Iniciación de la Transcripción Genética
El proceso que inicia la transcripción de una molécula de ARN. Se incluye el ensamblaje del complejo de iniciación y el establecimiento del sitio de inicio.
Terminación de la Transcripción Genética
La interrupción de la transcripción al final de una unidad de transcripción, incluyendo el reconocimiento de sitios de terminación y la liberación de la molécula de ARN recién sintetizado.
Elongación de la Transcripción Genética
Transcripción Genética
Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Instituciones Privadas de Salud
Secuencia de Bases
Factor de Transcripción Sp1
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Sistemas de Mensajero Secundario
Sistemas en los cuales se genera una señal intracelular como respuesta a un mensajero intercelular primario, por ej., una hormona o neurotransmisor. Son señales intermedias en procesos celulares tales como metabolismo, secreción contracción, fototransducción y crecimiento celular. Ejemplos de sistemas de mensajeros secundarios lo son: el sistema del AMP cíclico-adenil ciclasa, el sistema del fosfatidil inositol difosfato-inositol trifosfato y el sistema del GMP cíclico.
Activación Transcripcional
Línea Celular
Sitios de Unión
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Proteínas de Unión al ADN
Hedyotis
Proteínas Nucleares
Secuencia de Aminoácidos
Sitio de Iniciación de la Transcripción
El primer nucleótido de una secuencia de ADN transcrita donde la ARN polimerasa (ARN POLIMERASAS DIRIGIDAS POR ADN) comienza la síntesis de la transcripción de ARN.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Mutación
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
ARN Polimerasa II
ARN polimerasa dependiente de ADN, presente en células bacterianas, vegetales y animales. Funciona en la estructura nucleoplasmática y transcribe ADN en ARN. Tiene requerimientos diferentes para cationes y sal de la ARN polimerasa I y resulta fuertemente inhibica por la alfa-amanitina. EC 2.7.7.6.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Factor de Transcripción AP-1
Factor multiproteico compuesto por los productos de los proto-oncogenes c-jun y c-fos. Estas proteínas deben formar dímeros para unirse al sitio de reconocimiento AP-1, conocido también como el elemento de respuesta TPA (TRE). El AP-1 controla tanto la transcripción basal como la inducible de varios genes.
Células HeLa
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Factor de Transcripción STAT3
Células Cultivadas
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Variación de la técnica PCR en la que el cADN se hace del ARN mediante transcripción inversa. El cADN resultante se amplifica usando los protocolos PCR estándares.
Factores de Transcripción con Motivo Hélice-Asa-Hélice Básico
Familia de factores de transcripción de unión al ADN que contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE de carácter básico.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Genes Reporteros
Factores de Transcripción TFII
Los llamados factores generales de transcripción que se unen a la ARN POLIMERASA II y que son necesarios para iniciar la transcripción. Ellos incluyen a TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFII-I, y TFIIJ. Aparentemente, in vivo se unen en un proceso de pasos múltiples y ordenados y/o pueden formar un gran complejo de preiniciación llamado holoenzima ARN polimerasa II.
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Factor de Transcripción TFIID
Principal componente de unión al ADN de secuencia específica involucrado en la activación de transcripción de ARN POLIMERASA II. En un principio se describió como un complejo de PROTEÍNA DE UNIÓN A TATA-BOX y a FACTORES ASOCIADOS CON LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA. Actualmente se sabe que las PROTEÍNAS SIMILARES A LA PROTEÍNA DE UNIÓN TATA-BOX puede realizar la función de la proteína de unión TATA-box en el complejo.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Proteínas de Homeodominio
Proteínas que se codifican por los genes "homeobox" (GENES, HOMEOBOX) que muestran similitud estructural con ciertas proteínas unidas al ADN de procariotes y eucariotes. Las proteínas del homeodominio participan en el control de la expresión genética durante la morfogénesis y el desarrollo (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN DEL GEN, DESARROLLO).
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ácido nucléico que intervienen en la regulación de la expresión de genes.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Factores de Transcripción con Cremalleras de Leucina de Carácter Básico
Gran superfamilia de factores de transcripción que contienen una región rica en residuos de AMINOÁCIDOS BÁSICOS seguida por un dominio CREMALLERA DE LEUCINAS.
