Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
Un proceso electroquímico en el que las macromoléculas o partículas coloidales con una carga eléctrica negativa migran en una solución bajo influencia de una corriente eléctrica.
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Electroforesis en que se emplea un gel de agar o agarosa como medio de difusión.
Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Desorganización de la estructura secundaria de los ácidos nucleicos mediante ruptura de las uniones de hidrógeno e hidrofóbicas. El ADN desnaturalizado aparece como una estructura flexible de simple cadena. Los efectos de la desnaturalización sobre el ARN son similares aunque menos pronunciados y en gran medida reversibles.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.
Electroforesis en gel en el que la dirección del campo eléctrico se cambia periódicamente. Esta técnica es similar a otros métodos electroforéticos utiliza normalmente para separar las moléculas de doble cadena de ADN que varían en tamaño de hasta decenas de miles de pares de bases. Sin embargo, alternando la dirección de un campo eléctrico es capaz de separar las moléculas de ADN de hasta varios millones de pares de bases de longitud.
Electroforeses en las que se realiza un segundo transporte electroforético perpendicular para separar los componentes que resultan de la primera electroforesis. Esta ténica generalmente se usa en geles de poliacrilamida.
Una técnica para identificación de individuos de una especie basada en la singularidad de sus secuencias de ADN. La singularidad se determina identificándose cual combinación de variaciones alélicas ocurren en el individuo en un número estadísticamente relevante de sitios (o lugares) diferentes. En estudios forenses, POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCIÓN de LUGARES DE NVRT o lugares de REPETICIONES DE SATÉLITE múltiples y altamente polimórficos son analisados. El número de lugares usados para el perfil depende de la FRECUENCIA ALELICA en la población.
Coloides con una fase sólida continua y líquido como fase dispersa; los geles pueden ser inestables cuando, debido a la temperatura o a otras causas, la fase sólida se licuifica; el coloide resultante es llamado un sol.
La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Un sistema funcional el cual incluye los organismos de una comunidad natural junto a su ambiente. (MeSH/NLM) Unidad ecológica básica, formada por el ambiente viviente (biotopo) y de organismos animales y vegetables que interactúan como un ente funcional único (Material II - IDNDR, 1992)
Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.
La suma del peso de todos los átomos en una molécula.
Agua que contiene cantidades no significativas de sales, como el agua de RÍOS y LAGOS.
Una técnica altamente sensible (en el orden picomolar, que es 10,000 veces más sensible que la electroforesis convencional) y eficiente, que permite la separación de proteínas, ácidos nucléicos y carbohidratos.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Clase del filum PROTEOBACTERIA, compuesta por quimioheterótrofos y quimioautótrofos, que toman sus nutrientes de la descomposición de materia orgánica.
Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.
El espectro de los organismos vivos que habitan una determinada región determinada, hábitat o biotipo.
Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.
Enumeración por conteo directo de viables, aisladas células bacterianas, arquea, o por hongos o esporas capaz de un crecimiento sólido en medios de cultivo. El método se utiliza habitualmente por los microbiólogos ambientales para la cuantificación de microorganismos en el AIRE, ALIMENTOS y AGUA, por los médicos para medir la carga microbiana de los pacientes microbiana, y en las pruebas de drogas antimicrobianas.
Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.
Eliminación de CONTAMINANTES AMBIENTALES; PESTICIDAS y otros residuos usando organismos vivos, usualmente involucrando intervención de ingenieros ambientales o sanitarios.
Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Herramientas o aparatos para generar productos empleando la capacidad de conversión sintética o química de un sistema biológico. Pueden ser fermentadores clásicos, sistemas de perfusión de cultivo de células, o biorreactores de enzimas. Para la producción de proteínas o enzimas, se seleccionan microorganismos recombinantes como las bacterias, células de mamífero, o células de insectos o de vegetales.
Separación de partículas según la densidad, mediante el empleo de un gradiente de diversas densidades. En equilibrio cada partícula se sitúa en el gradiente equivalente a su densidad.
Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.
Género de bacterias grampositivas, microaerofílicas, en forma de bastoncillos que están ampliamente distribuidas en la naturaleza. Sus especies son parte también de la flora normal de la boca, del tracto intestinal y de la vagina de muchos mamíferos incluidos del hombre. La patogenicidad de este género es rara.
En relación con el tamaño de los sólidos.
Electroforesis que se aplica a PROTEÍNAS SANGUÍNEAS.
