Genoma Bacteriano
Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.
Genoma Viral
Complemento genético completo contenido en una molécula de ADN o de ARN en un virus.
Genoma
Complemento genético de un organismo, incluyendo todos sus GENES, representado en sus ADN o en algunos casos, sus ARN.
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Genoma Arqueal
Genoma de Planta
Genoma Humano
Complemento génico completo contenido en un juego de cromosomas de un ser humano, ya sea haploide (derivado de un progenitor) o diploide (conjunto doble, derivado de ambos progenitores). El conjunto haploide contiene de 50 000 a 100 000 genes y alrededor de 3 mil millones de pares de bases.
Sistemas de Lectura Abierta
Secuencia de Bases
Genoma Mitocondrial
Complemento genético de la MITOCONDRIA tal como se representa en su ADN.
Evolución Molecular
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Genoma Fúngico
El complemento génico completo contenido en un conjunto de cromosomas de un hongo.
ADN Bacteriano
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Homología de Secuencia
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Genoma de Protozoos
Complemento genético completo contenido en un conjunto de CROMOSOMAS de un protozoo.
Sintenía
La presencia de dos o más sitios genéticos en el mismo cromosoma. Extensiones de esta definición original se refieren a la similitud en el contenido y la organización entre cromosomas de diferentes especies, por ejemplo.
Mapeo Cromosómico
Genoma de los Insectos
Complemento genético de un insecto (INSECTOS), representado en su ADN.
Astroviridae
Familia de virus ARN con dos géneros: MAMASTROVIRUS y AVASTROVIRUS. Producen GASTROENTERITIS en humanos y infectan también a otros vertebrados.
Biología Computacional
Campo de la biología relacionada con el desarrollo de técnicas para la recolección y manipulación de datos biológicos, y la utilización de estos datos para hacer descubrimientos biológicos o predicciones. Este campo abarca todos los métodos computacionales y teorías para la solución de problemas biológicos, incluyendo la manipulación de modelos y conjuntos de datos.
Cromosomas Bacterianos
Siphoviridae
Familia de bacteriófagos que se caracterizan por poseer colas largas y no contráctiles.
Avulavirus
Un género en la subfamilia PARAMYXOVIRINAE, familia PARAMYXOVIRIDAE, causantes de enfermedades en las aves de corral. Hay muchas especies, la que más se conoce es el paramyxovirus 1 aviar (VIRUS DE LA ENFERMEDAD DE NEWCASTLE).
Secuencia de Aminoácidos
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Bases de Datos Genéticas
Recombinación Genética
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Transferencia de Gen Horizontal
Transmisión de información genética entre organismos, emparentados o sin parentesco, burlando la transmisión de padres a hijos, que se da de forma natural. Puede darse mediante procesos naturales como la CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA y la TRANSFECCIÓN. Puede dar lugar a un cambio de la composición genética del organismo recipiente (TRANSFORMACIÓN GENÉTICA).
Myoviridae
Familia de bacteriófagos que se caracterizan por poseer colas contráctiles complejas.
Modelos Genéticos
Genoma del Cloroplasto
Complemento genético de los CLOROPLASTOS tal como se representan en su ADN.
Anotación de Secuencia Molecular
La adición de información descriptiva sobre la función o estructura de una secuencia molecular a su registro de DATOS DE SECUENCIA MOLECULAR.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Duplicación de Gen
Procesos que ocurren en diversos organismos por el cual nuevos genes se copian. La duplicación puede resultar en una FAMILIA DE MULTIGENES.
Genes Bacterianos
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Profagos
Genomas de BACTERIÓFAGOS templados integrados en el ADN de las células del huésped bacteriano. Los profagos pueden duplicarse a lo largo de muchas generaciones celulares, hasta que algún estímulo induce su activación y virulencia.
Corynebacterium pseudotuberculosis
Especie de bacterias grampositivas, esporogénicas que se aisló originalmente de áreas necróticas del riñón de un carnero. Puede producir linfangitis ulcerativa, abcesos, y otras infecciones purulentas crónicas en el carnero, caballo, y otros animales de sangre caliente. Las enfermedades en humanos pueden provenir del contacto con animales infectados.
Programas Informáticos
Componentes Genómicos
Partes de una secuencia de GENOMA que están implicadas en las diferentes funciones o propiedades de los genomas, oponiendo las del conjunto a las de los GENES individuales.
