biologia

  • A área emergiu como um campo científico nos anos 60, quando pesquisadores das áreas da biologia molecular, biologia evolutiva e genética de populações procuraram entender algumas descobertas que haviam sido feitas sobre a estrutura e função de ácidos nucléicos e proteínas. (wikipedia.org)
  • Em biologia, filogenia (ou filogênese) é o estudo da relação evolutiva entre grupos de organismos (por exemplo, espécies, populações), que é descoberto por meio de sequenciamento de dados moleculares e matrizes de dados morfológicos. (wikipedia.org)
  • Ela dedicou sua carreira à aplicação das tecnologias computacionais para promover avanços no campo da biologia e da medicina, em especial à criação de bases de dados de ácidos nucleicos e proteínas, além de ferramentas para utilizá-las. (wikipedia.org)
  • Ela lecionou fisiologia e biofísica por 13 anos, tornando-se concomitantemente afiliada à Nacional Biomedical Research Foundation, membra da Associação Americana para o Avanço da Ciência, conselheira da Sociedade Internacional para o Estudo da Origem da Vida (1980) e atuando nos conselhos editoriais de Journal of Molecular Evolution e Computadores em Biologia e Medicina. (wikipedia.org)
  • Essas similaridades e diferenças entre os tipos de célula são particularmente relevantes para a biologia molecular. (wikipedia.org)
  • A teoria do relógio molecular é uma excelente ferramenta para a biologia. (wikipedia.org)
  • A genética molecular é a área da biologia que estuda a estrutura e a função dos genes a nível molecular. (wikipedia.org)
  • A genética molecular usa os métodos da genética e da biologia molecular. (wikipedia.org)
  • Através da utilização dos métodos de genética e biologia molecular, a genética molecular descobre as razões pelas quais as características são exercidas e como e porque algumas podem sofrer mutações. (wikipedia.org)
  • Nas classificações de base morfológica, anteriores à aplicação dos conceitos da biologia molecular e da moderna filogenia, todos os géneros agora incluídos nas Adoxaceae eram considerados parte da família Caprifoliaceae, a família das madressilvas. (wikipedia.org)
  • O surgimento de novas técnicas de biologia molecular permitiu a utilização de marcadores genéticos capazes de detectar polimorfismos a níveis de DNA. (wikipedia.org)
  • EMBOSS é um pacote de análise de código aberto especialmente desenvolvido para as necessidades da comunidade de usuários da biologia molecular e da bioinformática. (wikipedia.org)
  • Como um campo interdisciplinar da ciência, a bioinformática combina a biologia, ciência da computação, estatística, matemática e engenharia para analisar e interpretar e processar dados biológicos. (wikipedia.org)
  • Alguns especialistas brasileiros da área acreditam que a bioinformática, como se entende tradicionalmente no meio acadêmico e não pela análise da palavra, é circunscrita à biologia molecular, às vezes ainda mais especificamente restrita à Genômica. (wikipedia.org)
  • A bioinformática tornou-se uma parte muito importante de muitas áreas da biologia molecular. (wikipedia.org)
  • Em biologia molecular experimental, técnicas de bioinformática, tais como imagem e processamento de sinais, permitiram a extração de resultados úteis a partir de grandes quantidades de dados brutos. (wikipedia.org)
  • As ferramentas de bioinformática auxiliam na comparação de dados genéticos e genômicos e, mais geralmente, na compreensão dos aspectos evolutivos da biologia ao nível molecular. (wikipedia.org)
  • O termo bioinformática foi originalmente usado pelos biológos Paulien Hogeweg e Ben Hesper no começo dos anos 1970 para definir o estudo de processos informacionais nos sistemas bióticos, sendo ela uma ciência interdisciplinar, envolvendo matemática, tecnologia computacional e biologia molecular. (wikipedia.org)

