Grupo de protobacterias comprendidas por bacterias gramnegativas fermentadoras y facultativamente anaerobias.
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Agua salinizada de OCÉANOS Y MARES que proporciona el hábitat a los organismos marinos.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
Una familia en el orden Chromatiales, clase GAMMAPROTEOBACTERIA. Estas son bacterias haloalcalifílicas, fototróficas que depositan azufre elemental fuera de sus células.
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Crecimiento de microorganismos que utilizan PROCESOS AUTÓTROFOS para obtener nutrientes y procesos quimiótrofos para obtener su aporte principal de energía. Los procesos quimiótrofos intervienen en la obtención del aporte principal de energía de fuentes químicas exógenas. Los autótrofos quimiótrofos (quimioautótrofos) generalmente usan compuestos inorgánicos como fuentes de energía y, por tanto, se denominan quimiolitoautótrofos. La mayoría de los quimioautótrofos viven en medios hostiles, como las fumarolas marinas profundas. Son sobre todo BACTERIAS y ARCHAEA, y son los principales productores de estos ecosistemas.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Clase del filum PROTEOBACTERIA formado generalmente por dos fenotipos principales: bacterias púrpuras no sulfúricas y bacterias que contienen bacterioclorofilo aeróbico.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
No puedo proporcionar una definición médica de 'Mar Mediterráneo' ya que no es un término relacionado con la medicina, la salud o las ciencias de la vida. El Mar Mediterráneo es un mar interior en el sistema de mares interconectados de la Tierra, geográficamente localizado entre Europa, Asia y África.
Clase del filum PROTEOBACTERIA, compuesta por quimioheterótrofos y quimioautótrofos, que toman sus nutrientes de la descomposición de materia orgánica.
El Mar del Norte es un mar epicontinental marginal del océano Atlántico Northern, ubicado al norte de Europa, que se extiende desde Escocia hasta Noruega y Alemania.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.
Cantidades relativas de PURINAS y PIRIMIDINAS en un ácido nucleico.
Una bacterioclorofila II específica que es similar en estructura a la clorofilaII a.
Mar interior entre Europa y Asia. Está conectado con el Mar Egeo por el Bósforo, el Mar de Mármara y los Dardanelos.
Enzima que cataliza la conversión del aminoimidazol-4-carboxamida ribonucleótido a 5-formil-aminoimidazol-4-carboxamida ribonucleótido en la vía de la síntesis de novo de las purinas. Requiera el cofactor N(10)-FORMILTETRAHIDROFOLATO como donante de formilo.
Familia de PROTOBACTERIA marinas grmanegativas, que incluye el género ALTEROMONAS, Colwellia, Idiomarina, Marinobacter, MORITELLA, PSEUDOALTEROMONAS y SHEWANELLA.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Procesos en los que los organismos utilizan sustancias orgánicas como fuente de nutrientes. Se diferencian de los PROCESOS AUTÓTROFOS, que recurren a sustancias inorgánicas simples como fuente de aporte de nutrientes. Los heterótrofos pueden ser quimioheterótrofos (o quimioorganótrofos), que también necesitan compuestos orgánicos como la glucosa para satisfacer sus necesidades energéticas metabólicas principales, o fotoheterótrofos (o fotoorganótrofos), que satisfacen sus necesidades energéticas principales gracias a la luz. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden pasar de un modo nutricional a otro diferente (AUTOTROFIA, heterotrofia, quimiotrofia o FOTOTROFIA) para utilizar distintas fuentes con el fin de satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.
El espectro de los organismos vivos que habitan una determinada región determinada, hábitat o biotipo.
Aguas termales en el fondo del océano. Generalmente, se encuentran cerca de lugares de actividad volcánica tales como arrecifes oceánicos.
Organismos que viven en el agua.
Una familia de bacterias gramnegativas, en el orden Xanthomonadales, patogénico para plantas.
Género de bacteria gramnegativa en forma de bastoncillos o pleomórfica que son halotolerantes. Los miembros de este género son capaces de crecer a concentraciones de cloruro de sodio de hasta 20 por ciento o más.