Un grupo de diferentes especies de microorganismos que actúan juntos como una comunidad.
Un herbicida selectivo pre- y post-emergente.
Agua salinizada de OCÉANOS Y MARES que proporciona el hábitat a los organismos marinos.
Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.
Genoma colectivo representante de muchos organismos, principalmente microorganismos, que existe en una comunidad.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Subclase de baja densidad de las lipoproteínas de alta densidad, con tamaños de las partículas comprendidos entre 8 y 13 nm.
Género de bacterias gramnegativas, en forma elipsoidal o de bastoncillos cuya fuente principal de energía y de potencia reductora es la oxidación de nitrito. Sus especies se encuentran en los suelos, océanos, lagos, ríos y sistemas de aguas de albañales.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Residuo o excremento del tracto digestivo formado en el intestino y expulsado por recto. Las heces están compuestas por agua, residuos alimenticios, bacterias y secreciones del intestino y del hígado. (Diccionario Mosby. 5a ed. Madrid: Harcourt España, 2000, p.615).
Alimento nutritivo que contiene fundamentalmente el cuajo o la sustancia semisólida formada cuando la leche se coagula.
Subclase de densidad intermedia de lipoproteínas de alta densidad, con tamaños de las partículas comprendidos entre 7 y 8 nm. Como la lipoproteína HDL2 más grande y más ligera, la lipoproteína HDL 3 es rica en lípidos.
Hidrocarburos líquidos complejos naturales que, después de la destilación, producen combustibles, derivados petroquímicos y lubricantes.
Grupo de bacterias gramnegativas, anaerobias que son capaces de oxidar completamente al acetato hasta dióxido de carbono al utilizar azufre como aceptor de electrones.
Una familia de plantas del orden Rhizophorales, subclase Rosidae, clase Magnoliopsida, que incluye árboles de mangle.
Clase de lipoproteínas que suele dividirse en HDL2 y HDL3 y en la variante menor HDL1. La HDL estimula el transporte de colesterol desde el tejido extrahepático al hígado para su excreción en la bilis. Es sintetizada por el hígado en forma de partículas "HDL nacientes" discoidales que carecen de núcleo central lipídico, acumulan un núcleo central de ésteres de colesterol durante el transporte inverso de colesterol y los transfieren al hígado directa o indirectamente por medio de otras lipoproteínas. La HDL vehicula apolipoproteínas C-II y E hacia y desde las lipoproteínas ricas en triglicéridos durante el catabolismo de las lipoproteínas. El colesterol HDL del suero se ha correlacionado negativamente con la enfermedad cardíaca coronaria prematura. (Adaptación del original: Dorland, 28a ed.).
Constituyente de la subunidad 40S de los ribosomas de eucariotas. El rARN 18S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
El mineral no consolidada o materia orgánica en la superficie de la tierra que sirve como un medio natural para el crecimiento de las plantas terrestres.
Se aplica a soluciones adoptadas para la eliminación de aguas residuales excepto las indicadas por descriptores más específicos.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Sustancias que contaminan el suelo. Se emplea para contaminantes del suelo en general o para aquellos que no tienen un título específico.
Diferencias genotípicas observadas entre los individuos de una población.
Identificación bioquímica de cambios mutacionales en una secuencia de nucleótidos.
Procedimientos para identificar tipos y cepas de bacterias. Los sistemas de tipificación más frecuentemente empleados son los de TIPIFICACION DE BACTERIOFAGOS y la SEROTIPIFICACION, así como la tipificación de bacteriocina y la biotipificación.
Género de bacterias en forma de bastoncillos, gram positivas, no resistentes a ácidos, que no forman esporas, son inmóviles y pertenecen a la familia Bifidobacteriaceae, orden Bifidobacteriales, clase ACTINOBACTERIA. Habita en los intestinos y heces de humanos así como en la vagina humana.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
La zona física inmediata alrededor de las raíces de las plantas incluidas las raíces de las plantas. Es un área de intensa y compleja actividad biológica que involucra a las plantas, microorganismos, otros organismos del suelo, y al suelo.
El estudio de microorganismos vivos en diversos tipos de medio ambiente (aire, suelo, agua etc) y su relación patogénica con otros organismos inclusive el hombre.
Familia de plantas del orden Myrtales, subclase Rosidae y clase Magnoliopsida. Son de árboles y arbustos que crecen sobre todo en áreas templadas.
Cromatografía en geles no iónicos sin tener en consideración el mecanismo de discriminación del soluto.
