Tryptofan
Tryptophan är en essentiell aminosyra, som betyder att den måste införas genom kosten eftersom kroppen inte kan syntetisera den själv. Det är en building block för proteiner och spela en viktig roll i produktionen av neurotransmittor, såsom serotonin och melatonin, som är involverade i sömnschema reglering och humör.
Tryptofanoxygenas
Tryptophan oxygenase, även känt som tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO) eller tryptophan pyrrolase, är ett enzym involverat i nedbrytningen av aminosyran tryptofan. Det katalyserar reaktionen där syre molekyler adderas till tryptofan, vilket resulterar i formationen av formylkynurenin, som är en första steg i nedbrytningen av tryptofan till niacin (vitamin B3) och andra signalsubstanser som serotonin och melatonin. Tryptofan oxygenas är huvudsakligen beläget i levern och dess aktivitet kan påverkas av olika faktorer, inklusive hormonella, immunologiska och oxidativ stressorer.
Tryptofansyntas
Tryptophan synthesis refers to the biochemical process by which the essential amino acid tryptophan is produced in living organisms. This process involves several enzymatic steps that convert chorismate, a metabolite derived from the shikimate pathway, into tryptophan. The final step in this pathway is catalyzed by the enzyme tryptophan synthase, which converts indole and serine into tryptophan. Tryptophan synthesis is essential for the growth and survival of many bacteria and plants, as tryptophan is an important precursor for various metabolic pathways, including the biosynthesis of the neurotransmitter serotonin and the hormone melatonin in animals.
Tryptofanhydroxylas
Tryptophanhydroxylase är ett enzym involverat i serotoninsyntesen i kroppen. Det katalyserar den första och rate-limitierande reaktionen, nämligen omvandlingen av aminosyran tryptofan till 5-hydroxytryptofan (5-HTP). Serotonin är en signalsubstans som har betydelse för bland annat sömnbeteende, aptit och stämningsreglering.
Kynurenin
En aminosyra som är prekursor till kynurensyra och som utsöndras i små mängder i urin som metabolit av tryptofan.
Bromsuccinimid
Indoleamin-pyrrol-2,3,-dioxygenas
Indoleamine-2,3-dioxygenase (IDO) är ett enzym som katalyserar omvandlingen av essentiella aromatiska aminosyror till katekolaminer genom att klyva den indolring som finns i deras struktur. Detta enzym spelar en viktig roll i immunregleringen, eftersom det hjälper till att begränsa aktivering och proliferation av T-celler genom att bryta ned tryptofan, en aminosyra som är nödvändig för T-cellernas överlevnad. IDO uttrycks i flera olika typer av celler, inklusive dendritiska celler och cancerceller, och dess aktivitet kan påverka patofysiologiska processer som immunförsvar, autoimmunitet och cancer.
Antranilatsyntas
ortho-Aminobenzoates
Ortho-aminobenzoates are a group of chemical compounds that contain an ortho-substituted amino benzoate functional group, which consists of a benzene ring with a carboxylate group (–COO−) and an amino group (–NH2) attached to adjacent carbon atoms on the benzene ring. This group is often abbreviated as "o-ABA" or "OABA". These compounds have various applications, including use as pharmaceuticals, dyes, and plastic additives.
Akrylamid
Xanthurenates
Aminosyror
Serotonin
Serotonin är ett signalsubstanstans (neurotransmittor) som överför signaler mellan neuron i centrala nervsystemet och perifera nervsystemet. Det produceras naturligt i kroppen, främst i tarmarna och hjärnan. Serotonin har en rad olika funktioner i kroppen, inklusive att reglera humör, aptit, sömn, minne och läkningsprocesser. I hjärnan spelar serotonin en viktig roll för stämningsreglering och kan vara involverat i uppkomsten av depression och ångest.
Proteinkonfiguration
I enkelhet kan 'proteinkonfiguration' definieras som den specifika rymdstrukturen och orienteringen hos de aminosyror som utgör ett protein. Denna konfiguration bestäms av proteinkedjans primära struktur (sekvensen av aminosyror) samt hur dessa aminosyror är hopfogade och vevda i rummet, vilket kallas för sekundär, tertiär och kvartär struktur. Proteinkonfigurationen har en direkt betydelse för proteinets funktion och stabilitet.
