• fragmentos
  • En particular, el montaje o ensamblado de secuencias genómicas de alta calidad desde fragmentos obtenidos tras la secuenciación del ADN a gran escala es un área de alto interés. (wikipedia.org)
  • Por otra parte, y según el mismo autor: …la biología computacional generalmente se relaciona con el desarrollo de algoritmos nuevos y eficientes, que se puede demostrar funcionan sobre un problema difícil, tales como el alineamiento múltiple de secuencias o el montaje (o ensamblado) de fragmentos de genoma. (wikipedia.org)
  • Secuencias indicadoras: se clonan los fragmentos genómicos en cromosomas bacterianos artificiales (BAC), capaces de contener la región codificante y las secuencias reguladoras de un gen. (wikipedia.org)
  • La denominación "ADN recombinante" se refiere a combinaciones muevas de ADN creadas entre secuencias o fragmentos de esta molécula (los cuales son de interés por alguna razón) y moléculas de ADN bacteriano (o de otra clase ) capaces de duplicarse indefinidamente en el laboratorio (Freifelder, 1983). (monografias.com)
  • cuatro
  • Las quinasas Janus tienen una estructura molecular formada por cuatro dominios o regiones reconocidos, que se distribuyen cada uno de forma adyacente al siguiente según el orden: Dominio ERM: de unos 300 aminoácidos, se localiza en el extremo amino terminal. (wikipedia.org)
  • Para secuencias de nucleótidos puede usarse una matriz de sustitución, pero dado que sólo hay cuatro caracteres estándar posibles por secuencia, y que los nucleótidos individuales no difieren mucho en su probabilidad de sustitución, los parámetros para secuencias de ADN y ARN consisten, normalmente, en una penalización por gap, una puntuación positiva para coincidencias de caracteres, y una puntuación negativa para desigualdades. (wikipedia.org)
  • Es un péptido que consta de 36 aminoácidos, con 8 cisteínas que forman cuatro enlaces disulfuro. (wikipedia.org)
  • similitud
  • Para las proteínas, este método supone normalmente dos conjuntos de parámetros: una penalización por gap (o hueco) y una matriz de sustitución que asigna puntuaciones o probabilidades al alineamiento de cada posible par de aminoácidos basadas en la similitud de las propiedades químicas de los mismos o en la probabilidad evolutiva de la mutación. (wikipedia.org)
  • mediante
  • La filogenética tradicional usaba datos morfológicos obtenidos mediante la medición y cuantificación de las propiedades fenotípicas de los organismos representativos, mientras que los más recientes campos en filogenética molecular usan secuencias de nucleótidos que codifican genes o secuencias de aminoácidos que forman proteínas como bases de la clasificación. (wikipedia.org)
  • Es posible deducir la secuencia de aminoácidos de una proteína codificada por un gen mediante la secuencia de nucleótidos de este, aunque es un proceso muy costoso. (wikipedia.org)
  • El desarrollo de métodos informáticos que identifiquen la función de un gen mediante su secuencia de ADN ha permitido abaratar y acelerar la determinación de estas funciones. (wikipedia.org)
  • Uno de estos métodos consiste en la determinación de la función mediante una búsqueda de la homología, basada en la comparación de las secuencias del ADN y la proteína de un organismo u organismos diferentes. (wikipedia.org)
  • ​ Los métodos para reducir el espacio de búsqueda efectuando inicialmente alineamientos de pares mediante programación dinámica sobre cada par de secuencias en el conjunto problema, y buscando sólo el espacio solución cerca de estos resultados (encontrando de forma efectiva la intersección entre trayectorias locales en los alrededores inmediatos de cada solución óptima de alineamiento por pares) representan la técnica de programación dinámica más eficiente. (wikipedia.org)
  • usan
  • La mayor parte de los programas de alineamiento múltiple de secuencias usan métodos heurísticos en lugar de optimización global, porque identificar el alineamiento óptimo entre más de unas pocas secuencias de longitud moderada es prohibitivamente costoso computacionalmente. (wikipedia.org)
  • Los métodos de programación dinámica sólo se usan ahora cuando se necesita un alineamiento de muy alta calidad entre un pequeño número de secuencias, así como benchmark estándar en la evaluación de nuevas o mejoradas técnicas heurísticas. (wikipedia.org)
  • compuestos
  • Al igual que en las proteínas, el ADN y el ARN están compuestos por repeticiones de pequeños bloques, pero con la diferencia de que en lugar de aminoácidos, se trata de moléculas más complejas conocidas como nucleótidos. (monografias.com)
  • genes
