Enzimi in grado di catalizzare l ’ idrolisi dei legami interna e in tal modo la formazione di polynucleotides o oligonucleotides da ribo- o deossiribonucleotide catene. CE 3.1.-.
Subunità sistemi contenenti un singolo enzima e che necessitano solo magnesio per endonucleolytic. La relativa modifica Methylases sono diversi enzimi. I sistemi riconosce brevi sequenze di DNA specifico e aderiscono either within, o a breve distanza, il riconoscimento specifica sequenza di dare specifiche frammenti a doppia catena terminale 5 '-phosphates. Enzimi da diversi microrganismi con la stessa specificità sono chiamati isoschizomers. CE 3.1.21.4.
Enzimi che sono parte del Restriction-Modification sistemi endonucleolytic catalizzare la scollatura di sequenze di DNA che manca la metilazione specie-specifico schema il DNA della cellula ospite. Scollatura o specifici dei frammenti casuali a doppia catena terminale 5 '-phosphates. La funzione di enzimi di restrizione era eliminare ogni DNA estraneo che invade la maggior parte sono state studiate in sistemi batterici, ma pochi sono stati trovati in eukaryotic organismi. Sono anche usati come strumenti per la dissezione sistematico e la mappatura dei cromosomi, nella determinazione delle sequenze di base di diversi DNA, e aver reso possibile collegare e da un organismo si ricombinano geni nel genoma di un'altra. CE 3.21.1.
Un gruppo di enzimi endonucleolytic principale che catalizza la scissione del DNA e includono i membri della CE 3.1.21.-, CE 3.1.22.-, CE 3.1.23.- (DNA) RESTRICTION enzimi, enzimi RESTRICTION 3.1.24.- (DNA) e CE 3.1.25.-.
Un enzima che catalizza la scissione del endonucleolytic phosphodiester obbligazioni in purinic AP-sites siti (O) a produrre 5 '-Phosphooligonucleotide prodotti finali. L ’ enzima preferisce spaiati DNA (ssDNA) e in precedenza era classificato come CE 3.1.4.30.
Una reazione che separi uno dei collegamenti tra sugar-phosphate covalente nucleotidi che compongono lo zucchero fosfato spina dorsale di DNA. È catalizzato con metodi enzimatici, chimicamente o dalle radiazioni. Scollatura può essere exonucleolytic - rimuovere la fine nucleotide, o endonucleolytic - dividere il filamento in due.
La sequenza delle purine e PYRIMIDINES in acidi nucleici e polynucleotides. È anche chiamato sequenza nucleotide.
Un polimero deossiribonucleotide è il principale materiale genetico delle cellule eucariotiche procariote. E tutti gli organismi normalmente contiene DNA in uno Stato a doppia catena, eppure diversi importanti processi biologici temporaneamente coinvolgere spaiati regioni. DNA, che consiste in una proiezioni polysugar-phosphate spina dorsale possiede delle purine (adenina, guanina, citosina e timina pyrimidines (e), forma una doppia elica che e 'tenuto insieme da legami idrogeno tra questi purine e pyrimidines (adenina a timina e guanina, citosina).
Un enzima che catalizza la riparazione del DNA l'asportazione degli Ribosio residui al Sito Apurinico e Apyrimidinic DNA siti che può derivare da l'azione del DNA Glycosylases. L ’ enzima catalizza la reazione in cui il beta-elimination C-O-P legame 3 al Sito Apurinico O sito nel DNA e 'rotto, lasciando un 3' -terminal insaturo zucchero e un prodotto con un terminale 5 '-Fosfato. Questo enzima precedentemente elencate sotto CE 3.1.25.2.
Una caratteristica caratteristica dell ’ attività enzimatica in relazione al tipo di substrato per l ’ enzima o molecola catalitica reagisce.
Acido deossiribonucleico su materiale genetico di virus.
Una delle Type II forse 3.1.21.4 deoxyribonucleases (CE). Riconosce e Cleaves la sequenza G / AATTC alla barra. Ecorl è da E coliRY13. Diversi isoschizomers. CE 3.1.21.-.
Una delle Type II forse 3.1.21.4 deoxyribonucleases (CE). Riconosce e Cleaves la sequenza G / GATCC alla barra. Bamhl viene da Bacillus amyloliquefaciens N. diversi isoschizomers. CE 3.1.21.-.
Enzimi che catalizzare la estere idrossilasi di obbligazioni entro il DNA. CE 3.1.-.
Acido deossiribonucleico su materiale genetico di batteri.
Contenente tre diversi sistemi enzimatici subunità e con necessità di ATP, S-adenosylmethionine e magnesio per attività endonucleolytic frammenti casuali di dare a doppia catena terminale 5 '-phosphates. Funzionano anche come DNA-dipendente ATPases e modifiche Methylases, principale che catalizza la reazione della CE 2.1.1.72 e CE 2.1.1.73 con simili site-specificity. I sistemi riconosce specifico e aderiscono brevi sequenze di DNA nei siti lontano dal riconoscimento sequenza. Enzimi da diversi microrganismi con la stessa specificità sono chiamati isoschizomers. CE 3.1.21.3.
Le descrizioni di aminoacidi specifico, carboidrati o sequenze nucleotidiche apparse nella letteratura pubblicata e / o si depositano nello e mantenuto da banche dati come GenBank, EMBL (Laboratorio europeo di biologia molecolare), (Research Foundation, National Biomedical NBRF sequenza) o altri depositi.
Elettroforesi in cui Agar o Agarose gel è indicato come la diffusione medium.
ENDONUCLEASI che eliminano 5 'sequenze di DNA da una struttura del DNA ha chiamato un DNA. Il DNA risvolto struttura avviene in il DNA a doppia catena contenente una spaiati pausa dove il 5' parte della valle filamento troppo a lungo e si sovrapponeva al 3 'fine del controcorrente Strand. Flap Endonucleases fenderò l'a valle del lembo sovrapposizione struttura precisamente dopo i primi frammenti di DNA nucleotide, creando un ligatable Nick.
Variazione di una specie che avviene in presenza o lunghezza del frammento di DNA generata da una specifica Beh a uno specifico sito nel genoma. Tali variazioni sono dovute al mutazioni che creare o abolire riconoscimento siti per questi enzimi o cambiato la lunghezza del frammento.
