Métodos rápidos de medición de los efectos de un agente en un ensayo biológico o químico. El ensayo suele implicar algún tipo de automatización o una manera de llevar a cabo varios ensayos al mismo tiempo utilizando conjuntos de la muestra.
Técnicas de análisis de la secuencia de nucleótidos que aumentan el alcance, complejidad, sensibilidad y precisión de los resultados por un considerable incremento de la escala de operaciones y por lo tanto el número de nucleótidos, y el número de copias de cada uno de los nucleótidos secuenciados. La secuencia se podría realizar mediante el análisis de la síntesis o ligadura de los productos, hibridación a secuencias preexistentes, etc.
Grandes colecciones de moléculas pequeñas (peso molecular menor o igual a 600), de naturaleza similar o diferente, que se utilizan en pruebas rápidas de detección sistemática de la función génica, la interacción proteica, el procesamiento celular, las vías bioquímicas y otras interacciones químicas.
Prueba preclínica de medicamentos en animales experimentales o in vitro, para comprobar sus efectos biolóticos y tóxicos y las aplicaciones clínicas potenciales.
Programas y datos operativos y secuenciales que instruyen el funcionamiento de un computador digital.
El estudio sistemático de las secuencias completas del ADN (GENOMA) de los organismos.
Campo de la biología relacionada con el desarrollo de técnicas para la recolección y manipulación de datos biológicos, y la utilización de estos datos para hacer descubrimientos biológicos o predicciones. Este campo abarca todos los métodos computacionales y teorías para la solución de problemas biológicos, incluyendo la manipulación de modelos y conjuntos de datos.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Procedimiento consistente en una secuencia de fórmulas algebraicas y/o pasos lógicos para calcular o determinar una tarea dada.
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Operación controlada de un aparato, proceso, o sistema por dispositivos mecánicos o electrónicos que ocupan el lugar de los órganos humanos de observación, esfuerzo y decisión.
La reproductibilidad estadística de dimensiones (frecuentemente en el contexto clínico) incluyendo la testaje de instrumentación o técnicas para obtener resultados reproducibles; reproductibilidad de mediciones fisiológicas que deben de ser usadas para desarrollar normas para estimar probabilidad, prognóstico o respuesta a un estímulo; reproductibilidad de ocurrencia de una condición y reproductibilidad de resultados experimentales.
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
El proceso de encontrar productos químicos para su posible uso terapéutico.
Proceso de múltiples etapas que incluye la clonación, mapeo físico, subclonaje, y el análisis de una SECUENCIA DE BASE.
El estudio sistemático de la dotación completa de proteínas (PROTEOMA) de los organismos.
Ensayos de unión de ligandos que miden las interacciones proteína-proteína, proteína-pequeña molécula o proteína-ácido nucleico, usando un grupo muy amplio de moléculas de captura, es decir, aquellas agregadas separadamente a un soporte sólido para medir la presencia o interacción de moléculas diana en la muestra.
Bases de datos dedicadas al conocimiento de genes específicos y productos de los genes.
Una tecnología, en el que conjuntos de reacciones para su solución o síntesis en fase sólida, se utiliza para crear bibliotecas moleculares para el análisis de compuestos a gran escala.
Métodos que utilizan los principios de la MICROFLUIDICA para manipulación de muestras, mezcla de reactivo y separación y detección de componentes específicos de los fluidos.
Operaciones controladas por procesos analíticos o diagnósticos, o sistemas por medio de dispositivos mecánicos o electrónicos.
Métodos para determinar interacción entre PROTEÍNAS.
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.
La adición de información descriptiva sobre la función o estructura de una secuencia molecular a su registro de DATOS DE SECUENCIA MOLECULAR.
Ensayo de productos o vigilancia de varios procesos bioquímicos y reacciones en una célula individual.
Métodos utilizados para medir la actividad relativa de una enzima específica o su concentración en solución. Típicamente un sustrato de la enzima se añade a una solución tampón que contiene la enzima y la tasa de conversión de sustrato al producto se mide en condiciones controladas. Muchos de los métodos clásicos de análisis enzimático implican la utilización de sustratos sintéticos colorimétricos y la medición de las tasas de reacción, mediante un espectrofotómetro.
Medidas binarias de clasificación para evaluar los resultados de la prueba.Sensibilidad o su índice de repeteción es la proporción de verdaderos positivos. Especificidad es la probabilidad de determinar correctamente la ausencia de una condición. (Del último, Diccionario de Epidemiología, 2d ed)
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
El patrón de EXPRESIÓN GÉNICA a nivel de la transcripción genética en un organismo específico o bajo circunstancias específicas en las células específicas.
