Cristalografía por Rayos X
El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
Cristalografía
Rayos X
Radiación electromagnética emitida que penetra cuando los electrones orbitales internos de un átomo son excitados y liberan energía radiante. Las longitudes de onda de los rayos X van de 1 pm a 10 nm. Los rayos X de energía más alta son mas duros que los rayos X de longitud de onda más cortas. Los rayos X blandos o rayos Grenz son menos enérgicos y más largo en longitud de onda. El extremo corto de longitud de onda del espectro de rayos X se solapa con la gama de los RAYOS GAMMA de longitud de onda. La distinción entre los rayos gamma y los rayos X se basa en su fuente de radiación.
Difracción de Rayos X
Esparcimiento de rayos X por la materia, especialmente cristales, con la consiguiente variación en intensidad debida a los efectos de interferencia. El análisis de la estructura de los cristales de los materiales se hace pasando rayos x a través de ellos y registrando la imagen de difracción de los rayos (CRISTALOGRAFIA POR RAYOS X).
Modelos Moleculares
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Cristalización
Formación de sustancias cristalinas a partir de soluciones o fusiones. (traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Sincrotrones
Dispositivos para acelerar protones o electrones en órbitas cerradas donde el voltaje de aceleración y la fuerza del campo magnético varían (el voltaje de aceleración se mantiene constante para los electrones) para mantener el radio de la órbita constante.
Microscopía por Crioelectrón
Microscopía electrónica en la que se produce una congelación rápida de las muestras. La imagen de las moléculas hidratadas-congeladas y de los organelos permite obtener la mejor resolución posible que semeja al estado vivo, libre de fijadores químicos o de colorantes.
Sitios de Unión
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Estructura Molecular
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Electrones
Partículas elementales estables que poseen la carga negativa más pequeña conocida, presente en todos los elementos; también llamados negatrones. Los electrones cargados positivamente se denominan positrones. Los números, energías y ordenamiento de electrones alrededor de los núcleos atómicos determinan las identidades químicas de los elementos. Los rayos de electrones también se denominan RAYOS CATÓDICOS.
Secuencia de Aminoácidos
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Resonancia Magnética Nuclear Biomolecular
Espectroscopía por RMN de macromoléculas biolóticas de tamaño pequeño a mediano. Se emplea con frecuencia en investigaciones estructurales de proteínas y ácidos nucléicos, y a menudo comprende más de un isótopo.
Dispersión del Ángulo Pequeño
Dispersión de una RADIACIÓN electromagnética o acústica, o de partículas, en ángulos pequeños a causa de partículas o cavidades de dimensiones que a veces son del orden de varias veces la longitud de onda de la radiación o la longitud de onda de Briglie de las partículas dispersadas. También se denomina ángulo bajo de dispersión (de McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 6a ed). Las técnicas de dispersión de ángulo pequeño (SAS), neutrones de ángulo pequeño (SANS), rayos X (SAXS), y dispersión de luz (SALS o símplemente LS) se utilizan para la observación de objetos a escala nanométrica.
Unión Proteica
Enlaces de Hidrógeno
Difracción de Neutrones
La dispersión de NEUTRONS por la materia, en particular los cristales, con variación en la intensidad debido a los efectos de la interferencia. Es útil en CRISTALOGRAFÍA y DIFFRACTIÓN DE POLVO.
Espectroscopía de Resonancia Magnética
Método espectroscópico de medición del momento magnético de las partículas elementales tales como núcleos atómicos, protones o electrones. Se emplea en aplicaciones clínicas tales como IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA (IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA)
Dominio Catalítico
Espectrometría por Rayos X
Análisis de espectrometría de RAYOS X fluorescentes, es decir, rayos X-emitidos después de bombardear la materia con partículas de alta energía, tales como PROTONES; ELECTRONES, o rayos X dela más alta energía. Identificación de ELEMENTOS por esta técnica se basa en el tipo específico de rayos X que se emiten que son con características de los elementos específicos en el material que se analiza. La característica de los rayos X se distinguen y/o cuantifican por cualquiera de los métodos de dispersión de longitud de onda de dispersión o de energía.