Extrachromosomal, di solito CIRCULAR molecole di DNA che siamo autoreplicanti e valori da un organismo ad un altro. Si trovano in una varietà di Degli Archaea batteriche, fungine, proliferazione e piante. Vengono usati in genetico ENGINEERING come clonazione vettori.
Tecnica diagnostica largamente impiegata che sfrutta la capacità delle sequenze di DNA complementari spaiati o RNAS accoppiare con gli altri per formare una doppia elica. Ibridazione può avvenire tra due sequenze di DNA in omaggio, tra il DNA e RNA un filamento spaiato complementari, o tra due RNA sequenze. La tecnica è indicato per rilevare e isolare specifico sequenze, misurare omologia, o definire altre caratteristiche di uno o di entrambi i fasci. (Kendrew, Enciclopedia di biologia molecolare, 1994, p503)
Una delle Type II forse 3.1.21.4 deoxyribonucleases (CE). Riconosce e Cleaves le sequenze C / CGG e GGC / C alla barra. Hpall viene da Haemophilus parainfluenzae. Diversi isoschizomers. CE 3.1.21.-.
Una specie di, Facultatively anaerobi gram-negativi, forma a bastoncino batteri (anaerobi Gram-negativi Facultatively RODS) comunemente trovato nella parte inferiore dell ’ intestino di gli animali a sangue caldo. Di solito si nonpathogenic, ma alcuni ceppi sono nota per avere la diarrea e infezioni piogeno. Ceppi (patogeni virotypes) sono classificati in base al patogeno specifici meccanismi quali tossine (Enterotoxigenic Escherichia coli), ecc.
L'infibulazione di in-frame sequenze proteiche interna (INTEINS) di proteina, associata ad un "precursore" legatura delle sequenze di supporto (proteina splicing EXTEINS). E 'una reazione autocatalytic comporta la produzione di due proteine da un singolo prodotto primario traduzione: La proteina intein e maturo.
Uso di restrizione Endonucleases per analizzare e generare una mappa fisica di genomi, geni, o altri segmenti di DNA.
Che riconoscono Cruciform enzimi DNA e presentare accoppiati incisioni che aiutano a risolvere la struttura in due DNA elice.
Nessuna delle molecole di DNA trovato chiuso tramite un legame covalente con batteri, virus, molti mitocondri, plastids e plasmidi. Piccola, polydisperse circolare DNA sono stati osservati anche in un certo numero di organismi e eucariotiche consigliati è omologia con DNA cromosomico e la capacità di essere inerite e rimosso, DNA cromosomico. E 'un frammento di DNA formato da un processo di colpo e la cancellazione, contenente una costante regione del mu pesante catena e la 3' -part mu scambio della regione. Circolare DNA e 'un prodotto normale della riarrangiamento del gene variabile fra segmenti di regioni di immunoglobulina luce e catene molto pesanti, così come il recettore dell ’ a cellule T (Riger et al., glossary of Genetics, quinto M & Segen, Dictionary of Modern Medicine, 1992)
Un terreno una volta erano ameba patogeno per umani e animali e questo avviene anche in acqua e le fognature, la più diffusa specie di uomo è Naegleria fowleri ed e 'l'agente patogeno per ammalò meningoencefalite amebica primaria nei primati.
Virus la cui ospiti sono cellule batteriche.
La ricostruzione di un continuo two-stranded molecola di DNA senza disallineamento da una molecola che conteneva danneggiata regioni. I principali meccanismi di riparazione escissione riparazione, nelle quali regioni difettoso in un solo filo sono asportato, e resynthesized utilizzando le informazioni complementari accoppiamento delle basi intatto filamento; photoreactivation riparare, nel quale il letale e effetti mutageni di raggi ultravioletti vengono eliminati; e post-replication riparazione primaria, in cui le lesioni non sono riparata, ma la distanza tra una figlia duplex sono occupati per incorporazione di porzioni delle altre (intatta) figlia duplex. Una recisione riparazione e post-replication riparare sono talvolta indicato come "dark conservare" perche 'non ci serve luce.
Interruzione in uno dei filamenti del sugar-phosphate spina dorsale di il DNA a doppia catena.
La spaziale disposizione degli atomi di un acido nucleico polynucleotide o che comporta suo caratteristico forma tridimensionale.
L'ordine di aminoacidi che si verifichi in una catena polipeptidica. Questo viene definito la struttura primaria di proteine, è molto importante nel determinare PROTEIN la conferma.
Di lattoalbumina di DNA in cui purina basi sono state rimosse.
Procedure secondo le quali proteine sono cambiato struttura e sulla funzione o creato in vitro dal alterare i geni strutturali in atto o sintetizzare nuove dirige la sintesi di proteine con ricercata proprieta '. Tali procedure possono comprendere il design di MOLECULAR CYLON di proteine usando computer grafica o altre tecniche; specifica per il modello molecolare mutagenesi (mutagenesi, forse geni; e) dell' evoluzione MOLECULAR diretto tecniche per creare nuovi geni.
L ’ inserimento di molecole di DNA ricombinante da procariote e / o in un veicolo che fonti eucariotiche, quali un virus o plasmide vettore e l 'introduzione dell ’ ricevente ibrido molecole in cella senza alterare la fattibilità di quelle celle.
Una reazione che separi uno dei legami esistenti tra i sugar-phosphate phosphodiester spina dorsale dell'RNA. È catalizzato con metodi enzimatici, chimicamente, o dalle radiazioni. Scollatura può essere exonucleolytic o endonucleolytic.
Sequenze di DNA nei geni che si trova tra il Vdj. Sono trascritto insieme al Vdj ma sono rimossi dal gene primario di splicing dell'RNA RNA. Un po 'di lasciare maturo introni codice per separare i geni.
Una delle Type II forse 3.1.21.4 deoxyribonucleases (CE). Riconosce e Cleaves la sequenza A / AGCTT alla barra. Hindlll viene da Haemophilus influenzae R (d). Numerose isoschizomers. CE 3.1.21.-.
Una famiglia di enzimi che endonucleolytic catalizzare la scollatura dell'RNA. Include CE 3.1.26.-, CE 3.1.27.-, CE 3.1.30.- e CE 3.1.31.-.
Le componenti del macromolecule direttamente partecipare precisa combinazione con un'altra molecola.
The functional ereditaria unità di virus.