Complemento génico completo contenido en un juego de cromosomas de un ser humano, ya sea haploide (derivado de un progenitor) o diploide (conjunto doble, derivado de ambos progenitores). El conjunto haploide contiene de 50 000 a 100 000 genes y alrededor de 3 mil millones de pares de bases.
Confederación libre de redes de comunicación por computadoras de todas partes del mundo. Las redes que conforman Internet están conectadas a través de varias redes centrales. Internet surgió del proyecto ARPAnet del gobierno de los Estados Unidos y estaba destinada a facilitar el intercambio de información.
Complemento genético de un organismo, incluyendo todos sus GENES, representado en sus ADN o en algunos casos, sus ARN.
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Estudio de los canales de fluido y cámaras de pequeñas dimensiones de decenas a cientos de micrómetros y volúmenes de nanolitros o picolitros. Esto es de interés en la MICROCIRCULACIÓN biológica y se utiliza en MICROQUÍMICA y TÉCNICAS DE INVESTIGACIÓN.
Análisis métodico integral de sistemas biológicos complejos por medio del monitoreo de respuestas a perturbaciones o procesos biológicos. En gran escala, la colección computarizada y el análisis de la información se usan para desarrollar y ensayar modelos de sistemas biológicos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Variación de un único nucleótido en una secuencia genética que aparece con apreciable frecuencia en la población.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Complemento proteico de un organismo codificado por su genoma.
La parte de un programa interactivo de computadora que emite mensajes a un usuario y recibe órdenes de éste.
Método de medición de los efectos de una sustancia biológicamente activa mediante el uso de un modelo de tejido o de célula intermediario in vivo o in vitro bajo condiciones controladas. Incluye los estudios de virulencia en fetos de animales en el útero, el bioensayo de la convulsión del ratón por insulina, la cuantificación de sistemas iniciadores de tumores en piel de ratón, el cálculo de los efectos potenciadores de un factor hormonal en una muestra aislada de músculo estomacal contráctil, etc.
Análisis de la masa de un objeto mediante la determinación de las longitudes de ondas en las que la energía electromagnética es absorbida por dicho objeto.
Concentración de un compuesto necesaria para reducir in vitro el crecimiento poblacional de organismos, incluidas las células eucariotas, en un 50 por ciento. Aunque a menudo se expresa para denotar la actividad antibacteriana in vitro, se utiliza también como un patrón de citotoxicidad a las células eucariotas en cultivo.
Bases de datos que contiene información sobre PROTEÍNAS, tales como la SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS; CONFORMACIÓN PROTÉICA, y otras propiedades.
Diseño o construcción de objetos a escala muy reducida.
Constitución genética del individuo, que comprende los ALELOS presentes en cada locus génico (SITIOS GENÉTICOS).
Los métodos utilizados para determinar ALELOS específicos o SNPs (polimorfismo del nucleótido simple).
Análisis simultáneo, en un microchip, de múltiples muestras u objetivos ordenados en un formato en serie.
Representación por medio de la computadora de sistemas físicos y fenómenos tales como los procesos químicos.
Agentes que emiten luz tras la excitación luminosa. La longitud de onda de la luz emitida es usualmente mayor que la de la luz incidente. Los fluorocromos son sustancias que producen fluorescencia en otras sustancias, es decir, colorantes usados para marcar otros compuestos con marcadores fluorescentes.
Diseño molecular de drogas con propósitos específicos (tales como unión al ADN, inhibición enzimática, eficacia anti cancerígena, etc.) basado en el conocimiento de las propiedades moleculares tales como la actividad de los grupos funcionales, geometría molecular y estructura electrónica y también en la información catalogada sobre moléculas análogas. El diseño de drogas generalmente consiste en el modelaje molecular asistido por computación y no incluye la farmacocinética, análisis de dosis o análisis de administración de la droga.
Microdispositivos que combinan tecnología de microfluidos con funciones eléctricas y / o mecánicas para el análisis de volúmenes de líquido muy pequeño. Se componen de microcanales grabados en sustratos de silicio, vidrio o polímero usando procesos similares a la fotolitografía. Los fluidos de prueba en los canales pueden interactuar con diferentes elementos, tales como electrodos, fotodetectores, sensores químicos, bombas y válvulas.
Subsistemas reguladores codificados por ADN relacionados que se encuentran en el GENOMA y coordinan la entrada desde FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN activadores y represores durante el desarrollo, la diferenciación celular o en respuesta a estímulos ambientales. Las redes funcionan para en última instancia especificar la expresión de conjuntos concretos de GENES para estados, momentos o lugares específicos.