Estructura Cuaternaria de Proteína
Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Ligandos
Molécula que se une a otra molécula. Se usa especialmente para referirse a una molécula pequeña que se une específicamente a una molécula grande, como p. ej., la unión de un antígeno a un anticuerpo, la unión de una hormona o un neurotransmisor a un receptor, o la unión de un sustrato o un efector alostérico a una enzima. Un ligando es también molécula que dona o acepta un par de electrones para formar un enlace covalente coordinado con el átomo metálico central de un complejo de coordinación. (Dorland, 28a ed)
Fotorreceptores Microbianos
Proteínas y grupos prostéticos de proteínas que absorben luz y que se encuentran en ciertos microorganismos. Algunos fotorreceptores microbianos inician reacciones químicas específicas, que indican un cambio en el ambiente, mientras otros generan energía, bombeando iones específicos a través de la membrana celular.
Relación Estructura-Actividad
Proteínas
Catálisis
Dimerización
Coloración Negativa
La técnica que lava las muestras de tejidos con una solución concentrada de una sal de metal pesado, dejándola secar. La muestra se recubre con una capa muy fina de la sal metálica, excluyéndose las áreas donde está presente una macromolécula adsorbida. Las macromoléculas permiten que los electrones del rayo de un microscopio electrónico pasen mucho con mucha más facilidad que el metal pesado, produciéndose así una imagen inversa o negativa de la molécula.
Modelos Químicos
Agua
Un líquido transparente, inodoro, insaboro que es esencial para la vida de la mayoría de los animales y vegetales y es un excelente solvente para muchas sustancias. La fórmula química es el óxido de hidrógeno (H2O). (Traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Soluciones
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Muramidasa
Enzima básica que está presente en la saliva, lágrimas, clara de huevo y muchos fluidos animales. Funciona como agente antibacteriano, La enzima cataliza la hidrólisis de enlaces 1,4-beta entre los residuos de ácido N-acetilmurámico y la N-acetil-D-glucosamina en el peptidoglicano y entre residuos de N-acetil-D-glucosamina en la quitodextrina. EC 3.2.1.17.
Estereoisomerismo
Multimerización de Proteína
El montaje de la ESTRUCTURA CUATERNARIA DE PROTEÍNA de las proteínas multiméricas (COMPLEJOS MULTIPROTEÍNAS) desde sus compuestos de las SUBUNIDADES DE PROTEÍNA.
Neutrones
Partículas elementales eléctricamente neutras que se encuentran en todos los núcleos atómicos menos el de hidrógeno ligero; la masa es igual a la del protón y electrón combinados y son inestables cuando se aíslan del núcleo, sufriendo descomposición beta. Los neutrones lentos, térmicos, epitérmicos y rápidos se refieren a los niveles de energía con los cuales los neutrones son expulsados de los núcleos más pesados durante su descomposición.
Termodinámica
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Simulación de Dinámica Molecular
Una simulación por computador desarrollada para estudiar el movimiento de las moléculas en un período de tiempo.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Diseño de Drogas
Diseño molecular de drogas con propósitos específicos (tales como unión al ADN, inhibición enzimática, eficacia anti cancerígena, etc.) basado en el conocimiento de las propiedades moleculares tales como la actividad de los grupos funcionales, geometría molecular y estructura electrónica y también en la información catalogada sobre moléculas análogas. El diseño de drogas generalmente consiste en el modelaje molecular asistido por computación y no incluye la farmacocinética, análisis de dosis o análisis de administración de la droga.
Tomografía Computarizada por Rayos X
Tomografía que utiliza transmisión de rayos x y un algoritmo de computador para reconstruir la imagen.
Microespectrofotometría
Ténica analítica para estudiar sustancias presentes en concentraciones de coenzimas en células individuales, in situ, mediante la medición de la absorción de la luz. La luz de una lámpara de tungsteno o de un arco de xenonio dispersada por una retícula monocromática, ilumina el sistema óptico de un microscopio. La absorción de luz se mide (en nanómetros) comparando la diferencia entre la imagen de la muestra y una imagen de referencia.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Homología Estructural de Proteína
El grado de similitud entre la forma tridimensional de las proteínas. Puede ser una indicación de poca HOMOLOGÍA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y utilizada para el DISEÑO DE DROGAS racional.
