Utilizada gene dados de sequência molecular. Pesquisa médica. Perguntas frequentes

Das 124 sequências do gene 16S rRNA exibidas no banco de dados Synergistes GenBank, apenas duas são derivadas de isolados reais: Synergistes jonesii, número de acesso [[1]], isolado do rúmen de uma cabra, e Synergistes sp. (wikipedia.org)
Comparações das sequências com o banco de dados do RDP dos clones de Archaea indicaram na Baía das Laranjeiras 48,3% de organismos pertencentes ao Filo Crenarchaeota e 51,7% ao Filo Euryarchaeota. (ufpr.br)
Na comparação das sequências com o banco de dados do NCBI, na Baía das Laranjeiras, 83,3% pertencentes ao Domínio Bacteria e 93,1% de Archaea, estão relacionadas com sequências de organismos encontrados em regiões costeiras e oceânicas. (ufpr.br)
Ela identifica no banco de dados uma sequência parecida com a de interesse. (varsomics.com)
Quando o banco de dados foi construído juntamente com outros dois (DDBJ,ENA/EBI) foi proposto um consórcio que contava com a colaboração de diferentes bancos para atualizar os dados diariamente. (varsomics.com)
Dias após a postagem da sequência genética de um novo vírus ainda não identificado que estava causando um surto em Wuhan, na China, em um banco de dados internacional, o Dr. Barney Graham, então vice-diretor do Centro de Pesquisa de Vacinas do Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos e chefe do Laboratório de Patogênese Viral, já havia projetado uma estrutura para a vacina. (medscape.com)
A expectativa de vida (doença-específica) estimada em 5 anos de acordo com o banco de dados americanos do Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) está colocada entre parênteses na sequência de cada estádio clínico. (vencerocancer.org.br)

Os bancos de dados do NCBI são um dos maiores repositórios de informações sobre genes, proteínas, genomas, publicações e outros dados importantes nos campos da genética, bioquímica e biologia molecular. (varsomics.com)
A "Era da Virologia" durou até os anos 80, a "Era da Biologia Molecular" marcou os últimos 30 anos, e foi a que permitiu o desenvolvimento de vacinas contra hepatite A, hepatite B, encefalite japonesa, varicela, rotavírus e papilomavírus humano (HPV, sigla do inglês Human Papilomavirus ). (medscape.com)
Para estudar as formas de transmissão das informações genéticas nos indivíduos e populações, existem várias áreas de conhecimento que se relacionam com a genética clássica como a biologia molecular, a ecologia, a evolução e mais recentemente se destaca a genômica, em que se utiliza a bioinformática para o tratamento de dados. (yugrat.ru)
O teste de PCR Quantitativo para Adenovírus em sangue foi internalizado pelo Laboratório de Biologia Molecular e apresenta tempo de liberação em 4 dias. (einstein.br)

Por exemplo, fica claro que as sequências reguladoras de DNA altamente conservadas do genoma se juntam em blocos maiores de regulação que podem expandir-se para englobar diversos genes. (bvs.br)
Utilizando-se essa nova abordagem para a seleção de marcadores, foi necessário investigar um número de regiões do genoma consideravelmente menor que o utilizado pelo método utilizado tradicionalmente, simplificando o processo. (ufrn.br)
A expressão 'genoma' é utilizada igualmente para definir um grupo simples de cromossomos pertencentes a uma célula, denominado cariótipo . (infoescola.com)
O método Sanger de sequenciamento de DNA foi a primeira tecnologia que permitiu a leitura de sequências do genoma de uma forma sistemática: conhecendo um trecho curto próximo da região de interesse é possível utilizar uma sequência de ácido nucleico complementar a esse trecho (um primer ) e estender o fragmento para criar cópias da região que se quer conhecer. (mendelics.com.br)
Fizemos 2,8 mil experimentos, mapeando essas marcas por todo o genoma, examinando 150 bilhões de fragmentos de sequências, o suficiente para cobrir o genoma humano 3 mil vezes", contou, em uma coletiva de imprensa, Manolis Kelli, professor de biologia computacional do Instituto de Tecnologia de Massachusetts (MIT) e principal autor de um dos artigos publicados. (blog.br)
Ao se associar ao genoma, os compostos químicos epigenéticos não alteram a sequência de DNA, mas mudam a atividade de um gene. (blog.br)

