Streptomyces
Streptomyces är ett släkte av grampositiva, strikt aeroba bakterier som tillhör ordningen Actinomycetales. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att producera en rad olika antibiotika och andra bioaktiva metaboliter, vilket gör dem viktiga inom biomedicinsk forskning. Streptomyces-arterna har en komplex livscykel som inkluderar sporbildande hyfer och vegetativa mycel. De förekommer naturligt i en rad olika miljöer, till exempel jord, vatten och på levande växter.
Streptomyces griseus
'Streptomyces griseus' är en art av Gram-positiva, strikt aeroba bakterier som tillhör släktet Streptomyces. Denna bakterie är känd för sin förmåga att producera ett antibiotikum kallat streptomycin, som är verksamt mot flera gramnegativa och grampositiva bakterier, inklusive tuberkulosbacillen. 'Streptomyces griseus' har en komplex livscykel som involverar sporbildning och koloniverspridning. Denna bakterie förekommer naturligt i jord och vattenmiljöer och spelar en viktig roll i nedbrytningen av organiska material.
Streptomyces coelicolor
'Streptomyces coelicolor' är en art av grampositiva bakterier som tillhör släktet Streptomyces och familjen Streptomycetaceae. Den är känd för sin förmåga att producera ett antal olika antibiotika, inklusive aktinorhodin, undecylprodigiosin och calciumdependentant cyklopeptid. 'Streptomyces coelicolor' används ofta som en modellorganism inom forskning om bakteriers sekundära metabolism, genetik och cellbiologi.
Streptomyces lividans
'Streptomyces lividans' är en grampositiv bakterie som tillhör ordningen Actinomycetales och familjen Streptomycetaceae. Den är känd för sin förmåga att producera en rad olika bioaktiva molekyler, inklusive antibiotika och enzymer. 'Streptomyces lividans' används ofta som värdorganism vid genetisk manipulation och proteinproduktion på grund av sin goda tillväxt på billiga näringsmedel och sin förmåga att producera och sekretera stora mängder av heterologa proteiner. Den är också en modellorganism för studier av streptomyces-bakteriers differentiering och sekundära metabolitproduktion.
Streptomyces antibioticus
'Streptomyces antibioticus' är en bakteriestam som tillhör släktet Streptomyces, och är känd för sin förmåga att producera ett flertal olika antibiotika, inklusive streptomycin. Detta gram-positiva bacteria hör till aktinobakteriarna och förekommer naturligt i jordmånens mikroflora. Den har använts kommersiellt för att producera antibiotika som används inom medicinen för behandling av olika infektioner orsakade av bakterier.
Streptomyces aureofaciens
Antrakinoner
Jäsning
Molekylsekvensdata
Antibakteriella medel
Kemiska substanser som produceras av mikroorganismer och som, i utspädda lösningar, har förmåga att hämma tillväxten hos eller döda andra organismer. Antibiotika vars toxicitet tolereras av värden anv änds som kemoterapeutiska preparat för behandling av infektionssjukdomar hos människor, djur och växter.
Naftasener
Multigenfamilj
En uppsättning gener som genom mångfaldigande och variation härstammar från någon ursprunglig gen. Sådana gener kan sitta tillsammans på samma kromosom eller vara utspridda på olika kromosomer. Exempel på multigenfamiljer är de som kodar för hemoglobiner, immunglobuliner, histokompatibilitetsantigener, aktiner, tubuliner, keratiner, kollagener, stressproteiner, salivproteiner, korioproteiner, membranproteiner, ägguleproteiner och faseoliner, och även histoner, ribosom-RNA och tRNA-gener. De tre senare utgör exempel på upprepningsgener, av vilka det finns hundratals identiska i tandemformationer.
Prodigiosin
Prodigiosin är ett rödviolett pigment som produceras av vissa stammar av bakterien Serratia marcescens och andra relaterade arter. Det är ett sekundärt metabolit med potentialen att ha antibiotiska, antiproliferativa och cytotoxiska egenskaper. Prodigiosin har också visat sig ha immunomodulerande och neuroprotektiva effekter i vissa studier.
Reglering av genuttryck, bakterier
Aminosyrasekvens
Kloning, molekylär
Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.
Jordmikrobiologi
Streptomycetaceae
Streptomycetaceae är en familj av gram-positiva, aeroba och filamentösa bakterier som tillhör ordningen Actinomycetales. Dessa bakterier förekommer naturligt i jord och vatten och är kända för sin förmåga att producera en rad olika antibiotika och andra bioaktiva metaboliter. De flesta arterna inom familjen Streptomycetaceae lever som saprofyter, men några få arter kan vara patogena hos människor och djur.
