• podem
  • Junto com a determinação do padrão de descendentes, a genética molecular ajuda a compreender as mutações genéticas que podem causar certos tipos de doenças. (wikipedia.org)
  • Nucleótidos de DNA são a base para o novo DNA, o DNA molde é a sequência específica a ser amplificada, iniciadores são nucleótidos complementares que podem ir em ambos os lados do DNA molde, e a polimerase Taq é uma enzima termicamente estável que salta-inicia a produção de DNA novo às temperaturas elevadas necessárias para a reacção. (wikipedia.org)
  • Podem ser caracterizados como marcadores moleculares quando ocorrem em mais de 1% da população, pois quando essas variações são relatadas com uma frequência menor que este valor, então é considerado apenas como mutações pontuais. (wikipedia.org)
  • 6 Modelo de dados Uma coleção de conceitos que podem ser usados para descrever a estrutura do banco de dados. (slideplayer.com.br)
  • Os dados podem ser filtrados e analisados para desenvolver libarias de crivado (screening) de compostos para a identificação durante a descoberta de fármacos. (wikipedia.org)
  • Códigos de barra de DNA são sequências curtas de DNA, amplificadas por PCR e sequenciadas, que podem ser utilizadas na distinção e identificação de espécies. (wikipedia.org)
  • Christian de Duve (premiado com o Prémio Nobel Medicina , em 1974 ) considera que os peroxissomas podem ter sido os primeiros endossimbiontes, que permitiram às células adaptar-se à quantidade crescente de oxigénio molecular na atmosfera da Terra, no entanto, como estes organelos também não possuem DNA, esta teoria é considerada especulativa e sem bases sólidas. (wikipedia.org)
  • Cientistas brasileiros descobriram que as sequências das moléculas de DNA podem ser reproduzidas através de estruturas matemáticas. (blogspot.com)
  • Os gráficos são complementados por tabela apresenta, e, em muitos casos, os dados podem ser exportados diretamente da página em uma variedade de formatos de arquivo padrão, tais como FASTA. (wikipedia.org)
  • Externamente dados produzidos também podem ser adicionados para a exibição, através de uma DAS (Distributed Anotação do Sistema) servidor na internet, ou fazendo o upload de uma adequada arquivo em um dos formatos suportados, tais como BAM, CAMA, ou PSL. (wikipedia.org)
  • Os usuários podem até mesmo escolher para recuperar dados do MySQL com consultas diretas em SQL, mas isso requer um extenso conhecimento do atual esquema de banco de dados. (wikipedia.org)
  • Grandes conjuntos de dados podem ser recuperados usando a ferramenta de extração de dados, o BioMart. (wikipedia.org)
  • genes
  • É um programa instrumental para identificação de genes e de sequências genéticas características. (ulisboa.pt)
  • O presente trabalho teve como objetivo compilar, reinterpretar e determinar a diversidade cariotípica de Trinomys e Proechimys, associando cariótipos à distribuição geográfica e, por meio de filogenias geradas por sequências de DNA de genes nucleares e mitocondriais, associar clados e cariótipos. (ufes.br)
  • Trinomys, no qual cariótipos e sequências de 62 novos exemplares foram somados aos disponíveis na literatura para recuperar filogenias moleculares utilizando os genes citB e vWF, visando avaliar se o cariótipo é um bom marcador para a diagnose dos táxons. (ufes.br)
  • Atualmente é a genética que proporciona as ferramentas necessárias para a investigação das funções dos genes, isto é, a análise das interações genéticas. (wikipedia.org)
  • Após iniciativa dos Institutos Nacionais da Saúde estadunidenses (NIH), centenas de laboratórios de todo o mundo se uniram à tarefa de sequenciar, um a um, os genes que codificam as proteínas do corpo humano e também aquelas sequências de DNA que não são genes. (wikipedia.org)
  • Os cientistas brasileiros estabeleceram uma relação matemática entre um código numérico e a sequência do DNA, o ácido desoxirribonucléico, portador dos genes dentro das células. (blogspot.com)
  • Uma opção é a anotação manual, segundo a qual uma equipe de cientistas tenta localizar genes usando dados experimentais de revistas científicas e bancos de dados públicos. (wikipedia.org)
