Un actinomiceto usado en la producción de ANTIBIÓTICOS comerciales y como anfitrión para la clonación de genes.
Género de bacterias que forman micelas aéreas no fragmentadas. Se han identificado muchas especies de las que algunas son patógenas. Este género es responsable de la producción de la mayoría de los AGENTES ANTIBACTERIANOS de uso práctico.
Actinomiceto del que se obtienen los antibióticos ESTREPTOMICINA, griseina, y CANDICIDINA.
Un actinomiceto que vive en el suelo con un ciclo de vida complejo que implica elrecimiento micelial ylaa formación de esporas. Participa en la producción de numerosos ANTIBIÓTICOS médicamente importantes.
Actinomiceto del que se obtiene el antibiótico OLEANDOMICINA.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Compuestos basados en ANTRACENOS que contienen dos CETONAS en cualquier posición. Las sustituciones pueden estar en cualquier posición excepto en los grupos cetónicos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Actinomiceto del que se obtiene el antibiótico CLORTETRACICLINA.
Xilosidasa que cataliza la hidrólisis aleatoria de enlaces 1,3-beta-D-xilosídicos en 1,3-beta-D-xilanos.
Uno de los PÉPTIDOS CÍCLICOS del streptomyces que es activo contra las bacterias gram positivas. En veterinaria se ha usado en la mastitis causada por organismos gram negativos y en afecciones dermatológicas. ntibiótico que contiene un polipéptido aislado de una especie de Streptomyces en el suelo de Nuevo México. Parece ser altamente activo contra las bacterias gram-positivas. En la medicina veterinaria, la tiostreptona ha sido empleada en la mastitis provocada por organismos gram-negativos y en trastornos dermatológicos.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Una enzima que cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D-xilosídico en XILANOS.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.
4-Metoxi-5-((5-metil-4-pentil-2H-pirrol-2-ilideno)metil)- 2,2'-bi-1H-pirrol. Pigmente tripirrólico tóxico, de color rojo brillante, de la Serratia marcescens y otros. Tiene actividades antibacteriana, anticoccídica, antimalárica y antifúngica, pero es utlizado principlamente como una herramienta bioquímica.
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Poliacenos con anillos de benceno con cuatro uniones orto en una ordenación lineal. La subclase de este grupo llamada TETRACICLINAS es mejor conocida.
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Modificación hereditaria de las propiedades de una bacteria competente por ADN desnudo procedente de otra fuente. La incorporación de ADN desnudo es un fenómeno que ocurre naturalmente en algunas bacterias. esto es usado frecuentemente en TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Enzima que cataliza la conversión de los ésteres de acetato y agua en alcoholes y acetato. EC3.1.1.6.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces alfa o beta-xilosídicos. EC 3.2.1.8 cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D-xilosídicos; EC 3.2.1.32 cataliza la endohidrólisis de enlaces 1,3-beta-D-xilosídicos; EC 3.2.1.37 cataliza la exohidrólisis de enlaces 1,4-beta-D de los terminales no reductores de los xilanos; y la EC 3.2.1.72 cataliza la exohidrólisis de enlaces 1,3-beta-D de los terminales no reductores de los xilanos. Han sido identificadas otras xilosidasas que catalizan la hidrólisis de enlaces alfa-xilosídicos.
Sustancias que reducen el crecimiento o la reprodución de las BACTERIAS.
Orden de BACTERIAS grampositivas, principalmente aerobias, que tienden a formar filamentos ramificados.
