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  • podem
  • Árvore filogenéticas geradas pela filogenia computacional podem ser enraizadas ou não enraizadas dependendo dos dados de entrada e do algoritmo utilizado. (wikipedia.org)
  • Uma árvore não enraizada sempre pode ser produzida a partir de uma árvore enraizada, mas uma raiz normalmente não podem ser colocada em uma árvore não enraizadas sem dados adicionais sobre as taxas de divergência, como pressuposto na hipótese do relógio molecular. (wikipedia.org)
  • Caso as perguntas certas não sejam feitas na sequência certa, erros podem ser cometidos. (wikipedia.org)
  • Podem ser caracterizados como marcadores moleculares quando ocorrem em mais de 1% da população, pois quando essas variações são relatadas com uma frequência menor que este valor, então é considerado apenas como mutações pontuais. (wikipedia.org)
  • Os tipos de dados que podem ser manuseados incluem seqüencias moleculares, freqüências gênicas, sítios de restrição e fragmentos, matrizes de distância, e caracteres discretos. (wikipedia.org)
  • Alguns programas de análise de sequência, como o programa de alinhamento ClustalW podem gravar arquivos de dados no formato PHYLIP. (wikipedia.org)
  • Agora, os pesquisadores suecos acreditam que os verdadeiros parentes podem pertencem ao novo tipo de bactéria que descobriram. (nossofuturoroubado.com.br)
  • Christian de Duve (premiado com o Prémio Nobel Medicina, em 1974) considera que os peroxissomas podem ter sido os primeiros endossimbiontes, que permitiram às células adaptar-se à quantidade crescente de oxigénio molecular na atmosfera da Terra, no entanto, como estes organelos também não possuem DNA, esta teoria é considerada especulativa e sem bases sólidas. (wikipedia.org)
  • Em células humanas, tanto atividades metabólicas normais quanto fatores ambientais (como raios UV) podem causar danos no ADN, resultando em cerca de 1 000 000 lesões moleculares individuais por dia. (wikipedia.org)
  • A cada execução da máquina com uma amostra diferente, milhões de sequências genômicas podem ser produzidas e a interpretação dos dados leva à busca da compreensão e do conhecimento da biologia dos tumores, busca esta que invariavelmente traz benefícios para a sociedade, como na descoberta de alvos para fármacos ou enzimas de utilização na área da biotecnologia ", aponta. (paranashop.com.br)
  • Além disso, a plataforma conta também com um sistema de barcodes e UMIs (Unique Molecular Index), o que possibilita maior confiabilidade dos resultados, principalmente com relação às mutações artificiais que podem estar presentes quando verificadas em outros aparelhos que não utilizam este sistema. (paranashop.com.br)
  • Estas sequências podem ser usadas para eficientemente identificar espécies de forma análoga ao uso de códigos de barra na identificação de mercadorias em lojas e depósitos de material. (docplayer.com.br)
  • biologia
  • Nas classificações de base morfológica, anteriores à aplicação dos conceitos da biologia molecular e da moderna filogenia, todos os géneros agora incluídos nas Adoxaceae eram considerados parte da família Caprifoliaceae, a família das madressilvas. (wikipedia.org)
  • Essas similaridades e diferenças entre os tipos de célula são particularmente relevantes para a biologia molecular. (wikipedia.org)
  • O surgimento de novas técnicas de biologia molecular permitiu a utilização de marcadores genéticos capazes de detectar polimorfismos a níveis de DNA. (wikipedia.org)
  • Em biofísica e biologia estrutural este método é mais frequentemente aplicado ao estudo do movimento de macromoléculas biológicas como é o caso das protéinas e dos ácidos nucleícos, o que pode ser útil para a interpretação de resultados de experiências biofísicas ou para a modelação de interacções com outras moléculas como no caso dos acoplamentos moleculares. (wikipedia.org)
  • A biologia evolutiva do desenvolvimento aborda comparativamente os mecanismos e sequências do desenvolvimento embrionário, de modo a esclarecer como os genes poderiam produzir novas formas, funções e comportamentos durante o curso da evolução. (wikipedia.org)
  • Biologia evolutiva do desenvolvimento surgiu em reposta a esses dados. (wikipedia.org)
  • Um dos resultados mais surpreendentes e talvez, contra-intuitivos dessa pesquisa em biologia evolutiva do desenvolvimento feita nesse período é que tanto a diversidade de planos corporais quanto a morfológica em organismos de diversos filos não é necessariamente refletida em diversidade similar ao nível de sequências genéticas controlando o desenvolvimento. (wikipedia.org)
