• Um sítio de ligação com o ribossomo, ou sítio de ligação ribossômica (abreviado na literatura em inglês como RBS, de ribossomal binding site), é uma sequência de nucleótidos a montante do códon de iniciação de um transcrito de ARNm que é responsável pelo recrutamento de um ribossoma durante o início da tradução da proteína. (wikipedia.org)
  • A taxa de tradução depende de dois fatores: a taxa na qual um ribossomo é recrutado para a RBS a taxa na qual um ribossomo recrutado é capaz de iniciar a tradução (i.e. a eficiência de iniciação da tradução) A sequência RBS afeta ambos os fatores. (wikipedia.org)
  • O espaçamento ótimo aumenta a taxa de iniciação da tradução uma vez que o ribossomo foi ligado tenha sido ligado. (wikipedia.org)
  • O início da tradução acontece após o recrutamento do ribossomo, no códon de iniciação (sublinhado) encontrado dentro do sequência de consenso de Kozak ACCAUGG. (wikipedia.org)
  • Um passo muito importante nesse sentido foi dado pelo Grupo do Prof. Howard Salis , pesquisador que eu tenho o prazer de trabalhar dentro do Synberc , com o desenvolvimento da calculadora de RBS (ribossomal binding site ou sítio de ligação com o ribossomo). (unicamp.br)
  • Como foi descrito no video, a tradução em bactérias (procariotos) consiste em quatro fases: iniciação, elongamento, terminação e o turnover do ribossomo (na verdade, esta última fase não foi mostrada no video). (unicamp.br)
  • No ribossomo existem dois sítios A (onde há entrada do aminoácido) e sítio P (onde fica o polipeptídeo em formação). (webnode.com.br)
  • O RNAt da metionina fica associado ao sítio P do ribossomo, e o sítio A nesse momento permanece vazio. (webnode.com.br)
  • Este processo não depende do conjunto completo de fatores de iniciação da tradução (embora isso dependa do IRES específico) e é comumente encontrado na tradução de ARNm viral. (wikipedia.org)
  • Processo que inicia a transcrição de uma molécula de RNA. (bvsalud.org)
  • Na maioria dos casos, o início da transcrição é o gargalo do processo inteiro. (unicamp.br)
  • Os ribossomos eucarióticos são conhecidos por se ligarem a transcritos em um mecanismo diferente do que envolve o cap 5', em uma sequência chamada sítio interno de entrada do ribossoma. (wikipedia.org)
  • A iniciação, portanto, compreende o conjunto de reações que precedem a formação da primeira ligação peptídica da proteína. (webnode.com.br)
  • Assim, a tradução e a transcrição são processos paralelos. (wikipedia.org)
  • O taxa de iniciação de transcrição se dá pela combinação de diferentes efeitos moleculares: incluindo a hibridação do rRNA 16S com a sequencia do RBS, a ligação do tRNA formilmetionina ao start codon, a distância entre o síto de ligação do rRNA 16S e o start códon, e a presença de estruturas secundárias de RNA que podem obstruir o RBS ou o start codon. (unicamp.br)
  • Além disso, algumas regiões de iniciação bacteriana, tais como rpsA em E.coli tem lacunas de sequências SD completamente identificáveis. (wikipedia.org)
  • O presente projeto de pesquisa é continuidade dos projetos anteriores realizado por nosso grupo de pesquisa, nos quais produzimos metacaspases de leveduras em sistema de expressão em E. coli em suas formas selvagens e contendo mutações sítio dirigidas. (fapesp.br)
  • Além disso, algumas regiões de iniciação bacteriana, tais como rpsA em E.coli tem lacunas de sequências SD completamente identificáveis. (wikipedia.org)
  • Assim, propomos identificar e caracterizar fatores de transcrição da família MarR que controlam virulência nesse patógeno oportunista de humanos, buscando elucidar os sinais de ativação e os genes sob regulação de cada fator de transcrição. (fapesp.br)
  • Variações da sequência 5'-AGGAGG-3' tem sido encontrado em Archaea como regiões 5′-GGTG-3′ altamente conservadas, 5 pares de bases a montante do sítio de início. (wikipedia.org)
  • Para isto, iremos identificar os fatores de transcrição da família MarR no genoma de C. violaceum, classificá-los quanto a presença de cisteínas conservadas e realizar mutagênese sistemática para deleção da maioria dos genes que codificam estes reguladores. (fapesp.br)
  • Os regulons de alguns destes fatores de transcrição, principalmente os envolvidos em virulência, serão definidos por meio de microarranjos de DNA e análises bioquímicas, como ensaios de ligação ao DNA e mutagênse sítio-dirigida de cisteínas conservadas. (fapesp.br)