Filogenia

  • O problema da filogenia é que os dados genéticos estão disponíveis apenas para taxons vivos e nos registros fósseis (dados osteometricos) contendo poucos dados e características morfológicas ambíguas. (wikipedia.org)
  • Ver artigo principal: Filogenia molecular As conexões evolutivas entre organismos são representados graficamente através de árvores filogenéticas. (wikipedia.org)
  • Com Richard Eck, ela publicou a primeira reconstrução computacional de filogenia (árvore evolutiva) a partir de sequências moleculares, utilizando um método de máxima parcimônia. (wikipedia.org)
  • Todas as pesquisas envolvendo filogenia, epidemiologia, ecologia e taxonomia molecular, incluindo o uso de sequências genéticas publicadas em bancos de dados públicos (como por exemplo, o GenBank), provenientes de material vegetal, animal, fungos e micro-organismos em geral isolados do território nacional, mar territorial, plataforma continental e zona econômica exclusiva precisam estar cadastradas. (unifesp.br)
  • A filogenética tradicional baseia-se nos dados morfológicos obtidos pela medição e quantificação das propriedades fenotípicas de organismos representativos, enquanto o campo mais recente da filogenia molecular usa seqüências de nucleotídeos codificando genes ou seqüências de aminoácidos codificando proteínas como base para a classificação. (wikipedia.org)
  • Muitas formas de filogenia molecular estão intimamente relacionadas e fazem uso extensivo do alinhamento de seqüências na construção e refino de árvores filogenéticas, que são utilizadas para classificar as relações evolutivas entre genes homólogos representados nos genomas de espécies divergentes. (wikipedia.org)
  • Árvore filogenéticas geradas pela filogenia computacional podem ser enraizadas ou não enraizadas dependendo dos dados de entrada e do algoritmo utilizado. (wikipedia.org)

organismos

  • Isso é feito tanto em nível microscópico quanto em molecular, para organismos unicelular como bactérias e célular especializadas em organismos multicelular como os humanos. (wikipedia.org)
  • Com os avanços, nas ultimas décadas, de técnicas moleculares, ocorreu um aumento na utilização de organismos geneticamente modificados (Transgênicos). (wikipedia.org)
  • Um campo importante da genética molecular é o uso de informação molecular para determinar padrões de descendência, e assim a classificação científica correta dos organismos: a isto chamamos sistemática molecular. (wikipedia.org)

base

  • Esse livro levou à criação da base de dados Protein Information Resource, desenvolvida em seu grupo de pesquisa. (wikipedia.org)
  • Essa iniciativa, somada ao esforço do grupo de Walter Goad que originou o GenBank, base de dados de sequências de ácidos nucleicos, deram origem às bases de dados modernas de sequência moleculares. (wikipedia.org)
  • Nucleótidos de DNA são a base para o novo DNA, o DNA molde é a sequência específica a ser amplificada, iniciadores são nucleótidos complementares que podem ir em ambos os lados do DNA molde, e a polimerase Taq é uma enzima termicamente estável que salta-inicia a produção de DNA novo às temperaturas elevadas necessárias para a reacção. (wikipedia.org)
  • Um género monotípico adicional, o género Sinadoxa, foi adicionado com base em comparações moleculares com o género Adoxa. (wikipedia.org)
  • SNPs (single nucleotide polymorphism): são marcadores moleculares capazes de detectar mutações e polimorfismos através de alterações de uma única base no genoma. (wikipedia.org)

campo

  • Como disciplina, o campo da Evolução Molecular se encarrega da evolução de genes e proteínas, dando ênfase à taxa de mutação e aos mecanismos que regem a evolução molecular. (wikipedia.org)

marcadores moleculares

  • No meu projeto, eu pretendo analisar um organismo pouco estudado em relação ao processo de diversificação - Plasmodium de aves - em um contexto filogeográfico, a fim de identificar os fatores que influenciam a variação genética em marcadores moleculares neutros e adapt. (fapesp.br)
  • Um marcador genético ideal deve apresentar uma série de atributos: Alto nível de polimorfismo Estabilidade em diferentes ambientes Detectar grande número de loci não ligados Herança simplesGuerra, Nodari e Stefenon Os marcadores moleculares correspondem, basicamente, a uma sequência de nucleotídeos que atua como referência em um cromossomo. (wikipedia.org)
  • Através da tecnologia dos marcadores moleculares a caracterização genética de diferentes genomas se tornou mais fácil e rápida, e com isso foram surgindo diversas metodologias capazes de utilizar e caracterizar alterações nesses marcadores. (wikipedia.org)
  • Abaixo, segue uma lista com os principais tipos de marcadores moleculares genômicos: RFLP (Restriction fragment lenght polymorphism): são fragmentos de DNA obtidos a partir de uma técnica que consiste na hibridização de sequências específicas de DNA, denominadas sondas, com o DNA total digerido por enzimas de restrição dos indivíduos a serem analisados. (wikipedia.org)
  • Podem ser caracterizados como marcadores moleculares quando ocorrem em mais de 1% da população, pois quando essas variações são relatadas com uma frequência menor que este valor, então é considerado apenas como mutações pontuais. (wikipedia.org)