O DNA total dessas amostras foi extraído e usado como molde em reações de PCR com iniciadores universais para o gene 16S rRNA dos Domínios Bacteria e Archaea. (ufpr.br)
O fluxo de trabalho taxonómico envolve etapas extensas e longas, desde a recolha, preservação e arquivo de amostras biológicas, à identificação e descrição de espécies, até ao arquivo e partilha de dados taxonómicos. (oceandecade.org)
Os métodos de recolha e preservação precisam de assegurar a integridade morfológica e molecular das amostras. (oceandecade.org)
Esta foi a maior quantidade de amostras já utilizadas em pesquisas de subgênero, e a coleção destes espécimes compreendem grande parte de sua distribuição. (tamandua.org)
A circulação viral foi analisada dentro das seguintes etapas, coleta e identificação de culicídeos, extração de RNA viral, RT- qPCR para detecção de flavivírus , PCR do gene mitocondrial citocromo C oxidase (COI) para identificação molecular de amostras positivas utilizando-se DNA barcoding e Sequenciamento de pool positivo. (bvsalud.org)
Peggy Shelbourne realizou um trabalho inovador utilizando amostras de cérebro generosamente doadas por pessoas que tinham morrido de DH. (hdbuzz.net)

Muitos deles são transcritos de forma coordenada a partir de sequências que estão próximas a genes importantes. (bvs.br)
Neste artigo, vamos resumir o sucesso do reducionismo, especialmente na definição das operações moleculares que regulam os genes, as células e os tecidos durante a formação do embrião. (bvs.br)
Mais recentemente, o código de barras de ADN - um método que utiliza uma pequena secção de ADN de um gene ou genes específicos - também tem sido amplamente utilizado. (oceandecade.org)
Um par de bebês "editados" em laboratório nasceu na China: as gêmeas Nana e Lulu são, até onde se sabe, os primeiros humanos geneticamente alterados por pesquisadores, que utilizaram tecnologia de edição de genes para alteração do CCR5, gene que é atacado pelo vírus HIV, o agente causador da AIDS. (spotsci.com)
Segundo os dados da pesquisa, um grupo de pesquisadores da Universidade Sulista de Ciência e Tecnologia de Shenzhen, liderados por Jiankui He, usou uma tecnologia conhecida como "tesouras moleculares CRISPR/Cas9", que supostamente permite a alteração livre e quase irrestrita de genes do corpo humano. (spotsci.com)
Relacionando esses resultados com outros resultados do projeto "Bases moleculares da qualidade da carne de bovinos da raça Nelore", financiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp), os estudos da Embrapa identificaram diferenças de expressão dos genes relacionadas a características de qualidade da carne. (fapesp.br)
Quando se modifica o gene errado ou há falhas na adição de compostos químicos aos genes, isso pode levar à atividade ou à inatividade genética, o que causa doenças oncológicas, distúrbios metabólicos e degenerativos. (blog.br)
Os genes contêm a informação necessária para determinar a sequência de aminoácidos das proteínas, que desempenham uma função importante na hora de determinar o fenótipo final do organismo. (yugrat.ru)
1. A hipótese do gene de antagonismo sexual (sexually antagonistic gene hypothesis) postula que certos genes podem ter efeitos negativos quando presentes num sexo, porém esse efeito negativo é contrabalançado por benesses consideráveis no sexo oposto. (blogspot.com)

