Clase de enzimas que catalizan la ruptura de C-C, C-O y C-N y otros enlaces por otros medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. EC 4.
Enzimas que catalizan la eliminación de residuos de delta-4,5-D-glucuronato de polisacáridos que contienen enlaces 1,4-beta-hexosaminil y 1,3-beta-D-glucuronosil o 1,3-alfa-L-iduronosil, realizando así la despolimerización. EC 4.2.2.4 actúa sobre el condroitín sulfato A y C, así como sobre dermatán sulfato y lentamente, sobre el hialuronato. EC 4.2.2.5. actúa sobre condroitín sulfato A y C.age sobre condroitín sulfato A e C.
Especie de bacteria gramnegativa, anaerobia facultativa, con forma de bastoncillos que hace marchitar a un amplio número de especies de plantas. Antes se le denominaba Erwinia chrysanthemi.
Enzimas que catalizan la eliminación de residuos de glucuronato del condroitin A,B y C, o que catalizan la hidrólisis de grupos sulfato de las unidades de 2-acetamido-2-desoxi-D-galactosa 6-sulfato del condroitín sulfato. EC 4.2.2.-.
Polisacáridos de alto peso molecular presentes en la pared celular de todas las plantas. Las pectinas pegan las paredes celulares entre sí. Se utilizan como emulsionantes y estabilizantes en la industria alimentaria. Han sido probadas en una gran variedad de usos terapéuticos, incluso como agente antidiarreico, para lo que en la actualidad no se les considera efectivas y en el tratamiento de la hipercolesterolemia.
Proteínas que absorben la luz y se encuentran en los ficobilisomas.
Planta perenne de raíz gruesa (Cichorium intybus) natural de Europa pero que se cultiva ampliamente por sus hojas jóvenes como ensalada verde y por sus raíces, secas y tostadas se utilizan para saborizar o adulterar el café.
Enzimas que catalizan una condensación reversa de aldol. Una molécula que contiene un grupo hidroxilo y un grupo carbonilo se rompe en el enlace C-C para formar dos moléculas menores (ALDEHIDOS o CETONAS). EC 4.1.2.
Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace carbono-oxígeno por medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. EC 4.2.
Género de bacterias gramnegativas, facultativamente anaerobias, en forma de bastoncillos cuyos organismos se asocian a plantas como patógenos, saprofitos, o como constituyente de la flora epifítica.
Enzima de la clase de las isomerasas que cataliza la ruptura eliminativa de polisacáridos que contienen residuos de D-glucuronato o L-iduronato enlazados en 1,4 y residuos de 2-sulfoamino-2-desoxi-6-sulfo-D-glucosa en enlaces 1,4-alfa, para formar oligosacáridos con grupos terminales de 4-desoxi-alfa-D-gluc-4-enuronosil, en sus terminales no reductores. EC 4.2.2.7.
Sub-subclase de enzimas de la clase de las liasas que rompen el enlace C-C de un 3-hidroxiácido. (Dorland, 28a ed). EC 4.1.3.
Enzima degradadora de la pared celular presente en microorganismos y vegetales superiores. Cataliza la hidrólisis aleatoria de enlaces 1,4-alfa-D-galactosidurónicos en el pectato y otros galacturonanos. EC 3.2.1.15.
Sales de ácido algínico extraídas de algas marinas y empleadas para hacer impresiones dentales y como material absorbente para vendajes quirúrgicos.
Término utilizado para designar a los ácidos tetrahidroxi aldehídicos obtenidos por la oxidación de azúcares hexosa, es decir, ácido glucurónico, ácido galacturónico, etc. Históricamente el nombre de ácido hexurónico le fue otorgado al ácido ascórbico.
Enzima clave en el ciclo del glioxilato. Cataliza la conversión de isocitrato en succinato y glioxilato. EC 4.1.3.1.
Plantas de la división Rhodophyta comúnmente conocidas como algas rojas, en la cual predomina el pigmento rojo (FICOERITRINA). Sin embargo, si este pigmento es destruido, esta alga puede ser morada, marrón, verde o amarilla. Dos sustancias importantes encontradas en las paredes celulares del alga roja son el AGAR y la CARRAGENINA. Algunas rodofitas son notables ALGAS MARINAS (macroalgas).
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Tetrapirroles de cadena abierta que actúan como cromóforos que absorben la luz en las FICOBILIPROTEÍNAS.
Enzima que cataliza la degradación eliminativa de polisacáridos que contienen enlaces 1,4-beta-D-hexosaminil y 1,3-beta-D-glucuronosil o 1,3-alfa-L-iduronosil en disacáridos que contienen grupos de 4-desoxi-beta-D-gluc-4-enuronosil. (Enzyme Nomenclature, 1992)
Género de bacteria gramnegativas, aerobias, en forma de bastoncillos que se caracterizan por tener una membrana externa que contiene esfingolípidos pero que no tiene lipopolisacáridos. Tienen la capacidad de degradar una amplia gama de compuestos aromáticos sustituidos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Proteína citocrómica mitocondrial del tipo c, de 30-kD, ligada a la membrana, que funciona como donante de electrones al GRUPO CITOCROMO C en la CADENA RESPIRATORIA mitocondrial y bacteriana (Traducción libre del original: Enzyme Nomenclature, 1992, p545).