Análisis por Conglomerados
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Secuencias Repetitivas de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ADN o ARN que se producen en múltiples copias. Existen varios tipos: SECUENCIAS REPETITIVAS ESPARCIDAS son copias de elementos transponibles (ELEMENTOS TRANSPONIBLES DE ADN o RETROELEMENTOS) dispersos a través del genoma. Las SECUENCIAS REPETIDAS TERMINALES flanquean ambos extremos de una otra secuencia, por ejemplo, las repeticiones terminales largas (LTRs) en los RETROVIRUS. Las variaciones pueden ser repeticiones directas, ocurriendo en la misma dirección, o repeticiones invertidas, en dirección opuesta a cada una. Las SECUENCIAS REPETIDAS EN TANDEM son copias que se encuentran adyacentes unos a otros, directas o invertidas (SECUENCIAS REPETIDAS INVERTIDAS).
Seudogenes
Genes que presentan estrecha semejanza a genes conocidos en diferentes loci, pero que se tornan no funcionales por adiciones o deleciones en estructura que evitan una transcripción o translación normal. Cuando faltan intrones y contienen un segmento poly-A cerca del extremo inferior (como resultado de una copia inversa del ARN nuclear procesado en el DNA de doble cadena) se les denomina genes procesados.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Infecciones por Avulavirus
Infecciones con virus del género AVULAVIRUS, familia PARAMYXOVIRIDAE. Incluye ENFERMEDAD DE NEWCASTLE y otras infecciones de aves domésticas.
Cromosomas de Archaea
Fagos Pseudomonas
Genoma de los Helmintos
Complemento genético de un helminto (HELMINTOS) representado en su ADN.
Virulencia
Grado de patogenicidad dentro de un grupo o especie de microorganismos o virus, indicado por la tasa de mortalidad y/o la capacidad del organismo para invadir los tejidos del huésped. La capacidad patogénica de un organismo viene determinada por los FACTORES DE VIRULENCIA.
Elementos Transponibles de ADN
Segmentos discretos de ADN que pueden escindirse y reintegrarse a otro sitio del genoma. La mayoría son inactivos, es decir, no se han encontrado fuera del estado integrado. Los elementos transportables de ADN incluyen los elementos SI bacterianos (secuencias de inserción), los elementos Tn, los elementos controladores del maíz Ac y Ds, Drosophila P, elementos gitanos y pogo, los elementos humanos Tigger y los elementos Tc y marinos que se encuentran en todo el reino animal.
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Genoma de Plastidios
Complemento genético de los PLÁSTIDOS, tal como se representa en su ADN.
Bases de Datos de Ácidos Nucleicos
BASES DE DATOS que contienen información sobre ÁCIDOS NUCLEICOS tales como la SECUENCIA DE BASES, POLIMORFISMO DE NUCLEÓTIDO SIMPLE, CONFORMACIÓN DE ÁCIDO NUCLEICO y otras propiedades. La información sobre los fragmentos de ADN guardados en una BIBLIOTECA DE GENES o BIBLIOTECA GENÓMICA a menudo es mantenida en bases de datos de ADN.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Cromosomas Artificiales Bacterianos
Construcciones de ADN que se componen de al menos un ORIGEN DE RÉPLICA, para la exitosa replicación, propagación y mantenimiento como un cromosoma extra en las bacterias. Además pueden transportar grandes cantidades (cerca de 200 kilobases) de otra secuencia para una variedad de propósitos en bioingeniería.
Proyecto Genoma Humano
Esfuerzo coordinado de los investigadores para trazar el mapa (MAPEO CROMOSÓMICO)y la secuencia del GENOMA humano (ANÁLISIS DE SECUENCIA DE ADN).
Islas Genómicas
Unidades distintas en algunas bacterias, bacteriófagos o GENOMAS plasmidos que son tipos de ELEMENTOS GENETICOS MOVILES. Codificados en ellos hay una variedad de genes otorgando acondicionamiento, como FACTORES DE VIRULENCIA (en "islas de patogenicidad o isletas"), genes con RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS, o genes requeridos para SIMBIOSIS (en "islas de simbiosis o isletas"). Varían en tamaño desde 10 - 500 kilobases, y su CONTENIDO GC y el uso de CODON difiere del resto del genoma. Contienen tipicamente un gen INTEGRASA, aunque en algunos casos este gen ha sido eliminado resultando en "islas genómicas ancladas".
