Biologia6
- Os bancos de dados do NCBI são um dos maiores repositórios de informações sobre genes, proteínas, genomas, publicações e outros dados importantes nos campos da genética, bioquímica e biologia molecular. (varsomics.com)
- Essa confirmação foi feita com técnicas de biologia molecular, por meio da amplificação do DNA bacteriano por reação de polimerase em cadeia (PCR, ou polymerase chain reaction ). (fapesp.br)
- O Centro Multiusuário de Pesquisa de Bioinsumos e Tecnologias em Saúde (CMBiotecs), no IPTSP, foi inaugurado em 17 de dezembro de 2020 , abrigando diversos laboratórios nos quais é possível desenvolver atividades de pesquisa em bioinformática, bioquímica, biologia molecular, biotecnologia e também vacinas. (ufg.br)
- Fizemos 2,8 mil experimentos, mapeando essas marcas por todo o genoma, examinando 150 bilhões de fragmentos de sequências, o suficiente para cobrir o genoma humano 3 mil vezes", contou, em uma coletiva de imprensa, Manolis Kelli, professor de biologia computacional do Instituto de Tecnologia de Massachusetts (MIT) e principal autor de um dos artigos publicados. (blog.br)
- Se você comparar a identidade da sequência (comparando A, T, C e G dos cromossomos), os humanos são mais semelhantes aos chimpanzés, como seria de esperar", disse Kateryna Makova, professora de biologia Pentz na Penn State. (aulazen.com.br)
- Apesar de já existirem outros métodos moleculares de identificação de espécies, eles costumam envolver o sequenciamento do DNA da amostra, processo mais trabalhoso, lento e custoso", explica Sandra Regina Costa Maruyama, professora do Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular (PPGGEv) da UFSCar e coordenadora do estudo. (ubajaranoticias.com.br)
Bases de dados1
- A metodologia seguiu as diretrizes do PRISMA e incluiu pesquisa nas bases de dados Drugbank, PubMed, PsyclNFO, Embase e Scopus, com a aplicação de filtros para selecionar estudos em investigação e experimental. (ufpi.br)
Pesquisadores5
- Os pesquisadores atualmente são capazes de construir e examinar enormes bancos de dados contendo sequências de DNA, RNA, proteínas e nucleotídeos para resolver dúvidas genéticas, com o objetivo de armazenamento e recuperação de dados. (varsomics.com)
- Embora existam muitos bancos de dados úteis, um dos principais bancos de dados utilizados pelos pesquisadores é o National Center for Biotechnology Information (NCBI), mantido pelos National Institutes of Health dos EUA. (varsomics.com)
- Para identificar se o Omicron pode escapar da resposta das células T, os pesquisadores analisaram 1.500 epítopos de SARS-CoV-2 - um tipo de fragmento viral. (anad.org.br)
- Com essas novas sequências, os pesquisadores puderam ver que o bonobo e o chimpanzé compartilhavam o padrão incomum de taxas aceleradas de mudança na sequência de DNA e perda de genes, sugerindo que esse padrão surgiu antes da divisão evolutiva entre as duas espécies. (aulazen.com.br)
- Com o objetivo de acelerar e facilitar essa distinção e, consequentemente, a definição do tratamento, pesquisadores da Universidade Federal de São Carlos (UFSCar) desenvolveram um teste do tipo PCR - que analisa o material genético contido na amostra - e que leva menos de duas horas para ser concluído. (ubajaranoticias.com.br)
Identidade2
- O alinhamento é realizado de forma em que as sequências tenham identidade (onde são iguais entre si) e gaps (onde há um vazio em uma das sequências) para que tenham um maior score . (varsomics.com)
- Em segundo lugar, com essas informações, podemos saber quais são os reguladores responsáveis por estabelecer a identidade de cada tipo de células. (blog.br)
Repetitivas2
- O cromossomo Y contém muitas sequências repetitivas, que são um desafio para o sequenciamento de DNA, montagem de sequência e alinhamento de sequência para comparação. (aulazen.com.br)
- Mas se você olhar quais genes estão presentes, os tipos de sequências repetitivas e os palíndromos compartilhados, os humanos são mais como gorilas. (aulazen.com.br)
Diferentes tipos2
- Dentro dos diferentes tipos de biópsias, a biópsia incisional (uma incisão cirúrgica é feita para remover uma amostra) ou a biópsia por agulha grossa (uma agulha grossa é usada para retirar uma amostra) são preferidas. (sarcomahelp.org)
