Procesamiento Postranscripcional del ARN
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Edición de ARN
Proceso que cambia la secuencia de nucleótidos del ARNm a partir de aquella del molde de ADN que lo codifica. Algunas de las clases principales de edición de ARN son las siguientes: 1) conversión de la citosina a uracil en el ARNm, 2) adición de un número variable de guaninas en sitios predeterminados y 3) la adición y deleción de uracilos, modelados por ARNs guías (ARN GUIA).
Estabilidad del ARN
Grado en el que una molécula de ARN retiene la integridad estructural y resiste a la degradación por ARNasas y a HIDRÓLISIS catalizada por base, bajo condiciones variables in vivo o in vitro.
Empalme del ARN
Exlusión final de secuencias sin sentido o secuencias interventoras (intrones) antes de que la última transcripción de ARN sea enviada al citoplasma.
Regiones no Traducidas 3'
Secuencia en el extremo 3' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta región contiene secuencias reguladoras de la transcripción y de la traducción.
MicroARNs
ARN bicatenarios pequeños, no codificadores de proteínas, con una longitud de 21-25 nucleótidos, que son formados a partir de transcritos génicos de microARN de simple hélice por la misma RIBONUCLEASA III, Dícer, que produce ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS. Pasan a formar parte del COMPLEJO DEL SILENCIAMIENTO INDUCIDO POR ARN y reprimen la traducción (TRADUCCIÓN GENÉTICA) de determinados ARN mediante la unión a la región 3'UTR homóloga como apareamiento imperfecto. Los ARN pequeños temporales (ARNst), let-7 y lin-4, de C. elegans, son los 2 primeros ARNmi descubiertos y pertenecen a la clase de ARNmi implicados en la cronología del desarrollo.
Transcripción Genética
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
ARN Bacteriano
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Secuencia de Bases
Proteínas de Unión al ARN
Proteínas que se unen a moléculas de ARN. Están incluidas aquí las RIBONUCLEOPROTEÍNAS y otras proteínas cuya función es unirse especificamente al ARN.
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
ARN de Planta
Ácido ribonucleico en plantas que tiene función reguladora y catalítica así como participa en la síntesis de proteínas.
ARN Bicatenario
ARN constituido por dos cadenas, en oposición al ARN de una sóla cadena que tiene mayor prevalencia. La mayoría de los segmentos bicatenarios se forman por la transcripción del ADN, por pareamiento intramolecular de las bases se secuencias complementarias invertidas por un asa de una sola cadena. Algunos segmentos bicatenarios de ARN son normales en todos los organismos.
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Virus ARN
Virus cuyo material genético es el ARN.
Análisis de Secuencia de ARN
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Antígenos Hu de la Encefalomielitis Paraneoplásica
Familia de proteínas de unión al ARN que son homólogas de la proteína ELAV de Drosophila. Inicialmente se identificaron en seres humanos como dianas de autoanticuerpos en pacientes con ENCEFALOMIELITIS PARANEOPLÁSICA. Se piensa que regulan la EXPRESIÓN GÉNICA a nivel postranscripcional.
Conformación de Ácido Nucleico
ARN no Traducido
ARN que no codifica para proteína pero que tiene alguna función enzimática, estructural o regulatoria. Aunque el ARN ribosómico (ARN RIBOSÓOMICO) y ARN de transferencia;(ARN DE TRANSFERENCIA) son también ARNs no traducidos, ellos no están incluidos en este alcance.
ARN sin Sentido
Moléculas de ARN que se hibridizan con secuencias complementarias tanto en ARN o ADN y alteran la función de esta última. Los ARNs endógenos antisentido funcionan como reguladores de la expresión genética por una variedad de mecanismos. Los ARNs sintéticos antisentido se utilizan para afectar el funcionamiento de genes específicos para fines investigativos o terapéuticos.
ARN de Hongos
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Precursores del ARN
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
ARN Catalítico
ARN que tiene actividad catalítica. Tiene una secuencia que se enrolla para formar una superficie compleja que puede funcionar como una enzima en las reacciones con si mismo y con otras moléculas. Puede darse incluso en ausencia de proteina. Existen numerosos ejemplos de especies de ARN que actuan sobre el ARN catalítico, aunque el alcance de esta clase de enzima no se limita a un tipo particular de sustrato.