Electroforesis en que se establece un gradiente de pH en un medio de gel y las proteínas migran hasta que alcanzan el sitio (o foco) en el cual el pH es igual a su punto isoeléctrico.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Líquido rechazado o desechos arrastrados por las alcantarillas.
El hidrocarburo saturado más simple. Es un gas inflamable, incoloro, ligeramente soluble en agua. Es uno de los principales constituyentes del gas natural y se forma en la descomposición de materia orgánica.
Familia de bacterias grampositivas que no forman esporas entre las que se incluyen diversas formas parásitas, patógenas y saprofitas.
Centrifugación con una centrífuga que desarrolla campos centrífugos de más de 100,000 veces la gravedad.
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Cualquiera de los diversos procesos en los que las impurezas indeseables en el agua se eliminan o neutralizan, por ejemplo, la cloración, la filtración, tratamiento primario, intercambio iónico, y destilación. Se incluye el tratamiento de AGUAS RESIDUALES para proveer de agua potable e higiene en un ambiente controlado o cerrado, así como la provisión de los suministros públicos de agua potable.
Gas alcalino incoloro. Es formado en el cuerpo durante la descomposición de materiales orgánicos durante un gran número de importantes reacciones metabólicas. Notar que la forma acuosa del amoniaco se conoce como HIDRÓXIDO DE AMONIO.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Grandes flujos naturales de AGUA DULCE formado por tributarios convergentes y que desembocan en un cuerpo de agua (lago u océano).
Zonas de la tierra donde se ubican depósitos de hidrocarburos de PETRÓLEO y / o GAS NATURAL.
Reino de organismos eucariónticos, heterotróficos que viven parasitamente como sáprobos, incluyendo las setas (AGARICALES), LEVADURAS, moho, etc. Se reproducen sexual o asexualmente, y tienen ciclos de vida que van desde los simples a los complejos. Los hongos filamentosos, habitualmente llamados mohos, se refieren a los que crecen como colonias multicelulares.
Variación en la presencia o longitud de un fragmento de ADN que tiene lugar dentro de una especie, generada por una endonucleasa específica en un sitio específico del genoma. Tales variaciones se generan por mutaciones que crean o eliminan sitios de reconocimiento de estas enzimas o cambian la longitud del fragmento.
Clase de lipoproteínas responsable del transporte de colesterol a los tejidos extrahepáticos. Se forma en la circulación cuando las proteínas de muy baja densidad son degradadas inicialmente a lipoproteínas de densidad intermedia y después a LDL por la ganacia y la pérdida de apolipoproteínas específicas y la pérdida de la mayor parte de sus triglicéridos. Es captada y metabolizada por el hígado y por los tejidos extrahepáticos mediante endocitosis específica mediada por receptor. (Dorland, 28a ed)
Orden de metanógenos anaerobios del reino EURYARCHAEOTA. Hay dos familias: METHANOSARCINACEAE y Methanosaetaceae.
Degradación anaerobia de la GLUCOSA u otros nutrientes orgánicos para proporcionar energia en forma de ATP. Los productos finales varían según los organismos, sustratos y vías enzimáticas. Entre los productos comúnes de fermentación están el ETANOL y el ÁCIDO LÁCTICO.
Electroforesis en la que se introducen discontinuidades en el voltaje y en los gradientes de pH mediante tampones de diferente composición y pH en las diferentes partes de la columna del gel. El término "disc"se usó originalmente como una abreviatura de "discontinuo", en referencia a los tampones empleados, y no tiene nada que ver con la forma de las zonas separadas.
Efecto adverso en los cuerpos de agua (LAGOS; RÍOS; mares; aguas subterráneas, etc) causada por los CONTAMINANTES QUÍMICOS DEL AGUA.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Grupo de protobacterias comprendidas por bacterias gramnegativas fermentadoras y facultativamente anaerobias.
Electroforesis en la que se emplea un gel de amido (una mezcla de amilasa y amilopectina) como medio de difusión.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.
Las partes de una transcripción de un GEN que queda después que los INTRONES se remueven. Son ensambles que se convierten en un ARN MENSAJERO u otro ARN funcional.
Una técnica cromatográfica que utiliza la capacidad de moléculas biológicas de enlazarse a ciertos enlaces específicamente y reversiblemente. Se emplea en la bioquímica de las proteínas.
