MLST14
- La tipificación multilocus de secuencias (en inglés Multilocus sequence typing, MLST) es una técnica genética para la caracterización taxonómica de bacterias y microorganismos. (wikipedia.org)
- Cada muestra se caracteriza por las secuencias únicas de alelos en cada uno de los siete loci, lo cual constituye su perfil alélico o tipo de secuencia (en inglés sequence type, ST). El primer esquema MLST fue desarrollado para la bacteria Neisseria meningitidis, el agente causal de la meningitis meningocócica y de la septicemia. (wikipedia.org)
- 1] La MLST mide directamente los cambios en la secuencia de una serie de genes de mantenimiento y caracteriza cepas mediante sus perfiles alélicos únicos. (wikipedia.org)
- El principio de la MLST es sencillo: la técnica consiste en amplificación mediante PCR seguida de la secuenciación del ADN. (wikipedia.org)
- El flujo de trabajo de la MLST implica: recolección de los datos, análisis de los datos y análisis multilocus de las secuencias. (wikipedia.org)
- Por ejemplo, en el caso de Staphylococcus aureus se emplean siete genes de mantenimiento en la tipificación MLST. (wikipedia.org)
- La acumulación de cambios en los nucleótidos de los genes de mantenimiento es un proceso relativamente lento y los perfiles alélicos de las muestras bacterianas es lo suficientemente estable para resultar ideal para la epidemiología global, sin menoscabo de la gran capacidad de discriminación que la MLST proporciona. (wikipedia.org)
- se han asociado con diarrea y la técnica de tipado mediante análisis de secuencias de múltiples locus (MLST) se ha empleado para la tipificación genética. (seq.es)
- Después de comparar las secuencias obtenidas con la base de datos MLST para Campylobacter, se asignaron el número de los alelos, los secuenciotipos (STs) y los complejos clonales (CCs). (seq.es)
- Sin embargo, los recientes avances en la tipificación de secuencias multilocus (MLST) han permitido clasificar las cepas de S. suis según su tipo de secuencia, detectando hasta 616 tipos de secuencia, de los cuales el 61 % pertenecen a serotipos específicos. (unileon.es)
- Los datos genómicos de estas muestras pueden ser analizar de diferentes maneras: Análisis DNA ribosómico, Tipificación multilocus de secuencias (MLST) y análisis de genes específicos. (helixbios.com)
- El objetivo fue estimar la frecuencia de contaminación, diversidad de serotipos y tipificación por multilocus (MLST) de Salmonella enterica (SE) en linfonodos y carne molida de bovino. (scielo.org.mx)
- This study aimed to determine the frequency of contamination, serovar diversity, and multilocus sequence typing (MLST) of Salmonella enterica (SE) in lymph nodes and ground beef. (scielo.org.mx)
- Análisis de secuencias multilocus (mlst) de Brachyspira spp. (unileon.es)
Tipos de secuencia3
- En el análisis de los datos todas las secuencias únicas reciben números de alelo y son combinadas en perfiles alélicos y asignadas a tipos de secuencia (ST). Si aparecen alelos y ST nuevos, son almacenados en las bases de datos tras su verificación. (wikipedia.org)
- En investigación se realizan estudios epidemiológicos y filogenéticos mediante la comparación de los tipos de secuencia (ST) de distintos complejos clonales. (wikipedia.org)
- Se identificaron 24 tipos de secuencia, siendo el serotipo 4b ST1 (24,3%) el más frecuente, seguido del 1/2b ST87 (18,9%), que causó dos brotes largos en 2013-2014. (mastersenfermeria.org)
Cepas5
- En los laboratorios se suelen usar de siete a ocho genes de mantenimiento para alcanzar un equilibrio entre una capacidad aceptable de identificación, y el coste y la duración de la tipificación de las cepas. (wikipedia.org)
- Una serie de perfiles puede entonces pasar a constituir el indicador de identificación para la tipificación de cepas. (wikipedia.org)
- Por otro lado, en cuanto a la alta variabilidad entre las cepas de S. suis, los diferentes tipos de secuencias y serotipos son las principales dificultades para desarrollar una formulación vacunal eficaz que pueda proporcionar una protección amplia y duradera. (unileon.es)
- Se dio acceso público a una base de datos de códigos de barras , o perfiles genómicos, y detalles de identificación asociados, lo que permitió a los laboratorios de todo el mundo identificar cepas de Yersinia utilizando sus propias secuencias genómicas. (adiveter.com)
- Por tanto, es necesario establecer medidas encaminadas a prevenir la diseminación, a lo largo de la cadena productiva, de las cepas asociadas con animales aparentemente sanos. (scielo.org.mx)
Serotipos1
- El serotipo más prevalente a nivel mundial es el serotipo 2, mientras que en Europa los serotipos 2 y 9 son los más prevalentes y tienden a ser los más virulentos. (unileon.es)
Obtenidas1
- Se utilizan fragmentos internos de cada gen de entre 450 y 500 pares de bases, cuyas secuencias son obtenidas con exactitud mediante el uso de secuenciadores automáticos de ADN. (wikipedia.org)
Genes3
- En cualquier caso, no es raro que se usen hasta diez genes de mantenimiento. (wikipedia.org)
- Para cada uno de estos genes de mantenimiento se asignan como alelos las diferentes secuencias y los alelos en los loci constituyen un perfil alélico. (wikipedia.org)
- Cuando escaneamos la secuencia de numerosos genes en el genoma de Yersinia para cada cepa, nos dimos cuenta de que cada bacteria tiene su propio perfil genético único. (adiveter.com)
Perfiles1
- El almacenamiento o acceso técnico es necesario para crear perfiles de usuario para enviar publicidad, o para rastrear al usuario en una web o en varias web con fines de marketing similares. (helixbios.com)
Datos1
- En cumplimiento de la Ley Orgánica 15/1999, de 13 de diciembre, de Protección de Datos de Carácter Personal, le informamos que los datos personales que nos facilite serán incorporados a los ficheros del COLEGIO DE MÉDICOS DE GIPUZKOA cuya única función es el cumplimiento de los fines del Colegio descritos en la legislación nacional y autonómica de colegios profesionales y especialmente en los estatutos de la corporación. (mastersenfermeria.org)
Fragmentos4
- Se utilizan fragmentos internos de cada gen de entre 450 y 500 pares de bases, cuyas secuencias son obtenidas con exactitud mediante el uso de secuenciadores automáticos de ADN. (wikipedia.org)
- En la primera parte, la identificación definitiva de las variaciones es obtenida mediante la determinación de las secuencias de nucleótidos de los fragmentos génicos. (wikipedia.org)
- Secuenciación directa de nucleótidos de fragmentos de genes procedentes de múltiples genes de limpieza, para efectuar análisis filogenéticos, identificación de organismos y tipificación de especies, colonias, serovar u otro nivel de diferenciación filogenética. (bvsalud.org)
- Secuencia directa de nucleótidos de fragmentos de genes de múltiples genes de limpieza con el fin de un análisis filogenético, identificación del organismo, y tipificación de las especies, cepa, serotipo, o de otro nivel filogenético distinguible. (bvsalud.org)