  • A diferencia de la genómica y la proteómica, la genómica funcional se centra en los aspectos dinámicos de los genes, como su transcripción, la traducción, las interacciones proteína-proteína, en oposición a los aspectos estáticos de la información genómica como la secuencia del ADN o su estructura. (wikipedia.org)
  • estudio
  • La identificación de la raíz normalmente requiere la inclusión en los datos de entrada de al menos un grupo externo (en inglés outgroup) que esté relacionado solamente de forma distante con las secuencias en estudio. (wikipedia.org)
  • generalmente
  • La secuencia reguladora del gen clonado garantiza que se exprese en un momento y situación adecuados, dando lugar al producto conocido, generalmente un pigmento fluorescente. (wikipedia.org)
  • El origen evolutivo de la familia C-1 de las modernas cadherinas en los metazoos ha sido propuesto, gracias a herramientas bioinformáticas que emplean generalmente el algoritmo Neighbor-Joining (NJ) y la secuencia de la primera repetición cadherina EC1 ?un segmento muy pequeño de la longitud completa del dominio extracelular (EC), pero responsable del reconocimiento adhesivo? (uner.edu.ar)
  • Un alineamiento múltiple de secuencias (MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN. (wikipedia.org)
  • evolutiva
  • La reconstrucción filogenética de las 10 secuencias nucleotídicas indica que tienen una relación evolutiva muy cercana, los métodos de alineamiento múltiple previo al análisis de inferencia Bayesiana nos ayudó a obtener el árbol más probable, que nos ayudó a comprender que secuencias tienen parentesco en su función alergénica. (edu.pe)
  • En general, se asume que el conjunto de secuencias de consulta que se ingresa como entrada (conjunto problema) tienen una relación evolutiva por la cual comparten un linaje y descienden de un ancestro común. (wikipedia.org)
  • tienen
  • Actualmente se han identificado profilinas en una gran variedad de alimentos de origen vegetal, reportadas hasta el momento más de 800 secuencias de profilina y sus isoformas de diferentes organismos, de las cuales 73 están reportadas como alérgenos debido a que se tienen experimentos que demuestran la alergenicidad. (edu.pe)
  • Estos métodos, aplicados a una única secuencia, tienen como mucho una precisión del 60-65%, aunque a menudo no predicen correctamente las hojas beta. (wikipedia.org)
  • entrada
  • Un árbol enraizado es un grafo directo que implícitamente identifica un antecesor común más reciente, usualmente una secuencia imputada que no está representada en la entrada. (wikipedia.org)
  • Las medidas de distancia genética pueden ser usadas para trazar un árbol con las secuencias de entrada como nodos hoja y sus ramas con distancia a la raíz proporcionales a su distancia genética desde el hipotético antecesor común. (wikipedia.org)
  • Por el contrario, en los árboles sin raíz se trazan las distancias y relaciones entre las secuencias de entrada sin hacer suposiciones en cuanto a sus antecesores. (wikipedia.org)
  • diferentes
  • Las representaciones visuales del alineamiento ilustran mutaciones tales como mutaciones puntuales (un solo cambio de aminoácidos o nucleótidos) que aparecen como diferentes caracteres en una sola columna del alineamiento, y la inserción o supresión de mutaciones (o indels) que aparecen como huecos en una o varias de las secuencias en la alineación. (wikipedia.org)
  • espacio
  • De esta forma, el espacio de búsqueda se incrementa exponencialmente conforme se incrementa n, dependiendo también fuertemente de la longitud de la secuencia. (wikipedia.org)
  • cabo
  • Del MSA resultante, se puede inferir la homología, y puede llevarse a cabo el análisis filogenético para evaluar los orígenes evolutivos compartidos por las secuencias. (wikipedia.org)
  • Los científicos la seleccionaron por la secuencia de cambios estructurales que lleva a cabo cuando reacciona a la luz (a esto se lo llama fotociclo). (blogspot.com)
  • estructura secundaria
  • La mayoría de los péptidos antibióticos descritos comparten cierto carácter catiónico que favorece su interacción con las membranas celulares, pero difieren en cuanto a la secuencia, estructura secundaria o terciaria, estructura genética y la localización y función dentro del organismo (9). (kolejtercume.com)
  • ​ La gran cantidad de datos biológicos obtenidos mediante las diversas técnicas experimentales han resultado en el desarrollo de métodos computacionales para buscar y analizar secuencias de ADN que dan lugar a configuraciones similares en proteínas y para la predicción de la estructura secundaria y terciaria de estas. (wikipedia.org)
  • La predicción de la estructura secundaria es un conjunto de técnicas bioinformáticas cuyo objetivo es predecir la estructura secundaria local de secuencias de proteínas y ARN basándose sólo en el conocimiento de su estructura primaria de aminoácidos o de nucleótidos, respectivamente. (wikipedia.org)