Sustancias Macromoleculares
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Pantallas Intensificadoras de Rayos X
Pantallas que absorben la energía del haz de rayos x que ha penetrado al paciente y convierte esta energía en un patrón de luz que tiene la información más cercana posible al haz de rayos x original. Mientras más luz produzca la pantalla por entrada de radiación x, se requiere menor exposición a los rayos x y por tanto una exposición más corta en el tiempo para exponer la película, En la mayoría de los sistemas de pantalla, la misma se introduce entre dos pantallas en un contenedor de modo que la emulsión de cada lado se exponga a la luz que proviene de la pantalla contigua.
Espectroscopía de Absorción de Rayos X
Análisis de la energía absorbida a través de un espectro de energías de rayos X / longitudes de onda para determinar la estructura química y estados electrónicos del medio absorbente.
Especificidad por Sustrato
Conformación de Ácido Nucleico
Simulación por Computador
Análisis Espectral
Análisis de Fourier
Análisis basado en la función matemática formulada por primera vez en 1807 por Jean-Baptiste-Joseph Fourier. La función, conocida como la transformada de Fourier, describe el patrón sinusoidal de cualquier patrón fluctuante en el mundo físico en términos de su amplitud y su fase. Tiene amplia aplicación en biomedicina, por ej. análisis de datos cristalográficos de rayos X, cardinal en la identificación la naturaleza de doble hélice del ADN y en el análisis de otras moléculas, incluyendo virus, y el algoritmo de proyección reversa universalmente utilizado en tomografía computadorizada, etc.
Mioglobina
Una proteína conjugada que es el pigmento transportador de oxígeno del músculo. Está constituída por una cadena polipeptídica de globina y un grupo heme.
Automatización de Laboratorios
Procesamiento Automatizado de Datos
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Anhidrasa Carbónica II
Isoenzima de anhidrasa carbónica citosólica se encuentra ampliamente distribuida en las células de casi todos los tejidos. Las deficiencias de la anhidrasa carbónica II produce un síndrome caracterizado por la OSTEOPETROSIS, acidosis l tubular renal (ACIDOSIS TUBULAR RENAL ) y calcificación cerebral. EC 4.2.1.-
Sustitución de Aminoácidos
El reemplazo que occurre natural o inducido experimentalmente de uno o más AMINOÁCIDOS en una proteína con otra. Si un amino ácido equivalente funcional se sustituye, la proteína puede mantener el acitividad tipo salvaje. La sustitución también puede disminuir, aumentar, o eliminar la función de la proteína. La sustitución inducida experimentalmente se utiliza con frecuencia para estudiar las actividades y enlaces de las enzimas.
Mutación
Calorimetría
La medición de la cantidad de calor presente en varios procesos, tales como las reacciones químicas, cambios de estado, y formaciones de soluciones, o en la determinación de las cualidades caloríficas de las sustancias. La unidad fundamental de medida es el julio (joule, en inglés) o la caloría (4.184 julios).
Microscopía Electrónica
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
Ingeniería de Proteínas
Procedimientos mediante los que se cambia o se crea in vitro la función y estructura de las proteínas, alterando las existentes o sintetizando nuevos genes estructurales que dirigen la síntesis de proteínas con las propiedades deseadas. Esos procedimientos pueden incluir el diseño de MODELOS MOLECULARES de proteínas utilizando GRÁFICOS POR ORDENADOR u otras técnicas de modelado molecular; la MUTAGÉNESIS SITIO DIRIGIDA de genes existentes; y técnicas de EVOLUCIÓN MOLECULAR DIRIGIDA para crear nuevos genes.
Programas Informáticos
Ballenas
Grandes mamíferos marinos del orden CETACEA. En el pasado fueron muy valiosos comercialmente por el aceite, por su carne como alimento para los humanos y en ALIMENTACIÓN ANIMAL y FERTILIZANTES, así como por la lámina córnea de la mandíbula superior ("barba" de ballena). En la actualidad existe una moratoria en la mayoría de la pesca comercial de ballenas, ya que todas las especies están en la lista de amenazadas o en vías de extinción.
Teoría Cuántica
Solventes
Líquidos que disuelven otras sustancias (solutos), generalmente sólidos, sin cambio en la composición química, como el agua con azúcar.