Los componentes protéicos de las lipoproteínas que quedan después de que son removidos los lípidos a los que se enlazan las proteínas. Juegan un importante papel en el transporte de los lípidos y el metabolismo.
Clase de BACTERIAS con diversas propiedades morfológicas. Algunas Actinobacterias muestran entre si una semejanza de la secuencia 16S rADN/rARN mayor al 80 por ciento asi como la presencia de distintivos de nucleótidos. (Adaptación del original: Stackebrandt E. et al, Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491).
Generalmente se refiere a las estructuras digestivas que se extienden desde la BOCA al ANO, pero no incluyen los órganos gandulares accesorios (HIGADO, TRACTO BILIAR, PANCREAS).
Filum de esponjas, que son animales multicelulares sésiles, con alimentación en suspensión, que utilizan células flageladas llamadas coanocitos para propalar agua. La mayoria son hermafroditas. Probablemente existió una rama evolutiva que no dió lugar a ningún otro tipo de animal. Excepto para las aproximadamente 150 especies de agua dulce, las esponjas son animales marinos. Son una fuente de ALCALOIDES, ESTEROLES y otras moléculas complejas útiles en medicina e investigación biológica.
Familia de bacterias grampositivas que se encuentran regularmente en la boca y el tracto intestinal del hombre y de otros animales, en los alimentos y productos lácteos y en jugos fermentados de vegetales. Unas pocas especies son altamente patógenas.
Una versión altamente miniaturizada de ELECTROFORESIS hecha en un artefacto microfluídico.
Compuestos orgánicos que generalmente contienen un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Veinte aminoácidos alfa son las subunidades que se polimerizan para formar proteínas.
Animales bovinos domesticados del género Bos, que usualmente se mantienen en una granja o rancho y se utilizan para la producción de carne o productos lácteos o para trabajos pesados.
Técnica de ampliación que utiliza la amplificación de la reacción en cadena por polimerasa de baja viscosidad (PCR) con primers únicos de secuencia arbitraria para generar ordenamientos de cadena específica de fragmentos anónimos de ADN. La técnica RAPD puede usarse para determinar la identidad taxonómica, evaluar las relaciones de parentesco, analizar muestras de genomas mezclados, y crear sondas específicas.
Es el componente protéico principal de las lipoproteínas de alta densidad. Es crucial en la promoción del eflujo de colesterol del tejido extrahepático al hígado donde es metabolizado y excretado del cuerpo. El compuesto es el activador de la lecitina-colesterol aciltransferasa, la cual forma ésteres de colesteril en la HDL. El gen de esta apoliproteína se halla en el brazo largo del cromosoma 11.
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.
Un filo de bacteria compuesto de tres clases: Bacteroides, Flavobacteria, y Sphingobacteria.
Cualquier preparación líquida o sólida hecha específicamente para cultivo, almacenamiento o transporte de microorganismos u otros tipos de células. La variedad de los medios que existen permiten el cultivo de microorganismos y tipos de células específicos, como medios diferenciales, medios selectivos, medios de test y medios definidos. Los medios sólidos están constituidos por medios líquidos que han sido solidificados con un agente como el AGAR o la GELATINA.
Ácido desoxirribonucleico que consitituye el material genético de los hongos.
Usando técnicas de BIOLOGÍA MOLECULAR, tales como SECUENCIA DE ANÁLISIS DE ADN; ELECTROFORESIS EN GEL DE CAMPO PULSADO y DERMATOFIGLIA DEL ADN, para identificar, clasificar y comparar organismos y sus subtipos.
Determinación de la densidad de un material midiendo la cantidad de luz o radiación que pasa a través del mismo o es absorbida por él.
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
Presencia de bacterias, virus y hongos en alimentos y productos alimentarios. Este término no está restringido a organismos patógenos: la presencia de varias bacterias y hongos no patógenos en quesos y vinos, por ejemplo, se incluye en este concepto.
Especie de planta del género CHRYSANTHEMUM, familia ASTERACEAE. Las flores contienen PIRETRINAS, cinerolonas y crisanteminas, que son potentes insecticidas por contacto. La mayoría del antiguo genero Pyrethrum ha sido reclasificado como TANACETUM y algunos como ASTERACEAE.
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
Gran grupo de bacterias entre las que se incluyen aquellas que oxidan el amonio a nitritos, metabolizan el azufre y los compuestos con azufre, o depositan los óxidos de hierro y/o manganeso.