  • No projeto Ensembl, as sequências de dados são enviados para o sistema de anotação de genes (um conjunto de software de "pipelines", escrito em Perl), que cria um conjunto de locais previstos do gene e salva-los em um banco de dados MySQL para posterior análise e de visualização. (wikipedia.org)
  • A idea central para o conceito da Ensembl é a capacidade de gerar vistas gráficas automaticamente para o alinhamento de genes e outros dados genômicos contra um genoma de referência. (wikipedia.org)
  • Outras maneira de exibir dados em vários níveis de resolução, a partir de todo o cariótipo para baixo para texto baseado em representações de DNA e aminoácidos sequências, ou apresentar outros tipos de visualização, tais como árvores de genes similares (homólogos) através de uma variedade de espécies. (wikipedia.org)
  • Além de seu site, a Ensembl fornece um APIem Perl (Interface de Programação de Aplicativo) que produz modelos de objetos biológicos, tais como os genes e proteínas, permitindo serem escritos scripts simples para recuperar dados de interesse. (wikipedia.org)
  • diferentes
  • Ele foi obtido a partir de pesquisas sobre a estrutura da proteína no caso hemoglobinas de espécies diferentes, traçando o número de mudanças do aminoácido entre as sequências de proteína contra a idade estimada de espécies a partir de evidências fósseis. (wikipedia.org)
  • Um marcador genético ideal deve apresentar uma série de atributos: Alto nível de polimorfismo Estabilidade em diferentes ambientes Detectar grande número de loci não ligados Herança simplesGuerra, Nodari e Stefenon Os marcadores moleculares correspondem, basicamente, a uma sequência de nucleotídeos que atua como referência em um cromossomo. (wikipedia.org)
  • Através da tecnologia dos marcadores moleculares a caracterização genética de diferentes genomas se tornou mais fácil e rápida, e com isso foram surgindo diversas metodologias capazes de utilizar e caracterizar alterações nesses marcadores. (wikipedia.org)
  • Até o momento, mais de 17000 sequências de miRNAs em mais de 140 espécies diferentes foram catalogadas no miRBase (http://www.mirbase.org/), número este que tem aumentado exponencialmente, e nos últimos três anos quase triplicou. (wikipedia.org)
  • O Objetivo é expor uma visão geral dos aspectos básicos de um banco de dados (que costuma gerar um pouco de confusão nas conversas entre biológos e computeiros), sobre o que seriam esses dados biológicos, é claro interagindo com os diferentes momentos, mostrando também um pouco da evolução desse assunto. (slideplayer.com.br)
  • Está formatado de uma maneira que facilita o mineração de dados computarizado, e trata de normalizar atividades entre diferentes publicações, para permitir análises comparativas. (wikipedia.org)
  • BLAST (sigla em inglês que significa: Basic Local Alignment Search Tool), é um algoritmo para comparar informações de sequências biológicas primárias, tais como seqüências de aminoácidos de diferentes proteínas ou nucleotídeos de seqüencias de DNA. (wikipedia.org)
  • Foram dados historicamente aos codões de parada muitos nomes diferentes, uma vez que cada um deles correspondia a uma classe distinta de mutantes que se comportavam todos de maneira similar. (wikipedia.org)
  • O grupo brasileiro estabeleceu essa relação com diferentes sequências de DNA que constituem o genoma (exons, íntrons, DNA repetitivo, sequência de direcionamento, proteínas, hormônios, gene, etc) até chegarem na reprodução do genoma completo de um plasmídeo. (blogspot.com)
  • Uma sequência, ou "trem", de pulsos nervosos pode conter informação baseada em diferentes esquemas de codificação. (wikipedia.org)
  • outros
  • Metadados, ou Metainformação, são dados capazes de descrever outros dados, ou seja, dizer do que se tratam, dar um significado real e plausível a um arquivo de dados, são a representação de um objeto digital. (slideplayer.com.br)
  • Os dados deste serviço incluem compostos do conjunto de crivado Malaria Box, e também os outros dados sobre a malária singelos que se encontram em ChEMBL-NTD. (wikipedia.org)
  • A submissão dessas sequências segue um padrão de qualidade e acompanha também outros dados, como descrições morfológicas, fotografias, e o museu ou herbário onde aquela amostra foi depositada. (wikipedia.org)
