Factores de Transcripción Forkhead
Subclase de proteínas winged helix de unión al ADN, homólogas de su predecesor, la proteína "fork head" de Drosophila.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Transcripción Genética
Proteínas de Unión al ADN
Regiones Promotoras Genéticas
Regulación de la Expresión Génica
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Factor Nuclear 3-beta del Hepatocito
Secuencia de Bases
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Blefarofimosis
Proteínas Proto-Oncogénicas c-akt
Proteína serina-treonina cinasa que se activa por FOSFORILACIÓN en respuesta a FACTORES DE CRECIMIENTO o a la INSULINA. Desempeña un papel importante en el metabolismo, el crecimiento y la supervivencia de las células como componente fundamental de la TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES. En las células de los mamíferos se han descrito tres isoformas.
Unión Proteica
Proteínas Nucleares
Activación Transcripcional
Procesos que estimulan la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de un gen o conjunto de genes.
Línea Celular
Fosforilación
Sitios de Unión
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Proteínas Proto-Oncogénicas
Secuencia de Aminoácidos
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Factor de Transcripción Sp1
Proteínas Serina-Treonina Quinasas
Grupo de enzimas que catalizan la fosforilación de residuos de serina o treonina en las proteínas, con ATP u otros nucleótidos como donadores de fosfato.
Mutación
Genes Reporteros
Genes cuya expresión es fácilmente detectable y portanto se emplean para estudiar la actividad promotora en muhcas posiciones en un genoma diana. En la tecnología del ADN recombinante, estos genes pueden unirse a una región promotora de interés.
Hidroxitestosteronas
Células Cultivadas
Proteínas de Homeodominio
Proteínas que se codifican por los genes "homeobox" (GENES, HOMEOBOX) que muestran similitud estructural con ciertas proteínas unidas al ADN de procariotes y eucariotes. Las proteínas del homeodominio participan en el control de la expresión genética durante la morfogénesis y el desarrollo (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN DEL GEN, DESARROLLO).
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Fosfatidilinositol 3-Quinasas
Fosfotransferasas que catalizan la conversión de 1 fosfatidilinositol a 1-fosfatidilinositol 3-fosfato. Muchos miembros de esta clase de enzimas están involucradas en TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL y regulación del transporte vesicular con la célula. Fosfatidilinositol 3-Quinasas han sido clasificadas tanto de acuerdo con su especificidad de sustrato y su modo de acción dentro de la célula.
Ciclo Celular
Compleja serie de fenómenos que se producen entre el final de una DIVISIÓN CELULAR y el final de la siguiente y por la que el material celular se duplica y se divide en dos células hijas. El ciclo celular consta de la INTERFASE, que incluye la FASE G0, FASE G1, FASE S, FASE G2 y la fase de DIVISIÓN CELULAR.
Diferenciación Celular
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Ciclina G2
Una subtipo inusual de ciclina que se encuentra altamente expresada en las células diferenciadas. A diferencia de las ciclinas convencionales de expresión aumentada de ciclina G2 se cree causa de una retirada de células del CICLO CELULAR.
Apoptosis
Uno de los mecanismos mediante los que tiene lugar la MUERTE CELULAR (distinguir de NECROSIS y AUTOFAGOCITOSIS). La apoptosis es el mecanismo responsable de la eliminación fisiológica de las células y parece estar intrínsicamente programada. Se caracteriza por cambios morfológicos evidentes en el núcleo y el citoplasma, fraccionamiento de la cromatina en sitios regularmente espaciados y fraccionamiento endonucleolítico del ADN genómico (FRAGMENTACION DE ADN) en sitios entre los nucleosomas. Esta forma de muerte celular sirve como equilibrio de la mitosis para regular el tamaño de los tejidos animales y mediar en los procesos patológicos asociados al crecimiento tumoral.
Ratones Noqueados
Clase de ratones en los que ciertos GENES de sus GENOMAS han sido alterados o "noqueados". Para producir noqueados, utilizando la tecnología del ADN RECOMBINANTE, se altera la secuencia normal de ADN del gen estudiado, para prevenir la sintesis de un producto génico normal. Las células en las que esta alteración del ADN tiene éxito se inyectan en el EMBRIÓN del ratón, produciendo ratones quiméricos. Estos ratones se aparean para producir una cepa en la que todas las células del ratón contienen el gen alterado. Los ratones noqueados se utilizan como MODELOS DE ANIMAL EXPERIMENTAL para enfermedades (MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD)y para clarificar las funciones de los genes.
