Position-Specific Scoring Matrices
Analisi Di Sequenza Proteica
Matrice Extracellulare
Algoritmi
Biologia Computazionale
Un campo della biologia lo sviluppo delle tecniche per la raccolta e alla manipolazione di informazioni biologiche, e l ’ uso di tali dati per essere scoperte biologico o fare pronostici. Questo campo racchiuda tutti metodi computazionali e teorie per risolvere problemi biologici incluso manipolazione di modelli e serie di dati.
Basi Di Dati Di Proteine
Database contenente informazioni di proteine quali amino acido sequenza; PROTEIN la conferma, e altre proprieta '.
Allineamento Di Sequenze
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.
Proteine
Che sono sintetizzati glicosilati di lineare su ribosomi e può essere ulteriormente modificato, crosslinked, tagliato o assemblata in le proteine complesse con diversi subunità. La specifica sequenza di amminoacidi del polipeptide ACIDS determina la forma, durante PROTEIN SCATOLA, e la funzione della proteina.
Dati Di Sequenza Molecolare
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Support Vector Machines
Imparando algoritmi che sono una serie di computer sotto controllo i metodi di apprendimento e analizzare dati e riconosce gli schemi e ha usato per la classificazione e analisti di regressione.
Siti Di Legame
Sequenza Aminoacidica
L'ordine di aminoacidi che si verifichi in una catena polipeptidica. Questo viene definito la struttura primaria di proteine, è molto importante nel determinare PROTEIN la conferma.
Internet
Sequenza Base
Analisi Di Sequenze Di Dna
Un processo che include la clonazione, assemblata mappatura della fisica subcloning, determinazione della sequenza di DNA, analisi e informazioni.
Proteine Della Matrice Extracellulare
Macromolecular composti che contengono carbonio, idrogeno, ossigeno, azoto e zolfo. Di solito questi macromolecules (proteine) forma un'intricata umore acqueo sia in quali sono le cellule inserito per costruire i tessuti. Variazioni nella relativa tipi di macromolecules e la loro organizzazione determinare il tipo di matrice extracellulare, ogni adeguati ai requisiti funzionali dei tessuti. I due principali categorie di macromolecules che formano la matrice extracellulare sono: Glicosaminoglicani, normalmente associate alle proteine plasmatiche (proteine) e dei proteoglicani fibroso (ad esempio collagene; elastina; FIBRONECTINS; e La Laminina).
Gelatinasi A
Un secreto Endopeptidasi omologhe con collagenasi interstiziale, ma che possiede un ’ ulteriore fibronectin-like dominio.
Metalloproteinasi Della Matrice
Modelli Statistici
Le formulazioni statistica e analisi che, quando applicata a dati e trovato per i dati, e poi utilizzata per verificare le ipotesi e parametri utilizzati nell ’ analisi. Esempi di modelli statistici sono i modelli lineari, doppia modello, modello, modello polinomiale two-parameter, ecc.
Motivi Strutturali Degli Aminoacidi
Comunemente osservati elementi portanti di proteine, formato da combinazioni di strutture secondaria adiacente. Un comunemente osservati struttura é composto da una sequenza di CONSERVED che possono essere rappresentate da un consenso sequenza.
Struttura Secondaria Della Proteina
Il livello di proteine struttura in cui interazioni di periodi di hydrogen-bond catena polipeptidica all 'interno di alfa, beta elice filamenti (che si allineeranno formando beta lenzuola) o altri tipi di bobine. Questa è la prima scatola conferma livelli di proteina.
Fattori Di Trascrizione
Di solito endogena attivi, proteine, che siano efficaci nel trattamento dell 'inizio del trattamento, stimolazione, o la cessazione dell' trascrizione genetica.
Intelligenza Artificiale
Matrice Nucleare
Il residuo normativo struttura del nucleo cellulare che molti di tutti gli elementi architettonici del nucleo della cellula inclusa la lamina nucleare con poro nucleare, strutture complesse residua NUCLEOLI e una vasta cella fibrogranular struttura nell'entroterra. Nucleare degli enzimi (et Regul. 2002; 42: 39-52)
Sequenza Conservata
Una sequenza di aminoacidi in una glucosio-dipendente o di DNA o RNA nucleotidi che è simile in molteplici specie. Una serie di sequenze conservate è rappresentato da un consenso sequenza. Amino acido motivi sono spesso composto da conservato sequenze.