- Agora que mostramos que apresentam especificidade em diferentes tipos de amostras, é necessário otimizar o ensaio para que em uma única reação de qPCR saibamos se a espécie infectante em questão é Leishmania infantum, Crithidia ou ambas", diz Maruyama. (ubajaranoticias.com.br)
Pesquisa1
Baseadas2
- Avaliar os efeitos da injeção de uma solução contendo proteínas N recombinantes, do nucleocapsídeo, de SARS-CoV-2 sobre o conjunto total de miRNAs espermáticos de zebrafish a fim de identificar um conjunto de biomarcadores epigenéticos que apontem a segurança reprodutiva de imunizações baseadas na utilização desse tipo de proteína. (edu.br)
- 2. (Ufc 2009) Evidências moleculares, baseadas em sequências de RNA, sugerem o parentesco entre moluscos anelídeos. (monografias.com)
Genoma1
Estudo2
- A definição atual traz a epigenética como "o estudo das alterações na função do gene que podem ser herdadas por mitose ou meiose e que não envolvem mudança na sequência de nucleotídeos do DNA", ou seja, a epigenética se caracteriza como mecanismo de variação fenotípica em indivíduos e populações sem mudanças na estrutura genética. (scribd.com)
- Por fim, nos fornecem uma referência para o estudo das bases moleculares das doenças humanas, ao revelar as regiões de controle que abrigam variantes genéticas associadas a diferentes distúrbios", disse. (blog.br)
Quais3
- Quais são os tipos de análise de sequências de nucleotídeos? (varsomics.com)
- Isso permitiu que eles identificassem exatamente quais dos peptídeos reconhecidos nas variantes virais anteriores não existiam mais com exatamente a mesma sequência na variante Omicron", disse o Prof. Kern. (anad.org.br)
- Isso deu a eles confiança de que a grande maioria dos peptídeos que são importantes para a resposta das células T ao SARS-CoV-2 não foram afetados pelas mutações encontradas no Omicron e ainda se ligariam às moléculas do MHC às quais as sequências não mutadas se ligaram. (anad.org.br)
Alinhamento3
- Também há o alinhamento múltiplo de sequências onde duas ou mais sequências são alinhadas e comparadas entre si, podendo também escolher ter uma análise local ou global. (varsomics.com)
- Desta forma, o cálculo prevê qual alinhamento é o mais adequado para determinadas sequências. (varsomics.com)
- Para mais informações, acesse " Bioinformática: alinhamento de sequências" . (varsomics.com)
Comparar2
- A ferramenta de comparação de sequências de DNA com os bancos de dados genômicos é o BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), através dela podemos comparar sequências de DNA ou qualquer proteína com todas as sequências genômicas de domínio público. (varsomics.com)
- Esse recurso nos permite comparar diferentes tecidos e tipos de células no nível molecular e entender o que os faz diferentes", observou Kelli, lembrando que, embora todas as células do corpo contenham o mesmo DNA, algumas se tornarão neurônios, e outras, hemácias, por exemplo. (blog.br)
Identificar3
- Os estudos já permitiram desenvolver testes moleculares para identificar as plantas doentes, estabelecer formas de controle como a erradicação dos pés de citros atacados pelo greening . (fapesp.br)
- A calculadora de RBS, portanto, combina um modelo biofísico com otimização estocástica para identificar uma sequência sintética (não natural) de RBS que irá proporcionar a taxa de início de tradução desejada. (unicamp.br)
- Os novos alvos se mostraram específicos, entretanto é necessário realizar inicialmente um ensaio para detectar o primeiro parasita e, na sequência, um segundo para identificar Crithidia. (ubajaranoticias.com.br)
Analisar2
- Podemos analisar as mais variadas sequências das mais diversas formas. (varsomics.com)
- Para fazer isso, no entanto, eles precisam analisar dados biológicos extremamente grandes e altamente complexos. (engenhariae.com.br)
Artigos2
- Hoje, na edição on-line na revista Nature, os integrantes do projeto dos Estados Unidos divulgaram, em 24 artigos, o mapeamento epigenético de 111 tipos de células e tecidos primários humanos. (blog.br)
- Em 2017, o descritor será usado apenas para indexar artigos gerais sobre sequência de dados. (bvsalud.org)
Genes1
