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  • pode
  • Como proteína integral que é, só se pode isolar da bicamada lipídica mediante a aplicação de detergentes, como o SDS. (wikipedia.org)
  • O processo normalmente aplica-se às estruturas terciárias das proteínas, mas também pode ser usado para longas moléculas de RNA. (wikipedia.org)
  • Como estes alinhamentos dependem da informação sobre todas as conformações tridimensionais das sequências do problema, o método só pode ser usado para seqüências onde essas estruturas sejam conhecidas. (wikipedia.org)
  • O alinhamento estrutural pode complicar-se pela existência de múltiplos domínios protéicos no interior duma ou mais estruturas de entrada (input), uma vez que alterações na orientação relativa dos domínios entre duas estruturas a alinhar podem exagerar para RMSD artificialmente. (wikipedia.org)
  • Um alinhamento estrutural também implica um alinhamento de sequências unidimensional a partir do qual pode calcular-se uma sequência, identidade, ou a porcentagem de resíduos que são idênticos entre as estruturas de entrada, como uma medida da proximidade à qual se encontra ambas as sequências. (wikipedia.org)
  • Uma vez que as estruturas das proteínas são compostas por aminoácidos cujas cadeias laterais estão ligadas por um esqueleto proteico comum de ligações peptídicas, pode ser usado uma macromolécula de proteína para produzir um alinhamento estrutural e calcular os valores RMSD correspondentes. (wikipedia.org)
  • O RNA, como a proteína mas não como DNA, pode catalisar importantes reações biológicas. (wikipedia.org)
  • Nele se pode visualizar todas as combinações possíveis de ângulos diédricos Ψ (psi) versus os Φ (phi) nos aminoácidos de um polipeptídeo, e que contribuem para a conformação das estruturas das proteínas. (wikipedia.org)
  • Ao contrário das estruturas primárias, secundárias ou quaternárias, a estrutura terciária pode envolver ligações covalentes na forma de pontes de dissulfito entre dois resíduos de cisteína. (wikipedia.org)
  • Como se pode ver na figura ao lado, a estrutura secundária é constituída por segmentos em alfa-hélice e folhas beta, tendo 3 segmentos do primeiro e 5 do segundo. (wikipedia.org)
  • estrutural
  • 7 Introdução O Caderno de Estudos e Pesquisa Estudos Estruturais e Funcionais de Proteínas foi elaborado com o objetivo de proporcionar a você alguns conhecimentos básicos aplicados na área da Biologia Estrutural de Biomoléculas. (docplayer.com.br)
  • Ao contrário da sobreposição estrutural simples, onde se conhecem alguns resíduos equivalentes das duas estruturas, o alinhamento estrutural não requer um conhecimento prévio de posições equivalentes. (wikipedia.org)
  • É possível realizar um alinhamento estrutural de estruturas produzidas por métodos de predição de estrutura. (wikipedia.org)
  • Para a avaliação destas previsões, muitas vezes é necessário fazer um alinhamento estrutural entre o modelo e a estrutura real conhecida para avaliar a qualidade do modelo. (wikipedia.org)
  • Os alinhamentos estruturais são especialmente úteis para analisar dados surgidos dos campos da genómica estrutural e da proteómica, e podem ser utilizados como pontos de comparação para avaliar alinhamentos gerados por métodos bioinformáticos baseados exclusivamente em sequências. (wikipedia.org)
  • O resultado dum alinhamento estrutural é uma superposição dos conjuntos de coordenadas atómicas, e uma distância média quádrica mínima (ou RMSD, acrónimo de Root Mean Square Deviation, ou desvio da média quadrática) entre as estruturas básicas das proteínas sobrepostas. (wikipedia.org)
  • A informação mínima produzida por um alinhamento estrutural correto é um conjunto de coordenadas tridimensionais sobrepostas a cada estrutura inicial. (wikipedia.org)
  • envolve
