Grupo II de chaperonina que se encuentran en el CITOSOL eucariótico. Se compone de ocho subunidades con cada subunidad codificada por un gen por separado. Esta chaperonina es nombrada por una de sus subunidades que es una REGIÓN DEL COMPLEJO T polipéptido codificado.

Proteínas chaperonas grupo I que forma una estructura similar a una tapa- que encierra la cavidad no-polar del complejo de la chaperonina. La proteína se estudió inicialmente en BACTERIA donde comúnmente se refirió como proteína GroES.

Grupo I de proteína de chaperonina que forman la estructura semejante a barril del complejo de chaperonina. Es una proteína oligomérica con una estructura distintiva de catorce subunidades, dispuestas en dos anillos de siete subunidades cada uno. La proteína se estudió inicialmente en BACTERIAS donde es comúnmente llamada como proteína GroEL.

Familia de multisubunidades de complejos de proteínas que se forman en grandes estructuras cilíndricas que se unen a y encapsulan proteínas no nativas. Las chaperoninas utilizan la energía de la hidrólisis de ATP para aumentar la eficiencia de reacción del PLIEGUE DE PROTEÍNAS y de ese modo ayudar a las proteínas a alcanzar su conformación funcional. La familia de chaperoninas se divide en el GRUPO I DE CHAPERONINAS, y el GRUPO II DE CHAPERONINAS, donde cada grupo poseé su propio repertorio de subunidades de proteína y preferencias de subcelulares.

Subcategoría de chaperoninas que se encuentran en la ARCHAEA y el CITOSOL de las células eucariotas. El grupo II de chaperoninas forman una estructura molecular en forma de barril que se distingue de las CHAPERONINAS DEL GRUPO I en que no utiliza una estructura separada de unión para incluir las proteínas similares lid.

Una región de 20 cM del cromosoma 17 del ratón que está representada por al menos dos HAPLOTIPOS. Uno de los haplotipos se conoce como el haplotipo t y contiene una serie inusual de mutaciones que afectan el desarrollo embrionario y la fertilidad masculina. El haplotipo t se mantiene en la reserva de genes por la presencia de características inusuales que previenen su recombinación.

Enzima que cataliza la transferencia del átomo de azufre planetario del ión tiosulfato al ión cianuro, para formar el ión tiocianato. EC 2.8.1.1.

Procesos que intervienen en la formación de ESTRUCTTURA TERCIARIA DE PROTEÍNA.

Grupo II de chaperoninas que se encuentran en las especies ARCHEA.

Subcategoría de chaperoninas que se encuentran en las MITOCONDRIAS, CLOROPLASTOS; y BACTERIAS. El grupo I de chaperoninas forman una estructura macromolecular en forma de barril que es incluida por la separación del componente similar de la proteina -lid.

Enzima que cataliza la conversión de (S)-malato y NAD+ a oxalacetato y NADH. EC 1.1.1.37.

Grupo irregular de bacterias en forma de bastoncillos que toman coloración gram positiva y que no producen esporas.

Adenosina 5'-(tetrahidrógeno trifosfato). Nucleótido de adenina que contiene tres grupos fosfato esterificados a la molécula de azúcar. Además de su crucial rol en el metabolismo del trifosfato de adenosina es un neurotransmisor.

Proteínas que se hallan en cualquier especie arqueológica.

Transiciones conformacionales de una proteína de estados desplegados a estado más plegado.

Las proteínas que se sintetizan en los organismos eucariotes y las bacterias en respuesta a la hipertermia y a otras tensiones ambientales. Ellos incrementan la tolerancia térmica y realizan funciones esenciales para la supervivencia celular bajo estas condiciones.

Familia de proteínas celulares que median en la correcta conformación o desmontaje de polipéptidos y sus ligandos asociados. A pesar de que participan en el proceso de ensamblaje las chaperonas moleculares no son componentes de las estructuras finales.

Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).

Una carboxiliasa que desempeña un papel fundamental en la asimilación fotosintética del carbono en el CICLO DE CALVIN-BENSON, catalizando la formación de 3-fosfoglicerato a partir de la 1,5-bifosfato ribulosa y DIÓXIDO DE CARBONO. También puede utilizar el OXÍGENO como un sustrato para catalizar la síntesis de 2-fosfoglicolato y 3-fosfoglicerato en un proceso conocido como fotorrespiración.

Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).

Género de METHANOCOCCACEAE cocoides cuyos organismos se mueven por medio de un penacho de flagelos polares. Estos metágenos se encuentran en pantanos salinos, sedimentos marinos y estuarios, y en el tracto gastrointestinal de animales.