  • A especialista do Mantis e coordenadora do setor de Biologia Molecular Dra. (paranashop.com.br)
  • Sempre em busca de oferecer novos exames em oncologia molecular, o Mantis Diagnósticos Avançado, de Curitiba, adquiriu recentemente um novo equipamento, utilizado no laboratório de biologia molecular, o NGS (Sequenciamento de Nova Geração), GeneReader TM da marca QIAGEN, Modelo 2017, com plataforma automatizada. (paranashop.com.br)
  • banco de dados
  • A segunda etapa aprimorou o HTLV-1 Molecular Epidemiology Database, reconstruindo seu banco de dados e as páginas web da aplicação. (fiocruz.br)
  • O banco de dados passou a incluir sequências do HTLV-2, HTLV-3 e HTLV-4. (fiocruz.br)
  • Na terceira etapa, as ferramentas foram integradas através da construção de um Servlet no REGA Genotype Tool e de páginas específicas na aplicação de banco de dados capazes de realizar requisições e recuperar informações acerca das análises filogenéticas. (fiocruz.br)
  • Ocorreu a integração entre estas duas ferramentas, permitindo que o resultado de uma genotipagem seja recuperado pelo Banco de Dados e este possa realizar os tratamentos de arquivos e as consultas necessários para identificação dos tipos de vírus e seus subtipos. (fiocruz.br)
  • Após dois anos de estudo, a equipe liderada pelo pesquisador da Embrapa Renato Andreotti concluiu o genoma funcional do carrapato ou transcriptoma , um banco de dados que expressa o funcionamento do metabolismo desse artrópode, abrindo caminho para a elaboração de novos antígenos para o desenvolvimento de vacinas. (milkpoint.com.br)
  • Com o banco de dados, muda-se a velocidade das pesquisas e a geração de tecnologias de combate. (milkpoint.com.br)
  • Os resultados são analisados por um software de bioinformática com um amplo banco de dados com acesso a todos os clinical trials do mundo, permitindo assim resultados com maior acurácia e rapidez do que em outras plataformas de NGS. (paranashop.com.br)
  • filogenia
  • Muitas formas de filogenia molecular estão intimamente relacionadas e fazem uso extensivo do alinhamento de seqüências na construção e refino de árvores filogenéticas, que são utilizadas para classificar as relações evolutivas entre genes homólogos representados nos genomas de espécies divergentes. (wikipedia.org)
  • Trabalhos de filogenia molecular indicam que Convolvulaceae é grupo-irmão de Solanaceae, ambas famílias inclusas na ordem Solanales. (wikipedia.org)
  • PAUP MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis Clustal Filogenética computacional Árvore filogenética Filogenética Phylogeny Programs List: Uma grande lista de pacotes de filogenia com detalhes sobre cada software. (wikipedia.org)
  • seja
  • Além de dados moleculares, ou seja, estudos que permitem o conhecimento das moléculas de ácido nucleico ( DNA e RNA ). (infoescola.com)
  • Abreviadamente, a isomeria é o fenômeno pelo qual duas substâncias compartilham a mesma fórmula molecular (isto é, tantos átomos disso, tantos átomos daquilo), mas apresentam estruturas diferentes, ou seja, a forma como os mesmos átomos arranjam-se no espaço tri-dimensional é diferente em cada caso. (wikipedia.org)
  • É possível tentar corrigir comparando muitos dados simultaneamente, comprovando assim a robustez da árvore, seja usando métodos que incorporem ritmos diferentes de substituição entre linhagens (máxima probabilidade, por exemplo), seja acompanhando as análises genéticas com análises morfológicas, ou ainda, rompendo as ramificações longas com a adição de táxons que estejam relacionados com aqueles onde ocorra este tipo de ramificação. (wikipedia.org)
  • A teoria neutra pressupõe que a evolução a nível molecular seja dominada por processos aleatórios, a chamada deriva gênica que irá atuar em pequenas populações, Já a seleção natural agiria em grandes populações, sendo assim a neutralidade das mutações dependeria do tamanho da população. (wikipedia.org)
  • estudos
  • Com o avanço da tecnologia os estudos aumentaram e forneceram conhecimento com relação a dados provenientes de microscopia eletrônica (ultraestruturais), como o tipo de gametas, ou de divisão celular como a mitose . (infoescola.com)
  • Em estudos moleculares, um problema principal consiste na produção de um Alinhamento múltiplo de sequências entre os genes ou seqüências de aminoácidos de interesse. (wikipedia.org)
  • Os polimorfismos de sequência nucleotídica são fontes abundantes de variação genética e, por serem estáveis do ponto de vista evolutivo, estes marcadores são muito interessantes para estudos filogenéticos de evolução dentro da espécie. (wikipedia.org)