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Factores de Transcripción con Motivo Hélice-Asa-Hélice Básico
Familia de factores de transcripción de unión al ADN que contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE de carácter básico.
Proteínas de Caenorhabditis elegans
Proteínas de las especies de nematodos CAENORHABDITIS ELEGANS. Las proteínas de estas especies han despertado interés científico en el campo de la MORFOGÉNESIS de los organismos multicelulares.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Transporte Activo de Núcleo Celular
Proteínas de Ciclo Celular
Proteínas que controlan el CICLO DE DIVISIÓN CELULAR. Esta familia de proteínas incluye una gran variedad de clases, entre las que se encuentran las CINASAS DEPENDIENTES DE LA CICLINA, cinasas activadas por mitógenos, CICLINAS y FOSFOPROTEÍNA FOSFATASAS, así como sus presuntos sustratos, como las proteínas asociadas a la cromatina, las PROTEÍNAS DEL CITOESQUELETO y los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Regulación hacia Abajo
Proceso que disminuye las interacciones ligando/receptor debido a una reducción en el número de receptores disponibles. Esto puede ser resultado de la introversión del complejo ligando/receptor o de una expresión reducida del receptor. Clásicamente el concepto se refiere a los receptores de hormonas, pero el uso contemporáneo incluye otros receptores de la superficie celular.
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Western Blotting
Factor de Transcripción AP-1
Factor multiproteico compuesto por los productos de los proto-oncogenes c-jun y c-fos. Estas proteínas deben formar dímeros para unirse al sitio de reconocimiento AP-1, conocido también como el elemento de respuesta TPA (TRE). El AP-1 controla tanto la transcripción basal como la inducible de varios genes.
Células HeLa
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Ratones Transgénicos
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Sirtuinas
Familia homóloga de enzimas reguladoras que están estructuralmente relacionados con la proteína de tipo apareamiento en silencio reguladora de la información 2 (Sir2) encontrado en Saccharomyces cerevisiae. Las sirtuinas contienen una región núcleo catalítico central que une NAD. Varias de las sirtuinas utilizan NAD para desacetilar proteínas como las HISTONAS y se clasifican como HISTONA DESACETILASAS DEL GRUPO III. Varios de los otros miembros de las sirtuinas utilizan NAD para transferir ADP-RIBOSA a proteínas y se categorizan MONO ADP-RIBOSAS TRANSFERASAS, mientras que un tercer grupo de las sirtuinas parece tener actividades tanto desacetilasa y ADP ribosa transferasa.
Sirtuina 1
Un miembro de la familia sirtuina que se encuentra principalmente en el NÚCLEO CELULAR. Se trata de un deacetilasa dependiente de NAD con especificidad hacia las HISTONAS y una variedad de proteínas implicadas en la regulación génica.
Inhibidor p27 de las Quinasas Dependientes de la Ciclina
Inhibidor de quinasas dependientes de la ciclina que coordina la activación de la CICLINA y de las QUINASAS CICLINA-DEPENDIENTES durante el CICLO CELULAR. Interactúa con la CICLINA D activa acomplejada con la QUINASA 4 DEPENDIENTE DE LA CICLINA en las células en proliferación, mientras que en las células no proliferantes se une e inhibe la CICLINA E acomplejada con la QUINASA 2 DEPENDIENTE DE LA CICLINA.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Hibridación in Situ
Proteínas 14-3-3
Amplia familia de proteínas adaptadoras de transducción de señales presentes en una amplia variedad de eucariotas. Son proteínas de unión a FOSFOSERINA y FOSFOTREONINA implicadas en importantes procesos celulares, incluyendo TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL; control de CICLO CELULAR; APOPTOSIS, y respuestas al estrés celular. Las proteínas 14-3-3 funcionan mediante la interacción con otras proteínas de transducción de señales y efectúan cambios en su actividad enzimática y localización subcelular. El nombre 14-3-3 deriva de designaciones numéricas utilizadas en los patrones de fraccionamiento de las proteínas patrones.