Género de archaea heterotrófica extremadamente termofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que existen en corrientes marinas calientes. Son sulfidógenos quimiorganotróficos anaerobios.

Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.

La interrupción de los enlaces no covalentes y / o puentes disulfuro responsable de mantener la forma tridimensional y la actividad de la proteína nativa.

Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.

El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.

Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.

Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.

Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.

Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.

Microscopía electrónica en la que se produce una congelación rápida de las muestras. La imagen de las moléculas hidratadas-congeladas y de los organelos permite obtener la mejor resolución posible que semeja al estado vivo, libre de fijadores químicos o de colorantes.

Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.

Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.

Células de los organismos superiores que contienen un núcleo verdadero limitado por una membrana nuclear.

Ácido 5'-adenílico, monoanhídrido con ácido imidodifosfórico. Análogo del ATP, en el que el átomo de oxígeno que hace de puente entre el fosfato beta y gamma es reemplazado por un átomo de nitrógeno. Es un potente inhibidor competitivo de la ATPasa mitocondrial soluble y unida a la membrana, y tambien inhibe las reacciones de fosforilación oxidativa dependientes del ATP.

Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.

Adenosina 5'-(triidrógeno difosfato). Nucleótido de adenina que contiene dos grupos fosfato esterificados a la molécula de azúcar en la posición 5'.

Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.

Enzima que cataliza reversiblemente la etapa final de la fermentación alcohólica, reduciendo un aldehído a un alcohol. En el caso del etanol, el acetaldehído es reducido a etanol en presencia de NADH e hidrógeno. La enzima es una proteína con zinc que actúa en alcoholes primarios y secundarios o hemiacetales. EC 1.1.1.1.

Enzima dependiente de NAD+ que cataliza la oxidación de 3-carboxi-2-hidroxi-4-metilpentanoato a 3-carboxi-4-metil-2-oxopentanoato. Está implicada en la biosíntesis de la VALINA, LEUCINA e ISOLEUCINA.

Subunidad proteica de microtúbulo que se encuentra en grandes cantidades en el cerebro de mamíferos. Se ha aislado también del FLAGELO DEL ESPERMATOZOIDE, CILIOS y de otras fuentes. Estructuralmente, la proteína es un dímero con un PM aproximado de 120,000 KDa y un coeficiente de sedimentación de 5.8S. Se une a la COLCHICINA, VINCRISTINA y VINBLASTINA.

Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.

Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.

Especie de bacteria gramnegativa, aerobia, en forma de bastoncillos que se encuentran en las aguas termale s con pH neutro a alcalino, así como en los calentadores de agua.

La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.

Reconstitución de la actividad de una proteína después de la desnaturalización.

Un género de cocoides anaerobios, quimiolitotrópicos ARCHAEA, en la familia DESULFUROCOCCACEAE. Viven en ambientes marinos.

Enzima que cataliza el primer paso del ciclo del ácido tricarboxílico(CICLO DEL ACIDO CÍTRICO). Cataliza la reacción del oxaloacetato y el acetil CoA para formar citrato y coenzima A. Esta enzima fue listada anteriormente en EC 4.1.3.7.

Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.

Conjunto de reacciones opuestas, no equilibradas y catalizadas por diferentes enzimas que actúan simultáneamente, al menos con una de las reacciones guiadas por la hidrólisis del ATP. Los resultados del ciclo son el agotamiento de la energía del ATP, la producción de calor y la ausencia de conversión neta de sustrato a producto. Ejemplos del ciclo del sustrato lo son los ciclos de las vías de la gluconeogénesis y glicolisis y los de las vías de los triglicéridos y ácidos grasos. Las tasas de ciclaje del sustrato pueden aumentarse muchas veces al asociarse a estados hipermetabólicos que se producen durante las quemadas severas, la exposición al frío, el hipertiroidismo o al realizar ejercicio fuerte.

POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.

Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.

Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.

Género de METANOBACTERIAS anaerobias en forma de bastoncillos. Sus organismos son inmóviles y utilizan el amoniaco como única fuente de nitrógeno. Estos metanógenos se encuentran en sedimentos acuáticos, suelos, aguas residuales y en el tracto gastrointestinal de animales.

Complejos macromoleculares formados de la asociación de subunidades definidas de proteínas.

Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.

Clase de compuestos orgánicos que contienen un grupo anilino (fenilamino) unido a una sal o éster del ácido naftalensulfónico. Se utilizan con frecuencia como colorantes fluorescentes y reactivos sulfhidrilos.

Una fuerte base orgánica que existe principalmente como iones guanidínicos a pH fisiológico. Se encuentra en la orina como producto normal del metabolismo de las proteínas. Es utilizado en investigaciones de laboratorio como desnaturalizador de proteínas. (Traducción libre del original: Martindale, the Extra Pharmacopoeia, 30th ed and Merck Index, 12th ed). Es también utilizado en el tratamiento de la miastenia y como sonda fluorescente en cromatografía líquida de alta presión.

