La rappresentazione numerica tabulari GGQ variabilità mostrare i loro valori come probabilità per ogni possibile residui su ogni posizione in sequenza. Position-specific matrici di punteggio (PSSMs) è calcolata in base alla posizione frequenza matrici.
Un processo che include la determinazione di amino acido sequenza di una proteina (o peptide, peptide oligopeptide o frammento e le informazioni di analisi della sequenza.
Un meshwork-like sostanza trovata extracellulare e in associazione con la membrana della superficie cellulare. Promuove di proliferazione cellulare e fornisce una struttura a cui le cellule in coltura cellulare lysates piatti aderire.
Una procedura consistente in una sequenza di formule algebrica e / o a passi logici di calcolare o stabilire una data.
Sequenziale l programmi e dati che istruire il funzionamento di un computer digitale.
Un campo della biologia lo sviluppo delle tecniche per la raccolta e alla manipolazione di informazioni biologiche, e l ’ uso di tali dati per essere scoperte biologico o fare pronostici. Questo campo racchiuda tutti metodi computazionali e teorie per risolvere problemi biologici incluso manipolazione di modelli e serie di dati.
Database contenente informazioni di proteine quali amino acido sequenza; PROTEIN la conferma, e altre proprieta '.
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.
Che sono sintetizzati glicosilati di lineare su ribosomi e può essere ulteriormente modificato, crosslinked, tagliato o assemblata in le proteine complesse con diversi subunità. La specifica sequenza di amminoacidi del polipeptide ACIDS determina la forma, durante PROTEIN SCATOLA, e la funzione della proteina.
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Imparando algoritmi che sono una serie di computer sotto controllo i metodi di apprendimento e analizzare dati e riconosce gli schemi e ha usato per la classificazione e analisti di regressione.
Le componenti del macromolecule direttamente partecipare precisa combinazione con un'altra molecola.
L'ordine di aminoacidi che si verifichi in una catena polipeptidica. Questo viene definito la struttura primaria di proteine, è molto importante nel determinare PROTEIN la conferma.
Un computer di reti di comunicazione in tutto il mondo. I network di internet sono connessi attraverso reti diverse spina dorsale. Internet è cresciuto da ARPAnet progetto e il governo americano è stato disegnato per facilitare lo scambio di informazioni.
La sequenza delle purine e PYRIMIDINES in acidi nucleici e polynucleotides. È anche chiamato sequenza nucleotide.
Un processo che include la clonazione, assemblata mappatura della fisica subcloning, determinazione della sequenza di DNA, analisi e informazioni.
Macromolecular composti che contengono carbonio, idrogeno, ossigeno, azoto e zolfo. Di solito questi macromolecules (proteine) forma un'intricata umore acqueo sia in quali sono le cellule inserito per costruire i tessuti. Variazioni nella relativa tipi di macromolecules e la loro organizzazione determinare il tipo di matrice extracellulare, ogni adeguati ai requisiti funzionali dei tessuti. I due principali categorie di macromolecules che formano la matrice extracellulare sono: Glicosaminoglicani, normalmente associate alle proteine plasmatiche (proteine) e dei proteoglicani fibroso (ad esempio collagene; elastina; FIBRONECTINS; e La Laminina).
Un secreto Endopeptidasi omologhe con collagenasi interstiziale, ma che possiede un ’ ulteriore fibronectin-like dominio.
Una famiglia di zinc-dependent metalloendopeptidases coinvolto MATRIX extracellulare, riduce la degradazione di componenti.
Le formulazioni statistica e analisi che, quando applicata a dati e trovato per i dati, e poi utilizzata per verificare le ipotesi e parametri utilizzati nell ’ analisi. Esempi di modelli statistici sono i modelli lineari, doppia modello, modello, modello polinomiale two-parameter, ecc.
Comunemente osservati elementi portanti di proteine, formato da combinazioni di strutture secondaria adiacente. Un comunemente osservati struttura é composto da una sequenza di CONSERVED che possono essere rappresentate da un consenso sequenza.
Il livello di proteine struttura in cui interazioni di periodi di hydrogen-bond catena polipeptidica all 'interno di alfa, beta elice filamenti (che si allineeranno formando beta lenzuola) o altri tipi di bobine. Questa è la prima scatola conferma livelli di proteina.
