La enzima FokI es una endonucleasa de restricción (EC 3.1.21.4)[1] de tipo IIS de bacterias que se encuentra naturalmente en Flavobacterium okeanokoites y consiste en un dominio de unión al
ADN en el extremo N-terminal de la enzima y un dominio de corte no específico en el extremo C-terminal.[2] Una vez que la proteína se une a
ADN dúplex a través de su dominio de unión en el sitio de reconocimiento 5-GGATG-3 : 5-CATCC-3, el dominio de corte de
ADN se activa y corta de forma no específica entre nueve y trece nucleótidos hacia abajo del sitio de reconocimiento.[3] El peso molecular de esta enzima es de 65,4 kDa y se compone de 587
aminoácidos. El dominio de reconocimiento contiene tres subdominios (D1, D2 y D3), que están relacionados evolutivamente con el dominio de unión al
ADN de la proteína activadora de catabolito que contiene un motivo de hélice-giro-hélice.[3] La escisión del
ADN es mediada a través de dominios de corte no específicos, que incluye también ...