Familia de bacterias fototróficas púrpuras sulfúricas, que depositan globulos de azúfre elemental dentro de sus células. Se encuentran en diversos medios acuáticos.
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Un filo de bacteria compuesto de tres clases: Bacteroides, Flavobacteria, y Sphingobacteria.
Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.
Acidos orgánicos, monobásicos, derivados de hidrocarburos por el equivalente de oxidación de un grupo metilo a un alcohol, a aldehído y luego a ácido. Los ácidos grasos son saturados y no saturados (ACIDOS GRASOS NO SATURADOS).
Relación entre dos especies diferentes de organismos que son interdependientes; cada uno gana beneficios del otro o una relación entre las diferentes especies donde tanto de los organismos en cuestión se benefician de la presencia del otro.
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
No puedo proporcionar una definición médica de 'Océano Pacífico' ya que este término se refiere a un cuerpo de agua geográfico y no tiene relación con la medicina.
Una familia de bacterias gramnegativas en el orden Oceanospirillales.
Procedimientos para identificar tipos y cepas de bacterias. Los sistemas de tipificación más frecuentemente empleados son los de TIPIFICACION DE BACTERIOFAGOS y la SEROTIPIFICACION, así como la tipificación de bacteriocina y la biotipificación.
Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Género de bacterias baciliformes, incoloras y filamentosas de la familia THIOTRICHACEAE, que contienen glóbulos de azufre. Se encuentran especies Thiothrix como componentes de BIOPELÍCULAS en sistemas de irrigación y plantas de tratamiento de aguas, así como en medios marinos como endosimbiontes.
Genoma colectivo representante de muchos organismos, principalmente microorganismos, que existe en una comunidad.
Un grupo de diferentes especies de microorganismos que actúan juntos como una comunidad.
Un elemento miembro de la familia de los calcógenos. Tiene por símbolo atómico S, número atómico 16 y peso atómico [32.059; 32.076]. Se encuentra en los aminoácidos cisteína y metionina.
Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Una gran extensión de cuerpos continuos de agua salada que en conjunto cubren más del 70 por ciento de la superficie de la Tierra. El mar puede estar parcial o totalmente rodeado por la tierra, y son más pequeños que los cinco océanos (Atlántico, Pacífico, Índico, Ártico y Antártico).
Gran orden de insectos caracterizados por tener parte de la boca adaptada para perforar o chupar. Está constituido por cuatro subórdenes: HETEROPTERA, Auchenorrhyncha, Sternorrhyncha, y Coleorrhyncha.
Anillos de hidrocarburo que contienen dos partes de cetona en cualquier posición. Pueden ser sustituídos en cualquier posición excepto en los grupos cetona.
Reacciones vitales o metabólicas que ocurren en un ambiente que contiene oxígeno.
Hidrocarburos líquidos complejos naturales que, después de la destilación, producen combustibles, derivados petroquímicos y lubricantes.
No puedo proporcionar una definición médica del 'Océano Atlántico' porque no es un término relacionado con la medicina, sino con la geografía.
Procesos por los que los organismos fotótrofos utilizan la luz solar como fuente principal de energía. Contrasta con los procesos quimiótrofos que no dependen de la luz y obtienen la energía de fuentes químicas exógenas. La fotoautotrofia (o fotolitotrofia) es la capacidad de utilizar la luz solar como energía para fijar los nutrientes inorgánicos para ser usados por otros requerimientos orgánicos. Los fotoautótrofos incluyen todas las PLANTAS VERDES; ALGAS VERDES; CIANOBACTERIA, las BACTERIAS PÚRPURA SULFUROSAS y verdes. Los fotoheterótrofos o fotoorganótrofos requieren un aporte de nutrientes orgánicos para sus necesidades orgánicas, pero usan luz como su fuente de energía primaria; ejemplos incluyen ciertas RHODOSPIRILLACEAE. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden cambiar entre diferentes modos de nutrición (AUTOTROFIA; HETEROTROFIA; quimiotrófia, o fototrofía) para utilizar diferentes fuentes para satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.
Grupo de proteobacterias constituidas por quimiorganotrofos generalmente asociados con el SISTEMA DIGESTIVO de humanos y animales.
