biologia

  • A área emergiu como um campo científico nos anos 60, quando pesquisadores das áreas da biologia molecular, biologia evolutiva e genética de populações procuraram entender algumas descobertas que haviam sido feitas sobre a estrutura e função de ácidos nucléicos e proteínas. (wikipedia.org)
  • Em biologia, filogenia (ou filogênese) é o estudo da relação evolutiva entre grupos de organismos (por exemplo, espécies, populações), que é descoberto por meio de sequenciamento de dados moleculares e matrizes de dados morfológicos. (wikipedia.org)
  • Ela dedicou sua carreira à aplicação das tecnologias computacionais para promover avanços no campo da biologia e da medicina, em especial à criação de bases de dados de ácidos nucleicos e proteínas, além de ferramentas para utilizá-las. (wikipedia.org)
  • Ela lecionou fisiologia e biofísica por 13 anos, tornando-se concomitantemente afiliada à Nacional Biomedical Research Foundation, membra da Associação Americana para o Avanço da Ciência, conselheira da Sociedade Internacional para o Estudo da Origem da Vida (1980) e atuando nos conselhos editoriais de Journal of Molecular Evolution e Computadores em Biologia e Medicina. (wikipedia.org)
  • Essas similaridades e diferenças entre os tipos de célula são particularmente relevantes para a biologia molecular. (wikipedia.org)
  • A teoria do relógio molecular é uma excelente ferramenta para a biologia. (wikipedia.org)
  • A genética molecular é a área da biologia que estuda a estrutura e a função dos genes a nível molecular. (wikipedia.org)
  • A genética molecular usa os métodos da genética e da biologia molecular. (wikipedia.org)
  • Através da utilização dos métodos de genética e biologia molecular, a genética molecular descobre as razões pelas quais as características são exercidas e como e porque algumas podem sofrer mutações. (wikipedia.org)
  • Nas classificações de base morfológica, anteriores à aplicação dos conceitos da biologia molecular e da moderna filogenia, todos os géneros agora incluídos nas Adoxaceae eram considerados parte da família Caprifoliaceae, a família das madressilvas. (wikipedia.org)
  • O surgimento de novas técnicas de biologia molecular permitiu a utilização de marcadores genéticos capazes de detectar polimorfismos a níveis de DNA. (wikipedia.org)
  • EMBOSS é um pacote de análise de código aberto especialmente desenvolvido para as necessidades da comunidade de usuários da biologia molecular e da bioinformática. (wikipedia.org)
  • Como um campo interdisciplinar da ciência, a bioinformática combina a biologia, ciência da computação, estatística, matemática e engenharia para analisar e interpretar e processar dados biológicos. (wikipedia.org)
  • Alguns especialistas brasileiros da área acreditam que a bioinformática, como se entende tradicionalmente no meio acadêmico e não pela análise da palavra, é circunscrita à biologia molecular, às vezes ainda mais especificamente restrita à Genômica. (wikipedia.org)
  • A bioinformática tornou-se uma parte muito importante de muitas áreas da biologia molecular. (wikipedia.org)
  • Em biologia molecular experimental, técnicas de bioinformática, tais como imagem e processamento de sinais, permitiram a extração de resultados úteis a partir de grandes quantidades de dados brutos. (wikipedia.org)
  • As ferramentas de bioinformática auxiliam na comparação de dados genéticos e genômicos e, mais geralmente, na compreensão dos aspectos evolutivos da biologia ao nível molecular. (wikipedia.org)
  • O termo bioinformática foi originalmente usado pelos biológos Paulien Hogeweg e Ben Hesper no começo dos anos 1970 para definir o estudo de processos informacionais nos sistemas bióticos, sendo ela uma ciência interdisciplinar, envolvendo matemática, tecnologia computacional e biologia molecular. (wikipedia.org)
  • Em biologia molecular, sequenciamento (português brasileiro) ou sequenciação (português europeu) é o nome dado ao processo de determinação da ordem sequencial das partes constituintes de um biopolímero não ramificado, isto é, a ordem de nucleotídeos de uma molécula de DNA ou RNA, ou de aminoácidos de uma proteína. (wikipedia.org)
  • Em função do papel chave do DNA para os seres vivos, o conhecimento sobre a sequência de DNA pode ser útil em praticamente qualquer área da pesquisa em biologia. (wikipedia.org)
  • Os campos da biologia que mais se beneficiam da Biologia Computacional incluem: Bioinformática, que aplica algoritmos e técnicas estatísticas para bancos de dados de informação sobre biologia, que geralmente consistem de grande número sequências de DNA, RNA ou proteínas. (wikipedia.org)

