base


  • Para uma definição correta é necessário, uma análise mais detalhada com base na sequencia de DNA. (wikipedia.org)
  • Deste modo, em 2003, pesquisadores da Universidade de Guelph, em Ontário, Canadá, propuseram o código de barras de DNA (DNA barcoding) como forma de identificar as espécies com base na diversidade de uma parte da sequência de um gene mitocondrial: subunidade I da citocromo oxidase (COI). (wikipedia.org)
  • O esclarecimento do inter-relacionamento das espécies pertencentes a família Corvidae foi alcançado com base na análise de DNA de várias sequências. (wikipedia.org)
  • Os cromossomos já haviam sido apontados como base da herança em 1903, mas a estrutura do DNA só seria descrita em 1953 por James Watson e Francis Crick. (wikipedia.org)
  • Com base nas suas sequências de DNA ribossômico, as quatro espécia formam um clado, ou grupo monofilético (isto é, eles derivam de um único ancestral). (wikipedia.org)

genoma humano


  • 1989 - Criação nos EUA do Instituto Nacional para Pesquisa do Genoma Humano (NHGRI), chefiado por James Watson, para determinar toda a sequência do ADN que compõe os cromossomas humanos. (wikipedia.org)
  • 12 de Fevereiro de 2001 - É anunciada a publicação da análise da sequência do genoma humano. (wikipedia.org)
  • 2003 - Conclusão parcial da análise da sequência do genoma humano (PGH). (wikipedia.org)
  • Com um financiamento inicial de 50 bilhões de dólares e uma duração prevista de 15 anos, o Projeto Genoma teve como objetivos criar mapas físicos de alta resolução, sequenciar todo o DNA do genoma humano, criar e depositar as informações obtidas em um banco de dados e aperfeiçoar as técnicas moleculares de modo a melhorar a qualidade do estudo. (wikipedia.org)
  • Outros marcos importantes para a Genética Médica incluem a descoberta das endonucleases de restrição em 1970, permitindo a análise do DNA, bem como a publicação do esboço do genoma humano em 2000. (wikipedia.org)

dados


  • Em plantas, uma busca em bancos de dados de sequências de DNA publicadas revelou que sítios de microsatélites são largamente distribuídos com uma freqüência de um a cada 50 mil pares de bases. (wikipedia.org)
  • Para utilização forense do DNA mitocondrial, seja ela com o fim de associar uma evidência a um suspeito ou de identificar a relação matrilinear entre indivíduos, o estabelecimento de um banco de dados de haplótipos das regiões HVI e HVII que seja representativo da população é indispensável. (wikipedia.org)
  • Hoje em dia, dados moleculares, que inclui sequências de proteínas e de DNA, são utilizados para a construção de árvores filogenéticas. (wikipedia.org)
  • O sistema de dados de códigos de barra da vida, estabelecido em 2005 pelo Instituto de Biodiversidade de Ontário, é uma bancada de trabalho online que combina um repositório de código de barras, ferramentas analíticas, interface para apresentação de sequências de GenBank, uma espécie de ferramenta de identificação e conectividade para os desenvolvedores web externos e bioinformatas. (wikipedia.org)
  • O banco de dados do projeto Barcoding of Life reúne, atualmente, quase três milhões de sequências. (wikipedia.org)
  • O site do BOLD (boldsystems.org) disponibiliza, além do número atualizado de códigos de barra de DNA existentes no mundo, um portal público de buscas e um portal educacional para possibilitar uma melhor navegação no banco de dados além de tornar possível a contribuição para novos códigos de barra, dentre outras funcionalidades. (wikipedia.org)
  • Avanços tanto em métodos laboratoriais (por exemplo, na tecnologia de sequenciação de DNA por capilares) que permitiram uma sequenciação de DNA mais rápida e métodos computacionais que fazem melhor uso dos dados (por exemplo, usando a teoria do coalescente) ajudaram a melhorar as inferências filogeográficas. (wikipedia.org)
  • As relações filogenéticas dentro da subfamília Epidendroideae são complicadas entre as Tribos Epidendreae e Arethuseae que foram fixadas com parcimônia e modelo baseado em dados de análises individuais da sequência de DNA. (wikipedia.org)