Visando isso, este estudo teve como objetivo o desenvolvimento de dois métodos moleculares, um para detecção e o outro para genotipagem do T. gondii , possibilitando a identificação de todas as cepas conhecidas e a geração de dados que possam ser correlacionados com virulência. (ufrn.br)
No estudo genético, analisaram as sequências de nucleotídeos que compõem o DNA e que carregam informações sobre o gene e sua origem. (tamandua.org)
Já no estudo morfológico, utilizaram cerca de 55 espécimes do gênero Bradypus que estavam depositados em diferentes coleções taxonômicas do Brasil, do Museu de História Natural de Londres e também do Museu de História Natural em Leiden, na Holanda. (tamandua.org)
Esta expressão diferencia este campo de estudo do relacionado à anatomia, que vai se concentrar na compreensão de um gene ou de um conjunto deles. (infoescola.com)
Por fim, nos fornecem uma referência para o estudo das bases moleculares das doenças humanas, ao revelar as regiões de controle que abrigam variantes genéticas associadas a diferentes distúrbios", disse. (blog.br)

Luciana Regitano conta que eram utilizados bancos de dados de humanos e camundongos. (fapesp.br)
A ferramenta de comparação de sequências de DNA com os bancos de dados genômicos é o BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), através dela podemos comparar sequências de DNA ou qualquer proteína com todas as sequências genômicas de domínio público. (varsomics.com)
Os pesquisadores atualmente são capazes de construir e examinar enormes bancos de dados contendo sequências de DNA, RNA, proteínas e nucleotídeos para resolver dúvidas genéticas, com o objetivo de armazenamento e recuperação de dados. (varsomics.com)
Embora existam muitos bancos de dados úteis, um dos principais bancos de dados utilizados pelos pesquisadores é o National Center for Biotechnology Information (NCBI), mantido pelos National Institutes of Health dos EUA. (varsomics.com)

O Protein Data Bank, uma base de dados específica sobre proteínas, armazena informações acerca da estrutura de aproximadamente 25 mil dessas moléculas de plantas, animais e microorganismos. (fapesp.br)
Há também outros métodos de análise comparativa, como o BLASTX que consulta o DNA com base de dados de proteínas, válido quando as sequências são muito parecidas entre si e com os nucleotídeos que as codificam. (varsomics.com)

Não é mostrado no video (e não consegui encontrar um melhor) o RBS é uma sequencia do RNA que direciona o ribossomo para o start codon, ele complementar a região do rRNA 16S que é parte da subunidade pequena 30S do ribossomo. (unicamp.br)
O taxa de iniciação de transcrição se dá pela combinação de diferentes efeitos moleculares: incluindo a hibridação do rRNA 16S com a sequencia do RBS, a ligação do tRNA formilmetionina ao start codon, a distância entre o síto de ligação do rRNA 16S e o start códon, e a presença de estruturas secundárias de RNA que podem obstruir o RBS ou o start codon. (unicamp.br)

Material e Métodos: Foi realizada uma busca nas bases de dados Pubmed, Scopus e Web of Science por publicações até abril de 2016. (bvsalud.org)
A metodologia seguiu as diretrizes do PRISMA e incluiu pesquisa nas bases de dados Drugbank, PubMed, PsyclNFO, Embase e Scopus, com a aplicação de filtros para selecionar estudos em investigação e experimental. (ufpi.br)

O presente trabalho indica que as técnicas moleculares são particularmente úteis na busca pelo conhecimento da estrutura das comunidades procarióticas e suas inter-relações com o ambiente. (ufpr.br)
O BLASTN, busca homologia entre sequências de nucleotídeos, o BLASTp com sequências de proteínas. (varsomics.com)

A pesquisa trabalha com um volume de dados gigantesco, o chamado big data. (fapesp.br)
O legal é que aproveitamos os dados já disponíveis gerados pelo projeto temático 'Bases moleculares da qualidade da carne de bovinos da raça Nelore', financiado pela Fapesp, para investigar a expressão alélica, um campo de pesquisa que está ganhando força recentemente. (fapesp.br)

Sua construção e estrutura são similares à PAM, no entanto cada matriz foi construída usando blocos (alinhamentos locais sem gaps ) de sequências com diferentes níveis de similaridade, e não extrapoladas a partir de uma inicial). (varsomics.com)
O método Sanger foi desenvolvido em 1977 e é utilizado até hoje em diferentes áreas da genética. (mendelics.com.br)
Esse recurso nos permite comparar diferentes tecidos e tipos de células no nível molecular e entender o que os faz diferentes", observou Kelli, lembrando que, embora todas as células do corpo contenham o mesmo DNA, algumas se tornarão neurônios, e outras, hemácias, por exemplo. (blog.br)