Sistemi che consiste di due enzimi, una modifica methylase e Beh, sono strettamente correlati nella loro specificità e proteggere il DNA di una data specie batterica. La methylase aggiunge gruppi metilici a adenina e timina residui nello stesso obiettivo che costituisce l 'enzima di restrizione sito di legame. La metilazione rende l'obiettivo resistenti alla punizione, proteggendo in questo modo DNA con scollatura.
Biologicamente attivi creato dal DNA in vitro unione di segmenti di DNA da fonti diverse, che comprende le ricombinazione ’ articolazione o in una regione dove due heteroduplex ricombinazione di molecole dna sono collegati.
L'accordo di due o più sequenze di base aminoacido o un organismo o organismi in modo tale da allineare le aree di condividere le sequenze proprietà comuni. Il grado di relazione o omologia tra le sequenze prevista computationally o statisticamente basato su pesi attribuiti agli elementi allineati tra le sequenze. A sua volta questo puo 'servire da indicatore genetica potenziale relazione tra gli organismi.
Enzimi in grado di catalizzare la scollatura di un legame Carbonio-Ossigeno dal punto di idrolisi o ossidazione. CE 4.2.
La regione di un enzima che interagisce con il substrato di causare la reazione enzimatica.
Duplex circolare DNA isolato dal virus, batteri e i mitocondri né in supercoiled o supertwisted. Questo Superhelical DNA è dotata di energia gratuita. Durante l ’ entità della trascrizione RNA l ’ inizio e 'proporzionale al DNA superhelicity.
Qualsiasi metodo utilizzato per determinare la posizione di distanze relative tra geni e un cromosoma.
Sistemi enzimatici composta da due subunità e con necessità di ATP e magnesio per endonucleolytic attività; non funzionare come ATPases. Esistono come complessi con modifica Methylases di specificità sotto CE 2.1.1.72 o CE 2.1.1.73. I sistemi riconosce specifico brevi sequenze di DNA e dividere un breve distanza, circa 24 al 27 basi, lontano dal riconoscimento sequenza di dare specifiche frammenti a doppia catena terminale 5 '-phosphates. Enzimi da diversi microrganismi con la stessa specificità sono chiamati isoschizomers. CE 3.1.21.5.
Enzimi in grado di catalizzare la liberazione di mononucleotides dall ’ idrolisi di legame di terminale o deossiribonucleotide ribonucleotide catene.
Proteina componenti del CRISPR-CAS TITOLI per la difesa antivirale Archaea e batterio mangia-carne. Queste sono proteine che svolgere una varieta 'di funzioni durante la creazione e l'espansione della CRISPR set, la cattura di nuovo, di piccoli divisori CRISPR biogenesi CRISPR crRNAs INTERFERING RNA (o) e il virus di invadere il bersaglio e mettere a tacere e plasmidi e includono Elicasi Del Dna; RNA-BINDING proteine; Endonucleases; e RNA e DNA polimerasi.
Modelli utilizzati sperimentalmente o teoricamente a studiare, molecolare delle proprieta ', o interazioni di natura analoga; include molecole di grafica computerizzata, e meccanica strutture.
La somma del peso di tutti gli atomi in una molecola.
Un enzima che catalizza un endonucleolytic scollatura vicino pirimidina dimers per produrre un 5 '-Fosfato prodotto, l ’ enzima agisce sul DNA danneggiato, dal 5' parte di sito.
Enzimi che sono parte dei sistemi Restriction-Modification responsabili della produzione un species-characteristic metilazione schema, adenina e timina residui, in una specifica e breve sequenza base della cellula ospite. Il DNA di questa sequenza metilato avverrà tante volte nel host-cell DNA e 'rimasta intatta per la vita della cellula. Il DNA di un'altra specie che acquisisce di entrare in una cellula vivente e non ha la caratteristica metilazione schema sarà riconosciuta dagli restrizione Endonucleases di specificità e distrutto da scollatura. La maggior parte sono state studiate in sistemi batterici, ma pochi sono stati trovati in eukaryotic organismi.
Gel elettroforesi in cui la direzione del campo elettrico è cambiato periodicamente. Questa tecnica e 'simile ad altri metodi elettroforetica normalmente usata per separare le molecole di DNA a doppia catena che variano nel formato da decine di migliaia di base-pairs. Tuttavia, siccome alterna il campo elettrico direzione è in grado di separare le molecole di DNA base-pairs fino a diversi milioni di lunghezza.
Virus la cui ospite e 'Escherichia coli.
Una famiglia di enzimi che exonucleolytic catalizzare la scollatura di DNA. Include membri della classe CE 3.1.11 che producono 5 '-phosphomonoesters come scollatura prodotti.
Produzione di nuovi accordi di DNA da vari meccanismi quali assortimento, la segregazione, LIVELLO finita; Ehi CONVERSION; genetico trasformazione; genetico coniugazione; genetico trasduzione; o infezione dei virus.
Processi fisiologici e proprietà di microrganismi, incluso Archaea; batterio; Rickettsia; virus, funghi e gli altri.
Una serie di 7 Fagi Del Genere virulento che infettare E. coli, il Fagi Del Genere T-even T2, T4; (Fago T4) e la fagia T5 e T6 si chiamano "virulento autonomamente l ’ interruzione di tutti perché causano infezione batterica metabolismo Fagi Del Genere T1, la triiodotironina (T3) e Fago T7; (Fago T7) vengono chiamate" dipendente "virulento poiché dipendono dagli metabolismo batterica continuato durante il ciclo... i lytic Fagi Del Genere T-even contengono 5-hydroxymethylcytosine al posto di ordinario citosina nel loro DNA.
Un inducibile fagia e tipo specie del genere lambda-like virus, in famiglia SIPHOVIRIDAE. Il suo ospite naturale e 'E. Coli K12. Il suo FRAZIONATO contiene il DNA a doppia catena lineare con spaiati 12-base 5' estremità adesive. Il DNA circularizes di infezioni.
Una categoria di acidi nucleici sequenze che funzionano come unità di ereditarietà e che il codice per le istruzioni per lo sviluppo, riproduzione, e la manutenzione degli organismi.