Redes y Vías Metabólicas
Genotipo
Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento
Técnicas de análisis de la secuencia de nucleótidos que aumentan el alcance, complejidad, sensibilidad y precisión de los resultados por un considerable incremento de la escala de operaciones y por lo tanto el número de nucleótidos, y el número de copias de cada uno de los nucleótidos secuenciados. La secuencia se podría realizar mediante el análisis de la síntesis o ligadura de los productos, hibridación a secuencias preexistentes, etc.
ADN de Archaea
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
Mutación
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Genes Arqueales
Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.
Internet
Confederación libre de redes de comunicación por computadoras de todas partes del mundo. Las redes que conforman Internet están conectadas a través de varias redes centrales. Internet surgió del proyecto ARPAnet del gobierno de los Estados Unidos y estaba destinada a facilitar el intercambio de información.
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Algoritmos
Patos
Virus de la Diarrea Epidémica Porcina
Especie de CORONAVIRUS que causa enteritis aguda a los cerdos. Las infecciones se han producido sobre todo en Europa, donde es endémica, y en China.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Etiquetas de Secuencia Expresada
Secuencias parciales de ADNc (ADN COMPLEMENTARIO) que son únicas a los ADNc, de los que derivan.
Simbiosis
ADN Circular
Cualquiera de las moléculas de ADN covalentemente cerradas que se encuentran en bacterias, muchos virus, mitocondrias, plástidos, y plásmidos. También se han observado ADNs pequeños, circulares y polidispersos en un número de organismos eucarióticos y se ha sugerido que tienen homología con el ADN cromosómico y en la capacidad de insertarse en él, y escindirse del ADN cromosómico. Es un fragmento de ADN formado por un proceso de formación y de deleción de un asa , que contiene una región constante de la cadena pesada mu y la parte 3 de la región de cambio mu. El ADN circular es un producto normal de la reordenación entre los segmentos del gen que codifica las regiones variables de las cadenas ligeras y pesadas de las inmunoglobulinas, así como de los receptores de las células T.
Leviviridae
Familia de bacteriófagos que infectan las enterobacterias, Caulobacter, y Pseudomonas. El genoma consta de ARN lineal de hebra única con sentido positivo.
Virus Reordenados
Virus que contienen dos o más fragmentos de ácido nucléico (genoma segmentado) a partir de diferentes padres. Tales virus se producen en células coinfectadas con cepas diferentes de un virus dado.
Análisis de Secuencia de ARN
Transcripción Genética
Enterovirus Porcinos
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Mapeo Contig
Evolución Biológica
Picornaviridae
Familia de pequeños virus ARN constituida por algunos patógenos importantes en humanos y animales. La transmisión usualmente se produce de forma mecánica. Hay cinco géneros: APHTHOVIRUS, CARDIOVIRUS, ENTEROVIRUS, HEPATOVIRUS, y RHINOVIRUS.
Secuencias Repetitivas Esparcidas
Copias de elementos transponibles esparcidos a lo largo del genoma, algunos de los cuales están aún activos y a los que se les llama con frecuencia como "genes saltadores". Hay dos clases de elementos repetitivos esparcidos. Los elementos clase I (o RETROELEMENTOS - tales como los retrotransposones, retrovirus, ELEMENTOS DE NUCLEOTIDO ESPARCIDO LARGOS y ELEMENTOS DE NUCLEOTIDO ESPARCIDO CORTOS) se transponen vía transcripción inversa de un intermediario de ARN. Los elementos de clase II (o ELEMENTOS TRANSPONIBLES DE ADN) - tales como los transposones, elementos Tn, elementos de secuencia de inserción y cassettes de génes móviles de integrones bacterianos) se transponen directamente de un sitio a otro en el ADN.
Porcinos
Cualquiera de los diversos animales que constituyen la familia Suidae, integrada por mamíferos robustos, omnívoros, de patas cortas con gruesa piel, generalmente cubierta de cerdas gruesas, hocico bastante largo y móvil y una cola pequeña. Incluye el género Babyrousa,Phacochoerus (jabalí verrugoso) y Sus, del que forma parte el cerdo doméstico (SUS SCROFA).
Mapeo Físico de Cromosoma
Mapeo del orden lineal de los genes en un cromosoma, con unidades que indican sus distancias mediante el uso de métodos distintos a la recombinación. Estos métodos incluyen la secuenciación de nucleótidos, la sobreposición de deleciones en cromosomas politenos y la micrografía electrónica del ADN heteroduplex.