Métodos cromosómicos, bioquímicos, intracelulares y otros, empleados en el estudio de la genética.
Propiedad de un objeto de emitir radiación mientras que es irradiado. La radiación emitida es generalmente de mayor longitud de onda que la incidente o absorbida, por ej. una sustancia puede ser irradiada con radiación invisible y emitir luz visible. La fluorescencia de rayos X se utiliza para diagnóstico.
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Conjuntos complejos de reacciones enzimáticas relacionadas entre sí a través de sus productos y sustratos.
ARN bicatenarios pequeños, no codificadores de proteínas, con una longitud de 21-25 nucleótidos, que son formados a partir de transcritos génicos de microARN de simple hélice por la misma RIBONUCLEASA III, Dícer, que produce ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS. Pasan a formar parte del COMPLEJO DEL SILENCIAMIENTO INDUCIDO POR ARN y reprimen la traducción (TRADUCCIÓN GENÉTICA) de determinados ARN mediante la unión a la región 3'UTR homóloga como apareamiento imperfecto. Los ARN pequeños temporales (ARNst), let-7 y lin-4, de C. elegans, son los 2 primeros ARNmi descubiertos y pertenecen a la clase de ARNmi implicados en la cronología del desarrollo.
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
Una técnica altamente sensible (en el orden picomolar, que es 10,000 veces más sensible que la electroforesis convencional) y eficiente, que permite la separación de proteínas, ácidos nucléicos y carbohidratos.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de los procesos o fenómenos genéticos. Incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otro equipamiento electrónico.
Cultivos celulares establecidos que tienen el potencial de multiplicarse indefinidamente.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
BASES DE DATOS que contienen información sobre ÁCIDOS NUCLEICOS tales como la SECUENCIA DE BASES, POLIMORFISMO DE NUCLEÓTIDO SIMPLE, CONFORMACIÓN DE ÁCIDO NUCLEICO y otras propiedades. La información sobre los fragmentos de ADN guardados en una BIBLIOTECA DE GENES o BIBLIOTECA GENÓMICA a menudo es mantenida en bases de datos de ADN.
Un proceso que incluye la determinación de la SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS de una proteína (o péptido, o fragmento de oligopéptido o opéptido) y el análisis de la información de la secuencia.
Software desarrollado para almacenar, manipular, administrar y controlar datos para usos específicos.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Genoma colectivo representante de muchos organismos, principalmente microorganismos, que existe en una comunidad.
Complemento genético completo de una planta (PLANTAS), como se representa en su ADN.
Conjunto de pruebas utilizadas para determinar la toxicidad de una sustancia en sistemas vivos. Estos incluyen las pruebas sobre medicamentos clínicos, alimentos y contaminantes ambientales.
Técnica de espectrometría de masas que utiliza dos (MS/MS) o más analizadores de masas. Con dos en tándem, los iones precursores son seleccionados según masas por el primer analizador, y enfocados hacia una región de colisión donde se fragmentan en los productos de los iones que, a continuación, son identificados por el segundo analizador de masas. Para separar los compuestos se han utilizado muy diversas técnicas, ionizándolos, e introduciéndolos en el primer analizador. Por ejemplo, en el caso de GC-MS/MS, se utiliza CROMATOGRAFÍA DE GASES-ESPECTROMETRÍA DE MASAS para separar los compuestos relativamente pequeños mediante CROMATOGRAFÍA DE GASES antes de inyectarlos en una cámara de ionización para la selección de masas.
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
El análisis genómico de conjuntos de organismos.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Una colección de péptidos clonados, o químicamente sintetizados, frecuentemente constituídos por todas las combinaciones posibles de aminoácidos formando un péptido n-aminoácido.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Actividades que se organizan en relación al almacenamiento, localización, búsqueda y recuperación de información.
Secuencias parciales de ADNc (ADN COMPLEMENTARIO) que son únicas a los ADNc, de los que derivan.
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Aplicación de procedimientos estadísticos para analizar hechos observados o adoptados de un estudio particular.
Diferencias genotípicas observadas entre los individuos de una población.
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Proceso de comunicación pictórica entre los humanos y las computadoras, en que la entrada y la salida de datos de la computadora tienen la forma de gráfico, dibujos u otras representaciones pictóricas adecuadas.
El uso de herramientas de análisis sofisticados para revisar, organizar, analizar y combinar importantes conjuntos de información.