mitocondrial


  • O DNA mitocondrial é um ADN que não se localiza no núcleo da célula, mas sim na mitocôndria (organela celular). (wikipedia.org)
  • O DNA mitocondrial tem sido estudado com o intuito de investigar linhagens muito antigas. (wikipedia.org)
  • O conceito da Eva mitocondrial é baseado no mesmo tipo de análise. (wikipedia.org)
  • A existência de DNA mitocondrial também apoia a hipótese endossimbiótica, a qual sugere que as células eucarióticas surgiram quando uma célula procariótica foi englobada por outra célula sem ser digerida. (wikipedia.org)
  • A existência de DNA mitocondrial sugere que, as mitocôndrias já existiram um dia como entidades separadas das suas atuais células-hospedeiras. (wikipedia.org)
  • O DNA mitocondrial se difere do material genético encontrado no núcleo das células não só em relação a localização, mas também no tocante a quantidade de moléculas por célula, tipo de herança (exclusivamente materna) e seqüência. (wikipedia.org)
  • Por existir em múltiplas cópias, o DNA mitocondrial é especialmente útil em análises em que o DNA nuclear se encontra em quantidades diminutas, como as que são usualmente encontradas em cenas de crime. (wikipedia.org)
  • O DNA mitocondrial humano é uma molécula contendo 16.539 pares de bases nitrogenadas já completamente sequenciadas. (wikipedia.org)
  • Para a análise forense de DNA mitocondrial usualmente utiliza-se sequências das regiões hipervariáveis (HV) I e II. (wikipedia.org)
  • A principal limitação das análises forenses de DNA mitocondrial está em seu restrito poder de discriminação, o que ocorre em virtude da ocorrência de haplótipos comuns na população. (wikipedia.org)
  • Pesquisas com DNA mitocondrial de caucasianos norte-americanos demonstram que o perfil mais comum está presente em cerca de 7% daquela população e outros 12 tipos ocorrem em mais de 0,5% das pessoas (Parsons e Coble, 2001). (wikipedia.org)
  • Uma outra aplicação dos polimorfismos de DNA mitocondrial é a possibilidade de investigar um conjunto de polimorfismos que permita agrupar amostras em um determinado haplogrupo. (wikipedia.org)
  • Adicionalmente, é possível se encontrar variações entre amostras de DNA mitocondrial em diferentes tecidos do mesmo indivíduo, principalmente naqueles portadores de doenças metabólicas relacionadas a esta molécula. (wikipedia.org)
  • Além disto, a taxa de erro associado a replicação é maior em DNA mitocondrial, quando se compara com o DNA nuclear (Grover, Holland e Le Roux, 1999). (wikipedia.org)
  • Graças a este avanço, a informação contida nas sequências de DNA mitocondrial tornou-se muito mais acessível. (wikipedia.org)

podem ser


  • As partes coincidentes podem ser fundidas, unindo dois pedaços de DNA. (wikipedia.org)
  • Códigos de barra de DNA são sequências curtas de DNA, amplificadas por PCR e sequenciadas, que podem ser utilizadas na distinção e identificação de espécies. (wikipedia.org)

pares de bases


  • Microssatélites são unidades de repetição de pares de bases do DNA (AT, GC), que são utilizados como marcador genético em estudos de parentesco, as migrações humanas e de origem humana. (wikipedia.org)
  • Eles são basicamente loci polimórficos presentes no DNA nuclear e DNA organela que consistem em unidades repetitivas 1-6 pares de bases de comprimento. (wikipedia.org)
  • Também chamados "códigos da vida", baseiam-se em sequências de 500 a 800 pares de bases padronizados, ou seja, presentes em um mesmo trecho do genoma. (wikipedia.org)