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Regulación hacia Arriba
Efecto regulatorio positivo sobre procesos fisiológicos a nivel molecular, celular o sistémico. A nivel molecular, los lugares de regulación principales incluyen los receptores de membrana, genes (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA)ARNm (ARN MENSAJERO)y proteinas.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Caenorhabditis elegans
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Fenotipo
Proliferación de la Célula
Todos los procesos involucrados en el aumento del RECUENTO DE CELULAS. Estos procesos incluyen más que DIVISION CELULAR la cual es parte del CICLO CELULAR.
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Estrés Oxidativo
Alteración del equilibrio prooxidante-antioxidante en favor del primero, que conduce a daños potenciales. Los indicadores de estrés oxidativo incluyen bases de ADN dañadas, productos de oxidación de las proteínas, y de peroxidación de lípidos.
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Ratones Consanguíneos C57BL
Factores de Transcripción con Cremalleras de Leucina de Carácter Básico
Gran superfamilia de factores de transcripción que contienen una región rica en residuos de AMINOÁCIDOS BÁSICOS seguida por un dominio CREMALLERA DE LEUCINAS.
Factor de Transcripción AP-2
Familia de proteínas de unión al ADN que regulan la expresión de diversos GENES durante la DIFERENCIACIÓN CELULAR y la APOPTOSIS. Los miembros de esta familia contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE básico carboxiterminal altamente conservado, involucrado en la dimerización y la secuencia específica de unión del ADN.
Insulina
Hormona protéica segregada por las células beta del páncreas. La insulina desempeña un papel fundamental en la regulación del metabolismo de la glucosa, generalmente promoviendo la utilización celular de la glucosa. También es un regulador importante del metabolismo protéico y lipídico. La insulina se emplea para controlar la diabetes mellitus dependiente de insulina.
Células Tumorales Cultivadas
Supervivencia Celular
Factores de Transcripción de Tipo Kruppel
Familia de factores de transcripción dedos de zinc que son homólogos de la proteína Kruppel de Drosophila. Entre los MOTIVOS DEDOS DE ZINC contienen una secuencia espaciadora de siete aminoácidos muy conservada.
Proteínas del Tejido Nervioso
Las proteínas del tejido nervioso se refieren a las diversas proteínas específicas que desempeñan funciones cruciales en la estructura, función y regulación de las neuronas y la glía dentro del sistema nervioso central y periférico.
Regulación Neoplásica de la Expresión Génica
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Factores de Transcripción TFII
Los llamados factores generales de transcripción que se unen a la ARN POLIMERASA II y que son necesarios para iniciar la transcripción. Ellos incluyen a TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFII-I, y TFIIJ. Aparentemente, in vivo se unen en un proceso de pasos múltiples y ordenados y/o pueden formar un gran complejo de preiniciación llamado holoenzima ARN polimerasa II.
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Células 3T3 NIH
Una línea celular continua de alta inhibición de contacto establecida a partir de cultivos de embriones de ratón Swiss NIH. Las células son útiles para los estudios de transfección y transformación de ADN.
Proteínas Supresoras de Tumor
Elementos de Respuesta
Secuencias de nucleótidos, generalmente al inicio de la cadena, que son reconocidas por factores de transcripción reguladores específicos, provocando la respuesta del gen a los distintos agentes reguladores. Estos elementos pueden encontrarse tanto en regiones promotoras como intensificadoras.
Mesodermo
Factor de Transcripción YY1
Células Madre
Factor de Transcripción STAT3
Factor de Transcripción GATA4
Factor de transcripción GATA que se expresa en el MIOCARDIO del corazón en desarrollo y que se ha relacionado con el proceso de diferenciación de los MIOCITOS CARDÍACOS. El factor GATA4 se activa mediante FOSFORILACIÓN y regula la transcripción de genes cardioespecíficos.