Propiedades y procesos fisiológicos de BACTERIA.
Familia de bacterias gramnegativas cuyos miembros predominan en la flora bacteriana del PLANCTON, PECES y AGUA DE MAR. Algunos miembros son importantes patógenos para humanos y animales.
La zona física inmediata alrededor de las raíces de las plantas incluidas las raíces de las plantas. Es un área de intensa y compleja actividad biológica que involucra a las plantas, microorganismos, otros organismos del suelo, y al suelo.
Agua que contiene cantidades no significativas de sales, como el agua de RÍOS y LAGOS.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
La aplicación de SANGUIJUELAS en el cuerpo para extraer la sangre con fines terapéuticos. Tal aplicación de sanguijuelas medicinales es una práctica muy antigua y todavía utilizada en microcirugía y en el tratamiento de la congestión u obstrucción venosa.
Sal de sodio de distribución universal que se utiliza comúnmente para sazonar los alimentos.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Género de bacilos gramnegativos, facultativamente anaerobios. Es un saprofito, organismo marino que a menudo se aisla de los pescados en estado de descomposición.
Grandes flujos naturales de AGUA DULCE formado por tributarios convergentes y que desembocan en un cuerpo de agua (lago u océano).
Dispositivos para la provisión de energía eléctrica que convierten la energía biológica, tales como la energía química del metabolismo o la energía mecánica de los movimientos periódicos, en energía eléctrica.
Suborden en HEMÍPTEROS caracterizados por poseer dos pares de alas, uno de ellos córneo y el otro membranoso. Incluye las familias de importancia médica CIMICIDAE y REDUVIIDAE. (Dorland, 28a ed)
Grupo de PROTEOBACTERIA representadas por sulfidógenos anaerobios, morfológicamente variados. Algunos miembros de este grupo se consideran depredadores bacterianos, con propiedades bacteriolíticas.
Un sistema funcional el cual incluye los organismos de una comunidad natural junto a su ambiente. (MeSH/NLM) Unidad ecológica básica, formada por el ambiente viviente (biotopo) y de organismos animales y vegetables que interactúan como un ente funcional único (Material II - IDNDR, 1992)
Hábitat de aguas termales naturalmente calentadas por procesos geológicos subyacentes. La superficie de los manantiales calientes ha sido usada para la BALNEOLOGIA. Las de aguas termales submarinas se les llama RESPIRADEROS HIDROTÉRMICOS.
Clase del filo CNIDARIOS, compuesto principalmente de corales y anémonas. Todos los miembros se encuentran sólo como pólipos; el estadio de medusa está completamente ausente.
Género de bacterias gramnegativas de forma bacilar de la familia ALTEROMONADACEAE. Otros géneros de esta familia se caracterizan por la incapacidad de utilizar los hidratos de carbono.
El análisis genómico de conjuntos de organismos.
El océano Artico y las islas dentro de él y adyacentes a él. Incluye Point Barrow, Alaska, la mayor parte del Franklin District en Canadá, dos terceras partes de Groenlandia, Svalbard, Franz Josef Land, Lapland, Novaya Zemlya y Siberia del Norte.
Filum de esponjas, que son animales multicelulares sésiles, con alimentación en suspensión, que utilizan células flageladas llamadas coanocitos para propalar agua. La mayoria son hermafroditas. Probablemente existió una rama evolutiva que no dió lugar a ningún otro tipo de animal. Excepto para las aproximadamente 150 especies de agua dulce, las esponjas son animales marinos. Son una fuente de ALCALOIDES, ESTEROLES y otras moléculas complejas útiles en medicina e investigación biológica.
Una mutación denominada nombrada con la mezcla de la inserción y de la eliminación. Esta referida a una diferencia de la longitud entre dos ALELOS donde se desconoce si la diferencia fue causada originalmente por una INSERCIÓN DE LA SECUENCIA o por una ELIMINACION DE SECUENCIA. Si el número de nucleotidos en la inserción/eliminación no es divisible por tres, y ocurre en una región de la codificación de la proteína, es también una MUTACIÓN DEL SISTEMA DE LECTURA.