organismo


  • 1995 - É obtida a primeira sequência completa de ADN de um organismo de vida livre, a bactéria Hemophilus influenzae. (wikipedia.org)
  • A grande vantagem dos marcadores moleculares de DNA, com relação a outros tipos de marcadores é a sua abundância, a sua insensibilidade aos fatores do ambiente e o fato de o DNA estar presente em todas as células do organismo. (wikipedia.org)
  • Em 1973, um ano após o feito de Paul Berg, Stanley N. Cohen, Annie C. Y. Chang, Herbert W. Boyer, e Robert B. Helling realizam a primeira recombinação em um organismo, uma Escherichia coli que teve seu DNA recombinado in vitro. (wikipedia.org)
  • A técnica de microarranjo foi descrita por Schena em 1995, e em 1997 a técnica proporcionou a análise do genoma de um organismo eucariótico (Saccharomyces cerevisiae). (wikipedia.org)

estudo


  • Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia. (wikipedia.org)
  • Ver artigo principal: sequenciamento de DNA A montagem do genoma é feito através da união de um grande número de sequências de DNA que são juntadas para criar uma representação do cromossomo original do DNA em estudo. (wikipedia.org)

pode ser


  • DNA ISH pode ser usado para determinar a estrutura dos cromossomos. (wikipedia.org)
  • Solução de parâmetros, tais como temperatura, sal, e/ou concentração de detergente pode ser manipulada para remover quaisquer interações não-idênticas (por exemplo, apenas a exata sequência de combinações permanecerá vinculada). (wikipedia.org)
  • Uma tecnologia alternativa, "branched DNA essay", pode ser usado para o RNA (mRNA, lncRNA, e miRNA ) em ensaios de hibridização in situ com uma única molécula de sensibilidade sem o uso da radioatividade. (wikipedia.org)
  • A vicariância pode ser investigada pela observação da concordância entre o padrão de fragmentação de um táxon e a história geológica da região que habita - se os eventos cladogênicos correspondem às sucessivas fragmentações do terreno, a filogenia, deduz-se, é produto da sequência de eventos tectônicos. (wikipedia.org)
  • Pode ser classificado de acordo com a natureza da sonda utilizada, podendo ser fitas de DNA fita dupla (dsDNA), ou oligonucleotídeos. (wikipedia.org)
  • O advento da reacção da polimerase em cadeia (PCR), o processo pelo qual milhões de cópias de um segmento de DNA pode ser replicado, foi crucial no desenvolvimento da filogeografia. (wikipedia.org)

seja


  • Este loco altamente polimórfico, amplificado via PCR foi também denominado de "STMS- Sequence Tagged Microsatellite Sites", ou seja, sítios de microssatélies marcados por sequência,e constituem a classe mais polimórfica de marcadores moleculares disponíveis hoje.O acrônimo SSRP (Simple Sequence Repeat Polymorphism) também é comumente encontrado em literatura. (wikipedia.org)
  • Em um projeto de sequenciamento shotgun, todo o DNA do ser vivo analisado (seja uma bactéria, seja um mamífero) é inicialmente particionado em milhões de pequenos pedaços. (wikipedia.org)

utilizado


  • Hibridização In situ é utilizado para revelar a localização específica de sequências de ácidos nucleicos nos cromossomos ou em tecidos, um passo crucial para a compreensão da organização, regulação e função dos genes. (wikipedia.org)
  • DNA Fluorescente ISH (FISH) pode, por exemplo, ser utilizado em diagnósticos médicos para avaliar a integridade cromossômica. (wikipedia.org)
  • Partindo desse princípio, qualquer fragmento de DNA próximo ao gene de resistência poderia ser utilizado como marcador, que neste caso é denominado marcador molecular. (wikipedia.org)
  • Um algoritmo de montagem de genoma é então utilizado para reunir todas as partes e colocá-las na ordem original, detectando todos os locais onde existe coincidências entre pedaços distintos de DNA. (wikipedia.org)
  • A classificação de uma mutação depende do aspecto que é utilizado para a análise. (wikipedia.org)