Bassekvens
Makrolider
Sporer, bakteriella
4-butyrolakton
Dihydro-2(3H)-furanon. En endogen substans, framställd ur gamma-aminobutyrat och prekursor till gamma-hydroxybutyrat, som även används farmakologiskt. Den verkar uppenbarligen som modulator vid bindni ngsstället för pikrotoxin på GABA-A-receptorer och kan också ha verkan på GABA-B-receptorer. Används huvudsakligen experimentellt. Bland andra systemiska effekter orsakar den en ökning av dopamin i hj ärnan genom att hämma frisläppandet från nervändarna. Har också bruk som industrellt lösningsmedel och prekursor.
Molekylstruktur
DNA-sekvensanalys
Tylosin
Plasmider
En plasmid är en liten, cirkulär dubbelsträngad DNA-molekyl som kan replikera självständigt och förekommer hos bakterier och andra encelliga organismer. Plasmider kan överföras mellan celler och innehåller ofta gener som ger resistens mot antibiotika eller kodar för toxiner. De används också i molekylärbiologi som vektorer för kloning av gener.
Magnetisk resonansspektroskopi
Leukomyciner
En komplex förening med antibiotisk verkan som produceras av Streptomyces kitasatoensis. Föreningen består av åtminstone åtta biologiskt aktiva komponenter, A1 och A3 till A9. Leukomyciner är verksamma både mot bakterier och mykoplasma.
Cefamyciner
RNA, ribosomalt, 16S
16S RNA er en typ av ribosomalt RNA (rRNA) som finnes i prokaryote ribosomer og har en viktig rolle i translasjonen av genetisk informasjon til proteinsyntese. 16S rRNA-molekylen er en del av den lille ribosomale subuniten og inneholder konserverte sekvensregioner som kan brukes til identifisering og klassifisering av forskjellige arter av bakterier og archaea.
Kandicidin
Blandning av svampdödande heptaenmakrolider från Streptomyces griseus eller Actinomyces levoris för lokal behandling av candidiasis. Det antibiotiska komplexet består av kandicidin A, B, C och D, av vilka D är den huvudsakliga beståndsdelen.
Kemi
I en enkel medicinsk kontext kan 'kemi' definieras som studiet och användandet av kemiska substance och deras reaktioner för att förstå, behandla eller förebygga sjukdomar. Detta inkluderar bland annat utvecklingen av läkemedel, toxikologi och farmakokinetik. Kemi är en grundläggande vetenskap som är intimt förknippad med många aspekter av medicinen.
Kemiska fenomen
"Kemiska fenomen" refererar till de observationer och händelser som sker när materia bestående av atomer och molekyler interagerar på ett sätt som resulterar i förändringar orsakade av kemiska reaktioner, inklusive bildning och brytande av kemiska bindningar, förskjutningar i elektronfördelning och energiflyt.
Odlingsmedia
Varje flytande eller fast preparat som är specifikt avsett för odling, lagring eller transport av mikroorganismer eller andra sorters celler. Olika typer av media, såsom differentierande substrat, selektiva substrat, testsubstrat och definierade substrat, tillåter odling av bestämda mikroorganismer och celltyper. Fasta medier erhålls genom tillsats av agar eller gelatin till flytande substrat.
Naftokinoner
NAFTOKINONER är en grupp av aromatiska komplexa kväveheterocykler som förekommer naturligt i vissa växter, djur och mikroorganismer. De fungerar ofta som antioxidanter och hjälper till att skydda celler från skada. Naftokinoner har också visat sig ha potential som antiinflammatoriska, antibakteriella och antivirala medel. Vitamin K, ett viktigt vitamin för blodkoagulering, är ett exempel på en naturlig naftokinon.
Biosyntetiska banor
RNA, bakteriellt
Restriktionskartläggning
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Open Reading Frames
I en mening kan "Open Reading Frames" (ORF) definieras som en sekvens av DNA eller RNA som har potentialen att koda för ett protein. ORF börjar med en startkodon, vanligtvis AUG, och fortsätter till nästa stoppkodon (UAG, UAA eller UGA). Den resulterande aminosyrasekvensen kan potentiellt vara kapabel till att bilda ett protein om den översätts korrekt. Det är värt att notera att inte alla ORF:er leder nödvändigtvis till produktionen av ett funktionellt protein, eftersom det kan finnas flera skäl till varför translationen kan misslyckas eller ge upphov till en icke-funktionell peptid.
Aktinobakterier
Fenomen inom fysikalisk kemi
I en mening kan fenomen inom fysikalisk kemi definieras som de observerbara och beskrivbara händelser eller processer som sker på atom- och molekylnivå, baserat på principer och lagar inom fysiken. Exempel på sådana fenomen kan vara lösningars bildande, kemiska reaktioners energidynamik, elektrisk ledning i vätskor och fasta material, samt struktur och egenskaper hos konjugerade system.