  • Uma proteína transmembranar é um tipo de proteína membranar que envolve a totalidade da membrana biológica à qual é permanentemente ligada - ou seja, recobre essa membrana de um lado a outro, podendo cobrir a bicamada lipídica uma vez (unipasso) ou várias vezes (multipasso). (wikipedia.org)
  • Ao nível mais simples, o dobramento envolve inicialmente o estabelecimento duma estrutura secundária, particularmente hélices alfa e folhas-beta, e depois uma estrutura teciária (formação de estruturas quaternárias aparenta envolver a montagem de sub-unidades que já se tenham dobrado). (wikipedia.org)
  • As proteínas ingeridas são transformadas em aminoácidos através da digestão, a qual envolve a desnaturação da proteína através da exposição ao ácido e à hidrólise por parte de enzimas denominadas proteases. (wikipedia.org)
  • Os viroides não codificam proteínas e, diferentemente dos vírus, não possuem capa proteica (envoltório de proteína que envolve e protege o ácido nucleico viral), sendo totalmente dependentes da maquinaria transcricional da célula do hospedeiro para cumprir as diferentes etapas do seu ciclo infeccioso que inclui: replicação, movimento (intra- e inter-celular) e patogênese. (wikipedia.org)
  • outras
  • 9 Capítulo 1 Organização hierárquica da estrutura de proteínas Capítulo 2 Funções das proteínas Capítulo 3 Binômio estrutura-função de uma cadeia polipeptídica Unidade II estudos estruturais Capítulo 4 A Luz como Fonte de Informação Capítulo 5 Absorção no UV-Visível Capítulo 6 Difração de raios-x e cristalografia de proteínas Capítulo 7 Outras técnicas espectroscópicas Capitulo 8 O uso de Microscopia PARA (NÃO) FINALIZAR REFERÊNCIAS. (docplayer.com.br)
  • Geralmente a proteína que se deseja estudar é um componente minoritário (0,01 a 1%) em uma complexa mistura de outras proteínas que estão presentes em qualquer tipo de tecido ou célula. (slideplayer.com.br)
  • Purificar uma proteína significa separar a proteína de interesse das outras presentes na fonte de origem, de modo a ter somente ela no meio. (slideplayer.com.br)
  • As estruturas encaixadas podem ser usadas para calcular valores de RMSD mútuos e outras medidas estruturais estruturalmente similares mais sofisticadas como o teste de distância global (GDT, nas suas siglas em inglês, e que é a métrica utilizada em CASP, Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction). (wikipedia.org)
  • A sinalização por ubiquitina e suas cadeias tem um papel não proteolítico no transporte pela membrana, na estrutura e transcrição da cromatina, na reparação de DNA e diversas outras vias sinalizadoras. (wikipedia.org)
  • membrana
  • O extremo N-terminal da proteína fica de um dos lados da membrana e o extremo C-terminal, do outro. (wikipedia.org)
  • Existem muitos exemplos: receptores associados a proteínas G triméricas, canais iónicos, porinas em bactérias, e de novo no eritrócito, a proteína banda 3, proteína transmembranar multipasso que atravessa membrana com 12 α-hélices e com os seus extremos em direcção ao citosol. (wikipedia.org)
  • É o caso dos poros da porina, uma proteína presente na membrana de algumas bactérias, assim como em mitocôndrias e cloroplastos, através dos quais passam substâncias com um peso molecular inferior a 800 Da, por difusão simples. (wikipedia.org)
  • cadeias
  • Só quando as estruturas que se vão alinhar são muito semelhantes, e até mesmo idênticas, é que é importante alinhar posições de átomos da cadeia lateral, e nesse caso a RMSD reflete não só a conformação do esqueleto da proteína, como também os estados das rotações angulares nas cadeias laterais. (wikipedia.org)
  • Nem todos os pares de ângulos são, na verdade, possíveis dentro das estruturas dos peptídeos, isto é devido a efeitos estéricos entre os resíduos (cadeias laterais) dos aminoácidos. (wikipedia.org)
  • mesma