ADN Mitocondrial
ADN de doble cadena de la MITOCONDRIA. En los eucariotas, el GENOMA mitocondrial es circular y codifica los ARN ribosómicos, ARN de transferencia y alrededor de 10 proteínas.
Desulfurococcaceae
Familia de archaea, del orden DESULFUROCOCCALES, constituida por cocos anaerobios que utilizan facultativamente péptidos, proteínas o carbohidratos por respiración sulfurosa o fermentación. Hay ocho géneros: AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus y Thermosphaera (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).
Codón
Conjunto de tres nucleótidos en una secuencia de codificación de proteínas que especifica los aminoácidos individuales o una señal de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN). La mayoría de los codones son universales, pero algunos organismos no producen los ARN DE TRANSFERENCIA complementarios para todos los codones. Estos codones se conocen como codones no asignados (CODÓN SIN SENTIDO).
Bacterias
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Podoviridae
Familia de bacteriófagos que se caracterizan por poseer colas cortas no contráctiles.
Alphaproteobacteria
Clase del filum PROTEOBACTERIA formado generalmente por dos fenotipos principales: bacterias púrpuras no sulfúricas y bacterias que contienen bacterioclorofilo aeróbico.
Células Procariotas
Infecciones por Picornaviridae
Enfermedad viral producida por PICORNAVIRIDAE.
Rahnella
Género de pequeñas bacterias gramnegativas, facultativamente anaerobias, que aparecen en el agua dulce.
ADN Intergénico
Cualquiera de los ADN entre los ADN que codifican genes, incluyendo a regiones no traducidas, regiones flanqueadoras 5' y 3', INTRONAS, pseudogenes no funcionales, y secuencias repetitivas no funcionales. Este ADN puede o no codificar funciones reguladoras.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Kobuvirus
Género de la familia PICORNAVIRIDAE cuya especie típica, el virus Aichi, causa gastroenteritis a los seres humanos.
Pyrococcus
Género de archaea estrictamente anaerobios ultratermofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que ocurren en aguas de mares calientes. Muestran crecimiento heterotrófico con una temperatura óptima de 100 grados C.
Proteobacteria
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Mycoplasmataceae
Familia de bacterias gramnegativas, inmóviles, de origen humano y animal. Se conoce una especie saprofita.
Proteoma
Complemento proteico de un organismo codificado por su genoma.
Enfermedades de los Porcinos
Mutagénesis Insercional
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Enfermedad de Newcastle
Enfermedad vírica febril, aguda y contagiosa, de las aves, producida por un AVULAVIRUS llamado VIRUS DE LA ENFERMEDAD DE NEWCASTLE. Se caracteriza por presentar síntomas respiratorios y neurológicos en aves de corral y ser transmisible a humanos, causando una conjuntivitis grave, pero transitoria.
Infecciones por Astroviridae
Enfermedades de las Plantas
Enfermedades de las plantas.
Parechovirus
Factores de Virulencia
Componentes de un organismo que determinan su capacidad de causar enfermedad pero que, per se, no son necesarios para su viabilidad. Se han distinguido dos clases: TOXINAS BIOLÓGICAS y moléculas de adhesión superficial, que posibilitan al microorganismo la invasión y colonización del huésped (Adaptación del original: Davis et al., Microbiology, 4th ed. p486).
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Secuencias Repetidas Terminales
Secuencias nucleotídicas repetidas tanto en los extremos 5' como 3' de una secuencia dada. Por ejemplo, lo que distingue al transposón es que está flanqueado por repeticiones invertidas en cada extremo y que las repeticiones invertidas están flanqueadas por repeticiones directas. El elemento delta de los retrotransposones Ty y las RTL (repeticiones terminales largas) son ejemplos de este concepto.
Carlavirus
Pseudomonas stutzeri
Una especie de bacteria gramnegativa en el género PSEUDOMONAS, que contiene múltiples genomovares. Se distingue de otras especies pseudomónadas por su habilidad de usar MALTOSA y ALMIDON como únicas fontes de carbón y energía. Puede degradar CONTAMINANTES AMBIENTALES y ha sido usada como organismo modelo para estudiar desnitrificación.
Oryza sativa
Regiones no Traducidas 5'
Cromosomas
Estructuras de las células procariotas o del núcleo de las células eucariotas que consisten en o contienen ADN el cual porta la información genética esencial de la célula. (Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Enterococcaceae
Familia de bacterias grampositivas del orden Lactobacillales, filo Firmicutes.