base de dados

  • Esse livro levou à criação da base de dados Protein Information Resource, desenvolvida em seu grupo de pesquisa. (wikipedia.org)
  • Essa iniciativa, somada ao esforço do grupo de Walter Goad que originou o GenBank, base de dados de sequências de ácidos nucleicos, deram origem às bases de dados modernas de sequência moleculares. (wikipedia.org)
  • A lista de gêneros que ocorrem no Brasil é baseada na base de dados Flora do Brasil (2017): Aniseia Choisy Argyreia Lour Bonamia Thouars Calycobolus Willd. (wikipedia.org)
  • UniProt (Universal Protein) é uma base de dados acessível gratuitamente, de alta qualidade e completa de informação de sequências de proteínas e as suas funções, na qual muitas das entradas procedem de projectos de sequenciação de genomas. (wikipedia.org)
  • O PIR, está albergado na Fundação de Investigação Biomédica Nacional (National Biomedical Research Foundation, NBRF) do Centro Médico da Universidade de Georgetown em Washington, DC, EUA, e é herdeiro da antiga base de dados de sequências de proteínas chamadas Atlas de Sequências e Estruturas de Proteínas de Margaret Dayhoff, que se começou a publicar em 1965. (wikipedia.org)
  • Cada um dos membros do consórcio está muito implicado na manutenção da base de dados de proteínas e na sua anotação. (wikipedia.org)
  • Até há pouco, o EBI e o SIB em conjunto produziam as bases de dados Swiss-Prot e TrEMBL, enquanto que o PIR gerava a Base de dados de Sequências de Proteínas (Protein Sequence Database, PIR-PSD). (wikipedia.org)
  • Enquanto isso, o PIR mantinha a mencionada PIR-PSD e bases de dados relacionadas, incluindo a base de dados de proteínas e famílias proteicas revistas iProClass. (wikipedia.org)
  • UniProt Knowledgebase (UniProtKB) é uma base de dados de proteínas parcialmente revista por peritos, que consta de duas secções: UniProtKB/Swiss-Prot (que contêm entradas anotadas manualmente, revistas) e UniProtKB/TrEMBL (que contém entradas anotadas automaticamente e não revistas). (wikipedia.org)
  • UniProtKB/Swiss-Prot é uma base de dados de sequências não redundantes anotadas manualmente. (wikipedia.org)
  • As sequências do mesmo gene e da mesma espécie fundin-se na mesma entrada da base de dados. (wikipedia.org)

genoma

  • SNPs (single nucleotide polymorphism): são marcadores moleculares capazes de detectar mutações e polimorfismos através de alterações de uma única base no genoma. (wikipedia.org)
  • À medida em que as sequências do Projeto Genoma acumulam, as séries de dados moleculares se tornam imensos e confusos, com a maioria dos alinhamentos gênicos apresentando distribuições taxonômicas estranhas (desiguais) e histórias evolucionárias conflitantes. (blogspot.com)
  • A proposta visava reparar a incapacidade do Código Internacional de Nomenclatura Bacteriana em fornecer regulamentação sensata para a nomenclatura de novos táxons definidos através de poucos dados, como por exemplo uma sequência de nucleotídeos para uma pequena porção do genoma. (wikipedia.org)
  • Além das informações do genoma, tais como as sequências aptas a determinar a posição filogenética do organismo, todas as informações, incluindo as características estruturais, metabólicas e de reprodução devem ser incluídas na descrição, juntamente com o ambiente natural em que o organismo pode ser identificado através de hibridização "in situ", ou outras técnicas semelhantes para a identificação de células. (wikipedia.org)
  • Este material representa regiões do genoma de tumores malignos onde existem sequências de ADN anormais. (alert-online.com)