Un enzima responsabile per la metilazione species-characteristic a adenina residues in una specifica e breve base sequenza del DNA della cellula ospite. L'enzima catalizza la metilazione di DNA adenina in presenza di S-adenosyl-L-methionine per formare il DNA contenente 6-methylaminopurine e S-adenosyl-L-homocysteine. CE 2.1.1.72.
I frammenti di proteine (interno precursore proteine) che sono eliminati attraverso autocatalytically PROTEIN splicing. Il supporto frammenti (EXTEINS) sono legate alle proteine che formano matura. L'acido nucleico codifica inteins sequenze sono considerati CELLULARE genetico GIURIDICI. Inteine sono composte da Beh Self-Splicing dominio e un dominio che gioca un ruolo nella diffusione della intein 'sequenza genomica. Mini-inteins sono composte del Self-Splicing dominio.
Tracce riscontrabili di organismi e ereditabile cambiamento nel materiale genetico che causa un cambiamento del genotipo e trasmesse a figlia e ai diversi generazioni.
Il tasso dynamics in chimica o sistemi fisici.
Metodo in vitro per la produzione di grandi quantità di frammenti di DNA o RNA specifici definiti lunghezza e la sequenza di piccole quantità di breve analisi Di Sequenze sequenze di supporto (inneschi). Il passi essenziali includono termico la denaturazione del bersaglio a doppio filamento molecole annealing degli inneschi al loro sequenze complementari e l 'estensione della ritemprate enzimatica inneschi per la sintesi di DNA polimerasi. La reazione è efficiente, in particolare, ed estremamente sensibile. Usa la reazione comprendono la diagnosi di malattie, la valutazione della mutazione difficult-to-isolate patogeni, analisi, test genetici, sequenza del DNA, analizzando le relazioni evolutivo.
Una struttura del DNA a forma di croce che possono essere osservati con il microscopio elettronico. Si è formato dalla incompleta scambio di corde a doppio filamento elice tra due o da complementari INVERTED RIPETONO SEQUENCES che ripiegare nel fermaglio anelli ai fili di fronte all'altro.
Una specie di batteri gram-positivi sferiche in terreni e acqua fresca, e spesso sulla pelle dell'uomo e altri animali.
La restrizione una caratteristica comportamento, struttura anatomica o sistema fisico, come risposta immunitaria; risposta metabolico, o Gene o del gene variante ai membri di una specie. Si riferisce a quella proprieta 'che distingue una specie di un'altra ma è anche utilizzato per phylogenetic livelli maggiori o minori di quanto la specie.
Un enzima in grado di hydrolyzing altamente polymerized DNA dividendo phosphodiester linkages, preferibilmente nei pressi della pirimidina nucleotide. Questo catalizza endonucleolytic scollatura del DNA il cui contenuto abbia un metro e -phosphodi- e analisi Di Sequenze end-products. L ’ enzima ha una preferenza per il DNA a doppia catena.
L ’ aggiunta di gruppi metilici nella rimetilazione per histo-chemistry esterify carbossil gruppi e rimuovere solfato sezioni di tessuto gruppi di trattamento con il metanolo in presenza di acido cloridrico. (Dal Stedman, 25 Ed)
Batteriofago virulento e tipo specie del genere Fagi Del Genere T4-like in famiglia MYOVIRIDAE. Infetta E. coli ed è la più famosa del Fagi Del Genere T-even lineare, frazionato contiene il DNA a doppia catena, mortalmente ridondanti e circularly combinati.
Enzimi in grado di catalizzare la endonucleolytic spaiati regioni di molecole di DNA o RNA a doppio filamento mentre lasciavamo i regioni intatta. Sono particolarmente utili in laboratorio per la produzione di "blunt-ended" DNA le molecole di DNA con spaiati finisce e tecniche genetico per sensibile come protezione nucleasi test che implicano il rilevamento di spaiati DNA e RNA.
Una base della pirimidina è una unità di acidi nucleici.
Struttura nel il nucleo di cellule batteriche o di DNA, che trasportano informazioni genetiche essenziale per la cellula.
Un gruppo di deoxyribonucleotides (fino a 12) nel quale il fosfato residui di ogni atto deossiribonucleotide ponti diesteri per creare dei collegamenti tra le forme ribosio.
Ribonucleic dell'acido in Archaea avendo regolamentare e ruoli catalitica nonché coinvolgimento nella sintesi proteica.
Proteine ottenuti da Escherichia coli.
Sequenze di DNA che codificano dell ’ RNA ribosomiale e i segmenti di DNA che separa i singoli dell ’ RNA ribosomiale geni, referred to as ribosomiale distanziatore DNA.
The functional ereditaria unità di batterio mangia-carne.
L ’ agevolazione delle reazioni biochimiche naturale con l'aiuto di un catalizzatore, come enzimi.
Il grado di somiglianza tra sequenze di aminoacidi. Queste informazioni sono utili per la relazione genetica analisi di proteine e specie.
Difettoso dei virus che possono moltiplicare solo in associazione con un aiutante virus che completa il gene difettoso. Satellite virus può essere associata con alcune pianta virus, virus o animale bacteriophages. Differiscono dal satellite RNA; (RNA), satellite di quel satellite virus codificare il proprio cappotto proteine.
Ferite di DNA che presentarvi deviazioni dalle sue normali, intatta e la struttura che può, se lasciato intoccato, porterebbe ad una MUTATION o un blocco di processi di replicazione. Questi scostamenti possono essere causate da agenti chimici e fisici o avvenire per circostanze naturali o innaturali, presentati e includono l 'introduzione di basi illegittimo nella replicazione o deaminazione o altra modifica di alcune basi; la perdita di una base dalla spina dorsale lasciando un DNA abasic sito, associati alla proteina; doppio filamento rompe; e (intrastrand dimers) o delle pirimidine interstrand crosslinking. Danno spesso puo' essere riparato (DNA) RIPARAZIONE. Se il danno è esteso, può indurre apoptosi.
Polimeri fatta di pochi (2-20) nucleotidi. In genetica molecolare, si riferiscono a una breve sequenza sintetica di una regione dove e 'noto che si verifichi una mutazione, e poi ha usato come una sonda (analisi Di Sequenze PROBES Dorland, 28 (M)
Una specie di PASTEURELLACEAE che consiste in diverse specie che si verificano in animali e umani. I suoi organismi sono descritti come Facultatively anaerobi gram-negativi,, coccobacillus o forma a bastoncino e nonmotile.