Hydroxyindolättiksyra
Hydroxyindolilsyran, eller 5-HIAA (5-hydroxyindoleacetic acid), är ett metabolit av serotonin, ett signalsubstans som har en viktig roll i centralnervösa processer såsom stämningsreglering och sömn-vakenhetscykler. 5-HIAA:s nivåer i urinen används som markör för serotoninproduktionen i kroppen och kan vara förhöjda eller sänkta vid olika sjukdomstillstånd, till exempel karcinoidsyndrom och depression.
Tryptofanas
Tryptophan är en essentiell aminosyra, som betyder att den måste införas genom kosten eftersom kroppen inte kan syntetisera den själv. Tryptophan är en building block i proteiner och spela en viktig roll i människors näringsintag. Den konverteras också i kroppen till serotonin, ett signalsubstans som hjälper att reglera sömnen, humöret och smärtan.
3-hydroxyantranilsyra
Cirkulär dikroism
Aminosyrasekvens
Fenylalanin
Kolibakterie
Molekylsekvensdata
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
Bindningsplatser
Antranilatfosforibosyltransferas
Ultraviolettspektrofotometri
Ultraviolettspektrofotometri (UV-spektrofotometri) är en laboratorieteknik som används för att bestämma koncentrationen av ett ämne i en lösning genom att mäta absorptionen av ultraviolett ljus. Detta görs genom att lysa upp lösningen med UV-ljus och mäta den absorbierade strålningen vid specifika våglängder. Resultaten presenteras i form av ett spektrum, som visar absorptionen som en funktion av våglängden. Metoden är vanlig inom områden som kemi, biokemi och miljöanalys för att bestämma koncentrationer av olika organiska och oorganiska ämnen, till exempel aminosyror, vitaminer, pigment och vissa typer av föroreningar.
Modeller, molekylära
Fluorescens
Tryptofan-tRNA-ligas
Proteinbindning
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
Kynurenin-3-monooxygenas
Mutation
Mutagenes, riktad
Fluorescenspolarisation
Polarisationsmätning av fluorescerande ljus från lösningar eller mikroskopprov. Metoden används för att erhålla uppgifter om molekylstorlek, molekylform och konformation, anisotropi, elektroniskt energiflöde, molekylär interaktion, inkl. bindning av färg och koenzymer, samt antigen-antikroppreaktion.
Quinolinic Acid
Quinolinic acid, also known as 2,3-pyridinedicarboxylic acid, is a compound that is produced in the body and has been identified as an important neuroactive molecule. It is a metabolite of the amino acid tryptophan and is involved in the kynurenine pathway of tryptophan metabolism. Quinolinic acid can act as a neuroexcitatory agent and has been implicated in several neurological conditions, including Huntington's disease, Alzheimer's disease, and HIV-associated dementia. It is also believed to play a role in the development of chronic pain and depression.
Nikotinsyra
Nikotinsyra, även känd som pyridin-3-karboxylsyra, är en organic compound som är relaterad till tobak och nikotin. Det är den primära metaboliten av nikotin i människokroppen och hittas i höga koncentrationer i blod, urin och hjärna hos rökare. Nikotinsyra bildas när nikotin oxideras av enzymet cytochrom P450 2B6 i levern. Det har visat sig ha potentialen som ett biomarkör för tobaksrökning och kan användas för att bedöma skadan på kroppen orsakad av rökning.
Indolkinoner
Akrylamider
Kinolinsyror
Kinolinsyror är en grupp organiska föreningar som innehåller ett kinolinringsystem, vilket består av två benzening rings kopplade via en pyrrolring. De är vanligen syntetiska och har visat sig ha antibiotiska egenskaper. Exempel på kinolinsyror inkluderar ciprofloxacin och norfloxacin, som används för behandling av olika infektionssjukdomar.
Operon
Ett operon är ett genkluster i prokaryota celler, som består av en grupp reglerade strukturgener och ett operatörregion som kontrolleras av ett gemensamt promotorområde, vilket tillåter koordinerad transkription av flera gener under kontroll av samma regulatorprotein.