partir

  • Com Richard Eck, ela publicou a primeira reconstrução computacional de filogenia (árvore evolutiva) a partir de sequências moleculares, utilizando um método de máxima parcimônia. (wikipedia.org)
  • Ele foi obtido a partir de pesquisas sobre a estrutura da proteína no caso hemoglobinas de espécies diferentes, traçando o número de mudanças do aminoácido entre as sequências de proteína contra a idade estimada de espécies a partir de evidências fósseis. (wikipedia.org)
  • Abaixo, segue uma lista com os principais tipos de marcadores moleculares genômicos: RFLP (Restriction fragment lenght polymorphism): são fragmentos de DNA obtidos a partir de uma técnica que consiste na hibridização de sequências específicas de DNA, denominadas sondas, com o DNA total digerido por enzimas de restrição dos indivíduos a serem analisados. (wikipedia.org)
  • O biólogo evolucionista Dr. Matthew Phillips da Queensland University of Technology usou dados moleculares a partir de sequências de DNA para desafiar a teoria científica dominante que os mamíferos placentários diversificaram-se 20 milhões de anos antes de os dinossauros se extinguirem. (wordpress.com)
  • O software automaticamente lida com dados em uma variedade de formatos e até mesmo permite a recuperação transparente de dados de seqüências a partir da web. (wikipedia.org)
  • Uma árvore não enraizada sempre pode ser produzida a partir de uma árvore enraizada, mas uma raiz normalmente não podem ser colocada em uma árvore não enraizadas sem dados adicionais sobre as taxas de divergência, como pressuposto na hipótese do relógio molecular. (wikipedia.org)
  • Em março de 2014 saiu a edição "2014_03" de UniProtKB/Swiss-Prot, que continha 542.782 entradas de sequências (que constavam de 193.019.802 aminoácidos obtidos a partir de 226.896 referências) e a edição "2014_03" de UniProtKB/TrEMBL continha 54.247.468 de entradas de sequências (que constavam de 17.207.833.179 aminoácidos). (wikipedia.org)

organismos

  • Ver artigo principal: Filogenia molecular As conexões evolutivas entre organismos são representados graficamente através de árvores filogenéticas. (wikipedia.org)
  • Isso é feito tanto em nível microscópico quanto em molecular, para organismos unicelular como bactérias e célular especializadas em organismos multicelular como os humanos. (wikipedia.org)
  • Com os avanços, nas ultimas décadas, de técnicas moleculares, ocorreu um aumento na utilização de organismos geneticamente modificados (Transgênicos). (wikipedia.org)
  • Todas as pesquisas envolvendo filogenia, epidemiologia, ecologia e taxonomia molecular, incluindo o uso de sequências genéticas publicadas em bancos de dados públicos (como por exemplo, o GenBank), provenientes de material vegetal, animal, fungos e micro-organismos em geral isolados do território nacional, mar territorial, plataforma continental e zona econômica exclusiva precisam estar cadastradas. (unifesp.br)
  • Um campo importante da genética molecular é o uso de informação molecular para determinar padrões de descendência, e assim a classificação científica correta dos organismos: a isto chamamos sistemática molecular. (wikipedia.org)
  • A filogenética tradicional baseia-se nos dados morfológicos obtidos pela medição e quantificação das propriedades fenotípicas de organismos representativos, enquanto o campo mais recente da filogenia molecular usa seqüências de nucleotídeos codificando genes ou seqüências de aminoácidos codificando proteínas como base para a classificação. (wikipedia.org)
  • Para Johan Viklund, do Departamento de Evolução Molecular da universidade, a origem das mitocôndrias pode estar nos oceanos, mas os "parentes" mais próximos dessas estruturas não seriam bactérias do grupo SAR11, um tipo comum de organismos unicelulares nos mares. (nossofuturoroubado.com.br)

exemplo

  • Em sua tese de pós-graduação, Dayhoff foi pioneira na utilização de recursos computacionais - por exemplo, processamento de dados de massa - para química teórica. (wikipedia.org)
  • Um exemplo é a utilização do Sleeping Beauty Transposon system (SB), ele é um transposão artificial, construído com o objetivo de introduzir sequências de DNA bem conhecidas em cromossomos de vertebrados, afim de descobrir novos genes e funções. (wikipedia.org)
  • Identificam-se as diferenças entre sequências, e a sua causa é documentada (por exemplo splicing alternativo, variação natural, sítios de iniciação da tradução incorrectos, limites de exãos incorrectos, mutações de mudança de pauta de leitura, e conflitos não identificados). (wikipedia.org)