ARN Protozoario
ARN Polimerasa II
ARN polimerasa dependiente de ADN, presente en células bacterianas, vegetales y animales. Funciona en la estructura nucleoplasmática y transcribe ADN en ARN. Tiene requerimientos diferentes para cationes y sal de la ARN polimerasa I y resulta fuertemente inhibica por la alfa-amanitina. EC 2.7.7.6.
ARN Helicasas
Familia de proteínas que promueven la anulación de ARN durante el empalme y la traducción.
Línea Celular
Pliegue del ARN
Los procesos de formación de la estructura terciaria del ARN.
Secuencias Reguladoras de Ácido Ribonucleico
Secuencias dentro del ARN que regulan el procesamiento, la estabilidad (ESTABILIDAD DEL ARN) o la traducción de ARN (vea BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS).
Northern Blotting
Detección del ARN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa u otro tipo de papel o membrana de nylon.
ARN Pequeño no Traducido
ARN Nuclear Pequeño
Cadenas cortas de ARN (100-300 nucleótidos de largo) abundantes en el núcleo y que usualmente forman complejos con las proteínas en las ARNnps (RIBONUCLEOPROTEÍNAS, NUCLEARES PEQUEÑAS). Muchas funcionan en el procesamiento de los precursores del ARN mensajero. Otros, los ARNnops (ARN, NUCLEOLAR PEQUEÑO), participan en el procesamiento de los precursores del ARN ribosómico.
Dactinomicina
Sustancia compuesta de dos PÉPTIDOS CÍCLICOS añadidos a la fenoxazina, que deriva del STREPTOMYCES parvullus. Se úne al ADN e inhibe la síntesis de ARN (transcripción), siendo la elongación de la cadena más sensible que la iniciación, terminación o la liberación. Como resultado de la producción alterada de ARNm, la síntesis proteica también declina después del tratamiento con dactinomicina (Traducción libre del original: AMA Drug Evaluations Annual, 1993, p2015).
Caperuzas de ARN
Estructuras de ácido nucleico que se encuentran en el extremo 5' del ARN mensajero celular de eucariotes y de virus y de algunos ARN nucleares heterogéneos. Estas estructuras, que tienen carga positiva, protegen en sus sitios terminales a los ARNs especificados antes contra el ataque de fosfatasas y otras nucleasas y estimulan el funcionamiento del ARN mensajero en el inicio de la traducción. Los ANÁLOGOS DE CAPERUZA DE ARN, que no poseen carga positiva e inhiben la iniciación de la síntesis de proteínas.
Silenciador del Gen
Procesamiento Proteico-Postraduccional
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Variación de la técnica PCR en la que el cADN se hace del ARN mediante transcripción inversa. El cADN resultante se amplifica usando los protocolos PCR estándares.
Regiones no Traducidas 5'
Secuencia en el extremo 5' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta secuencia contiene el sitio de unión del ribosoma y otras secuencias que regulan la transcripción y la traducción.
Transporte de ARN
El proceso de pasar moléculas específicas de ARN de un compartimento celular o región a otra por diversas operaciones de selección y mecanismos de transporte.
ARN Helicasas DEAD-box
Gran familia de ARN helicasas que comparten un motivo proteico común con la secuencia de aminoácidos de una única letra D-E-A-D (Asp-Glu-Ala-Asp). Además de la actividad ARN helicasa, los miembros de la familia DEAD-box participan en otros aspectos del metabolismo del ARN y en la regulación de la función del ARN.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Regiones Promotoras Genéticas
Secuencia de Aminoácidos
Proteína de Factor 1 del Huésped
Factor de integración del huésped, que originariamente fue identificado como una proteína bacteriana necesaria para la integración del bacteriófago Q beta (ALOLLEVIVIRUS). Su función celular puede ser la de regular la estabilidad y procesamiento del ARNm ya que se une estrechamente al poli(A)ARN e interfiere con las uniones ribosómicas.