  • Porém, o uso dos resultados como evidência dum antepassado evolutivo comum deve ser feito com cautela, dado os possíveis efeitos da confusão com a evolução convergente, segundo a qual múltiplas sequências de aminoácidos sem relação filogenética entre eles convergem originando uma mesma estrutura terciária. (wikipedia.org)
  • modelo
  • Com os resultados aqui apresentados foi possível elaborar um modelo de regulação da atividade da proteína NifA de H. seropedicae pelos níveis de nitrogênio fixado e melhorar o entendimento sobre o papel do motivo conservado de cisteínas na atividade da proteína. (ufpr.br)
  • A falta de dados estruturais de alta resolução da proteína alterada (PrP-res) levou a produção de um modelo in silico, proposto por DeMarco e Daggett8, denominado modelo espiral. (ufrgs.br)
  • A unidade básica, a proteína alterada, utilizada neste modelo foi produzida por Alonso et. (ufrgs.br)
  • Replicação do DNA a Nível Molecular Função do DNA Transferência de informação Copiada em DNA (Replicação) Traduzida em proteína Modelo de replicação do DNA proposto por Watson e Crick Replicação ou Duplicação? (docplayer.com.br)
  • nativa
  • O ponto essencial no dobramento é, no entanto, o facto da sequência de aminoácidos específica de cada proteína conter a informação que indica a estrutura nativa e caminho para atingir esse estado: o dobramento é um processo espontâneo. (wikipedia.org)
  • permite
  • Exames de imagem: Ultrassom ou tomografia computadorizada (CT) permite analisar a estrutura dos seus rins e do tracto urinário e detectar tumores. (wikipedia.org)
  • A degradação protéica é feita em uma série de etapas que resultam na ubiquitinação da proteína a ser destruída, esse processo permite que a célula elimine proteínas de modo bastante específico e é esta regulação que exige energia. (wikipedia.org)
  • pontes
  • Durante o processo de dobramento, o número de pontes de hidrogénio não muda apreciavelmente, porque por cada ponte de hidrogénio interna, uma ponte de hidrogénio entre a proteína desdobrada e o meio aquoso terá de ser quebrada. (wikipedia.org)
  • podem
  • Os alinhamentos estruturais podem comparar duas ou múltiplas sequências. (wikipedia.org)
  • Muitas dessas lesões causam danos estruturais à molécula de ADN e podem alterar ou eliminar a habilidade celular para transcrição gênica. (wikipedia.org)
  • Estas modificações podem, por sua vez, alterar a estrutura helicoidal das moléculas ao introduzir ligações químicas não nativas ou adutos volumosos que não se encaixam bem na estrutura da dupla-hélice padrão. (wikipedia.org)
  • montagem
  • A proteína NifA desse organismo é responsável por regular a síntese das proteínas de estrutura e montagem do complexo enzimático da nitrogenase. (ufpr.br)
  • conhecidas
  • DNA nuclear existe em larga escala em estruturas agregadas conhecidas como cromossomos, os quais são compostos de DNA e, envolvidas por proteínas chamadas histonas. (wikipedia.org)
  • encontrada
  • A caseína (do latim "caseus", queijo) é uma proteína do tipo fosfoproteína encontrada no leite fresco. (wikipedia.org)
  • A ubiquitina é uma proteína encontrada nas células eucariotas constituída por 76 aminoácidos que desempenha uma função importante na regulação de proteínas. (wikipedia.org)
  • processo
  • O processo contrário chama-se desnaturação, em que uma proteína original é forçada a perder a sua configuração funcional, tornando-se uma cadeia amorfa e não funcional de aminoácidos. (wikipedia.org)
  • Como consequência, o processo de reparo de ADN precisa estar operando constantemente para resolver rapidamente os danos na estrutura do ADN. (wikipedia.org)
  • Aaron Ciechanover, Avram Hershko e Irwin Rose, conseguiram mostrar que o processo de proteólise ocorre em etapas que resultam na ubiquitinação da proteína a ser degradada. (wikipedia.org)
  • permitem
