Especie de bacteria gramnegativa, aerobia, en forma de bastoncillos que se encuentran en las aguas termale s con pH neutro a alcalino, así como en los calentadores de agua.

Bacilos gramnegativos que se encuentran en las aguas calientes (40-79 grados Celsius) como las aguas termales, tanques de aguas calientes y ríos con polución térmica.

Una especie de bacteria termofílica, gram-positiva que se encuentra en la LECHE y productos lácteos.

Enzima dependiente de NAD+ que cataliza la oxidación de 3-carboxi-2-hidroxi-4-metilpentanoato a 3-carboxi-4-metil-2-oxopentanoato. Está implicada en la biosíntesis de la VALINA, LEUCINA e ISOLEUCINA.

Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.

El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.

Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.

Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.

El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.

Proteína que se encuentra en bacterias y en las mitocondrias de eucariotas, que entrega los aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma. El aminoacil-ARNt está primero enlazado a un complejo de factor Tu de elongación, que contiene una molécula de GTP enlazada. El complejo resultante entonces se enlaza al complejo de iniciación 70S. Simultáneamente, el GTP es hidrolizado y el complejo Tu-GDP es liberado del ribosoma 70S. El complejo Tu-GTP es regenerado a partir del complejo Tu-GDP por el factor Ts de elongación y GTP.

Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).

Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.

Virus cuyo hospedero es el Streptococcus.

Formación de sustancias cristalinas a partir de soluciones o fusiones. (traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)

Enzima que activa la fenilalanina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.20.

Enzimas que catalizan la metilación dependiente de S-adenosil-L-metionina de las bases ribonucleótidas en el interior de una molécula de ARN de transferencia. EC 2.1.1.

Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.

Citocromos (proteínas transportadoras de electrones) con protoheme (HEME)como el grupo prostético.

Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)

Complejo enzimático de múltiples subunidades que contiene el GRUPO CITOCROMO A, CITOCROMOS A3, dos átomos de cobre y 13 subunidades protéicas diferentes. Es el complejo oxidasa terminal de la CADENA RESPIRATORIA y recoge electrones que son transferidos desde el GRUPO CITOCROMO C reducido que los cede al OXIGENO molecular, que es reducido a agua. La reacción redox se asocia de manera simultánea al transporte de PROTONES a través de la membrana mitocondrial interna.

Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.

Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.

ARN de transferencia que es específico para transportar fenilalanina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.

Una subclase de heme que contiene citocromos que tienen dos nitrógenos imidazoles como ligandos axiales y una absorción banda alfa de 605 nm. Se encuentran en una variedad de microorganismos y en eucariotes como un componente de citocromo de bajo spin de COMPLEJO IV DE TRANSPORTE DE ELECTRON MITOCONDRIAL.

Una subclase de heme a conteniendo citocromos que tienen una absorción alfa-banda de 605 nm. Se encuentran en una variedad de microorganismos y en eucariotes como un componente de citocromo de alto spin de COMPLEJO IV DE TRANSPORTE DE ELECTRON MITOCONDRIAL.

Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.

Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.

Subclase de enzimas que incluye todas las deshidrogenasas que actúan sobre alcoholes primarios y secundarios, así como hemiacetales. Posteriormente se clasifican de acuerdo con el aceptor, que puede ser NAD+ o NADP+ (subclase 1.1.1), citocromo (1.1.2), oxígeno (1.1.3), quinona (1.1.5) u otro aceptor (1.1.99).

Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).

Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.

Género de bacterias cocoides, grampositivas cuyos organismos se encuentran en pares o en cadenas. No se producen endosporas. Muchas especies existen como comensales o parásitos del hombre o de animales y algunos son altamente patógenos. Unas pocas especies son saprofitas y aparecen en el ambiente natural.

Factores que utilizan energía de la hidrólisis del GTP a GDP para la elongación de la cadena peptídica. EC 3.6.1.-.

Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.

Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.

La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.

ARN de transferencia que es específico para transportar glicina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.

Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.

Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.

Alimento lácteo ligeramente ácido producido por la fermentación que se obtiene por acción combinada del Lactobacillus acidophilus y el Streptococcus thermophilus.

Intermediarios en la biosíntesis de proteínas. Los compuestos se forman a partir de aminoácidos, ATP y ARN de transferencia, una reacción catalizada por la aminoacil ARNt sintetasa. Son compuestos claves en el proceso de translación genética.

Enzima que activa el ácido aspártico con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.12.

Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS de las eubacterias. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 16S y alrededor de 23 PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS distintas.

La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.

Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).

Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.

Factores proteicos que sólo se requieren durante la fase de elongación de la síntesis de proteínas.

Análogo fotoactivable de la URIDINA que se utiliza como marcador de afinidad.

Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.

Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.

Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.

La interrupción de los enlaces no covalentes y / o puentes disulfuro responsable de mantener la forma tridimensional y la actividad de la proteína nativa.

Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.