  • El éxito de una predicción se determina por su comparación con los resultados de aplicar el algoritmo DSSP (método estándar para asignar una estructura secundaria a los aminoácidos de una proteína dadas sus coordenadas atómicas de resolución) a la estructura cristalina de la proteína. (wikipedia.org)
  • La conservación evolutiva de estructuras secundarias puede ser aprovechada mediante la evaluación simultánea de varias secuencias homólogas en un alineamiento múltiple de secuencias, calculando así la propensión de una secuencia de aminoácidos alineada a formar redes de estructura secundaria. (wikipedia.org)
  • El método de Chou-Fasman fue uno de los primeros algoritmos desarrollados para la predicción de la estructura secundaria, y se fundamenta predominantemente sobre parámetros de probabilidad determinados por las frecuencias relativas de las apariciones de cada aminoácido en cada tipo de estructura secundaria. (wikipedia.org)
  • conocidas
  • Puesto que estos alineamientos dependen de información sobre todas las conformaciones tridimensionales de las secuencias problema, el método sólo puede ser usado sobre secuencias donde estas estructuras sean conocidas. (wikipedia.org)
  • Existe una gran superfamilia de receptores para numerosos fármacos destinatarios que interactúan con ciertas proteínas reguladoras heterotriméricas ligadas a GTP conocidas como proteínas G. Los receptores acoplados a la proteína G (GPCR, del inglés: G protein-coupled receptors) comprenden a los de varias aminas biógenas, eicosanoides y otras moléculas que envían señales a lípidos, péptidos hormonales, opiáceos, aminoácidos como GABA y muchos otros péptidos y ligandos proteínicos. (wikipedia.org)
  • cuyas
  • Puesto que las estructuras de las proteínas se componen de aminoácidos cuyas cadenas laterales están enlazadas por un esqueleto de proteínas comunes, se puede utilizar un número de los posibles subconjuntos diferentes de átomos que conforman una macromolécula de proteína para producir un alineamiento estructural y calcular los correspondientes valores RMSD. (wikipedia.org)
  • Al administrar la proteína Cas9 y los ARN guía apropiados a una célula, el genoma de esta puede cortarse en los lugares deseados, cuyas secuencias serán complementarias a las de los ARN guía utilizados. (wikipedia.org)
  • cadenas
  • Por ejemplo, una secuencia predicha como probable hélice puede ser capaz todavía de adoptar una conformación de hebra beta si está localizada dentro de una región hoja beta de la proteína y sus cadenas laterales encajan bien con sus vecinas. (wikipedia.org)
  • formar
  • ​ Nuevamente fue el grupo de Francisco J. Mojica quien primero se dio cuenta que las secuencias CRISPR y los espaciadores asociados podían formar parte de algún sistema inmune propio de estos microorganismos procarióticos, quien primero estableció la relación entre CRISPR e inmunidad. (wikipedia.org)
  • actividad
  • No. 2 ó 16, y presenta (a) actividad de estimulación de la secreción de insulina a partir de las células del páncreas mediante la activación a elevada concentración de glucosa y/o (b) actividad de incremento de la cantidad de AMPc en las células mediante activación, un polipéptido que contiene una secuencia aminoacídica en la que. (patentados.com)
  • papel
  • Estudios iniciales por Francisco J. M. Mojica y colaboradores postularon el posible papel de estas secuencias en la partición de replicones. (wikipedia.org)
  • posee
  • Posee dos dominios principales: El primer dominio es necesario para la dimerización con otras proteínas y con el ADN.Se conforma por un motivo de dimerización, denominado hélice-vuelta-hélice cremallera de leucina (HLH/LZ por su siglas en inglés), en el residuo C-terminal que consta de 90 aminoácidos. (wikipedia.org)
  • codifican
  • Estas proteínas y las secuencias de ácidos nucleicos que las codifican son útiles en la preparación de formulaciones plaguicidas y en la producción de plantas transgénicas resistentes a las plagas. (patentados.com)
  • grupo
  • El uso de un polipéptido seleccionado del grupo constituido por un polipéptido consistente en la secuencia aminoacídica de ID. (patentados.com)
  • veces
  • En biología molecular y genética, un factor de transcripción (a veces llamado factor de unión a una secuencia específica de ADN) es una proteína que une secuencias específicas de ADN, controlando así la transcripción de la información genética de ADN a ARN mensajero. (wikipedia.org)
  • sistemas
  • Los espaciadores de los CRISPR reconocen secuencias específicas y guían a las nucleasas cas para cortar y degradar esos elementos génicos exógenos de una manera análoga al ARNi en sistemas eucarióticos. (wikipedia.org)