Factor 1 de Elongación Peptídica
El factor 1 de elongación peptídica es una proteína con muchas subunidades, responsable del enlace dependiente de GTP, de los aminoacil-ARNt's a los ribosomas eucarióticos. La subunidad alfa (EF-1alfa) se une al aminoacil-ARNt y los transfiere al ribosoma, en un proceso vinculado a la hidrólisis del GTP. Las subunidades beta y delta (EF-1beta, EF-1delta) participan en la conversión de GDP a GTP. La subunidad gamma (EF-1gamma) es un componente estructural.
Factores de Elongación de Péptidos
Factores de Elongación Enlazados a GTP Fosfohidrolasas
Factor Tu de Elongación Peptídica
Proteína que se encuentra en bacterias y en las mitocondrias de eucariotas, que entrega los aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma. El aminoacil-ARNt está primero enlazado a un complejo de factor Tu de elongación, que contiene una molécula de GTP enlazada. El complejo resultante entonces se enlaza al complejo de iniciación 70S. Simultáneamente, el GTP es hidrolizado y el complejo Tu-GDP es liberado del ribosoma 70S. El complejo Tu-GTP es regenerado a partir del complejo Tu-GDP por el factor Ts de elongación y GTP.
Factor 2 de Elongación Peptídica
El Factor 2 de elongación peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A al sitio P de los ribosomas eucarióticos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Extensión de la Cadena Peptídica de Translación
Proceso de TRADUCCIÓN GENÉTICA en el que un aminoácido se transfiere de su cognado ARN DE TRANSFERENCIA a la cadena extendida de PÉPTIDOS.
Factor G de Elongación Peptídica
El Factor G de Elongación Peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A hacia el sitio P de los ribosomas bacterianos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Poli U
Aminoacil-ARN de Transferencia
Intermediarios en la biosíntesis de proteínas. Los compuestos se forman a partir de aminoácidos, ATP y ARN de transferencia, una reacción catalizada por la aminoacil ARNt sintetasa. Son compuestos claves en el proceso de translación genética.
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
ARN de Transferencia de Fenilanina
Péptidos
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Factores de Elongación Transcripcional
Biosíntesis de Péptidos
Producción de PÉPTIDOS o PROTEINAS por los constituyentes de un organismo vivo. La biosintesis de las proteinas en los RIBOSOMAS siguiendo un modelo de ARN se llama traducción (TRADUCCIÓN GENÉTICA). Hay otra biosíntesis de péptidos no ribosómica (BIOSINTESIS DE PÉPTIDOS, INDEPENDIENTES DE ÁCIDOS NUCLEICOS) que es llevada a cabo por PÉPTIDO SINTASAS y PEPTIDIL TRANSFERASAS. Modificaciones adicionales de las cadenas peptídicas producen moleculas funcionales de péptidos y proteinas.
Quinasa del Factor 2 de Elongación
Subtipo monomérico de proteína quinasa dependiente de calcio-calmodulina que de modo específico fosforila el FACTOR 2 DE ELONGACIÓN PEPTÍDICA. La enzima carece de un dominio de activación fosforilable que pueda responder a la PROTEÍNA QUINASA QUINASA DEPENDIENTE DE CALCIO-CALMODULINA; sin embargo, está regulada por fosforilación por la PROTEÍNA CINASA A y por la autofosforilación intramolecular.
Guanosina Trifosfato
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Factor B de Elongación Transcripcional Positiva
Complejo de factor de elongación transcripcional que está compuesto por un heterodímero de QUINASA 9 CICLINA-DEPENDIENTE y una de varias CICLINAS incluyendo la CICLINAS TIPO T y ciclina K. Funciona por fosforilación del dominio carboxi-terminal del ARN POLIMERASA II.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Guanosina Difosfato
Secuencia de Aminoácidos
ARN Polimerasa II
Fragmentos de Péptidos
Factores Generales de Transcripción
Factores de transcripción que forman complejos de iniciación de la transcripción del ADN, se unen a específicas ARN POLIMERASAS DIRIGIDAS POR ADN y son necesarios para iniciar la transcripción. Aunque su unión puede estar localizada en distintas secuencias y motivos estructurales dentro del ADN que son considerados no específicos con respecto al gen específico que está siendo transcrito.
Ácido Fusídico
Unión Proteica
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Secuencia de Bases
Biblioteca de Péptidos
Una colección de péptidos clonados, o químicamente sintetizados, frecuentemente constituídos por todas las combinaciones posibles de aminoácidos formando un péptido n-aminoácido.
Transcripción Genética
Aurodox
Nucleótidos de Guanina
Los nucleótidos de guanina son biomoléculas constituidas por un residuo de azúcar (ribosa o desoxirribosa), un grupo fosfato y la base nitrogenada guanina, que desempeñan un papel fundamental en la síntesis de ácidos nucleicos, energía celular y señalización intracelular.
Sitios de Unión
Péptidos Cíclicos
Péptidos Catiónicos Antimicrobianos
Pequeños péptidos catiónicos que son un componente importante en la mayoría de las especies, de las primeras defensas innatas e inducidas contra microbios invasores. En los animales se encuentran en las superficies mucosas, dentro de gránulos fagocíticos, y en la superficie del cuerpo. También se encuentran en insectos y plantas. Entre otros, este grupo incluye las DEFENSINAS, protegrinas, taquiplesinas, y tioninas. Desplazan a los CATIONES BIVALENTES de los grupos fosfato de LÍPIDOS DE LA MEMBRANA que conducen a la interrupción de la membrana.
Modelos Moleculares
Artemia
Ciclina T
Un subtipo de ciclina que se encuentra asociada a la QUINASA 9 DEPENDIENTE DE LA CICLINAciclina. A diferencia de las ciclinas tradicionales, que regulan el CICLO CELULAR, las ciclinas tipo T aparecen para regular la transcripción y son componentes del factor B de elongación transcripcional positiva.
Quinasa 9 Dependiente de la Ciclina
Quinasa multifuncional relacionada con la quinasa CDC2 que tiene funciones en la elongación transcripcional, DIFERENCIACION CELULAR y la APOPTOSIS.Se encuentra asociada con CICLINA T y es un componente de FACTOR B DE ELONGACION TRANSCRIPCIONAL POSITIVA.
Toxina Diftérica
Polipéptido de ribosilación del ADP producido por CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE que causa los signos y síntomas de la DIFTERIA. Puede escindirse en dos dominios desiguales: el más pequeño, el dominio A catalítico, es la porción mortal y contiene MONO(ADP-RIBOSA)-TRANSFERASAS, que transfieren ADP-RIBOSA al FACTOR 2 DE ELONGACIÓN DE PÉPTIDOS, inhibiendo en consecuencia la síntesis proteica; y el dominio B, de mayor tamaño, necesario para la entrada en las células.
Mutación
Proteínas Ribosómicas
Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.
Thermus thermophilus
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Mapeo Peptídico
Análisis de PÉPTIDOS generados por la digestión o fragmentación de una proteína o mezcla de PROTEINAS, mediante ELECTROFORESIS, CROMATOGRAFIA o ESPECTROMETRIA DE MASA. Las huellas del péptido resultante son analizadas para distintos propósitos incluyendo la identificación de las proteinas en una muestra. El POLIMORFISMO GENÉTICO, patrones de expresión genética y patrones para el diagnóstico de enfermedades.