Dicroismo Circular
Calixarenos
Interacciones Hidrofóbicas e Hidrofílicas
Espectrometría Raman
Temperatura Ambiental
Simulación del Acoplamiento Molecular
Una técnica de simulación por computador que se usa para modelar la interacción entre dos moléculas. Típicamente, la simulación de acoplamiento mide las interacciones de una molécula pequeña o ligando con una parte de una molécula más grande tal como una proteína.
Espectroscopía de Resonancia por Spin del Electrón
Técnica aplicable a la gran variedad de sustancias que exhiben paramagnetismo debido a los momentos magnéticos de los electrones no pareados. Los espectros son útiles para la detección e identificación, para la determinación de la estructura del electrón, para el estudio de las interacciones entre moléculas, y para la medición de los "spins" y momentos nucleares. La espectroscopía nuclear electrónica de doble resonancia (ENDOR), es una variante de la técnica que puede dar una mejor resolución. El análisis de la resonancia del spin electrónico puede hacerse ahora in vivo, incluyendo aplicaciones imagenológicas como la RESONANCIA MAGNÉTICA.
Complejos de Coordinación
Ligandos cargados neutral o negativamente vinculados a los cationes metálicos o átomos neutrales. El número de átomos del ligando a los que centro metálico está directamente vinculado es el número de coordinación del catión metálico, y ese número es siempre mayor que la de valencia regular o número de oxidación del metal. Una coordinación compleja de puede ser negativo, neutral o positivamente cargado.
Dispersión de Radiación
Thermus thermophilus
Especie de bacteria gramnegativa, aerobia, en forma de bastoncillos que se encuentran en las aguas termale s con pH neutro a alcalino, así como en los calentadores de agua.
Thermotoga maritima
Bacteria en forma de bastoncillo rodeada de una estructura en forma de vaina que tiene salientes en forma de balón fuera de los extremos de la célula. Es termofílica, el crecimiento ocurre con temperaturas tan altas como 90 grados C. Se aisla de sedimentos marinos geotérmicamente calientes o de aguas termales.
Biocatálisis
Hidrolasas de Triéster Fosfórico
Una clase de enzimas que catalizan la hidrólisis de una de los tres enlaces éster en un compuesto conteniendo fosfotriéster.
Espectrometría de Masas
Urato Oxidasa
Enzima que cataliza la conversión de urato y productos no identificados. Es una proteína que contiene cobre. Los productos iniciales se descomponen para formar alantoína. EC 1.7.3.3.
Compuestos Organometálicos
Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas
Módulos proteicos con superficies de unión a ligandos conservadas que intervienen en funciones de interacción específicas en las VIAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL y los SITIOS DE UNIÓN específicos de sus LIGANDOS proteicos afines.
Hemo
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Metales
Elementos químicos electropositivos caracterizados por su ductibilidad, maleabilidad, brillo, y conductibilidad al calor y la electricidad. Pueden reemplazar al hidrógeno de un ácido y formas bases con radicales hidroxilo.
Histidina
Protones
Algoritmos
Zinc
Metal de número atómico 30 y peso atómico 65.37. Es un oligoelemento necesario en la dieta, siendo una parte esencial de muchas enzimas, y desempeña una función importante en la síntesis de proteínas y en la división celular. La deficiencia de zinc se asocia con ANEMIA, baja estatura, HIPOGONADISMO, alteración de la CICATRIZACIÓN DE HERIDA y geofagia. Se conoce con el símbolo Zn.
Complejos Multiproteicos
Complejos macromoleculares formados de la asociación de subunidades definidas de proteínas.
Secuencia de Bases
Rudiviridae
Familia de virus ADN con forma bacilar que infectan a ARCHAEA. Carecen de cubiertas o lípidos víricos.
Espectrofotometría Ultravioleta
Diseño Asistido por Computador
Bromo
Estabilidad de Enzimas
Proteínas de la Membrana
Proteínas que se encuentran en las membranas celulares e intracelulares. Están formadas por dos tipos, las proteínas periféricas y las integrales. Incluyen la mayoría de las enzimas asociadas con la membrana, proteínas antigénicas, proteínas transportadoras, y receptores de drogas, hormonas y lectinas.