Il livello di proteine, associazioni di struttura in cui le strutture proteiche secondaria (alfa, beta lenzuola elice, regioni, e motivi) branco per formare piegato forme chiamato ponti disolfuro tra cysteines. In due parti diverse del catena polipeptidica insieme ad altri le interazioni tra le catene svolgere un ruolo nella formazione e stabilizzazione della struttura terziaria. Di solito piccole proteine consistono in un solo regno ma piu 'grandi proteine possono contengono segmenti dei settori connessi da cui mancanza normale catena polipeptidica struttura secondaria.
Un metodo per la prima volta dal (CE) del sud per la valutazione di DNA che è stato electrophoretically separati e tutto per colpa di sulla nitrocellulosa assorbente o altri tipi di carta o seguito da ibridazione con membrana di nylon etichettata dell ’ acido PROBES.
Piccoli segmenti di DNA che puo 'rimuovere e reintegrarsi in un altro sito nel genoma. La maggior parte sono inattivi, cioè, non esiste al di fuori delle integrato transposable elementi includono. DNA e' batterica (inserimento elementi in sequenza) elementi, il mais controllando elementi A e D Drosofila P, zingara e pogo elementi, la tiro elementi e la Tc e marinaio elementi che sono presenti in tutto il regno animale.
Una tecnica per identificare le persone di una specie che si basa sull'unicita 'della sequenza di DNA. Unicita' e 'determinato da identificare quale combinazione di variazioni allelic al individuo ad un aumento statisticamente rilevante diverse loci. Negli studi di medicina RESTRICTION frammento polimorfismo lunghezza di diversi, altamente VNTR loci polimorfici o MICROSATELLITE RIPETONO loci sono analizzati. Il numero dei loci utilizzato per il profilo allele dipende dalla frequenza nella popolazione di pazienti.
Il più comune forma di RNA. Insieme con le proteine, forma la ribosomi. Esse svolgono un ruolo strutturali e anche un ruolo nel legame ribosomiale del mRNA, sia tRNAs. Singolo catene sono convenzionalmente designato dalla loro coefficienti di sedimentazione. In eukaryotes, quattro grandi catene esiste, creati nell'Nucleolus rappresentano circa il 50% e del ribosoma. Dorland, 28 (M)
Adaptive meccanismi di difesa antivirale, in Archaea e batteri, basandomi sul DNA ripetere allineamenti chiamato raggruppate REGULARLY Interspaced breve REPEATS palindrome (CRISPR quella funzione elementi) in concomitanza con CRISPR-ASSOCIATED alle proteine plasmatiche (Cas proteine) sono state distinte. Diversi tipi, incluso di tipo I, Tipo II e Type III, in base alla firma CRISPR-ASSOCIATED motivi di proteine.
Le relazioni tra gruppi di organismi che si rifletteva la loro composizione genetica.
5-Bromo-2,4 (1H, 3H) -pyrimidinedione. Brominated derivato del Uracile che agisce come antimetabolita, per timina nel DNA. E 'usata principalmente come sperimentale, ma il mutageno deoxyriboside (BROMODEOXYURIDINE) è indicato nel trattamento di neoplasie.
Interruzione della struttura secondaria degli acidi nucleici dal calore estremo pH o trattamenti chimici, doppio filamento di DNA e '"fuso" di dissociazione della non-covalent legami idrogeno e Hydrophobic interazioni. Denaturato DNA sembra essere una struttura flessibile spaiati. Gli effetti di la denaturazione su RNA sono simili se meno pronunciato e generalmente reversibile.
La relativa quantità delle purine e PYRIMIDINES in un acido nucleico.
Proteine trovate in una specie di batteri.
La ereditabile modificazione della proprieta 'di un batterio competenti per il DNA da un'altra fonte. Il richiamo intracellulare di puro DNA e' un fenomeno che esiste in natura in alcuni batteri. E'usato spesso a Ehi TRASFERIMENTO tecnica.
Catalizzare l'unione di preformed ribonucleotides o deoxyribonucleotides in collegamento durante phosphodiester processi genetici. CE 6.5.1.
Diretto modifica del gene di un organismo vivente con tanta tecnica cambiare il DNA, materiale genetico per mezzo di un virus, trapiantare intera nuclei, trapiantare cella ibridi, eccetera.
La trasmissione verticale del virus a DNA da personaggi ereditari organelli citoplasmatica come mitocondri; cloroplasti; e PLASTIDS, o da plasmidi episomal o virale, DNA.
Piccolo kinetoplastid RNA mitocondriale che gioca un ruolo importante nel RNA MONTAGGIO forma perfetta. Queste molecole ibride con montato sequenza dell'RNA messaggero e sequenze nucleotidiche al loro 5 '-ends che sono complementari a quelle sequenze dei mRNA' immediatamente a valle del pre-edited regioni.
Una specie di BACILLACEAE che sono spore-forming, forma a bastoncino. Molte specie sono saprophytic terreno forme con solo poche specie di patogeno.
A doppio filamento dell ’ acido molecole (DNA-DNA o DNA-RNA) che contiene regioni di gestione (nucleotide non-complementary). In vivo, questi Heteroduplexes può derivare da mutazioni ricombinazione genetica; in vitro, sono formate da acidi nucleici ibridazione. Analisi al microscopio elettronico condotte della Heteroduplexes facilita la mappatura di regioni di base sequenza omologia degli acidi nucleici.
Una classe di enzimi coinvolti nella l ’ idrolisi del legame di N-glycosidic nitrogen-linked zuccheri.
Una singola catena di deoxyribonucleotides che si verifica in alcuni batteri e virus. Di solito esiste come una circolo chiuso.
Un elemento metallico che ha il simbolo Mg atomico, numero atomico 12 anni e peso atomico 24.31. E 'importante per l ’ attività di diversi enzimi, soprattutto quelli coinvolti in fosforilazione ossidativo.
Carica positiva atomi, radicali o gruppi di atomi di idrogeno con una valenza + 2, che viaggio verso il catodo o negativi palo durante l'elettrolisi.
Una specie di strettamente ultrathermophilic anaerobi archaea, in famiglia THERMOCOCCACEAE, verificatisi in riscaldata seawaters. Mostrano heterotrophic crescita a una temperatura ideale di 100 gradi.