2013) utilizaram uma abordagem de nested PCR 16S rDNA para monitorar a presença de S. jonesii em bovinos de propriedades do norte da Austrália. (wikipedia.org)
Abordagem utilizada para o levantamento dos microrganismos presentes em uma amostra utilizando a amplificação de marcadores genéticos específicos, os amplicons . (biome-hub.com)

A síndrome genética mais prevalente com relação ao câncer de mama é a síndrome de câncer hereditário de mama e ovário, que apresenta gene BRCA1 ou BRCA2 mutado. (infinitewh.com.br)
Na anemia falciforme, uma das cadeias polipeptídicas que compõem a hemoglobina, a proteína que transporta oxigênio no sangue, apresenta uma leve alteração na sequência. (khanacademy.org)

o desenvolvimento de uma nova rota metabólica para a produção de um produto químico pode levar de 5 a 10 anos de P&D para chegar a etapa industrial) que normalmente requer múltiplas rodadas de tentativas e erro utilizando mutações aleatórias. (unicamp.br)
Normalmente a impressão 3D, utiliza um método de deposição de materiais por camadas, para criar estruturas semelhantes a tecidos com utilização nos domínios médico e de engenharia de tecidos. (culturgest.pt)
A título de exemplo, existem casos onde o gene SRY - normalmente presente no cromossoma Y e responsável pela diferenciação sexual masculina - se torna disfuncional através de uma mutação, resultando com que uma pessoa "XY" seja diagnosticada como rapariga à nascença. (blogspot.com)

no entanto, no caso das VP, estas contêm mutações no gene S que propiciam o processo de contacto e de penetração nas células humanas, aumentando a transmissibilidade do vírus. (who.int)
Para fazer isso, no entanto, eles precisam analisar dados biológicos extremamente grandes e altamente complexos. (engenhariae.com.br)
No entanto, ele ainda é usado para o sequenciamento de regiões mais complexas do DNA, como o gene CYP21A2 , causador da Hiperplasia Adrenal Congênita (CAH). (mendelics.com.br)

Os esforços recentes de sequenciamento indicaram que há um grande número de RNA que são transcritos mas não traduzidos, mas que desempenham um papel na regulação da atividade do gene. (bvs.br)

Amamentação: Não há dados de estudos realizados com lactantes (mulheres amamentando). (drconsulta.com)
A incidência de leucemia e de vários tumores sólidos nos sobreviventes da bomba atômica produziu uma grande quantidade de dados para os estudos clássicos sobre a dosagem de radiação e suas consequências. (medicinanet.com.br)

A detecção molecular da estirpe do tipo S. jonesii (78-1, ATCC 49833) foi demonstrada pela primeira vez por McSweeney et al. (wikipedia.org)
A captura dos culicídeos foi realizada no Zoológico tendo como local de coleta copa e solo utilizando-se armadilhas iscas luminosas (tipo CDC) para capturar alados. (bvsalud.org)
Possibilita avaliar tipo histológico e molecular e auxilia no planejamento terapêutico pré-operatório. (infinitewh.com.br)
O gene N foi clonado em um adenovírus humano tipo 5 defectivo e transfectado para as células HEK-293A para gerar rAd5_N. Após o vetor ser obtido como esperado e a confirmação da expressão da proteína N em HEK-293ª, foi realizada inoculação pela via oculo-nasal na dose de 107 TCID50/0,1mL para imunização de galinhas livres de patógenos específicos (SPF). (embrapa.br)

Atenção: este produto é um medicamento novo e, embora as pesquisas tenham indicado eficácia e segurança aceitáveis, mesmo que indicado e utilizado corretamente, podem ocorrer eventos adversos imprevisíveis ou desconhecidos. (drconsulta.com)