Resonancia por Plasmón de Superficie
Una técnica biosensora en que las biomoléculas capaces de enlazar con analíticos o enlaces específicos son primero inmovilizadas en una cara de una película metálica. Entonces se proyecta luz por la cara opuesta de la película, para excitar los plasmones de superficie, o sea, las oscilaciones de los electrones libres propagándose a lo largo de la superficie de la película. Se mide el índice refractario de la luz que esta superficie refleja. Cuando las biomoléculas inmovilizadas son enlazadas por sus ligandos, se crea una alteración en los plasmones de superficie en la cara opuesta de esta película, la cual es directamente proporcional al cambio en la masa enlazada o adsorbida. El enlace se mide por los cambios en el índice refractario. La técnica se usa para estudiar las interacciones biomoleculares, como el enlace antígeno-anticuerpo.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Concentración de Iones de Hidrógeno
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Péptidos
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Oxidación-Reducción
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
Cobre
Un oligoelemento de metal pesado maleable anaranjado que tiene por símbolo atómico Cu, número atómico 29 y peso atómico 63.55. Sus sales son venenosas. El cobre es esencial en la nutrición siendo un componente de varias proteínas incluyendo la ceruloplasmina, eritrocupreína, citocromo c oxidasea, tirosinasa, etc. Su deficiencia, que es rara, puede resultar en anemia microcítica hipocrómica, neutropenia y alteraciones óseas.
Espectrofotometría Infrarroja
Subunidades de Proteína
Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.
Radiografía
Examen de cualquier parte del cuerpo con fines diagnósticos por medio de RAYOS X o RAYOS GAMMA, que registran la imagen en una superficie sensible (como una película fotográfica).
Medición de Intercambio de Deuterio
Una técnica de investigación para medir regiones de moléculas expuestas a solventes que es usada para percibir acerca de la CONFORMACION PROTEICA.
Espectroscopía Infrarroja Transformadora de Fourier
Oxígeno
Ribonucleasa Pancreática
Inhibidores Enzimáticos
Modelos Estructurales
Hidrógeno
Hidrógeno. El primer elemento químico de la tabla periódica. Tiene por símbolo atómico H, número atómico 1 y peso atómico [1.00784; 1.00811]. Existe, en condiciones normales, como un gas diatómico incoloro, inodoro e insípido. Los iones del hidrógeno son PROTONES. Además del isótopo común H1 el hidrógeno existe como el isótopo estable DEUTERIO y el isótopo radioactivo inestable TRITIO.
Alcanfor 5-Monooxigenasa
Enzima del citocromo P-450 soluble que cataliza la monooxigenación del alcánfor en presencia de putidaredoxin reductasa y oxigeno molecular. Esta enzima, codificada por el gen CAMC también conocido como CYP101, ha sido cristalizada a partir de bacterias y la estructura está bien definida. En condiciones anaeróbicas, esta enzima reduce los compuestos polihalogenados enlazados al sitio de enlace del alcánfor.
Acetato de Potasio
Estabilidad Proteica
Secuencias de Aminoácidos
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Clara de Huevo
Emparejamiento Base
Apareamiento de las bases de purinas y pirimidinas por ENLACES DE HIDRÓGENO en la molécula de doble cadena de ADN o ARN.
Iones
Un átomo o grupo de átomos que tiene una carga electrica positiva o negativa debido a la ganancia (carga negativa) o pérdida (carga positiva) de uno o mas electrones. Los átomos con carga positiva son llamados CATIONES; aquellos con carga negativa son ANIONES.
Bacteriorodopsinas
Rodopsinas que se encuentran en la MEMBRANA PÚRPURA de archaea halofílica como el HALOBACTERIUM HALOBIUM. Funcionan como transductores de energia, convirtiendo la energia luminosa en energia electroquímica mediante BOMBAS DE PROTONES.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Bibliotecas de Moléculas Pequeñas
Grandes colecciones de moléculas pequeñas (peso molecular menor o igual a 600), de naturaleza similar o diferente, que se utilizan en pruebas rápidas de detección sistemática de la función génica, la interacción proteica, el procesamiento celular, las vías bioquímicas y otras interacciones químicas.