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Factores de Transcripción Forkhead
Subclase de proteínas winged helix de unión al ADN, homólogas de su predecesor, la proteína "fork head" de Drosophila.
Diferenciación Celular
Elementos de Facilitación Genéticos
Factor de Transcripción TFIIB
Factor de transcripción específico de la ARN POLIMERASA II. Tiene una función en la reunión del complejo de preiniciación transcripcional pol II y ha sido implicado como objetivo de los activadores transcripcionales específicos de genes.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Saccharomyces cerevisiae
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Northern Blotting
Detección del ARN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa u otro tipo de papel o membrana de nylon.
Factor de Transcripción AP-2
Familia de proteínas de unión al ADN que regulan la expresión de diversos GENES durante la DIFERENCIACIÓN CELULAR y la APOPTOSIS. Los miembros de esta familia contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE básico carboxiterminal altamente conservado, involucrado en la dimerización y la secuencia específica de unión del ADN.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Factor de Transcripción STAT1
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Factor de Transcripción YY1
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
TATA Box
Una secuencia conservada rica en A-T que está contenida en los promotores para la ARN polimerasa II. El segmento tiene una longitud de siete pares de bases y los nucleótidos más comunmente hallados son TATAAAA.
Factores de Transcripción de Tipo Kruppel
Familia de factores de transcripción dedos de zinc que son homólogos de la proteína Kruppel de Drosophila. Entre los MOTIVOS DEDOS DE ZINC contienen una secuencia espaciadora de siete aminoácidos muy conservada.
Fosforilación
Factor de Transcripción Sp3
Factor de transcripción proteína de especificidad que regula la expresión de diversos genes, como el FACTOR DE CRECIMIENTO DEL ENDOTELIO VASCULAR y el INHIBIDOR P27 DE CINASA DEPENDIENTE DE LA CICLINA.
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Células Tumorales Cultivadas
FN-kappa B
Activador transcripcional nuclear, ubicuo, inducible, que se une a los elementos activadores en muchos tipos celulares diferentes y se activa por estímulos patógenos. El complejo FN-kappa B es un heterodímero compuesto por dos subunidades que se unen al ADN: FN-kappa B1 y relA.
Operón
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Factores de Transcripción NFATC
Familia de factores de transcripción que se caracterizan por la presencia de y calcineurina-dominios altamente conservadas de unión al ADN. Proteínas NFAT se activan en el CITOPLASMA de la fosfatasa CALCINEURINA dependiente de calcio. Ellos transducen señales de calcio al núcleo donde pueden interactuar con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN AP-1 o FN-KAPPA B e iniciar la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de genes implicados en la DIFERENCIACIÓN CELULAR y desarrollo. Proteínas NFAT estimulan la activación del LINFOCITO T a través de la inducción de GENES INMEDIATOS PRECOCES como la INTERLEUCINA-2.
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Factor de Transcripción Activador 2
Factor de transcripción activador que regula la expresión de diversos GENES, como los GENES C-JUN, CICLINA A, CICLINA D1 y el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN ACTIVADOR 3.
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Western Blotting
Homología de Secuencia de Aminoácido
Modelos Genéticos
Genes
Factor de Transcripción GATA4
Factor de transcripción GATA que se expresa en el MIOCARDIO del corazón en desarrollo y que se ha relacionado con el proceso de diferenciación de los MIOCITOS CARDÍACOS. El factor GATA4 se activa mediante FOSFORILACIÓN y regula la transcripción de genes cardioespecíficos.
Hibridación de Ácido Nucleico
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Regulación hacia Abajo
Proceso que disminuye las interacciones ligando/receptor debido a una reducción en el número de receptores disponibles. Esto puede ser resultado de la introversión del complejo ligando/receptor o de una expresión reducida del receptor. Clásicamente el concepto se refiere a los receptores de hormonas, pero el uso contemporáneo incluye otros receptores de la superficie celular.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Factor de Transcripción Activador 3
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Mapeo Restrictivo
Factor de Transcripción E2F1
Factor de transcripción E2F que interactúa directamente con la PROTEÍNA DEL RETINOBLASTOMA y la CICLINA A, y activa la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA necesaria para la entrada en el CICLO CELULAR y la síntesis de ADN. El factor E2F1 está relacionado con la reparación del ADN y con la APOPTOSIS.