genes

  • Todas essas informações sobre genes e proteínas podem ser utilizadas pela filogenética molecular para estabelecer uma árvore Filogenética concernente à evolução do grupo em estudo. (wikipedia.org)
  • Como disciplina, o campo da Evolução Molecular se encarrega da evolução de genes e proteínas, dando ênfase à taxa de mutação e aos mecanismos que regem a evolução molecular. (wikipedia.org)
  • Os dados da sequência permitiram aos pesquisadores identificar os genes responsáveis ​​pela biossíntese das toxinas, bem como entender melhor os controles genéticos relacionados com a formação de micorrizas. (wikipedia.org)
  • Muitas formas de filogenia molecular estão intimamente relacionadas e fazem uso extensivo do alinhamento de seqüências na construção e refino de árvores filogenéticas, que são utilizadas para classificar as relações evolutivas entre genes homólogos representados nos genomas de espécies divergentes. (wikipedia.org)
  • Em estudos moleculares, um problema principal consiste na produção de um Alinhamento múltiplo de sequências entre os genes ou seqüências de aminoácidos de interesse. (wikipedia.org)
  • Outro artigo de 2005, "Bushes in the Tree of Life", publicado na PLoS Biology, reconheceu que "uma grande fração de um único gene produzia filogenias de pobre qualidade," observando que uma pesquisa tinha "omitido 35% de um gene de sua matriz de dados, porque aqueles genes produziram filogenias em desacordo com o conhecimento convencional. (blogspot.com)
  • Análises de DNA mitocondrial, genes do citocromo b mitocondrial e sequências de intron nuclear demonstraram uma grande variação entre a população da Bolívia e a do Amazonas-Orinoco, demonstrando uma distinção à nível de espécie. (wikipedia.org)
  • O jogo, 'Play for Cure: Genes in Space', vai "permitir que pessoas do mundo inteiro ajudem os cientistas a decifrar dados genéticos de modo a 'encontrarem respostas a algumas das perguntas mais difíceis sobre o cancro', referiu a entidade. (alert-online.com)

campo

  • Simulação molecular, um campo que lida com métodos teóricos e técnicas computacionais para modelar ou imitar o comportamento de moléculas. (wikipedia.org)

bases

  • tudo o que é necessário é a sequência de bases do DNA e os materiais listados acima. (wikipedia.org)
  • As principais bases de dados que estão incluídas em UniProt são: Swiss-Prot, TrEMBL (estas duas fazem parte de UniProtKB), UniParc, UniRef, e UniMes. (wikipedia.org)
  • O EBI está localizado no Wellcome Trust Genome Campus em Hinxton, Reino Unido, e alberga um grande recurso de bases de dados informáticas e serviços. (wikipedia.org)
  • O SIB, está com sede em Genebra, Suíça, e mantém os servidores de ExPASy (Expert Protein Analysis System, Sistema de Análise de Proteíns @Experto) que é um recurso central de ferramentas proteómicas e bases de dados. (wikipedia.org)
  • Estas bases de dados coexistiam tendo prioridades diferentes no que diz respeito à cobertura na sequência de proteínas e na anotação. (wikipedia.org)
  • Swiss-Prot tem como objectivo proporcionar sequências fiáveis de proteínas associadas com um alto nível de anotação (como são a descrição da função da proteína, a sua estrutura de domínios, as modificações postraducionais, variantes etc.), um nível mínimo de redundância, e um alto nível de integração com outras bases de dados. (wikipedia.org)
  • O coração de UniProt está formado por quatro bases de dados: UniProtKB (que se subdivide em Swiss-Prot e TrEMBL), UniParc, UniRef, e UniMes. (wikipedia.org)

nucleicos

  • De uma maneira menos formal, a bioinformática também tenta entender os princípios organizacionais de sequências de ácidos nucleicos e proteínas. (wikipedia.org)
  • A sequência dos ácidos nucleicos codifica as informações necessárias à sobrevivência e à reprodução dos seres vivos. (wikipedia.org)

poucos dados

  • O problema da filogenia é que os dados genéticos estão disponíveis apenas para taxons vivos e nos registros fósseis (dados osteometricos) contendo poucos dados e características morfológicas ambíguas. (wikipedia.org)

