Espacio entre las membranas interna y externa de una célula que se comparte con la pared celular.
Proteínas que se encuentran en el PERIPLASMA de los organismos con paredes celulares.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Isomerasas de vinculo azufre-azufre que cataliza la reordenación de los enlaces de disulfuro en las proteínas durante el pliegue. Isoezimas disulfide-isomerasa de la proteina específica también se presentan como subunidades del PROCOLAGENO-PROLINA DIOXIGENASA.
Proteínas periplásmicas que barren o sienten diversos nutrientes. En el medio ambiente bacteriano suelen acoplarse a transportadores o receptores de quimiotaxia en la membrana bacteriana interna.
Proteínas periplásmicas que se unen a la MALTOSA y a la maltodextrina. Participan en el sistema de transporte de maltosa de las BACTERIAS.
Proteínas aisladas de la membrana externa de bacterias gramnegativas.
Secuencias aminoácidas que se hallan en proteínas transportadas que guían selectivamente la distribución de las proteínas a compartimentos celulares específicos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Células, usualmente bacterias o levaduras, que han perdido parcialmente su pared celular, su forma característica, y se tornan redondas.
Grupos químicos que contienen el enlace disulfuro covalente -S-S-. El átomo de azufre puede unirse a partes orgánicas o inorgánicas.
Proteinas de membrana cuya función primaria es facilitar el transporte de moléculas a través de una membrana biológica. En esta amplia categoria se incluyen las proteinas implicadas en el transporte activo (TRANSPORTE BIOLÓGICO ACTIVO), transporte ayudado y CANALES IÓNICOS.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Parte de una célula que contiene el CITOSOL y pequeñas estructuras que excluyen el NUCLEO CELULAR, MITOCONDRIA y las grandes VACUOLAS.(Glick, Glossary of Biochemistry and Molecular Biology, 1990)
Procesos que intervienen en la formación de ESTRUCTTURA TERCIARIA DE PROTEÍNA.
Membrana selectivamente permeable que contiene proteínas y lípidos y rodea el citoplasma de las células procariotas y eucariotas.
Proteínas que se encuentran en las membranas celulares e intracelulares. Están formadas por dos tipos, las proteínas periféricas y las integrales. Incluyen la mayoría de las enzimas asociadas con la membrana, proteínas antigénicas, proteínas transportadoras, y receptores de drogas, hormonas y lectinas.
Movimiento de materiales (incluyendo sustancias bioquímicas y drogas) a través de membranas celulares y capas epiteliales, generalmente por DIFUSIÓN pasiva.
Enzima que cataliza la conversión de un monoéster ortofosfórico y agua en un alcohol y ortofosfato. EC 3.1.3.1.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Proteínas recombinantes que se producen por TRADUCCIÓN GENÉTICA de genes de fusión formados por la combinación de SECUENCIAS REGULADORAS DEL ÁCIDO NUCLEICO de uno o mas genes con la proteina que codifica secuencias de uno o mas genes.
Proteínas de transporte que trasladan sustancias específicas en la sangre o a través de las membranas celulares.
Clase de todas las enzimas que catalizan reacciones de oxidación-reducción. El sustrato que es oxidado es considerado donador de hidrógeno. El nombre sistemático está basado en la oxidorreductasa donadora:aceptora. El nombre recomendado es deshidrogenasa, siempre que sea posible. Como alternativa puede usarse reductasa. Oxidasa sólo se usa en los casos en que el O2 es el aceptor.
Bacteriocinas elaboradas por cepas de Escherichia coli y especies asociadas. Son proteínas o complejos de proteína-lipopolisacáridos letales para otras cepas de la misma especie.
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
Grupo de citocromos con enlaces covalentes de tioéter, entre una o ambas cadenas vinílicas laterales del proto-heme y la proteína.
Familia de PROTEÍNAS DE TRANSPORTE DE MEMBRANA que requieren la hidrólisis del ATP para el transporte de substratos a través de las membranas. La família de proteínas deriva su nombre del dominio de unión a ATP encontrado en la proteína.