Mutación
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Poliadenilación
Adición de una parte de ácido poliadenílico (POLI A)a la terminal 3' del ARNm (ARN MENSAJERO). La poliadenilación implica el reconocimiento de la señal de lugar de procesamiento (AAUAAA)y división del ARNm para crear un terminal 3' OH al que la polimerasa poli A (POLINUCLEÓTIDO ADENILILTRANSFERASA)adiciona 60-200 residuos de adenilato. La terminal 3' procesada por algunos ARNs mensajeros, como la histona ARNm histona es llevado a cabo por un proceso diferente que no incluye la adición de poli A como se describe aqui.
Polirribosomas
Estructura multirribosómica que representa una secuencia lineal de RIBOSOMAS los cuales se mantienen unidos por el ARN MENSAJERO. Estos polirribosomas constituyen los complejos activos en la síntesis proteica celular y son capaces de incorporar los aminoácidos a los polipéptidos tanto in vivo como in vitro. (From Rieger, et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
ARN Nuclear
Moléculas de ARN que se encuentran en el núcleo, asociadas con cromosomas o en el nucleoplasma.
Poli A
Células HeLa
Regulación hacia Abajo
Proceso que disminuye las interacciones ligando/receptor debido a una reducción en el número de receptores disponibles. Esto puede ser resultado de la introversión del complejo ligando/receptor o de una expresión reducida del receptor. Clásicamente el concepto se refiere a los receptores de hormonas, pero el uso contemporáneo incluye otros receptores de la superficie celular.
Empalme Alternativo
Proceso en el cual muchas transcripciones de ARN se generan a partir de un solo gen. El empalme alternativo implica el empalme conjunto de otros conjuntos posibles de EXONAS durante el procesamiento de algunas, aunque no todas, las transcripciones del gen. Por tanto, una exona particular puede estar conectada a cualquiera de las diversas exonas alternativas para formar un ARN maduro. Las formas alternativas maduras de ARN MENSAJERO producen ISOFORMAS DE PROTEÍNAS en las que una parte de las isoformas es común, mientras que las otras partes son diferentes.
Cicloheximida
Células Cultivadas
Regiones no Traducidas
Partes de la secuencia del ARN mensajero que no codifica para productos, es decir, REGIONES 5' NO TRADUCIDAS y REGIONES 3' NO TRADUCIDAS.
Ribonucleasa III
Una endorribonucleasa que es específica para ARN bicatenario. Juega un rol en el PROCESAMIENTO DEL ARN POSTRANSCRIPCIONAL del pre-ARN RIBOSOMICO y una variedad de otras estructuras del ARNA que contienen regiones bicatenarias.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Hibridación de Ácido Nucleico
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
ARN de Helminto
Proteínas Argonauta
Familia de proteínas de unión a ARN que tienen especificidad por las MICROARNS y moléculas del ARN INTERFERENTE PEQUEÑO. Las proteínas participan del procesamiento del ARN como componentes básicos del complejo silenciador inducido por ARN.
Unión Proteica
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Regulación de la Expresión Génica de las Plantas
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial de la acción del gen en las plantas.
Ribonucleoproteínas Nucleares Heterogéneas
Familia de ribonucleoproteínas encontradas originalmente como proteínas unidas a tránscritos de ARN nacientes en forma de partículas de ribonucleoproteínas. Aunque consideradas ribonucleoproteínas, fueron clasificadas en principio atendiendo a su componente proteico. Se hallan implicadas en una variedad de procesos tales como empaquetamiento del ARN y TRANSPORTE del ARN dentro del núcleo. Un subgrupo de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas se hallan implicadas en otras funciones, como el transporte intracitoplásmico (TRANSPORTE ACTIVO, NÚCLEO CELULAR) del ARN y la estabilidad del ARNm en el CITOPLASMA.
Genes Reporteros
ARN Guia
Pequeño ARN mitocondrial cinetoplástido que desempeña un importante rol en la EDICIÓN DEL ARN. Estas moléculas forman híbridos perfectos con las secuencias editadas de ARNm y poseen secuencias de nucleótidos en sus extremos 5' que son complementarias con las secuencias del ARNm que están inmediatamente corriente abajo de las regiones preeditadas.