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Enzimas que degradan la quitina, hidrolizando los enlaces beta(1,4). Se encuentran en muchos organismos, desde bacterias, virus y hongos, hasta plantas y animales, con actividades específicas dependiendo de los organismos: en los hongos tienen funciones autolíticas, nutricionales y morfogénicas; en las bacterias digieren la quitina para obtener energía; en las plantas intervienen en la defensa y el desarrollo; y en crustáceos e insectos participan en los procesos de muda. (http://recursostic.javeriana.edu.co/wiki/index.php/Bioinformática_de_Quitinasas, 01-03-2009)
Glicósido hidrolasas (o glicosidasas) catalizan la hidrólisis del acoplamiento glicosídico para generar dos azúcares más pequeños. Ellas son enzimas sumamente comunes con papeles en la naturaleza incluyendo la degradación de biomasa como la celulosa y hemicellulose, en estrategias de defensa antibacterianas (ej. lisozimas), en mecanismos patogénicos (ej. neuraminidasas virales) y en la función normal celular (ej. ajustando manosidasas implicadas en la biosíntesis de glicoproteinas N-ligadas). Con las glicosiltransferasas, glicosidasas forman la principal maquinaria catalítica para la síntesis y la ruptura de enlaces glicosídicos.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Género de bacterias grampositivas que forman una micela ramificada. Comúnmente se encuentran como forma saprofítica en el suelo y en medios acuáticos.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Capacidad de los microorganismos, en especial las bacterias, de resistir o hacerse tolerantes a fármacos quimioterapéuticos, antimicrobianos o antibióticos. Esta resistencia puede ser adquirida a través de mutación génica o ADN extraño en plásmidos transmisibles (FACTORES R).
Antibiótico macrólido producido por Streptomyces antibioticus.
Estructuras dentro del núcleo de las células de bacterias que consisten en o contienen ADN el cual porta la información genética esencial de la célula.
Plásmidos que contienen al menos un cos (sitio de extremo cohesivo) del BACTERIÓFAGO LAMBDA. Se utilizan como vehículos de clonación.
Familia de bacterias que incluyen formas parásitas y patógenas.
Polisacáridos constituídos por unidades de xilosa.
Cataliza la oxidación del catecol a 2-hidroximuconato semialdehído en la degradación del carbazol y el BENZOATO en las vías de HIDROXILACIÓN. También cataliza la conversión de 3-metilcatecol a cis, cis-2-hidroxi-6-oxohepta-2,4-dienoato en la vía de degradación del TOLUENO y el XILENO. Esta enzima ha sido anteriormente caracterizada como EC 1.13.1.2.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Grupo de compuestos macrocíclicos glicolisados formados por una extensión de cadena de múltiples PROPIONATOS y ciclizados a una lactona con muchos miembros (habitualmente 12, 14, 16). Los macrólidos pertenecen a la clase POLICÉTIDOS de productos naturales, y muchos miembros demuestran propiedades antibióticas.
Uno de los FURANOS con un carbonilo que forma una lactona cíclica. Es un compuesto endógeno hecho a partir del gamma-aminobutirato y es el precursor del gamma-hidroxibutirato. Es también utilizado como un agente farmacológico y como solvente.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Complexo antibiótico producido por el Streptomyces kanamyceticus de suelo japonés. Comprende 3 componentes : kanamicina A, el componente principal, y kanamicinas B y C, los componentes secundarios.
ARN de transferencia que es específico para transportar leucina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Degradación anaerobia de la GLUCOSA u otros nutrientes orgánicos para proporcionar energia en forma de ATP. Los productos finales varían según los organismos, sustratos y vías enzimáticas. Entre los productos comúnes de fermentación están el ETANOL y el ÁCIDO LÁCTICO.
Secuencias aminoácidas que se hallan en proteínas transportadas que guían selectivamente la distribución de las proteínas a compartimentos celulares específicos.
No susceptibilidad de una bacteria a la acción del CLORANFENICOL, un potente inhibidor de la síntesis de proteínas en la subunidad 50S del ribosoma, donde los aminoácidos se unen a los polipéptidos bacterianos nacientes.
Un complejo antibiótico fuertemente básico, derivado de varias cepas de Streptomyces. Es alergénico y tóxico para los riñones y el laberinto. La viomicina se emplea en la tuberculosis como diferentes sales y en combinación con otros agentes.
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Familia de antibióticos beta-lactámicos naturales, del tipo de la cefalosporina, que tienen un grupo 7-metoxi y que poseen marcada resistencia para la acción de las beta-lactamasas de organismos gram positivos y negativos.
Enzima que cataliza reversiblemente la formación de galactosa 1-fosfato y ADP a partir de ATP y D-galactosa. La galactosamina también puede actuar como aceptor. La deficiencia de esta enzima provoca la GALACTOSEMIA. EC 2.7.1.6.
Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.
Enzimas que catalizan la endohidrólisis de los enlaces 1,4-alfa-glicosídicos en el ALMIDÓN, GLUCÓGENO, y POLISACÁRIDOS y OLIGOSACÁRIDOS relacionados que contienen 3 o más unidades de D-glucosa enlazadas en 1,4-alfa.
Compuestos glicosilados en los que hay una amina que sustituye a un glicósido. Algunos son ANTIBACTERIANOS clinicamente importantes.
Secuencias de ADN que son reconocidas (directa o indirectamente) y enlazadas por una ARN polimerasa dependiente de ADN durante la iniciación de la transcripción. Entre las secuencias altamente conservadas dentro del promotor están la caja de Pribnow en las bacterias y la TATA BOX en los eucariotes.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Una endocelulasa con especificidad para la hidrólisis de enlaces 1.4-beta-glicosídicos en la CELULOSA, liquenina y beta-glucanos de cereales.
Una prueba que se usa para determinar si tendrá lugar o no la complementación (compensación en forma de dominancia) en una célula con un fenotipo mutante dado cuando otro genoma mutante, que codifica el mismo fenotipo mutante, se introduce en dicha célula.
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Cualquier preparación líquida o sólida hecha específicamente para cultivo, almacenamiento o transporte de microorganismos u otros tipos de células. La variedad de los medios que existen permiten el cultivo de microorganismos y tipos de células específicos, como medios diferenciales, medios selectivos, medios de test y medios definidos. Los medios sólidos están constituidos por medios líquidos que han sido solidificados con un agente como el AGAR o la GELATINA.
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Oxidasas que introducen especificamente átomos de oxigeno derivado del DIOXIGENO dentro de distintas moléculas orgánicas.
O-2-Deoxi-2-(metilamino)-alfa-L-glucopiranosil-(1-2)-O-5- deoxi-3-C-formil-alfa-L-lixofuranosil-(1-4)-N,N'-bis- (aminoiminometil)-D-streptamina. Sustancia producida por el actinomycete Streptomyces griseus de la tierra. Actúa a través de la inhibición de los procesos de iniciación y elongación durante la síntesis de proteínas.
Proceso parasexual en las BACTERIAS, ALGAS, HONGOS y EUCARIOTAS ciliados para lograr el intercambio de material cromosómico durante la fusión de dos células. En las bacterias, es una transferencia unidireccional del material genético; en los protozoos es un intercambio bidireccional. En las algas y hongos, es una forma de reproducción sexual, con la unión de gametos masculinos y femeninos.
Clase de enzimas que inactivan antibióticos con aminoglicósidos-aminociclitol (AMINOGLICÓSIDOS), por la FOSFORILACIÓN en región específica del hidroxilo en 3' y/o 5'.
Sustancias químicas, producidas por microorganismos, que inhiben o impiden el desarrollo de neoplasias.
Género de bacterias grampositivas aerobias cuyas especies están ampliamente distribuidas y son abundantes en los suelos. Algunas cepas son patógenos oportunistas para hombres y animales.
Enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica de las regiones monocatenarias de las moléculas de ADN o ARN, dejando las regiones bicatenarias intactas. Son particularmente útiles en el laboratorio para producir moléculas de ADN de "extremos romos"; con terminaciones monocatenarias sensibles para TÉCNICAS GENÉTICAS, tales como ENSAYOS DE PROTECCIÓN DE NUCLEASAS que involucran la detección de ADN y ARN monocatenarios.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Cambio producido en la composición genética de un organismo por transferencia unidireccional (TRANSFECCIÓN, TRANSDUCCIÓN, GENÉTICA, CONJUGACIÓN, GENÉTICA, etc.) y la incorporación de ADN extraño en células procariotas o eucariotas por recombinación de parte o la totalidad de ese ADN en el genoma celular.