Aminoacidi
I composti organici che generalmente contiene una amino (-NH2) e un carbossile (-COOH). 20 alpha-amino acidi sono i subunità che sono polymerized per formare delle proteine.
Modelli Molecolari
Dna
Un polimero deossiribonucleotide è il principale materiale genetico delle cellule eucariotiche procariote. E tutti gli organismi normalmente contiene DNA in uno Stato a doppia catena, eppure diversi importanti processi biologici temporaneamente coinvolgere spaiati regioni. DNA, che consiste in una proiezioni polysugar-phosphate spina dorsale possiede delle purine (adenina, guanina, citosina e timina pyrimidines (e), forma una doppia elica che e 'tenuto insieme da legami idrogeno tra questi purine e pyrimidines (adenina a timina e guanina, citosina).
Modelli Chimici
Drosophila
Matrice Ossea
Sostanza extracellulari a base di tessuto osseo delle fibre di collagene, terra, e cristallino inorganico minerali e sale.
Evoluzione Molecolare
Morfogenesi
Lo sviluppo di parti anatomiche per creare la forma di un organismo somministrazioni singole o multi-cell. Morfogenesi fornisce forma cambia di una parte, parti, o l'intero organismo.
Interfaccia Utente-Computer
Matrix Metalloproteinase 1
Un membro della famiglia di enzimi che Metalloproteinase è principalmente responsabile staccando FIBRILLAR collagene, e può degradare Fibrillari interstiziale, tipo I, II e III.
Matrix Metalloproteinase Inhibitors
Omologia Di Sequenza Di Amino Acido
Il grado di somiglianza tra sequenze di aminoacidi. Queste informazioni sono utili per la relazione genetica analisi di proteine e specie.
Simulazione Computerizzata
Struttura Terziaria Della Proteina
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Proteine Della Drosophila
Proteine che derivano dalla... specie di insetti che appartiene al genere Drosophila. Le proteine del piu 'intensa e studiato specie di Drosophila, sulla Drosophila melanogaster, sono oggetto di grande interesse per la zona della morfogenesi e lo sviluppo.
Matrix Metalloproteinase 3
Un vertebrato Endopeptidasi extracellulare di tessuti simili a MATRIX Metalloproteinase 1. Che digerisce PROTEOGLYCAN; fibronectina:; collagene di tipo III, IV, V e IX e attiva procollagenase. (Enzima nomenclatura, 1992)
Riproducibilità Dei Risultati
Riproducibilità Dei misure statistiche (spesso in un contesto clinico), incluso il controllo di strumenti e tecniche per ottenere risultati riproducibile. Il concetto include riproducibilità Dei misurazioni fisiologiche, che può essere utilizzato per valutare la probabilità di sviluppare regole o prognosi, o dalla risposta agli stimoli; riproducibilità Dei verificarsi di una condizione; e risultati sperimentali riproducibilità Dei.
Modelli Genetici
Conformazione Della Proteina
La caratteristica forma tridimensionale di una proteina, incluso il secondario, supersecondary (motivi), la terza quaternaria (dominio) e struttura della catena peptidica. Proteine quaternaria descrive la struttura, conferma assumed by multimeric proteine (aggregati di più di una catena polipeptidica).
Mutazione
Drosophila Melanogaster
Conformazione Dell'Acido Nucleico
Regolazione Dell'Espressione Genica Nello Sviluppo
Legame Di Proteine
Proteine Leganti Dna
Fenotipo
Promoter Regions, Genetic
Sequenze di DNA che sono riconosciuti (direttamente o indirettamente) e di RNA DNA-dipendente polimerasi durante la fase iniziale della trascrizione. Altamente sequenze conservate nell'promoter includono la scatola Pribnow nei batteri e la TATA BOX in eukaryotes.
Trascrizione Genetica
Sensibilità E Specificità
Matrix Metalloproteinase 14
Un Transmembrane Domain-Containing Matrix Metalloproteinase. È sintetizzata come inattivo zymogen che viene attivato dall 'azione di PROPROTEIN Convertases come furina. Matrix Metalloproteinase 14 gioca un ruolo diretto nel solco delle proteine del pericellular ambiente e può funzionare con metodi enzimatici proprotein indirettamente da attivare la forma di MATRIX Metalloproteinase 15.