Uso de instrumentos y técnicas para visualizar material y detalles que no pueden ser vistos por el ojo sin ayuda. Normalmente se hace agrandando imágenes, transmitido por luz o haces de electrones, con lentes ópticas o magnéticas que magnifican todo el campo de la imagen. Con la microscopía de barrido, las imagenes son generadas juntandolas a la salida a partir de la muestra en un modo punto a punto, en una escala ampliada, de forma que la exploración se hace con un estrecho haz de luz o electrones, un laser, una sonda conductora o una sonda topográfica.
Representación de un sistema, proceso o relación a través de una forma matemática en la cual las ecuaciones se usan para inferir o estimar su funcionamiento o interrelación.
Teoría y desarrollo de SISTEMAS DE COMPUTACIÓN que realizan tareas que normalmente requieren de inteligencia humana. Estas tareas pueden incluir el reconocimiento de voz, APRENDIZAJE, PERCEPCIÓN VISUAL, CÓMPUTOS MATEMÁTICOS, razonamiento, SOLUCIÓN DE PROBLEMAS, TOMA DE DECISIONES y traducción de idioma.
Genes cuya expresión es fácilmente detectable y portanto se emplean para estudiar la actividad promotora en muhcas posiciones en un genoma diana. En la tecnología del ADN recombinante, estos genes pueden unirse a una región promotora de interés.
Una técnica espectrométrica que se emplea para el análisis de grandes biomoléculas. Se entierran moléculas analíticas en una matriz excedente de pequeñas moléculas orgánicas que muestran una absorción altamente resonante en la longitud de onda de láser empleada. La matriz absorbe la energía del láser, induciendo así una suave desintegración de la mezcla muestra-matriz hacia matriz libre (fase de gas) y moléculas analíticas e iones moleculares. En general, sólo se producen iones moleculares de las moléculas analíticas, y casi no ocurre fragmentación. Esto hace que el método sea muy apropiado para determinaciones del peso molecular y análisis de muestra.
Relación entre la estructura química de un compuesto y su actividad biológica o farmacológica. Los compuestos frecuentemente se clasifican juntos porque tienen características estructurales comunes, incluyendo forma, tamaño, arreglo estereoquímico y distribución de los grupos funcionales.
Cuerpo de conocimientos relativos al uso de organismos, células o constituyentes derivados de células con el fin de desarrollar productos que son técnica, científica y clinicamente útiles. La alteración de la función biológica a nivel molecular (es decir, INGENIERÍA GENÉTICA)es una cuestión central; los métodos de laboratorio utilizados incluyen tecnologías de TRANSFECCIÓN y CLONACIÓN, algoritmos de análisis de secuencia y estructura, bases de datos automatizadas y análisis y predicción de la función de estructuras de genes y proteinas.
Técnicas empleadas para producir moléculas que presentan propiedades que se corresponden con las demandas del experimentador. Estas técnicas combinan métodos para producir cambios estructurales con métodos de selección. También se utilizan para analizar mecanismos de evolución propuestos, en condiciones de selección in vitro.
Aplicación de sistemas de control electrónicos computadorizados a aparatos mecánicos diseñados para realizar funciones humanas. Anteriormente estaba restringido a la industria, pero actualmente se aplica a órganos artificiales controlados por aparatos biónicos (bioelectrónicos), como bombas automatizadas de insulina y otras prótesis.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Método de análisis para detectar y medir la fluorescencia de los compuestos o objetivos, tales como células, proteínas o nucleótidos, o los objetivos previamente marcados con COLORANTES FLUORESCENTES.
Especie del género SACCHAROMYCES, familia Saccharomycetaceae, orden Saccharomycetales, conocido como levadura del 'panadero' o del 'cervecero'. La forma seca se usa como suplemento dietético.
Procesamiento de datos ejecutado principalmente por medios automáticos.
Amplias colecciones, supuestamente completas, de hechos y datos almacenados a partir de material de un área especializada de temas para su análisis y aplicación. La colección puede ser automatizada por diversos métodos contemporáneos para su recuperación. El concepto debe distinguirse del de BASES DE DATOS BIBLIOGRAFICAS, el cual está restringido a las colecciones de referencias bibliográficas.
Bases de datos dedicado al conocimiento de productos químicos específicos.
Ácido ribonucleico en plantas que tiene función reguladora y catalítica así como participa en la síntesis de proteínas.
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Tipo de ESPECTROSCOPIA DE FLUORESCENCIA utilizando dos COLORANTES FLUORESCENTES con la superposición de los espectros de emisión y absorción, que se utiliza para indicar la proximidad de moléculas marcadas. Esta técnica es útil para el estudio de las interacciones de las moléculas y el PLIEGUE DE PROTEÍNAS.