Factor de Transcripción TFIID
Principal componente de unión al ADN de secuencia específica involucrado en la activación de transcripción de ARN POLIMERASA II. En un principio se describió como un complejo de PROTEÍNA DE UNIÓN A TATA-BOX y a FACTORES ASOCIADOS CON LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA. Actualmente se sabe que las PROTEÍNAS SIMILARES A LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA-BOX puede realizar la función de la proteína de unión TATA-box en el complejo.
Factores de Transcripción NFATC
Familia de factores de transcripción que se caracterizan por la presencia de y calcineurina-dominios altamente conservadas de unión al ADN. Proteínas NFAT se activan en el CITOPLASMA de la fosfatasa CALCINEURINA dependiente de calcio. Ellos transducen señales de calcio al núcleo donde pueden interactuar con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN AP-1 o FN-KAPPA B e iniciar la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de genes implicados en la DIFERENCIACIÓN CELULAR y desarrollo. Proteínas NFAT estimulan la activación del LINFOCITO T a través de la inducción de GENES INMEDIATOS PRECOCES como la INTERLEUCINA-2.
Cromonas
Factor de Transcripción Activador 3
Factor de transcripción activador que desempeña un papel clave en las respuestas celulares al ESTRÉS GENOTÓXICO y al ESTRÉS OXIDATIVO.
Factores de Transcripción Paired Box
Familia de factores de transcripción que controlan el DESARROLLO EMBRIONARIO de diversas estirpes celulares. Se caracterizan por poseer un dominio de unión al ADN emparejado altamente conservado que se identificó por vez primera en genes de segmentación de DROSOPHILA.
FN-kappa B
Activador transcripcional nuclear, ubicuo, inducible, que se une a los elementos activadores en muchos tipos celulares diferentes y se activa por estímulos patógenos. El complejo FN-kappa B es un heterodímero compuesto por dos subunidades que se unen al ADN: FN-kappa B1 y relA.
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
Inmunohistoquímica
Células COS
LÍNEA CELULAR derivada de la línea celular CV-1 mediante transformación con una replicación producida por un mutante incompleto del VIRUS 40 DE LOS SIMIOS, que codifica un largo antigeno T de tipo salvaje (ANTIGENOS TRANSFORMADORES DE POLIOMAVIRUS). Son usados para transfección y clonación. (La línea celular CV-1 ha sido derivada del riñón de un mono verde africano adulto macho (ERCOPITHECUS AETHIOPS)).
Factor de Transcripción Sp3
Proteínas Portadoras
Células 3T3
Líneas celulares cuyo procedimiento original de crecimiento consistia en seren transferidas (T) a cada 3 días e placadas a 300.000 células por placa (cápsula o disco de Petri). Las líneas se desarrollaron utilizando varias cepas diferentes de ratones. Los tejidos son generalmente fibroblastos derivados de embriones de ratones pero otros tipos y fuentes también ya fueron desarrollados. Las líneas 3T3 son sistemas de hospederos in vitro valiosos para los estudios de transformación de virus oncogénicos ya que las células 3T3 poseen una elevada sensibilidad a la INIBICION DE CONTACTO.
Elementos de Facilitación Genéticos
Secuencias de ADN de actuación cis que pueden incrementar la transcripción de los genes. Los elementos de facilitación generalmente pueden funcionar en cualquier orientación y a diversas distancias del promotor.
Sitio de Iniciación de la Transcripción
El primer nucleótido de una secuencia de ADN transcrita donde la ARN polimerasa (ARN POLIMERASAS DIRIGIDAS POR ADN) comienza la síntesis de la transcripción de ARN.
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Factor de Transcripción Activador 2
Factor de transcripción activador que regula la expresión de diversos GENES, como los GENES C-JUN, CICLINA A, CICLINA D1 y el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN ACTIVADOR 3.
Saccharomyces cerevisiae
Factor de Transcripción TFIIB
Factor de transcripción específico de la ARN POLIMERASA II. Tiene una función en la reunión del complejo de preiniciación transcripcional pol II y ha sido implicado como objetivo de los activadores transcripcionales específicos de genes.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Isoformas de Proteínas
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Factores de Transcripción Básicos con Cremalleras de Leucinas y Motivos Hélice-Asa-Hélice
Familia de factores de transcripción que contienen regiones ricas en residuos básicos, dominios CREMALLERA DE LEUCINAS y MOTIVOS HÉLICE-GIRO-HÉLICE.