  • Depois de 10 anos de existência, o objetivo da Ensembl continua a fornecer uma forma centralizada de recursos para os geneticistas, biólogos moleculares e de outros pesquisadores que estudam o genoma da nossa própria espécie e de outros vertebrados e de organismos modelo. (wikipedia.org)
  • Avaliou-se as características exclusivas para a proteína de S. mansoni por meio de uma análise das sequências FASTA em comparação com a DHFR de outros organismos. (usp.br)
  • banco
  • O pacote EMBOSS contém uma variedade de aplicações para alinhamento de sequências, busca rápida em banco de dados com padrões de seqüência, identificação de estruturas secundárias de proteínas (protein motif) (incluindo a análise de domínio), e muito mais. (wikipedia.org)
  • Com isso, a necessidade de catalogar a informação e facilitar a atribuição de nomes a novos miRNA levou ao desenvolvimento de um banco de dados de microRNA - o miRNA Registry, atualmente conhecido como miRBase. (wikipedia.org)
  • 3 Banco de Dados A database is a collection of related data. (slideplayer.com.br)
  • Inspirados neste sistema, o cientista Paul Hebert e seus colaboradores (2003) esperavam tornar o processo de identificação de espécies muito mais rápido e formar um banco de dados de toda a biodiversidade mundial. (wikipedia.org)
  • O banco de dados do projeto Barcoding of Life reúne, atualmente, quase três milhões de sequências. (wikipedia.org)
  • O site do BOLD (boldsystems.org) disponibiliza, além do número atualizado de códigos de barra de DNA existentes no mundo, um portal público de buscas e um portal educacional para possibilitar uma melhor navegação no banco de dados além de tornar possível a contribuição para novos códigos de barra, dentre outras funcionalidades. (wikipedia.org)
  • Todos os dados e o código produzido pelo projeto Ensembl está disponível para transferência, e há também um servido de acesso público de banco de dados, permitindo o acesso remoto. (wikipedia.org)
  • Este software pode ser usado para acesso público MySQL de banco de dados, evitando a necessidade de transferir enormes conjuntos de dados. (wikipedia.org)
  • foram
  • Outras proteínas também mostraram uma taxa constante de evolução molecular entre espécies, mas cada proteína com uma taxa diferente: histonas foram excepcionalmente lentas, citocromo c foi mais rápido (mas mais lento do que hemoglobinas) e fibrinopeptídeos foram mais rápidos ainda. (wikipedia.org)
  • Motoo Kimura e Ohta Tomoko afirmaram que a taxa constante para cada característica da proteína, sugeriu que a maior parte dos aminoácidos que sofriam alterações em uma proteína foram efetivamente neutras - ou seja,a mudança da sequência do aminoácido não teve influência sobre a aptidão de um organismo e, portanto, a taxa de mudança não foi afetado pela seleção natural. (wikipedia.org)
  • e algumas sequências gênicas específicas foram associadas a numerosas doenças e disfunções, incluindo câncer de mama, doenças musculares, surdez e cegueira. (revistaensinosuperior.com.br)
  • Os dados foram comprados por EMBL em 2008 com um abono de The Wellcome Trust, o que teve como resultado a criação do grupo de quimioxenómica ChEMBL no EMBL-EBI, encabeçado por John Overington. (wikipedia.org)
  • Foram desenvolvidos diversos algoritmos para problemas de classificação e regressão em problemas, onde se pretende prever estruturas complexas: vetores, sequências ou grafos. (inesctec.pt)
  • A fim de garantir a ação seletiva dessas moléculas frente a enzima do parasita, os campos moleculares de interação seletivos para Sm DHFR foram calculados e empregados na construção do modelo farmacofórico, o qual foi utilizado na triagem virtual de inibidores de Sm DHFR. (usp.br)
  • partir
  • O software automaticamente lida com dados em uma variedade de formatos e até mesmo permite a recuperação transparente de dados de seqüências a partir da web. (wikipedia.org)
  • Abaixo, segue uma lista com os principais tipos de marcadores moleculares genômicos: RFLP (Restriction fragment lenght polymorphism): são fragmentos de DNA obtidos a partir de uma técnica que consiste na hibridização de sequências específicas de DNA, denominadas sondas, com o DNA total digerido por enzimas de restrição dos indivíduos a serem analisados. (wikipedia.org)