  • À família pospiviroidae pertencem os viroides que se replicam no núcleo das células, apresentam uma região conservada na molécula de RNA denominada de CCR (região central conservada) e não possuem ribozimas (estruturas com sequências específicas da molécula de RNA que permitem seu auto-corte). (wikipedia.org)
  • cadeia lateral
  • Quando se alinham estruturas com sequências muito diferentes, os átomos da cadeia lateral, geralmente, não são tidos em conta, uma vez que suas identidades diferem em muitos dos resíduos alinhados. (wikipedia.org)
  • anos
  • Quarenta anos mais tarde, havia dezenas de milhares de estruturas de proteínas com alta resolução, determinadas por cristalografia de raios X, depositadas no Protein Data Bank (PDB). (wikipedia.org)
  • tipo
  • O tipo III da doença de von Willebrand é uma doença hemorrágica grave, não muito diferente da hemofilia tipo A ou B. A VWF atua no ensino da hemostasia para recrutar plaquetas para o local da lesão, e também é importante na hemostasia secundária, agindo como acompanhante para o fator VIII (FVIII) da coagulação. (wikipedia.org)
  • papel
  • Para esclarecer o papel do motivo conservado de cisteínas da proteína NifA, a tividade de ligação ao DNA in vitro de uma série de mutantes pontuais neste motivo foi testada. (ufpr.br)
  • Um é o [factor de von Willebrand]] (vWF) e uma proteína multimérica que desempenha papel importante na coagulação do sangue. (wikipedia.org)
  • diferentes
  • Nas aves, que apresentam origem evolucionária diferente, as células das penas sintetizam filamentos de queratina de estruturas moleculares diferentes denominadas β-queratina. (wikipedia.org)
  • fragmentos
  • Os resultados apontaram significativas diferenças estruturais entre os fragmentos simulados, neste trabalho, e os apresentados no artigo de Alonso et. (ufrgs.br)
  • O prolongamento da cadeia polipeptídica também induziu a formação de estruturas diferenciadas para os fragmentos protonados. (ufrgs.br)
  • Espectrometria de massa: determinação das massas de fragmentos correspondendo a aminoácidos, retirados sequencialmente da proteína. (slideplayer.com.br)
  • passo
  • Na determinação da composição em aminoácidos da proteína, a hidrólise das ligações peptídicas é um passo necessário. (wikipedia.org)
  • desnaturar
  • Temperaturas acima ou abaixo da gama na qual as células costumam sobreviver, levam a proteína a desdobrar-se ou desnaturar (é por esta razão que a ebulição leva a que a clara do ovo fique opaca). (wikipedia.org)
  • parte
  • Um destes activos processos é a síntese de proteínas, uma função universal fundamental na qual intervêm vários tipos de ARN: o ARNm leva a informação de como tem que ser a sequência da proteína, o ARNt leva os aminoácidos necessários, e o ARNr é parte constituinte do organelo onde se realiza a síntese, o ribossoma, e tem uma actividade catalítica que une os aminoácidos entre si. (wikipedia.org)
  • envolve
  • Ao nível mais simples, o dobramento envolve inicialmente o estabelecimento duma estrutura secundária, particularmente hélices alfa e folhas-beta, e depois uma estrutura teciária (formação de estruturas quaternárias aparenta envolver a montagem de sub-unidades que já se tenham dobrado). (wikipedia.org)
  • Uma proteína transmembranar é um tipo de proteína membranar que envolve a totalidade da membrana biológica à qual é permanentemente ligada - ou seja, recobre essa membrana de um lado a outro, podendo cobrir a bicamada lipídica uma vez (unipasso) ou várias vezes (multipasso). (wikipedia.org)
  • As proteínas ingeridas são transformadas em aminoácidos através da digestão, a qual envolve a desnaturação da proteína através da exposição ao ácido e à hidrólise por parte de enzimas denominadas proteases. (wikipedia.org)