El proceso de movimiento de proteínas de un compartimiento celular (incluyendo extracelular) para otro por varias clasificaciones y mecanismos de transporte, tales como transporte de compuerta, desplazamiento de proteína y transporte vesicular.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Género de bacteria capaz de desarrollarse dentro de otra bacteria.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Un dextrodisacárido derivado de la malta y el almidón. Se usa como agente edulcorante y como intermediario fermentable en la industria cervecera.
Moléculas de proteínas que se encontraron originalmente en la membrana externa de las BACTERIAS GRAMNEGATIVAS y que forman canales multiméricos para la DIFUSIÓN pasiva de AGUA; IONES; u otras moléculas pequeñas. Las porinas están presentes en las PAREDES CELULARES bacterianas, así como en la MEMBRANA CELULAR y las MEMBRANAS MITOCONDRIALES de plantas, hongos, mamíferos y otros vertebrados.
Especie de bacteria aerobia gram negativa en forma de bastoncillo que comúnmente se aisla de muestras clínicas (heridas, quemaduras e infecciones del tracto urinario). Se encuentra también ampliamente disminuida en el suelo y el agua. La P. aeruginosa es un agente importante de las infecciones nosocomiales.
Enzima que cataliza la isomerización de residuos de prolina en el interior de las proteínas. EC 5.2.1.8.
Familia de proteínas celulares que median en la correcta conformación o desmontaje de polipéptidos y sus ligandos asociados. A pesar de que participan en el proceso de ensamblaje las chaperonas moleculares no son componentes de las estructuras finales.
Espacios delimitados dentro de las células debidos a membranas selectivamente permeables que encierran cada una de las partes separadas, por ej. mitocondrias, lisosomas, etc.
Una prueba que se usa para determinar si tendrá lugar o no la complementación (compensación en forma de dominancia) en una célula con un fenotipo mutante dado cuando otro genoma mutante, que codifica el mismo fenotipo mutante, se introduce en dicha célula.
Citocromos tipo C que son pequeñas proteínas de heme único (12-14 kD). Funcionan como transportadores de electrón móvil entre enzimas de enlace a membrana en BACTERIA fotosintética.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
Proteínas donantes de hidrógeno que intervienen en diversas reacciones bioquímicas, como la reducción de ribonucleótidos y la reducción de PEROXIRREDOXINAS. La tiorredoxina se oxida a partir de un ditiol para formar un disulfuro cuando actúa como cofactor reductor. Luego el disulfuro es reducido por el NADPH en una reacción catalizada por la TIORREDOXINA REDUCTASA.
Enzima que cataliza la hidrólisis de la penicilina dando lugar a penicina y un anión de ácido carboxílico. EC 3.5.1.11.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Amplio grupo de proteinas de transporte de la membrana que enlazan MONOSACÁRIDOS a través de la MEMBRANA CELULAR.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Apéndices finos, semejantes a pelos, de 1 a 20 micrones de longitud y que a menudo se presentan en grandes números sobre las células de las bacterias gramnegativas, en particular las Enterobacteriaceas y Neisserias. A diferencia de los flagelos no poseen movilidad, pero por ser de naturaleza proteica (pilina), poseen propiedades antigénicas y hemoaglutinantes. Ellas tienen importancia médica porque algunas fímbrias median la ligadura de bacterias a las células a través de las adhesinas (ADHESINAS BACTERIANAS). El término fimbria bacteriana se refiere a los pelos comunes, lo que se debe distinguir del uso preferido de "pelos", que se utiliza para designar a los pelos sexuales (PILI SEXUAL).
Proteínas que son componentes estructurales de las FIMBRIAS BACTERIANAS o PILI SEXUAL.
Término utilizado para designar a los ácidos tetrahidroxi aldehídicos obtenidos por la oxidación de azúcares hexosa, es decir, ácido glucurónico, ácido galacturónico, etc. Históricamente el nombre de ácido hexurónico le fue otorgado al ácido ascórbico.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Un aminoácido no esencial que contiene tiol y que es oxidado para formar CISTINA.