Selección Genética
Hibridación de Ácido Nucleico
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Replicación del ADN
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
Manantiales de Aguas Termales
Especificidad del Huésped
Propiedades de un agente patógeno que lo hace capaz de infectar a uno o más huéspedes específicos. El patógeno puede incluir PARÁSITOS, así como también VIRUS, BACTERIA, HONGOS o PLANTAS.
Conformación de Ácido Nucleico
Replicación Viral
Marcadores Genéticos
Reordenamiento Génico
El reordeamiento ordenado de las regiones del gen mediante recombinación del ADN, como aquellas que ocurren normalmente durante el desarrollo.
Iridovirus
Género de IRIDOVIRIDAE que comprende pequeños virus iridiscentes. Las larvas infectadas y los "pellets" de virus purificados muestran una iridiscencia azul o púrpura.
Análisis de Secuencia
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Línea Celular
Mutación INDEL
Una mutación denominada nombrada con la mezcla de la inserción y de la eliminación. Esta referida a una diferencia de la longitud entre dos ALELOS donde se desconoce si la diferencia fue causada originalmente por una INSERCIÓN DE LA SECUENCIA o por una ELIMINACION DE SECUENCIA. Si el número de nucleotidos en la inserción/eliminación no es divisible por tres, y ocurre en una región de la codificación de la proteína, es también una MUTACIÓN DEL SISTEMA DE LECTURA.
Interfaz Usuario-Computador
Genes de Plantas
Unidades funcionales hereditarias de las PLANTAS.
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Circovirus
Género de la familia CIRCOVIRIDAE que infecta a PORCINOS, PSITTACIFORMES y AVES no psittaciformes. Entre las especies está el circovirus que origina una enfermedad fatal en aves psittaciformes y el circovirus porcino que produce un sindrome de pérdida multisistémica post-destete,en cerdos.
Respiraderos Hidrotermales
ADN de Plantas
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las plantas.
Células Eucariotas
Cronobacter sakazakii
Polimorfismo de Nucleótido Simple
Hibridación Genómica Comparativa
Un método para comparar dos series de ADN cromosómico mediante el análisis de las diferencias en el número de copias y la localización de secuencias específicas. Se usa para buscar cambios en la secuencia de gran tamaño como deleciones, duplicaciones, ampliaciones, o translocaciones.
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Pase Seriado
Inoculación de una serie de animales o de tejidos in vitro con una bacteria infecciosa o un viru, como ocurre en estudios de VIRULENCIA y en el desarrollo de vacunas.
Biblioteca de Genes
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.
Regiones no Traducidas
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Enfermedades de las Aves de Corral
Enfermedades de las aves que se crían como fuente de carne o huevos para el consumo humano y que usualmente se encuentran en granjas, criaderos, etc. El concepto se diferencia del de ENFERMEDADES DE LAS AVES el que se aplica a enfermedades de aves no consideradas de corral y que se encuentran usualmente en zoológicos, parques y en estado salvaje.
Piscirickettsiaceae
Una familia de bacterias gramnegativas, en el orden Thiotrichales.
Pollos
Nombre común de la especie Gallus gallus, ave doméstica, de la familia Phasianidae, orden GALLIFORMES. Es descendiente del gallo rojo salvaje de ASIA SUDORIENTAL.
Retroelementos
Elementos que se transcriben en el ARN, tienen transcripción inversa en el ADN y luego se insertan en un sitio nuevo del genoma. Las repeticiones terminales largas (RTL) similares a la de los retrovirus están contenidas en los retrotransposones y en elementos semejantes a los retrovirus. Los retroposones, como son los ELEMENTOS NUCLEOTÍDICOS MUY ENTREMEZCLADOS y los ELEMENTOS NUCLEOTÍDICOS POCO ENTREMEZCLADOS no contienen RTL.
Brucella canis
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Flexiviridae
Familia de virus ARN de las plantas que infectan a una gran variedad de herbéceas y leñosas. Cuenta al menos con ocho géneros, como POTEXVIRUS y CARLAVIRUS, ambos muy inmunógenos.
Metabolismo de los Hidratos de Carbono
Thermococcus
Género de archaea heterotrófica extremadamente termofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que existen en corrientes marinas calientes. Son sulfidógenos quimiorganotróficos anaerobios.