  • Dados moleculares têm se mostrado promissores no refinamento da prática taxonômica de grupos complexos e têm contribuído para estudos que integram diferentes conjuntos de dados e métodos para lidar com a delimitação de espécies (e.g. (docplayer.com.br)
  • comum
  • As espécies desta família são frequentemente encontradas tendo como hábito do tipo lianas e/ou do tipo volúveis, aparência bastante comum para esta família. (wikipedia.org)
  • Este erro é muito comum quando a evolução de um gene não seguiu um modelo de relógio molecular, e tende a ser verificado quando se mede com o método de máxima parcimônia. (wikipedia.org)
  • utilizado
  • Segundo esta nota, o termo Candidatus deve ser utilizado para descrever entidades procariotas cuja uma mera sequência genética esteja disponível ou então para os quais as características necessárias para a descrição de acordo com o Código Bacteriológico (Revisão 1990) estejam faltando. (wikipedia.org)
  • Estas novas demandas envolvem tanto a agregação de novas metodologias de custódia de material biológico associadas à manutenção do material testemunho (vouchers) utilizado na validação de dados moleculares, como a organização de novos tipos de coleções, como é o caso das coleções de tecidos e coleções de extratos de DNA destinadas a prover o material necessário para os procedimentos de geração de sequências propriamente ditos. (docplayer.com.br)
  • resultados
  • Cálculos das propriedades do sistema, como o coeficiente de auto-difusão deram resultados semelhantes aos dos dados experimentais. (wikipedia.org)
  • Este marcador genético está sendo amplamente usado por pesquisadores dos mais variados grupos de animais, existindo protocolos e iniciadores (primers) bem estabelecidos e grande quantidade de resultados já disponíveis através do Sistema de Dados do Código de Barras da Vida (Becker et al. (docplayer.com.br)
  • genoma
  • A proposta visava reparar a incapacidade do Código Internacional de Nomenclatura Bacteriana em fornecer regulamentação sensata para a nomenclatura de novos táxons definidos através de poucos dados, como por exemplo uma sequência de nucleotídeos para uma pequena porção do genoma. (wikipedia.org)
  • Além das informações do genoma, tais como as sequências aptas a determinar a posição filogenética do organismo, todas as informações, incluindo as características estruturais, metabólicas e de reprodução devem ser incluídas na descrição, juntamente com o ambiente natural em que o organismo pode ser identificado através de hibridização "in situ", ou outras técnicas semelhantes para a identificação de células. (wikipedia.org)
  • O material passou por isolamento e identificação de N. lactamica e caracterização molecular através do sequenciamento do genoma total. (fiocruz.br)
  • foram
  • Muito mais tarde, os géneros Sambucus (sabugueiros) e Viburnum (laurotinos ou folhados) foram adicionados à família após cuidadosa análise morfológica confirmada por dados bioquímicos, o que levou o Angiosperm Phylogeny Group a incluir no sistema APG II a família com a sua presente circunscrição taxonómica. (wikipedia.org)
  • Através da tecnologia dos marcadores moleculares a caracterização genética de diferentes genomas se tornou mais fácil e rápida, e com isso foram surgindo diversas metodologias capazes de utilizar e caracterizar alterações nesses marcadores. (wikipedia.org)
  • A terceira peça foram os dados coletados por Rosalind Franklin nos experimentos realizados em que os raios-X são disparados nas fibras de DNA e a dispersão dos raios nas fibras é observada captando os raios em um filme fotográfico. (wikipedia.org)
  • Para inferir a teoria neutra podemos citar 3 linhas menos diretas de evidências que foram originalmente usadas por Kimura para argumentar a importância da deriva neutra na evolução molecular. (wikipedia.org)
  • marcadores moleculares
  • Um marcador genético ideal deve apresentar uma série de atributos: Alto nível de polimorfismo Estabilidade em diferentes ambientes Detectar grande número de loci não ligados Herança simplesGuerra, Nodari e Stefenon Os marcadores moleculares correspondem, basicamente, a uma sequência de nucleotídeos que atua como referência em um cromossomo. (wikipedia.org)
  • Abaixo, segue uma lista com os principais tipos de marcadores moleculares genômicos: RFLP (Restriction fragment lenght polymorphism): são fragmentos de DNA obtidos a partir de uma técnica que consiste na hibridização de sequências específicas de DNA, denominadas sondas, com o DNA total digerido por enzimas de restrição dos indivíduos a serem analisados. (wikipedia.org)