Procedimientos mediante los que se cambia o se crea in vitro la función y estructura de las proteínas, alterando las existentes o sintetizando nuevos genes estructurales que dirigen la síntesis de proteínas con las propiedades deseadas. Esos procedimientos pueden incluir el diseño de MODELOS MOLECULARES de proteínas utilizando GRÁFICOS POR ORDENADOR u otras técnicas de modelado molecular; la MUTAGÉNESIS SITIO DIRIGIDA de genes existentes; y técnicas de EVOLUCIÓN MOLECULAR DIRIGIDA para crear nuevos genes.
Bacteria gramnegativa de forma variada desde bastón a elipsoidal, ella oxida al etanol para formar ácido acético y prefiere los medios ricos en azúcar.
Género de bacteriófagos filamentosos de la familia INOVIRIDAE. Los organismos de este género infectan a las enterobacterias, PSEUDOMONAS, VIBRIO y XANTHOMONAS.
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Clase de enzimas que catalizan cambios geométricos o estructurales de una molécula para formar un producto único. Estas reacciones no implican modificación de la concentración de sustancias salvo las del sustrato y el producto final. (Dorland, 28a ed). EC 5.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Ácido de azúcar formado por la oxidación del carbono C-6 de la GLUCOSA. Además de ser un metabolito intermediario clave de la vía del ácido urónico, el ácido glucurónico también juega un rol en la desintoxicación de ciertas drogas y toxinas mediante la conjugación con ellas para formar GLUCURÓNIDOS.
Especie de bacteria aislada del suelo.
Una especie de bacterias gramnegativas, cocoides, mayoritariamente quimiolitoautotróficas, en la familia RHODOBACTERACEAE. Algunas cepas pueden crecer anaerobicamente.
Compuestos de bajo peso molecular, producidos por microorganismos, que ayudan en el transporte y secuestro del ión férrico.
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Cualquier miembro del grupo de las endopeptidasas que contenga en el sitio activo un residuo de serina que intervenga en la catálisis.
Sustancias tóxicas formadas o elaboradas por las bacterias; usualmente son proteínas con elevado peso molecular y antigenicidad, algunas se utilizan como antibióticos y algunas en las pruebas cutáneas para demostrar la presencia o la susceptibilidad a ciertas enfermedades.
La presión necesaria para impedir el paso del solvente a través de una membrana semipermeable que separa un solvente puro de una solución de solvente y soluto o que separa a diferentes concentraciones de una solución. Es proporcional a la osmolalidad de la solución.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
Un péptido cíclico que consiste de tres residuos de delta-N-hidroxi-delta-N-acetilornitina. Actúa como un agente de transporte de hierro en la Ustilago sphaerogena.
Enzimas que se encuentran en muchas bacterias, que catalizan la hidrólisis del enlace amido en el anillo de la beta-lactama. Las penicilinas y las cefalosporinas son antibióticos bien conocidos que son destruídos por estas enzimas. EC 3.5.2.6.
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
Derivado de la celulosa empleado en cromatografía, como material de intercambio iónico, y para varias aplicaciones industriales.
Sales de ácido algínico extraídas de algas marinas y empleadas para hacer impresiones dentales y como material absorbente para vendajes quirúrgicos.
Bacterias que no se colorean con cristal violeta pero que se colorean de rosado cuando se tratan con el método de Gram.
Componentes de una célula que se obtienen por medio de diversas técnicas de separación las cuales, aunque rompen la delicada anatomía de una célula, preservan la estructura y fisiología de sus componentes funcionales y permiten realizar análisis bioquímicos y ultraestructurales.(Alberts, et al., Molecular Biology of the Cell, 2d ed, p163)
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Grupo de carbono-oxígeno liasas. Estas enzimas catalizan la ruptura de un enlace carbono-oxígeno en los polisacáridos, conduciendo a un producto insaturado y la eliminación de un alcohol. EC 4.2.2.
Compuestos orgánicos o inorgánicos que contienen hierro trivalente.
Género de bacterias gramnegativas, aerobias, y con motilidad que se encuentran en el agua y los suelos. Algunas son habitantes comunes del tracto intestinal de vertebrados. Estas bacterias producen ocasionalmente infecciones oportunistas en humanos.
La porción de la hemoglobina que aporta el color. Se halla libre en tejidos y como el grupo prostético en muchas hemoproteínas.
Bacteria gramnegativa inmóvil que se encuentra en los suelos o salmueras.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.