Segmentos discretos de ADN que pueden escindirse y reintegrarse a otro sitio del genoma. La mayoría son inactivos, es decir, no se han encontrado fuera del estado integrado. Los elementos transportables de ADN incluyen los elementos SI bacterianos (secuencias de inserción), los elementos Tn, los elementos controladores del maíz Ac y Ds, Drosophila P, elementos gitanos y pogo, los elementos humanos Tigger y los elementos Tc y marinos que se encuentran en todo el reino animal.
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Un método (desarrollado originalmente por E.M.Southern) para la detección del ADN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa o de otro tipo o en membrana de nylon.
Moléculas de ADN capaces de replicarse de forma autónoma dentro de una célula huésped y dentro de la cual pueden insertarse otras secuencias de ADN y de esta manera amplificarse. Muchas se derivan de PLÁSMIDOS, BACTERIÓFAGOS o VIRUS. Se usan para transportar genes foráneos a las células receptoras. Los vectores genéticos poseen un sitio replicador funcional y contienen MARCADORES GENÉTICOS para facilitar su reconocimiento selectivo.
Técnicas cromatográficas líquidas que se caracterizan por altas presiones de admisión, alta sensibilidad y alta velocidad.
Modificación dirigida del complemento genético de un organismo vivo por técnicas como las que alteran el ADN, sustituyen el material genético por mediación de un virus, trasplantan nucleos completos, trasplantan híbridos celulares, etc.
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Catalizan la segmentación endonucleolítica de secuencias de ADN que no poseen el patrón de metilación de la especie en el ADN de la célula hospedera. La segmentación produce fragmentos aleatorios, o específicos de doble cadena, con 5'-fosfatos terminales. La función de las enzimas de restricción es destruir cualquier ADN extraño que invada la célula hospedera. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero algunas han sido encontradas en organismos eucarióticos.También se han usado como herramientas en la disección sistemática y en el mapeo de los cromosomas, en la determinación de la secuencia de bases de ADNs y han hecho posible cortar y recombinar genes de un organismo al genoma de otro. EC 3.21.1.
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Clase de BIBLIOTECA DE GENES que contiene las secuencias de ADN completas presentes en el genoma de un organismo determinado. Contrasta con una biblioteca de ADNc que contiene solamente secuencias utilizadas en la codificación de proteínas (con ausencia de intrones).
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Cuerpos metabólicamente inactivos, resistentes al calor y a las coloraciones, formados dentro de las células vegetativas de las bacterias del género Bacillus y Clostridium.
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Enzimas que catalizan la transferencia de un grupo acetil, generalmente de la acetil coenzima A, hacia otro compuesto. EC 2.3.1.
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Un complejo de antibióticos producidos por Streptomyces kitasatoensis. El complejo consiste de una mezcla de al menos 8 compuestos biológicamente activos, A1 y A3 a A9. Las Leucomicinas tienen actividad tanto antibacteriana como antimicoplásmica.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
La suma del peso de todos los átomos en una molécula.
El pH en soluciones de proteínas y compuestos relacionados al cual los iones dipolares se encuentran en cantidad máxima.
En biología molecular, 'esterasas' son enzimas que catalizan la hidrólisis de ésteres, produciendo alcoholes y ácidos carboxílicos.
Glicoproteínas de la membrana celular selectiva para los iones potasio.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Familia de bacterias del suelo. También incluyen algunas formas parásitas.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Cualquier enzima, perteneciente a un subgrupo de enzimas de la clase transferasa, que cataliza la transferencia de un grupo metilo desde un compuesto a otro. (Dorland, 28a ed). EC 2.1.1.
Incremento selectivo en el número de copias de un gen que codifica para una proteína específica sin un incremento proporcional en otros genes. Ocurre náturalmente mediante la extirpación de una copia de secuencia repetidora de un cromosona y su replicación extracromosómica en un plasmidio, o mediante la producción de un transcripto de ARN de la secuencia entera de repetición del ARN ribosómico seguida por la transcripción inversa de la molécula para producir una copia adicional de la secuencia de ADN original. Se han introducido técnicas de laboratorio para inducir replicación desproporcional mediante cruzamiento desigual, admisión de ADN de células lisadas, o generación de secuencias extracromosómicas derivadas de la replicación de circunferencias primitivas.