Género de bacterias gramnegativos, anaerobias, en forma de bastoncillos . Sus organismos habitan normalmente en las cavidades orales, respiratoria, intestinal y urogenital de hombres, animales e insectos. Algunas especies pueden ser patógenas.
Género de bacterias aerobias, gramnegativas en forma de bastones que están ampliamente distribuidas en el SUELO y el AGUA. Sus organismos se encuentran también en carnes crudas, LECHE y otros ALIMENTOS, en los ambientes hospitalarios y en las muestras clínicas de humanos. Algunas especies son patógenas en humanos.
Enzima que, durante la biosíntesis de ribonucleótidos púricos, cataliza la conversión de 5'-fosforribosil-4-(N-succinocarboxamida)-5-aminoimidazol en 5'-fosforribosil-4-carboxamida-5-aminoimidazol y la conversión de ácido adenilosuccínico en AMP. EC 4.3.2.2.
Especie de bacteria grampositiva del STREPTOCOCCUS MILLERI (GRUPO). Es la especie de este grupo que se aísla con más frecuencia. Es proclive a formar abscesos y se suele aislar de la sangre, el tubo digestivo y el aparato genitourinario.
Ácido de azúcar formado por la oxidación del carbono C-6 de la GLUCOSA. Además de ser un metabolito intermediario clave de la vía del ácido urónico, el ácido glucurónico también juega un rol en la desintoxicación de ciertas drogas y toxinas mediante la conjugación con ellas para formar GLUCURÓNIDOS.
Género de plantas de la familia EUPHORBIACEAE, orden Euphorbiales, subclase Rosidae. La GOMA natural comercial se obtiene principalmente de Hevea brasiliensis pero también de algunas otras plantas.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Heteropolisacáridos que contienen una hexosamina N-acetilada en una unidad disacárida repitente característica. La estructura repitente de cada disacárido contiene enlaces alternos 1,4 y 1,3 que están constituídos bien sea por N-acetilglucosamina o por N-acetilgalactosamina.
Especie de bacterias gramnegativas, facultativamente anaerobias, en forma de bastoncillos que se encuentra en suelos, materia fecal y agua de albañales. Es un patógeno oportunista y produce cistitis y pielonefritis.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Ácidos derivados de los monosacáridos por oxidación del grupo alcohol primario (-Ch2OH), más alejado del grupo carbonilo, a un grupo carboxilo (-COOH). (Stedman, 25a ed)
Derivados del condroitín que tienen la parte del sulfato esterificado a la parte de galactosamina del condoitrín. El sulfato de condroitina A, o el 4-sulfato de condroitina y el sulfato de condroitina C, o 6-sulfato de condroitina, tienen el sulfato esterificado en las posiciones 4- y 6-, respectivamente. El sulfato de condroitina B (beta heparina; DERMATÁN SULFATO) es un nombre incorrecto y este compuesto no es un sulfato de condroitina auténtico.
Compuestos de azufre en los cuales el átomo de azufre está unido a tres radicales orgánicos y a un elemento electronegativo o radical.
Glicósido hidrolasas (o glicosidasas) catalizan la hidrólisis del acoplamiento glicosídico para generar dos azúcares más pequeños. Ellas son enzimas sumamente comunes con papeles en la naturaleza incluyendo la degradación de biomasa como la celulosa y hemicellulose, en estrategias de defensa antibacterianas (ej. lisozimas), en mecanismos patogénicos (ej. neuraminidasas virales) y en la función normal celular (ej. ajustando manosidasas implicadas en la biosíntesis de glicoproteinas N-ligadas). Con las glicosiltransferasas, glicosidasas forman la principal maquinaria catalítica para la síntesis y la ruptura de enlaces glicosídicos.
Un glucosaminoglicano que se encuentra en estado natural y que se halla principalmente en la piel y en el tejido conjuntivo. Se diferencia del SULFATO DE CONDROITINA A (ver SULFATOS DE CONDROITINA) en que contiene ÁCIDO IDURÓNICO en lugar de ácido glucurónico, su epímero, en el átomo de carbono 5.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Secuencia de carbohidratos en los POLISACÁRIDOS, GLICOPROTEINAS y GLUCOLÍPIDOS.
Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace carbono-nitrógeno a través de medios ajenos a la hidrólisis y la oxidación. Las subclases son : las AMONIO-LIASAS, las AMIDINO-LIASAS, las amino-liasas y otras liasas carbono-nitrógeno. EC 4.3.s.
Azúcares compuestos de dos monosacáridos unidos por enlaces glicosídicos.
Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace carbono-carbono por otros medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. Esta subclase contiene también a las DESCARBOXILASAS, las ALDEIDO-LIASAS y las OXO-ACIDO-LIASAS. EC 4.1.
Enzima de reparación del ADN que cataliza la escisión de los residuos de ribosa en los sitios de ADN apurínicos y apirimidínicos que pueden resultar de la acción de los ADN GLICOSILASAS. La enzima cataliza una reacción de beta-eliminación en el cual el enlace COP 3 'al sitio apurínico o apirimidínico en el ADN se rompe, dejando un azúcar insaturado 3'-terminal y un producto con un terminal 5'-fosfato. Esta enzima fue listada anteriormente bajo EC 3.1.25.2.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Género de bacterias gramnegativas, aerobias en forma de bastoncillos que está ampliamente distribuido en la naturaleza. Algunas especies son patógenos para humanos, animales y plantas.
Clase de enzimas implicadas en la hidrólisis de los enlaces N-glicosídicos de los azúcares unidos al nitrógeno.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Reino de organismos eucariónticos, heterotróficos que viven parasitamente como sáprobos, incluyendo las setas (AGARICALES), LEVADURAS, moho, etc. Se reproducen sexual o asexualmente, y tienen ciclos de vida que van desde los simples a los complejos. Los hongos filamentosos, habitualmente llamados mohos, se refieren a los que crecen como colonias multicelulares.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
Forma tridimensional característica de un carbohidrato.
Una familia de enzimas reparadoras de ADN que reconocen las bases de nucleótidos dañados y los remueven por hidrolización del vínculo N-glicosídico que los adhiere a la médula del azúcar de la molécula de ADN. El proceso llamado REPARACION DE EXCISION BASE puede ser completada por ADN-(SITIO APURINICO O APIRIMIDINICO) LIASA el cual extirpa el azúcar RIBOSA sobrante del ADN.
Género de BACILLACEAE que son células formadoras de esporas, tienen forma de bastones. La mayoría de las especies son saprofitas del suelo con sólo unas pocas especies que son patógenas.
Enzimas de la clase de las isomerasas que catalizan reacciones en las cuales un grupo puede ser considerado como eliminado de una parte de una molécula, abandonando un doble enlace, mientras permanece covalentemente enlazado a la molécula. EC 5.5.
Un heteropolisacárido cuya estructura es similar a la HEPARINA. Se acumula en individuos que tienen MUCOPOLISACARIDOSIS.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
La facilitación de reacciones bioquímicas con la ayuda de catalizadores de origen natural tales como las ENZIMAS.
La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Cromatografía en geles no iónicos sin tener en consideración el mecanismo de discriminación del soluto.
Las diversas formas estructuralmente relacionadas de una enzima. Cada una de ellas tiene el mismo mecanismo y clasificación, pero diferentes características químicas, físicas o inmunológicas.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Carbohidratos formados por dos a diez MONOSACARIDOS conectados por un enlace alfa- o beta-glicosídico. Son encontrados por toda la naturaleza tanto en la forma livre como vinculada.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Técnicas usadas para separar mezclas de sustancias basadas en diferencias en las afinidades relativas de las sustancias para fases móviles y estacionarias. Una fase móvil (líquido o gas) pasa a través de una columna que contiene una fase estacionaria de líquido sólido poroso líquido revestido en un soporte sólido. El uso es tanto analítico para pequeñas cantidades y preparativo para cantidades a granel.
La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
La suma del peso de todos los átomos en una molécula.
La capa mas externa de una célula en la matoría de las PLANTAS, BACTERIAS, HONGOS y ALGAS. La pared celular generalmente es una estructura rigida externa a la MEMBRANA CELULAR y proporciona una barrera protectora contra agentes físicos y químicos.
Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace fósforo-oxígeno por medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. EC 4.6.
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Especie de bacteria grampositiva que es un saprofito común en el suelo y el agua.
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
Técnica de separación en la que la fase estacionaria está constituída por resinas de intercambio iónico. Las resinas contienen pequeños iones libres que intercambian fácilmente de lugar con otros pequeños iones de carga similar presentes en las soluciones que las resinas.
Enfermedades de las plantas.
Formación de sustancias cristalinas a partir de soluciones o fusiones. (traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Técnicas cromatográficas líquidas que se caracterizan por altas presiones de admisión, alta sensibilidad y alta velocidad.
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Glicoproteínas que poseen alto contenido polisacárido.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Enzimas que catalizan la ruptura de un enlace carbono-azufre mediante medios ajenos a la hidrólisis o la oxidación. EC 4.4.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
La reconstrucción de una molécula de ADN de doble cadena continua sin defectos a partir de una molécula contenida en regiones dañadas. Los principales mecanismos de reparación son la reparación por extirpación, en la que las regiones defectuosas en una cadena son extirpadas y resintetizadas usando la información complementaria de pareamento de las bases que está en la cadena intacta.
Procesos que intervienen en la formación de ESTRUCTTURA TERCIARIA DE PROTEÍNA.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en la síntesis de las enzimas.