Regulación Viral de la Expresión Génica
Factores de Transcripción Básicos con Cremalleras de Leucinas y Motivos Hélice-Asa-Hélice
Familia de factores de transcripción que contienen regiones ricas en residuos básicos, dominios CREMALLERA DE LEUCINAS y MOTIVOS HÉLICE-GIRO-HÉLICE.
Genes Reguladores
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Regulación hacia Arriba
Efecto regulatorio positivo sobre procesos fisiológicos a nivel molecular, celular o sistémico. A nivel molecular, los lugares de regulación principales incluyen los receptores de membrana, genes (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA)ARNm (ARN MENSAJERO)y proteinas.
Moldes Genéticos
Moldes macromoleculares para la síntesis de macromoléculas complementarias, como ocurre en la REPLICACIÓN DEL ADN, TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de ADN a ARN y la TRADUCCIÓN GENÉTICA de ARN a POLIPÉPTIDOS.
Factores de Transcripción TCF
Familia de proteínas de unión al ADN que se expresan principalmente en los LINFOCITOS T. Estas proteínas interaccionan con la BETA CATENINA y actúan como activadores y represores transcripcionales en diversos procesos del desarrollo.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Factor de Transcripción TFIIH
Factor de transcripción general que está implicado en la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA basal y la REPARACIÓN DEL ADN. Consta de nueve subunidades, que incluyen ADN HELICASAS dependientes del ATP, ciclina H y la PROTEÍNA DEL XERODERMA PIGMENTOSO DEL GRUPO D.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Factor de Transcripción ReIA
Factor de Transcripción STAT5
Transductor de señales y activador de la transcripción que interviene en las respuestas celulares a diversas CITOCINAS. La activación de Stat5 se asocia a la transcripción de reguladores del CICLO CELULAR, como el INHIBIDOR P21 DE CICLINA-CINASA y de genes antiapoptóticos tales como los GENES BCL-2. Stat5 está constitutivamente activado en muchos pacientes con LEUCEMIA MIELOIDE aguda.
Proteína de Unión a Elemento de Respuesta al AMP Cíclico
Proteína que ha demostrado que funciona como factor de transcripción regulado por el calcio, además de ser un sustrato para la PROTEÍNA QUINASA DEPENDIENTE DE CA(2+)-CALMODULINA, activada por la despolarización. Esta proteína actúa integrando tanto las señales del calcio como del AMP cíclico.
Proteína de Unión a TATA-Box
Factor de transcripción general que desempeña un papele principal en la activación de los genes aucarióticos, transcritos por ARN POLIMERASAS. Se une específicamente al elemento promotor de TATA BOX, situado muy próximo a la posición de la iniciación de la transcripción en el ARN transcrito por la ARN POLIMERASA II. Aunque considerado como componente principal del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID, participa también en los complejos generales de factores de transcripción implicados en la transcripción de ARN POLIMERASA I y ARN POLIMERASA II.
Huella de ADN
Método para determinar la especificidad de secuencia de las proteínas que enlazan con el ADN. La dermatoglifia del ADN utiliza un agente que daña el ADN (ya sea un reactivo químico o una nucleasa) que rompe el ADN en cada par de bases. La ruptura del ADN es inhibida donde el ligando enlaza con el ADN.
Factores de Transcripción Paired Box
Familia de factores de transcripción que controlan el DESARROLLO EMBRIONARIO de diversas estirpes celulares. Se caracterizan por poseer un dominio de unión al ADN emparejado altamente conservado que se identificó por vez primera en genes de segmentación de DROSOPHILA.
Factores de Transcripción MEF2
La activación de factores de transcripción de la familia MADS que se unen a un elemento de secuencia específica (elemento MEF2) en muchos genes específicos de músculo y están involucrados en la miogénesis esquelética y cardíaca, la diferenciación neuronal y la supervivencia / apoptosis.
Hibridación in Situ
Cloranfenicol O-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la acetilación del cloranfenicol para formar cloranfenicol 3-acetato. Como el cloranfenicol 3-acetato no se enlaza con los ribosomas bacterianos y no es un inhibidor de peptidiltransferasa, la enzima es la responsable de la resistencia natural al cloranfenicol en las bacterias. La enzima, de la cual se conocen variantes, está presente en bacterias tanto gramnegativas como granpositivas. EC 2.3.1.28.