genes

  • Todas essas informações sobre genes e proteínas podem ser utilizadas pela filogenética molecular para estabelecer uma árvore Filogenética concernente à evolução do grupo em estudo. (wikipedia.org)
  • Um exemplo é a utilização do Sleeping Beauty Transposon system (SB), ele é um transposão artificial, construído com o objetivo de introduzir sequências de DNA bem conhecidas em cromossomos de vertebrados, afim de descobrir novos genes e funções. (wikipedia.org)
  • Em estudos moleculares, um problema principal consiste na produção de um Alinhamento múltiplo de sequências entre os genes ou seqüências de aminoácidos de interesse. (wikipedia.org)
  • Os dados da sequência permitiram aos pesquisadores identificar os genes responsáveis ​​pela biossíntese das toxinas, bem como entender melhor os controles genéticos relacionados com a formação de micorrizas. (wikipedia.org)

partir

  • Ele foi obtido a partir de pesquisas sobre a estrutura da proteína no caso hemoglobinas de espécies diferentes, traçando o número de mudanças do aminoácido entre as sequências de proteína contra a idade estimada de espécies a partir de evidências fósseis. (wikipedia.org)
  • O software automaticamente lida com dados em uma variedade de formatos e até mesmo permite a recuperação transparente de dados de seqüências a partir da web. (wikipedia.org)
  • Uma árvore não enraizada sempre pode ser produzida a partir de uma árvore enraizada, mas uma raiz normalmente não podem ser colocada em uma árvore não enraizadas sem dados adicionais sobre as taxas de divergência, como pressuposto na hipótese do relógio molecular. (wikipedia.org)

utilizados

  • Todos os métodos dependem de um modelo matemático explícito ou implícito que descreve a evolução das características observadas nas espécies e são normalmente utilizados pela Filogenética molecular, no qual os caracteres são alinhadas em sequências de nucleótidos ou aminoácidos. (wikipedia.org)
  • Hoje em dia, dados moleculares, que inclui sequências de proteínas e de DNA, são utilizados para a construção de árvores filogenéticas. (wikipedia.org)
  • O código de 1 letra utilizado para aminoácidos foi criado por ela, reduzindo o tamanho dos arquivos utilizados para escrever sequências de aminoácidos na era da computação por cartões perfurados. (wikipedia.org)
  • Microssatélites (SSRP - Simple Sequence Repeats Polymorphisms): um grupo de marcadores molecular muito utilizados, os quais são caracterizados por unidades muito curtas de sequências repetitivas de nucleotídeos. (wikipedia.org)

tipos

  • Junto com a determinação do padrão de descendentes, a genética molecular ajuda a compreender as mutações genéticas que podem causar certos tipos de doenças. (wikipedia.org)

muitas

  • Filogeneticistas moleculares, que usam sequência de DNA como dados, tem levado a muitas revisões recentes e provavelmente continuarão a fazê-lo. (wikipedia.org)

Existem

  • Existem quatro técnicas gerais utilizadas para genética molecular: amplificação, separação e detecção, e expressão. (wikipedia.org)

bases

  • tudo o que é necessário é a sequência de bases do DNA e os materiais listados acima. (wikipedia.org)

utilizando

  • A obtenção dos marcadores envolve a amplificação de sequências que flanqueiam essas regiões repetidas via PCR, utilizando-se de iniciadores específicos para as regiões que cercam os microssatélites. (wikipedia.org)
  • RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA): são fragmentos de DNA amplificados ao acaso pela PCR utilizando iniciadores curtos de sequência aleatória (Williams, 1990). (wikipedia.org)

todas

  • Ela também começou a reunir sequências de proteínas no Atlas de Estruturas e Sequências de Proteínas (Atlas of Protein Sequence and Structure), um livro reunindo todas as sequências de proteínas conhecidas até a época, publicado em1965. (wikipedia.org)

exemplo

  • Em sua tese de pós-graduação, Dayhoff foi pioneira na utilização de recursos computacionais - por exemplo, processamento de dados de massa - para química teórica. (wikipedia.org)

alinhamento

  • O pacote EMBOSS contém uma variedade de aplicações para alinhamento de sequências, busca rápida em banco de dados com padrões de seqüência, identificação de estruturas secundárias de proteínas (protein motif) (incluindo a análise de domínio), e muito mais. (wikipedia.org)