Mutación causada por la sustitución de un nucleótido por otro. Esto causa que una molécula de ADN tenga un cambio en un solo par de bases.
Infecciones por BACTERIAS del orden Bifidobacteriales. Incluye infecciones del género BIFIDOBACTERIUM y GARDNERELLA, de la familia Bifidobacteriaceae.
El pH en soluciones de proteínas y compuestos relacionados al cual los iones dipolares se encuentran en cantidad máxima.
Lipoproteínas que se hallan en el suero sanguíneo humano en la fracción liprotéica de alta densidad y de muy alta densidad (HDL, VHDL). Están constituídas por varios polipéptidos diferentes, siendo el más importante las apolipoproteínas A-I y A-II. Mantienen la integridad estructural de las partículas HDL y son activadoras de la lecitina colesterol aciltransferasa (LCAT). Los pacientes con ateroesclerosis muestran bajos niveles de apolipoproteína A, y en la ENFERMEDAD DE TANGIER estas apolipoproteínas están ausentes o presentes en niveles plasmáticos extremadamente bajos.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Género de bacterias gram positivas móviles e inmóviles de la familia Clostridiaceae. Se han identificado muchas especies, siendo algunas patógenas. Se encuentran en el agua, suelo y en el tracto intestinal de humanos y animales inferiores.
Distensión de paredes delgadas del tracto digestivo que sobresale justo fuera de la cavidad del cuerpo en el extremo distal del cuello (esófago), se utiliza para el almacenamiento temporal de los alimentos y el agua.
Complejos lípido-proteína involucrados en el transporte y metabolismo de lípidos en el cuerpo. Ellos son partículas esféricas consistentes en un núcleo central hidrofóbico de TRIGLICÉRIDOS y ÉSTERES DE COLESTEROL; PHOSPHOLÍPIDOS; y APOLIPOPROTEÍNAS. Las lipoproteínas se clasifican por su densidad variable boyante y tamaños.
Atrofia progresiva difusa, autosómica recesiva, de la coroides, pigmento del epitelio y de la retina sensitiva que comienza en la infancia.
Un proceso facilitado por bacterias especializadas que implican la oxidación de amonio a nitrito y nitrato.
Filo de bacterias verdes no sulfúricas incluyendo la familia Chloroflexaceae, entre otras.
La colección completa de microbios (bacterias, hongos, virus, etc.) que, naturalmente, existe dentro de un nicho biológico particular, tal como un organismo, el suelo, un cuerpo de agua, etc.
Cultivo de los recursos naturales de la fauna acuática.
Clase del filum PROTEOBACTERIA formado generalmente por dos fenotipos principales: bacterias púrpuras no sulfúricas y bacterias que contienen bacterioclorofilo aeróbico.
Porción que usualmente está bajo tierra de una planta que sirve como soporte, almacén de alimentos, y a través de la cual entran a la planta el agua y los nutrientes minerales .
Aparición regular y simultánea de dos o más genotipos discontinuos en una sola población de entrecruzamiento. El concepto incluye diferencias en los genotipos que oscilan desde un único sitio nucleotídico (POLIMORFISMO DE NUCLEÓTIDO SIMPLE) hasta grandes secuencias de nucleótidos visibles a nivel cromosómico.
Análisis de POLIMORFISMO DE LONGITUD DEL FRAGMENTO DE RESTRICCION de genes rARN que es usada para diferenciación entre especies o cepas.
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Seguimientos intergénicos de ADN que están entre los genes de ARN ribosómico (espaciadores transcriptos internos) y entre las unidades de repetición en tandem de ADNr (espaciadores transcriptos externos y espaciadores no transcriptos)
Filum de bacterias oxigénicas fotosintéticas que comprende desde bacterias unicelulares a multicelulares, que poseen CLOROFILA y que realizan la FOTOSÍNTESIS con oxígeno. Las Cyanobacteria son los únicos organismos conocidos capaces de fijar tanto el DIÓXIDO DE CARBONO (en presencia de luz) como el NITRÓGENO. La morfología celular puede incluir heterocistos fijadores de nitrogeno y/o células en reposo denominadas acinetos. Anteriormente denominadas algas azúl-verdosas, las cyanobacteria eran consideradas tradicionalmente como ALGAS.
Grupos químicos que contienen el enlace sulfuro covalente -S-. El átomo de azufre puede unirse a partes orgánicas o inorgánicas.