  • Com Richard Eck, ela publicou a primeira reconstrução computacional de filogenia (árvore evolutiva) a partir de sequências moleculares, utilizando um método de máxima parcimônia. (wikipedia.org)
  • Planeja-se explorar e estender estruturas conceituais como ontologias e thesauri, a partir do processamento de linguagem natural e da mineração de dados. (openwetware.org)
  • Decodificação neural se refere ao mapa inverso, da resposta para o estímulo, e o desafio é reconstruir um estímulo, ou certos aspectos daquele estímulo, a partir das sequências de pulsos nervosos que ele evoca. (wikipedia.org)
  • utilizando
  • A obtenção dos marcadores envolve a amplificação de sequências que flanqueiam essas regiões repetidas via PCR, utilizando-se de iniciadores específicos para as regiões que cercam os microssatélites. (wikipedia.org)
  • RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA): são fragmentos de DNA amplificados ao acaso pela PCR utilizando iniciadores curtos de sequência aleatória (Williams, 1990). (wikipedia.org)
  • Os dados cariotípicos presentes na literatura tem revelado que os gêneros Proechimys e Trinomys abrigam uma diversidade maior de táxons do que se reconhece, revelando a necessidade de uma investigação utilizando ferramentas com bom poder discriminatório. (ufes.br)
  • Depois da descoberta do código genético e de ferramentas de clonagem utilizando enzimas de restrição, os temas abertos à investigação científica em genética sofreram um aumento considerável. (wikipedia.org)
  • seja
  • No entanto, mesmo não fornecendo dados exatos, ou seja, ele fornece estimativas de tempo de eventos na história evolutiva, a ampla gama de hipóteses biológicas que vão desde as origens do reino animal para o surgimento de novas epidemias virais. (wikipedia.org)
  • Embora a variedade de cálculo de processos existentes seja muito grande (incluindo variantes que incorporam o comportamento estocástico, informações de tempo, e especializações para o estudo de interações moleculares), existem vários recursos que todos os cálculos de processos tem em comum: Representam interações entre processos independentes como comunicação (transmissão de mensagens). (wikipedia.org)
  • Também chamados "códigos da vida", baseiam-se em sequências de 500 a 800 pares de bases padronizados, ou seja, presentes em um mesmo trecho do genoma. (wikipedia.org)
  • GenBank
  • O sistema de dados de códigos de barra da vida, estabelecido em 2005 pelo Instituto de Biodiversidade de Ontário, é uma bancada de trabalho online que combina um repositório de código de barras, ferramentas analíticas, interface para apresentação de sequências de GenBank, uma espécie de ferramenta de identificação e conectividade para os desenvolvedores web externos e bioinformatas. (wikipedia.org)
  • grupo
  • Microssatélites (SSRP - Simple Sequence Repeats Polymorphisms): um grupo de marcadores molecular muito utilizados, os quais são caracterizados por unidades muito curtas de sequências repetitivas de nucleotídeos. (wikipedia.org)
  • Outras
  • São disponibilizados pelo NCBI outras ferramentas de software, entre elas a ferramenta ORF Finder (para encontrar uma grelha de leitura aberta - O pen R eading F rame), ou, dito de outra forma, de um gene. (ulisboa.pt)
  • Ao longo do tempo o projeto foi ampliado para incluir outras espécies (incluindo os principais organismos-modelo, tais como rato, mosca da fruta e o peixe-zebra), bem como uma vasta gama de dados genômicos, incluindo variações genéticas e recursos regulamentares. (wikipedia.org)
  • projeto
  • O presente projeto propõe investigações científicas teórico-práticas para a definição de relacionamentos e a busca entre informações médicas, moleculares e de saúde para auxiliar a prevenção de doenças crônicas. (openwetware.org)
  • O atual avanço da medicina molecular tão em voga no momento é resultado do Projeto Genoma Humano, iniciado em 1990, e coordenado pelo Departamento de Energia do Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos. (revistaensinosuperior.com.br)
  • A grande revolução nesse novo trabalho é a de que o genoma avaliado corresponde ao genoma diplóide, contendo a informação de cada par de cromossomo herdado de nossos pais, ao contrário da sequência determinada pelo Projeto Genoma que corresponde ao genoma haplóide. (wikipedia.org)