Matrix Metalloproteinase 7
Matrix Metalloproteinase 13
Un secreto Matrix Metalloproteinase che gioca un ruolo fisiologica la degradazione della matrice extracellulare trovato nei tessuti. È sintetizzata come precursore inattivo attivata per la segmentazione proteolitica dei suoi propeptide.
Saccharomyces Cerevisiae
Collagene
Un glucosio-dipendente attivo comprendente circa un terzo delle proteine totali in organismi di mammifero. E 'il principale componente delle pelle; - connettivo; e la sostanza organica delle ossa (e) le ossa e denti (dente).
Fibronectine
Glicoproteine presenti sulla superficie delle cellule, in particolare in strutture fibrillar. Le proteine sono scomparsi o ridotti se queste cellule sono sottoposte a trasformazione chimico o virale, sono altamente sensibile alla proteolisi e sono substrati per il fattore VIII della coagulazione del sangue. I moduli presente nel plasma sono chiamati cold-insoluble sessuali.
Matrix Metalloproteinases, Membrane-Associated
Matrix Metalloproteinase 12
Metalloendopeptidasi
Cellule Coltivate
Inibitore Tissutale Della Metalloproteasi-1
Un membro della famiglia di INIBITORI DELLA - di indici di infiammazione, e 'un peso molecolare, proteine N-glycosylated 28 kD, prodotto da una vasta gamma di tipologie cellulari e ho trovato in una varietà di tessuti e fluidi corporei. È stato dimostrato a sopprimere metastasi e tumore invasione inibisce in vitro.
Matrix Metalloproteinases, Secreted
La tipologia delle metalloproteinasi della matrice che sono secreti nel pericellular spazio.
Proteine Della Matrice Virale
Proteine associate con la superficie interna del lipidica a due strati di involucro virale. Queste proteine sono coinvolto nel controllo della trascrizione inversa virale e potrebbe mai servire come "colla" che blocca il nucleocapsid al relativo sito promettente virale membrana della cellula ospite.
Inibitori Tissutali Delle Metalloproteasi
Una famiglia di secrezione proteasi le proteine inibitorie che regola l ’ attività di SECRETED MATRIX METALLOENDOPEPTIDASES, giocano un ruolo importante per la modulazione della proteolisi di MATRIX extracellulare, soprattutto durante la ricostruzione e del tessuto processi infiammatori.
Collagenasi
Enzimi in grado di catalizzare la degradazione del collagene agendo sui legami peptidici.
Inibitore Tissutale Della Metalloproteasi-2
Un membro della famiglia di INIBITORI DELLA - di indici di infiammazione 21-kDa nonglycosylated. È una proteina presente nel liquido nei tessuti ed è escreto come complesso con progelatinase A mediante fibroblasti uncomplexed da umani e nei macrofagi alveolari. Un iperespressione di TIMP-2 ha mostrato di inibire invasiva e attività di tumore metastatico e riduzione la crescita del tumore in vivo.
Laminina
Fibroblasti
Tessuto connettivo cellule che secernono una matrice extracellulare ricca di collagene e altri macromolecules.
Gelatinasi
Matrix Metalloproteinase 10
Cartilage Oligomeric Matrix Protein
Componente principale di chondrocyte MATRIX extracellulare di vari tessuti comprese le ossa, legamenti sinovia, tendini e vasi sanguigni. Si lega alle proteine MATRILIN ed è associata con lo sviluppo della cartilagine e ossa.
Movimento Cellulare
Collagene Di Tipo I
La più comune forma di fibrillar collagene. E 'un componente delle ossa (e) le ossa e pelle e consiste di un Heterotrimer di due alpha1 (i) e una alpha2 (i) le catene.
Cartilagine
Una forma di del tessuto connettivo non-vascular composto da parte dei condrociti incastrato in una matrice che include condroitina ULFATE e vari tipi di collagene FIBRILLAR. Ci sono tre tipi: Cartilagine ialina; Fibrocartilagine; e ELASTIC cartilagine.