  • Os viroides não codificam proteínas e, diferentemente dos vírus, não possuem capa proteica (envoltório de proteína que envolve e protege o ácido nucleico viral), sendo totalmente dependentes da maquinaria transcricional da célula do hospedeiro para cumprir as diferentes etapas do seu ciclo infeccioso que inclui: replicação, movimento (intra- e inter-celular) e patogênese. (wikipedia.org)
  • pode
  • Embora o cabelo seja uma fibra de proteína, como a lã, o processo de tingimento de tecidos não pode ser imitado na cabeça. (blogspot.com)
  • Ao contrário das estruturas primárias, secundárias ou quaternárias, a estrutura terciária pode envolver ligações covalentes na forma de pontes de dissulfito entre dois resíduos de cisteína. (wikipedia.org)
  • Como proteína integral que é, só se pode isolar da bicamada lipídica mediante a aplicação de detergentes, como o SDS. (wikipedia.org)
  • A estrutura pode ser uma hierarquia (uma cascata de relacionamentos um-para-vários) ou uma rede contendo relacionamentos vários-para-vários. (wikipedia.org)
  • O termo forma musical, um tipo de estrutura, se refere a dois conceitos relacionados : o tipo de composição (por exemplo, um trabalho musical pode ter a forma de uma sinfonia, concerto, ou outro tipo genérico) a estrutura de uma parte particular (por exemplo, uma peça pode ser escrita na forma binária, forma de sonata, como um fugue, etc. (wikipedia.org)
  • Transporte
  • Uma propriedade especial da proteína responsável pelo transporte é a mudança de conformação que permite o fluxo de sódio para o interior somente após a ligação de uma molécula de glicose, de modo que o sódio e a glicose são transportados para o interior da célula simultaneamente. (wikipedia.org)
  • permite
  • A degradação protéica é feita em uma série de etapas que resultam na ubiquitinação da proteína a ser destruída, esse processo permite que a célula elimine proteínas de modo bastante específico e é esta regulação que exige energia. (wikipedia.org)
  • Exames de imagem: Ultrassom ou tomografia computadorizada (CT) permite analisar a estrutura dos seus rins e do tracto urinário e detectar tumores. (wikipedia.org)
  • Uma estrutura de dados bem desenvolvida permite que uma variedade de operações críticas sejam implementadas por uma linguagem de programação com os tipos de dados e referências e as operações que deles provêm. (wikipedia.org)
  • biologia
  • Ver artigo principal: Morfometria e Sistemas biológicos Na biologia, as estruturas existem em todos os níveis de organização, indo hierarquicamente dos níveis de átomos e moléculas para os de células, tecidos, órgãos, organismos, população, comunidade e ecossistema. (wikipedia.org)
  • animais
  • Anticorpos policlonais são obtidos pela injeção de um antígeno peptídico em animais e, após a estimulação de resposta imune secundária, isolamento dos anticorpos a partir do soro. (wikipedia.org)
  • poderiam
  • No início, químicos perceberam que, se adicionassem uma molécula secundária, chamada de acopladora, poderiam manipular as substâncias químicas - um carbono aqui, um par de nitrogênios lá - e multiplicar as opções de cores que estavam disponíveis com o PPD sozinho. (blogspot.com)
  • processo
  • Como consequência, o processo de reparo de ADN precisa estar operando constantemente para resolver rapidamente os danos na estrutura do ADN. (wikipedia.org)
  • Aaron Ciechanover, Avram Hershko e Irwin Rose, conseguiram mostrar que o processo de proteólise ocorre em etapas que resultam na ubiquitinação da proteína a ser degradada. (wikipedia.org)
  • O enovelamento de proteínas (em inglês: Protein Folding) é um processo químico em que a estrutura de uma proteína assume a sua configuração funcional. (wikipedia.org)
  • O processo contrário chama-se desnaturação, em que uma proteína original é forçada a perder a sua configuração funcional, tornando-se uma cadeia amorfa e não funcional de aminoácidos. (wikipedia.org)