Morfogénesis
Desarrollo de las estructuras anatómicas para crear la forma de un organismo uni o multicelular. La morfogénesis proporciona cambios de forma de una o varias partes o de todo el organismo.
Morfolinas
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Factor de Transcripción E2F1
Factor de transcripción E2F que interactúa directamente con la PROTEÍNA DEL RETINOBLASTOMA y la CICLINA A, y activa la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA necesaria para la entrada en el CICLO CELULAR y la síntesis de ADN. El factor E2F1 está relacionado con la reparación del ADN y con la APOPTOSIS.
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
ARN Polimerasa II
Inhibidores Enzimáticos
Péptidos y Proteínas de Señalización Intracelular
Proteínas y péptidos que están involucrados en TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL dentro de la célula. Aquí están imcluídos péptidos y proteínas que regulan la actividad de FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN Y PROCESOS CELULARES en respuesta a señales de RECEPTORES DE SUPERFICIE CELULAR. Los péptidos de señalización intracelular y proteínas pueden ser parte de una cascada de señalización enzimática o actuar a través de enlace y modificando la acción de otros factores de señalización.
Proteínas Fluorescentes Verdes
Analógos y derivados proteicos de la proteína fluorescente Aequorea victoria verde que emite luz (FLUORESCENCIA) cuando se estimula con RAYOS ULTRAVIOLETAS. Se usan en GENES REPORTEROS al hacer TÉCNICAS GENETICAS. Se han hecho numerosos mutantes para emitir otros colores o ser sensibles a pH.
Factores de Transcripción MEF2
La activación de factores de transcripción de la familia MADS que se unen a un elemento de secuencia específica (elemento MEF2) en muchos genes específicos de músculo y están involucrados en la miogénesis esquelética y cardíaca, la diferenciación neuronal y la supervivencia / apoptosis.
Factores de Tiempo
Factor de Transcripción GATA3
Factor de transcripción GATA que se encuentra principalmente en los precursores de las CÉLULAS LINFOIDES y que se ha relacionado con el proceso de DIFERENCIACIÓN CELULAR de los LINFOCITOS T COOPERADORES. La haploinsuficiencia de GATA3 se asocia a HIPOPARATIROIDISMO, HIPOACUSIA NEUROSENSORIAL y síndrome de anomalías renales.
Transporte de Proteína
Citoplasma
Factor de Transcripción GATA1
Factor de transcripción GATA que se expresa específicamente en los linajes hematopoyéticos y desempeña una función importante en la DIFERENCIACIÓN CELULAR de las CÉLULAS ERITROIDES y los MEGACARIOCITOS.
Factor de Transcripción GATA2
Factor de transcripción GATA esencial, que se expresa principalmente en las CÉLULAS MADRE HEMATOPOYÉTICAS.
Quinasas Ciclina-Dependientes
Proteína quinasas que controlan la progresión del ciclo celular en todos los eucariotes y requieren asociación física con las CICLINAS para alcanzar plena actividad enzimática. Las quinasas dependientes de ciclina son reguladas por eventos de fosforilación y desfosforilación.
Células Epiteliales
Células que recubren las superficies interna y externa del cuerpo, formando masas o capas celulares (EPITELIO). Las células epiteliales que revisten la PIEL, BOCA, NARIZ y el CANAL ANAL derivan del ectodermo; las que revisten el SISTEMA RESPIRATORIO y el SISTEMA DIGESTIVO derivan del endodermo; las otras (SISTEMA CARDIOVASCULAR y SISTEMA LINFÁTICO) del mesodermo. Las células epiteliales se pueden clasificar principalmente por la forma y función de las células en células epiteliales escamosas, glandulares y de transición.
Factores de Transcripción TCF
Familia de proteínas de unión al ADN que se expresan principalmente en los LINFOCITOS T. Estas proteínas interaccionan con la BETA CATENINA y actúan como activadores y represores transcripcionales en diversos procesos del desarrollo.
Factores de Transcripción GATA
Familia de factores de transcripción que contienen dos MOTIVOS DEDO DE ZINC y se unen a la secuencia (A/T)GATA(A/G) del ADN.