Técnica de separación en la que la fase estacionaria está constituída por resinas de intercambio iónico. Las resinas contienen pequeños iones libres que intercambian fácilmente de lugar con otros pequeños iones de carga similar presentes en las soluciones que las resinas.
Compuestos conjugados de proteína-carbohidrato que incluyen las mucinas, los mucoides y las glicoproteínas amiloides.
Constitución genética del individuo, que comprende los ALELOS presentes en cada locus génico (SITIOS GENÉTICOS).
Sales inorgánicas del ácido sulfúrico.
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Bacterias que requieren oxígeno molecular para su metabolismo y crecimiento, encontradas generalmente en la atmósfera o en entornos bien oxigenados.
Un surfactante aniónico, generalmente una mezcla de alquilsulfatos de sodio, principalmente el laurílico; disminuye la tensión superficial de soluiciones acuosas; es utilizado como emulsificador de las grasas, agente humectante y detergente en cosméticos, compuestos farmacéuticos y dentífricos; también como herramienta experimental en la bioquímica de proteínas.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Incrustaciones, formadas a partir de microbios (bacterias, algas, hongos, plancton, o protozoos) empotradas en los polímeros extracelulares, que se adhieren a las superficies, como dientes (DEPÓSITOS DENTALES); PRÓTESIS E IMPLANTES; y catéteres. Las biopelículas se previenen de formar mediante el tratamiento de las superficies con DENTÍFRICOS; DESINFECTANTES; ANTIINFECCIOSOS, y agentes anti-incrustantes.
Bacterias anaerobias son microorganismos unicelulares que no requieren oxígeno para sobrevivir y crecer, y a menudo producen toxinas que pueden causar infecciones graves en humanos y animales.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Clase de todas las enzimas que catalizan reacciones de oxidación-reducción. El sustrato que es oxidado es considerado donador de hidrógeno. El nombre sistemático está basado en la oxidorreductasa donadora:aceptora. El nombre recomendado es deshidrogenasa, siempre que sea posible. Como alternativa puede usarse reductasa. Oxidasa sólo se usa en los casos en que el O2 es el aceptor.
Técnica en la que existe difusión del antígeno o anticuerpo a través de un medio semisólido, usualmente gel de agar o agarosa, siendo el resultado una reacción de precipitina.
Artículos alimenticios que se derivan de procesos fabricados a partir de cualquier porción de los animales que se utilizan en la alimentación (ejemplo, queso de cabeza, salchichas, pasta frita de carne de cerdo)
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Una familia de bacterias gramnegativas aerobias en la clase BETA PROTEOBACTERIAS, circundando el complejo acidovorans rARN. Algunas especies son patogénicas para las PLANTAS.
Tipo de HIBRIDACION IN SITU en que las secuencias dianas se tiñen con colorante fluorescente de manera que se pueda determinar su localización y tamaño mediante el empleo de microscopía fluorescente. Esta coloración es lo suficientemente distintiva como para que la señal de hibridización pueda ser vista tanto en las difusiones de la metafase como en los núcleos de la interfase.
Masa total de todos los organismos de un determinado tipo y/o en una area determinada. Incluye el rendimiento de masa vegetativa producida de determinada cosecha.
Registro de descendencia o ascendencia en especial de una característica particular o rasgo, que indica cada miembro de la familia, su relación y su situación en relación a este rasgo o característica.
El continente situado alrededor del polo sur y las aguas del sur de los océanos Atlántico, Pacífico e Indico. Incluye las Dependencias de las Islas Falkland.
Moléculas de ácido nucleico de doble cadena (ADN-ADN o ADN-ARN) que contienen regiones mal pareadas de nucleótidos (no-complementarios). In vivo, estos heterodúplex pueden producirse por mutación o recombinación genética; in vitro, se forman por la hibridización de ácidos nucleicos. El análisis por microscopía electrónica de los heterodúplex resultantes facilita el mapeo de regiones de secuencias de bases homólogas de ácidos nucleicos.
Proteínas de transporte que trasladan sustancias específicas en la sangre o a través de las membranas celulares.
Sección del canal alimentario que va desde el ESTÓMAGO hasta el CANAL ANAL. Incluye al INTESTINO GRUESO y el INSTESTINO DELGADO.