  • O ponto essencial no dobramento é, no entanto, o facto da sequência de aminoácidos específica de cada proteína conter a informação que indica a estrutura nativa e caminho para atingir esse estado: o dobramento é um processo espontâneo. (wikipedia.org)
  • Durante o processo de dobramento, o número de pontes de hidrogénio não muda apreciavelmente, porque por cada ponte de hidrogénio interna, uma ponte de hidrogénio entre a proteína desdobrada e o meio aquoso terá de ser quebrada. (wikipedia.org)
  • Durante ou após o processo de síntese, os resíduos de uma proteína são muitas vezes alterados quimicamente através de modificação pós-traducional, a qual modifica as propriedades físicas e químicas das proteínas, o seu enovelamento, estabilidade, atividade e, por fim, a sua função. (wikipedia.org)
  • cabelo
  • As proteínas são das mais importantes moléculas para a vida, usadas em tudo, desde estruturas como o cabelo até às enzimas, os catalisadores que aumentam ou regulam as reacções químicas. (blogspot.com)
  • Outra
  • Outra carga secundária incluía o ASP, que possuía três sensores independentes montados em uma placa no compartimento da carga, o Modular Star Sensor, o Yaw Earth Sensor e o Low Altitude Conical Earth Sensor, todos suportados pela Agência Espacial Européia. (wikipedia.org)
  • meio
  • A falta de alguns fosfatos prejudica muito a qualidade de vida e em diversos casos acarreta doenças associadas a senilidade e senescência: Transformações ocorridas no século XX em certas regiões, com repercussões na urbanização, na fecundidade e no meio ambiente, têm produzido impacto na estrutura etária da população e na mortalidade, exigindo mudanças na resposta de cada sociedade aos problemas de saúde. (wikipedia.org)
  • Esta ligação é estabelecida em meio aquoso, levando a molécula a uma estrutura cíclica. (wikipedia.org)
  • anos
  • Foram encontradas plantas do cherte de Rhynie datadas do Devónico Inferior (400 milhões de anos) contendo estruturas similares a vesículas e esporos de espécies actuais de Glomus. (wikipedia.org)
  • seja
  • Ver artigo principal: Estrutura de dados Na ciência da computação, uma estrutura de dados é um modo de armazenar os dados no computador para que ele seja usado eficientemente. (wikipedia.org)
  • vezes
  • Estrutura é sempre uma noção fundamental e às vezes intangível cobrindo o reconhecimento, observação, natureza, e estabilidade de padrões e relacionamentos de entidades. (wikipedia.org)
  • usados
  • Entre os métodos usados para estudar a estrutura e funções das proteínas estão a imuno-histoquímica, mutagénese sítio-dirigida, ressonância magnética nuclear e espectrometria de massa. (wikipedia.org)
  • existe
  • DNA nuclear existe em larga escala em estruturas agregadas conhecidas como cromossomos, os quais são compostos de DNA e, envolvidas por proteínas chamadas histonas. (wikipedia.org)
  • Uma proteína completamente desnaturada não possui estruturas terciárias e secundárias, e existe sob a designação de espiral aleatória. (wikipedia.org)
  • exemplo
  • Quando a causa é secundária deve-se começar tratando a causa primária, por exemplo tratando a infecção por hepatite B ou trocando o medicamento que desencadeou o problema. (wikipedia.org)
  • descoberta
  • Durante as suas investigações esteve perto de descobrir a estrutura em hélice dupla do ADN , descoberta essa efectuada mais tarde por James Watson e Francis Crick , em 1953 . (blogspot.com)
  • Da descrição verbal de uma criança sobre um floco de neve até uma análise científica detalhada sobre as propriedades dos campos magnéticos, o conceito de estrutura é uma fundação essencial de praticamente todos os modos de inquisição e descoberta na ciência, filosofia, e arte. (wikipedia.org)
  • tempo
  • Ao mesmo tempo que estas estruturas são complexas e bastante diversificadas, são compostas por elementos recorrentes e facilmente identificáveis que actuam como blocos de construção. (wikipedia.org)