Factor de Transcripción Asociado a Microftalmía
Un factor de transcripción cremallera de leucina básica de hélice-bucle-hélice que regula la DIFERENCIACIÓN CELULAR y el desarrollo de una variedad de tipos de células que incluyen MELANOCITOS; OSTEOCLASTOS; y EPITELIO PIGMENTADO DE LA RETINA. Las mutaciones en la proteína MITF se han asociado con la OSTEOPETROSIS y SÍNDROME DE WAARDENBURG.
División Celular
Fisión de las CÉLULAS. Incluye la CITOCINESIS, cuando se divide el CITOPLASMA de una célula y la DIVISIÓN CELULAR DEL NÚCLEO.
Proteínas de la Membrana
Proteínas que se encuentran en las membranas celulares e intracelulares. Están formadas por dos tipos, las proteínas periféricas y las integrales. Incluyen la mayoría de las enzimas asociadas con la membrana, proteínas antigénicas, proteínas transportadoras, y receptores de drogas, hormonas y lectinas.
Fase G2
Periodo del CICLO CELULAR que sigue a la síntesis de ADN (FASE S) y precede a la FASE M (fase de división celular). Los CROMOSOMAS son tetraploides en este punto.
Hepatocitos
Factor de Transcripción STAT1
Transductor de señales y activador de la transcripción que interviene en las respuestas celulares a los INTERFERONES. Stat 1 interactúa con la PROTEÍNA SUPRESORA DE TUMORES P53 y regula la expresión de los GENES implicados en el control del crecimiento y en la APOPTOSIS.
Factores de Transcripción Activadores
Los factores de transcripción activadores se identificaron originalmente en PROTEÍNAS FIJADORAS DE ADN que interactúan con los PROMOTORES TEMPRANOS de ADENOVIRUS. Son una familia de factores de transcripción de cremalleras de leucinas de naturaleza básica que se unen al sitio de consenso de TGACGTCA del elemento de respuesta del AMP cíclico y se hallan estrechamente relacionados con la PROTEÍNA FIJADORA DE ADN QUE RESPONDE AL AMP CÍCLICO.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Proteínas Reguladoras de la Apoptosis
Gran grupo de proteínas que controlan la APOPTOSIS. En esta familia de proteínas figuran muchas PROTEÍNAS ONCOGÉNICAS, asi como una amplia variedad de clases de PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS DE SEÑALIZACIÓN INTRACELULAR, como las CASPASAS.
Mitosis
Tipo de divisaión del NÚCLEO CELULAR, mediante el que los dos núcleos hijos normalmente reciben dotaciones idénticas del número de CROMOSOMAS de las células somáticas de la especie.
Factor de Transcripción ReIA
Factores de Transcripción E2F
Familia de factores básicos de transcripción hélice-bucle-hélice que controlan la expresión de una variedad de GENES implicados en la regulación del CICLO CELULAR. Factores de transcripción E2F típicamente forman complejos heterodiméricos con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DP1 o factor de transcripción DP2, y tienen dominios de dimerización de unión a ADN y N-terminal. Factores de transcripción E2F pueden actuar como mediadores de la represión de la transcripción o la activación transcripcional.
Secuencias Hélice-Asa-Hélice
Estructuras supersecundarias recurrentes caracterizadas por 20 aminoácidos que se pliegan en dos alfa hélices conectadas por un segmento de "lazo" no helicoidal. Se encuentran en muchas secuencias específicas de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN y de PROTEINAS QUE SE UNEN AL CALCIO.
Hígado
Fosfohidrolasa PTEN
Fosfatasa lipídica que actúa sobre el fosfatidilinositol-3,4,5-trifosfato para regular diversas VÍAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES. Modula PROCESOS DE CRECIMIENTO CELULAR, MIGRACIÓN CELULAR y APOPTOSIS. Las mutaciones de PTEN se asocian a la ENFERMEDAD DE COWDEN y al SÍNDROME DE PROTEO así como a la TRANSFORMACIÓN NEOPLÁSICA DE LAS CÉLULAS.
Regulación de la Expresión Génica de las Plantas
Activación Enzimática
Factor de Transcripción GATA6
Factor de transcripción GATA que se expresa principalmente en las CÉLULAS DEL MÚSCULO LISO y regula la DIFERENCIACIÓN CELULAR del músculo liso vascular.