moleculares


  • Essas descobertas permitiram o diagnóstico de muitas doenças genéticas através da análise cromossômica e de testes moleculares. (wikipedia.org)

usualmente


  • Microarranjo de DNA ou Chip de DNA é uma coleção de pontos microscópicos, usualmente preenchidos com DNA, que contém sondas para determinadas moléculas-alvo produzindo resultados quantitativos, como expressão gênica. (wikipedia.org)

outros


  • Para outros significados, veja DNA (desambiguação). (wikipedia.org)

primeira


  • Sua presença foi constatada em 34 espécies vegetais, sendo que o alimento repetido mais comum foi o di-nucleotídeo AT claramente documentaram a presença de sequências simples repetidas em plantas pela primeira vez. (wikipedia.org)
  • Paul Berg juntamente com Robert H. Symons e David A. Jackson realizaram a primeira recombinação de uma molécula de DNA em 1972. (wikipedia.org)

quatro


  • Quatro espécies de Albatrellus foram incluídas em uma ampla análise filogenética da ordem Russulales publicada em 2003. (wikipedia.org)

Nesta


  • nesta condição, moléculas de DNA provenientes das duas amostras são marcadas com CY3 (verde) e CY5 (vermelho), e hibridizadas às sondas no microarranjo. (wikipedia.org)

complementares


  • sonda) marcadores complementares para localizar uma sequência específicas de DNA ou RNA de uma parte ou trecho de tecido (in situ), ou, se o tecido for pequeno o suficiente (por exemplo, sementes de plantas, embriões Drosophila), o tecido inteiro, nas células, e na circulação de células tumorais (os CTCs). (wikipedia.org)
  • Estes primers devem ser complementares à sequência a ser determinada e, para sintetizá-los é necessário se conhecer a sequência-alvo. (wikipedia.org)
  • As sondas contêm sequências complementares às moléculas-alvo correspondendo a uma parte específica de um gene e são fixadas em uma superfície sólida através de agulhas robotizadas, fotolitografia ou por impressão a jato. (wikipedia.org)

resultados


  • 1998) e que a extração de DNA feita a partir de dentes oferece melhores resultados que a realizada a partir de ossos longos (Primorac e Andelinovic, 1999). (wikipedia.org)

nucleicos


  • Hibridização in situ(do inglês: "In situ hybridization" (ISH) é um tipo de hibridização que usa DNA, RNA ou trechos de ácidos nucleicos modificados (i.é. (wikipedia.org)
  • De uma maneira menos formal, a bioinformática também tenta entender os princípios organizacionais de sequências de ácidos nucleicos e proteínas. (wikipedia.org)

diferentes


  • Diferentes experimentos no início dos anos 80 demonstraram que,os genomas eucariotas são densamente povoados por diferentes classes de sequências repetidas, umas mais complexas (minisatélites) e outras mais simples. (wikipedia.org)
  • O sequenciamento é um processo computacional difícil pois vários genomas possuem um grande número de sequências idênticas, às vezes com milhares de nucleotídeos, algumas ocorrendo em milhares de locais diferentes. (wikipedia.org)
  • O fato de milhares de cópias do DNA serem parcialmente digeridas indica que nem todos os sítios de reconhecimento das enzimas de restrição serão clivados, criando fragmentos diferentes mas que podem possuir algumas regiões idênticas que se sobrepõem. (wikipedia.org)
  • A análise desses padrões únicos dos diversos clones revela a localização das regiões que se sobrepõem entre diferentes clones. (wikipedia.org)

sequenciamento


  • Os primers são sequências sintéticas que, na reação, se anelam à sequência-alvo, iniciando o processo de replicação e sequenciamento. (wikipedia.org)
  • O mapa físico foi concluído em 1995 junto com novas técnicas que permitiram a automatização das técnicas de DNA (Genetics - a conceptual approach), tornando o sequenciamento do DNA em larga escala possível. (wikipedia.org)
  • Em 1999 começou-se a usar a técnica de microarranjo na análise de expressão gênica, e adotou-se o uso de uma série de oligonucleotideos para sequenciamento e analise de mutação. (wikipedia.org)