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Sitios de Unión
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
ARN Ligasa (ATP)
Enzima que cataliza la conversión del ARN lineal en una forma circular mediante la transferencia de 5'-fosfato hacia el terminal 3'-hidroxilado. También cataliza la unión covalente de dos polirribonucleótidos en la conexión fosfodiéster. EC 6.5.1.3.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
ARN Nuclear Heterogéneo
ARN nuclear no ribosómico con más de 1000 nucleótidos, cuya masa se sintetiza rápidamente y se degrada dentro del núcleo celular. Algunos ARN nucleares heterogéneos pueden ser precursores del ARNm. Sin embargo, la gran mayoría del ARNnh total forma un híbrido con el ADN nuclear en lugar de con el ARNm.
Endorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación endonucléolítica del ARN. Incluye EC 3.1.26.-, EC 3.1.27.-, EC 3.1.30.- y EC 3.1.31.-.
Tristetraprolina
MOTIVO DEDO DE ZINC que contiene un factor de transcripción originalmente identificado como una de las PROTEÍNAS INMEDIATAS TEMPRANAS. Conecta el CITOPLASMA con el NÚCLEO CELULAR y está involucrado en la desestabilización de ARNm por el FACTOR DE NECROSIS TUMORAL ALFA.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Citoplasma
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Modelos Genéticos
Tabaco
Western Blotting
Vida Media
ARN Polimerasa III
ARN polimerasa dependiente de ADN, presente em células bacterianas, vegetales y animales. Funciona en la estructura nucleoplasmática, donde transcribe ADN en ARN. Tiene requerimientos específicos para cationes y sal y ha mostrado sensibilidad intermedia a la alfa-amanitina en comparación con la ARN polimerasas I y II. EC 2.7.7.6.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Transcriptoma
El patrón de EXPRESIÓN GÉNICA a nivel de la transcripción genética en un organismo específico o bajo circunstancias específicas en las células específicas.
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
ARN Nucleolar Pequeño
ARNs nucleares pequeños que participan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico en el nucleolo. La caja C/D contiene ARNnop's (U14, U15, U16, U20, U21 y U24-U63) dirige la metilación específica del sitio de diversas porciones de ribosa. La caja H/ACA que contiene ARNnop's (E2, E3, U19, U23, y U64-U72) dirige la conversión de uridinas específicas a pseudouridina. La escisión en sitios específicos que se produce en los ARNs ribosómicoa maduros es dirigida por ARNnop's U3, U8, U14, U22 y los componentes ARNnop's de la ARNasa MRP y ARNasa P.
Ribonucleasas
Enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces éster dentro del ARN. EC 3.1.-.
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
ARN Polimerasa I
ARN polimerasa dependiente de ADN presente en células bacterianas, vegetales y animales. La enzima funciona en la estructura nucleolar y transcribe ADN a ARN, Tiene requerimientos diferentes para cationes y sales de la ARN polimerasa II y III, y no es inhibida por la alfa-amanitina. EC 2.7.7.6.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Plantas Modificadas Genéticamente
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo D
ARN Ribosómico 28S
Constituyente de la subunidad 60S de los ribosomas eucarióticos. El rARN 28S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Emparejamiento Base
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Saccharomyces cerevisiae
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
ARN de Archaea
ARN Largo no Codificante
Clase de moléculas de ARN no traducidas que son generalmente mayores a 200 nucleótidos de longitud y que no codifican para las proteínas. Miembros de esta clase se ha encontrado que desempeñan un papel en la regulación transcripcional, procesamiento post-transcripcional, REMODELACIÓN DE LA CROMATINA y en el control epigenético de la cromatina.
Biología Computacional
Campo de la biología relacionada con el desarrollo de técnicas para la recolección y manipulación de datos biológicos, y la utilización de estos datos para hacer descubrimientos biológicos o predicciones. Este campo abarca todos los métodos computacionales y teorías para la solución de problemas biológicos, incluyendo la manipulación de modelos y conjuntos de datos.
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Proteínas Nucleares
Regulación Neoplásica de la Expresión Génica
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Proteínas Reguladoras del Hierro
Replicación Viral
ARN del Cloroplasto
Células Tumorales Cultivadas
Oligorribonucleótidos
Proteína 1 Reguladora de Hierro
proteína multifuncional de hierro-azufre que es a la vez proteína reguladora del hierro y forma citoplásmica de la aconitato hidratasa. Se une a los elementos reguladores del hierro en los ARNm implicados en el metabolismo del hierro y regula su traducción. Su capacidad para unirse al ARN y su actividad aconitato hidrolasa dependen de la disponibilidad de HIERRO.