Estruturas

  • As geometrias moleculares obtidas por espectros de refracção de estruturas cristalinas, apesar de úteis não permitem toda a informação necessária nas moléculas biolóicas. (scribd.com)

evolutiva

  • No entanto, mesmo não fornecendo dados exatos, ou seja, ele fornece estimativas de tempo de eventos na história evolutiva, a ampla gama de hipóteses biológicas que vão desde as origens do reino animal para o surgimento de novas epidemias virais. (wikipedia.org)

mecanismos

  • Ele ajudou a estudar os mecanismos que impulsionam a evolução molecular. (wikipedia.org)

permite

  • A Evolução Molecular permite revelar a natureza das mudanças no material genético e nos produtos codificados por ele, além de determinar por métodos estatísticos o curso histórico-evolutivo dessas mudanças em uma determinada linhagem, ou entre linhagens diferentes. (wikipedia.org)

evolutivos

  • Evolução molecular refere-se a vários processos evolutivos resultantes de alterações no DNA, RNA, e/ou Proteína. (wikipedia.org)

meio

  • Nestes últimos anos, graças ao desenvolvimento das técnicas de informática, desenvolveram-se novos e potentes métodos que estudam as relações actividade/estrutura por meio de descritores moleculares que têm em conta as posições relativas no espaço, dos átomos que formam as moléculas. (scribd.com)

teoria

  • Com essa teoria ficou possível prever várias fontes de variação na taxa de evolução molecular. (wikipedia.org)

fontes

  • Ele tornou possível prever várias fontes de variação na taxa de evolução molecular. (wikipedia.org)
  • Os polimorfismos de sequência nucleotídica são fontes abundantes de variação genética e, por serem estáveis do ponto de vista evolutivo, estes marcadores são muito interessantes para estudos filogenéticos de evolução dentro da espécie. (wikipedia.org)

natureza

  • As moléculas e os sistemas moleculares são univocamente definidos pela natureza dos átomos que os compõem, posição relativa dos núcleos dos diferentes átomos e a sua carga eléctrica bruta (diferença entre o número de protões e de electroes do sistema). (scribd.com)

ferramentas

  • Uma das primeiras ferramentas a ser utilizada pelos geneticistas moleculares na década de 1970 foi o rastreio genético (mapeamento genético no Brasil). (wikipedia.org)

identificar

  • Do ponto de vista molecular, um marcador genético (ou locus marcador) serve para identificar um local ou uma região de um cromossomo. (wikipedia.org)

levou

  • Muito mais tarde, os géneros Sambucus (sabugueiros) e Viburnum (laurotinos ou folhados) foram adicionados à família após cuidadosa análise morfológica confirmada por dados bioquímicos, o que levou o Angiosperm Phylogeny Group a incluir no sistema APG II a família com a sua presente circunscrição taxonómica. (wikipedia.org)

envolve

  • O termo clonagem para este tipo de amplificação envolve fazer múltiplas cópias idênticas de uma sequência de DNA. (wikipedia.org)

entender

  • De uma maneira menos formal, a bioinformática também tenta entender os princípios organizacionais de sequências de ácidos nucleicos e proteínas. (wikipedia.org)

geralmente

  • A identificação de uma raiz geralmente requer a inclusão nos dados de entrada de pelo menos um "grupo-externo" sabendo-se apenas remotamente relacionado com as seqüências de interesse. (wikipedia.org)

teve

  • Motoo Kimura e Ohta Tomoko afirmaram que a taxa constante para cada característica da proteína, sugeriu que a maior parte dos aminoácidos que sofriam alterações em uma proteína foram efetivamente neutras - ou seja,a mudança da sequência do aminoácido não teve influência sobre a aptidão de um organismo e, portanto, a taxa de mudança não foi afetado pela seleção natural. (wikipedia.org)

caso

  • Esse método torna possível contar as discrepâncias em sequências moleculares entre indivíduos sobreviventes, no caso espécies. (wikipedia.org)

grupo

  • O Dr. Yassin irá participar da discussão das análises de dados dos projetos de pesquisa em nível doutorado, do nosso grupo de pesquisa a saber:*Estrutura Populacional de Drosophila sturtevanti e biodiversidade de drosofilídeos em domínios da Mata Atlântica e sua aplicação em programas de conservação. (fapesp.br)

taxa

  • Outras proteínas também mostraram uma taxa constante de evolução molecular entre espécies, mas cada proteína com uma taxa diferente: histonas foram excepcionalmente lentas, citocromo c foi mais rápido (mas mais lento do que hemoglobinas) e fibrinopeptídeos foram mais rápidos ainda. (wikipedia.org)
  • Esse estudo prevê que a longo prazo a taxa de evolução molecular neutra em espécies é o mesmo que a taxa de mutação neutra nos indivíduos.Se grande parte das mudanças dos aminoácidos são neutras ou deletérias, em seguida, a taxa prevista constante de mudança de proteína produz um relógio molecular. (wikipedia.org)