genomas


  • Em genomas de eucariotos, estas sequências simples são mais freqüentes, melhor distribuídas ao acaso e formam locos hipervariáveis constituídos por minisatélites. (wikipedia.org)
  • Ver artigo principal: Mutação Mutação é um erro que ocorre no material genético, principalmente durante o processo de replicação do DNA, envolvendo falhas nos mecanismos normais pelos quais os genomas são copiados e, eventualmente, corrigidos. (wikipedia.org)

usado


  • Bissulfito de sódio é usado na análise do status da metilação de citosinas em DNA. (wikipedia.org)

atuais


  • Portanto, os biólogos normalmente estão restrito a análise de organismos atuais para identificar as suas relações evolutivas. (wikipedia.org)

comumente


  • Como observado acima, a sonda é um marcador complementar de DNA ou, mais comumente, de RNA (riboprobe). (wikipedia.org)

partir


  • Para microarrays dsDNA, as sondas são feitas a partir da amplificação de uma sequência gênomica pelo método de PCR. (wikipedia.org)

completa


  • O processo é repetido até montar a sequência completa. (wikipedia.org)

feita


  • A leitura destas sequências é feita por intermédio do código genético, que especifica a sequência linear dos aminoácidos das proteínas. (wikipedia.org)

todas


  • Entretanto para se montar a sequência final é necessário avaliar todas as regiões de sobreposição entre os pequenos fragmentos criados. (wikipedia.org)

sonda


  • A sonda hibridiza a sequência marcadora em temperatura elevada, e, em seguida, o excesso de sonda é lavado (após a hidrólise utilizando RNase no caso de excesso de sonda de RNA não-hibridizada). (wikipedia.org)
  • O histórico do microarranjo começa na década 70 com o advento da técnica de Southern blot, descrita por Edwin M. Southern (Southern, 1975), na qual ocorre a transferência de fragmentos de DNA separados por eletroforese para uma membrana, e esses são detectados por hibridização de um sonda marcada. (wikipedia.org)

artigo


projeto


  • Como não se conhecia a sequência do DNA genômico, essa abordagem não pôde ser aplicada da forma original no Projeto. (wikipedia.org)

portanto


  • Os microssatélites apresentam taxas mais altas de mutação genética em relação a outras partes do DNA e, portanto, perfeito para estudar ancestralidade humana. (wikipedia.org)

comprimento


  • Sequências simples repetidas ("SSR-Simple Sequence Repeats"), mais tarde denominadas também de microsatélites, consistem de pequenas sequências ("sequence motif") com 1 a 4 nucleotídeos de comprimento, repetidas em tandem. (wikipedia.org)

estrutural


  • Em biologia estrutural, a bioinformática auxilia na simulação e modelagem de DNA, RNA e proteínas, bem como interações biomoleculares. (wikipedia.org)
  • O restante da sequência de ADN tem importância estrutural ou está envolvido na regulação do uso da informação genética. (wikipedia.org)

geralmente


  • Geralmente a técnica de microarranjo de DNA tem aplicações direcionadas para análise de expressão gênica e de mutações pontuais. (wikipedia.org)

seguida


  • Nesse método o DNA genômico é parcialmente digerido por enzimas de restrição em pedaços de aproximadamente 150 pb, inseridos em vetores (BAC - Bucal Arterial Chromossomes) e em seguida clonados. (wikipedia.org)

observadas


  • Todos os métodos dependem de um modelo matemático explícito ou implícito que descreve a evolução das características observadas nas espécies e são normalmente utilizados pela Filogenética molecular, no qual os caracteres são alinhadas em sequências de nucleótidos ou aminoácidos. (wikipedia.org)