A notificação apresentada recebeu o seguinte número B/PT/08/01 (Evento GA21) - Notificação para a realização de ensaios de campo de milho geneticamente modificado tolerante ao herbicida glifosato com o evento GA21. (1library.org)
O milho GM evento GA 21 foi modificado geneticamente pela inserção do gene mepsps que confere tolerância ao herbicida glifosato. (1library.org)
A terapia gênica para a AME envolve a introdução da cópia funcional do gene SMN1 nas células nervosas do paciente por meio de um vetor viral geneticamente modificado. (cienciahoje.org.br)

O Alinhamento de sequências pode ser realizado entre pares ou entre múltiplas sequências, e são classificados como locais (em uma região do gene) ou globais (em todo o gene). (varsomics.com)
O câncer de mama pode ser classificado de acordo com sua origem histológica e molecular. (infinitewh.com.br)
Utiliza-se a mesma cirurgia descrita anteriormente no estádio I, que pode ser realizada por via aberta ou por laparoscopia, robótica ou não. (vencerocancer.org.br)
O processo de envelhecimento pode ser descrito como uma acumulação gradual de danos moleculares e celulares que conduz à degeneração de tecidos e perda da funcionalidade de órgãos. (culturgest.pt)

Na sequência temos o Carcinoma Lobular Infiltrativo em 5-15% dos casos. (infinitewh.com.br)
Os dados mais recentes surgiram de casos de câncer como complicações tardias de radioterapias e de quimioterapias radiomiméticas usadas no tratamento de malignidades em fase inicial. (medicinanet.com.br)

Eles argumentaram que as teorias dominantes, aquelas que eram centradas no gene (neodarwinistas), colocaram ênfase indevida sobre as características individuais. (bvs.br)

Habitualmente utilizado, o disco de difusão (também chamado de teste de Kirby-Bauer) é apropriado para microrganismos de crescimento rápido. (msdmanuals.com)

Em essência, eles argumentaram que pelo menos algumas morfologias poderiam ser consideradas como os acidentes indiretos de decisões antepassadas e arquitetônicas mais primárias, e que essas características acidentais poderiam mais tarde ser utilizadas para alterar e informar modificações da estrutura primária. (bvs.br)
O nível mais simples da estrutura da proteína, a estrutura primária , é simplesmente uma sequência de aminoácidos em uma cadeia polipeptídica. (khanacademy.org)

E assim essa classificação se manteve… até que recentemente esses dados mudaram! (tamandua.org)

A metodologia de sequenciamento desenvolvida por Sanger usa o método de terminação de cadeia para identificar a ordem em que os fragmentos são inseridos na sequência estudada. (mendelics.com.br)
Ter um volume grande de cópias é vantajoso pois, quanto mais cópias são lidas durante o sequenciamento, maior a certeza de que a sequência lida está correta, minimizando erros de leitura. (mendelics.com.br)

Gould e Lewontin usaram uma metáfora poderosa para explicar sua crítica à visão de evolução e desenvolvimento reducionista e centrada no gene (1). (bvs.br)
aproveitam novas tecnologias e criam uma rede global de peritos para apoiar o desenvolvimento de um quadro regulamentar sólido, baseado nos melhores dados e informações disponíveis. (oceandecade.org)
Um passo muito importante nesse sentido foi dado pelo Grupo do Prof. Howard Salis , pesquisador que eu tenho o prazer de trabalhar dentro do Synberc , com o desenvolvimento da calculadora de RBS (ribossomal binding site ou sítio de ligação com o ribossomo). (unicamp.br)

Os dados obtidos permitirão diversos avanços que vão desde direcionar programas de melhoramento genético bovino até desenvolver animais que apresentem carnes sob medida com detalhes como maciez e sabor determinados. (fapesp.br)
No Brasil são utilizados diversos agrotóxicos na agricultura com a finalidade produtividade agrícola tornando o país um dos maiores consumidores mundiais. (unifesp.br)

O paciente recolhe a amostra em casa utilizando uma técnica comum de esfregaço de bochecha. (nebula.org)

Além de apreciados na culinária, amplamente distribuídos e importantes na avaliação da qualidade ambiental, esses organismos têm sido utilizados como sentinelas da contaminação por MPs. (fapesp.br)