Factor Nuclear 3-alfa del Hepatocito
Factor de transcripción forkhead que es un activador esencial de la expresión génica del GLUCAGÓN.
Factor de Transcripción Activador 4
Proteína 1 Similar al Factor de Transcripción 7
Factor de Transcripción Activador 1
Proteína de Unión a Elemento de Respuesta al AMP Cíclico
Modelos Genéticos
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Factor de Transcripción TFIIIA
Uno de los distintos factores de transcripción general, específicos para la ARN POLIMERASA III. Es una proteína dedo de zinc (DEDOS DE ZINC),necesaria para la transcripción de los genes 5S ribosómicos.
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
TATA Box
Una secuencia conservada rica en A-T que está contenida en los promotores para la ARN polimerasa II. El segmento tiene una longitud de siete pares de bases y los nucleótidos más comunmente hallados son TATAAAA.
Factores de Transcripción NFI
Factores de transcripción originalmente identificados como proteínas de unión al ADN específicas de sitios, esenciales para la REPLICACIÓN DEL ADN en los ADENOVIRUS. Son importantes para el desarrollo y el funcionamiento de la GLÁNDULA MAMARIA.
Neuronas
Proteínas Proto-Oncogénicas c-jun
Proteína celular, que se une al ADN, y que es codificada por el gen c-jun (GEN, JUN). Ellas participan en el control transcripcional relacionado con el crecimiento. Parece que tienen tres funciones diferentes: dimerización (con c-fos), unión al ADN, y activación transcriptional. La transformación oncogénica puede tener lugar por la expresión constitutiva de c-jun.
Receptor de Insulina
Receptor de la superficie celular para la INSULINA. Comprende un tetrámetro de dos subunidades alfa y dos beta, que se derivan de la ruptura de una única proteína precursora. El receptor contiene un dominio intrínseco de TIROSINA QUINASA que está localizado dentro de la subunidad beta. La activación del receptor por la INSULINA da lugar a numerosos cambios metabólicos, incluído el incremento de la captación de GLUCOSA en el hígado,músculos, y TEJIDO ADIPOSO.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-ets
Familia de factores de transcripción que comparten un único dominio de unión del ADN. Debe su nombre a la proteína oncogénica v-ets del VIRUS DE LA ERITROBLASTOSIS AVIAR.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Proteínas Potenciadoras de Unión a CCAAT
Una clase de proteínas que fueron originariamente identificadas por su habilidad de ligarse a la secuencia de CCAAT del ADN. La proteína potenciadora de unión a CCAAT típica forma dímeros y consiste de un dominio de activación, una región básica de unión a ADN, y un dominio de dimerización rico en leucina (LEUCINA ZIPPERS). FACTOR DE ENLACE A CCAAT es estructuralmente un tipo distinto de proteína potenciadora de unión a CCAAT que consiste de un trímero de tres diferentes subunidades.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Proteínas de Dominio T Box
Proteínas que contienen una región de secuencia conservada, con alrededor de 200 aminoácidos de longitud, que codifica una secuencia específica particular de un dominio que se une al ADN (el dominio de la "T-box"). Estas proteínas son factores de transcripción que controlan las vías de desarrollo. El prototipo de esta familia es el producto genético del ratón Brachyury (o T).
Factor de Transcripción TFIIH
Factor de transcripción general que está implicado en la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA basal y la REPARACIÓN DEL ADN. Consta de nueve subunidades, que incluyen ADN HELICASAS dependientes del ATP, ciclina H y la PROTEÍNA DEL XERODERMA PIGMENTOSO DEL GRUPO D.
Factor de Transcripción SOX9
Factor de transcripción SOXE que juega un papel crítico en la regulación de la CONDROGÉNESIS; OSTEOGÉNESIS, y determinación del sexo masculino. La pérdida de la función del factor de transcripción SOX9 debido a mutaciones genéticas es una causa de DISPLASIA CAMPOMÉLICA.