teoria

  • Com essa teoria ficou possível prever várias fontes de variação na taxa de evolução molecular. (wikipedia.org)
  • A teoria neutra pressupõe que a evolução a nível molecular seja dominada por processos aleatórios, a chamada deriva gênica que irá atuar em pequenas populações, Já a seleção natural agiria em grandes populações, sendo assim a neutralidade das mutações dependeria do tamanho da população. (wikipedia.org)
  • Para inferir a teoria neutra podemos citar 3 linhas menos diretas de evidências que foram originalmente usadas por Kimura para argumentar a importância da deriva neutra na evolução molecular. (wikipedia.org)
  • A constância da evolução molecular, a qual foi deduzida ser inconsistente com a seleção natural, A observação de que partes funcionalmente menos obrigatórias das moléculas evoluem em uma taxa maior, o que se deduziu ser o oposto do que a teoria da seleção natural iria prever. (wikipedia.org)
  • Ela simplesmente tem uma utilização diferente para ela da teoria selecionista da evolução molecular. (wikipedia.org)

filogenia molecular

  • Trabalhos de filogenia molecular indicam que Convolvulaceae é grupo-irmão de Solanaceae, ambas famílias inclusas na ordem Solanales. (wikipedia.org)

estudos moleculares

  • No início da década de 2000, a hipótese de duas espécies válidas foi analisada com estudos moleculares e genéticos. (wikipedia.org)

muitas

  • Filogeneticistas moleculares, que usam sequência de DNA como dados, tem levado a muitas revisões recentes e provavelmente continuarão a fazê-lo. (wikipedia.org)

permite

  • A Evolução Molecular permite revelar a natureza das mudanças no material genético e nos produtos codificados por ele, além de determinar por métodos estatísticos o curso histórico-evolutivo dessas mudanças em uma determinada linhagem, ou entre linhagens diferentes. (wikipedia.org)
  • O percurso traçado pela nave para apanhar o 'Elemento Alfa' permite a leitura de dados moleculares, bem como a deteção de mutações associadas ao cancro da mama. (alert-online.com)

utilizando

  • A obtenção dos marcadores envolve a amplificação de sequências que flanqueiam essas regiões repetidas via PCR, utilizando-se de iniciadores específicos para as regiões que cercam os microssatélites. (wikipedia.org)
  • RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA): são fragmentos de DNA amplificados ao acaso pela PCR utilizando iniciadores curtos de sequência aleatória (Williams, 1990). (wikipedia.org)
  • Esta técnica tem como princípio a terminação sequência-específica da reação de síntese de DNA utilizando nucleotídeos modificados, análogos aos dNTPs normais. (wikipedia.org)

diferentes

  • Um marcador genético ideal deve apresentar uma série de atributos: Alto nível de polimorfismo Estabilidade em diferentes ambientes Detectar grande número de loci não ligados Herança simplesGuerra, Nodari e Stefenon Os marcadores moleculares correspondem, basicamente, a uma sequência de nucleotídeos que atua como referência em um cromossomo. (wikipedia.org)
  • Através da tecnologia dos marcadores moleculares a caracterização genética de diferentes genomas se tornou mais fácil e rápida, e com isso foram surgindo diversas metodologias capazes de utilizar e caracterizar alterações nesses marcadores. (wikipedia.org)
  • As calibrações fósseis reexaminadas, excluindo os que foram contenciosas ou com base em canais fósseis mal resolvidos e também calibrações fósseis de dentro de grupos de mamíferos muito grandes ou de longa duração, como as baleias, para o qual as mudanças paralelas na taxa de evolução de DNA em diferentes linhagens poderiam distorcer as estimativas dos dados. (wordpress.com)
  • Os fragmentos obtidos, possuindo diferentes tamanhos, são separados por peso molecular em processos de eletroforese em gel de agarose (ver imagem ao lado), ou mais comumente através de capilares preenchidos por um polímero viscoso, no qual os fragmentos correm, ordenadamente, dos mais leves aos mais pesados. (wikipedia.org)

todas

  • Ela também começou a reunir sequências de proteínas no Atlas de Estruturas e Sequências de Proteínas (Atlas of Protein Sequence and Structure), um livro reunindo todas as sequências de proteínas conhecidas até a época, publicado em1965. (wikipedia.org)

computacional

  • Árvore filogenéticas geradas pela filogenia computacional podem ser enraizadas ou não enraizadas dependendo dos dados de entrada e do algoritmo utilizado. (wikipedia.org)