Cualesquiera de una variedad de procedimientos que utilizan sondas biomoleculares para medir la presencia o concentración de moléculas biológicas, estructuras biológicas, microorganismos, etc., al convertir una interacción bioquímica sobre la superficie de la sonda en una señal física cuantificable.
Identificación sistemática y cuantificación de todos los productos metabólicos de una célula, tejido, órgano, u organismo bajo distintas condiciones. El METABOLOMA de una célula o un organismo es una colección dinámica de los metabolitos que constituyen su red de respuesta a las condiciones corrientes.
Polímeros de silicio que consisten de átomos de silicio sustituídos con grupos metilo y unidos mediante átomos de oxígeno. Comprenden una serie de materiales biocompatibles utilizados como líquidos, geles o sólidos; como películas para membranas artificiales, geles para implantes, líquidos como vehículos de drogas y como agentes antiespumante.
Técnica que emplea un sistema instrumental para realizar, procesar y exhibir una o más mediciones de células individuales obtenidas de una suspensión celular. Las células generalmente son coloreadas con uno o más tintes fluorescentes específicos para los componentes celulares de interés, por ejemplo, el ADN, y la fluorescencia de cada célula se mide cuando atraviesa rápidamente el haz de excitación (láser o lámpara de arco de mercurio). La fluorescencia brinda una medición cuantitativa de varias propiedades bioquímicas y biofísicas de la célula como base para diferenciación celular. Otros parámetros ópticos mensurables incluyen la obsorción y la difusión de la luz, aplicándose esta última a la medición del tamaño, forma, densidad, granularidad de la célula y su absorción del colorante.
Analógos y derivados proteicos de la proteína fluorescente Aequorea victoria verde que emite luz (FLUORESCENCIA) cuando se estimula con RAYOS ULTRAVIOLETAS. Se usan en GENES REPORTEROS al hacer TÉCNICAS GENETICAS. Se han hecho numerosos mutantes para emitir otros colores o ser sensibles a pH.
Rasgo genético, fenotípicamente reconocible, que puede ser utilizado para identificar un locus genético, un grupo de 'linkage' o un evento recombinante.
Uso de dispositivos que emplean moléculas detectoras para detectar, investigar o analizar otras moléculas, macromoléculas, agregados moleculares u organismos.
Especie exótica de la familia CYPRINIDAE, originarios de Asiae e introducidos en América del Norte. Se utilizan en estudios embriológicos y para evaluar los efectos de ciertas sustancias químicas sobre el desarrollo.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Luciferasas de LUCIÉRNAGAS, generalmente Photinus, que oxidan la LUCIFERINA DE LUCIÉRNAGA para originar emisión de FOTONES.
Formas diferentes del mismo gen, que ocupan el mismo locus en CROMOSOMAS homólogos y controlan las variantes del mismo producto génico.
Grupo de átomos o moléculas unidas a otras moléculas o estructuras celulares y que se utilizan en el estudio de las propiedades de estas moléculas y estructuras. Las secuencias de ADN o ARN radioactivos se utilizan en BIOLOGÍA MOLECULAR para detectar la presencia de una secuencia complementaria por HIBRIDACIÓN DE ÁCIDO NUCLEICO.
Comúnmente observados SECUENCIA DE BASES o nucleótidos componentes estructurales que pueden ser representados por una SECUENCIA DE CONSENSO o una SECUENCIA LOGO.
Un análisis que compara las frecuencias de los alelos de todos los marcadores polimórficos disponibles (o un conjunto representativo del GENOMA completo), en pacientes no relacionados con un síntoma específico o afección y controles saludables para identificar marcadores asociados con una enfermedad específica o afección.
Compuestos o agentes que se combinan con una enzima de manera tal que evita la combinación sustrato-enzima normal y la reacción catalítica.
Técnicas utilizadas para determinar los valores de los parámetros fotométricos de la luz como resultado de LUMINISCENCIA.
En la RECUPERACIÓN DE LA INFORMACIÓN, la detección o identificación automática de patrones visibles (figuras, formas, y configuraciones) (Adaptación del original: Harrod's Librarians' Glossary, 7th ed).
Procedimientos que participan en la combinación de módulos, componentes o subsistemas desarrollados por separado, para que trabajen juntos como un sistema completo.
Crecimiento anormal y nuevo de tejido. Las neoplasias malignas muestran un mayor grado de anaplasia y tienen la propiedad de invasión y metástasis, comparados con las neoplasias benignas.