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Kemi, fysikalisk
Kolibakterie
Ribosom-DNA
Spiramycin
Spiramycin är ett makrolidantibiotikum som används för behandling av olika infektioner orsakade av bakterier, särskilt respiratoriska och hudinfektioner. Det fungerar genom att stoppa tillväxten och förökarningen av susceptibla bakterier inom stunden efter dosering. Spiramycin används också som profylax vid exponering för toxoplasmosinfektion under graviditet.
Polyener
I biokemin refererar 'polyener' till molekyler som innehåller flera (poly) energirika fosfatbindningar (enER). Dessa bindningar kan dissocieras för att frigöra energi, vilket gör polyener till viktiga energikällor i cellulära processer. Exempel på polyener är ATP (adenosintrifosfat) och GTP (guanosintrifosfat).
Kromomyciner
Oleandomycin
Oleandomycin är ett macrolidantibiotikum som används för behandling av olika typer av bakteriella infektioner, särskilt i övre luftvägarna och huden. Det fungerar genom att stoppa bakteriens förmåga att producera protein, vilket är nödvändigt för dess överlevnad och multiplikation. Oleandomycin har även visat sig vara verksamt mot atypiska mykobakterier.
Högtrycksvätskekromatografi
Mutation
Streptomycin
Streptomycin är ett antibiotikum som tillhör aminoglykosidgruppen och är verksamt mot flera gramnegativa och grampositiva bakterier, inklusive tuberkulosbakterien. Det fungerar genom att störa bakteriens proteinsyntes, vilket leder till död av bakterien. Streptomycin används vanligen i kombination med andra antibiotika för att behandla allvarliga infektioner och tuberkulos.
Bakteriekromosomer
Ivermektin
En blandning av huvudsakligen avermektin H2B1a och en del avermektin H2B1b, vilka är makrolider från Streptomyces avermitilis. Medlet binder glutamatstyrda kloridkanaler, vilket ger ökad permeabilitet och hyperpolarisering hos nerv- och muskelceller. Det samverkar också med andra kloridkanaler. Ivermektin är ett parasitmedel av bredspektrumtyp som är verksamt mot mikrofilarier till Onchocerca volvulus, men inte det vuxna stadiet.
Test för genetisk komplementering
Tiostrepton
Laktoner
Cykliska estrar av hydroxikarboxylsyror, med en 1-oxacykloalkan-2-on-struktur. Stora, cykliska laktoner med fler än ett dussin atomer är makrolider.
Transformation, bakteriell
"Bakteriel transformation" är ett begrepp inom mikrobiologi och genetik som refererar till processen där en bakteriecell tar upp främmande DNA (deoxyribonucleic acid) från sin omgivning, integrerar det i sitt eget genom och på så sätt förändrar sina arvsmassa och egenskaper. Detta fenomen upptäcktes av Frederick Griffith 1928 och är ett viktigt forskningsområde inom molekylär biologi, med tillämpningar inom bland annat genteknik och medicinsk forskning.
Streptotricin
Streptotricin är ett samlingsnamn för en grupp antibiotika som produceras av Streptomyces griseus bakterier. Dessa substanser är kända för sin förmåga att inhibera proteintranslering hos bakterier, vilket gör dem effektiva mot många grampositiva och gramnegativa bakterier. Streptotriciner används inte som läkemedel på grund av deras toxicitet för djurceller, men de har forskningsmässigt använts för att utveckla andra antibiotika med liknande egenskaper.
Läkemedelsresistens, mikrobiell
Xylella
Xylella är ett släkte av bakterier som orsakar sjukdomar hos växter, särskilt i medelhavsområdet. Den mest kända arten är Xylella fastidiosa, som kan leda till dödlig skador på en rad olika värdväxter, inklusive olivträd, citrusfrukter och druvor.
Klavulansyra
Klavulansyra (C8H9O5N) och dess salter och estrar. Syran är en självmordsblockerare av bakteriella betalaktamasenzymer från Streptomyces clavuligerus. När den ges för sig har den endast svag antibakteriell verkan, men i kombination med betalaktamantibiotika hindrar den mikrobiellt laktamas att inaktivera antibiotikaeffekten.
Oxitetracyklin
"Oxitetracycliner är en grupp av brett verksamma antibiotika som står för sin bakteriestatiska aktivitet genom att hämma proteinsyntesen hos bakterier. De används vanligtvis för behandling av olika infektioner orsakade av både grampositiva och gramnegativa bakterier, såsom lunginflammation, hudinfektioner och urinvägsinfektioner. Oxitetracykliner har även visat sig vara verksamma mot vissa parasiter och protozoer."
Laktamer
Cykliska amider som bildas ur aminokarboxylsyror genom förlust av vatten. Laktimer är enolformer av laktamer.