- Para o otimização de expressão de genes, é muito comum o desenvolvimento de bibliotecas de sequencias de RBS com o objetivo de otimização de funções de sistemas gênicos. (unicamp.br)
Estudos1
- A incidência de leucemia e de vários tumores sólidos nos sobreviventes da bomba atômica produziu uma grande quantidade de dados para os estudos clássicos sobre a dosagem de radiação e suas consequências. (medicinanet.com.br)
Seja2
- 1998 - 2004), verificamos que, apesar de pequenas mudanças em bases nos cromossomos, a sequência genética de todos os indivíduos difere muito pouco, ou seja, o mesmo material que você tem, uma pessoa da Indonésia terá. (scribd.com)
- O tamanho da biblioteca aumenta combinatoriamente com o número de proteínas do sistema, ou seja, 16,7 milhões de sequências para um sistema com 3 proteínas e 2,8 x 1014 sequencias para um sistemas com 6 proteínas). (unicamp.br)
Mesma1
- Contudo, a complexidade dos alelos é a mesma complexidade relacionada à genética molecular: um alelo A e um a possuem a mesma base genotípica, mas podem ter pequenas diferenças de bases nucleotídicas que farão a ser mascarado, não ser expressado (em dominâncias completas) ou ser expressado em menores porcentagens. (scribd.com)
Parecidas2
- Há também outros métodos de análise comparativa, como o BLASTX que consulta o DNA com base de dados de proteínas, válido quando as sequências são muito parecidas entre si e com os nucleotídeos que as codificam. (varsomics.com)
- Após esta produção da sequência genética capaz de induzir a formação de proteínas parecidas com a do novo coronavírus, o material genético é protegido por um "envelope" de partículas lipídicas, e estão prontas. (ufg.br)
Montagem1
- Dado um RBS e a região codificadora da proteína, o modelo é capaz de calcular a mudança de energia livre durante a montagem do complexo ribossomal 30S no RNAm (ΔGTOT). (unicamp.br)
Cromossomos1
- A reanálise da sequência de DNA dos cromossomos Y específicos do homem de todas as espécies vivas da família dos grandes macacos ajuda a esclarecer nossa compreensão de como esse cromossomo enigmático evoluiu. (aulazen.com.br)
Desenvolvimento2
- Para finalizar, as infecções virais foram vinculadas ao desenvolvimento de tipos específicos de câncer. (medicinanet.com.br)
- Um passo muito importante nesse sentido foi dado pelo Grupo do Prof. Howard Salis , pesquisador que eu tenho o prazer de trabalhar dentro do Synberc , com o desenvolvimento da calculadora de RBS (ribossomal binding site ou sítio de ligação com o ribossomo). (unicamp.br)
20161
- Até a versão de 2016, o MeSH fazia distinção entre dois tipos de sinônimos: os "Print entry terms" (PE) e os "Non-print entry terms" (NPE). (bvsalud.org)
DDBJ1
- Quando o banco de dados foi construído juntamente com outros dois (DDBJ,ENA/EBI) foi proposto um consórcio que contava com a colaboração de diferentes bancos para atualizar os dados diariamente. (varsomics.com)
Ferramenta1
- Esses resultados têm potencial de gerar um conjunto de biomarcadores moleculares epigenéticos para o déficit reprodutivo, sendo uma ferramenta bastante útil no processo de testagem de futuras vacinas para a COVID-19. (edu.br)
Anteriores1
- Trabalhos anteriores da equipe comparando sequências de humanos, chimpanzés e gorilas revelaram alguns padrões inesperados. (aulazen.com.br)
Comum1
- Um tipo muito comum de mudança epigenômica é a metilação. (blog.br)
Sarcoma2
- e sarcoma de Kaposi com herpesvírus humano tipo 8. (medicinanet.com.br)
- Sarcoma de células claras de partes moles (não confundir com sarcoma de células claras renal) é um tipo de câncer primário raro, que afeta adultos jovens entre 20 e 40 anos de idade. (sarcomahelp.org)
Humanos1
- Uma equipe de biólogos e cientistas da computação da Penn State sequenciou e montou o cromossomo Y de orangotango e bonobo e comparou essas sequências com as sequências Y existentes de humanos, chimpanzés e gorilas. (aulazen.com.br)
Unidades1
- Esse tipo de refrigerador não é encontrado nas unidades de saúde convencionais e são de alto custo, por isso a parceria com a UFG poderá agilizar a vacinação da população neste momento de crise sanitária e evitar custos aos cofres públicos. (ufg.br)
Modelos1
- Para isso, serão necessários modelos biofísicos que descrevam a relação de uma sequência de DNA que a sua função. (unicamp.br)