Principales proteínas estructurales de LIPOPROTEÍNAS ricas en triacilglicerol. Hay dos formas, la apolipoproteína B-100 y la apolipoproteína B-48, ambas derivadas de un único gen. La ApoB-100 expresada en el hígado ocurre en lipoproteínas de baja densidad (LIPOPROTEÍNAS LDL; LIPOPROTEÍNAS VLDL). La ApoB-48 expresada en el intestino ocurre en QUILOMICRONES. Son importantes en la biosíntesis, el transporte, y en el metabolismo de lipoproteínas ricas en triacilglicerol. Los niveles plasmáticos de Apo-B son altos en pacientes ateroscleróticos pero no detectables en ABETALIPOPROTEINEMIA.
Electroforesis en la que el medio de difusión es el acetato de celulosa.
Producto alimenticio hornadeado que se confecciona a partir de la harina de trigo que se humedece, amasa y en ocasiones se fermenta. Es una de las comidas principales desde tiempos prehistóricos, se ha confeccionado en diversas formas utilizando variedad de ingredientes y métodos.
Un género de bacterias grampositivas, en la familia Lachnospiraceae que habita el RUMEN, INTESTINO GRUESO y CIEGO de MAMIFEROS.
SUPLEMENTOS DIETÉTICOS microbianos vivos que afectan beneficiosamente al animal huésped, al mejorar su equilibrio microbiano intestinal. Los antibióticos y otros compuestos relacionados no se incluyen en esta definición. En humanos, los lactobacilos se utilizan habitualmente como probióticos, como especies únicas o como cultivos mixtos con otras bacterias. Otros géneros que se han utilizado son la bifidobacteria y los estreptococos (Traducción del original: J. Nutr. 1995;125:1401-12).
Saco ciego o fondo de saco del INTESTINO GRUESO, que está debajo de la entrada del INTESTINO DELGADO. Tiene una extensión semejante a un gusano, el APÉNDICE vermiforme.
El estudio sistemático de la dotación completa de proteínas (PROTEOMA) de los organismos.
Medidas binarias de clasificación para evaluar los resultados de la prueba.Sensibilidad o su índice de repeteción es la proporción de verdaderos positivos. Especificidad es la probabilidad de determinar correctamente la ausencia de una condición. (Del último, Diccionario de Epidemiología, 2d ed)
Sustancias o mezclas que se añaden al suelo para suministrarle nutrientes o para que los nutrientes ya presentes en el suelo sean aprovechables, para incrementar el desarrollo y productividad de las plantas.
El estudio del origen, estructura, desarrollo, crecimiento, función, la genética y la reproducción de los organismos que habitan en los OCÉANOS Y MARES.
Agua contaminada generada como producto de desecho de la actividad humana.
Género de bacterias gramnegativos, anaerobias, en forma de bastoncillos . Sus organismos habitan normalmente en las cavidades orales, respiratoria, intestinal y urogenital de hombres, animales e insectos. Algunas especies pueden ser patógenas.
Cualquiera de los diversos animales que constituyen la familia Suidae, integrada por mamíferos robustos, omnívoros, de patas cortas con gruesa piel, generalmente cubierta de cerdas gruesas, hocico bastante largo y móvil y una cola pequeña. Incluye el género Babyrousa,Phacochoerus (jabalí verrugoso) y Sus, del que forma parte el cerdo doméstico (SUS SCROFA).
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Un método (desarrollado originalmente por E.M.Southern) para la detección del ADN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa o de otro tipo o en membrana de nylon.
Género de plantas de la familia POACEAE es la fuente de GRANOS COMESTIBLES. Un híbrido con Centeno (SECALE CEREALE) es llamado TRITICALE. La semilla se muele en HARINA y se utiliza para hacer PAN, y es la fuente de AGLUTININAS DEL GERMEN DE TRIGO.
Género de bacterias gramnegativas, aerobias en forma de bastoncillos que está ampliamente distribuido en la naturaleza. Algunas especies son patógenos para humanos, animales y plantas.
Un gran órgano glandular lobulada en el abdomen de los vertebrados que es responsable de la desintoxicación, el metabolismo, la síntesis y el almacenamiento de varias sustancias.
Género de bacteria gramnegativas, aerobias, en forma de bastoncillos que se caracterizan por tener una membrana externa que contiene esfingolípidos pero que no tiene lipopolisacáridos. Tienen la capacidad de degradar una amplia gama de compuestos aromáticos sustituidos.
Complemento proteico de un organismo codificado por su genoma.
Acumulaciones de excretas de animales sólidas o líquidas generalmente de establos y corrales con o sin basura. Su principal aplicación es como fertilizante.