Una specie di strettamente anaerobi hyperthermophilic archaea, che vive nei sedimenti marini. Geothermally-heated dimostra di possedere heterotropic crescita per fermentazione o zolfo respirazione.
Specie o subspecies-specific DNA (incluso LEGISLAZIONE DNA, conservato geni, cromosomi, o intero genoma) usati per l'ibridazione studi al fine di identificare i microrganismi, misurare DNA-DNA homologies, sottospecie di gruppo, ecc. La sonda di DNA hybridizes con uno specifico mRNA, se presente. Tecniche convenzionali usati come cavie per l'ibridazione prodotto includono Dot macchia di analisi, Southern blot, RNA e DNA: Hybrid-specific. - I test sugli anticorpi etichette convenzionali per la sonda di DNA include il radioisotopo etichette 32 penny e 125I e la sostanza etichetta Biotin. L 'uso di DNA sonde prevede una specifica, sensibile, rapido ed economico sostituto per le colture di cellule per la diagnosi di infezioni.
Proteine che si legano al DNA. La famiglia contiene proteine che si legano ad entrambi e doppio filamento spaiato DNA e include anche proteine leganti specifica il DNA nel siero che possono essere usati come segni per malattie maligne.
Una base in eukaryotic metilato nucleotidici trovato DNA, in animali, il DNA metilazione di citosina per formare 5-methylcytosine si trova principalmente nelle sequenze palindrome CpG. In piante, la sequenza è metilato CpNpGp, dove N può essere nessuna qualsiasi base.
Una famiglia di BACTERIOPHAGES e Archaea dei virus che e 'caratterizzata da complesso contractile code.
Enzimi implicati nella two-stranded continua ricostruzione di una molecola di DNA senza disallineamento da una molecola, che conteneva danneggiata regioni.
Comunemente osservati elementi portanti di proteine, formato da combinazioni di strutture secondaria adiacente. Un comunemente osservati struttura é composto da una sequenza di CONSERVED che possono essere rappresentate da un consenso sequenza.
Sequenze di DNA o RNA che avvengono in copie multiple... ci sono diversi tipi: REPETITIVE costellato SEQUENCES sono copie di transposable elementi (DNA transposable GIURIDICI o RETROELEMENTS) sparpagliati per il genoma terminal RIPETONO SEQUENCES fianco entrambe le parti di un'altra sequenza, per esempio, il LTR (LTRs) il retrovirus. Variazioni possono essere diretto ripete, quelli che compaiono nella stessa direzione, o rovesciato ripete, quelle di fronte all'altra in direzione. Tandem RIPETONO SEQUENCES sono le copie che si trovano vicino a vicenda, direttamente o rovesciato (INVERTED RIPETONO SEQUENCES).
Una specie di scimmia Rhesus polyomavirus originariamente isolati dal tessuto renale produce malignità umano e cellule renali di criceti neonati.
Sugar-phosphate spina dorsale di interruzioni nel DNA, da tutte e due filamenti conseguentemente.
Una sequenza di aminoacidi in una glucosio-dipendente o di DNA o RNA nucleotidi che è simile in molteplici specie. Una serie di sequenze conservate è rappresentato da un consenso sequenza. Amino acido motivi sono spesso composto da conservato sequenze.
Il DNA a doppia catena di mitocondri. In eukaryotes, il genoma mitocondriale e 'circolare, i codici di trasferimento, RNAS ribosomiale RNAS, lei e 10 proteine.
Una delle purine e 'un isomer dell ’ adenina (6-aminopurine).
Acido deossiribonucleico su materiale genetico di funghi.
Una specie del genere Saccharomyces, famiglia Saccharomycetaceae, ordine Saccharomycetales, conosciuto come "pasticcino" o "com'è secco" candidamente. Forma è usato come integratore alimentare.
Il processo con cui due molecole della stessa composizione chimica o forma una condensazione di polimeri.
Il processo in cui endogena o di sostanze, o, esogene peptidi legarsi a proteine, enzimi, o alleati precursori delle proteine di legame alle proteine specifiche misure composti sono spesso usati come metodi di valutazione diagnostica.
Una delle categorie generali di enzimi che sono coinvolti nel processo di ricombinazione genetico.
Barre aerobi Gram-negativi trovato nell'acqua calda (79 gradi centigradi) come sorgenti calde, acqua calda taniche, e termici inquinato fiumi.
Emissione o propagazione delle onde acustiche (suono), onde di energia elettromagnetica (come luce; radio ondate; GAMMA piu 'in alto, o lastre) o un flusso di particelle subatomiche (come gli elettroni, neutroni, protoni; o Alpha di bitume nei pasticcini al).
Lo studio della struttura del cristallo usando tecniche di diffrazione dei raggi x. (McGraw-Hill scientifico e tecnico Dictionary of Voglia, 4th Ed)
Una specie di forma a bastoncino ellipsoidal batteri gram-negativi, di che si verificano da soli o in coppia e ho trovato in fiori, terra, le api, frutta, birra, vino, sidro e aceto. (Dal Bergey 'Manuale delle determinanti Batteriologia, nono Ed)
Una specie di albero bisbetiche della famiglia TUPAIIDAE è composta da circa 12 specie. Uno degli incontrato specie e 'T. glis. Membri di questo genere popolano aree cresciute foreste pluviali e secondaria nel sud-est asiatico.
Electropositive elementi chimici, caratterizzata da ductility malleabilità, fascino e conduttanza del calore e l'elettricita '. Si puo' sostituire l'idrogeno di un acido e formare delle basi con idrossili. - & Hackh 'Chemical Dictionary, quinto Ed)
Methylases sono specifici per citosina residui trovati sul DNA.
Il DNA di un batterio rappresentata nel suo DNA.
Contemporanea infiammazione della cornea e nella congiuntiva.
Polinucleotidi sono catene lunghe composte da nucleotidi uniti insieme attraverso legami fosfodiesterici, presenti comunemente negli acidi nucleici come DNA ed RNA.
L 'integrazione dei DNA esogena nel genoma di un organismo in luoghi dove la sua espressione può essere adeguatamente controllata. Questa integrazione avviene come risultato di ricombinazione omologa.
Gli effetti sull ’ espressione genica dipende dal tipo di posizione di un gene nelle sue geni vicini e regione di cromosoma. Posizione stabile effetti indesiderati sono sequenza dipendente. Posizione variegato effetti dipende se il gene si trova dentro o vicino a HETEROCHROMATIN o EUCHROMATIN.