ARN Ribosómico 18S
Constituyente de la subunidad 40S de los ribosomas de eucariotas. El rARN 18S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Hígado
Diferenciación Celular
Sistemas de Lectura Abierta
Complejo Silenciador Inducido por ARN
Complejo ribonucleoproteico con múltiples componentes conformado por una de la familia de las PROTEÍNAS ARGONAUTAS y el "hilo guía" de uno de los 20 a 30 nucleótidos ARNs pequeños. RISC separa ARNs específicas, que se destinan a la degradación por homología con estos pequeños ARNs. Funciones en la regulación de la expresión genética son determinadas por las proteínas argonautas específicas y ARN pequeño incluyendo ARNsi (ARN INTERFERENTE PEQUEÑO), ARNmi (MICROARN), o ARNpi (ARN DE INTERACCIÓN PIWI).
Regulación hacia Arriba
Efecto regulatorio positivo sobre procesos fisiológicos a nivel molecular, celular o sistémico. A nivel molecular, los lugares de regulación principales incluyen los receptores de membrana, genes (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA)ARNm (ARN MENSAJERO)y proteinas.
Plantas Tóxicas
Plantas o partes de plantas que son peligrosas para el hombre y otros animales.
Trypanosoma brucei brucei
Regulación Viral de la Expresión Génica
ARN Ribosómico 16S
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
ARN Ribosómico 23S
Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Inhibidores de la Síntesis de la Proteína
Compuestos que inhiben la síntesis de proteínas. Generalmente son AGENTES ANTIBACTERIANOS o toxinas. El mecanismo de acción de la inhibición incluye la interrupción de la prolongación de la cadena peptídica, el bloqueo del sitio A de los ribosomas, la lectura errónea del código genético o el impedimiento de la unión de las cadenas laterales de los oligosacáridos con las glicoproteínas.
Uridina
Uridina es una nucleósido pirimidina, un componente fundamental de ARN y fuente de energía y estructura para células vivas.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Arabidopsis
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Genes
Transgenes
Genes que son introducidos en un organismo empleando TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GENES.
Redes Reguladoras de Genes
Subsistemas reguladores codificados por ADN relacionados que se encuentran en el GENOMA y coordinan la entrada desde FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN activadores y represores durante el desarrollo, la diferenciación celular o en respuesta a estímulos ambientales. Las redes funcionan para en última instancia especificar la expresión de conjuntos concretos de GENES para estados, momentos o lugares específicos.
Células HEK293
Proteínas de Plantas
Proteínas que se encuentran en plantas (flores, hierbas, arbustos, árboles, etc.). El concepto no incluye a proteínas que se encuentran en las verduras para los que las PROTEÍNAS DE VERDURAS están disponibles.
Virus de Plantas
Virus parásitos de plantas que son superiores a las bacterias.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Inmunoprecipitación
Factores de Tiempo
Evolución Molecular
Genes de Plantas
Unidades funcionales hereditarias de las PLANTAS.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
ARN Lider Empalmado
Satélite de ARN
Moléculas de ARN pequeña, lineal y de una sola cadena que actúan funcionalmente como parásitos moleculares de ciertos virus ARN de plantas. Los ARNs satélites muestran cuatro rasgos característicos: 1) requieren de virus auxiliares para replicarse; 2) son innecesarias para la replicación de virus auxiliares; 3) están encapsulados en el envoltorio proteico del virus auxiliar; 4) no tienen gran homología de secuencia con el virus auxiliar. Así estos difieren del VIRUS SATÉLITE que codifican su propia proteína del envoltorio, y del ARN genómico (=ARN, VIRAL) de los virus satélites.
Exones
Las partes de una transcripción de un GEN que queda después que los INTRONES se remueven. Son ensambles que se convierten en un ARN MENSAJERO u otro ARN funcional.
Estructuras Citoplasmáticas
Componentes del citoplasma excluyendo el CITOSOL.
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ácido nucléico que intervienen en la regulación de la expresión de genes.