A calculadora de RBS, portanto, combina um modelo biofísico com otimização estocástica para identificar uma sequência sintética (não natural) de RBS que irá proporcionar a taxa de início de tradução desejada. (unicamp.br)

Queremos encontrar fatores que regulam a maciez e já temos o conjunto de dados mais importante para procurar essas variações", informa Regitano. (fapesp.br)
O câncer é o termo utilizado que abrange um conjunto de mais de 100 doenças que possuem em comum o crescimento desordenado e descontrolado de células anormais. (unifesp.br)

2002) utilizaram um par de primers do gene 16S rRNA (rADN) consistindo de um primer bacteriano universal (Primer 357F, Lane 1991) e iniciador DHP 1006 para amplificar um produto específico de 438 nucleotídeos para S. jonesii. (wikipedia.org)

Podemos analisar as mais variadas sequências das mais diversas formas. (varsomics.com)

Como muitas drogas são excretadas no leite humano, deve-se ter cautela ao utilizar VPRIV durante a amamentação. (drconsulta.com)

O gene viral S é importante, uma vez que codifica a proteína Spike, ou seja, a molécula que entra em contacto com o vírus e que permite a sua penetração em células hospedeiras susceptíveis, provocando infecção. (who.int)
O tamanho da biblioteca aumenta combinatoriamente com o número de proteínas do sistema, ou seja, 16,7 milhões de sequências para um sistema com 3 proteínas e 2,8 x 1014 sequencias para um sistemas com 6 proteínas). (unicamp.br)

Mesosphaerum suaveolens (L.) Kuntze (Lamiaceae), conhecida como "bamburral", é utilizada na medicina popular, entretanto, pouco se sabe dos constituintes químicos dela, os seus efeitos tóxicos e terapêuticos. (sld.cu)
Hoje, a medicina se prepara para passar por outra grande mudança: o uso rotineiro da terapia gênica, que emprega sequências de DNA ou RNA para curar ou aliviar doenças hereditárias e adquiridas. (cienciahoje.org.br)

Em indivíduos com AME, esse gene está ausente ou não está funcionando corretamente, o que leva à morte dessas células nervosas e à fraqueza muscular progressiva e fatal. (cienciahoje.org.br)

Uma mudança na sequência de DNA do gene pode levar à mudança na sequência de aminoácidos da proteína. (khanacademy.org)

Dessa maneira, o modelo biofísico preenche uma lacuna de desenho racional de RBS, criando uma relação quantitativa entre um sequencia de letras (As, Gs, Cs e Us) e um número (taxa de iniciação de tradução). (unicamp.br)
Há uma sequência de letras que são as bases. (fapesp.br)
São modificações que não criam mutações, já que as letras continuam na ordem certa, mas são capazes de silenciar ou ativar aquele gene. (blog.br)

Coleta sanguínea para análises moleculares / Foto: Adriano Gambarini. (tamandua.org)

Anatomia5

Organismos12

Compostos Químicos e Drogas23

Técnicas e Equipamentos Analíticos, Diagnósticos e Terapêuticos29

Fenómenos e Processos65

Disciplinas e Ocupações8

Antropologia, Educação, Sociologia e Fenômenos Sociais1

Tecnologia, Indústria, Agricultura1

Ciência da Informação24

Assistência Saúde9

Denominações Geográficas2

Banco de dados7

Biologia molecular4

Genoma6

Amostras6

Genes9

Estudo5

Bancos de dados4

Base de dados2

RRNA 16S2

Bases de dados2

Busca2

Pesquisa2

Diferentes3

Abordagem2

Apresenta2

Normalmente3

Entanto3

Atividade1

Estudos2

Tipo4

Podem ocorrer1

Geneticamente3

Pode ser4

Casos2

Eram1

Chamado1

Estrutura2

Recentemente1

Sequenciamento2

Desenvolvimento3

Diversos2

Amostra1

Organismos1

Identificar1

Conjunto2

Primers1

Analisar1

Humano1

Seja2

Medicina2

Corretamente1

Levar1

Letras3

Coleta1