Una classe di enzimi che catalizzare l ’ idrolisi di una delle due titoli entro un estere phosphodiester complesso. CE 3.1.4.
Íonarío per generare un MUTATION. Essa può sopraggiungere spontaneamente o essere indotto da agenti mutageni.
L'ultimo l 'esclusione delle sciocchezze sequenze o intervenire sequenze (introni) prima dell ’ ultimo RNA trascrizione è inviato all' citoplasma.
L ’ agevolazione delle una reazione chimica da materiale (catalizzatore) non consumato dalla reazione.
Una famiglia di enzimi riparazione del DNA che riconoscono danneggiata basi nucleotidiche a rimuoverli da hydrolyzing la N-glycosidic legame che li lega al sostegno della molecola di DNA. Il processo chiamato BASE chirurgico con le altre RIPARAZIONE puo 'essere completata da un DNA- (Sito Apurinico O Apyrimidinic sito) Liasi che excises i restanti Ribosio lo zucchero dal DNA.
Proteine ottenute dalla specie Saccharomyces cerevisiae. La funzione di proteine specifiche da questo organismo sono oggetto di intensa interesse scientifico e sono stati usati per ricavare comprensione del funzionamento proteine simili eukaryotes più alte.
Geni coinvolto attivare l ’ enzima Esoni Translated. RAG-1 si trova in 11 cromosoma cromosoma nell ’ uomo (2) e nei topi è espressa esclusivamente ai linfociti maturando.
Una sequenza di nucleotidi sono tripletta che equivale a codoni specificando amino ACIDS e cominciare con un detonatore codone e finisce con una fermata codone (codone, TERMINATOR).
Poli (deossiribonucleotide): Poli (deossiribonucleotide) Ligasi. Enzimi in grado di catalizzare l'unione di preformed deoxyribonucleotides in collegamento durante phosphodiester processi genetici durante la riparazione di una pausa spaiati in duplex DNA. Il corso include sia CE 6.5.1.1 (Atp) e CE 6.5.1.2 (NAD).
Sequenze brevi (generalmente circa dieci coppie base) di DNA che sono complementari a sequenze di RNA messaggero transcriptases temporanee e permettere a inizia a copiare sequenze adiacente del mRNA. Segnali usata prevalentemente in genetica e biologia molecolare tecniche.
Un processo che include la clonazione, assemblata mappatura della fisica subcloning, determinazione della sequenza di DNA, analisi e informazioni.
Il processo di cambiamento a livello cumulativo del DNA, RNA e proteine, per generazioni successive.
Proteine trovate in qualche specie di archaeon.
Dimers trovato in catene di DNA danneggiato da raggi ultravioletti piu 'in alto. Consiste di due adiacenti pirimidina nucleotidi, di solito timina nucleotidi della pirimidina, nella quale i residui glucidici addizionali non sono un tramite un legame covalente cyclobutane e dimers blocca la replicazione del DNA.
Separazione bidimensionale e dall ’ analisi di nucleotidi.
Una famiglia di batteri gram-negativi, volteggia nell'ordine Cytophagales, classe Cytophagia. Sono trovato in terra e mare d'acqua.
Specie del genere MASTADENOVIRUS, causando una vasta gamma di malattie nell ’ uomo. Infezioni sono soprattutto asintomatico, ma può essere associata a malattie, disturbo respiratorio e gastrointestinale. Sierotipi (sistemi di nome arabo con numeri) sono stati raggruppati in specie determinate Human adenovirus AF.
Resistenza genotipica differenze osservate tra individui in una popolazione.
La riforma di tutto, o in parte, i nativi della conferma di una molecola dopo molecola dell ’ acido ha subito la denaturazione.
Un DNA-dipendente distruggendo definita in procarioti e può essere presente a organismi. Ci sono sia 3, 5 e 5 '-3' exonuclease attivita ', ma non possiamo usare i nativi il DNA a doppia catena come template-primer. Non è inibito da reagenti sulfhydryl ed è attivo in entrambi sintesi del DNA e riparazione. CE 2.7.7.7.
Una classe di plasmidi quel trasferimento resistenza antibiotica da un batterio ad un altro da quelli di coniugazione.
Un enzima che e 'una riparazione del DNA N-glycosyl idrolasi con specificità per DNA-containing ad anello aperto, N (7) -methylguanine residui.
Uno dei tre i dominii della vita (il batterio e gli altri), un tempo chiamato Eukarya archeobatterio sotto il tassonomiche Batteri, ma ora considerati separati e distinti. Sono caratterizzato da: (1) la presenza del tRNAs e RNAS ribosomiche; (2) assenza di peptidoglicano pareti cellulari; (3) la presenza di lipidi ether-linked costruita dal branched-chain subunità; e (4) la loro incidenza di habitat. Mentre Archaea assomigliano batteri nella morfologia e organizzazione genomica, assomiglia eukarya nel loro modo di replicazione genomica. Il dominio contiene almeno quattro regni: CRENARCHAEOTA; EURYARCHAEOTA; NANOARCHAEOTA; e KORARCHAEOTA.
Le tecniche usate per produrre molecole pertanto conformi alle richieste del ricercatore. Queste tecniche si combinano metodi di generare modifiche strutturali con i metodi di selezione. Sono utilizzati anche per esaminare i meccanismi proposti dell'evoluzione per selezione in vitro.
Batteriocine elaborati da ceppi di Escherichia coli e specie collegata. Sono proteine o protein-lipopolysaccharide complessi letale per altri ceppi della stessa specie.
Un mezzo di contrasto che inibiscono la biosintesi proteica allo stadio iniziale. L'ammonio sale (aluminon) è un reagente colorimetrici per la stima di alluminio in acqua, cibo e tessuti.
Coppie di basi, della purina e pirimidina HYDROGEN BONDING a doppio filamento di DNA o RNA.
Acido Ribonucleic nei batteri avendo regolamentare e ruoli catalitica nonché coinvolgimento nella sintesi proteica.
Stabilito colture cellulari con il potenziale di propagarsi a tempo indeterminato.
La proprieta 'di oggetti che determina la direzione del flusso caldo quando si sono collocate in diretto contatto termica. La temperatura è l'energia di microscopiche mozioni (vibrazione translational) e delle particelle di atomi.