Proteínas Proto-Oncogénicas
Factores de Transcripción Activadores
Los factores de transcripción activadores se identificaron originalmente en PROTEÍNAS FIJADORAS DE ADN que interactúan con los PROMOTORES TEMPRANOS de ADENOVIRUS. Son una familia de factores de transcripción de cremalleras de leucinas de naturaleza básica que se unen al sitio de consenso de TGACGTCA del elemento de respuesta del AMP cíclico y se hallan estrechamente relacionados con la PROTEÍNA FIJADORA DE ADN QUE RESPONDE AL AMP CÍCLICO.
ARN Polimerasa III
ARN polimerasa dependiente de ADN, presente em células bacterianas, vegetales y animales. Funciona en la estructura nucleoplasmática, donde transcribe ADN en ARN. Tiene requerimientos específicos para cationes y sal y ha mostrado sensibilidad intermedia a la alfa-amanitina en comparación con la ARN polimerasas I y II. EC 2.7.7.6.
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Factor 1 de Transcripción de Unión a Octámeros
Factor de transcripción octámero que se manifiesta ubicuamente, que regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA del ARN NUCLEAR PEQUEÑO, GENES DE INMUNOGLOBULINAS y genes de HISTONAS H2b.
Factores de Transcripción NFI
Factores de transcripción originalmente identificados como proteínas de unión al ADN específicas de sitios, esenciales para la REPLICACIÓN DEL ADN en los ADENOVIRUS. Son importantes para el desarrollo y el funcionamiento de la GLÁNDULA MAMARIA.
Factor de Transcripción GATA1
Factor de transcripción GATA que se expresa específicamente en los linajes hematopoyéticos y desempeña una función importante en la DIFERENCIACIÓN CELULAR de las CÉLULAS ERITROIDES y los MEGACARIOCITOS.
Eliminación de Secuencia
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Proteínas del Complejo de Iniciación de Transcripción Pol1
Factores que forman un complejo pre-iniciador en los promotores, especificamente transcritos por la ARN POLIMERASA I.
Conformación de Ácido Nucleico
Factores de Transcripción GATA
Familia de factores de transcripción que contienen dos MOTIVOS DEDO DE ZINC y se unen a la secuencia (A/T)GATA(A/G) del ADN.
Subunidad Apc5 del Ciclosoma-Complejo Promotor de la Anafase
Subunidad del complejo promotor de la anafase, cuya función principal es la de proporcionar un soporte estructural para los módulos catalíticos y de reconocimiento de sustrato del complejo Apc5 junto con el complejo Apc4, atando el subcomplejo de unión al coactivador de tetratricopéptido a la principal subunidad estructural, Apc1.
Factor de Transcripción TFIIA
Factor de transcripción específico ARN POLIMERASA II. Puede tener una función en la activación transcripcional de la expresión genética interactuando con la PROTEÍNA DE UNIÓN A TATA-BOX, componente del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID.
ARN Bacteriano
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Regiones Terminadoras Genéticas
Secuencias de ADN reconocidas como señales para finalizar la TRANSCRIPCION GENÉTICA.
Factores de Transcripción E2F
Familia de factores básicos de transcripción hélice-bucle-hélice que controlan la expresión de una variedad de GENES implicados en la regulación del CICLO CELULAR. Factores de transcripción E2F típicamente forman complejos heterodiméricos con FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DP1 o factor de transcripción DP2, y tienen dominios de dimerización de unión a ADN y N-terminal. Factores de transcripción E2F pueden actuar como mediadores de la represión de la transcripción o la activación transcripcional.
Proteínas Portadoras
Factor de Transcripción GATA2
Ratones Consanguíneos C57BL
Regulación de la Expresión Génica de las Plantas
ARN Polimerasa I
ARN polimerasa dependiente de ADN presente en células bacterianas, vegetales y animales. La enzima funciona en la estructura nucleolar y transcribe ADN a ARN, Tiene requerimientos diferentes para cationes y sales de la ARN polimerasa II y III, y no es inhibida por la alfa-amanitina. EC 2.7.7.6.