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
ARN de Transferencia de Lisina
Caenorhabditis elegans
Fenotipo
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Proteínas de Unión a Poli(A)
Proteínas Recombinantes de Fusión
Técnicas de Silenciamiento del Gen
La inducción artificial del SILENCIADOR DEL GEN por el uso de la INTERFERENCIA DE ARN para reducir la expresión de un gen específico. Se incluye el uso de ARN BICATENARIO, tales como los ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS y ARN que contenga SECUENCIA DE LA HORQUILLA EN BUCLE, y OLIGONUCLEÓTIDOS ANTISENTIDO.
ARN de Transferencia de Fenilanina
Inducción Enzimática
Ribonucleasa T1
Enzima que cataliza la segmentación endonucleolítica del ARN en la posición 3' de un residuo de guanilato. EC 3.1.27.3.
Amanitinas
Péptidos cíclicos extraídos de los carpóforos de varias especies de homgos. Son potentes inhibidores de las ARN polimerasas en la mayoría de las especies eucarióticas, bloqueando la producción de ARNm y la síntesis protéica. Estos péptidos son importantes en el estudio de la transcripción. La alfa-amanitina es la principal toxina de la especie Amanita phalloides, que es venenosa si la ingieren los humanos o animales.
Oligonucleótidos
Polímero constituido por pocos nucleótidos (de 2 a 20). En genética molecular, secuencia pequeña sintetizada para igualar a una región donde se sabe que ocurre una mutación y luego usada como detector (SONDA DE OLIGONUCLEÓTIDO). (Dorland, 28a ed)
Proteínas de Unión al ADN
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Endonucleasas Específicas del ADN y ARN con un Solo Filamento
Enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica de las regiones monocatenarias de las moléculas de ADN o ARN, dejando las regiones bicatenarias intactas. Son particularmente útiles en el laboratorio para producir moléculas de ADN de "extremos romos"; con terminaciones monocatenarias sensibles para TÉCNICAS GENÉTICAS, tales como ENSAYOS DE PROTECCIÓN DE NUCLEASAS que involucran la detección de ADN y ARN monocatenarios.
Anticodón
Conjunto secuencial de tres nucleótidos en el ARN DE TRANSFERENCIA, que interactúa con su secuencia complementaria en el ARN MENSAJERO, el CODÓN, durante el proceso de traducción en el ribosoma.
Modelos Moleculares
Moldes Genéticos
Moldes macromoleculares para la síntesis de macromoléculas complementarias, como ocurre en la REPLICACIÓN DEL ADN, TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de ADN a ARN y la TRADUCCIÓN GENÉTICA de ARN a POLIPÉPTIDOS.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Hibridación in Situ
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Drosophila
Isoformas de Proteínas
Diferentes formas de una proteína que puede ser producida a partir de genes diferentes, o por el mismo gen por uniones alternativas.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Drosophila melanogaster
Sitios de Empalme de ARN
Secuencias de nucleótidos localizadas en las terminaciones de las EXONAS e identificadas en ARN premensajero por las ESPLICEOSOMAS. Se unen durante la reacción de EMPALME DEL ARN, formando las uniones entre las exonas.
Ribonucleoproteína Heterogénea-Nuclear Grupo A-B
Clase de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas muy relacionadas, de aproximadamente 34-40 kD de tamaño. Aunque generalmente se encuentran en el nucleoplasma, también hacen de enlace entre el núcleo y el citoplasma. Se ha demostrado que los miembros de esta clase tienen una función en el transporte de ARNm, biogénesis telómera y EMPALME DEL ARN.
Activación Transcripcional
Motivos de Nucleótidos
Comúnmente observados SECUENCIA DE BASES o nucleótidos componentes estructurales que pueden ser representados por una SECUENCIA DE CONSENSO o una SECUENCIA LOGO.
Relojes Circadianos
Mecanismo biológico que controla el RITMO CIRCADIANO. Los relojes circadianos existen en forma más simple en la cianobacteria y, sistemas más complejos en hongos, plantas y animales. En los humanos el sistema incluye fotorespuesta a CÉLULAS GANGLIONARES DE LA RETINA y el NÚCLEO SUPRAQUIASMÁTICO, que actúa como el oscilador central.
Eliminación de Secuencia
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Especificidad de Órganos
División del ARN
Una reacción que corta uno de los enlaces azúcar-fosfato de la columna fosfodiéster del ARN. Es catalizada enzimáticamente, químicamente o por radiación. La división puede ser exonucleolítica o endonucleolítica.