Utilización de un tinte u otro reactivo para marcar material biológico con el propósito de identificar y cuantificar componentes de tejidos, células o sus extractos.
Microscopía de muestras coloreadas con colorantes que fluorescen (usualmente isotiocianato de fluoresceina) o de materiales naturalmente fluorescentes, que emiten luz cuando se exponen a la luz ultravioleta o azul. La microscopía de inmunofluorescencia utiliza anticuerpos que están marcados con colorantes fluorescentes.
Desarrollo e empleo de técnicas para estudiar fenómenos físicos y estructuras construidas en escala nanométrica o menor.
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Partículas pequeñas de tamaño uniforme, de dimensiones micrométricas, frecuentemente marcadas con radioisótopos o varios reagentes que actúan como etiquetas o marcadores.
Especie de nemátodo ampliamente utilizada en estudios biológicos, bioquímicos y genéticos.
Métodos de creación de máquinas y dispositivos.
Técnicas cromatográficas en las que la fase móvil es un líquido.
Gráficos que representan conjuntos de medición, no covalentes contactos físicos con PROTEINAS específicas en los organismos vivos o en las células.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Técnicas que utilizan células que expresan PROTEÍNAS RECOMBINANTES DE FUSIÓN por ingeniería genética para translocarse a través de la MEMBRANA CELULAR y permanecer unidas a la parte exterior de la célula.
Un teorema en la teoría de probabilidades llamado así por Thomas Bayes (1702 - 1761). En epidemiología, este es usado para obtener la probabilidad de enfermedad en un grupo de personas con alguna característica sobre la base de la tasa general de aquella enfermedad y de la probabilidad aquella característica en individuos sanos y enfermos. La aplicación más familiar es en el análisis de decisión clínica en donde es usada para estimar la probabilidad de un diagnóstico en particular dada la aparición de algunos síntomas o resultados en la prueba.
Variación de la técnica PCR en la que el cADN se hace del ARN mediante transcripción inversa. El cADN resultante se amplifica usando los protocolos PCR estándares.
Preparación y análisis de muestras en aparatos miniaturizados.
Uso de ADN recombinante (RECOMBINACIÓN GENÉTICA) para preparar una gran librería de nuevos genes quiméricos a partir de una población de ADN fragmentado aleatoriamente procedente de secuencias genéticas relacionadas.
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Métodos de investigación de efectividad de medicamentos citotóxicos anticáncer e inhibidores biológicos. Estos incluyen modelos de muerte celular in vitro y pruebas de exclusión de colorantes citostáticos, así como medición in vivo de los parámetros de crecimiento tumoral en animales de laboratorio.
La colección completa de microbios (bacterias, hongos, virus, etc.) que, naturalmente, existe dentro de un nicho biológico particular, tal como un organismo, el suelo, un cuerpo de agua, etc.
Técnica de introducir imágenes bidimensionales en una computadora y entonces realzarlas o analizar las imágenes de una forma más útil al observador humano.
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Un sistema para verificación y mantenimiento de un nivel deseado de calidad en un producto o proceso por cuidadosa planeación, uso de equipo apropiado, inspección continuada y acción correctiva cuando necesaria (Random House Unabridged Dictionary, 2d ed) (NLM). Se entiende por buena calidad de atención el servicio que reúne los requisitos establecidos y, dados los conocimientos y recursos de que se dispone, satisface las aspiraciones de obtener el máximo de beneficios con el mínimo de riesgos para la salud y bienestar de los pacientes. Por consiguiente, una atención sanitaria de buena calidad se caracteriza por un alto grado de competencia profesional, la eficiencia en la utilización de los recursos, el riesgo mínimo para los pacientes, la satisfacción de los pacientes y un efecto favorable en la salud. (Racoveanu y Johansen)
Línea celular generada a partir de células embrionarias de riñón humano que fueron transformadas con adenovirus humano de tipo 5.
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Elementos de intervalos de tiempo limitados, que contribuyen a resultados o situaciones particulares.
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Adición de grupos metilo al ADN. Las metiltransferasas ADN (metilasas DNA) metilasas realizan esta reacción utilizando S-ADENOSILMETIONINA como donante del grupo metilo.
Medición de la polarización de la luz fluorescente de soluciones o especímenes microscópicos. Se emplea para aportar información referente al tamaño, forma y conformación molecular, anisotropía molecular, transferencia de energía electrónica, incluyendo el enlace del colorante y la coenzima y la reacción del antígeno y el anticuerpo.
