosis

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Nous avons inclus 13 essais impliquant 2 794 femmes. La qualité des données probantes variait de faible à modérée. Les principales limites étaient limprécision, lincohérence et le risque de biais de publication.. Comparaison entre la FIV avec DPI-A et la FIV sans DPI-A avec lutilisation danalyses globales du génome Biopsie de globule polaire Un essai a utilisé la biopsie de globule polaire avec une hybridation génomique comparative sur microréseau (aCGH). Il nest pas certain que lajout de DPI-A par biopsie de globule polaire augmente le taux cumulé de naissance vivante par rapport à la FIV sans DPI-A (rapport des cotes (RC) de 1,05 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % de 0,66 à 1,66 ; 1 ECR ; N = 396 ; données probantes de faible qualité). Les données suggèrent que pour un taux cumulé de naissance vivante de 24 % observé dans le groupe de contrôle, la probabilité de naissance vivante à la suite des résultats dun cycle de FIV avec DPI-A se situe entre 17 % et 34 ...

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