ordem

  • Ver artigo principal: Sequenciamento de DNA Sequenciamento de DNA é o processo de determinação da ordem dos nucleotídeos de um dado fragmento de DNA. (wikipedia.org)
  • Outro artigo publicado na Trends in Ecology and Evolution concluiu que "a riqueza de sugestões morfológicas bem como moleculares de filogenias prevalentes da ordem dos mamíferos reduziria a [a árvore dos mamíferos] a um arbusto não resolvido, o único clade consistente provavelmente sendo o agrupamento de elefantes e peixes-boi. (blogspot.com)
  • O grupo é monofilético, segundo análises de filogenia, pelo que se lhe deu o estatuto de táxon nos sistemas de classificação modernos como o Angiosperm Phylogeny Website e o sistema APG III de 2009, Segundo o Angiosperm Phylogeny Website, a divisão da ordem em três famílias está avalizada por análises moleculares de ADN e são facilmente distinguíveis pela sua morfologia distintiva. (wikipedia.org)
  • Didymeles foi incluído em Buxaceae no sistema APG III e incluída de maneira opcional em Buxaceae no sistema APG II, mas no sistema de classificação Angiosperm Phylogeny Website encontram-se segregadas dentro da ordem Buxales (pelo que Didymeles ascende a estatuto de família, Didymelaceae) devido a dados derivados de análises moleculares de ADN]], e são clados facilmente distinguíveis devido à sua morfologia distintiva. (wikipedia.org)

taxa

  • Ele tornou possível prever várias fontes de variação na taxa de evolução molecular. (wikipedia.org)
  • Outras proteínas também mostraram uma taxa constante de evolução molecular entre espécies, mas cada proteína com uma taxa diferente: histonas foram excepcionalmente lentas, citocromo c foi mais rápido (mas mais lento do que hemoglobinas) e fibrinopeptídeos foram mais rápidos ainda. (wikipedia.org)
  • Motoo Kimura e Ohta Tomoko afirmaram que a taxa constante para cada característica da proteína, sugeriu que a maior parte dos aminoácidos que sofriam alterações em uma proteína foram efetivamente neutras - ou seja,a mudança da sequência do aminoácido não teve influência sobre a aptidão de um organismo e, portanto, a taxa de mudança não foi afetado pela seleção natural. (wikipedia.org)
  • Esse estudo prevê que a longo prazo a taxa de evolução molecular neutra em espécies é o mesmo que a taxa de mutação neutra nos indivíduos.Se grande parte das mudanças dos aminoácidos são neutras ou deletérias, em seguida, a taxa prevista constante de mudança de proteína produz um relógio molecular. (wikipedia.org)
  • Dr. Phillips disse que pelos dados moleculares do trabalho os cientistas tiveram que calibrar a taxa de evolução de DNA de fósseis de idade conhecida. (wordpress.com)

utilizados

  • Todos os métodos dependem de um modelo matemático explícito ou implícito que descreve a evolução das características observadas nas espécies e são normalmente utilizados pela Filogenética molecular, no qual os caracteres são alinhadas em sequências de nucleótidos ou aminoácidos. (wikipedia.org)
  • Hoje em dia, dados moleculares, que inclui sequências de proteínas e de DNA, são utilizados para a construção de árvores filogenéticas. (wikipedia.org)
  • O código de 1 letra utilizado para aminoácidos foi criado por ela, reduzindo o tamanho dos arquivos utilizados para escrever sequências de aminoácidos na era da computação por cartões perfurados. (wikipedia.org)
  • Microssatélites (SSRP - Simple Sequence Repeats Polymorphisms): um grupo de marcadores molecular muito utilizados, os quais são caracterizados por unidades muito curtas de sequências repetitivas de nucleotídeos. (wikipedia.org)

conjunto

  • Na base deste estudo está um conjunto enorme de dados genéticos que foram recolhidos pelos investigadores Carlos Caldas, da Universidade de Cambridge, no Reino Unido, e Samuel Aparício, da Agência do Cancro da Columbia Britânica, no Canadá. (alert-online.com)