Complemento C2
Componente de la VÍA CLÁSICA DEL COMPLEMENTO. C2 es partido por el COMPLEMENTO C1S activado en COMPLEMENTO C2B y COMPLEMENTO C2A. C2a, el fragmento terminal COOH que contiene una PROTEASAS DE SERINA, se combina con el COMPLEMENTO C4B para formar C4b2a (CONVERTASA DEL COMPLEMENTO C3 DE LA VÍA CLÁSICA)y el subsiguiente C4b2a3b (CONVERTASA DEL COMPLEMENTO C5 DE LA VÍA CLÁSICA).
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Regulación Neoplásica de la Expresión Génica
Factores de Tiempo
Factor de Transcripción GATA3
Factor de transcripción GATA que se encuentra principalmente en los precursores de las CÉLULAS LINFOIDES y que se ha relacionado con el proceso de DIFERENCIACIÓN CELULAR de los LINFOCITOS T COOPERADORES. La haploinsuficiencia de GATA3 se asocia a HIPOPARATIROIDISMO, HIPOACUSIA NEUROSENSORIAL y síndrome de anomalías renales.
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-jun
Proteína celular, que se une al ADN, y que es codificada por el gen c-jun (GEN, JUN). Ellas participan en el control transcripcional relacionado con el crecimiento. Parece que tienen tres funciones diferentes: dimerización (con c-fos), unión al ADN, y activación transcriptional. La transformación oncogénica puede tener lugar por la expresión constitutiva de c-jun.
Desoxirribonucleasa I
Enzima que es capaz de hidrolizar el ADN altamente polimerizado quebrando los enlaces fosfodiéster, preferencialmente adyacentes a un nucleótido de pirimidina. Cataliza la segmentación endonucleolítica del ADN dando lugar a los productos finales 5'-fosfodi- y oligonucleótido. La enzima tiene preferencia por el ADN de cadena doble. EC 3.1.21.1 (anteriormente EC 3.1.4.5).
Factor de Transcripción Activador 1
Factores de Transcripción TFIII
Factores que se unen a la ARN POLIMERASA III y que ayudan en la transcripción. Incluyen los factores de conformación TFIIIA y TFIIIC y el factor de iniciación TFIIIB. Todos se combinan para formar un complejo de preiniciación con el promotor que dirige la unión de la ARN POLIMERASA III.
Oligodesoxirribonucleótidos
Factor de Transcripción Activador 4
Factor de transcripción activador que regula la expresión de diversos GENES implicados en el metabolismo y transporte de aminoácidos. Interactúa también con la PROTEÍNA HTLV-I TRANS-ACTIVADORA.
Ratones Transgénicos
ARN Interferente Pequeño
Pequeños ARN bicatenarios no codificadores de proteínas, de 21 A 31 nucleótidos, implicados en mecanismos de SILENCIAMIENTO GÉNICO, especialmente en la INTERFERENCIA POR ARN o RIBOINTERFERENCIA (RNAi). Los RNA interferentes pequeños (siRNA) se forman endógenamente a partir de dsRNA (ARN BICATENARIOS) por acción de una misma ribonucleasa, Dícer, que genera miRNA (MICROARN). El apareamiento perfecto de la hebra antiparalela de siRNA con ARN complementarios es un paso intermedio en la RNAi, que permite la escisión de los RNA guiada por el siRNA. Los siRNA se clasifican en: siRNA que actúan en trans (tasiRNA), RNA asociados a repeticiones (rasiRNA), RNA small-scan (scnRNA) y RNA de interacción con proteínas Piwi (RNApi), y desempeñan diversas funciones específicas de silenciamiento génico.
Interferencia de ARN
Fenómeno por el cual el silenciamiento de genes específicos de ARN de doble cadena (ARN BICATENARIO) desencadena la degradación del ARNm homólogo (ARN MENSAJERO). Las moleculas del ARN de doble cadena específicos se procesan en ARN INTERFERENTE PEQUEÑO (siRNA) que sirve como una guía para la escisión del ARNm homólogo en el COMPLEJO SILENCIADOR INDUCIDO POR ARN. La METILACIÓN DE ADN también puede ser activada durante este proceso.
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Factor de Transcripción TFIIIB
Uno de los distintos factores de transcripción general, específicos para la ARN POLIMERASA III. TFIIIB recluta y posiciona el pol III sobre el sitio de iniciación y mantiene un vínculo estable con el ADN a través de múltiples vueltas de reiniciación de la ARN POLIMERASA III.