Termolisina
Metaloendopeptidasa extracelular termoestable, que contiene cuatro iones de calcio. EC 4.4.24.27.
Metaloproteínas
Proteína que tiene uno o más iones metálicos estrechamente unidos y que forman parte de su estructura. (Dorland, 28a ed)
Hierro
Ácidos Nucleicos
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Manganeso
Un oligoelemento que tiene por símbolo atómico Mn, número atómico 25 y peso atómico 54.94. Está concentrado en la mitocondria, principalmente en la glándula pituitaria, hígado, páncreas, riñón y hueso, influencia la síntesis de mucopolisacáridos, estimula la síntesis hepática de colesterol y ácidos grasos y es un cofactor de muchas enzimas incluyendo la arginasa y la fosfatasa alcalina en el hígado.
Regulación Alostérica
Modificación de la reactividad de las ENZIMAS por la unión de los efectores a sitios (SITIOS ALOSTÉRICOS) de las enzimas distintos a los SITIOS DE UNIÓN del substrato.
Detergentes
Bovinos
Animales bovinos domesticados del género Bos, que usualmente se mantienen en una granja o rancho y se utilizan para la producción de carne o productos lácteos o para trabajos pesados.
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Rastreo Diferencial de Calorimetría
Microtomografía por Rayos X
TOMOGRAFÍA COMPUTARIZADA POR RAYOS X con resolución en el rango micrométrico.
ARN Catalítico
ARN que tiene actividad catalítica. Tiene una secuencia que se enrolla para formar una superficie compleja que puede funcionar como una enzima en las reacciones con si mismo y con otras moléculas. Puede darse incluso en ausencia de proteina. Existen numerosos ejemplos de especies de ARN que actuan sobre el ARN catalítico, aunque el alcance de esta clase de enzima no se limita a un tipo particular de sustrato.
Bioquímica
Cobalto
Xenón
Química Física
Membrana Dobles de Lípidos
Bases de Datos de Proteínas
Bases de datos que contiene información sobre PROTEÍNAS, tales como la SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS; CONFORMACIÓN PROTÉICA, y otras propiedades.
Acetato de Sodio
Sal de sodio trihidratada del ácido acético, la cual es utilizada como una fuente de iones sodio en soluciones de diálisis y como un alcalinizante sistémico y urinario, diurético y expectorante.
Hidrólisis
Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.
Rutenio
Azufre
Un elemento miembro de la familia de los calcógenos. Tiene por símbolo atómico S, número atómico 16 y peso atómico [32.059; 32.076]. Se encuentra en los aminoácidos cisteína y metionina.
ADN de Forma Z
Amidas
Compuestos orgánicos que contiene el radical -CO-NH2. Las amidas son derivadas de los ácidos por el reemplazo del OH por -NH2 o del amoníaco por el reemplazo del H por un grupo acilo.
Película para Rayos X
Base de película recubierta con una emulsión diseñada para ser utilizada con los rayos x.
Fenómenos Fisicoquímicos
Proteínas del Complejo del Centro de Reacción Fotosintética
Complejos de proteína que toman parte en el proceso de FOTOSÍNTESIS. Se encuentran en las MEMBRANAS TILACOIDES de los CLOROPLASTOS de plantas y en una variedad de estructuras en los organismos más primitivos. Hay dos complejos mayores involucrados en los procesos fotosintéticos llamados FOTOSISTEMA I y FOTOSISTEMA II.
Fragmentos de Péptidos
Proteínas parciales formadas por hidrólisis parcial de proteínas o generadas a través de técnicas de INGENIERÍA DE PROTEÍNAS.
Propiedades de Superficie
Procesamiento de Imagen Asistida por Computador
Isomerismo
Radiografías Pulmonares Masivas
Metamioglobina
Desnaturalización Proteica
Acetilcolinesterasa
Imagen Tridimensional
Proceso de generación de imágenes tridimensionales por métodos electrónicos, fotográficos u otros métodos. Por ejemplo, pueden generarse imágenes tridimensionales por montaje de imágenes tomográficas múltiples con el auxilio de un ordenador, mientras que las imágenes fotográficas en 3-D (HOLOGRAFIA) pueden ser hechas por exposición de película al modelo de interferencia creado cuando dos fuentes de luces de laser iluminan un objeto.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Ácidos Carboxílicos
Compuestos orgánicos que contienen el grupo carboxi (-COOH). Este grupo de compuestos incluyen aminoácidos y ácidos grasos. Los ácidos carboxílicos pueden ser saturados, insaturados o aromáticos.