Existem

  • Existem quatro técnicas gerais utilizadas para genética molecular: amplificação, separação e detecção, e expressão. (wikipedia.org)

incluindo

  • O pacote EMBOSS contém uma variedade de aplicações para alinhamento de sequências, busca rápida em banco de dados com padrões de seqüência, identificação de estruturas secundárias de proteínas (protein motif) (incluindo a análise de domínio), e muito mais. (wikipedia.org)

foram

  • Muito mais tarde, os géneros Sambucus (sabugueiros) e Viburnum (laurotinos ou folhados) foram adicionados à família após cuidadosa análise morfológica confirmada por dados bioquímicos, o que levou o Angiosperm Phylogeny Group a incluir no sistema APG II a família com a sua presente circunscrição taxonómica. (wikipedia.org)
  • Didymelaceae foi determinada com irmã de Buxaceae (foram incluídas representantes das duas tribos de buxáceas, Sarcococceae e Buxeae) na análise executada sobre 3 sequências de ADN por Worberg et al. (wikipedia.org)

processos

  • Evolução molecular refere-se a vários processos evolutivos resultantes de alterações no DNA, RNA, e/ou Proteína. (wikipedia.org)

ferramentas

  • Uma das primeiras ferramentas a ser utilizada pelos geneticistas moleculares na década de 1970 foi o rastreio genético (mapeamento genético no Brasil). (wikipedia.org)

geralmente

  • A identificação de uma raiz geralmente requer a inclusão nos dados de entrada de pelo menos um "grupo-externo" sabendo-se apenas remotamente relacionado com as seqüências de interesse. (wikipedia.org)

recentes

  • Embora tenha sido sugerido anteriormente que a Gammaproteobacteria é parafilética com relação a Betaproteobacteria, dados moleculares recentes sugerem que os grupos são monofiléticos. (wikipedia.org)

mitocondrial

  • 1999) usaram dados moleculares (distâncias imunológicas e sequências de ADN mitocondrial) para estimar as relações filogenéticas entre as espécies de Bitis. (wikipedia.org)

pode

  • O artigo sugere que "certas partes críticas da árvore da vida pode ser difícil de resolver, apesar da quantidade de dados convencionais disponíveis. (blogspot.com)

artigo

  • Em um artigo publicado na revista Biology Systematic e entregue na Sociedade para a Society for Molecular Biology and Evolution Conference , pelo Dr. Phillips apresentou dados dos modelos de evolução de DNA inflando estimativas dos mamíferos modernos, uma vez que estes não eram maiores do que uma cobaia, e diversificaram-se e evoluíram para os animais que estamos familiarizados hoje. (wordpress.com)
  • Um artigo publicado em 2012 no Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society destaca que "o conflito filogenético tem um problema mais agudo com o advento das séries de dados de escala genômica. (blogspot.com)
  • Um importante artigo de revisão publicado na não menos importante revista científica Nature reportou que "as disparidades entre as árvores moleculares e morfológicas" resultam em "guerras evolucionárias" porque as árvores evolucionárias construídas estudando-se as moléculas biológicas frequentemente não se parecem com aquelas tiradas da morfologia. (blogspot.com)
  • O artigo afirma que "a descoberta recorrente de clades persistentemente não resolvidos (arbustos) deveria forçar a reavaliação de diversas pressuposições de sistemática molecular amplamente defendidas. (blogspot.com)
  • Em um artigo publicado no Annual Review of Ecology and Systematics, o grande sistematista Colin Patterson afirmou: "Como morfologistas com grandes esperanças da sistemática molecular, nós terminamos esta pesquisa com as nossas esperanças esmorecidas. (blogspot.com)

pesquisa

  • A determinação destas sequências é útil à pesquisa básica, para compreender como funciona a vida, assim como oferece soluções em âmbito aplicado. (wikipedia.org)

interesse

  • Isto produz fragmentos truncados da sequência completa de interesse. (wikipedia.org)

evolutiva

  • No entanto, mesmo não fornecendo dados exatos, ou seja, ele fornece estimativas de tempo de eventos na história evolutiva, a ampla gama de hipóteses biológicas que vão desde as origens do reino animal para o surgimento de novas epidemias virais. (wikipedia.org)

sequenciamento

  • O sequenciamento resulta numa representação linear simbólica conhecida como sequência, a qual sucintamente resume a estrutura da molécula sequenciada. (wikipedia.org)

mecanismos

  • Ele ajudou a estudar os mecanismos que impulsionam a evolução molecular. (wikipedia.org)

grupo

  • O grupo usa dados de pesquisas internacionais sobre o DNA de bactérias em todos os oceanos do mundo. (nossofuturoroubado.com.br)