Drosophila
Proteínas Potenciadoras de Unión a CCAAT
Una clase de proteínas que fueron originariamente identificadas por su habilidad de ligarse a la secuencia de CCAAT del ADN. La proteína potenciadora de unión a CCAAT típica forma dímeros y consiste de un dominio de activación, una región básica de unión a ADN, y un dominio de dimerización rico en leucina (LEUCINA ZIPPERS). FACTOR DE ENLACE A CCAAT es estructuralmente un tipo distinto de proteína potenciadora de unión a CCAAT que consiste de un trímero de tres diferentes subunidades.
Secuencias Hélice-Asa-Hélice
Estructuras supersecundarias recurrentes caracterizadas por 20 aminoácidos que se pliegan en dos alfa hélices conectadas por un segmento de "lazo" no helicoidal. Se encuentran en muchas secuencias específicas de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN y de PROTEINAS QUE SE UNEN AL CALCIO.
Proteína 1 Similar al Factor de Transcripción 7
Factor de Transcripción TFIIIA
Uno de los distintos factores de transcripción general, específicos para la ARN POLIMERASA III. Es una proteína dedo de zinc (DEDOS DE ZINC),necesaria para la transcripción de los genes 5S ribosómicos.
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
AMP Cíclico
Nucleótido de adenina que contiene un grupo fosfato que está esterificado en las posiciones 3'- y 5'- de la molécula de azúcar. Es un segundo mensajero y un importante regulador intracelular, que funciona como mediador de la actividad para un número de hormonas, entre las que se incluyen epinefrina, glucagón, y ACTH.
Hígado
beta-Galactosidasa
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Factor de Transcripción Asociado a Microftalmía
Un factor de transcripción cremallera de leucina básica de hélice-bucle-hélice que regula la DIFERENCIACIÓN CELULAR y el desarrollo de una variedad de tipos de células que incluyen MELANOCITOS; OSTEOCLASTOS; y EPITELIO PIGMENTADO DE LA RETINA. Las mutaciones en la proteína MITF se han asociado con la OSTEOPETROSIS y SÍNDROME DE WAARDENBURG.
Factor de Transcripción GATA6
Factor de transcripción GATA que se expresa principalmente en las CÉLULAS DEL MÚSCULO LISO y regula la DIFERENCIACIÓN CELULAR del músculo liso vascular.
Sistema Libre de Células
Extracto celular fraccionado que mantiene una función biológica. Fracción subcelular aislada por ultracentrifugación u otro medio con el uso de técnicas de separación; primero debe estar aislado para que el proceso pueda estudiarse libre de todas las reacciones complejas que ocurren en una célula. El sistema libre de células, por tanto, se utiliza mucho en la biología celular.
Técnicas del Sistema de Dos Híbridos
Técnicas de cribado concebidas inicialmente en levaduras para identificar genes que codifican proteínas interactuantes. Se usan variantes para evaluar la interrelación entre las proteínas y otras moléculas. Las técnicas de dos híbridos se refieren al análisis de interacciones entre proteínas; las técnicas de un híbrido, a las interacciones entre ADN y proteína; las técnicas de tres híbridos, a las interacciones entre ARN y proteína o entre ligando y proteína. Las técnicas de n híbridos en configuración inversa se refieren al análisis de mutaciones o de moléculas pequeñas que disocian las interacciones conocidas.
Exones
Las partes de una transcripción de un GEN que queda después que los INTRONES se remueven. Son ensambles que se convierten en un ARN MENSAJERO u otro ARN funcional.
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Fibroblastos
Poli A
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Silenciador del Gen
Células COS
LÍNEA CELULAR derivada de la línea celular CV-1 mediante transformación con una replicación producida por un mutante incompleto del VIRUS 40 DE LOS SIMIOS, que codifica un largo antigeno T de tipo salvaje (ANTIGENOS TRANSFORMADORES DE POLIOMAVIRUS). Son usados para transfección y clonación. (La línea celular CV-1 ha sido derivada del riñón de un mono verde africano adulto macho (ERCOPITHECUS AETHIOPS)).