Di solito endogena attivi, proteine, che siano efficaci nel trattamento dell 'inizio del trattamento, stimolazione, o la cessazione dell' trascrizione genetica.
Teoria e lo sviluppo dei computer TITOLI che svolgere attività che richiedono l'intelligenza umana. Tali compiti possono comprendere un riconoscimento vocale, impara; VISUAL intuizione; COMPUTING matematico; ragionamento, problema SOLVING, GLI e traduzione del linguaggio.
Il residuo normativo struttura del nucleo cellulare che molti di tutti gli elementi architettonici del nucleo della cellula inclusa la lamina nucleare con poro nucleare, strutture complesse residua NUCLEOLI e una vasta cella fibrogranular struttura nell'entroterra. Nucleare degli enzimi (et Regul. 2002; 42: 39-52)
Una sequenza di aminoacidi in una glucosio-dipendente o di DNA o RNA nucleotidi che è simile in molteplici specie. Una serie di sequenze conservate è rappresentato da un consenso sequenza. Amino acido motivi sono spesso composto da conservato sequenze.
I composti organici che generalmente contiene una amino (-NH2) e un carbossile (-COOH). 20 alpha-amino acidi sono i subunità che sono polymerized per formare delle proteine.
Modelli utilizzati sperimentalmente o teoricamente a studiare, molecolare delle proprieta ', o interazioni di natura analoga; include molecole di grafica computerizzata, e meccanica strutture.
Un polimero deossiribonucleotide è il principale materiale genetico delle cellule eucariotiche procariote. E tutti gli organismi normalmente contiene DNA in uno Stato a doppia catena, eppure diversi importanti processi biologici temporaneamente coinvolgere spaiati regioni. DNA, che consiste in una proiezioni polysugar-phosphate spina dorsale possiede delle purine (adenina, guanina, citosina e timina pyrimidines (e), forma una doppia elica che e 'tenuto insieme da legami idrogeno tra questi purine e pyrimidines (adenina a timina e guanina, citosina).
Rappresentazioni teorico che simula il comportamento o dell 'attività degli processi chimici o fenomeni; include l ’ uso di equazioni matematiche, computer e altre apparecchiature elettroniche.
Una specie di piccolo, two-winged mosche contenente circa 900 descritto specie. Questi organismi sono i studiato approfonditamente di tutti i generi dal punto di vista della genetica e citologia.
Sostanza extracellulari a base di tessuto osseo delle fibre di collagene, terra, e cristallino inorganico minerali e sale.
Il processo di cambiamento a livello cumulativo del DNA, RNA e proteine, per generazioni successive.
Lo sviluppo di parti anatomiche per creare la forma di un organismo somministrazioni singole o multi-cell. Morfogenesi fornisce forma cambia di una parte, parti, o l'intero organismo.
La parte di un programma interattivo che questioni e riceve messaggi a comando da un utente.
Un membro della famiglia di enzimi che Metalloproteinase è principalmente responsabile staccando FIBRILLAR collagene, e può degradare Fibrillari interstiziale, tipo I, II e III.
Composti che inibiscono l ’ attività enzimatica o attivazione di MATRIX indici di infiammazione.
Il grado di somiglianza tra sequenze di aminoacidi. Queste informazioni sono utili per la relazione genetica analisi di proteine e specie.
Informatizzato rappresentazione di sistemi fisici e fenomeni quali processi chimici.
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Proteine che derivano dalla... specie di insetti che appartiene al genere Drosophila. Le proteine del piu 'intensa e studiato specie di Drosophila, sulla Drosophila melanogaster, sono oggetto di grande interesse per la zona della morfogenesi e lo sviluppo.
Database devoto a conoscenza di geni specifici e prodotti genici.
