Facteurs de transcription2
- Depuis son invention en 2007, la ChIP-séq est devenue la méthode la plus populaire d'étude des protéines associées à la chromatine, comme les histones et les facteurs de transcription. (epfl.ch)
- On obtient ce genre de pic en étudiant les facteurs de transcription et certaines marques de chromatine. (bioinfo-fr.net)
L'analyse1
- Des noyaux isolés peuvent être utilisés pour des applications en aval tels que l'analyse de l'expression génique et immunoprécipitation de la chromatine. (jove.com)
L'ADN6
- L'immunoprécipitation de la chromatine est une méthode qui permet de déterminer les sites de liaison de l'ADN sur le génome pour une protéine particulière et donne accès à une représentation des interactions protéine-ADN qui ont lieu dans le noyau de la cellule vivante ou dans les tissus. (wikipedia.org)
- En employant un anticorps spécifique d'une protéine présumée liée à l'ADN, on peut faire une immunoprécipitation du complexe protéine-ADN du lysat cellulaire. (wikipedia.org)
- L'immunoprécipitation de la chromatine fut établie en 1984 par John T. Lis et David Gilmour, en utilisant des rayons UV de manière à créer des cross-links ou liens covalents entre des protéines en contact avec l'ADN et avec celui-ci dans des cellules bactériennes vivantes. (wikipedia.org)
- Cette technique associe l'immunoprécipitation de la chromatine avec le séquençage de l'ADN pour identifier les sites où les protéines sont associées à l'ADN. (wikipedia.org)
- Pour que ce soit possible, les protéines doivent pénétrer dans le noyau de la cellule où l'ADN est enroulé étroitement et compacté sous forme de chromatine, à l'origine des chromosomes bien connus. (epfl.ch)
- Lorsque la protéine atteint son emplacement cible, la chromatine se déroule et dévoile la section de l'ADN avec laquelle la protéine va interagir. (epfl.ch)
Anticorps2
- L'idée principale de la ChIP consiste à utiliser un anticorps qui cible la protéine de liaison de la chromatine puis qui «l'attire vers le bas» ou la précipite avec la section d'ADN capturée. (epfl.ch)
- Avant même d'avoir vos données, sachez que pour une expérience de ChIP-seq il est indispensable d'avoir un échantillon contrôle, cela peut être un séquençage sans immunoprécipitation ou avec un anticorps non spécifique, qui ne ciblera rien sur votre génome. (bioinfo-fr.net)
Interactions2
- Pour étudier les interactions entre protéines et chromatine, les biologistes ont recours à une technique appelée «immunoprécipitation de la chromatine» (ChIP). (epfl.ch)
- Grâce à sa rentabilité, son rendement et sa facilité d'application générale, nous pensons que FloChIP va devenir d'elle-même un complément valide aux outils actuels d'étude de la biologie de la chromatine et des interactions entre protéines et ADN», déclare Riccardo Dainese, auteur principal de l'étude. (epfl.ch)
Technique2
- Les chercheurs de l'EPFL ont mis au point FloChIP, une nouvelle puce microfluidique basée sur la technique de l'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). (epfl.ch)
- Nous espérons que cette technique boostera l'utilisation des protéines liées à la chromatine en tant qu'indicateurs diagnostiques à fort potentiel informatif, pour toutes sortes de maladies, y compris le cancer. (epfl.ch)