  • obtidos
  • formação de "pescoço" em nanofios, ou mesmo movimento de receptores em células dos seres vivos ocorrem em femtosegundos O método foi desenvolvido por Fermi, Pasta e Ulam (e Tsingou) na década de 1950, Alder e Wainwright no final da década de 50 e por Rahman (de forma independente) na década de 60, na sequência dos sucessos obtidos pelas Simulações de Monte Carlo. (wikipedia.org)
  • Este efeito recomenda extrema precaução na interpretação dos dados obtidos. (wikipedia.org)
  • Alguns
  • Ainda antes de ser possível fazer as simulações de dinâmica molecular com recurso a computadores, alguns dedicaram-se à árdua tarefa de as fazer utilizando modelos físicos como esferas macroscópicas. (wikipedia.org)
  • O gerenciamento e a análise de dados biológicos através de métodos computacionais modernos necessitam que, em alguns casos, os pesquisadores submetam seus dados para diversas aplicações diferentes, inclusive softwares distintos. (fiocruz.br)
  • grupo
  • Os tipos de reprodução variam conforme o grupo e o tipo de talo. (infoescola.com)
  • A identificação de uma raiz geralmente requer a inclusão nos dados de entrada de pelo menos um "grupo-externo" sabendo-se apenas remotamente relacionado com as seqüências de interesse. (wikipedia.org)
  • o mesmo que C4H10 CH3 H3C - CH2 - CH2 - CH3, que C4H10 Os isômeros pertencem à mesma função e têm o mesmo tipo de cadeia, mas apresentam diferença na posição de um grupo funcional, de uma ramificação ou insaturação. (wikipedia.org)
  • Microssatélites (SSRP - Simple Sequence Repeats Polymorphisms): um grupo de marcadores molecular muito utilizados, os quais são caracterizados por unidades muito curtas de sequências repetitivas de nucleotídeos. (wikipedia.org)
  • O grupo usa dados de pesquisas internacionais sobre o DNA de bactérias em todos os oceanos do mundo. (nossofuturoroubado.com.br)
  • maioria
  • A maioria dos programas procuram os dados em um arquivo chamado infile- se eles não encontram esse arquivo, pedem então que o usuário digite o nome do arquivo de dados. (wikipedia.org)
  • dois
  • Desde 2002, o Comitê Internacional de Sistemática Procarionte e a International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology exigem dos autores de novas espécies, novas subespécies e novas combinações, que providenciem evidências documentais de que as cepas-tipo estejam depositadas em ao menos duas "Coleções de Cultura" em dois países diferentes. (wikipedia.org)
  • Para isso, serão necessários, no mínimo, mais dois anos de experimentos e os dados serão disponibilizados aos projetos com linhas de pesquisa semelhantes. (milkpoint.com.br)
  • algumas
  • As folhas são do tipo simples, alternas e espiraladas, com algumas espécies contendo folhas lobadas ou compostas, com nervura peninérvea e entre outras espécies, venação palmada. (wikipedia.org)
  • pode
  • Para sistemas que obedecem à hipótese da ergodicidade, a evolução de uma única simulação de dinâmica molecular pode ser utilizada para determinar propriedades termodinâmicas macroscópicas do sistema: os intervalos de tempo médio correspondem às médias do conjunto microcanónico. (wikipedia.org)
  • Os dados são lidos no programa a partir de um arquivo de texto, que o usuário pode preparar utilizando qualquer processador de texto ou editor de texto (mas é importante que este arquivo de texto não esteja em um formato especial do processador de texto- ele deve ser em vez disso estar em Flat ASCII ou Formato somente texto). (wikipedia.org)
  • Cientistas da Universidade de Uppsala, na Suécia, descobriram um novo tipo de bactéria que pode alterar o consenso sobre a evolução de estruturas como a mitocôndria - as "usinas" de energia dentro das células humanas e de outro animais - existente atualmente. (nossofuturoroubado.com.br)
  • A integração entre as ferramentas de bioinformática pode atenuar esta problemática abstraindo o fluxo de dados, tornando mais transparente para o usuário o processo de obtenção de tipos específicos de informação, como a identificação automática de vírus e seus subtipos. (fiocruz.br)
  • recentes
  • Embora tenha sido sugerido anteriormente que a Gammaproteobacteria é parafilética com relação a Betaproteobacteria, dados moleculares recentes sugerem que os grupos são monofiléticos. (wikipedia.org)
  • geralmente
  • Inflorescências são do tipo determinadas, cimosas e, geralmente, reduzidas a uma única flor, podendo ser terminais ou axilares. (wikipedia.org)