Factor de Transcripción TFIIA
Factor de transcripción específico ARN POLIMERASA II. Puede tener una función en la activación transcripcional de la expresión genética interactuando con la PROTEÍNA DE UNIÓN A TATA-BOX, componente del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID.
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Factor de Transcripción STAT5
Transductor de señales y activador de la transcripción que interviene en las respuestas celulares a diversas CITOCINAS. La activación de Stat5 se asocia a la transcripción de reguladores del CICLO CELULAR, como el INHIBIDOR P21 DE CICLINA-CINASA y de genes antiapoptóticos tales como los GENES BCL-2. Stat5 está constitutivamente activado en muchos pacientes con LEUCEMIA MIELOIDE aguda.
Factor de Transcripción DP1
Factor de transcripción que posee dominios de unión al ADN y E2F pero que carece de dominio de activación transcripcional. Es una molécula de unión de los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN E2F y potencia la unión al ADN y la función de transactivación del complejo DP-E2F.
Técnicas del Sistema de Dos Híbridos
Técnicas de cribado concebidas inicialmente en levaduras para identificar genes que codifican proteínas interactuantes. Se usan variantes para evaluar la interrelación entre las proteínas y otras moléculas. Las técnicas de dos híbridos se refieren al análisis de interacciones entre proteínas; las técnicas de un híbrido, a las interacciones entre ADN y proteína; las técnicas de tres híbridos, a las interacciones entre ARN y proteína o entre ligando y proteína. Las técnicas de n híbridos en configuración inversa se refieren al análisis de mutaciones o de moléculas pequeñas que disocian las interacciones conocidas.
Glucosa
Proteínas de Arabidopsis
Proteínas de especies vegetales pertenecientes al género ARABIDOPSIS. Las especies de Arabidopsis más estudiadas, la Arabidopsis thaliana, se utilizan generalmente en laboratorios de experimentación.
Huella de ADN
Método para determinar la especificidad de secuencia de las proteínas que enlazan con el ADN. La dermatoglifia del ADN utiliza un agente que daña el ADN (ya sea un reactivo químico o una nucleasa) que rompe el ADN en cada par de bases. La ruptura del ADN es inhibida donde el ligando enlaza con el ADN.
Linaje de la Célula
Historia del desarrollo de tipos de células diferenciadas específicas, desde las CÉLULAS MADRE originales del embrión.
Drosophila
Leucina Zippers
Motivos que se unen al ADN formados por dos alfa hélices que se entrelazan durante 8 giros en una espiral enrollada y luego se bifurcan para formar unas estructuras en forma de Y. Las leucinas que ocurren en repeticiones heptádicas terminan en los mismos lados de las hélices y son adyacentes unas a otras en el tronco de la Y (la región "zipper"). Los residuos que se unen al ADN se encuentran en la región bifurcada de la Y.
Factor 1 de Transcripción de Unión a Octámeros
Factor de transcripción octámero que se manifiesta ubicuamente, que regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA del ARN NUCLEAR PEQUEÑO, GENES DE INMUNOGLOBULINAS y genes de HISTONAS H2b.
Elementos Reguladores de la Transcripción
Secuencias de nucleótidos de un gen que están involucradas en la regulación de la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA.
Arabidopsis
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Factor I del Crecimiento Similar a la Insulina
Péptido básico bien caracterizado que se considera que es secretado por el hígado y que circula en la sangre. Tiene actividades de regulación del crecimiento, similar a la insulina y mitogénica. Este factor de crecimiento tiene una dependencia fundamental, pero no absoluta, de la HORMONA DEL CRECIMIENTO. Se piensa que es principalmente activo en adultos, a diferencia del FACTOR II DEL CRECIMIENTO SIMILAR A LA INSULINA, que es un factor fundamental de crecimiento fetal.
Proteína de Unión a TATA-Box
Factor de transcripción general que desempeña un papele principal en la activación de los genes aucarióticos, transcritos por ARN POLIMERASAS. Se une específicamente al elemento promotor de TATA BOX, situado muy próximo a la posición de la iniciación de la transcripción en el ARN transcrito por la ARN POLIMERASA II. Aunque considerado como componente principal del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID, participa también en los complejos generales de factores de transcripción implicados en la transcripción de ARN POLIMERASA I y ARN POLIMERASA II.