respeito

  • Este problema diz respeito tanto aos dados moleculare e morphologicos: "A incongruência entre as filogenias derivadas de análises morfológicas versus moleculares, e entre as árvores baseadas em subconjuntos de sequências moleculares tem se tornado difusivo à medida em que os conjuntos de dados têm se expandido rapidamente tanto em características e espécies. (blogspot.com)

segundo

  • Em análises moleculares dentre os gêneros e tribos da família Convolvulaceae, segundo Stefanovic et. (wikipedia.org)
  • Está dividido em cinco seções baseadas na análise de sequências de 16S rRNA, denominadas segundo as cinco primeiras letras do alfabeto grego. (wikipedia.org)
  • Segundo esta nota, o termo Candidatus deve ser utilizado para descrever entidades procariotas cuja uma mera sequência genética esteja disponível ou então para os quais as características necessárias para a descrição de acordo com o Código Bacteriológico (Revisão 1990) estejam faltando. (wikipedia.org)

podem ser

  • Podem ser caracterizados como marcadores moleculares quando ocorrem em mais de 1% da população, pois quando essas variações são relatadas com uma frequência menor que este valor, então é considerado apenas como mutações pontuais. (wikipedia.org)

tipos

  • Junto com a determinação do padrão de descendentes, a genética molecular ajuda a compreender as mutações genéticas que podem causar certos tipos de doenças. (wikipedia.org)

sendo

  • Sendo assim, a subespécie I. g. humboldtiana não é sustentada por dados moleculares. (wikipedia.org)
  • Como consequência, nomes formais estavam sendo propostos para procariontes não cultivados cuja singularidade era definida apenas por características muito limitadas, tais como as diferenças em um sequência molecular. (wikipedia.org)

baseada

  • Em 2005, Zhang e seus colegas realizaram uma análise filogenética baseada em sequências de espaçador interno transcrito de várias espécies tóxicas de Amanita com corpos de frutificação de cor branca, a maioria delas encontradas na Ásia. (wikipedia.org)

entrada

  • A anotação manual de uma entrada implica a análise detalhada da sequência de proteínas e da literatura científica. (wikipedia.org)

iniciadores

  • Nucleótidos de DNA são a base para o novo DNA, o DNA molde é a sequência específica a ser amplificada, iniciadores são nucleótidos complementares que podem ir em ambos os lados do DNA molde, e a polimerase Taq é uma enzima termicamente estável que salta-inicia a produção de DNA novo às temperaturas elevadas necessárias para a reacção. (wikipedia.org)

teve

  • Porém, com o passar do tempo teve que reconhecer-se que os dados de sequências estavam gerando-se a um ritmo que excedia a capacidade de Swiss-Prot para tratá-los, criou-se então TrEMBL (Translated EMBL Nucleotide Sequence Data Library, Biblioteca de Dados de Sequências de Nucleótidos da EMBL Traduzidas) para proporcionar anotações automatizadas dessas proteínas que não estavam em Swiss-Prot. (wikipedia.org)

nomes

  • Boto-cor-de-rosa, boto-vermelho, boto-rosa, boto-malhado, boto-branco, boto, costa-quadrada, cabeça-de-balde ou uiara são nomes comuns dados a 3 espécies de golfinhos fluviais (não confundir com golfinhos, que pertencem à família Delphinidae) do gênero Inia. (wikipedia.org)

fontes

  • Os polimorfismos de sequência nucleotídica são fontes abundantes de variação genética e, por serem estáveis do ponto de vista evolutivo, estes marcadores são muito interessantes para estudos filogenéticos de evolução dentro da espécie. (wikipedia.org)

devido

  • Em 2011, foi classificada pela IUCN na categoria de espécies com dados insuficientes, devido à incerteza em relação ao número total da população, a sua tendência e o impacto das ameaças. (wikipedia.org)
  • Antes da introdução dos métodos moleculares de análise filogenética, os taxonomistas consideravam que os fungos eram membros do reino Plantae devido a semelhanças nos seus modos de vida: tanto os fungos como as plantas são na sua maioria imóveis, e apresentam semelhanças na morfologia geral e no habitat em que se desenvolvem. (wikipedia.org)

termos

  • O filo "Proteobacteria" é definido principalmente em termos de sequências de RNA ribossômico (16S rRNA). (wikipedia.org)

ocorrem

  • Estudos de sequências de mtDNA control region e de DNA microssatélite demonstraram que duas linhagens de botos ocorrem na bacia do Orinoco. (wikipedia.org)