  • Como resultado, descobriu-se que a semelhança das sequências genéticas entre dois indivíduos é de 99,5% e não de 99,9% como se imaginava ao fim do Projeto Genoma Humano. (wikipedia.org)
  • meio
  • Boa tarde, meu nome é Daniel, sou aluno de doutorado do Departamento de Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto e trabalho com bioinformática a cerca de 6 anos e meio no Laboratório de Genética Molecular e Bioinformática. (slideplayer.com.br)
  • complexos
  • Os métodos de modelação preditiva desenvolvidos no MAESTRA lidam com fluxos de dados complexos e estruturados, gerados por processos não estacionários e com elevado grau de incerteza. (inesctec.pt)
  • exemplo
  • Um exemplo seria escolher um dado parafuso e projetar a entrada em componentes nos quais este parafuso se fixe corretamente neste. (wikipedia.org)
  • usam
  • Filogeneticistas moleculares, que usam sequência de DNA como dados, tem levado a muitas revisões recentes e provavelmente continuarão a fazê-lo. (wikipedia.org)
  • De forma geral, os códigos de correção de erros estão presentes na comunicação via satélite, nas comunicações internas de um computador e no armazenamento de dados - portanto, fazem parte do cotidiano de todos que usam a internet, celulares, TVs, CDs, pen-drives etc. (blogspot.com)
  • longo
  • Esse estudo prevê que a longo prazo a taxa de evolução molecular neutra em espécies é o mesmo que a taxa de mutação neutra nos indivíduos.Se grande parte das mudanças dos aminoácidos são neutras ou deletérias, em seguida, a taxa prevista constante de mudança de proteína produz um relógio molecular. (wikipedia.org)
  • campo
  • O campo da fisiologia animal se estende desde as ferramentas e métodos da fisiologia humana até as espécies não-humanas. (wikipedia.org)
  • European Molecular
  • An interview with John Overington, team leader, chemogenomics at the European Bioinformatics Institute Outstation of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL-EBI). (wikipedia.org)
  • Biology
  • Introduction to Computational Molecular Biology. (wikipedia.org)
  • The molecular biology has provided the basic tool for geneticists deepening in the molecular mechanisms that influence different diseases. (scielosp.org)
  • The objective of this review was to bring the light of knowledge, data on characteristics of the ethical application of molecular biology, linking it with the rights of human beings. (scielosp.org)
  • conhecida
  • As vantagens do microPIXE aparecem ao se analisar uma proteína com sequencia conhecida, a emissão de raios-X do Enxofre pode ser utilizado como uma padrão interno para calcular a quantidade de metais por monômero proteico. (wikipedia.org)
  • cientistas
  • Só depois da morte de Mendel é que o seu trabalho foi redescoberto, entendido (início do século XX) e lhe foi dado o devido valor por cientistas que então trabalhavam em problemas similares. (wikipedia.org)
  • utilizados
  • O código de 1 letra utilizado para aminoácidos foi criado por ela, reduzindo o tamanho dos arquivos utilizados para escrever sequências de aminoácidos na era da computação por cartões perfurados. (wikipedia.org)
  • pode ser
  • A escolha do tipo de dados que pode ser trocado em uma interação é uma das principais características de diferenciação dos cálculo de processos. (wikipedia.org)
  • Se a breve duração de um potencial de ação (aproximadamente 1ms) é ignorada, uma sequência de potencial de ação, ou trem de pulsos nervosos, pode ser caracterizada simplesmente por uma série de eventos ponto de tudo ou nada no tempo. (wikipedia.org)
  • obteve
  • Ela obteve seu doutorado na Universidade de Columbia, no Departamento de Química, onde elaborou métodos computacionais para calcular a energia de ressonância molecular de diversos compostos orgânicos. (wikipedia.org)
  • resultados
  • Assim, os resultados obtidos reforçam a importância dos dados cariotípicos na caracterização das espécies de Trinomys. (ufes.br)
  • diversos
  • Apresenta história taxonômica confusa, com vários nomes genéricos propostos, diversos abandonados, tornando os dados sobre a família e gêneros altamente instáveis. (ufes.br)