Galliformes
Un orden de AVES de cuerpos-pesados, en gran parte terrestres que incluye los faisanes, PAVOS, urogallos, CODORNICES, y POLLOS.
Bifidobacterium
Género de bacterias en forma de bastoncillos, gram positivas, no resistentes a ácidos, que no forman esporas, son inmóviles y pertenecen a la familia Bifidobacteriaceae, orden Bifidobacteriales, clase ACTINOBACTERIA. Habita en los intestinos y heces de humanos así como en la vagina humana.
Mycoplasma
Género de bacterias gram negativas, la mayoría facultativamente anaerobias de la familia MYCOPLASMATACEAE. Las células están revestidas por la MEMBRANA PLASMÁTICA y carecen de una verdadera PARED CELULAR. Estos organismos patógenos se encuentran en las MEMBRANA MUCOSA de humanos, ANIMALES y PÁJAROS.
Fenotipo
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Gammaproteobacteria
Grupo de protobacterias comprendidas por bacterias gramnegativas fermentadoras y facultativamente anaerobias.
Eucariotas
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.
Biblioteca Genómica
Clase de BIBLIOTECA DE GENES que contiene las secuencias de ADN completas presentes en el genoma de un organismo determinado. Contrasta con una biblioteca de ADNc que contiene solamente secuencias utilizadas en la codificación de proteínas (con ausencia de intrones).
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Streptococcus thermophilus
Leuconostoc
Vías Biosintéticas
Cromosomas de las Plantas
Enfermedades de las Aves
Enfermedades de aves que no son de corral, por tanto se encuentran usualmente en zoológicos, parques, y en estado salvaje. El concepto se diferencia de las ENFERMEDADES DE LAS AVES DE CORRAL el cual se utiliza para aves que se crían como fuentes de carne o huevos para el consumo humano, y que usualmente se encuentran en granjas, criaderos, etc.
Análisis de Secuencia de Proteína
Un proceso que incluye la determinación de la SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS de una proteína (o péptido, o fragmento de oligopéptido o opéptido) y el análisis de la información de la secuencia.
Bases de Datos Factuales
Amplias colecciones, supuestamente completas, de hechos y datos almacenados a partir de material de un área especializada de temas para su análisis y aplicación. La colección puede ser automatizada por diversos métodos contemporáneos para su recuperación. El concepto debe distinguirse del de BASES DE DATOS BIBLIOGRAFICAS, el cual está restringido a las colecciones de referencias bibliográficas.
Flavivirus
Loros
Weissella
Género de bacterias del ácido láctico, grampositivas y asporogéneas, en la familia LEUCONOSTOCACEAE.
Infecciones por Corynebacterium
Infecciones producidas por bacterias del género CORYNEBACTERIUM.
Thermoproteus
Un género de ARCHAEA obligatoriamente anaerobios, en la familia THERMOPROTEACEAE. Se encuentran en manantiales calientes ácidos y en hoyos de agua.
Microbiología del Suelo
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Proteínas Estructurales Virales
Proteínas virales que componen las PARTÍCULAS DE VIRUS maduras ensambladas. Pueden incluir proteinas nucleares de nucleocápside (proteinas gag), enzimas empaquetadas dentro de la partícula viral (proteinas pol)y componentes de membrana (proteinas env). No incluye las proteinas codificadas en el GENOMA VIRAL, que se producen en células infectadas pero que no se empaquetan en la particula viral madura, es decir, las llamadas proteinas no estructurales (PROTEINAS NO ESTRUCTURALES VIRALES).
Origen de Réplica
Secuencia única de ADN de un replicón en la que se inicia la REPLICACIÓN DEL ADN y prosigue bidireccional o unidireccionalmente. Contiene los sitios en que ocurre la primera separación de las cadenas complementarias, se sintetiza un primer ARN, y tiene lugar el cambio del primer ARN a la síntesis de ADN. (Adaptación del original: Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
Iridoviridae
Familia de grandes virus ADN icosaédricos que infectan a insectos y a vertebrados poiquilotérmicos. Los géneros incluyen IRIDOVIRUS, RANAVIRUS, Chloriridovirus, Lymphocystivirus, y Virus semejante al virus-1 del Goldfish.
Regiones no Traducidas 3'
Plectrovirus
Género de bacteriófagos de la familia INOVIRIDAE. Los organismos de este género infectan a la Acholeplasma y Spiroplasma.