Una famiglia di virus a infettare mammiferi (compreso l ’ uomo), uccelli e gli insetti. Ci sono due subfamilies: CHORDOPOXVIRINAE, i virus del vaiolo di vertebrati e ENTOMOPOXVIRINAE, i virus del vaiolo di insetti.
La caratteristica forma tridimensionale di una proteina, incluso il secondario, supersecondary (motivi), la terza quaternaria (dominio) e struttura della catena peptidica. Proteine quaternaria descrive la struttura, conferma assumed by multimeric proteine (aggregati di più di una catena polipeptidica).
Delle procedure per identificare i tipi e ceppi di batteri più frequentemente utilizzate scrivendo i sistemi sono Fago TYPING e SEROTYPING nonché bacteriocin dattilografia e biotyping.
Mutagenesi geneticamente modificato a uno specifico sito nel DNA molecola che introduce una base sostituzione, o un inserimento o la cancellazione.
Una specie di batteri gram-positivi e 'una terra e acqua saprofita.
Copie di transposable elementi sparpagliati nel il genoma, alcune delle quali e 'ancora attivo e spesso definito come "geni". Ci sono due classi di inseriti elementi ripetitivo. Corso che elementi (o RETROELEMENTS - come retrotransposons, retrovirus, lungo e breve costellato nucleotidici costellato nucleotidici ELEMENTI GIURIDICI) recepire attraverso trascrizione inversa dell'RNA intermedio. Aspetti (di classe II o DNA transposable GIURIDICI - come i transposoni, elementi in sequenza, elementi e mobile Gene cassette di origine batterica integroni) recepire direttamente da un unico sito nel DNA in un altro.
Una specie di forma a bastoncino Facultatively anaerobi gram-negativi, batteri, che si verifica nel terreno, materia fecale, e le fognature, e 'un'agente patogeno e causa cistite e pielonefrite.
Il processo con cui una molecola di DNA è duplicato.
Un gruppo di 13 o più deoxyribonucleotides nel quale il fosfato residui di ogni atto deossiribonucleotide ponti diesteri per creare dei collegamenti tra le forme ribosio.
Una tipologia di enzimi transferasi classe in grado di catalizzare il trasferimento di un gruppo metilico da un edificio all'altro. (28 Dorland, Ed, del trattato CE 2.1.1.
Una delle purine o delle pirimidine base legato a un Deoxyribose contenente un legame con un gruppo fosfato.
L'unità Monomeriche dal quale DNA o RNA polimeri. Sono composti da una base, una delle purine o delle pirimidine pentose zucchero, e un gruppo fosfato (da Re & Stansfield, un dizionario delle Genetics, 4th Ed)
DNA-dipendente DNA polimerasi trovato nei batteri, animali e cellule vegetali. Durante i processi di replicazione, questi enzimi catalizzare l 'aggiunta di deossiribonucleotide residue alla fine di un filamento di DNA in presenza di DNA come template-primer. Che possiede attività exonuclease e pertanto la funzione nella riparazione del DNA.
La corrispondenza in sequenza di nucleotidi in una molecola di acido nucleico con quelli di un altro acido nucleico molecola. Sequenza omologia segnala la relazione genetica di diversi organismi e Gene.
Proteine trovate in una specie di virus.
Una base della purina e un fondamentale unita 'di adenina nucleotidi.
Una specie di ALPHARETROVIRUS causando anemia in pollo.
Componente delle subunità 30S procariote ribosomi contenente 1600 nucleotidi e 21 proteine. 52 rRNA è coinvolto nel polipeptide l ’ inizio della sintesi.
Una traccia con il signor simbolo atomico, numero atomico 25 anni e peso atomico 54.94. E 'concentrata nei mitocondri cellulari alla ghiandola pituitaria, fegato, pancreas, reni e ossa, influenze mucopolysaccharides, stimola la sintesi della sintesi epatica del colesterolo e acidi grassi e è un cofattore in diversi enzimi, incluso arginase e fosfatasi alcalina nel fegato. (Dal AMA Drug Evaluations Rapporto 1992, p2035)
Il processo di staccando un composto chimico con l 'aggiunta di una molecola d'acqua.
I soggetti nei quali DNA- RNA-binding proteine e aminoacidi strutturali sono piegate in un unico gruppo intorno a un zinco atomo. Nel classico dito di zinco, zinco Atom è legato a due histidines cysteines e due, tra le cysteines e histidines sono 12 residui che si legano al DNA forma un dito. Da variazioni nella composizione delle sequenze in i polpastrelli e il numero e spazi tra ripetizioni di lato, zinco dita possono formare un numero ampio di sequenza diversi siti di legame specifico.
Plasmidi contenenti almeno uno di loro, o (cohesive-end sito della fagia Lambda. Sono utilizzati come clonazione veicoli.
Il materiale di CHROMOSOMES. Si tratta di un complesso del DNA, HISTONES; e (proteine cromosomiche nonhistone proteine Cromosomiali Non Istoniche) trovato all'interno del nucleo di una cella.
Il processo di di cumulativa generazioni successive attraverso i quali organismi acquisire le loro morfologica particolari caratteristiche e fisiologica.
Il tipo specie del genere microVirus. Un prototipo del piccolo virulento DNA coliphages, esso è costituito da un singolo filamento di DNA che supercoiled circolare di infezione, viene trasformato in un replicative a doppio filamento forma da un ospite enzima.
La relazione tra la struttura chimica e di un composto biologico o attività farmacologica. I composti sono spesso classificato insieme perché hanno caratteristiche strutturali in comune anche forma, dimensione, stereochemical accordi e distribuzione di gruppi funzionali.
Una specie di virus della famiglia potenzialmente tipi oncogeni POLYOMAVIRIDAE. Questi virus sono normalmente presente nella loro naturale ospiti come infezioni latenti, il virus è in oncogeni ospiti diversa da quella specie di origine.
La misura in cui un enzima mantiene la sua conferma strutturali o la sua attività quando sono esposte al magazzino, isolamento e la purificazione o varie altre manipolazioni chimici e fisici, incluso proteolitico enzimi e calore.
La biosintesi del RNA condotti in un modello di DNA. La biosintesi del DNA di un modello si chiamato RNA invertito Transcription.