Un compuesto formado en el hígado a partir del amoníaco producido por la desaminación de los aminoácidos. Es el principal producto final del catabolismo de las proteínas y constituye aproximadamente la mitad del total de los sólidos urinarios.

Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.

Proteínas de alto peso molecular que se encuentran en los MICROTÚBULOS del sistema citoesquelético. Bajo ciertas condiciones son necesarias para organizar la TUBULINA en los microtúbulos y estabilizar los microtúbulos organizados.

Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.

Proteínas filamentosas que son el constituyente principal de los delgados filamentos de las fibras musculares. Los filamentos (conocidos como F-actina) pueden ser disociados en sus subunidades globulares; cada subunidad está compuesta por un solo polipéptido de 375 aminoácidos. Esto es conocido como actina globular o actina G. La actina, junto con la miosina, es la responsable de la contracción y relajación muscular.T.

Animales bovinos domesticados del género Bos, que usualmente se mantienen en una granja o rancho y se utilizan para la producción de carne o productos lácteos o para trabajos pesados.

Género de archaea heterotrófica facultativamente anaerobia del orden THERMOPLASMALES, aisladas de pilas de residuos de carbón para autocalentamiento y de fuentes de aguas calientes ácidas. Son termofílicas y pueden crecer tanto con como sin azufre.

Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.

Organelas semiautónomas que se reproducen por sí mismas y se presentan en el citoplasma de la mayoría de las células eucariotas, pero no en todas. Cada una está rodeada por una doble membrana limítrofe. La membrana interna presenta múltiples invaginaciones y sus proyecciones se denominan crestas. La mitocondria es el lugar de las reacciones de fosforilación oxidativa que dan lugar a la formación de ATP. Contienen RIBOSOMAS, varios ARN DE TRANSFERENCIA, SINTETASAS AMINOACIL-ARN T y factores de elongación y terminación. Las mitocondrias dependen de los genes del núcleo, de las células en que residen, para muchos ARN MENSAJEROS. Se cree que las mitocondrias se han originado a partir de bacterias aerobiass que establecieron una relación simbiótica con los protoeucariotas primitivos. (King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed)

Clase de CHAPERONES MOLECULARES que se encuentra en procariotes y en varios compartimientos de las células eucariotas. Estas proteínas pueden interactuar con polipéptidos durante distintos procesos de acoplamiento, de forma que puedan prevenir la formación de estructuras no funcionales.

Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.

Enzima mitocondrial que cataliza la decarboxilación oxidativa de isocitrato para formar alfa-cetoglutarato, usando NAD+ como aceptor de electrones; la reacción es una etapa clave limitante de la velocidad en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos. La enzima requiere Mg2+ o Mn2+ y es activada por ADP, citrato y CA2+, e inhibida por NADH, NADPH, y ATP. (Dorland, 28a ed). EC 1.1.1.41.

Líquido intracelular del citoplasma después de eliminar las ORGANELAS y otros componentes citoplasmáticos insolubles.

Medición de la intensidad y calidad de la fluorescencia.

Enzima perteneciente a la clase oxidorreductasa que cataliza la reacción de dihidrofolato a tetrahidrofolato utilizando NADPH como donante de electrones; como resultado de la reacción se forma folato reducido, que se utiliza en el metabolismo de los aminoácidos, la síntesis del anillo de purina y en la formación de monofosfato de desoxitimidina. El metotrexato y otros compuestos antagonistas del ácido fólico, que se utilizan como fármacos quimioterapéuticos, actúan inhibiendo esta enzima. (Dorland, 28a ed) EC 1.5.1.3.

Modificación de la reactividad de las ENZIMAS por la unión de los efectores a sitios (SITIOS ALOSTÉRICOS) de las enzimas distintos a los SITIOS DE UNIÓN del substrato.

Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.

Cuerpos de inclusión de las células vegetales que contienen el pigmento fotosintético CLOROFILA, asociado con la membrana de los TILACOIDES. Los cloroplastos se encuentran en los tallos jóvenes y hojas de las plantas superiores. También se encuentran en algunas formas de FITOPLANCTON como la HAPTOPHYTA; DINOFLAGELADOS; DIATOMEAS; y CRPTÓFITAS.

Familia de archaea, del orden DESULFUROCOCCALES, constituida por cocos anaerobios que utilizan facultativamente péptidos, proteínas o carbohidratos por respiración sulfurosa o fermentación. Hay ocho géneros: AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus y Thermosphaera (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).

Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.