Proteindenaturation
Protein denaturering refererar till processen där ett protein förlorar sin naturliga, biologiskt funktionella konformation och tredimensionell struktur som resulterar från att den korrekta sekvensordningen av aminosyror i polypeptidkedjan störs. Detta kan orsakas av faktorer såsom förändringar i pH, temperatur, koncentrationen av salt eller organiska lösningsmedel, mekanisk påverkan eller exponering för kemiska substanser som t.ex. detergenter eller lösningsmedel. När ett protein denatureras kan det bli mer benäget att aggregera och bilda insolubila klumpar, vilket kan leda till förlust av dess funktionella kapacitet. Det är värt att notera att proteiner ofta kan delvis eller fullständigt återfå sin ursprungliga konformation och funktion om de exponeras för normala villkor igen, men i vissa fall kan denaturering vara permanent och leda till
RNA, transfer, Trp
Energiöverföring
Skatol
Scatol, eller specifikt 3-metylindol, är ett organisk förening som produceras naturligt i kroppen som en biprodukt vid nedbrytningen av aminosyran tryptofan. Det kan påträffas i höga koncentrationer i fetma personers urin och feces, och har ansetts vara en orsak till illaluktande lukter hos vissa medicinska tillstånd som exkrétionssjukdomar.
Tyrosin
Tyrosine är en aromatisk essentiell aminosyra som fungerar som byggsten i proteiner och neurotransmittor i kroppen. Det syntetiseras i kroppen från den icke-essentiella aminosyran fenylalanin.
Proteinstruktur, sekundär
Pellagra
Pellagra är en preventbar näringsbristssjukdom orsakad av brist på niacin (vitamin B3) och/eller aminosyran tryptofan i kosten. Sjukdomen är karaktäriserad av symptom från hud, mag-tarmsystem, nervsystem och psykiatrisk rubricering. Typiska tecken på pellagra inkluderar hudskador som rodnad, svullnad och blåsbildningar i solexponerade områden, diarré, demens och depression. Pellagra behandlas vanligen med niacin-supplémentering och korrektion av underliggande näringsbrist.
Bassekvens
Rekombinanta proteiner
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Transaminaser
Transaminaser, också kända som aminotransferaser, är en grupp av enzymer som hjälper till att katalysera överföringen av aminosyror mellan olika molekyler i kroppen. De flesta transaminaserna finns i levern, men de kan även påträffas i andra delar av kroppen, såsom hjärtat, musklerna och njurarna. Ökade nivåer av transaminaser i blodet kan vara ett tecken på skada eller sjukdom i levern eller andra organ.
Enzymrepression
Aminosyretransportsystem
En medicinsk definition av 'Aminosyretransportsystem' är ett system av membranproteiner som transporterar aminosyror genom cellytans membran. Aminosyror är nödvändiga byggstenar i proteiner och andra biologiskt viktiga molekyler, så dessa transportsystem är av grundläggande betydelse för cellens överlevnad och homeostas. Aminosyretransportsystem kan vara specifika för en viss aminosyra eller kunna transportera flera olika aminosyror. Dysfunktion i aminosyretransportsystem kan leda till olika sjukdomar och störningar, såsom aminoacidurier och neurologiska störningar.
Struktur-aktivitet-relation
"Structure-activity relationship (SAR) refers to the correlation between the chemical structure of a drug or molecule and its biological activity, describing how changes in the molecular structure can affect its ability to interact with biological targets and produce a desired pharmacological response."
Proteinstruktur, tertiär
Proteinveckning
Proteinveckning, eller proteinfoldning, är den process där ett proteinmolekyl plattar ut sig självt och bildar en tredimensionell struktur, som är nödvändig för dess funktion. Denna process sker spontant och är styrd av interaktionerna mellan de aminosyror som proteinets sekvens består av. Fel i proteinveckningen kan leda till att proteinet inte fungerar korrekt, vilket kan orsaka sjukdomar.
Spektrofotometri
Oxidation-reduktion
Guanidin
Ett kraftigt basisk, organiskt ämne, främst i form av guanidiumjoner vid fysiologiskt pH. Det återfinns i urin som en normal metabolit av protein. Guanidinhydroklorid används i laboratoriearbete för proteindenaturering. Det används även för behandling av myasteni och som fluorescerande sond vid HPLC.