Un vertebrato Endopeptidasi extracellulare di tessuti simili a MATRIX Metalloproteinase 1. Che digerisce PROTEOGLYCAN; fibronectina:; collagene di tipo III, IV, V e IX e attiva procollagenase. (Enzima nomenclatura, 1992)
Riproducibilità Dei misure statistiche (spesso in un contesto clinico), incluso il controllo di strumenti e tecniche per ottenere risultati riproducibile. Il concetto include riproducibilità Dei misurazioni fisiologiche, che può essere utilizzato per valutare la probabilità di sviluppare regole o prognosi, o dalla risposta agli stimoli; riproducibilità Dei verificarsi di una condizione; e risultati sperimentali riproducibilità Dei.
Rappresentazioni teorico che simula il comportamento o dell 'attività degli processi genetici o fenomeni e includono l ’ uso di equazioni matematiche, computer e altre apparecchiature elettroniche.
La caratteristica forma tridimensionale di una proteina, incluso il secondario, supersecondary (motivi), la terza quaternaria (dominio) e struttura della catena peptidica. Proteine quaternaria descrive la struttura, conferma assumed by multimeric proteine (aggregati di più di una catena polipeptidica).
Tracce riscontrabili di organismi e ereditabile cambiamento nel materiale genetico che causa un cambiamento del genotipo e trasmesse a figlia e ai diversi generazioni.
Una specie di moscerino molto usate in genetica per colpa dell 'ampiezza dei suoi cromosomi.
Processi implicato nella formazione del PROTEIN struttura terziaria.
La spaziale disposizione degli atomi di un acido nucleico polynucleotide o che comporta suo caratteristico forma tridimensionale.
Uno dei processi che nucleare, citoplasmatica o fattori di interregolazione cellulare influenza il differenziale il controllo di Gene azione durante la fase di sviluppo di un organismo.
Il processo in cui endogena o di sostanze, o, esogene peptidi legarsi a proteine, enzimi, o alleati precursori delle proteine di legame alle proteine specifiche misure composti sono spesso usati come metodi di valutazione diagnostica.
Proteine che si legano al DNA. La famiglia contiene proteine che si legano ad entrambi e doppio filamento spaiato DNA e include anche proteine leganti specifica il DNA nel siero che possono essere usati come segni per malattie maligne.
L'apparenza esteriore dell'individuo. E 'il risultato di interazioni tra geni e tra il genotipo e l ’ ambiente.
Sequenze di DNA che sono riconosciuti (direttamente o indirettamente) e di RNA DNA-dipendente polimerasi durante la fase iniziale della trascrizione. Altamente sequenze conservate nell'promoter includono la scatola Pribnow nei batteri e la TATA BOX in eukaryotes.
La biosintesi del RNA condotti in un modello di DNA. La biosintesi del DNA di un modello si chiamato RNA invertito Transcription.
Classificazione binario misure per valutare i risultati del test di sensibilità o ricordare la percentuale di vero positivi. Specificità è la probabilità di correttamente determinare l 'assenza di una condizione. (Di Ieri, dizionario di Epidemiologia, secondo Ed)
Un Transmembrane Domain-Containing Matrix Metalloproteinase. È sintetizzata come inattivo zymogen che viene attivato dall 'azione di PROPROTEIN Convertases come furina. Matrix Metalloproteinase 14 gioca un ruolo diretto nel solco delle proteine del pericellular ambiente e può funzionare con metodi enzimatici proprotein indirettamente da attivare la forma di MATRIX Metalloproteinase 15.
Qualsiasi membro della MATRIX indici di infiammazione, e svolge un ruolo nel tumore progressione.
Un secreto Matrix Metalloproteinase che gioca un ruolo fisiologica la degradazione della matrice extracellulare trovato nei tessuti. È sintetizzata come precursore inattivo attivata per la segmentazione proteolitica dei suoi propeptide.
Una specie del genere Saccharomyces, famiglia Saccharomycetaceae, ordine Saccharomycetales, conosciuto come "pasticcino" o "com'è secco" candidamente. Forma è usato come integratore alimentare.
Un glucosio-dipendente attivo comprendente circa un terzo delle proteine totali in organismi di mammifero. E 'il principale componente delle pelle; - connettivo; e la sostanza organica delle ossa (e) le ossa e denti (dente).