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Identificación bioquímica de cambios mutacionales en una secuencia de nucleótidos.
Sobreposición de ADN clonado o secuenciado para construir una región contínua de un gen, cromosoma o genoma.
Una mutación denominada nombrada con la mezcla de la inserción y de la eliminación. Esta referida a una diferencia de la longitud entre dos ALELOS donde se desconoce si la diferencia fue causada originalmente por una INSERCIÓN DE LA SECUENCIA o por una ELIMINACION DE SECUENCIA. Si el número de nucleotidos en la inserción/eliminación no es divisible por tres, y ocurre en una región de la codificación de la proteína, es también una MUTACIÓN DEL SISTEMA DE LECTURA.
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Bases de valor establecido para medir la cantidad, peso, extensión o calidad, ejemplo, estándares de peso, estándares de soluciones, métodos, técnicas y procedimientos utilizados en el diagnóstico y tratamiento.
Drogas producidas para el uso veterinario o en humanos, presentadas en su forma final. Aquí se incluyen los materiales utilizados en la preparación y/o en la formulación final.
Método para generar aleatoriamente una gran biblioteca de nucleótidos y seleccionar APTÓMEROS DE NUCLEÓTIDOS mediante ciclos sucesivos de selección in vitro. Existe un procedimiento modificado que sustituye AMINOÁCIDOS por NUCLEÓTIDOS para obtener APTÁMEROS DE PÉPTIDOS.
Detección de una MUTACIÓN; GENOTIPO; CARIOTIPO; o ALELOS específicos asociados con los rasgos genéticos, enfermedades hereditarias o predisposición a una enfermedad, o que puede conducir a la enfermedad en los descendientes. Incluye pruebas genéticas prenatales.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
El estudio sistemático de la expresión génica global de los cambios debidos a la EPIGÉNESIS GENÉTICA y no debido a cambios de la secuencia de bases del ADN.
Cualquier técnica por medio de la cual un color desconocido es evaluado en términos de colores estándares. La técnica puede ser visual, fotoeléctrica, o indirecta por medios de la espectometría. Se emplea en la química y en la física.
Temperatura a la que cambia una sustancia desde un estado de estructura de la materia a otro.
Moléculas de ADN capaces de replicarse de forma autónoma dentro de una célula huésped y dentro de la cual pueden insertarse otras secuencias de ADN y de esta manera amplificarse. Muchas se derivan de PLÁSMIDOS, BACTERIÓFAGOS o VIRUS. Se usan para transportar genes foráneos a las células receptoras. Los vectores genéticos poseen un sitio replicador funcional y contienen MARCADORES GENÉTICOS para facilitar su reconocimiento selectivo.
Tecnología de fabricación para hacer dispositivos microscópicos en el rango micrómetro (normalmente 1-100 micrómetros), tales como circuitos integrados o MEMS. El proceso usualmente involucra la replicación y fabricación paralela de cientos o millones de estructuras idénticas usando diversas técnicas de deposición de películas delgadas y llevar a cabo salas limpias en el medio ambiente controlado.
Sales inorgánicas del ácido sulfuroso.
Heterociclos de seis miembros que contienen un oxigeno y un nitrogeno.
Término general para hongos redondos unicelulares que se reproducen por brotes. Los hongos de los panaderos y cerveceros son el SACCHAROMYCES CEREVISIAE; la levadura terapéutica seca es LEVADURA, SECA.
Compuestos, como las PROTEÍNAS LUMINISCENTES, que producen o emiten luz (LUMINISCENCIA FÍSICA).
Regiones específicas que se asignan dentro de un GENOMA. Los sitios genéticos son generalmente identificados con una anotación abreviada que indica el número de cromosomas y la posición de una banda específica a lo largo del brazo P o Q del cromosoma, donde se encuentran. Por ejemplo, el sitio 6p21 se encuentra dentro de la banda 21 del brazo P del CROMOSOMA 6. Se sabe que muchos sitios genéticos son también conocidos por los nombres comunes que estan asociados con una función genética o ENFERMEDAD HEREDITARIA.
Descripción de funciones recurrentes o procedimientos de patrones que se encuentran con frecuencia en procesos organizacionales, tales como la notificación, decisión y acción.
Técnicas para estandarizar y agilizar la identificación taxonómica o clasificación de organismos que estén basados en el desciframiento de la secuencia de una o unas pocas regiones de ADN conocidas como el "código de barras de ADN".
Esfuerzo coordinado de los investigadores para trazar el mapa (MAPEO CROMOSÓMICO)y la secuencia del GENOMA humano (ANÁLISIS DE SECUENCIA DE ADN).
