• Abordagens computacionais para o alinhamento de sequências dividem-se, em geral, em duas categorias: alinhamentos globais e alinhamentos locais. (wikipedia.org)
  • Por outro lado, os alinhamentos locais identificam regiões de similaridade dentro de sequencias longas que são geralmente bastante divergentes em um todo. (wikipedia.org)
  • Sua construção e estrutura são similares à PAM, no entanto cada matriz foi construída usando blocos (alinhamentos locais sem gaps ) de sequências com diferentes níveis de similaridade, e não extrapoladas a partir de uma inicial). (varsomics.com)
  • Sequências alinhadas de nucleotídeos ou resíduos de aminoácidos são representadas tipicamente como linhas de uma matriz. (wikipedia.org)
  • Também há o alinhamento múltiplo de sequências onde duas ou mais sequências são alinhadas e comparadas entre si, podendo também escolher ter uma análise local ou global. (varsomics.com)
  • Calcular um alinhamento global é uma forma de otimização global que "força" o alinhamento a cobrir todo o comprimento de todas as sequencias interrogadas (query). (wikipedia.org)
  • Uma grande variedade de algoritmos existem para abordar o problema de alinhamento de sequencias, sendo os mais conhecidos os baseados em programação dinâmica, mais lentos porém teoricamente otimizadores, ou baseados em heurística, mais eficientes/rápidos mas sem prova formal de obtenção de solução ótima. (wikipedia.org)
  • O Alinhamento de sequências pode ser realizado entre pares ou entre múltiplas sequências, e são classificados como locais (em uma região do gene) ou globais (em todo o gene). (varsomics.com)