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Antiguo reino, situado en la península de Corea entre el Mar de Japón y el Mar Amarillo en la costa este de Asia. En 1948, cayó la monarquía y dos países independientes se formaron, separados por el paralelo 38.
Organismos diminutos que flotan libremente en el agua y que son fotosintéticos. El término no es taxonómico y se refiere a una forma de vida (utilización de la energía y motilidad) mas que a un determinado tipo de organismo. La mayoría, pero no todos, son algas unicelulares. Grupos importantes incluyen DIATOMEAS, DINOFLAGELADOS, CIANOBACTERIAS, CHLOROPHYTA, HAPTOPHYTA, CRIPTÓFITAS y silicoflagelados.
Un elemento no metálico cuyo símbolo atómico es C, número atómico 6, y peso atómico [12.0096; 12.0116]. Puede existir en forma de diferentes alótropos tales como el DIAMANTE; CARBÓN ORGÁNICO; y GRAFITO; y como HOLLÍN de combustible quemado de forma incompleta.
El hidrocarburo saturado más simple. Es un gas inflamable, incoloro, ligeramente soluble en agua. Es uno de los principales constituyentes del gas natural y se forma en la descomposición de materia orgánica.
Sustancias que contaminan el suelo. Se emplea para contaminantes del suelo en general o para aquellos que no tienen un título específico.
Esteres y sales orgánicas o inorgánicas del ácido nítrico. Estos compuestos contienen el radical NO3-.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Transmisión de información genética entre organismos, emparentados o sin parentesco, burlando la transmisión de padres a hijos, que se da de forma natural. Puede darse mediante procesos naturales como la CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA y la TRANSFECCIÓN. Puede dar lugar a un cambio de la composición genética del organismo recipiente (TRANSFORMACIÓN GENÉTICA).
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Generalmente se refiere a las estructuras digestivas que se extienden desde la BOCA al ANO, pero no incluyen los órganos gandulares accesorios (HIGADO, TRACTO BILIAR, PANCREAS).
Una técnica para identificación de individuos de una especie basada en la singularidad de sus secuencias de ADN. La singularidad se determina identificándose cual combinación de variaciones alélicas ocurren en el individuo en un número estadísticamente relevante de sitios (o lugares) diferentes. En estudios forenses, POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCIÓN de LUGARES DE NVRT o lugares de REPETICIONES DE SATÉLITE múltiples y altamente polimórficos son analisados. El número de lugares usados para el perfil depende de la FRECUENCIA ALELICA en la población.
Tipo de HIBRIDACION IN SITU en que las secuencias dianas se tiñen con colorante fluorescente de manera que se pueda determinar su localización y tamaño mediante el empleo de microscopía fluorescente. Esta coloración es lo suficientemente distintiva como para que la señal de hibridización pueda ser vista tanto en las difusiones de la metafase como en los núcleos de la interfase.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Líquido rechazado o desechos arrastrados por las alcantarillas.
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
El mineral no consolidada o materia orgánica en la superficie de la tierra que sirve como un medio natural para el crecimiento de las plantas terrestres.
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Movimiento o capacidad de moverse de un lugar a otro. Se puede referir a humanos, animales vertebrados o invertebrados y microorganismos.
Microscopia electrónica en la cual los ELECTRONES o sus productos reactivos que se transmite a través de la muestra aparecen bajo el plano de la muestra.
Ausencia total, o (aproximadamente) la escasez, de oxígeno elemental disuelto o gaseoso en un lugar o ambiente determinado.
Un elemento que tiene por símbolo atómico N, número atómico 7 y peso atómico [14.00643; 14.00728]. El nitrógeno existe como un gas diatómico y conforma aproximadamente el 78 por ciento del volumen de la atmósfera terrestre. Es un constituyente de las proteínas y los ácidos nucleicos y se encuentra en todas las células vivientes.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Eliminación de CONTAMINANTES AMBIENTALES; PESTICIDAS y otros residuos usando organismos vivos, usualmente involucrando intervención de ingenieros ambientales o sanitarios.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Diferencias genotípicas observadas entre los individuos de una población.