Una gran familia de gramíneas herbáceas de hoja estrecha del orden Cyperales, subclase Commelinidae, clase Liliopsida (monocotiledóneas). Los cereales (GRANOS COMESTIBLES) provienen de los miembros de esta familia. La RINITIS ALÉRGICA ESTACIONAL puede ser inducida por el POLEN de muchas de las hierbas.
Elementos de intervalos de tiempo limitados, que contribuyen a resultados o situaciones particulares.
Especie Oryctolagus cuniculus, de la familia Leporidae, orden LAGOMORPHA. Los conejos nacen en las conejeras, sin pelo y con los ojos y los oídos cerrados. En contraste con las LIEBRES, los conejos tienen 22 pares de cromosomas.
Primer estómago de los rumiantes. Descansa en el lado izquierdo del cuerpo, ocupa todo el lado izquierdo del abdomen y se alarga a través de todo el plano medio del cuerpo hacia el lado derecho. Tiene gran capacidad, se divide en un saco superior y uno inferior, cada uno de los cuales posee un saco ciego en su extremidad posterior. El rumen está cubierto por una membrana mucosa que no contiene glándulas digestivas, pero que contiene gran cantidad de glándulas que segregan moco. Alimento poco procesado y parcialmente masticado se almacena y agita en el rumen hasta que el animal encuentra que hay circunstancias convenientes para rumiarlo. Cuando esto ocurre, pequeñas bolas de alimentos se regurgitan a través del esófago hacia la boca, y se someten a una segunda masticación más cuidadosa, se traga, y pasa hacia otras partes del estómago compuesto.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Tipo de cromatografía de intercambio iónico que emplea dietilaminoetil celulosa (DEAE-CELULOSA) como resina cargada positivamente.
Ausencia total, o (aproximadamente) la escasez, de oxígeno elemental disuelto o gaseoso en un lugar o ambiente determinado.
Oligonucleótidos sintéticos o naturales utilizados en estudios de hibridización con el propósito de identificar y estudiar fragmentos específicos de ácidos nucleicos, ejemplo, segmentos de ADN cercanos o que están dentro de locus específicos del gen o de genes. La sonda hibridiza con un ARNm específico, si está presente. Las técnicas convencionales utilizadas para evaluar el producto de hibridización incluyen el ensayo de dot blot, ensayo de Southern blot, y las pruebas de anticuerpos específicos de híbridos de ADN:ARN. Las marcas convencionales para la sonda incluyen el marcaje con radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina.
Técnicas usadas para separar mezclas de sustancias basadas en diferencias en las afinidades relativas de las sustancias para fases móviles y estacionarias. Una fase móvil (líquido o gas) pasa a través de una columna que contiene una fase estacionaria de líquido sólido poroso líquido revestido en un soporte sólido. El uso es tanto analítico para pequeñas cantidades y preparativo para cantidades a granel.
Especie de bacterias grampositivas en forma de bastoncillos aislada del tracto intestinal de humanos y de animales, de la boca humana y de la vagina. Este organismo produce el producto fermentado, leche acidificada.
Métodos de comparación de dos o más muestras en el mismo gel de electroforesis bidimensional.
El contenido incluido en todo o cualquier segmento del TUBO DIGESTIVO.
Técnica que combina la electroforesis de proteína y la inmunodifusión doble. En este procedimiento las proteínas primero se separan por electroforesis en gel (usualmente agarosa), luego se hacen visibles por inmunodifusión de anticuerpos específicos. Se produce un arco elíptico específico de precipitina para cada proteína detectable por el antisuero.
Proteína de 513 kDa sintetizada en el HÍGADO. Sirve como proteína estructural mayor de las lipoproteínas de baja densidad (LIPOPROTEÍNAS LDL.
Cultivos celulares establecidos que tienen el potencial de multiplicarse indefinidamente.
Bacteria que retiene la coloración violeta cristal cuando se trata con el método de Gram.
Hábitat de aguas termales naturalmente calentadas por procesos geológicos subyacentes. La superficie de los manantiales calientes ha sido usada para la BALNEOLOGIA. Las de aguas termales submarinas se les llama RESPIRADEROS HIDROTÉRMICOS.
Colesterol contenido en o unido a lipoproteínas de alta densidad (HDL), incluyendo los ÉSTERES DEL COLESTEROL y colesterol libre.
Técnicas para dividir varios componentes de la célula en FRACCIONES SUBCELULARES.