Fotones
Concentraciones discretas de energía, aparentemente partículas elementales sin masa, que se mueven a la velocidad de la luz. Son unidades o cuantos de radiación electromagnética. Los fotones son emitidos cuando los electrones se mueven de un estado de energía a otro.
Compuestos Organofosforados
Iminas
Fragmentos Fab de Inmunoglobulinas
Fragmentos de unión univalentes de antígeno, compuestos por una CADENA LIGERA DE INMUNOGLOBULINAS entera y el amino terminal de una de las CADENAS PESADAS DE INMUNOGLOBULINA de la región media, unidas entre sí mediante uniones disulfuro. Los Fab contienen las regiones variables de la molécula de inmunoglobulina, que son parte del sitio de unión a antígeno y las primeras regiones constantes. Este fragmento puede obtenerse por digestión de las inmunoglobulinas con la enzima proteolítica PAPAINA.
Deuterio
Deuterio. El isótopo estable del hidrógeno. Tiene un neutrón y un protón en el núcleo.
Rayos Láser
Fuente óptica que emite fotones en un haz coherente. Amplificación de luz por emisión estimulada de radiación (LASER) producida usando dispositivos que transforman la luz de diferentes frecuencias en un solo haz intenso, casi no divergente de radiación monocromática. Los láseres operan en regiones del espectro ultrarrojo, visibles, ultravioleta o de rayos X.
Triptófano
Aminoácido esencial, necesario para el crecimiento normal de los niños y para el equilibrio del NITRÓGENO en los adultos. Es un precursor de los ALCALOIDES DE INDOL en las plantas. Es un precursor de la SEROTONINA (y por ello utilizado como antidepresivo y facilitador del sueño). Puede ser un precursor de la NIACINA en mamiferos, aunque de manera ineficiente.
Monóxido de Carbono
Monóxido de carbono (CO). Un gas venenoso, incoloro, inodoro e insaboro. Se combina con la hemoglobina para formar la carboxihemoglobina, que no tiene la capacidad de transportar el oxígeno. La falta de oxígeno resultante provoca dolor de cabeza, vértigo, disminuye el pulso y el ritmo respiratorio, inconciencia y muerte.
Cianobacterias
Filum de bacterias oxigénicas fotosintéticas que comprende desde bacterias unicelulares a multicelulares, que poseen CLOROFILA y que realizan la FOTOSÍNTESIS con oxígeno. Las Cyanobacteria son los únicos organismos conocidos capaces de fijar tanto el DIÓXIDO DE CARBONO (en presencia de luz) como el NITRÓGENO. La morfología celular puede incluir heterocistos fijadores de nitrogeno y/o células en reposo denominadas acinetos. Anteriormente denominadas algas azúl-verdosas, las cyanobacteria eran consideradas tradicionalmente como ALGAS.
Carboxipeptidasas A
Carboxipeptidasas que primariamente se encuentran en el SISTEMA DIGESTIVO que cataliza la liberación de C-terminal aminoácidos. Las carboxipeptidasas A tienen una pequeña o ninguna actividad para hidrólisis de ACIDO ASPARTICO C-terminal; ACIDO GLUTAMICO; ARGININA; LISINA; o PROLINA. Esta enzima requiere ZINC como cofactor y fue antes listada como EC 3.4.2.1 y EC 3.4.12.2.
Disulfuros
Grupos químicos que contienen el enlace disulfuro covalente -S-S-. El átomo de azufre puede unirse a partes orgánicas o inorgánicas.
Solubilidad
Huella de Proteína
Un método para determinación de puntos de contacto entre proteínas interactivas o sitios de enlace de proteínas a ácidos nucleicos. Para la huella de proteína se utiliza un reagente o protease que corta la proteína. La segmentación proteica es inhibida cuando las proteínas, o ácidos nucleicos y proteína, entran en contacto mutuamente. Después de la finalización de la reacción de corte, los fragmentos restantes de péptidos son analizados por electroforesis.