Emisión de LUZ cuando los ELECTRONES vuelven al estado electrónico a tierra desde un estado excitado y pierden la energía como FOTONES. Alguna veces es llamada luz fría en contraste con INCANDESCENCIA. Las MEDICIONES LUMINISCENTES aprovechan este tipo de luz emitidos por AGENTES LUMINISCENTES.
Método para el mantenimiento o el crecimiento de CÉLULAS in vitro.
Procedimientos mediante los que se cambia o se crea in vitro la función y estructura de las proteínas, alterando las existentes o sintetizando nuevos genes estructurales que dirigen la síntesis de proteínas con las propiedades deseadas. Esos procedimientos pueden incluir el diseño de MODELOS MOLECULARES de proteínas utilizando GRÁFICOS POR ORDENADOR u otras técnicas de modelado molecular; la MUTAGÉNESIS SITIO DIRIGIDA de genes existentes; y técnicas de EVOLUCIÓN MOLECULAR DIRIGIDA para crear nuevos genes.
Técnicas de laboratorio que involucran la síntesis in vitro de muchas copias de ADN o ARN de un modelo original.
Proteínas que participan en el fenómeno de la emisión de luz en los sistemas vivos. Se incluyen los tipos "enzimáticos" y "no-enzimáticos" de sistemas con o sin la presencia de oxígenos o cofactores.
Pequeños tramos de secuencias de ADN que se usan como sitios marcadores en el mapeo del GENOMA. En la mayoría de los casos, un Sitio de Secuencia Marcada (SSM) es definida por 200 a 500 pares de bases de una secuencia y es operacionalmente único en el genoma humano (es decir, puede ser detectado específicamente con la reacción en cadena de la polimerasa en presencia de todas las demás secuencias genómicas). La inmensa ventaja de los SSM sobre los sitios marcadores definidos de otros modos consiste en que los medios de examen para buscar la presencia de un SSM determinado pueden describirse completamente como información en una base de datos.
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Ténica que incluye la morfometría, densitometría, redes neurales y sistemas especializados que tienen muchas aplicaciones en el campo de la clínica y de la investigación y que es particularmente útil en la anatómica patológica para el estudio de lesiones malignas. La aplicación más común de la citometría de imagen es para análisis del ADN, seguido de la cuantificación de coloraciones inmunohistoquímicas.
Determinación, mediante medición o comparación con un patrón, del valor correcto de cada escala leída en un metro u otro instrumetno de medida; o determinación del calibraje en un instrumento de control que corresponde a valores particulares de voltaje, corriente, frecuencia u otra salida.
Sustancias complejas farmacéuticas, preparados, o de materias procedentes de organismos generalmente obtenidos por métodos biológicos o ensayo.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Molécula que se une a otra molécula. Se usa especialmente para referirse a una molécula pequeña que se une específicamente a una molécula grande, como p. ej., la unión de un antígeno a un anticuerpo, la unión de una hormona o un neurotransmisor a un receptor, o la unión de un sustrato o un efector alostérico a una enzima. Un ligando es también molécula que dona o acepta un par de electrones para formar un enlace covalente coordinado con el átomo metálico central de un complejo de coordinación. (Dorland, 28a ed)
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
El espectro de los organismos vivos que habitan una determinada región determinada, hábitat o biotipo.
Juegos de vocabularios estructurados utilizados para describir y categorizar los genes y productos de genes por su función molecular, participación en los procesos biológicos, y la localización celular. Estos vocabularios y sus asociaciones, a los genes y productos de genes (Gene Ontology annotations) son generados y comisariados por el Gene Ontology Consortium.
Lenguajes específicos que se usan para preparar los programas de las computadoras.
La primera LINEA CELULAR humana, maligna, cultivada de forma continua, proveniente del carcinoma cervical Henrietta Lacks. Estas células son utilizadas para el CULTIVO DE VIRUS y para el estudio de drogas antitumorales.
Una técnica de simulación por computador que se usa para modelar la interacción entre dos moléculas. Típicamente, la simulación de acoplamiento mide las interacciones de una molécula pequeña o ligando con una parte de una molécula más grande tal como una proteína.
Luciferasas de RENILLA que oxidan ciertos AGENTES LUMINESCENTES para originar emisión de FOTONES.
Métodos usados en el estudio de CÉLULAS.
Pruebas que demuestran la eficacia relativa de agentes quimioterápicos contra parasitos específicos.
Especificaciones e instrucciones aplicadas a los programas de las computadoras.