Esparcimiento de rayos X por la materia, especialmente cristales, con la consiguiente variación en intensidad debida a los efectos de interferencia. El análisis de la estructura de los cristales de los materiales se hace pasando rayos x a través de ellos y registrando la imagen de difracción de los rayos (CRISTALOGRAFIA POR RAYOS X).

Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.

Especie de archaea halofílica que se distingue por su producción de ácido a partir del azúcar. Esta especie se llamó previamente Halobacterium marismortui.

ARN de transferencia que es específico para transportar asparragina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

El Factor G de Elongación Peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A hacia el sitio P de los ribosomas bacterianos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.

Disacárido que consta de dos unidades de glucosa en un enlace glicosídico alfa (1-6).

La suma del peso de todos los átomos en una molécula.

Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.

Un metabolito de la vía bioquímica principal de la lisina. Antagoniza la actividad neuroexitatoria modulada por el receptor de glutamato, N-METILASPARTATO (NMDA).

ATPasas de translocación de protones que intervienen en la acidificación de diversos compartimentos intracelulares.

Subunidad mayor del ribosoma 70S de eubacterias. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 37 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.

ARN de transferencia que es específico para transportar ácido aspártico hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Guanosina 5'-(trihidrógeno difosfato). Nucleótido de guanina que contiene dos grupos fosfato esterificados en la molécula del azúcar. Sinónimos: GRPP; guanosina pirofosfato.

Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.

Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.

Amplio grupo de bacterias aerobias que toman color rosado (negativas) cuando se tratan con el método de coloración de gram. Esto es debido a que las paredes celulares de las bacterias gram negativas tienen poca cantidad de peptidoglicano y por ello tienen baja afinidad a la coloración violeta y alta afinidad por el tinte rosa de safranina.

Ausencia de sensibilidad de las bacterias a la KANAMICINA, antibiótico que puede unirse a los ribosomas 70S y provocar una lectura incorrecta del ARN mensajero.

Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.

Enzima mitocondrial que cataliza la decarboxilación oxidativa de isocitrato para formar alfa-cetoglutarato, usando NAD+ como aceptor de electrones; la reacción es una etapa clave limitante de la velocidad en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos. La enzima requiere Mg2+ o Mn2+ y es activada por ADP, citrato y CA2+, e inhibida por NADH, NADPH, y ATP. (Dorland, 28a ed). EC 1.1.1.41.

Enzima que cataliza la formación de ácido orotidina-5'-fosfórico (ácido orotidílico) a partir de ácido orótico y 5-fosforribosil-1-pirofosfato, durante la biosíntesis de nucleótidos de pirimidina. EC 2.4.2.10.

Proteína de REPARACIÓN DE ADN mal apareado dirigida por metilo con débil actividad ATPASA. Fue descrita por primera vez en ESCHERICHIA COLI.

Grupo de citocromos con enlaces covalentes de tioéter, entre una o ambas cadenas vinílicas laterales del proto-heme y la proteína.

La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.

Análisis rigurosamente matemático de las relaciones energéticas (calor, trabajo, temperatura y equilibrio). Describe sistemas cuyos estados están determinados por parámetros térmicos, como la temperatura, además de parámetros mecánicos y electromagnéticos.

Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.

La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)

Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.

Modificación hereditaria de las propiedades de una bacteria competente por ADN desnudo procedente de otra fuente. La incorporación de ADN desnudo es un fenómeno que ocurre naturalmente en algunas bacterias. esto es usado frecuentemente en TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.

Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.

Proceso mediante el cual dos moléculas con la misma composición química forman un producto de condensación o polímero.

MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.

Un cambio de polarización planar a polarización elíptica cuando una onda de luz plano-polarizada atraviesa un medio ópticamente activo.

Proteínas chaperonas grupo I que forma una estructura similar a una tapa- que encierra la cavidad no-polar del complejo de la chaperonina. La proteína se estudió inicialmente en BACTERIA donde comúnmente se refirió como proteína GroES.

Enzima que activa el ácido glutámico con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.17.

Enzima que activa la serina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.11.

Enzima que activa la treonina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.3.

Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.

Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.

Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.

Ácidos glicéridos son ésteres formados por la unión de glicerol con uno, dos o tres ácidos grasos, desempeñando un rol importante en el metabolismo de lípidos y energía en los organismos vivos.

El grado de similitud entre la forma tridimensional de las proteínas. Puede ser una indicación de poca HOMOLOGÍA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y utilizada para el DISEÑO DE DROGAS racional.

Género de cocos aerobios grampositivos que se encuentran en el suelo, muy resistentes a las radiaciones, especialmente a las radiaciones ionizantes (RADIACIÓN IONIZANTE). La especie tipo es Deinococcus radiodurans.

Enzima que cataliza la hidrólisis de residuos terminales no reductores de alfa-D-galactosa en los alfa-galactósidos, incluyendo oligosacáridos de galactosa, galactomananos y galactolípidos. EC 3.2.1.22.

Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.

Enzima que activa la glicina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.14.

Enzima que activa la metionina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.10.