Glicoproteine presenti sulla superficie delle cellule, in particolare in strutture fibrillar. Le proteine sono scomparsi o ridotti se queste cellule sono sottoposte a trasformazione chimico o virale, sono altamente sensibile alla proteolisi e sono substrati per il fattore VIII della coagulazione del sangue. I moduli presente nel plasma sono chiamati cold-insoluble sessuali.
Matrice indici di infiammazione associati alla membrana cellulare, sia tramite settori diversi, o transmembrana GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL ancore. Membrane-type indici di infiammazione può agire all'interno della matrice pericellular ambiente di influenzare il processo di CELLULARE MIGRAZIONE.
Un secreto Matrix Metalloproteinase che è altamente espressa da macrofagi dove si svolga un ruolo nella ferita INFLAMMATION e aiutarvi.
Endopeptidasi che usare un metal come commercio dello zinco nel processo catalitico.
Propagati in vitro in cellule speciale media favorevoli alla crescita. Colture cellulari sono utilizzati per studiare, sullo sviluppo morphologic, disturbo metabolico e fisiologico processi genetici, tra gli altri.
Un membro della famiglia di INIBITORI DELLA - di indici di infiammazione, e 'un peso molecolare, proteine N-glycosylated 28 kD, prodotto da una vasta gamma di tipologie cellulari e ho trovato in una varietà di tessuti e fluidi corporei. È stato dimostrato a sopprimere metastasi e tumore invasione inibisce in vitro.
La tipologia delle metalloproteinasi della matrice che sono secreti nel pericellular spazio.
Proteine associate con la superficie interna del lipidica a due strati di involucro virale. Queste proteine sono coinvolto nel controllo della trascrizione inversa virale e potrebbe mai servire come "colla" che blocca il nucleocapsid al relativo sito promettente virale membrana della cellula ospite.
Una famiglia di secrezione proteasi le proteine inibitorie che regola l ’ attività di SECRETED MATRIX METALLOENDOPEPTIDASES, giocano un ruolo importante per la modulazione della proteolisi di MATRIX extracellulare, soprattutto durante la ricostruzione e del tessuto processi infiammatori.
Enzimi in grado di catalizzare la degradazione del collagene agendo sui legami peptidici.
Un membro della famiglia di INIBITORI DELLA - di indici di infiammazione 21-kDa nonglycosylated. È una proteina presente nel liquido nei tessuti ed è escreto come complesso con progelatinase A mediante fibroblasti uncomplexed da umani e nei macrofagi alveolari. Un iperespressione di TIMP-2 ha mostrato di inibire invasiva e attività di tumore metastatico e riduzione la crescita del tumore in vivo.
Grande, noncollagenous glicoproteina con proprietà antigeniche. E 'localizzato nella cantina della membrana lucida e le funzioni per legare cellule epiteliali in cantina. Le prove suggeriscono che la proteina svolge un ruolo nel tumore invasione.
Glicoproteine che hanno un'alta polisaccaride contenuto.
Tessuto connettivo cellule che secernono una matrice extracellulare ricca di collagene e altri macromolecules.
Una classe di enzimi che catalizza l ’ inattivazione della gelatina agendo sui legami peptidici. CE 3.4.24.-.
Un secreto Matrix Metalloproteinase che svolga un ruolo nella matrice degradazione durante ferita aiutarvi. È espresso in crescita dei cheratinociti, suggerendo che il suo ruolo nel Cheratinocita migrazione.
Componente principale di chondrocyte MATRIX extracellulare di vari tessuti comprese le ossa, legamenti sinovia, tendini e vasi sanguigni. Si lega alle proteine MATRILIN ed è associata con lo sviluppo della cartilagine e ossa.
Il movimento delle cellule di un luogo a un altro. Distinguere CYTOKINESIS che e 'il processo di dividere il citoplasma cellulare.
La più comune forma di fibrillar collagene. E 'un componente delle ossa (e) le ossa e pelle e consiste di un Heterotrimer di due alpha1 (i) e una alpha2 (i) le catene.
Una forma di del tessuto connettivo non-vascular composto da parte dei condrociti incastrato in una matrice che include condroitina ULFATE e vari tipi di collagene FIBRILLAR. Ci sono tre tipi: Cartilagine ialina; Fibrocartilagine; e ELASTIC cartilagine.