  • As proteínas diferem entre si fundamentalmente na sua sequência de aminoácidos, que é determinada pela sua sequência genética e que geralmente provoca o seu enovelamento numa estrutura tridimensional específica que determina a sua atividade. (wikipedia.org)
  • genes
  • Essa informação possibilita identificar genes e mecanismos moleculares envolvidos na interação parasita-hospedeiro', detalha a pesquisadora em genômica funcional Poliana Giachetto, responsável pela análise do transcriptoma, após a produção de bibliotecas de DNA complementar (cDNA) e devido sequenciamento. (milkpoint.com.br)
  • Na Embrapa Informática Agropecuária (SP) e de posse da sequência, Poliana e equipe utilizaram diversos programas de computador para classificar os genes do parasita de acordo com determinados 'sinais' presentes neles, por meio de bioinformática. (milkpoint.com.br)
  • bases
  • Tratando de uma substância química o DNA é simples, contém três tipos de componentes químicos: o fosfato, um açúcar (desoxirribose) e quatro bases nitrogenadas (adenina, timina, cianina, guanina). (wikipedia.org)
  • determinar
  • Como os sistemas moleculares tipicamente consistem num vasto número de partículas, é impossível determinar analiticamente as propriedades de sistemas complexos. (wikipedia.org)
  • envolvidos
  • Morfografia inclui toda a exploração sistemática e classificação dos fatos (pt: factos) envolvidos no reconhecimento de todos os tipos de animais extintos e atuais e a distribuição deles no espaço e no tempo. (wikipedia.org)
  • sequenciamento
  • Com o resultado do laudo é possível o médico direcionar melhor o tratamento nos pacientes oncológicos, pois atualmente não é possível tratar certos tipos de câncer sem o sequenciamento genético tumoral. (paranashop.com.br)
  • taxa
  • A constância da evolução molecular, a qual foi deduzida ser inconsistente com a seleção natural, A observação de que partes funcionalmente menos obrigatórias das moléculas evoluem em uma taxa maior, o que se deduziu ser o oposto do que a teoria da seleção natural iria prever. (wikipedia.org)
  • partir
  • O PHYLIP é um programa a partir de linha de comando e não tem uma interface do tipo aponte-clique. (wikipedia.org)
  • utilizando
  • A obtenção dos marcadores envolve a amplificação de sequências que flanqueiam essas regiões repetidas via PCR, utilizando-se de iniciadores específicos para as regiões que cercam os microssatélites. (wikipedia.org)
  • RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA): são fragmentos de DNA amplificados ao acaso pela PCR utilizando iniciadores curtos de sequência aleatória (Williams, 1990). (wikipedia.org)
  • Nas versões mais comuns as trajectórias são determinadas pela resolução numérica das equações de movimento de Newton, enquanto que as forças entre as partículas e as suas energias potenciais são calculadas utilizando potenciais interatómicos ou campos de força criados através de métodos de mecânica molecular. (wikipedia.org)
  • simularam os danos causados em cobre sólido pela radiação utilizando um tipo de interacções repulsivas de Born-Mayer juntamente com forças de coesão superficiais. (wikipedia.org)
  • computacional
  • Reproduzir conteúdo Dinâmica molecular (DM) é um método de simulação computacional que estuda o movimentos físico dos átomos e moléculas das quais se conhecem o potencial de interacção entre estas partículas e as equações que regem o seu movimento. (wikipedia.org)
  • principal
  • O principal benefício é a terapia direcionada, o que possibilita uma conduta mais efetiva para o tipo tumoral", cita a especialista. (paranashop.com.br)
  • acordo com
  • O código original (1957) e a Comissão Judicial, considerando as revisões de 1976 e 1990, não previram ou agiram de acordo com a possibilidade da descrição ou tipificação molecular de procariotas não cultivados. (wikipedia.org)
  • possuem
  • Outros tipos de algas possuem cloroplastos que provavelmente têm origem numa endossimbiose secundária (como as atuais zooxantelas simbiontes dos corais) ou por ingestão dum organismo com aqueles organelos. (wikipedia.org)
  • maior
  • A espécie-tipo para este género é B. arietans, a qual é também a víbora com maior distribuição em África. (wikipedia.org)
  • sendo
  • Como consequência, nomes formais estavam sendo propostos para procariontes não cultivados cuja singularidade era definida apenas por características muito limitadas, tais como as diferenças em um sequência molecular. (wikipedia.org)