Apoptosis
Uno de los mecanismos mediante los que tiene lugar la MUERTE CELULAR (distinguir de NECROSIS y AUTOFAGOCITOSIS). La apoptosis es el mecanismo responsable de la eliminación fisiológica de las células y parece estar intrínsicamente programada. Se caracteriza por cambios morfológicos evidentes en el núcleo y el citoplasma, fraccionamiento de la cromatina en sitios regularmente espaciados y fraccionamiento endonucleolítico del ADN genómico (FRAGMENTACION DE ADN) en sitios entre los nucleosomas. Esta forma de muerte celular sirve como equilibrio de la mitosis para regular el tamaño de los tejidos animales y mediar en los procesos patológicos asociados al crecimiento tumoral.
Drosophila melanogaster
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Células 3T3
Líneas celulares cuyo procedimiento original de crecimiento consistia en seren transferidas (T) a cada 3 días e placadas a 300.000 células por placa (cápsula o disco de Petri). Las líneas se desarrollaron utilizando varias cepas diferentes de ratones. Los tejidos son generalmente fibroblastos derivados de embriones de ratones pero otros tipos y fuentes también ya fueron desarrollados. Las líneas 3T3 son sistemas de hospederos in vitro valiosos para los estudios de transformación de virus oncogénicos ya que las células 3T3 poseen una elevada sensibilidad a la INIBICION DE CONTACTO.
Proliferación de la Célula
Todos los procesos involucrados en el aumento del RECUENTO DE CELULAS. Estos procesos incluyen más que DIVISION CELULAR la cual es parte del CICLO CELULAR.
Ciclo Celular
Compleja serie de fenómenos que se producen entre el final de una DIVISIÓN CELULAR y el final de la siguiente y por la que el material celular se duplica y se divide en dos células hijas. El ciclo celular consta de la INTERFASE, que incluye la FASE G0, FASE G1, FASE S, FASE G2 y la fase de DIVISIÓN CELULAR.
Elementos Reguladores de la Transcripción
Secuencias de nucleótidos de un gen que están involucradas en la regulación de la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA.
Factor de Transcripción DP1
Factor de transcripción que posee dominios de unión al ADN y E2F pero que carece de dominio de activación transcripcional. Es una molécula de unión de los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN E2F y potencia la unión al ADN y la función de transactivación del complejo DP-E2F.
Arabidopsis
Género de plantas de la familia BRASSICACEAE que contienen PROTEÍNAS DE ARABIDOPSIS y PROTEÍNAS DE DOMINIO MADS. La especie A. thaliana se utiliza para experimentos de genética clásica en plantas así como en estudios de genética molecular en fisiología, bioquímica y desarrollo de las plantas.
Mapeo Cromosómico
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.
Inmunohistoquímica
Proteínas Proto-Oncogénicas c-ets
Familia de factores de transcripción que comparten un único dominio de unión del ADN. Debe su nombre a la proteína oncogénica v-ets del VIRUS DE LA ERITROBLASTOSIS AVIAR.
Dactinomicina
Sustancia compuesta de dos PÉPTIDOS CÍCLICOS añadidos a la fenoxazina, que deriva del STREPTOMYCES parvullus. Se úne al ADN e inhibe la síntesis de ARN (transcripción), siendo la elongación de la cadena más sensible que la iniciación, terminación o la liberación. Como resultado de la producción alterada de ARNm, la síntesis proteica también declina después del tratamiento con dactinomicina (Traducción libre del original: AMA Drug Evaluations Annual, 1993, p2015).
Transporte Activo de Núcleo Celular
Mecanismos de transporte de compuerta por los cuales proteínas o ARN son movidos a través de la MEMBRANA NUCLEAR.
Factor sigma
Factores de Elongación Transcripcional
Factores de transcripción cuya función principal es regular la velocidad a la que se transcribe el ARN.
Nucleosomas
Proteínas de Arabidopsis
Proteínas de especies vegetales pertenecientes al género ARABIDOPSIS. Las especies de Arabidopsis más estudiadas, la Arabidopsis thaliana, se utilizan generalmente en laboratorios de experimentación.
Histona Desacetilasas
Deacetilasas que separan grupos N-acetil de las cadenas aminósidas de los aminoácidos de HISTONAS. La familia de enzimas pueden dividirse en al menos tres subclases estructuralmente definidas. La clase I y la clase II de desacetilasas utilizan un mecanismo dependiente de zinc. Las sirtuinas son histona deacetilasas que pertenecen a la clase III y son enzimas dependientes de NAD.